2WGRA

Combining crystallography and molecular dynamics: the case of schistosoma mansoni phospholipid glutathione peroxidase
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
SWNSIYEFTVKDINGVDVSLEKYRGHVCLIVNVACKSGATDKNYRQLQEMHTRLVGKGLRILAFPCNQFGGQEPWAEAEIKKFVTEKYGVQFDMFSKIKVNGSDADDLYKFLKSRQHGTLTNNIKWNFSKFLVDRQGQPVKRYSPTTAPYDIEGDIMELLEKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
publication title Combining Crystallography and Molecular Dynamics: The Case of Schistosoma Mansoni Phospholipid Glutathione Peroxidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTATHIONE PEROXIDASE
total genus 65
structure length 163
sequence length 163
ec nomenclature ec 1.11.1.9: Glutathione peroxidase.
pdb deposition date 2009-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00255 GSHPx Glutathione peroxidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2wgrA00
1A23A 5DQYA 1YF0A 1VF2A 4XCSA 3F0IA 5CYYA 5DJLA 3IV4A 19GSA 1AUCA 1V58A 3ZITA 1IYHA 3FRCA 1BX9A 4YAPA 3FK8A 3C1SA 4KSOA 2DBCA 3MAKA 2PUKC 2L59A 1WJKA 3ERWA 4KDXA 2GSQA 3TGZA 4I97A 2H1AA 3IAS2 4DSRA 1MDJA 4HOJA 1DE2A 3GSTA 2N5FA 5B6NA 4RQXA 4GTUA 2H70A 1R7HA 2WGRA 1MD3A 1F3AA 4MF7A 3GMFA 3NOFA 2ZUPA 2ALBA 3P7XA 1TK5B 3L9SA 1YEXA 2JZTA 2B5YA 1GH2A 3KM6A 1OC9B 1F2EA 1OVNA 1PX6A 1JLWA 1HNBA 4G10A 2A2RA 4PUFC 4MJEA 4ECIA 2M80A 1SYXA 4MH3A 4EDZA 3M0FA 1ACVA 5G5EA 4V2MA 3MDKA 2XPDA 2CQ9A 1YY7A 4MMMA 2JADA 2H6XA 4V2LA 3ZFBA 1K0OA 4F03A 1TW9A 5ID2A 5J5NA 4K8MA 2L57A 4KGIA 1U87A 2WS2A 2XBQA 12GSA 3D4MA 4POKA 3QAVA 4KSMA 3VWUA 2R37A 2L5OA 4BPYA 1WMJA 1XWGA 3LG6A 1E2YA 1XWBA 2CA8A 4L0UA 2GQMA 2O85A 3GKMA 4HZ4A 4IJ3A 1XXUA 5H5QA 1ZGNA 4WR4A 4KX4A 3TJKA 4AGSA 5ECRB 1A8YA 3HDCA 3CTFA 