4ZIJA

Crystal structure of e.coli dsba in complex with 2-(4-iodophenylsulfonamido) benzoic acid
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbA
publication title Determination of ligand binding modes in weak protein-ligand complexes using sparse NMR data.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
total genus 65
structure length 188
sequence length 188
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4zijA00
2GT5A 3LFLA 4ECBA 1GUKA 4K7NA 4V2MA 3GKMA 2KP1A 4WBRD 2KLXA 1YF1A 4WXTA 1O81A 1J9BA 2YANA 5DJLA 4XS4A 3E0UA 1E6BA 1YY7A 1NHOA 1QK8A 2JSZA 5G1KA 1GUMA 4K8MA 4F9ZA 4ZB9A 2X8CA 5D9VA 3CRTA 4ULXA 3GTUB 2H1BA 4X43A 2C8UA 3VWWA 2TRCP 3G7JA 2G2QA 2C0FA 5EVOA 2CX4A 2IFQB 5G5EA 2FCHA 4FH8A 5AGYA 1X5EA 4RQXA 4EL1A 5E4WA 2C0GA 1V98A 4TR3A 4TOPA 3D6IA 5KN1A 1XZOA 1ZCPA 4KW6A 5B6NA 2O87A 5DAKB 2OBKA 4OD7A 1H75A 3IV4A 4ILFA 3I69A 2R2JA 3EYTA 3LWAA 2JZRA 1MTCA 5EPFA 3ZTLA 2P31A 3F4RA 1J08A 4V1Ag 2H73A 3IR4A 2FWHA 2G0FA 2PGTA 2O7KA 2YV7A 3FR3A 3SWLA 1XOAA 5JCUA 4HQSA 1X9WB 2YN1A 2EIQA 5ELAA 1SKRB 2VL2C 2I3YA 2QGVA 1YEXA 3ERFA 3HHVA 3QCPA 5HR0A 3MWHA 4MZWA 4ECJA 2MYGA 1TOFA 5F07A 2FHEA 4WETA 4XTSA 3LGCA 3VWXA 3AY8A 1Z7PA 2OE1A 3CRUA 2NPBA 4TVEA 3UIWA 3F9UA 1NW2A 4PNGA 4YH2A 3GX0A 5A4VA 2DJ0A 4BA7A 5GSTA 4MF6A 1K0DA 4J57E 4AF2A 1GSFA 1ZYQB 4JU5A 1V58A 1SL0B 4IJ3A 3QAWA 3CSHA 1Z3EA 3FR9A 1JZOA 1IYHA 1J0FA 4PQ1A 2M46A 1O85A 1XWAA 1A2LA 1YEPA 5IMVA 1SK0A 7GSSA 3P7XA 5J9BA 3DVWA 2K8VA 2YJ7A 1NSWA 2FGXA 5GAND 2LJAA 4GXZA 2RLIA 4HZ4A 4GQFA 2GQKA 3APQA 4QL9A 1XWKA 2D2ZA 2KOKA 4KGIA 2HSYA 1GTAA 2JADA 4RUVA 3CXGA 4PGTA 5FT3A 3D4MA 1A23A 3N9JA 4MF7A 4POBA 2B7KA 3QR6A 1EZKA 2DMMA 4ZIJA 2TRXA 1A0FA 2GQLA 1G6YA 2NVLA 2FA8A 2P5RA 5ECLB 1VRSD 2VM2A 4HJMA 4MK3A 4GF0A 5ECSA 3MSZA 3U6VA 2PVQA 1M2DA 2CT6A 2C3TA 1CQGA 4N10A 4V1Ap 2B1LA 4LMVA 1PN9A 5IOWA 3EMPA 3NIVA 2HRNA 5EL8A 3UMAA 5HR2A 3FW2A 1FO5A 4TKYA 2FA4A 2YNXA 1TU8A 5ECKB 1GTIA 5IQYA 1OAZA 1OKDA 4LL4B 3P2AA 2L59A 3TDGA 