1F6MC

Crystal structure of a complex between thioredoxin reductase, thioredoxin, and the nadp+ analog, aadp+
Total Genus 21
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
21
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPSKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords THIOREDOXIN REDUCTASE
publication title Twists in catalysis: alternating conformations of Escherichia coli thioredoxin reductase.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Oxidoreductase
total genus 21
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence D, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1f6mC00
4TR1A 2P5RA 5ELGA 5LNKe 3LXTA 4ECIA 4WEYA 2YNXA 1YF0A 5F05A 1UN2A 2OBKA 3WYWA 5B7CA 3IAM2 2N5AA 4MH3A 4MA9A 2VCVA 4K0NA 2RM5A 2XPEA 1O8WA 1Y6EA 1YJ6A 3L0HA 3DVXA 2ZUPA 3ZRDA 1SU9A 1RK4A 3UJ1A 3F9UA 4Q5NA 3EURA 3RHCA 1YDKA 4OFTA 4FIWA 3QAWA 3DWVA 1RQMA 3ERGA 5GSTA 2B3SA 3GUSA 1G7OA 2GTUA 2CA8A 2HZEA 2GVPA 1Z6NA 2TRCP 3QAGA 2XBQA 2Z9SA 3TKQA 4ULXA 1MD3A 3QR6A 2HSHA 4NMUA 4O5RA 1K3OA 3P8WA 4K7IA 2VUPA 2DIYA 5CRHA 1DUGA 5E59A 1A2LA 4LL4B 1NHYA 2A2SA 2DJ1A 2LTKA 1GUKA 5CAXA 1X0RA 4IP6A 3EINA 1AW9A 4NPBA 2YV7A 1JFUA 2VIMA 3UIWA 1V98A 3EMXA 1QXHA 3C71A 3GHAA 1UC7A 4HS1A 4TW5A 1BEDA 4X1UA 1GNEA 1ZYQB 3H8QA 4HZ2A 2RM6A 2NBSA 3M8NA 4KB3A 1A23A 4ZBBA 2OBIA 1PN9A 4MZBA 2DMLA 1U6TA 2H66A 2VLVA 3GX8A 1ZMAA 3LG6A 1TRSA 3KXOA 2OE0A 4H86A 4CW9A 4ECCA 4EE0A 2DJ3A 5ECQB 1G6YA 1V40A 3PINA 1MDKA 2FY6A 4PUFC 1B4PA 2MMAA 4YQUA 1GL8A 4N11A 1MDIA 3HVSA 5DQSA 3Q74A 1XBSA 5CYYA 1XIYA 2LJRA 4G2EA 4K1FA 1TRUA 1SK0A 4J2FA 4E8HA 2H0HA 2WS2A 3FYGA 5HR1A 1K0DA 5IOXA 2L4CA 1YEPA 3VWXA 2XPDA 2RIIA 3DXBA 1GTUA 5IPHA 4MJAA 3TUEA 3GTUB 4WR5A 2CAQA 3MNGA 3O6TA 2V32A 1AC1A 2WZ9A 1XWKA 3D22A 3TOTA 1B4QA 3GTUA 1AQVA 2GZPA 1X5CA 1QQ2A 2QSIA 3RDWA 2AJQB 4XS6A 4G10A 1TU8A 1V57A 4KUNA 2VD1A 2F8FA 3C73A 5ECIB 2MBSA 3W8SA 4WBRD 3CSHA 3S9FA 1K0OA 1K3LA 2YOIA 3D5JA 1NM3A 3P7XA 3GKMA 4I97A 5CREA 3ZZXA 1XCCA 3IPZA 5AISA 2VCQA 4I6XA 2K8VA 