5IMZA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f7
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
total genus 51
structure length 157
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imzA00
2ZCTA 4GRFA 4TOPA 2L4CA 4IW9A 1XWAA 3KM6A 5B8AA 1UVZA 1USBA 1SYRA 4ZL7A 3C1SA 1XWKA 4QL7A 2YWNA 4WEYA 4N30A 2AJQB 5ABRA 2B5EA 2DIYA 4JBBA 1A2LA 1PKZA 2N5AA 4F03A 2OBKA 1V2AA 1DE2A 2C0DA 3L9UA 2H72A 1SYXA 5CAXA 4POLA 4O92A 1N8JA 3K8NA 4K0GA 2OE1A 4MJCA 4IQ1A 1FG4A 5IOWA 2GT6A 2IWTA 5KN3A 8GSSA 5FWGA 4JR6A 3ZFBA 20GSA 4Z7XA 2IMFA 3FR6A 2YV9A 2P31A 1MDIA 1T4ZA 5ELGA 3LSZA 3U6VA 4ECIA 1XW6A 1Y25A 3GNJA 3LQ7A 4NWYA 1PMTA 4TR3A 2AHEA 1GSQA 4L5OA 1QQ2A 1GSUA 2VLTA 3ZYWA 3VK9A 5D93A 3H4KA 2PVQA 1PL2A 2TRCP 2WCIA 4GTUA 4TXOB 3FZ4A 4IP6A 1TK8B 1K0MA 2ON5A 2EIQA 3S9FA 1R26A 4FYUA 5FHIA 2VUPA 5EPFA 3QAWA 3HJMA 3W8JA 5LCZA 2YP6A 1EEMA 4X1UA 2P0GA 4RQRA 2C0EA 2FWGA 3L0HA 1GTUA 2C4JA 9GSSA 3DVXA 3ERWA 3G9BA 2AUVA 3GL3A 1WPIA 3RAZA 1U88A 2H75A 5HR3A 2DJ0A 1WP0A 4IBPA 2GZZA 2JL4A 3R2QA 1YZXA 3KIJA 4PXOA 1G6WA 2NPBA 1AQXA 2DJ3A 2F8FA 3TDGA 3ZTLA 3E0UA 5H5QA 3VURA 3D6IA 4POMA 4V2LA 1TI1A 3BOAA 2JACA 4G2EA 2H74A 4RI6A 3EURA 4ISDA 1YKCA 2YPMA 2HYXA 1XW9A 2HT9A 1ZZYA 3L78A 2CZ3A 1B48A 1WOUA 4KSOA 1EP7A 3E3EA 1V9WA 5INYA 2LEGA 5G2ZA 4RUVA 4K1FA 4YAVA 2DJKA 5H5RA 4WKWA 5G5FA 2FA8A 2E2GA 2WZ9A 2OE3A 3CTGA 4KDXA 5D73A 2YWIA 2ZUPA 2VD0A 1SKRB 4KCAA 22GSA 3TJBA 5DJMA 3GL5A 2OBIA 3I9V2 1F9MA 1FVJA 3UARA 3UVTA 1SJIA 5HR0A 1GNWA 5IMDA 4MK3A 3MDKA 1XWBA 5A4UA 4I2UA 4TRXA 3WGEA 3HA9A 2XBIA 4N10A 2FWFA 4ID0A 2OACA 3HCZA 1EEJA 3HD5A 1EZKA 3N9JA 3UEMA 1U6TA 2GS3A 2VAFA 3ME8A 4N11A 3VI5A 5FT3A 2KP2A 4IP1A 4ML1A 1S3DA 5ID2B 1GNEA 4NAXA 4OWYA 4XS6A 3GSSA 3WGXA 5C00A 4IN0A 2LRCA 1Z3EA 4ZBAA 1EOGA 4G10A 2J9HA 1VGLA 3HDCA 4YAPA 1SKWB 3VPTA 4HJ2A 4I5QA 3FHKA 3TRQA 1URMA 3AY8A 5ECIB 3P90A 1XIYA 4G19A 1GSSA 1THOA 3LJRA 3V1WA 4ZBDA 2E2MA 1OKTA 3KTBA 2OKAA 3VWWA 