2H8LA 5J4UA 1R4WA 3WD6A 2IMIA 2CVBA 5DJMA 1O8WA 1UN2A 1Z6NA 2CA8A 1B4PA 2L6DA 5D9TA 1EP7A 3BOAA 1A8YA 4WF4A 11GSA 4POKA 3F63A 2R37A 2HE3A 4N0VA 1OC9B 1RK4A 1TKDB 3CSIA 4ID0A 5A4WA 1H4OA 4F03A 4HEA2 1X9SB 1DE1A 1K3LA 2L5LA 2X64A 2QC7A 2VL3A 5L71A 3UAPA 3FEUA 1XFLA 6GSSA 2LV3A 5ECIB 1OYJA 3CBUA 4G9HA 5J3RA 6GSTA 4FYBA 3IHQA 3C8EA 2OACA 4EUYA 1WPIA 3H93A 5DALB 4TR0A 1T3BA 4OFNA 5ENUA 4I5QA 1TTZA 2H76A 4O7HA 3IC4A 4ZL9A 2NTOA 4E8EA 2H6ZA 1Z6MA 3HZ8A 3FZ4A 2R4VA 1TP9A 2ON5A 3RAZA 4Q5QA 1GP1A 1SK1A 2YCDA 3DIEA 1M7TA 3PGTA 4XS1A 1GL8A 2X8GA 1GLQA 1OE8A 3TRXA 3APOA 5KEJA 2XBIA 4NWYA 1U3AA 1WRYA 4IP6A 3HA9A 3Q74A 4BL7A 2VO4A 1AQVA 2VM1A 2VD0A 4KSOA 1VF2A 1T1VA 3HKRA 4MH3A 3QMXA 5ECHB 4WEYA 2LNSA 5B7CA 4OCFA 2H19A 1F3AA 2TIRA 1IYIA 3DGQA 1ON4A 2FY6A 2DMLA 3ZVJA 2B7JA 2F8AA 6GSWA 5ID2A 1F37A 4IHUA 4CDOA 1B48A 3ERGA 2HLSA 3I9V2 3DKSA 1TJDA 1R5PA 2WRTA 4N30A 5LCZA 20GSA 3TRPA 5IO0A 1FG4A 3KH9A 4L5LA 4Q5RA 1GSDA 1S3DA 2LQQA 1KEBA 2LRCA 2OKAA 5F8BA 1K0OA 4P3YB 3F8UA 3ZIVA 3RHCA 3E3EA 3KM6A 4QQ7A 4MPGA 4IKHA 2H0HA 2VCXA 5ELGA 3VURA 1QGVA 2VCZA 4JE1A 4DSRA 4HI7A 3PINA 4O5RA 4ZL7A 3S9FA 5ID2B 2MBSA 4JEDA 5HQPA 5GAPD 3IAS2 1PX7A 1SYRA 4LL1B 1T4YA 2RM5A 2B5YA 4ZILA 1VF4A 2GS3A 1JFUA 2H0GA 3W6GA 2GZZA 1JZDA 3TJJA 2H72A 3HZ4A 2LSTA 3UOMA 1VGLA 1S3AA 5AIVA 3HCZA 5IMDA 5HR3A 13GSA 4PUFC 3UL3A 4POLA 2CX3A 4IQAA 4O32A 5FHIA 1XOBA 4Q5FA 3HVVA 4ML1A 4BWQA 1WE0A 5DCHA 1SJ6A 4V2NA 17GSA 2A2SA 2HRFA 5CYYA 2HZEA 5INYA 4IBPA 3TKRA 1WP0A 3EINA 3ZL5A 3GYKA 1AC1A 3LYPA 2JU5A 4D73A 10GSA 2OADA 2WFCA 4CHSA 1FB6A 2JZTA 3IA1A 2E2GA 2FWGA 1ML6A 3GFKA 5CREA 3LYKA 1GLPA 3QPMA 5ECRB 2HSHA 1RW1A 2GSRA 2FD3A 3GSTA 2CAIA 2CVDA 3VFIA 3G9BA 2LEGA 2OBIA 3FYGA 2B5XA 2H74A 2FWEA 3KIJA 4DSSB 4N11A 2IIYA 5CNWA 2WGRA 5ECNB 3P90A 4ZBDA 1EOGA 3QDNA 1HQOA 3UEMA 3WGEA 4G10A 3V1WA 1YF0A 4NMUA 3VLNA 1M2BA 5JWOB 5JWRB 3ERWA 1EGRA 1O7UA 5ECQB 2DJKA 2GQMA 2I9HA 5CRDA 3GRXA 3GKKA 1XW5A 3FZ5A 2KUCA 2M80A 5DBQA 3F4TA 4MH2A 3KXOA 2C1YA 