2OE1A 5G31A 4MF7A 1AQWA 3VWVA 1FO5A 3KH7A 3UVTA 3GL5A 2CQ9A 4TKYA 4GRFA 5ELAA 1OC8A 3TJBA 2EIQA 3DMLA 2LUSA 2I4AA 3RHBA 1GWCA 1DBYA 4HOJA 1M7TA 3D0ZA 4LLRA 1YF1A 4PXOA 2WDUA 4AJ8A 2MYGA 4KE3A 2EIOA 1I5GA 4KCAA 4ZL9A 3D21A 4PQHA 5ABRA 2O85A 4OWYA 1M2DA 4MZWA 3VWWA 3EU4A 2LNSA 1A2JA 4TXOB 2CX3A 1UVZA 1WP0A 2B1KA 3EVIA 2RUEA 4IELA 3HZ4A 3FR3A 3UOMA 3BJ5A 5G1LA 2HRNA 2EC4A 4HI7A 4HJ2A 4FH8A 3I9V2 4PGTA 4OO4A 3HXSA 1FVJA 1ZGNA 4L5OA 2IMIA 4IJ3A 2DBCA 2BTOT 4JR4A 3SWLA 1ON4A 3E3EA 1BYEA 1GRXA 3Q18A 3BBYA 2KLXA 1E2YA 6GSVA 4IQ1A 2R4VA 4OFMA 4F0CA 3RPPA 1JZRA 1B48A 4BA7A 5JCWA 3IBHA 2D2ZA 2E7PA 2I9HA 5J4UA 1A8LA 5F0GA 2CZ3A 3ZITA 4GSNA 5J3RA 3F3RA 2IWTA 3TDGA 2PU9C 2O89A 3MWHA 2O7KA 1O85A 2I81A 2EIRA 1A8YA 4BVXA 4TOPA 2PUKC 1J0FA 3ZVJD 4GSSA 4KGIA 17GSA 1X5EA 3Q6OA 2CVBA 2FGXA 4X43A 3IRAA 3GSSA 2JU5A 2YZHA 2ZNMA 4V2NA 2F51A 5DDLA 2QC7A 3DRNA 2K18A 4V2MA 1ZL9A 2H1BA 5IPGA 2L5LA 1QK8A 2V2GA 11GSA 2VAFA 3TRQA 1U88A 4NHWA 2J23A 3KZQA 2LRCA 5B8BA 3F63A 2B1LA 3BOAA 1KBNA 4E8EA 3C8EA 2H76A 4TRXA 2TIRA 2LNTA 3J7Yk 1EEMA 4RUVA 1KTEA 3A2XA 2V1MA 4KDUA 5A4WA 1TKDB 1XPVA 2PN8A 3RPNA 2IMEA 5ECKB 2JZSA 3M9KA 2GZZA 3WT1A 2LEGA 3KH9A 4IS0A 3CBUA 3IHQA 5COHA 3ZIJA 4RQRA 5J5NA 5ID2A 1Q98A 5EY6A 2YJHA 1WMJA 4BWSA 2CZ2A 2HNLA 3A5WA 4WXTA 2GSRA 5IMFA 3FK8A 2NVLA 5HFIA 3F4RA 1TK5B 4KNDA 3P2AA 2H73A 4KDYA 2L59A 2IIYA 4JZQA 4DSRA 2IMDA 3UEMA 1DSBA 2GSTA 1SJIA 5D93A 1FG4A 2DJJA 5LCZA 3QDNA 1GSEA 10GSA 2FWFA 3HKRA 1K0MA 1GLQA 2H0GA 5EPFA 3KD0A 3TJFA 1GSQA 3QD9A 3G9BA 3HJMA 2RUFA 4ZILA 1O6JA 1GTBA 1OE7A 2C3TA 3UBKA 5G2ZA 2DJKA 2PGTA 3GYKA 4NHZA 1GH2A 3UARA 4KDXA 4ZIJA 1NHOA 4I2UA 1EOHA 1VGLA 3R2QA 2OADA 4OO5A 1HNCA 2JADA 3UL3A 4ZBAA 2R5GA 5CO3A 4ML6A 3MAKA 1XVQA 2VL2C 1ERWA 3FKFA 4PNGA 1YKAA 4ZB6A 2OACA 1G0TA 3HY2A 2KHPA 2XHFA 4TVEA 5DQYA 3APQA 1T3BA 2GQLA 2IMFA 2ON7A 3MSZA 3MDKA 1Z9HA 2HZEB 2H19A 1R4WA 4YH2A 4ZB8A 2YWNA 3GV1A 3ISOA 1YQ1A 1BQ7A 2CVDA 1F3BA 4XCSA 2GQMA 1SK1A 3VLNA 2VCWA 3BCKA 1GSUA 2HLSA 1Z6MA 3ZREA 1F9MA 4POMA 3CRUA 5G5FA 5JWQB 