5IMZA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f7
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
b'TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule tags Oxidoreductase
total genus 51
structure length 157
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imzA00
1V40A 4F03A 2VD1A 2FY6A 3KM6A 3L4NA 3IC4A 2GSSA 3TOUA 4PUFC 1X5CA 2LJRA 3EVIA 3APOA 1SL0B 5D96A 3F4TA 3DYRA 3QAVA 2GS3A 1FO5A 4BL7A 2LV3A 5D8IA 1SJIA 2FUG2 4CHSA 4WR5A 2X99A 4GSNA 2FCHA 1O81A 3FR6A 1TW9A 3VK9A 1YJ6A 4MF7A 2TRCP 1K3OA 1XXUA 3KP8A 4TOPA 1BJXA 2HLSA 2HE3A 2VAFA 4LL1B 3TRPA 1GTUA 4IJ3A 5CNWA 1G0TA 5F0GA 4I6XA 1BEDA 2HYXA 2H0HA 3V1WA 1XW5A 3IRAA 2DBCA 3QAWA 1TP9A 2AYTA 3FKFA 2LUSA 1A2JA 1FG4A 5A4WA 5HFIA 1X5DA 3LJRA 1XOBA 4YH2A 2I4AA 4GQFA 2HI7A 2K6VA 4GTUA 1R5PA 5F05A 2O8VB 1N8JA 4Q5RA 1M2AA 1WOUA 2WZ9A 2YOIA 2EIRA 2WRTA 3UIWA 1X9MB 3MWHA 5IPHA 3EURA 3IXRA 5DCGA 5B6MA 4V1Ag 3HD5A 4GLTA 4XS1A 4HEA2 2YV9A 2OA7A 1V2AA 4MCUA 4MJEA 5ELAA 1A8LA 2K9FA 2H1GA 3GYKA 3TJFA 4OO4A 2HRFA 4TVEA 2FWGA 5ECLB 2DLXA 2L4CA 3KEBA 4RI6A 4RQXA 2OE1A 5IM9A 2HRNA 2YCDA 1THXA 3KMNA 3U6VA 2OACA 1RK4A 1YY7A 4IVFA 5IMVA 4ZL9A 1AQVA 3TJJA 3P7XA 1G7EA 2WFCA 5HR3A 1HQOA 2R2JA 2WS2A 1OKTA 1DE1A 1F3AA 5CRWA 1K0AA 2DSAA 1J08A 5G31A 2H6XA 4AJ7A 2CAQA 2CZ3A 1YEXA 1O73A 2J23A 4MH2A 3UMAA 2OBKA 3SWLA 2C3TA 2I1UA 3FYGA 3HXSA 4NXIA 3ZYWA 4K7OA 1U3IA 3C73A 1MDKA 5IMCA 4E8EA 1ZOFA 1M2DA 5FHIA 5HFKA 4KUNA 2AB6A 2JACA 1SJZA 1SD8A 2LS5A 1Z7RA 1TRUA 5DJLA 4ZBBA 1XWBA 4ISDA 3ZITA 3RHBA 4MK3A 5KEJA 1GL8A 3M9KA 3H79A 1ZL9A 2YZUA 3SBCA 2YV7A 4IQ1A 2DJJA 4WR4A 4KE3A 4K9ZA 2CZ2A 4AGSA 2K18A 2VLVA 3PR8A 13GSA 1O6JA 2XBQA 5HR2A 1XIYA 5LD0A 3GH9A 1OE8A 4MPFA 2V32A 2VO4A 3CTGA 3TJBA 2ZNMA 4V2NA 1GTBA 1GH2A 2B1KA 4K7IA 1LJRA 2DIZA 3HHVA 3GH6A 3GIXA 2QKEA 1ML6A 4KNDA 4OFTA 3GSSA 4AF2A 5G1LA 5ECHB 3ZIJA 22GSA 2MMAA 2XBIA 4KA0A 1K0DA 3HA9A 5HQPA 2FNOA 4PX1A 2IMDA 5HFGA 4KDUA 3TKQA 1S3AA 4KDYA 1C72A 