2E2MA

Crystal structure of archaeal peroxiredoxin, thioredoxin peroxidase from aeropyrum pernix k1 (sulfinic acid form)
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
240
structure length
235
Chain Sequence
SIPLIGERFPEMEVTTDHGVIKLPDHYVSQGKWFVLFSHPADFTPVTTEFVSFARRYEDFQRLGVDLIGLSVDSVFSHIKWKEWIERHIGVRIPFPIIADPQGTVARRLGLLATHTVRGVFIVDARGVIRTMLYYPMELGRLVDEILRIVKALKLGDSLKRAVPADWPNNEIIGEGLIVPPPTTEDQARARMESGQYRSLDWWFCWDTPASRDDVEEARRYLRRAAEKPAKLLYE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Probable peroxiredoxin
publication title Oxidation of archaeal peroxiredoxin involves a hypervalent sulfur intermediate
pubmed doi rcsb
source organism Aeropyrum pernix
molecule tags Oxidoreductase
total genus 71
structure length 235
sequence length 240
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2006-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 2e2mA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2e2mA01
4ID0A 1FB6A 5IPHA 1VGLA 1BYEA 1T7PB 5FT3A 3F0IA 4D73A 3LFLA 4MH2A 2V2GA 1JZOA 4ML1A 3WGDA 1HNAA 3GURA 3CMIA 1MD3A 1FVKA 1EOGA 2LRTA 1ZOFA 4E8HA 1EEJA 4MJCA 2YWMA 2DBCA 3TRQA 5ECMB 4ZILA 5ECQB 3ZIJA 3CXGA 2DMMA 4ECBA 4AGSA 2M72A 1XCCA 1QXHA 2MMOA 4HZ4A 3PR8A 1O6JA 1PQNA 1AXDA 1GP1A 5D93A 2O85A 3ERFA 1GUMA 4RI7A 1NHYA 1NHOA 3V1WA 5IMDA 4XS4B 1G0TA 4N0VA 4TKYA 1UC7A 3QCPA 1ZGNA 5HFIA 3NIVA 1VF4A 8GSSA 4PNGA 3CTFA 4BVXA 3HA9A 2NVLA 4WF5A 1SKRB 4JR4A 2CT6A 1PSQA 3W8SA 4K2DA 5J9BA 3WGXA 1ERWA 5DBQA 1SK0A 1X0RA 2X64A 3CRTA 3VLNA 3TDGA 3TJKA 3GIXA 2FUG2 1H75A 4DEJA 2GQLA 1PX6A 1M0UA 2DMLA 5CYYA 5J3RA 1PN9A 3M8NA 3TRXA 1WIKA 2H6YA 1GULA 4Q5QA 3TKSE 1XBSA 4NPBA 1KNGA 3EVIA 2WGRA 1QFNA 1YKCA 3MWHA 4IQAA 5IO2A 3KD0A 4IP1A 2H73A 1THXA 