5LNKe

Entire ovine respiratory complex i
Total Genus 19
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
19
sequence length
84
structure length
84
Chain Sequence
LGLREIRIHLCQRSPGSQGVRDFIEKRYVELKKANPDLPILIRECSDVQPKLWARYAFGQEKNVSLNNFSADQVTRALENVLSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Atomic structure of the entire mammalian mitochondrial complex I.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitochondrial complex I, 51 kDa subunit
molecule tags Oxidoreductase
total genus 19
structure length 84
sequence length 84
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
e PF05047 L51_S25_CI-B8 Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5lnke00
1BG5A 3APOA 1OC8A 2RLIA 6GSUA 5F07A 3C1SA 2LV3A 5DJMA 4JZQA 1SK0A 2WFCA 2OJLA 1SK1A 3IV4A 2X8CA 3UJ1A 4HOJA 3QAVA 1SD9A 1YJ6A 2CZ3A 5JCUA 3ZL5A 2L4CA 3GURA 2DJJA 3VI7A 5F06A 1T4YA 2HI7A 3IAS2 13GSA 2HZFA 3M3MA 2P5QA 3FR3A 1YEPA 3KP8A 3GX0A 3IXRA 3IAM2 3N9JA 4IELA 4ZBAA 2P0GA 3IK7A 1UA5A 4FYCA 2C3QA 1ERVA 1WE0A 3PH9A 1F3AA 1NHOA 1LU4A 2P31A 1TRWA 1PRXA 2K18A 2DJ1A 5D93A 3H4KA 3ZMKA 4I6XA 9GSSA 5DAKB 1TXXA 2YZUA 2QC7A 2QGVA 2VAFA 3HA9A 2HLSA 3ZRDA 2HZEA 3UVHA 1WWJA 5HR2A 4XRDA 4BWQA 2OACA 3VLNA 4YQVA 2PU9C 4ECIA 1K0OA 4HU7A 5GZZB 1PMTA 4KDXA 1FOVA 2H66A 4MK3A 4KB3A 2IMKA 5ENUA 2EC4A 4MZBA 1V2AA 2N5BA 4E8HA 5CRWA 3HVSA 1Z9HA 3GH6A 3WYWA 1SL0B 4Q5NA 2R5GA 3FHKA 2M72A 3D0ZA 4TR1B 1XPVA 3CSHA 3FZ4A 3Q18A 2HSHA 4O7HA 4CW9A 2JU5A 1GUMA 1H75A 2E0QA 2CAIA 5EVOA 1GWCA 4KH7A 3F4SA 2GQLA 4MJAA 4QL9A 1I9DA 3EMPA 2MMOA 5KN0A 3UBKA 4ECBA 4PQHA 1XCCA 3LWAA 3M9JA 2FCHA 1LBKA 3F4RA 2YANA 1JFUA 1JZWA 5ECLB 5JWOB 2CV4A 1TK0B 2H1BA 1OKTA 4GCIA 2ON7A 4EO3A 3MAKA 1GLQA 2XBIA 1G7OA 4N0ZA 5AIXA 4MJEA 4F2IA 1IYIA 2V32A 5IO2A 4OD7A 3IBHA 5DAKA 3FRCA 4YH2A 3N5OA 5H5QA 4IJIA 5CRGA 2B5EA 4MLYA 2H19A 4IKHA 1G6YA 1HNCA 1X9WB 2WULA 2FWGA 3ISOA 3F9UA 4I8BA 1H4OA 4HUAA 3CSJA 3L9UA 1TI1A 4RUVA 5AISA 4TR3A 1XOAA 1O8WA 3QFBC 4MA9A 1TP9A 2CX3A 5G5EA 4PUFC 3A2VA 1TK8B 1SL1B 3E3EA 2L6DA 