1CQGA

High resolution solution nmr structure of mixed disulfide intermediate between human thioredoxin (c35a, c62a, c69a, c73a) mutant and a 13 residue peptide comprising its target site in human ref-1 (residues 59-71 of the p50 subunit of nfkb), nmr, 31 structures
Total Genus 23
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
23
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPAKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDAQDVASEAEVKATPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The solution structure of human thioredoxin complexed with its target from Ref-1 reveals peptide chain reversal.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
molecule tags Complex (electron transport/peptide)
source organism Homo sapiens
total genus 23
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-04-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1cqgA00
5D96A 4ZIJA 2EIOA 1TRSA 4F9ZA 1O8XA 1UC7A 4WEYA 2DMLA 1ZGNA 4G9HA 1K0AA 2L6CA 2C0EA 4PQHA 3IXRA 3VWXA 1MTCA 1QGVA 2B1KA 2H6YA 2I3YA 1QMVA 3FRCA 9GSSA 4GSTA 2H75A 2HT9A 1PQNA 1Q4JA 5KEJA 1O85A 1MDIA 3GX8A 5F07A 2IWTA 2K18A 1JZDA 2MMAA 3WT1A 2DC5A 4O5RA 1X9WB 1XWKA 1SENA 1Z7PA 1A23A 2H1BA 3IE3A 2C3TA 1GTAA 2JZSA 3GN3A 2HZFA 1XOBA 5IIZA 4IBPA 3LFLA 3QMXA 1YEPA 2H30A 3QFAC 2WULA 4JE1A 1ZMAA 1O6JA 2A2RA 3ME7A 2JU5A 1VF2A 3TGZA 2YWOA 4HJ2A 1VF1A 1O81A 1ZCPA 5ECNB 1SJ6A 4OO5A 3Q18A 3U6VA 3TUEA 3A2VA 4IVFA 5G5EA 3F4TA 3IRAA 4GLTA 5ABRA 5IOXA 3SWLA 2CX4A 5DAKA 4ZL7A 4AF2A 5A5KA 1AQWA 5JCGA 5CO3A 2X99A 2I1UA 3QD9A 1J9BA 2VLTA 2YANA 3KIJA 1T7PB 2YWNA 2WGRA 2C0GA 4GF0A 3QR6A 4RUVA 2DIYA 3FY7A 2C0FA 3RPPA 2LNTA 2KUCA 2L59A 1FHEA 4AJ8A 4JRRA 5AGYA 2D2ZA 5G31A 4MZBA 4FYBA 1T8EB 1EV9A 1Z6NA 3WD6A 3A2WA 2GSRA 4HU9A 2LRCA 2LTKA 4E8EA 4HQZA 4HDEA 1OE7A 2FD3A 3LG6A 2V6OA 3H8QA 3GURA 2LRTA 2DJ1A 1MD3A 3ZRDA 4GWRA 18GSA 1XBSA 3HXSA 2X64A 3KTBA 3HVXA 1G6WA 1QK8A 2K9FA 1X5DA 3KP9A 2R2JA 1W89A 1M9AA 4RI6A 1BAYA 5AN1A 1KTEA 2XHFA 3C71A 1MDKA 2ON5A 1ZOFA 4K1FA 3QAGA 1THXA 4RQRA 2HRNA 3P2AA 2CVDA 4BL7A 3M0FA 