4WF4A

Crystal structure of e.coli dsba co-crystallised in complex with compound 4
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Application of Fragment-Based Screening to the Design of Inhibitors of Escherichia coli DsbA.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
total genus 63
structure length 188
sequence length 188
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.4.2: Protein-disulfide reductase (glutathione).
pdb deposition date 2014-09-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4wf4A00
5KN0A 1F6MC 11GSA 5C04A 2JZRA 2REMA 3CSJA 4RI7A 5B8BA 2E2GA 4KCAA 2AAWA 2V6OA 1ACVA 3TJBA 4WXTA 2N5FA 4O7HA 3M9JA 1ZYEA 1TI3A 3GH6A 3UL3A 5AN1A 3U5RE 2WCIA 3I9V2 3QCPA 1CQHA 9GSSA 2VCTA 1VRSD 1X9WB 4IN0A 2AHEA 5H5QA 4PUFC 2GS3A 1R26A 1X5CA 1OC9A 2H1AA 2GT5A 2PERA 1PSQA 4EF0A 5ENUA 1ERWA 2L6DA 4BPYA 4E8HA 3O76A 5ECIB 2WRTA 5COHA 4TR1B 4D73A 1TW9A 3D4MA 2MMZA 4BWSA 2C0FA 2DJ3A 2IFQB 4KUNA 4YQMA 1VGLA 3QDNA 2B7KA 3HXSA 2TIRA 5DQSA 3I69A 2DJ1A 3LJRA 2WFCA 1YEPA 10GSA 3ISOA 2M72A 3DXBA 1K0CA 2YV9A 2M46A 4V2MA 4Q5NA 3CXGA 2H66A 3ZIJA 1XPVA 4POKA 3N9JA 5CNWA 1S3CA 4DSQA 5IO2A 4F0BA 1DE2A 3IK9A 5IMDA 2HI7A 3EU3A 5HR3A 3DRNA 2JU5A 4WF5A 1R7HA 2YPMA 2V32A 3GSSA 4HJMA 1A24A 3LG6A 3IDVA 2CVDA 1TRVA 1S3DA 1A2JA 1N8JA 4ZBAA 1V40A 5FHIA 3UAPA 2ON7A 3QFBC 3UEMA 5J9CA 1GH2A 3OR5A 4PQHA 4OMVA 1ZOFA 3DKSA 2B1KA 4NAXA 1SL1B 1B8XA 3UMAA 1EGOA 1J9BA 4E8EA 4NHWA 3ZMKA 2XPDA 1WP0A 4IHUA 5IM9A 4CHSA 4GCIA 5ECRB 2WZ9A 4JR4A 3TJJA 1OE8A 1V9WA 3ERFA 2MMOA 4TN8A 4X0XA 4BWQA 4MF7A 5ID2A 4MLYA 5JCWA 2C0EA 3CMIA 1B48A 1PRXA 4L8EA 1OKDA 2O85A 4IBPA 1PKWA 3DYRA 4IJ3A 4ZIJA 4TXVA 1SKSB 2GDRA 3V1WA 5F07A 5H5SA 4GSSA 1O8XA 4YH2A 2AB6A 1SK2A 5AGYA 4YAPA 1XVQA 2PN8A 4F03A 3RHBA 3BCKA 2FUG2 3P90A 1GSSA 5G1KA 5D9TA 5IMFA 5ECKB 5GZZB 3KZQA 1EV9A 3GRXA 1GP1A 4RQXA 1EEJA 2LJRA 4ZB6A 2RUEA 2GZYA 2OE0A 5AIXA 4ZB8A 4V2LA 4GF0A 3M3MA 2RM5A 1TRSA 5D8IA 1A8YA 2WGRA 5LCZA 2TRCP 1X0RA 4MABA 3TJFA 1AIUA 6GSYA 1U3IA 1HD2A 