4IS0A 3D4TA 4XS4B 1A8LA 2B6MA 2DJ1A 1TI1A 2R5GA 3FR6A 4NXIA 1B4QA 4ISDA 2LRTA 1SYXA 2LJRA 4ML6A 5LD0A 5DCGA 3UARA 1SD8A 2GLRA 4EXJA 2K18A 1T7PB 4K6XA 2PUKC 5J41A 3M1GA 2R3XA 1K0NA 2GZYA 1G0TA 2WULA 4MCUA 4ZBAA 1BYEA 3KJYA 3ZZXA 4NHWA 3GH9A 3A2VA 2C4JA 5HFIA 1O8XA 1DSBA 3EMXA 4Q5NA 2CV4A 3Q18A 4ACSA 2XBQA 3ZYWA 4EDZA 4BVXA 4L0WA 5IMZA 2RIIA 2H1AA 1JZRA 5CP1A 2DSAA 1XW9A 1WOUA 2HNLA 2H1DA 4WBJA 2OA7A 4IJIA 4ZB8A 5DQSA 2VD1A 4EF0A 2C80A 3I43A 5CRWA 3PH9A 4E8HA 2VIMA 1ZZYA 3TKSA 3ZVJD 9GSSA 3EVIA 2IPAA 1K0MA 1JLWA 2WDUA 2N5FA 4OCEA 3EE2A 5IO2A 1K0CA 1ABAA 3TKPA 4PX1A 1SU9A 3F0IA 4PXOA 1ERTA 5CRGA 5E59A 4I6XA 4LLRA 4DEJA 5ECMB 4WR5A 3GH6A 2I81A 3GX8A 4AJ8A 1TRSA 2WS2A 5G5FA 2JL4A 2NBSA 4IVFA 1B8XA 4HOJA 3IK7A 2GSTA 3UBLA 2HT9A 5CAXA 3TOUA 1EV4A 1K3YA 4XRDA 2F8FA 18GSA 2VCVA 4TN8A 3QFBC 4JZQA 3HD5A 3VK9A 2CVKA 2IL3A 1UA5A 1AIUA 1Q4JA 4DSQA 2OE3A 1PX6A 3GKNA 4MF5A 5A5KA 5AN1A 4F2IA 1LBKA 1WIKA 5J5NA 1LU4A 4NV2A 3IXRA 3O6TA 4MZBA 4J56E 1M99A 1MEKA 3IDVA 2JSYA 2YJHA 2NDOA 3ME8A 2ZUPA 5F05A 2OJLA 2P0GA 4FIWA 5HFGA 1K3OA 1OC3A 3GL5A 2E2MA 1Q98A 2AV4A 1GNWA 3HJPA 1BAYA 4PUAA 4GCIA 4KCAA 5G1LA 3WT2A 1TI3A 1XWGA 2AYTA 3L78A 3EURA 2PERA 3N5OA 1YKAA 1SENA 4MMMA 1GTBA 3H8QA 4OWYA 5GSSA 3F6FA 2MMNA 1FAAA 3OR5A 3NZNA 2H75A 1XIYA 2AUVA 1M9AA 3FY7A 5EY6A 1OVNA 4K7IA 2C0DA 4QL7A 2L4CA 3ZMLA 1QFNA 4YAVA 3TKSE 2V2GA 3KZQA 3GL3A 3H1NA 1BQ7A 3LEFA 2H6YA 3L9SA 2DJJA 2HYXA 3L9UA 1ZOFA 3TOTA 3TUEA 4IN0A 1A2JA 1PA3A 4RQRA 3MNGA 1VF3A 5F0GA 2Z9SA 1V40A 1NM3A 2B1KA 3TJFA 2LKUA 2CQ9A 1V57A 3C73A 1F3BA 1X5CA 4I8BA 2PWJA 4XS6A 3D22A 3GUSA 3RDWA 1W89A 4PQHA 4CW9A 2H1GA 1KTEA 3TJBA 3EC3A 2FNOA 5DVBA 1PD21 2XC2A 5KN0A 4H86A 1USBA 1PGTA 1XXUA 1XVWA 4X0XA 1C72A 3GHAA 2E0QA 3VI5A 5IPHA 4YQVA 4BVYA 4PQIA 2QKEA 3Q19A 4JR4A 3ZITA 6GSUA 1R26A 1HNAA 1SJZA 3US3A 1PL2A 4G2EA 3LXZA 2LTKA 3CTFA 3D21A 4DVCA 5ECPB 1PRXA 4J2FA 1B9YC 2O85A 3DYRA 4GSSA 3M9KA 4KDYA 1PSQA 1THXA 4K2DA 3ZRDA 5LNKe 2IWTA 4EDYA 2L4QA 4RI7A 4MLYA 