3J7Yb 4MJBA 4PQ1A 4QL7A 1VF2A 2YP6A 2DMMA 5D96A 4Q5FA 3GA4A 4MK3A 1AXDA 7GSSA 2IPAA 5IMCA 3KTLA 3F0IA 1OKTA 4OD7A 3ME7A 4WF5A 3ZL5A 3GMFA 3LEFA 3C1SA 3TJKA 2AAWA 1SKWB 1B8XA 2OKAA 1TI3A 4EXJA 4GQCA 4CHSA 1SKSB 3A2VA 1OAZA 3E9JB 3WD6A 4GTUA 4DVCA 3VURA 3H1NA 2VCTA 1WOUA 2KP2A 1V2AA 3FZ9A 3KMOA 3GURA 4WF4A 3EMPA 3VK9A 3EE2A 4AGSA 3JCML 1M0UA 1ZOFA 3QFBC 4K7NA 4XRDA 4FYCA 3GKNA 2H72A 2C4JA 3W8JA 4G9HA 5AIXA 5CRWA 5B6NA 2LQQA 20GSA 2H6ZA 4IN0A 2HT9A 1W4VA 3VI5A 2IL3A 1XWGA 2O8VB 2PVOC 2LJKA 3GSTA 4V1Ap 4DEJA 2R2JA 3H93A 3ZFBA 1SJ6A 2LV3A 2BMXA 2FD3A 4IP1A 3C7MA 1W89A 1TI1A 3WGXA 3LFLA 1ILOA 1J08A 1GUMA 2H1GA 1G6WA 3FHKA 2JZRA 4F2IA 1FB6A 2LRTA 4FYBA 5IMDA 2C3NA 2FWHA 4XRAA 2KP1A 2JL4A 1MEKA 5GAND 3D4MA 2N5BA 1EOGA 1TXXA 3F4SA 1OC9B 4BVYA 1EP8A 3GRXA 5ECOB 3GNJA 1ERUA 3ZTLA 2K9FA 1J9BA 3PH9A 1SD9A 4PQIA 2ON5A 4IW9A 1OC9A 3ZLPA 2X8HA 4AJ7A 1JZOA 1TRWA 4MH2A 4KCEA 1FHEA 4I5QA 2IJYA 4Z7XA 4HZ4A 4ECBA 1S3AA 4NAXA 3KP8A 3QPMA 1FAAA 2OE3A 5FHIA 2MMZA 2FWEA 3A3TA 4ISDA 1THXA 2H01A 3ZMLA 4ECJA 5KN1A 2AV4A 3KM6A 5ECSA 2VCZA 1YZXA 4QL9A 1TRVA 5F8BA 4IKHA 3F4TA 4PNFA 1VF3A 3NZNA 1EWXA 5ECLB 4TN8A 2G0FA 1GTIA 4IQAA 4JE1A 3CMIA 4WBJA 2ZCTA 2JSZA 5KEJA 1IYIA 4MDCA 5IQYA 1X5DA 1TJDA 3L78A 2R37A 3GX0A 6GSYA 1HYUA 3BCIA 2I3YA 2CT6A 1EV9A 2C0EA 3D4TA 3KIJA 2YV9A 5B8AA 3TKRA 3VI7A 4F03A 2A4VA 4LMVA 3I69A 4ML1A 2VL2A 3L4NA 1XXUA 3L9UA 2FLSA 4LL1B 1BAYA 4OCEA 3ED3A 1K0CA 1VRSD 4EDZA 5J9CA 1O8XA 1QMVA 5IIZA 2H74A 3VPQA 1DE2A 3CSIA 4JR6A 5ECRB 2JSYA 2WFCA 5DALB 2XBIA 3EU3A 3NOFA 2M72A 5CNWA 5F07A 2M80A 22GSA 1YKCA 3C1RA 5D9VA 3HVXA 2AYTA 2TRXA 5ECNB 1TW9A 3HDCA 4KH7A 2RLIA 3DD3A 6GSTA 5DALA 3IR4A 3F3QA 4ZBDA 1EGRA 3HA9A 4NWYA 5G1KA 2HXKA 1AAZA 1JLVA 2VM2A 2YWIA 2C1YA 1CQHA 4N0ZA 3UBLA 2OA7A 5KN3A 4EKZA 1ERTA 5H5QA 4YAVA 5D9TA 2B5YA 1WJKA 2GZYA 2P5QA 2G2QA 3CSJA 1TK8B 1Z7PA 5JCUA 3IA1A 2MMOA 5D9XA 1S3DA 3UVHA 4K0GA 4L8EA 3HHVA 2DJ0A 4O7HA 3KJYA 1F2EA 2AB6A 4F9ZA 1ST9A 3KEBA 1DE1A 3VWUA 3IOSA 4BPYA 2LS5A 2E0QA 2VOCA 3LORA 4K6XA 5IM9A 