4DSSB 1TDIA 1Z6NA 1S3AA 1BQ7A 2KP2A 5ABRA 1LBKA 2I1UA 2FNOA 5E4WA 4WF4A 2VCZA 3GTUB 22GSA 1V98A 1XW6A 3H4KA 3G7JA 3Q74A 2RM6A 5IPGA 4KSOA 2E2MA 3G7YA 1T3BA 1O73A 1MDJA 4MJAA 5IO0A 2E0QA 1W4VA 1XOBA 3WT2A 4WBJA 4NXIA 4G9HA 1TK8B 3DVWA 2ON5A 4IP6A 4GWRA 4OWYA 2K8SA 3L4NA 2FWFA 2CZ2A 5G5FA 5AISA 3EURA 2VL3A 5B7CA 1FB0A 2HZEA 2JSYA 2GQKA 3CSHA 5HFKA 2R2JA 4MF5A 1OKTA 3CRTA 4L0UA 3Q6OA 2X99A 2P0GA 1K0MA 1HQOA 1ML6A 3DWVA 1K0NA 3DEXA 5DALB 2EIRA 3HVVA 1KTEA 2PUKC 2H74A 1A23A 1F37A 2VLTA 4HJ2A 5CO3A 2KHPA 5HFIA 1ON4A 2K9FA 3H1NA 1JZDA 3H79A 3P2AA 4ACSA 2H19A 1ZYQB 4K0NA 3TB2A 3A5WA 4KB3A 1WWJA 4MMMA 4KDUA 2O8VB 4TRXA 3LFLA 3TOTA 3QR6A 2FA4A 1TKDB 2XBIA 2H6ZA 4AJ6A 4KSMA 1NHYA 2YJ7A 4XRAA 3WGXA 1KBNA 5D96A 1XZOA 4FYCA 4ZXGA 4PX1A 4EDZA 3FEUA 3P8WA 4AGSA 1EWXA 1F2EA 4LLRA 4MP4A 5KN2A 5IMCA 4K9ZA 5D9VA 2H76A 3CTGA 1AC1A 6GSSA 3A3TA 4BA7A 5A5KA 1TOFA 3IAM2 3ZIVA 1XXUA 3FK8A 2VLUA 3LGCA 6GSUA 1UN2A 1SU9A 5IIZA 2IMKA 3TCOA 1GNWA 3UBLA 1QXHA 3L78A 1X5DA 4HEA2 4TKYA 1BYEA 1GTUA 2LQQA 1RQMA 2VUPA 2VAFA 1NHOA 2CAQA 5CAXA 4AJ7A 3TGZA 1HNBA 4L5LA 3L0HA 4NHZA 4FYUA 1OC8A 1Z5YE 2H1DA 1WMJA 1PA3A 2VCVA 3IAS2 1GSFA 2LRCA 3KGKA 1GSDA 1G0TA 3LWAA 5B6NA 1J0FA 2NDOA 4P3YB 2LSTA 2N5AA 5GSTA 2JZSA 3D4TA 1TK0B 1GTIA 4NMUA 1ILOA 4LMWA 3RBTA 2K8VA 1BEDA 1IYHA 4JBBA 3MSZA 1U6TA 1Q4JA 4K0GA 1YKCA 5KN3A 2YCDA 2K18A 4OFNA 2J9HA 2MMAA 3KP8A 1EOGA 5LD0A 2BJXA 2IMIA 3R2QA 4K6XA 4XS4B 1HYUA 3D6IA 2HSHA 5JWQB 1PL2A 4L5OA 3VI5A 4CDOA 3QD9A 3TRQA 2VL9A 1B9YC 3IXRA 2H6YA 4DEJA 5CRHA 2C0DA 3ED3A 3LYPA 3F6DA 4NV2A 2VLVA 5IMAA 1HNAA 4HZ2A 14GSA 4JU5A 5J5NA 3TKRA 3PGTA 2WS2A 3LQ7A 3N5OA 4FIWA 2L6CA 2VL2C 5JWOB 3VI7A 3GV1A 2B3SA 3LEFA 3UVHA 3ERWA 4IW9A 4AJ8A 4YAVA 1M2DA 2C1YA 4J57E 4RUVA 3K8NA 3P7XA 5IPHA 1AAZA 4MH3A 3GX8A 1O7UA 1Z9HA 3C7MA 2IWTA 8GSSA 16GSA 1W89A 5F0GA 1MD3A 2H1BA 4FH8A 2YN1A 1PX7A 1X9MB 3FKFA 2X8HA 4K7NA 1SYRA 3RDWA 3EWLA 4KNDA 4TXOB 1G7OA 5DAKA 3LXZA 5D9WA 3VWWA 4G19A 4KAEA 4LL4B 1HNCA 5EVOA 5B8AA 4AF2A 1M2BA 2GGTA 