4X4JA

Structural and functional studies of bexe: insights into oxidation during be-7585a biosynthesis
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
486
structure length
482
Chain Sequence
DAPVVIAGAGPAGLMLAGELRLAGIGVVVLERLPARTGESRGLGFTARTMEVFDQRGLLRRFGEVQTSDQGHFGGIPVDFGLLDGAHQAAKTIPQSATEAVLEAWAGELGADIRRGHELTGVRDDGDGVAVTVRGPAGEHVLRAGWLVGCDGGRSAVRKAVGFDFPGTAATREMFLADLRGVELEPRMSLPGGMVMVGPLPGGVTRIIVCERDAPPRRRTGPPPFHEVADAWKRITGIDISAAEPVWLSAFGDATRQVTEYRRGRVLLAGDAAHVHLPAGGQGMNAGIQDAVNLGWKLAAVVRGTARADLLDTYHGERHPVGVRLLMNTRAQGLLFLNGAEMQPLRDVLAELTGYPDVARHLAAMVSGLEIAYDVGGGSHPWLGRRLPRLELDRGGRPSSTAELLRPARGLLLDFAGNAALRDRAAPWAGRIDVVTARPAGRVPGATTAVLVRPDGHVAWAAPGTHADLPMALERWFGPAPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural and Functional Studies of BexE: Insights into Oxidation During BE-7585A Biosynthesis
rcsb
source organism Amycolatopsis orientalis subsp. vinearia
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Putative oxygenase
total genus 134
structure length 482
sequence length 486
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4x4jA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4x4jA01
1PJ5A 2ZZBA 4U8LA 3T37A 2V3AA 1E1KA 1PHHA 3I6DA 5JCLA 1MO9A 1CBOA 4EIPA 2YVJA 1JOAA 1B4VA 2BK5A 3S61A 3Q6JA 1K0JA 3AE6A 3CGDA 4U8PA 1TDNA 1REOA 2QAEA 4BURA 2R0CA 3KA7A 2YM2A 1ZMDA 2CDUA 3NG7X 2VOUA 1COYA 4NTDA 4H4PA 3VR8A 3NYEA 1OJTA 1H84A 1DXLA 2BC0A 2RABA 2WP6A 3ICSA 3K7MX 3H8IA 4C77A 1L9EA 3VRAA 5C2TA 4X9MA 2V3BA 3GSIA 3UTHA 2C7GA 3QSEA 1LPFA 2R4JA 5IQ4A 2J3NA 1Y56A 1JRXA 3GMCA 3NIXA 4EQRA 3ICTA 2Z5XA 2GB0A 4J31A 3ALMA 2XFOA 1B5QA 4GCMA 4XXGA 1CC2A 3DH9A 1N4UA 4JNAA 2QA2A 3NK1X 2QA1A 4OPIA 3DK8A 5JCMA 3NK2X 1GRAA 3NTDA 1B8SA 2WDQA 4YWOA 3ISHA 1JEHA 3GMBA 2GR2A 4AT0A 2VVMA 2WBAA 4XWZA 4EM4A 2YLSA 3GRTA 1H81A 4NZHA 2VRMA 2Y6RA 1CJ2A 4YSYA 4FX9A 