2CQ9A 3BCIA 2YN1A 5ECSA 1QXHA 4OO5A 1W4VA 5IO2A 4KCEA 4I97A 3LWAA 5B8AA 1QK8A 4EE0A 2E7PA 2H0IA 1X5EA 4FO5A 2EIQA 3IBHA 4YQUA 1WIKA 4WF4A 3FZAA 6GSVA 9GSSA 1K3LA 4WBRD 2C4JA 3UJ1A 5FWGA 2PVQA 4PURA 2YP6A 1TOFA 3QFAC 2C8UA 3ZL5A 4OFMA 5G30A 3VI5A 4TXOA 3GSTA 3M8NA 1K3YA 2VIMA 4V1Ap 2C1YA 5EPFA 4BPYA 1MD3A 2BJXA 3Q19A 4Q5NA 2MMZA 2JZTA 5G2ZA 3LGCA 1CQGA 3P90A 5A4UA 2AJQB 3LXZA 2VCWA 5CAXA 1F3BA 4HOJA 4YQVA 2HFDA 2E2MA 1ACVA 3EWLA 2YWIA 2B3SA 5ID2A 4TXOB 3C1RA 1BAYA 5J4UA 2HZFA 3ED3A 1AQWA 2ON5A 4TRXA 5A4VA 2C3QA 3F4SA 4IJIA 2GT5A 2DJKA 3BCKA 5IO0A 4DSRA 3WYWA 1TI3A 3LFLA 4ZB6A 4YAVA 3HJPA 3QMXA 1ERTA 4K7NA 4ECIA 2R5GA 1TU7A 5ID2B 1Q98A 4X0XA 4KDXA 4ZL8A 1SJ6A 4P3YB 2O87A 3VPQA 3ZMLA 4BVXA 2WJUA 4H86A 1OAZA 1MEKA 4TR4A 4N10A 3FY7A 3Q6OA 5HR1A 2REMA 4O92A 2MMOA 1K0OA 1OE7A 1YDKA 2CVBA 2B6MA 1ILOA 1O8WA 5CREA 4HJ2A 1GSDA 3J7Yk 2OKAA 4MABA 2H30A 5CRGA 2VM1A 2HZEA 2VCVA 4WETA 5DQYA 4L8EA 5F06A 3UARA 4PQHA 12GSA 3GKXA 1A0FA 3KXOA 1H75A 1GRXA 3LXTA 5ECKB 3VWXA 4PNGA 2B1LA 1OVNA 3MAKA 2VM2A 3D6IA 4KW6A 1GNWA 1BG5A 1M0UA 4XS4A 1HNAA 5H5RA 5B6NA 6GSWA 4EVMA 5DAKA 2HZEB 1IYIA 2VCTA 5GSTA 7GSSA 1Z3EA 2IMIA 4JE1A 3HCZA 1PL2A 1ERWA 2IPAA 3M3MA 4PNFA 1GTIA 3HZ4A 5J3RA 3N5OA 3KMOA 3DEXA 4XCSA 2KLXA 4OWYA 4MJAA 3EE2A 4XS4B 2H6YA 4MPGA 1YZXA 4HI7A 4YQMA 3P2AA 4GXZA 1XPVA 2OBIA 3EMXA 1VRSD 1OC8A 1TKDB 3F63A 4XRAA 1F9MA 3ERWA 3PH9A 2BTOT 2HNLA 1XWAA 3I6AA 3QOUA 1PGTA 2CX3A 2C0DA 4BWQA 3US3A 1T00A 3EU4A 1T8EB 3RAZA 2VL2A 3JCML 4KH7A 1K0CA 4POMA 1H4OA 2MYGA 2PERA 1EV9A 3RBTA 1QMVA 2LRCA 4OCFA 3WGEA 5CP1A 4KCAA 1AUCA 3IAS2 2RUFA 3IDVA 1S3DA 2VLUA 2EIOA 3ZFBA 2HT9A 3DKSA 4PGTA 1SL1B 2CAIA 1QFNA 4J2FA 1A2LA 3TOTA 1TRWA 1EEJA 2MBTA 2JSYA 3IHQA 4EUYA 5FT3A 1M2BA 1PX7A 3VWVA 1XFLA 3VFIA 1KBNA 2H8LA 3TKPA 2X64A 1A24A 2GQLA 4OMVA 4DEJA 2I3YA 3TGZA 1F6MC 2PWJA 2J9HA 4MZBA 2VL2C 2N5AA 3VPTA 1OC9A 4ZL7A 4PUAA 4IKHA 2A2RA 4F0BA 4ECCA 1GWCA 2PU9C 3M9JA 2RIIA 2DMLA 2IMEA 1VF1A 