1ZCPA

Crystal structure of a catalytic site mutant e. coli trxa (caca)
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
DKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCACAKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Thioredoxin 1
publication title The crystal structure of TrxA(CACA): Insights into the formation of a [2Fe-2S] iron-sulfur cluster in an Escherichia coli thioredoxin mutant
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Electron transport
total genus 30
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-04-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1zcpA00
4OO5A 5ID2B 3VURA 3ZIJA 2B5XA 2DIYA 4WXTA 1F3AA 3M0FA 5DDLA 4KNDA 4BA7A 1Z7PA 2YOIA 3TJBA 4D73B 4K1FA 3GFKA 5IMVA 1BAYA 3UJ1A 1GLPA 2N5FA 2HZEB 4HU9A 4I8BA 3TKSA 1SK0A 3UEMA 2KP2A 4HU7A 1QQ2A 4RI7A 2VO4A 2JU5A 3F3QA 1BYEA 7GSSA 3KTLA 2OA7A 1ZYEA 4K8MA 3PGTA 1M2BA 1NW2A 3APQA 3RAZA 5IMCA 3FR3A 5B8AA 3EE2A 5B8BA 4IVFA 1H4OA 3H79A 1X9WB 5DJMA 2H6XA 1E2YA 4RQRA 1NHYA 3IK9A 5IMDA 4YQVA 2FWGA 3PH9A 3KD0A 2H1DA 2WJUA 4XS6A 6GSTA 1X5EA 5IO0A 3O6TA 5LCZA 1OE8A 2AAWA 1X9MB 1O81A 1C72A 2I1UA 1EGRA 1TXXA 2AB6A 3G7JA 1YF1A 4BWQA 4N0VA 2O85A 3GTUB 5GZZB 1HQOA 5H5RA 5ENUA 4IHUA 4F0CA 4JE1A 3GL5A 1A8LA 4ZB8A 2B7JA 2L4CA 4ML1A 2YWIA 1AAZA 1XOBA 4NHWA 2LJKA 3F3RA 1WOUA 2V2GA 2QC7A 1WE0A 5D8IA 2FWHA 5CP1A 2YWOA 2C3NA 4KUNA 3J7Yb 3VI7A 1WRYA 3G7YA 3KCMA 3GV1A 2FHEA 4N11A 3GIXA 3H4KA 2WB9A 3FKFA 3LQ7A 4CW9A 3PR8A 4JRRA 5KN0A 4WKWA 2WFCA 1DUGA 1TOFA 2V1MA 2X8CA 3WD6A 2LQQA 4XTSA 4KCEA 5G1LA 4NAXA 4DSQA 4EUYA 1AW9A 3D4TA 1JFUA 3QCPA 3IBHA 3L0HA 1A8YA 4TR4A 1N2AA 1ILOA 1OE7A 1LBKA 3D22A 2LJRA 2VLUA 1G7OA 2OE3A 3V1WA 2A2RA 2R2JA 4MF5A 3GYKA 1K0DA 4TXOB 3ZVJD 6GSUA 3US3A 1FVKA 2C0EA 5C00A 1GH2A 3A2WA 2E0QA 4X0XA 2LRTA 1YEXA 4POBA 3F8UA 1F6MC 2OADA 3VWVA 4MCUA 4WEYA 1Y6EA 3C71A 1T8EB 1RQMA 3QOUA 3M9KA 3LYKA 2B5YA 4KA0A 1QFNA 2IMEA 5A4UA 1UC7A 3TJKA 3APOA 2M46A 2VL9A 1ZOFA 1XW5A 2CA8A 5F07A 3CRTA 1B4PA 5JWRB 2B3SA 1UA5A 2PU9C 