3KVEA 5L46A 3DJGX 1GTHA 2YM1A 2YLZA 1H7XA 3C96A 4PABA 1DOEA 1BZLA 1S2YA 1D4DA 1LTXR 1H7WA 4J33A 4YSZA 1FECA 3LJPA 1QLBA 4USQA 4K8DA 4O5QA 4Z43A 5KWFA 4Z2UA 3AWIA 3AB1A 5KVHA 1L9CA 3GDNA 3AD9B 1N1PA 5HYMA 2ZBWA 2WOWA 1FOHA 3AEEA 2YLXA 4X4JA 4OCGA 1F8SA 3B3RA 1DJQA 4FK1C 1AOGA 4A65A 3REDA 3V3OA 4UDPA 2VZ2A 2W0HA 2YLTA 2XVHA 4U2LA 2V60A 4B67A 3VRDB 1NHQA 1H83A 1QJDA 2XCGA 4FDCB 5KXJA 3QFAA 2JKCA 4A9WA 1O95A 4AP3A 1YQZA 3K30A 1F6MA 1VG0A 1IJHA 3KKJA 4OPLA 2VVLA 3QSMA 4B68A 1BKWA 3UOVA 4CNJA 1NDAA 1GOSA 3SFEA 1NHSA 1UKVG 4J2WA 2WP5A 1JNZA 5CQFA 3DGZA 3LXDA 4A5LA 2WU2A 3P4SA 4AP1A 1RP0A 2JBVA 3FBSA 4EIQA 2GH5A 2WQYA 1GNDA 2FJBA 3KPFA 2WDRA 4A6NB 2OLNA 1NHRA 5BRTA 3KD9A 3UOZA 3DGHA 1IUTA 2JAEA 3ATRA 4H2QA 4OPUA 4P9SA 1JNRA 4CY6A 4K5RA 3AYJA 4Z24A 1IUVA 4J56A 4HA6A 1JRZA 4I58A 5U1OA 4XWRA 3RNMA 4A79A 3D1CA 2WESA 2GRTA 2YVGA 2B9XA 1VDCA 2R45A 3L8KA 3LADA 4H4WA 2RGJA 3UP5A 4BK3A 3AEAA 4CRTA 2C70A 4J57A 4K5SA 3NT6A 2VQBA 2YR6A 3AEFA 4DGKA 1EBDA 4PAAA 5LV9A 1TYTA 1M64A 3GDPA 4DSHA 3AE5A 3GD3A 3NH3X 1K0IA 2GR0A 4EMIA 3UOXA 3AE1A 5EBKA 3NKSA 1TRBA 1ZOYA 2YR4A 3DK9A 2X50A 1KSUA 4O5UA 5FS9A 3RHAA 4A6NA 5TR3A 3AD8B 2C76A 3WE0A 4OPGA 3ITJA 1CL0A 4FK1A 1VQWA 4TM0A 5HHFA 3RP6A 2BS3A 2GR3A 3C4AA 1GESA 4B66A 4CCRA 4J36A 4CCQA 1FEBA 4YKGA 3AXBA 1XHCA 2GEWA 2WPEA 3DA1A 1EL9A 3EAOA 1SEZA 3DJJA 4ICYA 2BABA 3GWFA 3BI4A 1GERA 2WOIA 4UP3A 3VRBA 2R0PA 1GV4A 1MOKA 4H4TA 5FS8A 1D7LA 4IA5A 1DODA 4ADWA 1CF3A 1JRYA 1OJAA 4H7UA 4BK2A 4GRTA 4U2TA 2XDOA 2XVIA 2RGHA 4OPCA 3I3LA 1TDEA 4H50A 1F8WA 4RSLA 3UKAA 4UDQA 4OPTA 1L9DA 4EMJA 3PO7A 4TLZA 4Z2RA 3L1RA 3QFBA 2YQUA 1RYIA 2XLPA 3V76A 4EM3A 4B69A 3NN0X 2OA1A 3F8DA 3VR9A 1E6EA 1PBDA 3CPIG 1OJ9A 4YXDA 3ABVA 3M12A 2BK4A 1VG9A 1F3PA 4CY8A 4TM3A 1CC4A 2UZZA 3ATQA 2XVEA 1S2QA 5FS7A 5HXIA 3S5WA 2XFUA 2E5VA 1PBFA 2C66A 2GR1A 3IWAA 2AQJA 2BC1A 2BCPA 