1Q98A 2WRTA 3GFKA 2GGTA 2ES7A 1YDKA 2IMKA 2B1KA 5D9TA 4KAEA 2RLIA 3HA9A 2AB6A 2RM5A 1URMA 3TUEA 1Y6EA 3FR9A 4JE1A 1V98A 1TKDB 4HUAA 2F3MA 2QSIA 1SENA 1GUMA 3C1RA 1GTBA 2KUCA 2OJLA 2GZZA 2L6CA 4ILFA 2PWJA 4DSSB 5ECKB 1XWAA 1M7TA 2WJUA 2K8SA 4GXZA 6GSXA 3WT2A 4CW9A 4MJCA 1M2BA 4K7IA 2I1UA 4XS1A 3DD3A 4PQIA 1V9WA 2XPEA 3GIXA 3HKRA 3L0HA 1N2AA 5CREA 3TCOA 1ERUA 5FHIA 2A2SA 5A4UA 3ERGA 2OKAA 3ZTLA 2LEGA 1T7PB 2WZ9A 2H1GA 3UARA 3HYPA 1PMTA 3WGEA 2VL9A 4XTSA 2IN3A 1SD9A 1LBKA 2F8FA 3IAM2 4GCIA 1EEJA 3RHCA 4GLTA 2GSRA 4LA1A 5ECQB 1RK4A 3VURA 3MSZA 2DJ0A 1H75A 2EIQA 5HFIA 5ABRA 5LNKe 3QDNA 3ZIJA 2DLXA 3GTUA 2BMXA 5D9XA 2C3NA 3QPMA 3L9VA 3CRUA 3GKXA 1OAZA 4KUNA 1G7EA 2ZCTA 3BD2A 2JSYA 1TRWA 3HVVA 2IFQA 4FH8A 3ZYWA 4ZXGA 1AQXA 5ENUA 5GZZB 2H1DA 3M3MA 4FIWA 2YCDA 4OWYA 2FNOA 3GHAA 4ACSA 3CRTA 4OFTA 2BJXA 1CQGA 5JWRB 1FHEA 1YKAA 4IHUA 2R5GA 2XBIA 3V1WA 3N5OA 1K3LA 2F51A 4JR6A 1AAZA 4GWRA 4NXIA 3TRPA 2H30A 3GURA 2R2JA 3H8QA 3A5WA 3QCPA 2IMDA 2OACA 5INYA 2LNTA 1O8XA 3QMXA 3QR6A 4KB3A 3ED3A 3F63A 2VLVA 1THOA 5KEJA 1WP0A 1FB6A 4KA0A 3GSSA 1T3BA 3F3QA 3DXBA 4HJMA 5H5SA 4E8HA 5HR2A 3R2QA 4LMWA 5ECIB 4XIHA 1PSQA 4PX1A 3ZVJA 3CSJA 4BA7A 2IPAA 3IC4A 5AIXA 4MLYA 1T8EB 2HRNA 5IMAA 3HCZA 3APOA 3GNJA 3F4RA 2QKEA 1MTCA 17GSA 1OC8A 4ECJA 4JZQA 1FO5A 4MJBA 2LQOA 3L78A 2XHFA 3VI5A 1X9MB 4L5OA 1JZWA 3EU3A 3US3A 1R4WA 1U6TA 2VCQA 3GN3A 2MMNA 4HS1A 1DUGA 1SL0B 2DJ1A 2B5EA 1M9BA 2KLXA 4WETA 4XS4B 3KTBA 4RI7A 1SL1B 4BVYA 2DIYA 2MMAA 4HU9A 2CVKA 3FR3A 1T4YA 3L9UA 1QMVA 1EGOA 1K0CA 2VCTA 4IQAA 1B9YC 3EMXA 2X99A 3VWWA 2CX3A 2HZFA 2CZ2A 1M2DA 1PX7A 2LUSA 4AJ8A 4F0BA 3H1NA 3UVHA 2G0FA 4OFNA 2DSAA 2WB9A 3TB2A 2LKUA 4WR5A 3EURA 4O7HA 3UBLA 1Q4JA 2B3SA 4Q5NA 2LS5A 1XW5A 