2RM6A 5CO3A 5AGYA 1T7PB 5D9WA 1T3BA 2B5XA 4LA1A 3NZNA 3IE3A 2D2ZA 3APSA 1GULA 4EDZA 19GSA 2DIYA 3GUSA 1QGVA 3LQ7A 5CRHA 1OC9B 4FH8A 3GTUA 1B9YC 3GX0A 5ECPB 1SENA 2GSQA 1LBKA 3F6DA 4ILFA 2OADA 1GSYA 4FYBA 3TCOA 1ZMAA 4LLRA 1Y6EA 4HQZA 4HZ2A 6GSSA 2YWNA 4EKZA 2G0FA 3KJYA 4HJMA 4ULXA 2YJ7A 3F6FA 2H1AA 3GTUB 1YKCA 5ECQB 4POKA 5C00A 4PQIA 1PD21 1ZZYA 2N5FA 1SYRA 4DVCA 1K0MA 3TUEA 1T1VA 1EEMA 3KD0A 4G2EA 3TJKA 2LRTA 4JR4A 4IN0A 1M99A 4ACSA 1Y25A 3BOAA 1V58A 1BX9A 1EOHA 1TJDA 2C3NA 2KP1A 2LNSA 5C04A 3LEFA 4F0CA 1ERVA 3IA1A 1KEBA 2FA4A 2V1MA 2V2GA 4K8MA 3APQA 1PX6A 4MP4A 1XW6A 3VWUA 2PUKC 2P5RA 2LQOA 3LSZA 1FB0A 4XHMA 2GSRA 3KGKA 3CXGA 2LJAA 3L9SA 16GSA 3W6GA 4FYUA 4ZB9A 1PRXA 1HNCA 3N9JA 3MNGA 3A2VA 2A4VA 4HDEA 4LMVA 4JEDA 5AIVA 2CX4A 3FZ4A 5LNKe 1F2EA 1WWJA 2JZSA 1ZGNA 5ECNB 1Z7PA 4ZBDA 3UAPA 1U3AA 3HYPA 1XW9A 1OYJA 1T4ZA 2O85A 2ZUPA 1GSQA 1MDJA 3UL3A 1HNBA 3IK7A 2DJ0A 18GSA 1GLQA 1JHBA 3L9UA 2YNXA 2H71A 3NIVA 2KP2A 5HR0A 2EC4A 3UVHA 3LG6A 5AIXA 1GSEA 1A23A 3IOSA 5D9TA 3QDNA 5JWOB 2YPMA 2Z9SA 5ECOB 2RUEA 5IIZA 4EF0A 3GURA 4IS0A 3TKRA 3GRXA 1UA5A 1J0FA 4L0WA 4F82A 5AN1A 1NW2A 4MH3A 2GQKA 1ON4A 1SU9A 2LRNA 5IOWA 2QSIA 5ECIB 4IELA 1PKWA 3PGTA 2QGVA 3GX8A 1ZYQB 2F3MA 2ES7A 3VWWA 4IQAA 5ABRA 2E2GA 2YZHA 5CYYA 5JCWA 1BQ7A 1GUHA 17GSA 4V2MA 1WMJA 3DXBA 2YANA 1PA3A 6GSXA 3WGXA 4NV5A 1JZWA 2V6OA 2IL3A 3DIEA 4GF0A 3ZRDA 1ZCPA 4IBPA 2CVDA 3EINA 4KAEA 3GKKA 1EV4A 3LORA 2WULA 3QD9A 1AXDA 2P0GA 4KSMA 4Q5QA 3MDKA 3G7JA 1V98A 1EWXA 3EYTA 4RQRA 1FOVA 2FWFA 2BMXA 3HVXA 2H73A 2GZZA 5E4WA 3UBKA 1FAAA 3EU3A 4XIHA 5JCUA 4XRDA 2AHEA 4Z7XA 3KH9A 2NTOA 5AISA 4I5QA 4NHZA 2PPTA 1UVZA 3F4RA 3FEUA 8GSSA 5KN1A 4ECBA 4ZBAA 1O85A 1GNEA 3DVXA 4X1UA 3KZQA 2V6KA 1B8XA 4MDCA 2GQMA 3RHCA 4KGIA 2VD0A 4QQ7A 2PMTA 1S3CA 2GVPA 2ZCTA 2LSTA 4E8HA 3M1GA 1NHYA 1PQNA 1XZOA 2ALBA 5ECMB 2L5OA 4I2TA 2OE0A 5GSSA 1RQMA 1B4QA 1AW9A 1WPIA 5ENUA 1E6BA 3BD2A 3P8WA 2LEGA 2F8FA 4MF5A 3D22A 1BYEA 1URMA 