5ECKB 2WFCA 4NXIA 3MNGA 4XRDA 1HNAA 4K0GA 3VWVA 4LA1A 1TU8A 4GSNA 4MF7A 1RQMA 2HE3A 5DBQA 2OJLA 3C8EA 22GSA 4I6XA 2FCHA 2CAQA 1BQ7A 3W8SA 2YJHA 1OVNA 2IFQB 4YH2A 3L9SA 3J7Yb 4J2FA 2LQOA 2KOKA 4ZL9A 1F9MA 3CSIA 5CREA 1GNEA 1XVWA 4LMWA 4KH7A 5CRDA 1I5GA 2RUFA 1O73A 2JACA 3EE2A 3IBHA 5GSSA 2FGXA 3EU3A 3ZVJA 3KJYA 2IMEA 3KTLA 3UMAA 4MZCA 2X8GA 1OC9A 4AJ6A 2C0DA 3K8NA 3GA4A 1FAAA 4KGIA 2XBIA 3JCML 2IPAA 4FYUA 1TTZA 1LBKA 3GIXA 2F51A 2NBSA 6GSSA 2ALBA 2MMNA 1FB0A 1S3CA 4MF6A 3FR9A 5AISA 5IM9A 1WWJA 3NIVA 2HLSA 3TDGA 2B7JA 3H93A 2VM2A 3IK9A 4DSSB 2V2GA 3CBUA 1E6BA 3FK8A 5DALB 2X8CA 4YAVA 4JZQA 1OAZA 4KNDA 3GUSA 1YZXA 1K0MA 4ZBBA 2OE1A 4ILFA 4AGSA 3A3TA 3TKPA 1XWBA 1OC8A 4NHWA 3KCMA 4K2DA 2H66A 3F8UA 3DRNA 1DBYA 4FO5A 2JADA 5FT3A 3FYGA 3R2QA 3D4TA 3M9JA 4MP4A 6GSTA 2P5QA 1NM3A 1S3DA 1EGRA 4D73B 3QAWA 3QFBC 2LRNA 1B48A 4KDXA 5J5NA 1R7HA 4JR6A 2I4AA 2L57A 2A4VA 2G0FA 4IKHA 2C3QA 5JWOB 4POMA 5IO2A 5GZZB 5FHIA 14GSA 2C8UA 4MLYA 2H19A 4WF4A 2FWGA 2BTOT 5ECSA 5DDLA 5C04A 3BJ5A 1UN2A 3CRTA 2L5LA 2YP6A 1B9XC 1BEDA 1SD8A 3FZ5A 1SK2A 5DJMA 2VL2A 5COHA 2YNXA 3TRPA 3WGXA 2HSYA 3KM6A 4ECCA 4KSMA 2IMDA 5A4VA 3VK9A 1VGLA 1GUKA 2FHEA 4GQCA 1ZL9A 3GV1A 3TKSA 1SKRB 2JSZA 1AW9A 1F37A 3VPTA 2PERA 4IP6A 3TB2A 3GTUB 3FHKA 2TRXA 5ECIB 3TKRA 1KEBA 6GSWA 4TXOB 1EOHA 1U6TA 3F3RA 2LJKA 1JLWA 4V1Ap 5B6NA 3RHBA 4N0ZA 4JU5A 2GS3A 3UVTA 1PMTA 3EURA 3O6TA 1EP8A 3O3TA 1WE0A 1R5PA 2OKAA 3L9VA 11GSA 3ZREA 1O8WA 4LLRA 3CTGA 1Z7RA 4IW9A 3A5WA 2KP2A 1SKSB 4IHUA 3HJOA 2C1YA 4HI7A 2VLVA 4K7NA 2P5RA 2RLIA 3PH9A 3DMLA 5J41A 1GSUA 3HJPA 2M80A 3GH9A 2YWMA 2O8VB 4MH3A 2N5BA 3CSJA 2GZZA 2PVOC 3LYPA 4P3YB 2N5AA 2PN8A 3F6DA 3DWVA 3HVVA 4D73A 3IOSA 5CRGA 2H0GA 2WS2A 2FA4A 3WT2A 1TP9A 3I6AA 1YQ1A 1HNCA 1T00A 1TJDA 2ZUPA 2PU9C 5D9TA 3D4MA 4RI7A 3MSZA 1TI3A 4F0BA 1T3BA 5J3RA 2HZEA 2B7KA 5F8BA 3G9BA 2MMOA 2GDRA 3D21A 4K7OA 2C3NA 3ZIJA 5ECLB 1YKCA 1A24A 1AUCA 2IL3A 5DCHA 1THOA 4ULXA 2OACA 1ZZYA 4GTUA 4O7HA 5C00A 3SBCA 2CA8A 5AIXA 17GSA 2DJJA 1ST9A 1BX9A 12GSA 2L6DA 1FVKA 5EY6A 5CP1A 3F9UA 2VIMA 4L0UA 4V2MA 1YF1A 3LJRA 