5ECSA 4TR1A 1V98A 1ERTA 3U5RE 1HYUA 4DSQA 2FWHA 4ML1A 3IC4A 2F8FA 4CDOA 1I5GA 4WR5A 2YJHA 4KX4A 1XWBA 1SL2B 1GULA 3F3QA 2C80A 1LJRA 2KLXA 3L78A 3DMLA 3HDCA 3WD6A 4K0GA 1DUGA 5EPFA 3TDGA 4MABA 2C3NA 2YWMA 2V6OA 2H72A 2XHFA 4JRRA 4XS4B 5HR3A 4GTUA 5D96A 3LG6A 5HFIA 1TTZA 4V1Ag 2F8AA 3TCOA 2IIYA 3GNJA 2HRFA 2LS5A 1JZOA 1GSQA 2H1GA 3GTUB 1GLPA 2IJYA 5GAPD 4PNFA 4ID0A 4MZWA 4NV5A 1SENA 2FA4A 4ML6A 2VCZA 3I9V2 1V57A 3RHBA 4KGIA 2WGRA 5ID2B 1FVKA 4KA0A 1AQXA 4AF2A 4PURA 3RDWA 5A4VA 2KHPA 2FA8A 2GQKA 2H0IA 3D4TA 4LA1A 1T7PB 1EP7A 1CQGA 4GRFA 3K8NA 1RK4A 5IO0A 5KN2A 2V6KA 3P7XA 3EU3A 4RQXA 1X9MB 2LNTA 3QFAC 3EINA 2E2MA 2B7JA 3RBTA 3UARA 4HZ2A 2LRNA 4K0NA 4G9HA 2KUCA 4ILFA 3KH7A 2GSTA 3GRXA 3D6IA 4MF7A 4TOPA 5D9VA 1UC7A 4TRXA 2H01A 4YAPA 1X5EA 2DJ0A 3TUEA 4EKZA 1GH2A 3GKXA 4POBA 2IPAA 5C00A 4IJ3A 1ZYEA 2C3TA 2VL3A 2LQOA 1NM3A 4JU5A 1TW9A 12GSA 2IMIA 3CBUA 3LFLA 4XS4A 1QQ2A 5D9WA 5ECHB 1GNEA 1TRSA 4HQZA 1AAZA 3HJPA 4K2DA 5GAND 1O81A 3TKRA 3ZIJA 3HJMA 4QQ7A 1RW1A 2EIQA 1J9BA 2WDUA 4YAVA 1F2EA 3GTUA 4JR6A 1WMJA 4FYUA 2H74A 2GT5A 3I69A 4AJ8A 4J56E 3HHVA 3P90A 2VOCA 5D9TA 5J41A 5A5KA 2XPEA 1ZCPA 1GSEA 1AC1A 3D5JA 3TKSA 3WT1A 2PBJA 3ZZXA 4MP4A 5IPGA 1V58A 4YQUA 3CYNA 4NXIA 3ZTLA 3C71A 2X8HA 4MPFA 2IMDA 2R3XA 4O32A 2OKAA 3IHQA 4LMWA 3GSSA 2NBSA 1AIUA 2NDOA 2REMA 3W6GA 1OC3A 3TKSE 2H70A 2ZNMA 3CXGA 5CO3A 16GSA 1YQ1A 3HXSA 3DKSA 1HNBA 1T3BA 2DMLA 2H6YA 4FH8A 3TKPA 4GXZA 2TIRA 1O7UA 2OADA 1YEXA 3PINA 1K3LA 2HZEB 4MPGA 2JSZA 4D73B 2NVLA 1SD8A 1HD2A 1Z6NA 4DEJA 1G7EA 5DBQA 5LD0A 2IFQB 1QUWA 1R5PA 2RUFA 1T00A 3DWVA 4EDZA 4EE0A 2EIOA 4RI7A 3ZVJA 3OR5A 4RQRA 2A4VA 5D9XA 2LJRA 1WOUA 3VWXA 1YZXA 3MDKA 3HVXA 3EVIA 1M0UA 4MH3A 1R26A 1PA3A 3WT2A 2FWEA 1EOGA 3FR9A 4G2EA 1B4PA 2VCVA 1PKZA 2C0DA 3CRTA 2JSYA 1K0AA 1THXA 3QD9A 5IPHA 2G2QA 3GL3A 1TDIA 1FG4A 5FHIA 3HJOA 5AN1A 2YN1A 1GRXA 4X43A 3VPQA 4PQ1A 1XWAA 5J9BA 2XBQA 3VFIA 2IMFA 2O8VB 5IMVA 3QCPA 1K3OA 3MSZA 4V1Ap 3TOUA 5GSSA 2H30A 1VGLA 1JLVA 4MJBA 4NHWA 4KDUA 3LYKA 4TXOA 3CMIA 3IK9A 2QSIA 1Z3EA 