2WPCA 4E0VA 1FCDA 3CIRA 3EPTA 2BXRA 2BYBA 2YG3A 2GMHA 4H2RA 1ZOVA 4OVIA 2WDVA 1ELIA 3BNUA 1PDHA 2JB1A 3CGBA 1NG4A 1P2EA 1CJCA 2X3NA 2XFQA 3UKFA 1DOCA 2B7RA 3QVRA 1D4EA 3SFDA 4U8JA 3V3NA 4JQ9A 4CNKA 1GRFA 5BULA 3D8XA 4J34A 3NK0X 4Z25A 1PJ7A 3K7QX 2RGOA 2YG4A 4LU6A 5JCNA 2R4EA 4JN9A 2XYOA 3QSSA 2C3CA 3DMEA 1Y0PA 2A87A 4B63A 2NVKX 4H4XA 3PVCA 5GSNA 2X99A 4H4RA 2Z5YA 2AAQA 2F5ZA 1O5WA 5EB4A 2FJDA 3AEGA 3P9UA 4AOSA 3DJDA 3GYJA 2WU5A 2C65A 3KLJA 1KDGA 3IF9A 2TMDA 1TYPA 2WHDA 5CKUA 2EQ9A 1RSGA 3Q9TA 3EANA 3FG2P 2GAGB 4JY2A 5J60A 3F8RA 3F8PA 3IC9A 2YG5A 3ICRA 3ZYXA 3NN6X 2XLUA 3OC4A 3OZ2A 3URHA 5KVIA 1F8RA 1S3EA 1TDFA 1O94A 3EF6A 3NLCA 4NEVA 3CTYA 1NENA 4KPRA 5DBJA 3UKHA 2BA9A 5EB5A 1L0VA 4C5OA 4YSHA 4YSXA 4EQWA 4H4SA 1YQ3A 1EL5A 2C67A 3UP4A 2OALA 3G5RA 5EOWA 4U2SA 2JB3A 3SQPA 1IUUA 2APGA 1W4XA 1EL7A 4RG3A 1CHUA 4ZCCA 4K7ZA 4RG4A 1D4CA 4C3YA 3DJEA 1ZMCA 4BV6A 3P4QA 5FMHA 2I0ZA 2XVFA 5M10A 2EQ7A 3CPHG 1IUWA 1XDIA 1Q1RA 4TLXA 2YG7A 3IHMA 1N4WA 4YTMA 1BF3A 4A99A 2C75A 2V61A 2VVLG 2WP9A 4KX6A 1E1LA 4WX1A 2PHHA 4TM1A 3BI2A 4Y4MA 1YKJA 1KF6A 2WS3A 2JK6A 4EQXA 1PXCA 3QVPA 1GRHA 1Q9IA 1NG3A 2X8GA 5BUKA 3JSKA 1PBCA 5KOWA 1CJ4A 2A8XA 2EQ8A 1IUSA 4H4YA 5FS6A 1KNRA 1GREA 3AE2A 2DKIA 3FMWA 1YY5A 1BGNA 1V59A 1LVLA 2C64A 3G5QA 3LOVA 2FJAA 2GMJA 3BNMA 3GD4A 2GAHB 3NNEA 3UKQA 1ZKQA 3PS9A 3UTFA 2ZZCA 4EQSA 1XPQA 4GUVA 1ZY8A 1GEUA 2XFNA 4USRA 3UCLA 1PJ6A 2JB2A 3QJ4A 3H8LA 2BXSA 5C3JA 1PXAA 2GQFA 2Q6UA 3NGCX 1D5TA 2C73A 2E1MA 3CNDA 2Y6QA 3AE9A 4H4QA 1H6VA 1NPXA 3UKPA 1DNCA 1GRTA 3AE7A 4H4VA 2ACZA 2VQ7A 3G5SA 5IQ1A 1YQ4A 1E7PA 4IVOB 3AE3A 4DNAA 2YLWA 2GVCA 4Z2TA 1TDKA 4YT0A 2HQMA 4YKFA 4U8KA 2IIDA 1M6IA 1D7YA 1OJDA 1FEAA 1NEKA 3AE8A 3B6DA 5JCIA 1Q1WA 2CULA 1GETA 3CNSA 4IA6A 4B64A 3M0OA 1XANA 1IUXA 2BS4A 3R9UA 4AOXA 2Q7VA 3HZLA 1NAAA 2NPXA 3COXA 4NTCA 2FJEA 4Z44A 1DOBA 1LJ1A 3LB8A 