4BWQA 3GFKA 4EO3A 4QQ7A 5G2ZA 1EZKA 3GTUA 4XCSA 3VPQA 2VUPA 5ENUA 1FVJA 2O85A 1T4ZA 5IMFA 5CYYA 3IPZA 1R4WA 2F9SA 2DIZA 4PGTA 3DVXA 3LXZA 4GSSA 3UJ1A 1XW5A 2KHPA 1OC3A 2H76A 4WETA 16GSA 2TIRA 1JZOA 4Q5RA 1N2AA 3PINA 3P7XA 2B6MA 1EP7A 2OE3A 4MDCA 1H4OA 5B7CA 4HZ2A 3TJFA 3F0IA 1ON4A 1V98A 5EL8A 3TJKA 3BCKA 1LU4A 3VLNA 2QC7A 2E7PA 1TRUA 2FWEA 5E4WA 4ECIA 1BG5A 1GUMA 3FZ4A 2R5GA 2PPTA 2L5OA 1T1VA 1V57A 4EE0A 3QPMA 1XVQA 1EOGA 1F2EA 3IA1A 2DJKA 4HS1A 3TKQA 4BVYA 4BPYA 1A8YA 4EDYA 1ERTA 2YCDA 4XS6A 3BBYA 3MWHA 3FR6A 2H8LA 4PQIA 4F2IA 2RM6A 1M99A 2VCZA 2LS5A 1GRXA 1A2LA 3KH9A 2FY6A 2C4JA 1M2BA 1PL1A 3ED3A 3GH6A 1XWCA 3IC4A 4YQMA 4CHSA 3VWUA 1ML6A 3DXBA 3LWAA 5KN3A 5CRHA 3TOUA 4TOPA 1PD21 7GSSA 4OCEA 1ZYQB 1N8JA 1YKAA 4TRXA 3IHQA 5CRWA 4IQAA 2H0IA 5H5RA 1WJKA 3HY2A 4F82A 5HR3A 1CQHA 5A4WA 3WYWA 5B8BA 4ACSA 3D22A 5HFGA 1I9DA 3GKNA 1TRWA 4NV2A 5GSTA 4F03A 1XW6A 4IJ3A 3E3EA 1XXUA 1ILOA 4G19A 3DVWA 3E9JB 1MD4A 3ZYWA 4K0NA 3LEFA 1XFLA 4TR3A 1AC1A 1TK8B 2VCVA 3IDVA 2RM5A 4LMVA 2QSIA 3HHVA 1A0RP 2DJ3A 2FNOA 1K0CA 3VI5A 4J57E 4ZBAA 3W6GA 6GSYA 2E2MA 1M2DA 2AB6A 3EVIA 4V1Ag 1T4YA 1DE1A 2HNLA 4K9ZA 4HU7A 1DSBA 5IPGA 2WCIA 1E2YA 1PKZA 2CZ2A 2CQ9A 1Z6MA 4O32A 3FKFA 3MDKA 3LYKA 5ECPB 1UA5A 4N0VA 2HXKA 3PGTA 2CVKA 1YEXA 1SYXA 5ELGA 4WR4A 4ZBDA 1V40A 1J08A 1GSDA 3ZTLA 5ECHB 5EVOA 2WRTA 3I9V2 5IMCA 3KZQA 4K6XA 2ZNMA 5KN2A 2GT6A 4CW9A 2HSHA 1R26A 3J7Yk 5D9XA 4FH8A 5ECOB 4IELA 4TXVA 3CYNA 2BJXA 2LEGA 4XS4B 2H1GA 4QL9A 3N5OA 4HUAA 2H01A 2LQQA 1X9MB 5ELAA 2GQLA 3L9UA 5KN1A 2XPDA 1LJRA 4NAXA 4IP1A 3GKKA 5DQYA 2DJ0A 4K8MA 1FW1A 2VCXA 2WZ9A 5IMVA 2OBIA 3RBTA 2VCQA 2XC2A 2I81A 5CAXA 4N10A 3DGQA 3EU4A 5CNWA 3HZ8A 1PKWA 3O76A 2VL2C 4POLA 3GHAA 5HR1A 4MJEA 3UEMA 1TKDB 4PUAA 3KEBA 1PSQA 3HKRA 3TKSC 2DLXA 3Q74A 1S3AA 1SL2B 3DIEA 3GKMA 5H5SA 3FZAA 3U5RE 2MYGA 3UARA 4IGJA 4PUFC 4KDUA 1JHBA 1K3OA 1R5AA 4H86A 2B5XA 2IFQA 2O89A 2PUKC 2WDUA 3IV4A 3QOUA 5IO0A 1ERWA 2MBSA 5ID2B 5A4UA 1B4QA 1FG4A 1QXHA 4PQ1A 1DUGA 2FA8A 1JLVA 1AIUA 3D6IA 3LXTA 2YOIA 3GSSA 4TR0A 4PURA 4MJBA 1PA3A 5HR0A 2VL3A 2H1AA 1DE2A 