1DSBA 2C3NA 1M9BA 18GSA 1WRYA 2B3SA 4MPFA 1BX9A 4BVYA 1ERVA 4IJ3A 5AN1A 2MMOA 2FCHA 2MMZA 3IK7A 4IELA 5CYYA 2C3TA 2J23A 3GTUB 1B9XC 2VLUA 4FYBA 3ZMLA 4WR4A 3IOSA 1IYHA 1TP9A 2YCDA 2P5QA 2FY6A 1OC9A 3CRUA 1T7PB 1GSEA 1YQ1A 4V1Ag 4OMVA 2I3YA 3CBUA 3IAM2 2HI7A 4ML6A 1MD3A 1A8LA 1XOAA 2YZUA 2H8LA 1RQMA 4F0BA 3GX0A 5B7CA 1LBKA 4N0VA 1ERUA 4JU5A 1XBSA 4XS1A 1SK0A 4EF0A 3TCOA 3APQA 3C7MA 2VCTA 4CHSA 2R37A 3IPZA 1EWXA 4ECCA 2GT5A 2JU5A 1TTZA 2REMA 3PGTA 2H1GA 4DSSB 5HR1A 2H76A 4NXIA 4POBA 5IMFA 3QAVA 1H75A 3FEUA 2D2ZA 2IIYA 1U87A 2DJ2A 4OO4A 4JR4A 4D73A 4HI7A 2IMIA 3GFKA 3DWVA 3GA4A 4E8HA 3RPPA 2O8VB 1V57A 4HUAA 1VF2A 1ON4A 2X8CA 2XPEA 3D5JA 3F3QA 2E0QA 4XS4A 2YJHA 4HU7A 4JE1A 5D9TA 4IKHA 3H1NA 2GSRA 1R5AA 3O76A 3IK9A 5DQYA 3Q19A 2V6KA 3MAKA 5LNKe 3ZIJA 3L9SA 2RUEA 2X99A 3EMXA 4TR1B 4AF2A 4TW5A 4ZL9A 1ST9A 3FK8A 1KBNA 2A2RA 2R2JA 4DVCA 4AJ8A 4OCFA 2H0HA 4HEA2 3LFLA 1GL8A 2IFQA 3FZ9A 3Q74A 3FZAA 4BVXA 2MBTA 2JZTA 2LV3A 3TKPA 5GSSA 4BPYA 1E2YA 4J57E 2M80A 3HVSA 1O73A 1U3IA 1FW1A 1NHYA 2YV7A 3KD0A 5CRGA 2RM5A 6GSTA 3KZQA 3CMIA 1X0RA 2GQMA 2K8VA 1SU9A 1AIUA 1B4PA 1ML6A 2Z9SA 5DAKA 1SJ6A 3UVHA 3DVWA 4ULXA 4TN8A 2XC2A 1QK8A 5JCWA 3FKFA 3I43A 3EINA 2IMEA 1HNAA 3HJPA 4HQZA 2WB9A 4Q5FA 4EC0A 1EOHA 3UJ1A 3QCPA 1X9SB 3M9JA 1Q4JA 2P5RA 3ZVJD 3VWXA 1IYIA 5AIXA 1TU7A 2AAWA 4ACSA 3RBTA 3P7XA 3CYNA 3QPMA 2I4AA 4V1Ap 4EE0A 2CA8A 1B9YC 1K0NA 3EU4A 2GDRA 4QL9A 5IIZA 2VCVA 1PQNA 2IN3A 1GLQA 2HXKA 3ZMKA 4NV5A 3GMFA 1K0AA 3ERFA 1Z6MA 4N0ZA 3WD6A 4EKZA 3Q18A 5AGYA 3TJJA 2L57A 2GLRA 3A2VA 2PU9C 3UBKA 3EC3A 2YANA 4TR4A 2C0FA 1X9MB 4LL4B 2PVOC 5DJLA 4EDYA 2C80A 1O8WA 2O85A 2DLXA 1ZL9A 1U3AA 2HE3A 1GP1A 2NDOA 3DMLA 1K0BA 1SL2B 4BWSA 3HVXA 2RM6A 2HZFA 5CREA 1F2EA 5ECKB 1ERWA 5G30A 1Y6EA 1KTEA 2BTOT 1GUMA 1TDIA 3GN3A 1GH2A 5L71A 2PPTA 13GSA 4HU9A 5JCGA 3TUEA 3NIVA 5DBQA 3CSJA 1UC7A 4F82A 4ZB8A 2VO4A 1AAZA 3F63A 3RDWA 1H4OA 4KSMA 3VLNA 1OAZA 2BMXA 4ZXGA 4GSTA 