3E9JB 4G10A 2M80A 1BJXA 3FZ4A 5JCGA 3ERGA 3BJ5A 5EPFA 1SK1A 1AQVA 2F8FA 3FR3A 3FZAA 3FR6A 4MZCA 2B5YA 3M0FA 3NOFA 4MJCA 1XWAA 4OFTA 2H71A 2MBTA 5IMZA 4IS0A 3WD6A 4ZL7A 1GRXA 3HZ8A 1WRYA 4MCUA 2ES7A 2EIOA 2AYTA 2P5QA 4K1FA 2VCQA 5ECOB 1PGTA 1LJRA 3BBYA 4IQAA 3F8UA 3TOUA 1GULA 3GKXA 5J3RA 2KLXA 2V2GA 3PH9A 2R37A 3O6TA 3FZ5A 2YZHA 3A2XA 1GNEA 2GQMA 1SD9A 5HQPA 2NTOA 2VD1A 3HZ4A 1VF3A 2R3XA 2TRXA 3I6AA 4GQCA 2F51A 4I5QA 2IIYA 3HVSA 3APOA 3TKSC 4N30A 3SWLA 4PUAA 1PQNA 2QKEA 1U88A 1H4OA 4HZ4A 3BD2A 2CV4A 1OYJA 2P5RA 3EU4A 1B4QA 3F63A 4ECIA 4MK3A 1TU8A 1R4WA 4WR5A 3C1RA 5D73A 4GSTA 2GZZA 1UVZA 1WJKA 2QSIA 3HJPA 4HDEA 1K3YA 2R5GA 2YV7A 3G9BA 1XW9A 2OJLA 2GSTA 1XWGA 4HUAA 3VURA 2CZ3A 4GSNA 3FHKA 2IMEA 4NPBA 4POMA 5G30A 4TR0A 2A2RA 7GSSA 4EXJA 3J7Yb 5ECQB 3JCML 1XVWA 3C8EA 3TRXA 1AW9A 3H93A 3KTLA 3APQA 1EV4A 3GMFA 4OD7A 3ZVJD 1M9AA 3DGQA 2IJYA 1JLWA 1A2MA 2BMXA 4K2DA 4Z7XA 2DJ2A 2F3MA 2MBSA 1V2AA 2K6VA 1YDKA 2LRTA 3US3A 5B6MA 4ECBA 2VL2A 2LQOA 1DE1A 3W6GA 3WGDA 4HOJA 3ME8A 1FG4A 3QAWA 1PD21 1NSWA 2RLIA 2DLXA 2A2SA 1YY7A 3MNGA 3GKNA 3ZRDA 1QK8A 2JADA 2KOKA 3HD5A 2PPTA 2PVQA 1XFLA 2QGVA 1QMVA 4I2TA 4GLTA 2CVKA 4HQSA 2X8CA 4ZILA 6GSVA 2C3QA 3GHAA 1E6BA 4LMVA 3GURA 2LNSA 1U87A 4KH7A 2OA7A 1RW1A 1SKRB 2BTOT 3ZITA 1RK4A 3BCIA 1QQ2A 4TR1A 1URMA 1TJDA 1QFNA 3ZTLA 2C80A 3J7Yk 3RPNA 4N10A 2IMFA 3L9SA 3EE2A 2IFQA 3KH9A 4WBRD 4ZBDA 2G2QA 3E0UA 2V6KA 4ILFA 2H70A 3IV4A 1GUMA 2FWEA 4IKHA 2LKUA 1T4ZA 3GUSA 3HJMA 2NVLA 3D22A 5F05A 4LA1A 3PR8A 1ZL9A 2H1GA 3APSA 1XW5A 5DCGA 3ME7A 1A0FA 5G2ZA 2PWJA 2H72A 3FZ9A 4MPGA 4PURA 1JLVA 2DIZA 2B7JA 2VM2A 1IYIA 1J08A 4QQ7A 2H0GA 1FW1A 3W8SA 1DSBA 4QL9A 5H5RA 3WGEA 4KDYA 1DUGA 5ECNB 4NWYA 1M2AA 1YZXA 1SJIA 3IE3A 3FY7A 1V58A 4MDCA 4POLA 2HE3A 2L59A 3TKSA 1THOA 3C71A 4ZBBA 5ECMB 2LV3A 1GL8A 4GRFA 4N11A 2WB9A 1GLPA 4BVXA 1WE0A 5G5EA 3TJKA 4TR3A 2LNTA 3EVIA 2CA8A 1EZKA 1EEMA 3QFAC 1ERTA 3IK7A 4ISDA 3GSTA 5F06A 1GSEA 4XS6A 3LORA 18GSA 4ZL9A 1K0OA 1O85A 2FWGA 4JZQA 1OE7A 5E59A 