1JZWA 1F3AA 3F3QA 4N11A 4RQXA 2HI7A 3IR4A 4OO4A 3LORA 1K3YA 1PGTA 3QAVA 2RIIA 3ZMKA 2V1MA 3TRQA 1SL1B 19GSA 5D9WA 4HOJA 1MEKA 4KW6A 1ACVA 4OCFA 4YQVA 2JZRA 4K7IA 2F8FA 1AAZA 1VRSD 4NPBA 5DVBA 1K0NA 5IQYA 2JSYA 1Z3EA 4XS4A 1SKWB 2DMMA 1A2MA 4MPFA 4TR1B 4ZL8A 4ML6A 1X5CA 1K0OA 1GH2A 1SK0A 1FO5A 4TVEA 4DSSA 1F6MC 2R4VA 3UBLA 3VI7A 4IS0A 3F4RA 2FUG2 5DALA 2H70A 4JBBA 5G5FA 4HJMA 1JZRA 1SL0B 3TRXA 1YDKA 2OADA 3DEXA 3KXOA 2F8AA 4E8HA 2NDOA 4L5OA 4O92A 4KDYA 5D8IA 3G7JA 2GSQA 3V1WA 4POKA 2MZCA 3GL3A 4WR5A 2DJ2A 4OMVA 1BJXA 4EVMA 2J9HA 1SJZA 4DEJA 3A2XA 3G7IA 3MAKA 1RK4A 3UBKA 1SK1A 1RW1A 2AAWA 3Q6OA 3HD5A 2TRCP 2EIRA 3UIWA 4ML1A 1GLPA 3IAM2 5HFIA 4EKZA 4OFTA 2YN1A 3QCPA 3S9FA 1X9SB 5DAKB 5D93A 1ERUA 2VL9A 2R37A 1F3BA 2AYTA 3GRXA 3L4NA 1BYEA 3HZ4A 4MABA 3W8JA 4EDZA 2XBQA 1V9WA 1SYRA 3KD0A 5GAPD 2LJAA 3AY8A 1NHOA 1XOAA 3F6FA 1XWAA 3FW2A 5IMZA 3HJMA 3P90A 3KH7A 1K0BA 1PL2A 1PX7A 2PGTA 2B3SA 1ERVA 1ABAA 4PXOA 2YV7A 4XS1A 4KX4A 1SJIA 1M0UA 3CXGA 3OR5A 5IPHA 2PVQA 3Q19A 3L0HA 1H75A 6GSVA 1PRXA 2PBJA 4X1UA 3P8WA 5IOWA 1GSYA 3UVHA 1W4VA 1EEJA 5JWRB 2LV3A 3DKSA 4NV5A 3QDNA 4TXOA 1CQGA 5J9CA 3HA9A 2G2QA 3FEUA 2H6XA 1IYHA 5B6MA 2VM1A 3GYKA 5AIVA 4TR1A 4Q5FA 4F0CA 1G0TA 4KCEA 3IK7A 4KUNA 3KMNA 4TN8A 1TRVA 13GSA 3ZIVA 1VF4A 2WB9A 2YWIA 1YJ6A 2IN3A 3WGDA 1Y25A 4ISDA 1TK0B 4MMMA 2O7KA 2B1LA 2P0GA 2F3MA 6GSXA 1SD9A 5DQSA 3C1SA 3L78A 3ERWA 4TR4A 3TJJA 1VF3A 2YPMA 4QL7A 1XIYA 1XPVA 2IJYA 1J0FA 3DYRA 4EF0A 2WJUA 4GRFA 2GT5A 4G2EA 4JR4A 2GLRA 1GSFA 4ZILA 2AUVA 1OC9B 1QFNA 1EEMA 4J56E 2CAIA 2R6KA 1HYUA 4DVCA 4DSQA 2CZ3A 1EGOA 3M9KA 1HD2A 1GSQA 4XIHA 1GTUA 1NW2A 1Q98A 4EC0A 2EC4A 2E0QA 2VD1A 2GQKA 3EMPA 5G1KA 4KSOA 2YJ7A 1KNGA 2BMXA 3HDCA 3HVSA 3ZLPA 1WIKA 1X0RA 5LNKe 3GSTA 3VFIA 1GLQA 3EWLA 1M2AA 3APOA 4EUYA 3ME8A 1AXDA 3GNJA 2B5EA 4XHMA 4I2UA 1IYIA 4ECBA 2CT6A 5IMDA 1GNWA 4WBJA 1EWXA 1YY7A 5JCUA 5GAND 4L8EA 3TCOA 4OWYA 3N9JA 2JZTA 1OYJA 4TKYA 5HR2A 3ZFBA 1QQ2A 2H72A 2DBCA 1AQXA 3EC3A 3DD3A 4MF5A 4DSRA 4TW5A 1TK5B 4Z7XA 2PWJA 1Y6EA 1U88A 3C73A 1SU9A 2V41A 2B5YA 5LD0A 3EMXA 1TDIA 3ISOA 