2V1MA 1T4YA 2YV7A 2GGTA 2VCXA 2A2RA 1WP0A 4MF6A 4QL9A 3LSZA 1V98A 1A23A 1ZZYA 2KP2A 3VPQA 2H70A 4PURA 3CBUA 2KP1A 3D22A 1XFLA 5CREA 1QK8A 3RDWA 1WOUA 3BD2A 4L8EA 4K6XA 2I4AA 5ELGA 1XW5A 2BTOT 3UJ1A 3DRNA 1UVZA 5ECSA 3A2XA 1X9MB 2R2JA 2OBIA 2L4QA 5B6NA 4PUFC 3HYPA 14GSA 5IPGA 4EF0A 4NHZA 1PGTA 2OKAA 2CVDA 2C3NA 1GSSA 2TRXA 1Y25A 4Q5NA 2YNXA 3HJOA 5IIZA 2GDRA 3IC4A 2YV9A 4G19A 3LJRA 3TJFA 1FO5A 3L4NA 1DE2A 3F4TA 2AHEA 2L5OA 2TIRA 2XBQA 2LKUA 1YKAA 3ZFLA 5AISA 2GSRA 2O89A 3UL3A 1A2LA 4HJ2A 2I81A 2KOKA 2GSSA 3P2AA 5IMVA 1BX9A 2IMKA 4MH3A 4IVFA 2LUSA 2VIMA 1AQVA 3VFIA 1R5AA 1F3BA 1Q4JA 1A2JA 13GSA 1TXXA 3US3A 3AY8A 4XIHA 5JCWA 3QAWA 1SL0B 1JZRA 2GLRA 2HYXA 5G31A 5CNWA 1GSDA 6GSXA 2HXKA 2IMIA 5J4UA 4PQ1A 4WF4A 4WBJA 4WKWA 4P3YB 2EIRA 1NSWA 5ECNB 4IS0A 2CA8A 4J2FA 2B5XA 1FVJA 4MCUA 1ZYEA 1TU8A 5D8IA 2HLSA 4TR4A 1PKWA 1O8WA 4GWRA 3ZMKA 2NPBA 3FKFA 3BCIA 1DUGA 2Z9SA 4HU7A 3J7Yk 3D6IA 2GSQA 4N30A 1ABAA 3O76A 4L0WA 1EGRA 4KB3A 4KSOA 5IO0A 4CHSA 2AV4A 4OO4A 1SYRA 4Q5RA 3F63A 4MPFA 2WDUA 3QR6A 1PX7A 4HQSA 3ZMLA 3U6VA 4GCIA 2VCWA 4TR0A 2GT6A 5HFKA 4JR6A 4LLRA 1I9DA 2VCVA 4IQ1A 2AJQB 3H8QA 2PVOC 3EC3A 4NAXA 4TXOA 2VLVA 2IWTA 4MA9A 4ZXGA 1ERVA 2DJJA 5CRWA 1YQ1A 4EC0A 2V6OA 1PMTA 5ECOB 3GX8A 1OE7A 2MMNA 2ZCTA 5DVBA 2KUCA 1EV4A 1W4VA 2IFQB 5GZZB 1A0FA 2YWOA 3C1SA 2AAWA 3GTUA 2I9HA 3KH7A 4MABA 1R4WA 3M0FA 1PA3A 3CYNA 3IBHA 4MLYA 5B6MA 4FYUA 4YAPA 2ES7A 1GSFA 4XRAA 2R6KA 3LQ7A 5EVOA 2FD3A 2GQMA 4JE1A 1GTAA 5F07A 2DC5A 2L6DA 3E3EA 4MK3A 2B3SA 2N5BA 1G6YA 2F8FA 17GSA 4JBBA 2H0GA 4KW6A 1SJIA 4ZB8A 1A2MA 2WULA 4TR3A 2JU5A 1M99A 2E2GA 2NDOA 5ELAA 1JFUA 5HFGA 2GSTA 4IJIA 6GSTA 2CVKA 4N10A 3LYPA 2X8CA 4FO5A 3GX0A 3IAM2 3TKSC 2ON7A 4K0NA 2JZRA 3MSZA 4BVYA 2I3YA 1S3CA 