3NTAA 1ZX9A 4WCTA 1X31B 2DKHA 3ZDNA 4D04A 4YTPA 4B65A 4REKA 2X8HA 2EQ6A 2XLTA 1ZDLA 1PS9A 4JNQA 1LV0A 3GYIA 4U8OA 1KFYA 4CBQA 4EMWA 1PN0A 2B9WA 3UTEA 3UTGA 4K2XA 5U25A 3E1TA 4GDEA 2OLOA 3AEDA 1LQTA 3AE4A 3P4PA 1GRBA 4AT2A 4ZN0A 4ECHA 2B9YA 1H82A 1K4QA 2XFPA 3IHGA 1MXTA 1BGJA 4LA1A 1KSSA 3LZXA 5U63A 1Y56B 2V6OA 2Q0KA 1ONFA 2V5ZA 3ALJA 3ADAB 4YTNA 3BHFA 4GR1A 4MJWA 4BJYA 5HY5A 4ZCDA 1BWCA 2PYXA 2XLSA 1FL2A 1HYUA 1CJ3A 4K22A 1B37A 2QCUA 5M0ZA 4N9XA 2ZZ0A 1GRGA 4A7AA 4B1BA 3K7TA 4BJZA 2CFYA 1E39A 3CNJA 2BS2A 3CGCA 3FPZA 4HB9A 3AECA 4GF7A 2B7SA 3P1WA 2FBWA 2WEUA 4H4ZA 4NTEA 2YG6A 1QO8A 4Z26A 2CVJA 2IVDA 4LIIA 5KRQA 2TPRA 3II4A 4X9NA 4U8MA 3NYFA 2E4GA 4UDRA 2XVJA 2YVFA 3ALLA 4U8IA 5JCKA 3O0HA 3AYIA 1E1NA 1ZP0A 1LQUA 3CPJG 3H4KA 4C3XA 1ZK7A 2WOVA 3FIMB 1CC6A 4H2NA 2GQWA 3AD7B 2BK3A 2C3DA 4GDPA 1N4VA 3UOYA 2A89A 3CN8A 1TDOA 1K0LA 1NHPA 3NRNA 4JY3A 3LZWA 3AYLA 2WETA 2WPFA 4H4UA 5IPYA 1GPEA 2OAMA 1Z6LA 4IV9A 3UKKA 4APNA 3AEBA 2VRLA 1PXBA 3DK4A 4IVMB 3UKLA 1VRQB 1EL8A 1PBBA 2R0GA 1GALA 1PBEA 2YR5A 4BK1A 3NYCA 2XLRA 2GF3A 1KNPA 1E1MA 2AR8A 1GT8A 5KOXA 3CGEA 2X8CA 4TM4A 3VQRA 2IVEA 3KU9A 4NEWA 4DSGA 2C72A 1H86A 2H89A 3SGLA 4Y4NA 2BCGG 3GRSA 3GWDA 2O9ZA 1DJNA 1JU2A 2YWLA 3NHOX 2ARDA 3RP8A 2BACA 4D03A 4JDRA 1GTEA 3CNTA 4M52A 5BVAA 2GV8A 2R9ZA 2R46A 1P2HA 1S3BA 3M13A 2YAUA 4Y4LA 3BHKA 5J7XA 4I59A 1GSNA 1OJCA 2H88A 3BI5A 4H2PA 2YLRA 2B76A 3CNPA 4OPDA 3SM8A 4C74A 3C4NA 3RP7A 5GRTA 5ER0A 4U8NA 3P4RA 1GXFA 2Q0LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RPNA 2ZZBA 2PUKC 2HLSA 3WGDA 4U8LA 1F9MA 3VWWA 3I6DA 3H79A 5JCLA 1S3AA 1YY7A 3Q6JA 2E7PA 4NXIA 5FHIA 1OKTA 1UN2A 6GSWA 3KGKA 4BURA 3KA7A 4HEA2 1G7OA 2VOUA 2WGRA 3ZVJA 2DJ2A 1H84A 2BC0A 3QFAC 4IELA 3VRAA 5EY6A 2V3BA 2IFQA 1PFOA 3P2AA 3US3A 2LV3A 1M2AA 2C7GA 5GSTA 1LPFA 2R4JA 1GP1A 1KTEA 2YV7A 2CAQA 3KP8A 2M80A 