4WF5A 4ZBDA 4GSNA 2JU5A 4TR1A 3TOTA 1X5EA 1X9WB 4KH7A 1GSDA 1TDIA 1AQVA 3HZ8A 1TU8A 1YEPA 2J23A 4JRRA 22GSA 2H75A 6GSYA 4EF0A 3GH6A 3N9JA 1MDKA 1PGTA 1FVJA 1A24A 4OO4A 2L4CA 4HJ2A 1GRXA 5CO3A 3W8SA 4HEA2 5ID2B 2HT9A 2H76A 4K9ZA 4GSTA 3E9JB 2NTOA 5F06A 1SJ6A 2IWTA 3TJBA 4BVXA 2C0EA 4G19A 1A2MA 3GKNA 3K8NA 4TXOB 2C80A 1O8WA 2VD0A 3PR8A 2YV7A 5CNWA 2E2MA 3QOUA 2GSTA 5JCUA 20GSA 1GUKA 4HI7A 2A4VA 4J57E 5B7CA 3EWLA 5GAND 1GNWA 1NSWA 3FZ4A 1TP9A 4WBRD 3OR5A 2YZUA 1G6YA 2B1LA 1TXXA 3HY2A 4EKZA 3H79A 1EP7A 1W89A 1WOUA 3ZFLA 4L0WA 1AC1A 1GSFA 5CRHA 3U5RE 1Z7PA 2C0DA 4K2DA 1OKTA 1XW9A 3L4NA 3FZAA 4I2UA 3DVXA 3C8EA 2RIIA 4YAVA 1THXA 3GUSA 1B9XC 3LJRA 2IMIA 2R4VA 4IJIA 1JZDA 1MEKA 3WGXA 4N30A 1XWCA 4IVFA 6GSSA 3ZVJD 4IELA 2CV4A 2WDUA 4OFMA 2IIYA 1RQMA 1ML6A 3RBTA 4WXTA 1WRYA 1K0MA 3TKQA 2WFCA 3LXZA 2L5LA 5B8AA 4YH2A 4KCAA 2FY6A 2OBKA 1R5AA 4ML6A 3UEMA 3D5JA 2VO4A 1ST9A 4V1Ag 1ZCPA 4IKHA 3GYKA 1K0NA 4RQRA 3IPZA 2FD3A 5DVBA 2LJAA 5ECNB 4P3YB 2IL3A 4ML1A 4POMA 1EZKA 4O5RA 2F9SA 1EV4A 3KMNA 2GZYA 1ERVA 1JZRA 4TW5A 4QL9A 1USBA 2LTKA 4HZ2A 5DJMA 1WWJA 1V40A 5J3RA 2JACA 1K0AA 2PPTA 2C0FA 4KE3A 1PQNA 1ERWA 3TKSE 2O87A 2H0GA 2V41A 1ABAA 1GSSA 3FKFA 2YJ7A 4POLA 5G1KA 1EOGA 4DVCA 4MA9A 1BG5A 5COHA 4EXJA 4JU5A 4TR3A 3Q18A 3FZ5A 1K0DA 3GTUB 3TDGA 2V1MA 2EC4A 1SD8A 3KP9A 4IGJA 4N0VA 2YNXA 4K0NA 5DCGA 3E3EA 3CTGA 2CT6A 1EWXA 1TI3A 3IDVA 1J0FA 2IFQB 3VI7A 14GSA 1SK0A 4V1Ap 1YQ1A 2Z9SA 4KNDA 4F0CA 5D9WA 1AQWA 4JEDA 5FT3A 2E2GA 2HNLA 2VL3A 3EC3A 2MBTA 5CRGA 4WKWA 5G30A 1XBSA 1ZYEA 10GSA 3ME8A 1T1VA 4WF4A 4X1UA 2YN1A 2VM2A 4ISDA 2H6YA 1BJXA 3F6FA 3W6GA 3KCMA 3IK7A 1U3IA 1FOVA 3QAGA 1X0RA 3KP8A 2H0HA 2CVBA 4V2NA 5KN1A 1AXDA 2YJHA 4PXOA 5F07A 2K18A 5D73A 4HQZA 