2QC7A 4AJ6A 2OA7A 2GZPA 3CSJA 2GQKA 4PQIA 3DVWA 2E2MA 2CX3A 5DAKA 4V1Ag 1PL1A 2FA4A 5DJLA 3FZAA 3HKRA 3DXBA 2VL2A 3WGEA 3C71A 3HZ4A 3G7YA 1K0DA 2BJXA 5G5EA 5GAND 2L59A 4JEDA 2JACA 3GSSA 1MD4A 4OFMA 3EYTA 2VAFA 3EU3A 3IK7A 2OJLA 3ISOA 3PGTA 3L0HA 5ECLB 2C0EA 3QPMA 5A4VA 5ECKB 1SYXA 3NZNA 2VLUA 1XVQA 1MTCA 3HD5A 4LMWA 1A8LA 3TB2A 1OE8A 1V40A 2PGTA 2ALBA 2HFDA 4O92A 2LTKA 4WXTA 1F9MA 3DVXA 3WT1A 1V9WA 1UA5A 2HZEA 1K0AA 2VD1A 1C72A 2DJ1A 5H5QA 2PPTA 5DALA 4YAVA 4E8EA 1K3LA 2L6CA 2YN1A 16GSA 1AQWA 1O85A 1VF1A 3IOSA 1LBKA 3I69A 2LV3A 5DCHA 4ACSA 4NV5A 2O8VB 3RBTA 3UMAA 4LA1A 3KMNA 3M9KA 3ZVJD 5ECPB 4PXOA 1R5PA 3GYKA 2D2ZA 5CRHA 3WD6A 4ZL7A 2VCTA 3KCMA 20GSA 3PINA 1S3AA 2H1GA 2JADA 5D96A 3HXSA 4OMVA 5E59A 1Z9HA 3U5RE 3GMFA 1GRXA 2H0IA 3HVVA 2M46A 3RPPA 3P90A 4HZ2A 4ZB6A 3EE2A 4POBA 1E6BA 3ZITA 18GSA 2MZCA 3FHKA 12GSA 3WYWA 4NWYA 2GZZA 4NHWA 2IMFA 3TKQA 4BPYA 2EC4A 4KDUA 3FYGA 4O32A 5HQPA 5E4WA 1GH2A 2K9FA 2PBJA 3RPNA 2H8LA 1PRXA 1TJDA 2H72A 3N5OA 3TKPA 3GKNA 2MMAA 3L9UA 5D9XA 3VK9A 1R7HA 3ZYWA 2WRTA 3OR5A 1MDIA 4HEA2 1K0CA 2M80A 1IYIA 5ECIB 5ECHB 5IMZA 1TDIA 1AC1A 4MZWA 3EINA 1YF0A 2F9SA 1AAZA 2DLXA 2H1BA 3IR4A 3QD9A 2J23A 5D9TA 3LGCA 3C8EA 1VF2A 1XWGA 1HNBA 2LQOA 2K8SA 4XHMA 5IOWA 3LEFA 2XHFA 3GSTA 5D73A 2VCZA 2GVPA 4KAEA 1U87A 3LG6A 4N0ZA 2HSYA 1FAAA 4N11A 3KZQA 4V2NA 4F03A 4OFTA 1M2DA 2F51A 4AJ7A 2DIZA 3BCKA 5KN0A 1XVWA 22GSA 3ERGA 3S9FA 3Q19A 1LU4A 4F0BA 5HR1A 3APOA 4TRXA 4OCFA 1SENA 1X5DA 3GKKA 4KCAA 3GUSA 1WE0A 3KTLA 2PERA 2CV4A 5L71A 2XPEA 4RQRA 2WZ9A 2H75A 3TOUA 3QFAC 3F3RA 3H79A 2FWHA 1FB0A 5DJMA 5JWRB 1O8XA 4K8MA 5DDLA 2C3TA 4IP6A 3FZ5A 5EY6A 2X8GA 3NOFA 2ON5A 3GFKA 3KM6A 3G9BA 4ILFA 4D73B 4MP4A 2BMXA 2OACA 3IAS2 2VM2A 3UEMA 3E0UA 4BL7A 