3GMCA 1DBYA 5H5SA 2XFOA 2H76A 4YH2A 1QUWA 1ZOFA 3F8UA 1MD4A 1EWXA 4OPIA 2K8VA 3D4TA 3NZNA 5CO3A 3NK2X 5D73A 4KSMA 5ECLB 2GR2A 4WXTA 1FOVA 4XWZA 2YLSA 2X49A 1WJKA 3VURA 1CJ2A 5L46A 4CDOA 2YM1A 5C00A 3E9JB 3C96A 1DOEA 1BZLA 5ABRA 1D4DA 3GSSA 2OE0A 1FECA 1QLBA 3FR9A 4Z43A 2HYXA 1G7EA 1AQXA 4NHZA 3HYVA 1TI1A 5HYMA 5IMFA 2ZBWA 2WOWA 4HZ2A 3AEEA 2YLXA 3KEBA 1F8SA 2GSSA 1DJQA 1OAZA 4YQVA 3REDA 2X4AA 4UDPA 5H5RA 1ERVA 2VZ2A 2W0HA 1ON4A 4B67A 3VRDB 1NHQA 1H83A 2XCGA 4HJMA 2B5YA 2H1BA 4N0VA 1YQZA 5JWQB 1F6MA 3TJFA 1MEKA 1SL1B 1IJHA 4KCAA 4MF5A 1GSYA 2GSTA 5A5KA 2A2PA 5IO0A 4B68A 1BKWA 1GOSA 4IGJA 4LMWA 2WU2A 2H72A 2JBVA 3TCOA 3EMPA 4KDYA 4LL1B 4G10A 3GKNA 2WQYA 2FJBA 2WDRA 1NHRA 2JAEA 4J2FA 3SX6A 5CRWA 4P9SA 3TJGA 3DVWA 1OC9B 3UVTA 4K5RA 1GLQA 3QAGA 4E8HA 1IUVA 4HA6A 4AGSA 4I58A 4NV2A 1Z3EA 4RI6A 1FVJA 2VCZA 2F9SA 3AEAA 2C70A 5IMDA 3RHBA 4WBRD 2VQBA 5HFIA 3TRQA 3KTBA 4DSHA 2B6MA 2OE1A 3AE5A 1X9MB 3NH3X 3L0HA 1R26A 1GLPA 4PQ1A 3NKSA 3DK9A 1KSUA 4A6NA 3TGZA 2YN1A 1VF2A 3IE3A 4IQ1A 1GUKA 2KOKA 1U6TA 2MBTA 5B6MA 1EZKA 4B66A 1VRSD 1OE7A 4J36A 4YKGA 3Q74A 3Q18A 2YJ7A 4DVCA 2WOIA 3NIVA 1ZZYA 4HQSA 3VRBA 2R0PA 4H4TA 4IA5A 4FYBA 1Z7PA 4GXZA 3UMAA 4JE1A 2C0DA 4ZB9A 4JZQA 2B7KA 1EV4A 4OPCA 1T4ZA 4RSLA 3UKAA 4ML6A 3CRTA 3A5IA 4TLZA 4EMJA 2A4HA 1JZDA 2GZPA 4WBJA 2XLPA 2A2SA 4KE3A 4EM3A 3F4TA 3VR9A 1PBDA 1FVKA 3CPIG 3VWXA 1OJ9A 4YXDA 3HZ8A 1F3PA 5COHA 2AB6A 3MDKA 1TK0B 3ATQA 4KDXA 5F05A 3M1GA 1M99A 3MWHA 2XFUA 4MA9A 2BC1A 3A2XA 2BCPA 4G6HA 4E0VA 2L6DA 4D73B 2VCTA 3U5RE 2BXRA 1EV9A 2BYBA 2YG3A 4L8EA 2GMHA 2HE3A 1TJDA 5A4VA 2JB1A 3RBTA 1DOCA 2B7RA 4LLRA 2YG4A 2JZRA 4JN9A 1NHYA 5D9TA 2C3CA 3DMEA 1IYIA 3HCZA 3TJBA 1Y0PA 4B63A 2BMXA 1GTBA 4ZL7A 2B5XA 5EB4A 5DVBA 4FYCA 3P9UA 3DJDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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