2XBIA 1GSEA 4MF7A 5F05A 2GZZA 3O3TA 6GSWA 4JBBA 1S3AA 2JSYA 5IOXA 4F2IA 4HOJA 1FVJA 2GS3A 2DMLA 3AY8A 4FYUA 5CYYA 2GT6A 5C04A 5HFGA 2PWJA 5IIZA 5J9BA 3ZMKA 2CT6A 4Q5NA 2VCWA 3TB2A 1KBNA 5ELAA 4KE3A 3G7IA 1Z5YE 2F3MA 2FCHA 2DIZA 2L5LA 2KUCA 4ZB6A 5EPFA 4IJ3A 4WF5A 2C1YA 1YQ1A 3U5RE 4PQHA 5JWQB 5ABRA 3TJJA 5HR1A 1TRSA 2K8SA 2CZ2A 20GSA 3FZ5A 4ML6A 4ZB9A 2ON5A 5ECRB 4J2FA 5L71A 5ECKB 4BVYA 2IN3A 3TKPA 2TRCP 3ED3A 6GSSA 4EC0A 2K18A 3HVSA 4N10A 3RHBA 4EXJA 5JCUA 1J0FA 2V6OA 1K0MA 2IMKA 2XPEA 22GSA 2OACA 2F51A 1GTBA 2IMDA 3DKSA 3GRXA 5CRWA 2B7KA 2EIOA 2HFDA 3GSTA 3HJPA 2JL4A 3CSJA 2JZRA 2X8HA 1AXDA 2FUG2 1M9AA 3APSA 2O7KA 1KNGA 3GHAA 5IQYA 4ZBDA 2YP6A 4MJBA 1A23A 5IOWA 2O89A 2AUVA 2H66A 3ZFLA 4WR4A 3HA9A 2PVQA 1F3BA 3DIEA 4I97A 2LNSA 3RBTA 2DJ3A 2HSHA 2RM5A 1QK8A 2I81A 2H1AA 3C73A 2H72A 2CV4A 3ZIVA 3F9UA 3LWAA 1TU7A 5J3RA 4ULXA 4MK3A 2H1GA 1SU9A 2V32A 1PX7A 5D93A 5INYA 14GSA 2D2ZA 3CMIA 2DJ0A 3C1RA 3HDCA 2KOKA 1WMJA 1WJKA 3DWVA 4FO5A 5DALA 4O32A 3ZITA 3RPPA 1SJZA 5CNWA 2VM2A 4DSSB 3CRUA 4EF0A 1RW1A 5ECMB 2I3YA 1XIYA 3NOFA 1PL2A 2I4AA 3ZYWA 2P5RA 5FHIA 1TRWA 5FWGA 1AQWA 2AYTA 4QL9A 4O92A 1YKCA 1A0FA 2QGVA 5DJLA 1DE2A 5KN2A 2CZ3A 5DAKA 5A4WA 4WR5A 5GSTA 2XBQA 2VLVA 3FY7A 3GL3A 1EGOA 2WDUA 1TU8A 3CSIA 2ALBA 3FZ4A 4OWYA 2PERA 3VI5A 3LXTA 5ECLB 3WT2A 2H30A 2MMZA 3FEUA 4HJMA 2P31A 2FY6A 3EU3A 1JZOA 2MZCA 3GKMA 1O85A 5DVBA 5J4UA 1YZXA 2WULA 3IK7A 3A5WA 1T7PB 1QXHA 2DJJA 2PVOC 4Q5RA 2YPMA 4I2TA 3TJGA 2HYXA 4K6XA 2DBCA 3TJFA 2MBSA 2C0FA 2GVPA 4LL4B 1O8XA 4GSSA 3IPZA 1BX9A 1JZWA 4FH8A 4F82A 1N8JA 3UBLA 1AQVA 2E2MA 5HR2A 2CAIA 1MEKA 3MAKA 2FD3A 4XRDA 4K2DA 3QDNA 2GSQA 1ERTA 2RUEA 1MDIA 3GMFA 2L5OA 2GSTA 4TXVA 4MZWA 5G2ZA 1K3OA 2FGXA 4POKA 11GSA 5EVOA 4HQSA 1XWAA 4TR0A 1T3BA 3D6IA 2P0GA 3QMXA 2H70A 3E3EA 3H8QA 5FT3A 2GQKA 4IQAA 3P90A 5J41A 4V1Ag 1GP1A 4AJ6A 3L4NA 2QSIA 3OR5A 1AC1A 4HI7A 3GKNA 2M80A 3VWWA 5JCWA 2X64A 1B9XC 4KW6A 3KGKA 1Q4JA 5KEJA 4FYCA 3P2AA 2DJKA 3UMAA 3BJ5A 4E8EA 1ZMAA 2HNLA 5IMAA 1GTIA 2VLTA 1PKZA 3ISOA 