1SJ6A 1ERTA 2YANA 4F0CA 3VURA 3KXOA 2QSIA 3RAZA 1GNEA 1SD9A 1EP7A 1Z7PA 1ML6A 2X99A 3GL3A 4ML6A 3EU4A 3VWVA 2IFQA 4HU9A 1MDJA 1JZWA 3HVSA 2FNOA 1M2BA 4MDCA 5G30A 4POLA 3TCOA 1GUHA 2VM1A 4EKZA 2JL4A 1HNCA 4FIWA 4HUAA 1XWKA 4ISDA 3DEXA 2VUPA 4KNDA 2V6KA 5HR0A 2F3MA 1GSYA 1WPIA 1RK4A 5JCGA 1TKDB 5CP1A 1VF3A 1GTUA 3LXTA 1J9BA 3ZVJA 1QUWA 1TW9A 4DSSA 2RLIA 1TI3A 1B9XC 4K0GA 5EPFA 3IRAA 4EL1A 1T4ZA 2VD0A 3KIJA 4I6XA 2LJKA 4GF0A 3ZLPA 2LNSA 1T1VA 4EDZA 4GTUA 2PVQA 5IQYA 1ZMAA 3RHBA 2VL3A 1TP9A 3UVHA 4ULXA 4EVMA 3G7IA 5CRGA 3J7Yb 2LQQA 5H5SA 2CZ3A 2WFCA 2H6XA 2GZYA 2B7JA 1RW1A 2H1DA 5D9VA 2HSHA 4MF5A 1K0NA 1OC8A 1F6MC 2F8AA 2FGXA 3GV1A 5LNKe 4YH2A 1UN2A 3BOAA 1B4QA 3FEUA 4PX1A 3CSIA 2R5GA 1M2AA 3HJPA 3M9JA 2B5YA 3HVXA 2YPMA 1XPVA 2AB6A 1ZYQB 4ZB9A 4I5QA 5KEJA 5AGYA 1EWXA 2QGVA 2C8UA 5IMCA 2XC2A 2REMA 2N5AA 3P8WA 3Q6OA 3I6AA 2R4VA 1K3YA 4MPGA 3UAPA 1XW9A 2LJAA 1GSEA 3TOTA 3KJYA 1OC9A 2JZSA 1GLQA 2JSYA 1JLWA 1Z6NA 5JWOB 2GS3A 5G5FA 1FW1A 1J0FA 1OKDA 4HDEA 1F3AA 3RHCA 11GSA 2IMDA 3DIEA 4XTSA 3APQA 3L78A 1FOVA 4KE3A 3IA1A 3CTGA 2MYGA 1QGVA 1DE1A 4HQZA 1U6TA 1M9BA 3TJJA 3UBKA 1TU7A 3TJGA 4IW9A 4RQXA 3VI5A 1S3DA 3VWUA 5H5RA 4V2MA 5ENUA 1GSQA 5ID2A 1SKSB 5IM9A 1EP8A 1PD21 2H74A 4K1FA 2N5FA 5A5KA 3H4KA 1X5EA 3N9JA 1M7TA 1EOHA 2C3QA 2OE3A 4EXJA 2IMEA 1Y6EA 2JSZA 2E7PA 1GLPA 2C0GA 1FHEA 2C0FA 2H71A 1V57A 3FR6A 2RUFA 3EMXA 3KMOA 1N2AA 3QAVA 2CVBA 3MAKA 4L0UA 5B7CA 1WMJA 3ME7A 3D21A 4GXZA 3IK9A 1G6WA 4GQCA 1HYUA 2CAQA 1MDKA 4BWQA 4HOJA 4KA0A 3UVTA 2YJHA 3P7XA 3F9UA 1GTIA 3MDKA 3HZ8A 1U3IA 3DGQA 4F9ZA 2YWNA 3KP9A 3C1RA 1B9YC 3M1GA 5F06A 3UOMA 1YY7A 1OVNA 1XZOA 1TRUA 5AIVA 3BJ5A 2K8VA 5CO3A 2AYTA 1CQGA 4OWYA 5DQSA 3TUEA 3SWLA 4XS4A 4KH7A 1EEMA 2LEGA 3W6GA 5FWGA 