2JACA 4GXZA 1AXDA 1EGRA 1SD8A 1OC9B 4IJIA 2L4CA 3EMXA 17GSA 4HI7A 2MMNA 2FY6A 3ZL5A 3UIWA 4JE1A 3AY8A 1T8EB 4V2NA 1TU7A 4IP1A 4D73B 2I3YA 3M1GA 2ALBA 3M9KA 2OACA 3F3QA 4RI6A 3H8QA 4F9ZA 5HR2A 4O92A 3G7IA 1VF4A 2LJAA 3EMPA 5A4WA 2H0HA 4OO4A 4ZB9A 1Z7RA 4GTUA 4DSSA 4YQVA 1K0BA 4N0VA 4XRDA 2AUVA 5GSSA 1T7PB 1PKZA 2DMLA 3TKSE 1WIKA 3GKKA 4FYBA 4EUYA 3GTUA 2GTUA 1ZGNA 3LXTA 1O8WA 1MDKA 1YEXA 4XS1A 1TK5B 1G7EA 4WETA 2LEGA 3HYPA 3KJYA 2CQ9A 2FA8A 5FT3A 1M7TA 5A4VA 4KE3A 1AQXA 3VLNA 3HVXA 1PN9A 1FVKA 2HZFA 2L57A 1PX6A 2RIIA 2OBKA 5CRWA 1M99A 3IPZA 2ZUPA 1DBYA 3F4TA 4F0CA 3F3RA 3I43A 5DALA 5CREA 4I2UA 5EL8A 3ZYWA 4KGIA 5ID2B 4TW5A 1FO5A 5DBQA 3KEBA 5INYA 5J4UA 3TKQA 1TI1A 3D0ZA 2WJUA 2E7PA 1T00A 3HKRA 4J56E 5JCUA 1LU4A 5ECPB 4MJBA 3TRPA 3KM6A 4WEYA 4EO3A 2CT6A 1R5AA 2CX3A 2DJ0A 2LRNA 4IELA 1ZCPA 4DSRA 1Z7PA 4N0ZA 1EP8A 4Q5RA 1YKAA 2B6MA 1KNGA 1MDIA 1X5EA 2I81A 4TR4A 4TOPA 4ECCA 2AV4A 1MTCA 4KA0A 1F3AA 1WPIA 2GSRA 2PGTA 2F8AA 1JZOA 2DJJA 2LUSA 3F0IA 1GSQA 2C3NA 2LJKA 2YWNA 1SKWB 3SBCA 4EE0A 3MWHA 4WKWA 1R5PA 2LTKA 2GQLA 2H75A 4Q5QA 3EC3A 1N2AA 4XIHA 1BX9A 4OO5A 1TRWA 3GN3A 2DMMA 2X64A 3VPQA 2HRNA 3IHQA 4ZL8A 2VCXA 2B1LA 1FB6A 4BVYA 3IR4A 3ZFLA 1EOHA 3ZMLA 4PQIA 4HU9A 5C00A 1GUKA 2NPBA 1K3OA 1M0UA 2OE3A 2ZNMA 2YZUA 2OADA 2FCHA 3HCZA 2EIQA 1JFUA 5FWGA 2HZEB 3NZNA 4KW6A 2FD3A 2HFDA 1TTZA 2XBQA 1V57A 2F9SA 3UJ1A 2YP6A 1O6JA 4MA9A 2I4AA 3IC4A 4XS4A 3W8JA 3E3EA 2VOCA 2JZTA 2CX4A 2X8GA 5DDLA 5ELGA 1ABAA 5GAND 4EKZA 1XIYA 3RHCA 4JEDA 1TXXA 2FLSA 5CRGA 5ELAA 5KEJA 5IOXA 1NM3A 1SL0B 2CVBA 3CSIA 4K8MA 4JRRA 2GT6A 1ST9A 3L9VA 5GAPD 2DC5A 4K7OA 1CQGA 5IOWA 1XBSA 6GSWA 5CYYA 1OVNA 4OCEA 3UBKA 5D9XA 4X43A 5G1LA 2B5EA 2HYXA 3KCMA 4YQUA 1UA5A 1SJZA 2VCWA 1K0DA 3KD0A 4I6XA 2RUFA 4F82A 2FGXA 2HRFA 3KP9A 1XWBA 3IRAA 3UOMA 3UVTA 4KX4A 1Y25A 2H0IA 4ID0A 4HS1A 1SENA 2L5OA 1GTBA 1OAZA 2HNLA 3TDGA 2ZCTA 4TXOA 2C4JA 4POBA 3FRCA 1Z3EA 5LNKe 2B5XA 1GUHA 4L0WA 3HDCA 4MJEA 1F3BA 4KDXA 1T4YA 2GSQA 1SJ6A 2R4VA 1G6YA 2JSZA 4CW9A 