3L9UA 4EE0A 8GSSA 2YZHA 2FA8A 4X1UA 1AUCA 2YV7A 1K0NA 3DEXA 2C80A 5F06A 5GAPD 3DVWA 1F37A 2VL2A 4GSTA 1JZDA 3KJYA 4MDCA 3RDWA 4PGTA 1ABAA 2IMIA 2P5QA 1PSQA 2IFQB 1TI3A 3C8EA 1PGTA 2R5GA 1GUKA 3ERFA 3F4RA 1T4ZA 2C0GA 4I6XA 4K7IA 1LJRA 4DSRA 1W89A 3Q6OA 1A24A 2VL3A 1DSBA 3MNGA 1Z9HA 3I9V2 4MH2A 3HY2A 3TDGA 2LV3A 3ERWA 1ML6A 4MPFA 2M72A 1IYIA 1EWXA 4Q5FA 3IRAA 1PQNA 1PKWA 2O87A 3TRXA 2H73A 1GSSA 2HE3A 4TR3A 3KEBA 2HZFA 4GQCA 4YQUA 1SD9A 1F2EA 2XPDA 3GH9A 1Z6MA 2WGRA 1PD21 4OFNA 2VM1A 2HXKA 1J9BA 3GURA 1K3LA 4HZ4A 1MD4A 3WGDA 18GSA 1TDIA 2H74A 2F8AA 3NZNA 3CBUA 3IHQA 4KDYA 2OBIA 3QAWA 1T1VA 1M2AA 3Q74A 4AJ8A 1VF2A 2X8GA 4F03A 4IP6A 3VWUA 1BQ7A 2QKEA 1O7UA 1A2LA 1Q98A 1ERUA 3GSSA 2R37A 3U6VA 5GAND 4ZXGA 2H8LA 3UOMA 3SBCA 3ZZXA 3H93A 5A5KA 3S9FA 1TK0B 1ACVA 1UN2A 1FW1A 2OE0A 4MPGA 2MMOA 2GLRA 2GZYA 5ECSA 5HR3A 1BEDA 4NHZA 1SL0B 5COHA 3E0UA 4L5LA 2HSYA 3VWXA 3L9SA 1U3AA 4MA9A 3VPQA 4HS1A 4H86A 2GZPA 3DMLA 3FK8A 1TJDA 4TR1A 1GRXA 3P7XA 5G1KA 3IOSA 1FHEA 4CHSA 2YJ7A 2YWMA 4GRFA 2GSSA 1Z7RA 2L57A 3MDKA 2CX4A 4IKHA 2HLSA 2JZSA 4CDOA 2V6KA 3ZREA 1VF1A 1XBSA 2RIIA 17GSA 1A2JA 2A4VA 4XS4A 5DBQA 4IQ1A 5IPHA 3C1SA 3E9JB 1DBYA 2H71A 2ZUPA 3UARA 4KSOA 1PN9A 2H01A 2ON7A 1OAZA 2CVKA 5IM9A 1R5AA 3M8NA 3FZAA 3A3TA 4N0ZA 1JHBA 3TKSC 3CTFA 2RM6A 2IJYA 1ERVA 1I5GA 2PMTA 3GX8A 4WBJA 4PUAA 4PQIA 5E59A 4DVCA 3QFAC 1QUWA 1WPIA 1SKSB 2NPBA 4AF2A 4L0UA 4YAPA 1HNCA 5IMZA 1XCCA 1YY7A 1AIUA 1EZKA 2DMMA 2C0DA 1SJ6A 2GSRA 1Z6NA 2OKAA 1K0OA 4ZL8A 4MJEA 1X0RA 3M9JA 1GL8A 2GGTA 4JZQA 4KSMA 4I2UA 1GNEA 2AV4A 1K3YA 4PNGA 2H76A 2C8UA 4POLA 1GSFA 3TRPA 3ME7A 3D21A 1LU4A 2VUPA 1URMA 3DD3A 5ID2A 2H19A 4G9HA 1SD8A 3SWLA 1XFLA 3BBYA 9GSSA 1T4YA 3KH7A 1EP7A 4D73A 3BOAA 1R5PA 4NXIA 1XWCA 4LA1A 4JEDA 4POMA 5B6NA 2L4QA 3IDVA 5J5NA 4GSNA 1H75A 4K0GA 2YNXA 5A4VA 3HJOA 2VD1A 2DJ1A 3IA1A 1OYJA 5B6MA 1TK5B 4MMMA 4N30A 2MMNA 1W4VA 2G2QA 2KHPA 3EYTA 4QQ7A 5IPGA 3N9JA 1XWGA 1TKDB 4RQXA 3TKQA 2H75A 4PNFA 1FAAA 5AIXA 1ERWA 4HEA2 3GNJA 4ZIJA 4MJAA 1ZL9A 4WETA 1SYRA 