3ZFLA 3TKSC 2LJKA 4NPBA 2KHPA 3EMPA 3ZREA 4AJ6A 1EGOA 5JWQB 3RPPA 3AY8A 3H4KA 3HKRA 3WT1A 2DJ2A 1YQ1A 2N5BA 2YWMA 4ZIJA 4MMMA 2WDUA 4GSTA 3C7MA 4TKYA 3U5RE 4EO3A 4L0UA 3FZ5A 4MA9A 1R5AA 2GTUA 1THOA 3IPZA 1SK1A 2YWOA 4G9HA 4YAPA 3MSZA 1WJKA 2H74A 4MZWA 4GWRA 4HUAA 2PVOC 2H01A 3IR4A 2KUCA 3D5JA 1Z5YE 4ZILA 4IHUA 2CVKA 2JU5A 1XVWA 1ABAA 1VF2A 1YEPA 3TB2A 1W89A 1TK8B 1FVJA 3FR9A 3O76A 2IJYA 1K0NA 4POBA 1I9DA 5DVBA 3QAGA 1WE0A 1MD4A 4PXOA 3HJOA 4HQSA 3DD3A 4MZCA 1T4YA 4BWSA 2H1DA 4G19A 3GL3A 2GGTA 1Z6MA 3H1NA 2MZCA 2V41A 2DC5A 4IP1A 3VLNA 3CTFA 5DAKB 3A5WA 2GT6A 1SK2A 1M9BA 4OCEA 3ZTLA 3J7Yb 1OC3A 4FIWA 1JZDA 3WGDA 4XTSA 4K1FA 3DRNA 4QL7A 2FLSA 4IP6A 4V2LA 4HZ4A 2H0GA 2IWTA 2H66A 1EP7A 1VF4A 3ZIVA 1RW1A 3GKNA 5F8BA 4TN8A 2TIRA 3HVVA 3RDWA 2VCZA 3TRXA 2TRXA 4AJ8A 2VOCA 3UEMA 4WBJA 3FRCA 3W8JA 1YF0A 3C71A 1SD9A 4L5LA 1DE2A 4F2IA 4POLA 4WKWA 2H6ZA 3F0IA 3Q74A 1AC1A 5DBQA 4D73A 2CV4A 3Q18A 4HU9A 3TKSE 4QL9A 4F9ZA 1K0BA 1DSBA 4CW9A 3K8NA 1R26A 5H5SA 1EOGA 2IMKA 1GSSA 4OFNA 2JZRA 5DJMA 3D21A 2JSZA 5J41A 3DMLA 3G7YA 3ME8A 5F07A 3FW2A 3C1SA 4D73B 1ERUA 2F8AA 3KTLA 1TDIA 3R2QA 2H70A 5JWRB 3F8UA 5JCGA 1XBSA 2NPBA 2PN8A 3F3RA 3H8QA 3IK9A 4PQ1A 1VF3A 20GSA 11GSA 1PMTA 1USBA 3ERGA 1U87A 2GLRA 2G2QA 1FW1A 1WRYA 1JZRA 4MF6A 2VL3A 1TRVA 1R7HA 5KN2A 5INYA 1DUGA 1UN2A 3UBLA 3E9JB 1O7UA 2XPDA 4N0VA 5D9VA 3ME7A 5KN3A 2XHFA 2GDRA 1PSQA 2XC2A 2AAWA 1SYXA 2RM5A 3I43A 1TU8A 5GZZB 2H76A 1FHEA 3ISOA 1MDIA 3GMFA 2H19A 4O5RA 2A2SA 1B48A 2LQQA 2AUVA 5GAND 2FGXA 3KH7A 4TR3A 4DSSA 4K2DA 4N11A 2VCXA 3QCPA 3H93A 2B7KA 1R4WA 2FD3A 2JL4A 1QUWA 2YJHA 3KTBA 2CT6A 2E0QA 5IMAA 2O89A 3FR3A 3TRQA 3HZ8A 3GV1A 4MJCA 3KIJA 1PKZA 2I9HA 1XVQA 1UC7A 5GAPD 1SKRB 1EZKA 4DSSB 4GQCA 1J9BA 1ZYEA 2DJ1A 6GSTA 3G9BA 4OD7A 2FHEA 4G10A 2FA8A 4I2UA 2IFQA 1XWCA 4N0ZA 1GLPA 3IV4A 1M7TA 4KSOA 2P5QA 4X43A 5D93A 5IMFA 2WGRA 4TXVA 2M72A 3F3QA 4I8BA 3S9FA 1M9AA 3G7IA 1U6TA 1PL1A 3OR5A 2HSHA 5J5NA 1EGRA 4HU7A 