5G30A 3ZMLA 1M7TA 2IIYA 4XTSA 3RHCA 4XRAA 3D5JA 2FLSA 2K8VA 1TOFA 2QGVA 4L5LA 1KBNA 4NHZA 3FR3A 2XPEA 4I97A 1FB6A 4MK3A 5J9BA 2MBTA 2YZHA 2CX3A 3FZ9A 2V6KA 4BWSA 2NTOA 5HFKA 2LJRA 4KB3A 4AJ7A 4YQUA 2NVLA 1V2AA 2M72A 4PNFA 1YF0A 5D9VA 4I5QA 4WF5A 2AHEA 5JWQB 2L4CA 2VO4A 4IJIA 3NOFA 4BA7A 1B9YC 4KE3A 4G10A 4PX1A 2K8SA 1GUHA 1A2JA 2RUEA 2GVPA 1Z5YE 3GL5A 2QKEA 1HQOA 4L0WA 1JFUA 3PR8A 1GSEA 3UL3A 1V58A 4WKWA 2N5FA 4X0XA 2VAFA 3WGEA 2HRFA 4X43A 4IN0A 1GL8A 3TKSE 1G7OA 2H0HA 1U3AA 4KA0A 3HCZA 2L4QA 2NPBA 4JEDA 5KN0A 4OD7A 5ECRB 4WBRD 2P31A 3RPNA 2EIQA 2IMIA 1PN9A 4ZB8A 2J23A 4ZXGA 4CDOA 2VLUA 4KAEA 2I9HA 1C72A 3ZITA 2E2GA 4ZB9A 5JCWA 2IMKA 4MZWA 2GTUA 2VD0A 1WMJA 1XCCA 3BCIA 1TXXA 1B8XA 2H71A 5IMAA 4MCUA 1U3IA 2HFDA 1GWCA 5F06A 3H1NA 3VURA 1XWGA 3APQA 3G7YA 3GMFA 4FYCA 1GTBA 5ECMB 2Z9SA 3IAS2 2M46A 4YAPA 5DCGA 2K6VA 1HNBA 3US3A 3BD2A 2GZPA 1EV4A 2GSTA 3TOTA 2OBKA 5J4UA 2ES7A 4GCIA 4MH2A 2LUSA 5EPFA 2FWHA 4ID0A 1UVZA 1TW9A 2HZEB 2A2SA 5B8AA 5HQPA 3TJGA 3TJBA 3GKXA 1K0DA 3CSHA 4ECJA 2JL4A 2GZYA 1NHYA 3KMOA 3E0UA 1FOVA 1GTIA 4GXZA 1M9BA 2GGTA 4NMUA 3F4SA 3EYTA 1OKDA 4WXTA 3ZZXA 4IQ1A 2H6ZA 1USBA 1AQVA 2KLXA 4Q5QA 4I8BA 5L71A 2LKUA 5INYA 1Z9HA 2H73A 2V32A 1WPIA 4OFMA 3EINA 2VCTA 3I69A 2H1DA 3LQ7A 1OKTA 2CV4A 4NWYA 4Q5NA 1GSSA 1XW9A 4MJAA 3NZNA 4HZ4A 2DSAA 2FWFA 4BVXA 1TU7A 1MDJA 20GSA 4PNGA 3ZL5A 2C80A 4MA9A 4MPGA 8GSSA 1GULA 2AV4A 1GP1A 1PX6A 2YV9A 1NSWA 5F05A 2LNSA 3H79A 4I2TA 2H74A 3M1GA 3M8NA 2AJQB 2HYXA 3ERGA 3LSZA 3C1RA 1B4PA 4FIWA 4EL1A 2VCWA 4EXJA 6GSUA 3CTFA 1O7UA 4V2LA 3VWWA 2IMFA 2ON7A 2R3XA 5H5QA 2OE0A 4LL1B 3KP8A 3I43A 2KP1A 1A0FA 1G7EA 3CRUA 4MJCA 3LGCA 4V2NA 2X8HA 1X5EA 3F63A 3C7MA 3HYPA 2LSTA 1ZYEA 5ECQB 3CMIA 5FWGA 2GQMA 2REMA 3RDWA 3KGKA 1G6YA 5LCZA 1WOUA 2OA7A 1XZOA 2PMTA 2MMZA 4OFNA 3RAZA 4ZB6A 5D73A 2CVBA 1URMA 3GX0A 3UAPA 3ZVJD 1WP0A 1U87A 3M3MA 4KCAA 1K3LA 2ZCTA 4GQFA 3BOAA 5G1LA 5F0GA 5E59A 3D0ZA 1OE8A 3APSA 1QUWA 5ID2A 4HEA2 3ZFLA 1A8LA 1WRYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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