2MBSA 3LWAA 2H30A 4XS6A 3IXRA 2C80A 4MZBA 1GUKA 1URMA 5A4UA 4K7OA 4X1UA 3ED3A 1B4PA 2K6VA 1EZKA 4YQUA 3HY2A 1K0MA 4IGJA 2HRNA 1YJ6A 4I2UA 2L5LA 4PQHA 2H6ZA 19GSA 1BQ7A 1BEDA 3BBYA 3ZIVA 1T00A 3GNJA 4K9ZA 5F8BA 1YZXA 3TKRA 5ECRB 5B8AA 2YCDA 1BAYA 3FK8A 2FLSA 3GKMA 5LCZA 1PKZA 2DIYA 3UIWA 1ZL9A 4ECCA 1TK5B 4TOPA 2NBSA 3GTUB 1T3BA 9GSSA 1U3AA 4WR5A 3EURA 3GA4A 1SL1B 3FR9A 4XCSA 2C1YA 3DMLA 1IYHA 2LNTA 2O7KA 3KP8A 4FYBA 2GTUA 3GH6A 3A2VA 1SKWB 5IMFA 4MF7A 3GHAA 1Z5YE 4IJ3A 3KTBA 4OD7A 1GNWA 1WWJA 3D4TA 1OYJA 4G10A 2B7KA 4L5LA 3TGZA 5IOXA 2O87A 5J9CA 2IN3A 4ZL9A 4TVEA 2OADA 2DSAA 4GSTA 4XRDA 4NV2A 2HI7A 4MJEA 3KEBA 3HJMA 1KBNA 4KCEA 2HNLA 2PMTA 2LS5A 1HQOA 3EWLA 1NM3A 4O5RA 1AIUA 2LSTA 2JZTA 1OKTA 2NTOA 3GRXA 3PH9A 4I2TA 4TN8A 1G7OA 1CQHA 4K7NA 1YEXA 3E9JB 4Q5FA 5F0GA 2FWGA 2B5EA 4AF2A 5DAKB 4DSRA 4DSQA 2B1KA 5J41A 5GAPD 1E2YA 2PN8A 2IIYA 2X8HA 2VL9A 2P31A 1N8JA 2DJ3A 2P5QA 1USBA 3UBLA 1ZCPA 4I97A 2HT9A 1O7UA 3SBCA 2L4CA 4QL7A 1BJXA 5C00A 3Q74A 4EO3A 4GQFA 4BA7A 5EL8A 4EUYA 3D5JA 3G7JA 2J9HA 2RM5A 1JLVA 4EE0A 3VPTA 1NW2A 4IKHA 3ZFBA 4GLTA 4TR1B 5A4WA 3D4MA 2H76A 3MNGA 3I43A 2HZEB 3FZ4A 4X0XA 2YJ7A 2YWIA 1TK0B 5DALB 4ZBDA 3FR3A 1ACVA 3DD3A 4JZQA 2VL2C 2IPAA 4K7IA 1ON4A 1MEKA 3HCZA 4ECIA 4OO5A 4CW9A 6GSWA 3GKXA 1V58A 2AUVA 4IBPA 4ECJA 5G1LA 4G2EA 1YEPA 3TRPA 5LD0A 3ZRDA 2YP6A 3IDVA 3IPZA 4I8BA 3K8NA 4BWSA 2MMZA 1GWCA 5KN3A 7GSSA 2K18A 4J56E 3LXZA 3A5WA 3TKSA 4WETA 4Z7XA 4NMUA 4MMMA 3O3TA 1ILOA 3APSA 4ZBBA 1BG5A 4KDXA 1X9WB 1VRSD 4KX4A 2RUEA 2FY6A 3HHVA 2EIQA 2WS2A 1M9AA 1K3OA 1TTZA 1QMVA 1AW9A 2FHEA 1AUCA 4V1Ap 5JWQB 1SU9A 1THOA 3H1NA 1F2EA 4DVCA 3CRUA 2G2QA 2YZHA 2B6MA 3C7MA 3CSHA 3ERWA 1K0OA 2FWFA 3QFBC 1RQMA 1XOBA 2ZUPA 2PU9C 5KN1A 4JU5A 1QQ2A 