1B9XC 3GL5A 4IVFA 2WDUA 2OE1A 3GFKA 1U3AA 3FR9A 1A0RP 1JZWA 4EDYA 1GTAA 1E2YA 4ECJA 3L9UA 3DMLA 4HQZA 5G31A 3WYWA 2IMDA 3QMXA 3PINA 1GLQA 4MPFA 3C1SA 3EINA 5DJLA 2VIMA 1ERUA 4PNFA 3CBUA 2NBSA 2MYGA 1QUWA 2YJHA 3CYNA 2QC7A 2IL3A 3D5JA 4G2EA 1JHBA 3F4RA 1A2LA 2YOIA 4RQRA 2R6KA 4F2IA 2V41A 3NIVA 5JWRB 1SL2B 4XTSA 1Z6MA 3GNJA 2AJQB 1EP7A 1WOUA 2O7KA 1PL1A 3HY2A 2YNXA 5J9BA 2VM1A 4BL7A 4GQFA 2J23A 1BAYA 5ECLB 4PQ1A 1AQWA 1FVJA 3F9UA 5DJMA 1GSUA 1FAAA 1H75A 3IA1A 4IGJA 2PBJA 1ERVA 3GIXA 5ECHB 1YQ1A 2LS5A 3MAKA 2H8LA 1USBA 3HHVA 4NV5A 1OC3A 4JR6A 13GSA 2C0GA 5L71A 5HR1A 3UARA 2HSYA 3ZREA 4V1Ap 4PXOA 2O89A 4TVEA 5AIVA 2PMTA 4PGTA 3KMNA 1F9MA 1T1VA 2IN3A 4MZWA 3A2WA 2PU9C 5F8BA 2GLRA 3ZLPA 3TUEA 3RAZA 1BG5A 1YJ6A 3VWVA 4OCFA 2WULA 3ZFBA 2Z9SA 1NW2A 4EL1A 2YWIA 2DBCA 5CRDA 2XC2A 1YF1A 5DAKB 1SK0A 4FO5A 3S9FA 4I97A 2VO4A 3A2VA 2GSSA 2KP1A 2KUCA 3HA9A 3KMOA 4J2FA 5DCHA 5HFGA 1G6WA 4KCEA 3GL3A 2GVPA 3WT1A 4XHMA 2XPEA 1ZMAA 2N5BA 3O3TA 3C73A 3CRUA 2L4QA 4H86A 3VWXA 5DVBA 1VF1A 2OKAA 1K0AA 3GYKA 4ML6A 5ECSA 2I9HA 1ZZYA 3DD3A 3GA4A 4O5RA 5IMVA 1XOAA 3KIJA 3FW2A 5D93A 2G0FA 2GZPA 3FYGA 1X9SB 3ZZXA 3VWUA 2JL4A 3DVXA 3ZVJA 3F4SA 1I5GA 2HXKA 1MD4A 4MZBA 5A4UA 3GH9A 1B4PA 2FWHA 3QAGA 3QPMA 5CP1A 2PVOC 1YF0A 2OBIA 4MF6A 3KXOA 2IPAA 6GSXA 2L5LA 1VF2A 1UC7A 1JZRA 2H01A 1AUCA 2EC4A 2P31A 4IQ1A 2YWMA 4K7IA 1THXA 2DIYA 2FHEA 3DIEA 3TJGA 3KTBA 2DSAA 3EYTA 1XWKA 3KH7A 2MZCA 4Q5FA 1K3LA 1TRUA 3GKMA 1SYXA 12GSA 2YWOA 4ULXA 1O81A 3QAVA 4MH2A 4X1UA 1GWCA 4EVMA 2V1MA 20GSA 3Q18A 5DQYA 1FHEA 1Q98A 3Q19A 3D21A 2H6XA 5HR0A 1QGVA 1FOVA 1Y6EA 1C72A 1XWCA 4V1Ag 3LSZA 1MEKA 3CTFA 3RPPA 2DJKA 19GSA 2C3TA 1XCCA 3IBHA 1A8LA 4DVCA 3TKPA 2YANA 3IOSA 1TP9A 3MDKA 4OFMA 3BOAA 3U6VA 2CAIA 3VPTA 1PMTA 2VD0A 4EC0A 2A4VA 4QL7A 1M9BA 2C8UA 3VFIA 4O32A 2H30A 2D2ZA 3GX0A 3HJOA 6GSTA 3LYKA 2H73A 2XHFA 4ML1A 4I8BA 3VK9A 4HU7A 2O87A 4XCSA 3QOUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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