2NVLA 4X43A 1PMTA 2F8FA 1OC9A 3GTUA 1GSYA 2BTOT 3D0ZA 4ACSA 3CYNA 1XOAA 2LTKA 2B1KA 5KN3A 1THOA 2E7PA 2N5BA 4EO3A 5ECHB 4ZL9A 1K0CA 4GTUA 1M0UA 1NHOA 4MABA 2VCQA 1XZOA 4K0NA 2VOCA 4WBRD 2FA4A 5AN1A 4PQ1A 4YAVA 1ZGNA 2GQLA 2LJAA 1ON4A 2NBSA 4PX1A 3TOTA 1KTEA 2TRXA 5DCGA 2RUFA 4IN0A 1NM3A 1K0BA 1AQXA 1OKTA 3HVXA 3LJRA 4HZ2A 4KGIA 2B6MA 5G31A 4GLTA 4NV2A 1XVQA 4OD7A 2LNTA 3KXOA 3DRNA 4OFMA 2MYGA 2DC5A 3CXGA 3M3MA 1SK2A 1YKAA 3VPTA 1I9DA 1VGLA 1VRSD 2H6ZA 2CVDA 4EVMA 1GUHA 3IR4A 3D5JA 2IMFA 5D9TA 3I69A 4XCSA 4ECCA 1GUMA 1E6BA 2E2GA 2HRFA 3M1GA 4TXOA 1RK4A 3K8NA 3TKRA 3ZFBA 5HR0A 3WT1A 4JR6A 4ZBAA 3RPNA 2MBTA 1BJXA 2ZCTA 2EC4A 1X5CA 3TGZA 2H0GA 3L9VA 5EY6A 5CAXA 1ZCPA 1USBA 1XVWA 3FHKA 4XRAA 3WGXA 2HRNA 1TRUA 1B8XA 2K8VA 16GSA 1GTUA 12GSA 1NSWA 1YF0A 2B1LA 5CRGA 1HNBA 4ECIA 1XW6A 3FW2A 3LG6A 4I5QA 2XC2A 2AJQB 4G2EA 4RI6A 2ES7A 3VK9A 1MD3A 2HT9A 1V98A 1O73A 2WZ9A 4YQMA 3F6FA 2LEGA 6GSXA 3KH9A 4MJCA 3JCML 3N5OA 5ECIB 1CQHA 3WYWA 3NIVA 4ID0A 3VLNA 1JLWA 4G19A 1U88A 1T00A 1TI1A 2YN1A 5HFKA 4TVEA 2ZNMA 1GWCA 3EVIA 1TRVA 4O7HA 4EDYA 1WIKA 2MMAA 2VCZA 3HKRA 3ME8A 1R7HA 3GUSA 3ERGA 2REMA 3HVVA 1X9SB 5D9VA 4MF6A 3ZL5A 4LL1B 3R2QA 3EU4A 2CVBA 5J9CA 3LYPA 4QL7A 1PX6A 2V41A 3A2XA 1X5DA 1YEPA 3KIJA 3QPMA 5D73A 1YDKA 1EV9A 5CREA 10GSA 3W8JA 1O8WA 4EDZA 3UVHA 5DCHA 1V40A 4HJ2A 4KB3A 4FYBA 1TW9A 2YV9A 3EWLA 3TUEA 2L6DA 3BCKA 2KP1A 1SKRB 4KCAA 5DALB 4MZBA 1O6JA 3DYRA 3GKKA 2K9FA 1HYUA 2CX3A 2N5AA 3PINA 1OC9B 4GCIA 4JR4A 2I9HA 2CQ9A 4G10A 1G6WA 2J9HA 4PUFC 4NV5A 1FOVA 4GQFA 1MTCA 4BPYA 2B5EA 3ZRDA 4LLRA 2TIRA 3QFBC 1THXA 3UIWA 4GXZA 3F63A 3C7MA 1EV4A 3GA4A 1QGVA 2VD0A 4GWRA 1XWBA 2YWNA 5DAKB 2H6YA 1FB0A 2CAQA 2VIMA 2LRCA 1SENA 4ISDA 5F0GA 4J56E 4KAEA 2GTUA 3P8WA 4WF4A 4XS1A 4TN8A 4GF0A 2WRTA 2LSTA 1PA3A 2Z9SA 3LSZA 1FG4A 3UL3A 4IBPA 3EMPA 5HFIA 2H0IA 2VCVA 4V1Ap 2R4VA 4IW9A 2JACA 3HJMA 3EC3A 4ZILA 3W6GA 3QAGA 2YJHA 2YCDA 4MH3A 3UBKA 2RLIA 1TTZA 1V58A 5DQYA 4PXOA 1ZYQB 4DSSA 3HYPA 3DVXA 5EL8A 2LUSA 4MLYA 3LXZA 2YANA 3HZ8A 