1V40A 3TGZA 2CV4A 3A2XA 4TVEA 2H70A 4AGSA 3PH9A 3QFAC 2KOKA 1M2AA 5J9BA 4KDUA 12GSA 2ALBA 4O32A 5ENUA 1TI3A 1EP8A 4XTSA 5J41A 3VWUA 2DMMA 2VCQA 1GWCA 6GSYA 2PMTA 4HZ4A 2QKEA 5CP1A 1K3LA 4OFMA 2KLXA 5E59A 4IGJA 5JWRB 1WWJA 1UA5A 2C1YA 1BEDA 2GQKA 1R7HA 2VL2A 3KEBA 3KP9A 3GHAA 4I97A 2GZPA 5DCHA 4DSQA 2NVLA 2L6CA 2MMAA 4K2DA 2LKUA 2B7JA 1PRXA 3DRNA 5ELAA 5IMCA 1J0FA 1PSQA 4H86A 2B5XA 2JZRA 5EL8A 1M0UA 2EIRA 5HFKA 3ED3A 3QMXA 3G7JA 2GVPA 2GQLA 4PURA 2FNOA 2WRTA 3G7IA 2JZSA 1F3BA 3N5OA 4K6XA 3EVIA 5JCUA 1MTCA 1Z7RA 3IDVA 2K8SA 4NHWA 3GYKA 4WR5A 2GZYA 1XW5A 2PGTA 5J9CA 4I8BA 4BA7A 1G6YA 1ZMAA 5A4WA 1TJDA 1ABAA 2QC7A 1HQOA 2V32A 2VL2C 2LQOA 3LORA 1AW9A 3A2WA 1X9WB 1VF4A 5D96A 1T00A 2YZHA 5F0GA 5ECNB 3WGDA 3GH9A 3FRCA 3NOFA 1X5CA 2GSSA 2WDUA 1AXDA 2AB6A 3VPQA 4IS0A 2M72A 1OVNA 3BD2A 3QFBC 1OC9B 3IAS2 2IJYA 4GSNA 5G1LA 3ZREA 2HSYA 1XFLA 3BBYA 4LMWA 5KN2A 3W6GA 5G1KA 5HR2A 2IMDA 3GKXA 2V6OA 3ZITA 3CTFA 4MABA 2LRNA 2H1BA 4MJAA 1A2JA 3ZRDA 4V2MA 3M8NA 2ZNMA 4GQFA 2B1KA 4MF5A 2CAQA 3FW2A 3TKSA 1PD21 3HY2A 2RIIA 1T3BA 4OFNA 1OE8A 1QMVA 1N2AA 5CRWA 2VM2A 3M1GA 5JWQB 2EIOA 2O7KA 1SENA 2RUFA 2X64A 4GSSA 2VCXA 4YQUA 1S3AA 3KCMA 5DALA 1QUWA 4KUNA 2DJJA 1QGVA 1YEPA 2H66A 3RHBA 4KX4A 4PQIA 1CQHA 4RI7A 2H30A 1GUHA 3I69A 1I5GA 3GKNA 1XPVA 5C04A 19GSA 4L5LA 3D4MA 4MJEA 2L5LA 3IHQA 2A2SA 1BYEA 1GSFA 2LS5A 2A4VA 3HVVA 4K7OA 4IQAA 2VCWA 2DSAA 1G7EA 2WULA 3TOUA 3VI7A 1GLPA 4KB3A 2B7KA 3GKMA 3SWLA 5ECQB 2I1UA 3NZNA 1THXA 2H0IA 2HLSA 1M2DA 2V2GA 5EVOA 4E8EA 3A3TA 5J5NA 1QXHA 2H6XA 1KNGA 5EY6A 1XZOA 2TRXA 1G7OA 1VRSD 1K0OA 4HZ2A 4LLRA 3ZIVA 3FYGA 4MZWA 3F4SA 1ZCPA 3CRTA 1SK2A 3D21A 1AQVA 3GX8A 2X8HA 2KHPA 5H5SA 7GSSA 5LD0A 2DBCA 3HZ8A 4Q5QA 4MH2A 2AV4A 1MDKA 2YOIA 1Z5YE 5IMAA 1F3AA 3G7YA 5F07A 2CT6A 4JZQA 5GAND 5IMVA 4KA0A 5GZZB 1HNCA 1Q98A 1FB0A 1AC1A 3GRXA 1SKSB 5DAKB 1V58A 3KMOA 2VOCA 2IMKA 2K6VA 5F8BA 2HNLA 3LXZA 2MMNA 2H1AA 6GSUA 2GGTA 2I81A 2DIZA 3QOUA 