4WEYA 4GCIA 5EL8A 1A0RP 2QC7A 5B8BA 4N30A 4GRFA 2IFQB 3CSIA 4JZQA 4JBBA 4GSSA 2M46A 4NWYA 2VCQA 3NOFA 2H75A 3DVWA 1VGLA 1PN9A 3TJGA 5J9CA 3L0HA 2L57A 3BJ5A 4ECJA 1FVKA 2B5EA 5D73A 4K0GA 1TK0B 2WB9A 2WCIA 3DWVA 4LL4B 1DBYA 2PBJA 4KX4A 3LYKA 3D0ZA 1YKAA 2C80A 4KB3A 14GSA 2OE3A 1YF1A 4FYCA 3D4MA 1B4PA 1AIUA 5DQSA 3GFKA 1IYHA 4ML1A 3WD6A 4EDYA 2H1BA 2GZPA 2JADA 4ID0A 3CYNA 3CRTA 5B7CA 3CSHA 4O7HA 3QPMA 2C0EA 2RLIA 3FK8A 3ZVJD 2B5YA 2F9SA 5D9XA 3M0FA 2NBSA 3UVTA 4EXJA 2AV4A 3KP9A 4XS6A 6GSYA 1TI1A 4NHWA 1MTCA 5EY6A 2IN3A 3QFBC 4ZB8A 4TW5A 2NDOA 1GTAA 3FZ9A 3QR6A 3VI7A 1XCCA 1JLVA 1AQXA 3HVSA 4K6XA 4WXTA 5ECRB 3CSJA 2C0FA 1G7OA 3RPNA 3GN3A 2FWHA 3CBUA 3EC3A 3ZLPA 1E2YA 2DJ3A 1A8YA 2R4VA 3LYPA 3GA4A 1XWKA 3KCMA 2H72A 2R3XA 4L5OA 5G5FA 2LTKA 4J57E 3ERFA 3A2WA 1GUMA 1B9XC 5E59A 3A3TA 1OKDA 3IAM2 3GNJA 1Z9HA 5H5QA 4BA7A 3O6TA 3W8SA 2L4QA 4JRRA 5DALA 1X0RA 2F51A 5LCZA 4RI7A 1SK0A 3TKSA 3O3TA 4K0NA 4HS1A 4NV2A 2I81A 2HXKA 4BVYA 3HDCA 1NM3A 2DMMA 3A2XA 1HD2A 1X9WB 4TR0A 2PGTA 2P31A 2C0GA 1N2AA 1CQHA 1NHOA 5DALB 5ELGA 2K8VA 1FB6A 4ML6A 2MMNA 2R6KA 10GSA 2FWEA 1TXXA 1V9WA 4MJBA 1XWGA 1F37A 4JR6A 3VURA 1O8XA 3GHAA 2GSTA 4EC0A 3HJMA 2LKUA 3GL5A 4ZXGA 3FHKA 4WF5A 4MLYA 1LU4A 1V57A 2O7KA 1GSFA 1TTZA 4NMUA 2L6DA 1QQ2A 1EP8A 1Q4JA 1KTEA 2CA8A 2K8SA 2IIYA 2VL9A 1NSWA 4DSQA 2LNTA 1SKWB 4JU5A 5IOXA 3CRUA 5A5KA 5IQYA 4CDOA 2L59A 3L9VA 1XOAA 2B7JA 6GSUA 3HY2A 3E0UA 4NAXA 1SKSB 3CMIA 1ST9A 1JZOA 3ZVJA 4IW9A 2L5LA 5DDLA 4IGJA 2L6CA 1G6WA 1WP0A 3ZZXA 4EL1A 1SL2B 2X8HA 1TK5B 5G1KA 1JFUA 5G5EA 3L78A 4RUVA 3D4TA 5IMZA 1I5GA 2ON7A 3PINA 5IPGA 5EVOA 1G6YA 2GZYA 1GSUA 1JLWA 2MBSA 3GKMA 1X9SB 5CRDA 2XPEA 3C8EA 5KN0A 2KOKA 5DCHA 5IMDA 3I69A 1KNGA 4TR1A 5L71A 3E3EA 3ZMKA 2VUPA 2HSYA 3F9UA 2NVLA 3WT2A 3DGQA 2X8GA 3BBYA 1U88A 1GUKA 1AAZA 3UOMA 2X8CA 4O32A 1TRSA 1HYUA 5COHA 1A2MA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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