5G1KA 3KH9A 4WEYA 2IJYA 4YQVA 6GSVA 1OAZA 3DWVA 5COHA 2VCQA 2GT5A 1TRSA 2OBKA 5C04A 2PUKC 1TRVA 2RM6A 3IE3A 2CAIA 1HD2A 2QKEA 2FWEA 3L9SA 4GRFA 4HS1A 4X43A 5CRDA 5DCGA 5HR2A 4MZCA 4GSNA 4MJAA 1V2AA 3QAGA 3FZ9A 2DJ2A 1EV9A 1O81A 3FRCA 5INYA 1KEBA 4EDYA 1I5GA 1XOAA 2FA8A 1WJKA 1J08A 3ZTLA 2LJRA 1XW6A 2LRCA 3F6FA 5GSSA 5HR3A 3F8UA 1DSBA 2E0QA 1X5CA 1Z6MA 2H19A 2TRCP 2EIOA 2A4VA 1A0RP 1GL8A 3EMPA 6GSUA 4XS1A 3DKSA 4JRRA 3IV4A 4WR4A 3QOUA 3QMXA 4IHUA 2VLTA 4PGTA 3D0ZA 1Z7RA 2YZUA 2B1LA 6GSYA 3GN3A 2FCHA 2KHPA 1JHBA 3L9VA 2CX4A 1T8EB 2LRNA 3GH9A 4F82A 1U88A 4HI7A 2IL3A 3I9V2 1FG4A 3A3TA 1XWBA 4J57E 10GSA 1SL2B 2WCIA 4FH8A 1TRWA 2H01A 1TI1A 1YDKA 4GSSA 4PNFA 3F3QA 2XBIA 6GSSA 4AJ8A 2YOIA 4OCEA 1KTEA 5AN1A 4MJBA 2OE1A 2OE0A 1O73A 4ZBAA 1LJRA 3FY7A 2PWJA 5F05A 3ZREA 2R37A 1XIYA 5JCUA 2KLXA 1SJZA 3KGKA 4LMVA 1X9SB 4O7HA 1OC3A 2DJKA 3R2QA 1DBYA 4RI6A 1JZDA 5G2ZA 3VWXA 3QDNA 3W8JA 2VOCA 1AQXA 2CZ2A 2G0FA 4DSSB 4L5OA 4PUAA 2MBTA 4V2LA 5AIXA 2RIIA 1PL2A 5GSTA 1SK2A 1K0BA 2HRFA 1SD8A 4F2IA 1WRYA 5ABRA 5B8BA 2HZFA 2C0DA 2WJUA 3TJBA 4ZL8A 3O6TA 1TOFA 1SK1A 1F37A 2C4JA 3A2WA 3F4SA 5KN2A 3F6DA 2P5RA 1GTBA 3VWWA 4IN0A 3H93A 3HDCA 1XXUA 4ZIJA 5D9WA 2H1AA 5CAXA 3JCML 1A24A 4POKA 4LL1B 1YF1A 3F4RA 3M3MA 4KGIA 3VI7A 4KUNA 3WT2A 4WBRD 1A8YA 4TW5A 2H66A 2ZNMA 4TXVA 4NXIA 2DJ0A 3C73A 3FW2A 2P0GA 3UARA 1W89A 4FYCA 2L57A 1B48A 3DYRA 1OC9B 2R3XA 2H0HA 1ERUA 2XPDA 4YQMA 2VO4A 3Q18A 4G9HA 4RUVA 4TXOB 3ZL5A 2I1UA 5FHIA 2V32A 3GL5A 4TR1A 1EGOA 1GSUA 2WB9A 1R26A 1XWAA 3ZZXA 1B8XA 4HJMA 5J5NA 4LL4B 2HE3A 2A2SA 2CQ9A 4POMA 5IMAA 4IELA 1Q98A 2V41A 4QQ7A 3ME8A 3IHQA 1H4OA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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