2GSQA 4YH2A 3L4NA 4F9ZA 4EL1A 1XWCA 4KAEA 4NPBA 3DIEA 1DUGA 4ZBBA 1GUKA 4KGIA 5J4UA 1A24A 4MCUA 4XRAA 2K18A 2VLVA 3BCIA 4L8EA 3UOMA 2XPDA 2CQ9A 3DGQA 3PINA 5D9WA 4EDZA 1ERTA 2IPAA 4L0UA 3C8EA 1TRUA 5B6MA 1ILOA 1ZYEA 1FO5A 4YQMA 2VCZA 1XVQA 3H79A 5IOXA 4ZILA 1O85A 3F0IA 3FY7A 2RLIA 2FA4A 3JCML 5ECOB 1M99A 2O89A 2MBSA 3F8UA 3DKSA 4ECBA 1BJXA 1SL0B 1WE0A 4OD7A 3LG6A 4V2NA 1WIKA 1TKDB 4KH7A 1SD8A 3F3RA 3HYPA 1HNBA 1B8XA 4TXVA 3ZZXA 1EGRA 2H1DA 1V98A 4DEJA 1DE1A 4K9ZA 2C0GA 4K0NA 4JEDA 1O8XA 1KEBA 2PWJA 1PKWA 3TB2A 3QD9A 2HZEA 1J9BA 2GTUA 2HRFA 3I6AA 4QQ7A 2VIMA 1PA3A 4TKYA 2F51A 5DCGA 1PGTA 1TOFA 3A5WA 5IO0A 3HHVA 5J3RA 5GSTA 2JSYA 3KXOA 4ZL8A 1TU8A 4PQHA 5IPGA 1SD9A 3QDNA 2CAIA 2F8AA 5KEJA 2MYGA 1S3CA 3U5RE 3LGCA 3F4TA 1F37A 4MDCA 4DSSA 2LUSA 2PN8A 3EWLA 2HRNA 2NTOA 3P8WA 2ON7A 3HKRA 2DJ1A 5ECSA 2K9FA 5F06A 3O3TA 4MMMA 3C1RA 2VL9A 1DBYA 3D4TA 4XIHA 1NM3A 2LRTA 1C72A 3D0ZA 2LJKA 4ILFA 4BL7A 3DXBA 3TJKA 4F2IA 3IE3A 3MNGA 3ERGA 2C8UA 3IA1A 4MF7A 2KP1A 4IVFA 4WF5A 1T1VA 2ES7A 2WGRA 1G0TA 4J56E 1TRWA 4HQSA 3KH7A 3CSIA 4K7NA 3GUSA 4TR1A 4MLYA 2CZ2A 2C3QA 2LJAA 4MZCA 3IBHA 1XVWA 1XCCA 2M46A 4KCEA 1HD2A 1A8YA 4IJIA 3UAPA 2QGVA 3BJ5A 1Z9HA 4YQVA 3EYTA 1MEKA 2JSZA 5IM9A 3MWHA 1NW2A 1JZOA 2R6KA 4ZB6A 1FOVA 2R4VA 2HSHA 4L0WA 4MJBA 1YDKA 3LXTA 3VFIA 3WT1A 2VM1A 1GTIA 2OA7A 3WT2A 5DVBA 3W8SA 1X5EA 4WBJA 4DSRA 3US3A 3KMNA 4PNFA 2AYTA 1JFUA 1FAAA 1ZYQB 1A23A 1W4VA 3ZL5A 3HZ4A 1YEXA 2KUCA 3TJGA 5GAPD 5AISA 4K7IA 3DYRA 4Q5NA 4NHZA 1FB6A 4OCEA 1T4YA 5JWOB 1TK5B 1YJ6A 1YF1A 4P3YB 3TRPA 4NV2A 5CNWA 1XOBA 3ZLPA 5DALB 3UL3A 1OYJA 3EU3A 4FH8A 4CW9A 4O5RA 2MZCA 3F9UA 2B5YA 2G0FA 5E4WA 1A2MA 1I9DA 2HFDA 11GSA 1ZGNA 3GKKA 3BCKA 1WJKA 4WXTA 1HYUA 2FWEA 3KP8A 3M9KA 4OFTA 1PN9A 2FHEA 4XHMA 3IR4A 2LJRA 2JADA 2FWHA 3PR8A 4Q5RA 5KN0A 10GSA 2YNXA 3P2AA 1QFNA 3DD3A 2VL3A 6GSSA 2LQQA 3GIXA 1RK4A 3J7Yk 1O81A 4MZBA 2LNTA 3J7Yb 2BJXA 4KE3A 2O87A 3IV4A 2LSTA 1ZOFA 