3O6TA 1ZYQB 4N0ZA 4NWYA 3D0ZA 2DJ2A 2VCWA 1HD2A 4NAXA 2B5XA 1OC9A 4CHSA 5GAPD 3GRXA 2PN8A 3IK9A 3G9BA 3P8WA 3IOSA 4K1FA 5C00A 4IBPA 1PKWA 5B6MA 1FG4A 5DAKA 1EOHA 1X9SB 5HR0A 2X8CA 2YANA 3M8NA 3A2XA 5ECSA 3FR6A 1XWKA 2R3XA 1WPIA 2P31A 2LRNA 3DYRA 1Z3EA 3KEBA 4POBA 1BYEA 3DKSA 2V2GA 9GSSA 4MPFA 3GA4A 1GTUA 4E8EA 3A2WA 5JCGA 2DMMA 3HVSA 1XIYA 16GSA 2XC2A 2X8HA 3Q6OA 1KTEA 5EPFA 1BEDA 2OE3A 1GUHA 5FWGA 1AW9A 5D93A 3CMIA 4IW9A 1PL1A 4IP6A 1TRVA 1QUWA 4MZWA 1XPVA 1ILOA 2H01A 2AJQB 4I2TA 2PBJA 3VWVA 4OD7A 3GX8A 1K3YA 3AY8A 4IP1A 4HU7A 1GSUA 2PERA 3U6VA 1H4OA 2N5BA 2HYXA 5DALA 2IMFA 3TKSC 4EE0A 3UAPA 1Z9HA 18GSA 2VCVA 2YZHA 1X5DA 2I9HA 4O32A 4YQMA 3W8JA 3D4TA 2J9HA 1J9BA 4LMVA 2M46A 4EL1A 1SL2B 4OCEA 5AGYA 4J2FA 3DGQA 4PGTA 3VWXA 2B7JA 1TI1A 3ZL5A 1PA3A 5ELGA 4MPGA 4TR1B 1XVQA 4OMVA 4ZBBA 3G7JA 1NHYA 3RDWA 5EVOA 1GSQA 2V6KA 4XRAA 3FW2A 2RUEA 2TIRA 4ZL9A 1SK1A 2DJJA 4K7NA 2K9FA 1GTAA 3TJFA 1ZMAA 13GSA 3Q74A 3EYTA 1HNCA 2GVPA 1R5PA 2VL2C 3G7IA 3I6AA 2VUPA 4ZL7A 3TRQA 5E59A 5ECLB 5ECPB 1V57A 1FAAA 2BTOT 2VCZA 1VF1A 1VGLA 4YQUA 1UN2A 4L5LA 2VLUA 3HD5A 3Q19A 4QL7A 4MH2A 5IMCA 1LJRA 4OO5A 5ECMB 2H66A 3KGKA 1KEBA 5HFKA 5A5KA 2NVLA 2QGVA 3KIJA 2OBIA 3IR4A 1YJ6A 1M99A 4EVMA 3IBHA 4I6XA 2JZRA 2RM6A 1I5GA 2FA4A 2HZEA 4LL4B 4GQCA 3LSZA 2C3TA 2QC7A 3UIWA 1GULA 2G2QA 5IM9A 3PH9A 1DSBA 4BL7A 2MZCA 4XS6A 1S3CA 1F3BA 4TN8A 2P5RA 4HQSA 2PMTA 3EE2A 4ZILA 3EINA 1TK0B 2NDOA 4MABA 1U3AA 5IO2A 4GRFA 4AF2A 1G6WA 4I8BA 2KOKA 1VRSD 3ZREA 1QK8A 1Z6MA 4KDUA 1B48A 2CZ3A 5IOWA 3WYWA 3CBUA 1T4ZA 3FEUA 4YQVA 3J7Yb 2YV9A 3CSHA 3BCKA 3HHVA 4MZBA 2KP2A 1UA5A 2HRFA 4KDYA 4ZB9A 5F8BA 4RI6A 5GSSA 1F9MA 2CAIA 5JWOB 6GSWA 5HQPA 11GSA 5CAXA 2H8LA 2KHPA 3FHKA 1VF3A 3GV1A 3PINA 3P2AA 