3ZITA 2O87A 1J08A 2H0HA 3KGKA 1ZZYA 3KMNA 3WGDA 4XTSA 1EP8A 2AHEA 2HXKA 3F63A 1MD4A 4WF4A 2LJAA 1A2MA 3ZFBA 4F82A 5C04A 4H86A 2OE0A 2MBTA 1FVJA 3G7JA 3GUSA 4D73A 4XCSA 1R5AA 1F3BA 4ZB9A 3IPZA 2IFQA 2CVBA 4KAEA 4PXOA 4V2NA 2PN8A 1KBNA 2KP1A 5DQSA 3APQA 2B1KA 2FY6A 4G10A 1U88A 1ZYQB 1GSFA 1XW6A 1EEMA 4N0VA 2DJKA 2GLRA 2KP2A 1OAZA 3ZMLA 4E8EA 3HD5A 19GSA 3F4TA 3A5WA 1QXHA 2VO4A 3NOFA 3JCML 3IOSA 3KXOA 5DVBA 2DMMA 3IA1A 3V1WA 2H1DA 4ECCA 4EUYA 4JR4A 3O3TA 5ECPB 5LCZA 2YNXA 2DC5A 6GSYA 4ECJA 4NAXA 1TU7A 5J5NA 4K7NA 4ISDA 1ON4A 3CSIA 3DVXA 3BJ5A 1N2AA 3FYGA 2H1AA 1SJZA 2YV9A 1XWGA 8GSSA 1JZRA 3A2WA 3LYPA 14GSA 1MDJA 5HFGA 1FW1A 4JBBA 5DCHA 1GL8A 2FUG2 5IQYA 1SU9A 3ME7A 3QOUA 1XVQA 2VL2C 4AJ6A 2ES7A 3CRUA 1ST9A 2OA7A 1MTCA 4OFMA 2L5OA 2B7KA 1HQOA 2CX4A 4K7IA 1ZL9A 4O5RA 5F0GA 5CREA 1TRUA 1URMA 3RHCA 3Q19A 1O6JA 3ERGA 4HS1A 2JADA 4LL4B 3TJBA 4IP6A 1Z7RA 4ZILA 3GHAA 2I9HA 1QFNA 2G0FA 3TKQA 1A24A 5JCGA 1THOA 1O73A 2DJ2A 2ZUPA 4WR4A 5DQYA 3GN3A 3PGTA 3BCIA 1TKDB 3RAZA 2LEGA 1DE2A 2CVDA 3GKNA 4I2TA 3J7Yk 4N11A 3I43A 3NZNA 4GSNA 2LSTA 4XS6A 3VURA 2D2ZA 2LJKA 3IE3A 4TW5A 2P5RA 3EYTA 1FB0A 1MDIA 4BWSA 2C1YA 2DBCA 2HT9A 2B1LA 4ZIJA 2V1MA 5B6NA 1K0BA 1T8EB 3UL3A 4F0CA 1F9MA 3GSTA 3C7MA 3ME8A 4OFTA 1KEBA 2YZHA 4IGJA 3UVTA 4V2LA 5D8IA 3TJJA 3U6VA 3KTBA 3P2AA 5ECQB 2J9HA 1SK2A 3M1GA 3FR6A 4GWRA 1XWKA 2IN3A 3G9BA 2OBIA 2M46A 3HZ4A 3L9VA 3HVVA 4GQFA 2ON5A 3EC3A 3TOTA 1NW2A 4JE1A 2PVOC 1ERUA 2VLUA 2GVPA 4IP1A 5DDLA 2BTOT 4OCFA 2VLVA 1WRYA 2FD3A 4BA7A 3J7Yb 1QGVA 1VF4A 2WB9A 4XIHA 3EWLA 1GTAA 2AUVA 1M2BA 1TJDA 4L5OA 2RM5A 2YCDA 1U3IA 4IQ1A 4PUAA 3EE2A 1MD3A 1XVWA 2N5AA 3C73A 1T4ZA 3ED3A 3R2QA 4FO5A 3LEFA 2R37A 3IRAA 1GNWA 3F8UA 3GIXA 3LXZA 1GSSA 4I97A 2VCXA 3DYRA 2K6VA 1SYRA 4FYBA 2AV4A 1TI3A 2GZZA 4EXJA 5ECNB 4NMUA 3DGQA 3KD0A 6GSWA 4KCEA 5B7CA 3KJYA 5JWRB 2MZCA 3FZ5A 1BEDA 4ZXGA 3FZ9A 4WXTA 3W8JA 1XZOA 3QMXA 2BMXA 4DVCA 1B9YC 2H76A 3C1RA 1XFLA 4MF6A 2R4VA 4MZCA 5AIVA 4IW9A 4OMVA 2C0FA 4L0UA 2V2GA 3KTLA 5KN1A 4MCUA 1RQMA 2YOIA 2OE1A 2IMEA 