1GSSA 1BEDA 3WGXA 4MJEA 3I6AA 1WWJA 5B6MA 2PPTA 3G7IA 4KNDA 1AAZA 1B9XC 2YZUA 2KHPA 2XPEA 1YDKA 3TJKA 3U5RE 1F2EA 1MD3A 2VCWA 5IPGA 2IJYA 1HD2A 2C3QA 1EOHA 5DQYA 1MD4A 3Q6OA 2FUG2 2B5EA 1ZL9A 3TKQA 2EC4A 4EO3A 1EEMA 3KH7A 5J9CA 3VPTA 3C71A 5B8BA 1JLVA 1T4ZA 4ECIA 1Z9HA 3WGDA 3GN3A 2L57A 5D93A 3IAM2 3KD0A 2CZ3A 3C7MA 1TXXA 1R5AA 1Z5YE 3RPPA 2X8HA 1XW6A 3F3QA 5AIXA 1FW1A 4MZCA 3KCMA 4TR4A 6GSXA 2C0EA 3H4KA 2X99A 4I2UA 2LS5A 4NAXA 1OC8A 4AGSA 2FWFA 4V2LA 3NOFA 5D73A 8GSSA 3KMOA 1A2MA 5GZZB 3KMNA 2YV9A 1THOA 14GSA 3R2QA 3H79A 2YWNA 1X9MB 5D96A 1GH2A 1YZXA 4GSNA 2AB6A 3WT1A 3DMLA 1EEJA 2REMA 4TXVA 3KEBA 2A2RA 2ALBA 2DJ3A 5JWQB 2GGTA 5IMAA 4N0ZA 3F4SA 3G7YA 2H01A 2IMFA 3IOSA 2RM6A 4GLTA 2CAQA 2L6CA 3E9JB 4ZBBA 1I5GA 1GWCA 5HR1A 1EV9A 4MABA 4O92A 3GTUA 1E2YA 1AQWA 1PL1A 1YKCA 3LXTA 19GSA 4HS1A 1G6WA 1SKSB 1YQ1A 3BD2A 3ZIJA 2O8VB 3ME7A 4LMWA 3L4NA 2IFQA 4EKZA 1ACVA 3LQ7A 3TJGA 1XBSA 2YOIA 1PKZA 2GSQA 4TW5A 1TDIA 2VAFA 3HY2A 2V6KA 2HZEB 3UVHA 5G30A 2IN3A 3LSZA 5D8IA 4OFTA 5DAKA 4K0NA 1HNBA 2DIYA 4IW9A 2JACA 2VLTA 1AUCA 1UVZA 1BJXA 4D73B 5KN3A 1JZWA 3ED3A 3VPQA 2VLVA 2H0IA 1TRUA 4MP4A 1WMJA 2EIRA 4KDXA 4I97A 4PNFA 2N5BA 4AJ6A 2PBJA 4OO4A 4POMA 1PKWA 1BG5A 1GTUA 3IK9A 2YPMA 4K0GA 1EP8A 3TGZA 1XWCA 1U3IA 4IP1A 3TRQA 1GRXA 3QD9A 3KGKA 5COHA 1ZGNA 4MJCA 2HFDA 3HVSA 4GTUA 2WJUA 4YQMA 4F0CA 1U6TA 1RQMA 1T00A 2YWIA 3WYWA 4F82A 2AJQB 3A2XA 1OKTA 5IMFA 2EIOA 2IMDA 4NHZA 4JR6A 4GQCA 2VOCA 2P5QA 3VWUA 2H30A 2HZFA 1G7EA 1JHBA 1X0RA 2ON7A 2V1MA 1MDKA 3HDCA 4MA9A 1ILOA 1TW9A 1ST9A 4FYCA 4EC0A 1DUGA 4KA0A 3A3TA 3L0HA 1WJKA 3DWVA 1FVKA 2PVOC 4BPYA 4LA1A 1Y6EA 1Z7RA 3FRCA 2YWOA 2HI7A 2LUSA 2R6KA 1U88A 3A2WA 4MDCA 3HJMA 5D9XA 4OFMA 3RPNA 16GSA 1CQHA 1SD9A 4HU7A 1KNGA 4L8EA 2GZPA 2PN8A 3GNJA 3HXSA 4MPFA 5CO3A 2IMEA 4TR1A 3BCIA 2HXKA 4K9ZA 1S3CA 2VLUA 2WB9A 3IE3A 4GWRA 2K8SA 4PURA 1TRVA 3EU3A 3L9VA 4KX4A 2IMKA 5C04A 1SKWB 4HU9A 1XWBA 4XRAA 5DDLA 1HYUA 2YZHA 1QQ2A 3W8JA 2LQOA 2F3MA 3D5JA 2JZSA 5A4UA 