3C71A 1S3AA 3M9KA 2OADA 1EP8A 3BBYA 3LYKA 4GSSA 1NM3A 1E6BA 3UJ1A 2PGTA 2YP6A 2FWEA 2GTUA 5J9BA 8GSSA 2YWIA 2HFDA 3O76A 3C73A 2FWHA 5DBQA 3RHBA 4FO5A 2PVOC 5IPGA 2K6VA 3I69A 4G9HA 2KP1A 4H86A 4IQ1A 1B4PA 1PN9A 1WIKA 4TRXA 2TRCP 3PGTA 3WGDA 2I4AA 3SBCA 4EO3A 3C7MA 3FZ9A 3GL3A 3KXOA 1XCCA 3F4SA 1EV9A 1WE0A 1FW1A 3ZMKA 4MZCA 3HJPA 5HR1A 2EIRA 2H6ZA 1TJDA 3HJMA 1BAYA 4OCFA 2H0IA 3FY7A 3TKPA 5J9CA 1GP1A 1Y25A 1ZZYA 5AISA 1XVWA 2H19A 2CAQA 2M72A 3F9UA 1GSYA 4Z7XA 5G2ZA 3QFAC 2GDRA 4PURA 5GSTA 4NMUA 1K3OA 4TR4A 3MNGA 1GSEA 4CDOA 4D73A 3DWVA 1SJZA 1F6MC 1R26A 2B6MA 1PL2A 2C1YA 1GWCA 4ZIJA 5HR3A 5F05A 1GTIA 2ZNMA 4MF5A 3ZMLA 2YWMA 3TOUA 4Q5QA 4AJ7A 5HFGA 1VF4A 2HE3A 5ELAA 3M1GA 3QAWA 5IIZA 1Z6NA 1W4VA 2F8AA 1PD21 2YWNA 5LCZA 3MWHA 3EMPA 4NHWA 1M0UA 1F37A 2O89A 1TRSA 4EC0A 3D22A 3VK9A 5IO0A 4X0XA 3RAZA 2N5AA 7GSSA 5DAKB 1S3DA 1XFLA 1MD4A 5H5RA 2VLTA 4ECCA 2LRCA 2GS3A 1OC3A 3D21A 4F2IA 2C8UA 3CXGA 4BWQA 1DE1A 1NHOA 2ON7A 4ULXA 2CVDA 3QFBC 2C4JA 4MJAA 1KBNA 2LQQA 3A3TA 1G0TA 2WULA 1SK2A 2H71A 1KNGA 4MK3A 2IMEA 5IMVA 6GSTA 2FGXA 1EEMA 2JSZA 2FA8A 3DEXA 4EUYA 2R6KA 4TXOA 4DEJA 2AHEA 3FYGA 5ECHB 1XW6A 1M2AA 3KTLA 4NHZA 4JR4A 1SJIA 3LEFA 4NV2A 3KJYA 2I81A 5E4WA 1A0RP 1OKDA 2HI7A 5IQYA 2H1BA 1RW1A 2I3YA 4GF0A 3ISOA 1FVKA 2VD1A 5IMFA 2YWOA 4HDEA 3QD9A 3F6DA 3NIVA 3UVTA 1A2JA 4PUAA 2OA7A 2O7KA 2P0GA 3LQ7A 5DALB 5CRDA 4L8EA 3KMOA 3BJ5A 1XOBA 5D8IA 3S9FA 3HXSA 2GLRA 2ON5A 1O85A 4ZL8A 1ON4A 2DJKA 3UL3A 4FYCA 2DC5A 3TKRA 5JWQB 2LNSA 3JCML 4TR0A 1O6JA 1X5CA 1DBYA 4WBJA 2E0QA 3UOMA 5F0GA 3ME7A 1J08A 2EIOA 4KCEA 1K0BA 3A2VA 3LYPA 1A8LA 1G7OA 1BQ7A 2HLSA 1MDIA 1SYRA 2VM1A 3IRAA 5IPHA 2JZSA 1ERTA 4X43A 2V6OA 3UMAA 2GSSA 4BWSA 1XOAA 5C04A 5J41A 1O81A 1TRUA 