2I4AA 6GSXA 5IIZA 2PVQA 2CVKA 1F6MC 5G31A 4EF0A 1M7TA 2VCWA 1MEKA 3BBYA 1YY7A 3TB2A 1OC9B 5A4WA 5ECKB 3H79A 5H5SA 1YF0A 3US3A 4BVYA 1XBSA 4Z7XA 2CZ2A 3VWVA 1TRVA 2LUSA 3UIWA 4YQMA 3LORA 5G1KA 2H8LA 3BOAA 1M2AA 3FEUA 1UVZA 1N8JA 4ZBDA 2YV7A 2HYXA 1O8XA 3VI5A 5HR1A 1V9WA 2YP6A 5L71A 4OWYA 5E4WA 1QK8A 5CP1A 3UEMA 2LRCA 4MF5A 4Q5RA 3D4MA 5F05A 3M8NA 1EEJA 2OE3A 4WF5A 1E6BA 4HJ2A 5IMCA 1BQ7A 5COHA 4TXOB 4Q5FA 4PQIA 2GTUA 5JWQB 1DBYA 1IYHA 2HE3A 4IHUA 1EV4A 1A8LA 17GSA 1KNGA 3GMFA 6GSVA 4NPBA 4F9ZA 3BCKA 3TJGA 1XIYA 3F6DA 3AY8A 1W4VA 4V2MA 3DVWA 2DLXA 4K1FA 1SKRB 3C8EA 2QKEA 4IS0A 3FY7A 4P3YB 1PL2A 2C0GA 2AAWA 3DXBA 4EL1A 3S9FA 2R2JA 5FT3A 3KEBA 5IMDA 1XW9A 6GSTA 4AJ7A 3NIVA 2MMNA 3M9KA 5IOXA 1G6WA 2JL4A 1OE8A 3SWLA 3GX8A 2F51A 1AQWA 2LNSA 5DALA 5H5RA 3WGXA 3G7YA 1OC9A 5ECMB 3L4NA 1U87A 2NPBA 2VLTA 3QR6A 5G5FA 2K9FA 2VD1A 3HYPA 2MBSA 3IDVA 2AYTA 1GTIA 3GL5A 2X8GA 3KM6A 2H73A 2L4QA 4WBJA 5E59A 3EU4A 1GUHA 4MJCA 1Z6MA 4POMA 3QPMA 5D73A 3FK8A 2VIMA 1SKSB 4L8EA 1M2DA 3TJKA 3GV1A 3L0HA 1Q4JA 1ERWA 5INYA 4L0WA 3VK9A 4Q5QA 5DCGA 5IOWA 1OE7A 2ZCTA 5J9CA 4ZL8A 5FWGA 2AJQB 2C4JA 4X0XA 4WETA 3F0IA 2R6KA 1TOFA 2PMTA 4OCEA 4KSMA 4POLA 1PN9A 5DJLA 3MWHA 3KP9A 5LNKe 3H93A 3LXTA 1ZMAA 4FIWA 1T1VA 5ECIB 4GSTA 2J23A 3GKMA 3DD3A 2XPDA 4DSRA 1PD21 2YWOA 1YF1A 5ECOB 3QDNA 3FZAA 2MYGA 3TRPA 3RPPA 4HI7A 4PGTA 1K0NA 1YKAA 4ACSA 3WGEA 5IMZA 2BJXA 2I81A 4IBPA 2VM2A 1FO5A 2RIIA 1SJIA 2IL3A 4ZB6A 2B3SA 1EWXA 1A23A 4G19A 4DSSB 2PPTA 3H8QA 5B8AA 5HR0A 3HKRA 3TKSC 2M80A 3O76A 2YJ7A 3FW2A 1A2JA 1GTBA 2LKUA 4ZBBA 1A0RP 1EOHA 1R7HA 2L5LA 3TJFA 2Z9SA 1XWCA 4IVFA 4KE3A 2VUPA 4BVXA 4KW6A 1B9XC 4WBRD 1ZGNA 2EIRA 3ERFA 5CAXA 5B6MA 1MDKA 1PX6A 2FWFA 1K3YA 2K8VA 2VCQA 1WPIA 1J0FA 5G30A 1M9AA 3A2XA 3VWWA 3MNGA 4XRAA 3KMOA 2TRCP 3DRNA 1OKDA 2WJUA 2DIYA 1JHBA 3UOMA 2L59A 1AW9A 2RM6A 1S3CA 4TR0A 4GSSA 1M9BA 2VL9A 1SJ6A 6GSSA 3HZ8A 2V41A 1ZOFA 1SKWB 2VM1A 4K7OA 3CTGA 5EY6A 3QAWA 5CNWA 2F3MA 5EL8A 2GZPA 2F9SA 2PUKC 1WP0A 1Z5YE 1VRSD 3IR4A 3O6TA 3TRQA 2B5YA 1JLWA 4NV2A 2HFDA 