4OMVA 3LFLA 3QAVA 3IV4A 2K6VA 4IS0A 3J7Yk 3F4SA 5ECQB 5ECPB 4AJ7A 2J23A 1J08A 2LS5A 3LORA 3RHCA 3FR9A 2VAFA 1SL2B 1F9MA 4NWYA 2H1BA 3GKXA 1MDKA 4FIWA 2BMXA 4IGJA 3HZ4A 3A2VA 3IXRA 4TW5A 4ECJA 3I6AA 4MZCA 4XHMA 3ZVJA 4MP4A 1V9WA 1M2DA 2GDRA 3LGCA 3F4TA 2C3QA 3F0IA 3VFIA 1VF4A 4DEJA 1CQGA 1K0AA 1PRXA 4ILFA 4O5RA 3FR6A 4ZL7A 4EKZA 3CTGA 3GX0A 1M7TA 3Q18A 1TK8B 3TRQA 4Q5QA 1EOHA 5AISA 2PUKC 3O76A 3KMOA 1BG5A 2NTOA 2LQOA 5B7CA 1G0TA 4XIHA 4J57E 4IP1A 5E4WA 3FZ9A 5G5FA 1SKWB 1B48A 1GSUA 1M9BA 2AHEA 5IO2A 3DXBA 4NPBA 1GULA 1G7EA 3GN3A 1XXUA 3BD2A 2X99A 3TKSE 1SYXA 5G30A 2L59A 2VL2C 3KP8A 3TCOA 5ELGA 1GSQA 3I43A 4RUVA 2WS2A 4HDEA 4KDUA 3HXSA 1R4WA 6GSVA 4PURA 1OKDA 1JLVA 3UAPA 3W8SA 3G9BA 4V2NA 3QD9A 2FLSA 1XPVA 2C3TA 1EOGA 3DGQA 4BWSA 1SJIA 2KLXA 2HZEA 2XHFA 1YJ6A 2NDOA 5GSSA 4F9ZA 2FWEA 2C4JA 1UVZA 5ECNB 1WP0A 3KTBA 3MWHA 1XWKA 1OC8A 3EMXA 3KZQA 3QR6A 5AIVA 3F6DA 1U3IA 4OO4A 3ZTLA 3HCZA 2OE1A 5LD0A 1HD2A 4IJIA 3IE3A 5D9WA 3L78A 4LMWA 1GSDA 1V2AA 2EIRA 3HHVA 4ZBBA 1IYHA 4L8EA 1M99A 4TKYA 1WWJA 3TOUA 3IAS2 2JSZA 2IFQA 2WCIA 2VCTA 4V2MA 4TOPA 4ECBA 1EEMA 2O8VB 1EP8A 2G0FA 1A2MA 4P3YB 1VF3A 1KEBA 3EINA 4BVXA 4K9ZA 13GSA 3Q19A 1S3DA 4K7NA 2PGTA 1SL1B 1B4QA 3D4MA 4Z7XA 5ECOB 3IC4A 5F8BA 1U87A 2YZUA 4HUAA 3KM6A 1U6TA 3LEFA 4JU5A 4TR1B 4OFTA 2A2SA 2DLXA 2HI7A 3GH6A 4LMVA 1Y25A 2DSAA 3KMNA 4BL7A 5LNKe 1G6YA 2LKUA 4NMUA 2LRNA 4KDXA 1JZRA 2L6CA 3MSZA 4TRXA 2OBKA 1MDJA 2EIQA 1XW9A 2VCXA 4L5OA 1EEJA 2IL3A 1PL1A 1R26A 4E8HA 1DE1A 1OC3A 4AGSA 4XS4B 4KX4A 2FWFA 5D9XA 4K7OA 1FO5A 3ZLPA 5DQSA 3H1NA 3CSHA 2PN8A 3FYGA 3WGEA 5CRDA 3UVTA 1HNAA 2JZTA 4OCFA 3HD5A 5IMFA 6GSYA 5KN1A 3EURA 1ZZYA 1V57A 1A0RP 2DJ2A 2PPTA 2PBJA 3KP9A 5H5QA 3ZMLA 1ST9A 5CRHA 5D96A 3BCIA 4F0BA 1GNWA 1GLQA 5H5SA 5JCGA 2R6KA 2OJLA 1OVNA 1Z3EA 4OCEA 5HQPA 2GT5A 4EL1A 2R3XA 2F9SA 2IPAA 4YH2A 1S3CA 1QMVA 4IELA 1SK1A 5CO3A 5JWOB 4L0WA 2BJXA 5AGYA 5G5EA 1TP9A 2IIYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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