4ZB6A 2LJKA 2IJYA 2CX4A 1JHBA 4WEYA 3GX0A 4MP4A 5KN0A 3HZ4A 1GLQA 3F3RA 1JLVA 2H72A 2HSHA 5D9VA 4F9ZA 2AUVA 3M9JA 5EL8A 1XZOA 3IHQA 2VCXA 4K7OA 1U88A 3SWLA 1B4QA 4ECBA 1O7UA 2WCIA 2HZEB 1ZOFA 2FWGA 1I9DA 3HVXA 2B7KA 3KH9A 3VLNA 2DIZA 2NPBA 3VFIA 1OE8A 1FB0A 1GL8A 2YPMA 2AAWA 4Q5FA 3HJOA 2LSTA 2DMLA 2FCHA 5B8BA 4IN0A 2MMZA 2PU9C 3KH7A 4XHMA 2GQLA 4I5QA 3F4TA 3WD6A 2D2ZA 1V2AA 6GSVA 2E7PA 3ZZXA 1UC7A 1Z5YE 1HQOA 3DMLA 5IMZA 3LGCA 1YF1A 4TOPA 3KD0A 1EGRA 1TK8B 4QQ7A 1GNEA 3APQA 5G1LA 1N8JA 1SKWB 2HXKA 3GL5A 4DSSA 1QGVA 2YOIA 3D6IA 2L6DA 4G2EA 4J56E 4N11A 3DRNA 4GQFA 5AN1A 3RPPA 2X8GA 5CRWA 2X64A 3H4KA 1JFUA 3TKSA 2HSYA 5KN2A 2LV3A 2GQKA 3TJJA 1A0FA 3IA1A 3LORA 3BCIA 2AV4A 3G7YA 1C72A 3KZQA 4ZBAA 5ECOB 4NPBA 3P90A 5DCHA 1YZXA 2OE0A 2FWFA 2RUFA 2FUG2 2K8VA 4MCUA 2GZPA 2TRXA 4DSQA 2H73A 2DJ3A 1IYIA 4N10A 1QFNA 1B8XA 1LU4A 5DDLA 4IS0A 4JBBA 1HNAA 3ZIVA 6GSUA 3CSIA 4NV5A 4AJ6A 2VL2A 3DVWA 1AIUA 4F82A 2VOCA 2VIMA 5A4WA 4KW6A 1O73A 1OE7A 1QQ2A 2L4QA 1UVZA 1OYJA 2GT5A 2C3QA 4K6XA 4PNFA 3F8UA 2JL4A 3CYNA 4PNGA 3BOAA 5LD0A 1T00A 1QXHA 4ZB8A 2LJRA 3I9V2 4O92A 1TTZA 4MDCA 3DIEA 4D73B 4PQ1A 5D96A 3TRXA 4PQHA 4Q5RA 3EU4A 1A2LA 2REMA 4XRDA 4TVEA 5L71A 3APSA 3I43A 1Z7RA 2MMOA 3EVIA 4RUVA 2LRTA 3VPTA 1SKRB 2V32A 2PVQA 1SKSB 2FLSA 1GLPA 4FYUA 4MF6A 2MBSA 1TOFA 2C0GA 4TXVA 1TU7A 2GT6A 5EY6A 3LFLA 5IOXA 3UBKA 5IMDA 4FYBA 1PRXA 3LWAA 1HYUA 3NZNA 1SU9A 4EDYA 5JCWA 5A4VA 1NW2A 3GKKA 2FHEA 2NBSA 4LL1B 2P5QA 3ZRDA 3ERFA 1ZL9A 3WT1A 2O8VB 2VAFA 5DQSA 1JZOA 5J4UA 3ZLPA 5G5FA 2MYGA 3IXRA 4TKYA 2AYTA 3LXTA 3RPNA 5CP1A 3E0UA 3H93A 3J7Yk 5G31A 4LLRA 3O3TA 1PKZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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