2O89A 2E7PA 5JCWA 2H6XA 3G7IA 3LJRA 2A2RA 1OYJA 2L6CA 1G0TA 2NTOA 4KSOA 3M0FA 3KCMA 4AGSA 4F0BA 3QAGA 1PQNA 4DSSA 2YWIA 3APSA 2CAQA 1EGRA 2H75A 2GQMA 4HDEA 4EVMA 3ZLPA 2X99A 1TU8A 3W8SA 1Y25A 1A0FA 4N10A 5F8BA 2GSQA 22GSA 3Q74A 1XOBA 11GSA 4GF0A 5ECRB 3GKKA 2A2SA 1OVNA 4ULXA 3KH9A 4K6XA 2FLSA 5AGYA 4LL1B 10GSA 1U3AA 4F03A 2JZRA 2MMZA 4KUNA 4TR4A 4TXVA 3L9SA 2IWTA 1ACVA 1EZKA 2X64A 4MH2A 1B48A 2ALBA 2KOKA 3HY2A 1X5DA 1E2YA 1W89A 2N5FA 2CA8A 4ZB8A 4O92A 5GSTA 5HFKA 2DJ3A 5CRDA 1PX7A 2GSRA 3H1NA 1WJKA 1FHEA 5IMAA 5B8BA 1GSDA 4I2UA 1Y6EA 2WRTA 1GTUA 1C72A 2C0EA 1BX9A 3P8WA 3F6FA 1GUKA 1VF1A 3ZFLA 1KTEA 2YWNA 1VF3A 1BJXA 3TGZA 4L5LA 4BL7A 3GFKA 2MMAA 3LQ7A 4MDCA 1YDKA 3EURA 1FAAA 1HNAA 1ABAA 2HSYA 3RPNA 1DSBA 5CYYA 5ABRA 2HRNA 1K0MA 18GSA 3KIJA 2HNLA 1O85A 2H6ZA 3ZIVA 1XW5A 4IQAA 4KDYA 5CRHA 1X5CA 3LSZA 2GDRA 3UAPA 4POKA 4JEDA 4XS1A 3LGCA 3Q6OA 1GSUA 1UN2A 2YPMA 3GA4A 1AXDA 3EMXA 2DSAA 1S3DA 4EDYA 4RI6A 4BPYA 4MMMA 2O85A 1K0DA 5J4UA 4GQCA 1CQHA 1ILOA 3TRXA 1ML6A 3F3RA 5G2ZA 1JZDA 1SYXA 2C8UA 3HCZA 5IMFA 3ZREA 4HQSA 20GSA 4NWYA 2CQ9A 3I6AA 4PX1A 2FNOA 4LMVA 5G1LA 4HZ4A 4IN0A 7GSSA 2JZSA 2TRXA 4WKWA 3DIEA 4K9ZA 1PSQA 5IM9A 4HJMA 1AQVA 1A8YA 1X9SB 1PGTA 4I5QA 4OO4A 4WEYA 2WZ9A 2B6MA 1GP1A 4OO5A 4HEA2 1F37A 2H71A 5DALB 3E0UA 5HQPA 2VD0A 3ERWA 1USBA 2H0GA 4J57E 1NHYA 2FGXA 3D22A 1M99A 1U6TA 2GT6A 4PNGA 1DE1A 1PKWA 4X1UA 4NHZA 3UBLA 1S3AA 3D21A 1A2LA 4N30A 2E2GA 2AB6A 5KN3A 2K8SA 5ID2A 4EC0A 4K8MA 2JZTA 3PR8A 1BYEA 3VWUA 3ZYWA 3VPTA 4HU9A 4TN8A 1V40A 2O7KA 4QL7A 1XXUA 4OFNA 1YKCA 5A4UA 4J2FA 1BAYA 3DEXA 4LLRA 1VF2A 1EV9A 2PWJA 3SBCA 1FB6A 1R4WA 2L57A 2XC2A 3FKFA 2JACA 4KNDA 5ELAA 3GYKA 2GSSA 1X0RA 2I1UA 3E9JB 1GSYA 3CTFA 4ZL9A 1B4QA 4ZL7A 4XHMA 4CHSA 1WIKA 2RUEA 2FHEA 2GZYA 2VL2A 1Q98A 3A3TA 2GS3A 3BD2A 2VCTA 2B5XA 2DIZA 2GGTA 2LTKA 2OBKA 4TVEA 2WCIA 1NSWA 3UMAA 5J3RA 4KCAA 2CT6A 4TKYA 1Z7PA 3GH9A 2WS2A 2LQQA 2PERA 3ZVJD 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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