4TXOA 2H73A 1PL1A 1J08A 3RPNA 1TXXA 1NSWA 3O6TA 1X5DA 5HFIA 4O7HA 3M0FA 1GSDA 3LEFA 2OJLA 5ECMB 4GLTA 3GV1A 5AIVA 4K8MA 2CVDA 2QSIA 2X8GA 17GSA 2XBQA 5IMZA 3GH6A 1FHEA 1JHBA 1O6JA 4POKA 2L59A 2FGXA 2L4QA 2V41A 3TKQA 4PUFC 2R5GA 2EC4A 1VF1A 5ECPB 3TKSE 2LTKA 1JZDA 2NBSA 3IXRA 2FUG2 1LJRA 5B6NA 3L9VA 5CRHA 1A0RP 5KN1A 1AQWA 1YKAA 2H71A 3UIWA 4MF6A 1SK1A 4PUAA 1TK0B 1F6MC 4PQ1A 4D73B 1R4WA 4BWQA 4FYCA 4KDYA 1WMJA 4X43A 3F6FA 1LU4A 2PERA 1T8EB 5IQYA 4KW6A 5A5KA 2CVKA 1BG5A 4XS4B 4OO5A 2PUKC 1SL1B 3KH9A 14GSA 5COHA 4I6XA 4CDOA 2WS2A 5DDLA 1GTAA 3SBCA 4KNDA 3FR3A 4MH3A 2YJ7A 3TKSC 5ECLB 2I9HA 2E7PA 3H93A 2H01A 2F3MA 3M3MA 2B1LA 1CQGA 6GSWA 2H0GA 2XHFA 2V1MA 5ECRB 1JZRA 2N5FA 4EXJA 3UMAA 4PGTA 1XWGA 5D9XA 4I2TA 2YN1A 2IFQB 2H6ZA 4LMVA 3KGKA 1TW9A 3UBLA 2PBJA 3GURA 3C73A 1E6BA 3Q6OA 1K3YA 3FR9A 1YY7A 5HQPA 3EE2A 1JLWA 1GTBA 6GSVA 1JLVA 1XXUA 5DQSA 3H8QA 2FLSA 4ZIJA 1FVKA 2YWMA 3KJYA 4HJMA 5CO3A 1MD4A 2YWOA 1M9AA 3TRXA 1YF0A 3IC4A 2HZEB 3ISOA 4XCSA 3MSZA 3QAGA 1EV9A 3RHCA 1GSYA 1UN2A 1PX6A 3KTLA 2R3XA 4AJ7A 4IHUA 1MDJA 4FIWA 4MP4A 1M7TA 4FO5A 4MPGA 3LWAA 1OC8A 5ID2A 4LA1A 2DMLA 3CSHA 2F9SA 3E9JB 3VWVA 4PX1A 2CX4A 16GSA 2N5BA 1K0DA 1K0CA 1BAYA 3APSA 2B6MA 1SJZA 1TRVA 4ZB9A 1W89A 4G9HA 1EV4A 1RW1A 3HXSA 4WBRD 4F0CA 1PX7A 1OC3A 2IL3A 5A4VA 3DEXA 2WJUA 3HJOA 4J2FA 4JRRA 3LYPA 4RQXA 4XRDA 4WF4A 4TR0A 1OKDA 2CVBA 2H19A 4EVMA 2CX3A 1O7UA 3CXGA 3D22A 2GSTA 2OE0A 4GQCA 1K3OA 4GXZA 2G2QA 4HS1A 6GSXA 3TJFA 5D9VA 4NMUA 4GWRA 3APOA 4EUYA 3WYWA 3GSTA 1AUCA 3FZ5A 1R5PA 2VD1A 3TKRA 5IPHA 5B8BA 4GF0A 5ECHB 3ZFLA 1OE7A 2FD3A 2DC5A 5IO2A 1EGOA 1JZWA 4LL1B 1A0FA 3GTUA 1BQ7A 1TRSA 3OR5A 4AJ6A 2L5OA 3IRAA 1VF3A 4EO3A 2L6DA 2LNSA 2OADA 3LYKA 3QR6A 5F05A 1B4QA 4WETA 4HOJA 4X0XA 4HDEA 5D8IA 5HFGA 1GULA 2H6YA 3C71A 4GCIA 3F6DA 2TIRA 1GRXA 3EMPA 1M2BA 3F4RA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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