4PURA 4WKWA 1JZWA 4N30A 1GULA 1OC3A 4GLTA 5F06A 1TK0B 1N2AA 2GSSA 2C0FA 1WIKA 2FHEA 5ID2B 1X9WB 4KAEA 4KW6A 4XIHA 2H30A 2I1UA 13GSA 1JLWA 1HD2A 1Z5YE 3M0FA 4TXVA 2N5FA 4PUAA 4V2LA 2FUG2 2LJAA 4EUYA 2H6YA 1R5AA 1QFNA 1XW6A 5DCHA 5KN2A 1PKWA 4KSMA 5A5KA 1OVNA 4POKA 1XOAA 1A0FA 3EYTA 5DJMA 5DVBA 2NTOA 5J9BA 1K0BA 3DKSA 2X99A 1SJZA 4HU9A 5A4UA 1SL0B 2ES7A 3KMNA 3KGKA 4CDOA 1Z7RA 1QGVA 5FT3A 2V6KA 2L6DA 4YQVA 12GSA 4FO5A 3QAVA 5ENUA 3V1WA 5JWOB 5ECHB 1MD4A 5DAKB 1TP9A 2C0DA 3IE3A 1K0AA 3LSZA 5GAPD 4TR3A 4HJMA 1V9WA 2YANA 4AF2A 5C04A 1EZKA 3IV4A 2DJ2A 4EL1A 5IOWA 1VF1A 3ERFA 5DAKA 2F8AA 3TKPA 4TR0A 2B7KA 5FWGA 4ZB9A 1XW5A 14GSA 2P0GA 1OKDA 4ACSA 1V58A 5LD0A 4YQMA 2L6CA 4F0BA 4I8BA 1PA3A 4JEDA 3LJRA 1FOVA 3IK9A 1SENA 2CAIA 1SYXA 4MCUA 2GT6A 1OE8A 2YWMA 3DVWA 2DIZA 4GWRA 1PRXA 4ID0A 3CRTA 4GXZA 2GQKA 2HFDA 3F6FA 4I2TA 1SK2A 2ALBA 5HR0A 4L0WA 1PSQA 5D8IA 4MMMA 1AUCA 3IAS2 4RI7A 2YWOA 1BX9A 3HVVA 1BG5A 1XZOA 4N10A 2REMA 4GQFA 1NW2A 3BD2A 3SBCA 1O73A 1USBA 3HD5A 3TKSC 3FRCA 1Z3EA 2LQOA 2VCXA 5HFGA 1E6BA 3RBTA 2VL9A 2DSAA 4J56E 3FZ4A 1XVWA 2VM1A 1X9SB 4JU5A 1WRYA 2GS3A 3QCPA 2B5EA 2H1AA 4O92A 5G30A 2AUVA 2K6VA 2L4QA 3Q19A 4FYUA 3M1GA 3TGZA 1PQNA 1SL1B 3CYNA 4GF0A 2PVQA 4XHMA 2FA8A 4EC0A 3KP9A 4MLYA 3GH9A 3PR8A 4Q5RA 5H5SA 4OMVA 5E4WA 3GKKA 4LMWA 2YN1A 4DSQA 5IMVA 1O81A 1EV4A 2WULA 1TU7A 3ZIVA 3WT2A 2B6MA 6GSSA 5AIVA 3NIVA 4NXIA 3UAPA 4HQZA 3K8NA 1ML6A 19GSA 5ECMB 5JWRB 2H6XA 5GSSA 1SD8A 3LYPA 5DCGA 1EGOA 3W6GA 4JRRA 2PBJA 1WE0A 4TR4A 2DLXA 2A2RA 4MZCA 1CQGA 2DC5A 2GSQA 4ZL7A 1XW9A 2FCHA 3I43A 1F6MC 4O32A 3LQ7A 1M9AA 4MPGA 3LYKA 1THOA 2GGTA 4MPFA 3HYPA 2V6OA 4MJEA 3TJGA 1B9XC 1PGTA 5D9WA 3O3TA 3WGDA 2F3MA 2PMTA 4X0XA 2R6KA 1JZDA 2BJXA 4HEA2 3WGEA 1WPIA 2QKEA 1XOBA 3APSA 3DEXA 5IMZA 1ABAA 3U6VA 1T4ZA 5CRDA 3PGTA 3F8UA 1TDIA 3VFIA 3TJJA 4N0VA 2QGVA 5D73A 1HNAA 3DGQA 1R26A 5INYA 3ZVJA 1XWAA 6GSWA 3U5RE 2H1DA 2CVKA 2OJLA 1FB0A 1K3YA 3TRXA 1FW1A 8GSSA 4HDEA 2JZTA 2WRTA 1HNBA 4HU7A 2HYXA 2H0IA 1GUHA 1PX7A 5GZZB 2P31A 4G19A 