2CZ2A 2QSIA 5G31A 3KP9A 3APSA 3F6DA 2F9SA 4JRRA 2PMTA 2AAWA 2WZ9A 2WCIA 4EE0A 1TK8B 2AHEA 2VUPA 1FHEA 2OE0A 2GDRA 1DBYA 4ZB6A 3J7Yb 5FWGA 2H70A 4TR1B 2K6VA 3IBHA 1ZMAA 2E7PA 2N5AA 2GT6A 1SL1B 3GMFA 4IGJA 1A0RP 2V6OA 3O76A 4L5OA 1UC7A 2BMXA 4HDEA 2A4VA 2PU9C 3MAKA 4HUAA 1HNCA 2XHFA 5IOXA 3VI7A 3QOUA 1K0BA 1SL2B 2ES7A 3RBTA 3W8SA 1GNEA 4K1FA 6GSYA 3M0FA 1OC9A 5IM9A 2FLSA 4HJ2A 1ERWA 2BTOT 4K7OA 4KH7A 2GVPA 1FVJA 2O89A 2H6XA 1OE7A 3J7Yk 3UJ1A 3UBKA 3UVTA 5JCGA 3HYPA 1KBNA 3LJRA 1PQNA 1ERUA 4TRXA 5B8AA 4XIHA 4ECCA 2GTUA 3LG6A 4Z7XA 1MDJA 1AQXA 3ISOA 3FKFA 1DE2A 3KTBA 3CSJA 5IMCA 1W4VA 1TU7A 1GUHA 5DALA 4MJBA 1GSUA 3QFAC 5KN2A 3MDKA 3M3MA 3JCML 1SK2A 2H71A 2ZNMA 5H5RA 1F9MA 1AW9A 4GRFA 1K0AA 4ZL8A 2KP2A 1GULA 3IPZA 4OO5A 3TCOA 3KP8A 4I2TA 4KAEA 4RI6A 4JBBA 1V2AA 3CTGA 2VCTA 4FYUA 1BX9A 3ZMKA 4L0UA 1QXHA 4ZXGA 2M72A 4WR4A 3QAGA 1AXDA 3KTLA 3GIXA 3ZFBA 3BCKA 6GSVA 2GSSA 1GSQA 4WKWA 5HFKA 1TK5B 2RUEA 1LJRA 3DRNA 1PMTA 3GURA 3ZREA 2H66A 2VL2A 3CMIA 2DLXA 1VF1A 4HQZA 5AISA 3BBYA 1M9BA 5D9WA 1U87A 2DBCA 1N8JA 1MDIA 4BWSA 1X5DA 1ERVA 3EU4A 3EWLA 2XPDA 1URMA 5CRHA 3FK8A 4XHMA 2F51A 3RHBA 3DVXA 3TB2A 1EGOA 1TRWA 22GSA 1XVQA 3A5WA 3QAVA 1F6MC 5H5SA 2BJXA 3DD3A 1TK0B 3IRAA 3VWVA 2YP6A 1G7OA 4YQUA 2VCQA 12GSA 4G19A 3GA4A 3P8WA 3LORA 2YWMA 3HJOA 4KSMA 4KDUA 3TKSC 4GSTA 3SBCA 3GSSA 4KCEA 3DEXA 2LRNA 4IQ1A 1FB0A 1I9DA 5JCWA 3PR8A 4NV5A 4FO5A 2B3SA 2LNTA 1SJIA 4TXOA 4KB3A 4YAPA 2V32A 1M0UA 1YJ6A 4KUNA 3D0ZA 4KE3A 3GV1A 3M9JA 3O3TA 3FZAA 1QMVA 1GSYA 3GKXA 1ZYEA 4HZ2A 1QUWA 2LJKA 1M2AA 1V9WA 4X1UA 3ZFLA 3ZLPA 1GSEA 2I1UA 2V41A 3CYNA 4MJAA 3C1SA 1FOVA 3HVXA 1O73A 5H5QA 2DJ2A 2MZCA 1O6JA 4WF5A 4OMVA 5F06A 1Y25A 3BJ5A 2VL9A 4TXOB 2RUFA 1A24A 1T8EB 5ECOB 2K9FA 2DC5A 2MMAA 4AJ7A 2MMOA 3F3RA 2J23A 4XCSA 1XPVA 2C3NA 1XCCA 1N2AA 3FHKA 3C1RA 4NPBA 2DIZA 1R7HA 2J9HA 2MBTA 3FZ9A 4EVMA 4F0BA 3DXBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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