6GSUA 2MBTA 2VLTA 1M99A 2HZFA 1UA5A 4MP4A 2H70A 3TB2A 2VLUA 2H8LA 4XS1A 4BL7A 1O7UA 1XWBA 1EEJA 3FR9A 4L5LA 1ERVA 3GN3A 3GFKA 5J41A 4KSOA 4Q5QA 3TCOA 3TKSE 3M9JA 3LXZA 1U3AA 4PX1A 3QFAC 3EWLA 3ZFLA 1X9MB 3H79A 5B6MA 4EDYA 4J57E 4K2DA 4KX4A 4EVMA 1FVKA 4OCFA 5JCGA 1QUWA 5IMAA 3FZ5A 2WJUA 2NPBA 4KA0A 3IXRA 1A0RP 1GTAA 5DJLA 1KNGA 1T1VA 5AN1A 1PMTA 1IYHA 3ZMKA 4IBPA 1TTZA 9GSSA 2HI7A 16GSA 3IK7A 2NDOA 1T00A 1I9DA 3D6IA 1U87A 1PD21 2LSTA 1T8EB 2H75A 4HQSA 3G7IA 1NSWA 4BWQA 5KN0A 1A24A 3L9SA 1H75A 5HFKA 1PX6A 2FA4A 4JBBA 4OFNA 5HR3A 3HJPA 5G5EA 4DSSB 1AQXA 4TXOA 4D73B 3HJOA 1R5PA 1JHBA 4ILFA 2B5XA 3TKSA 1ZCPA 2GT5A 1T7PB 3AY8A 2WCIA 2X64A 1N8JA 2YJ7A 4DSSA 3M3MA 4IHUA 4D73A 1Q4JA 1XWCA 2E2MA 2M46A 2VD0A 4ZXGA 5CP1A 1C72A 1M9BA 3ME8A 2IN3A 1ACVA 1GSYA 4POLA 3ZYWA 1LU4A 2LKUA 4POBA 1PKZA 3US3A 2L5OA 1WWJA 5EVOA 3QOUA 2KUCA 3FY7A 5IO2A 2WGRA 4HUAA 1YEXA 1GSSA 2JACA 4YAPA 1XFLA 4P3YB 2GLRA 1VF4A 3KCMA 4V1Ag 3DIEA 1ZZYA 2C80A 2J9HA 2PWJA 3FZAA 2FWGA 4WR4A 5A4VA 2KOKA 3APOA 3N9JA 4L0UA 1TOFA 5IO0A 2O87A 2YPMA 1H4OA 4IJIA 1T4YA 2V41A 3E0UA 1LBKA 4QQ7A 1EP7A 1SKRB 3RAZA 1AIUA 2L57A 6GSXA 3L9VA 2X8CA 4LA1A 1M2AA 18GSA 3N5OA 3UMAA 3LWAA 2C3QA 2HE3A 1F3AA 2PERA 4EF0A 1ZYEA 3H4KA 4K7OA 1GLPA 2GDRA 4MF6A 1URMA 3KTBA 3GIXA 1F37A 2X8GA 2VL3A 2F9SA 2C8UA 2R3XA 5L71A 4XS4B 3I6AA 3LGCA 5CRGA 2WB9A 1SL2B 3CXGA 4ZL8A 3IC4A 4RI6A 1LJRA 2HRFA 5EL8A 1M2BA 1OYJA 1R7HA 3ERWA 3G7YA 3TOUA 4K9ZA 2C0GA 1S3CA 4XS4A 2IMKA 3TRPA 2YCDA 4F82A 1YY7A 3GL3A 1KEBA 1GSDA 5H5RA 2XC2A 1GSFA 1GP1A 2PPTA 4EO3A 3GH6A 2CV4A 4AJ6A 2MMNA 4RQXA 2YZUA 1U3IA 4XTSA 3A2WA 1GNWA 3G7JA 1A2MA 2IFQB 3FEUA 1MTCA 3CTGA 5DBQA 2AHEA 4GCIA 4NV5A 4MJCA 1K0NA 2E2GA 3O76A 3F6DA 5HR2A 5HQPA 2IFQA 2B7JA 3OR5A 2MZCA 4MABA 4WETA 3FW2A 1BJXA 4IVFA 3VPTA 5AGYA 3EC3A 2FNOA 1PL1A 3HZ8A 5C00A 1MDJA 1PL2A 3P90A 2LRNA 4MF5A 3DYRA 1Y25A 5ECPB 2CX4A 1G7EA 1HQOA 4NV2A 3IDVA 3GKXA 2HSYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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