4X4JA

Structural and functional studies of bexe: insights into oxidation during be-7585a biosynthesis
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
486
structure length
482
Chain Sequence
DAPVVIAGAGPAGLMLAGELRLAGIGVVVLERLPARTGESRGLGFTARTMEVFDQRGLLRRFGEVQTSDQGHFGGIPVDFGLLDGAHQAAKTIPQSATEAVLEAWAGELGADIRRGHELTGVRDDGDGVAVTVRGPAGEHVLRAGWLVGCDGGRSAVRKAVGFDFPGTAATREMFLADLRGVELEPRMSLPGGMVMVGPLPGGVTRIIVCERDAPPRRRTGPPPFHEVADAWKRITGIDISAAEPVWLSAFGDATRQVTEYRRGRVLLAGDAAHVHLPAGGQGMNAGIQDAVNLGWKLAAVVRGTARADLLDTYHGERHPVGVRLLMNTRAQGLLFLNGAEMQPLRDVLAELTGYPDVARHLAAMVSGLEIAYDVGGGSHPWLGRRLPRLELDRGGRPSSTAELLRPARGLLLDFAGNAALRDRAAPWAGRIDVVTARPAGRVPGATTAVLVRPDGHVAWAAPGTHADLPMALERWFGPAPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Putative oxygenase
publication title Structural and Functional Studies of BexE: Insights into Oxidation During BE-7585A Biosynthesis
rcsb
source organism Amycolatopsis orientalis subsp. vinearia
molecule tags Oxidoreductase
total genus 134
structure length 482
sequence length 486
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4x4jA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4x4jA01
2EQ9A 3E1TA 3CNDA 3K7MX 3NKSA 4I58A 4XXGA 3QJ4A 1GRFA 1REOA 3AYJA 1CJ2A 3CGBA 1O5WA 4TM1A 2WDRA 3UOVA 2QA1A 1XHCA 1YQ3A 4AOXA 4D03A 3BHFA 3FG2P 3AEAA 3AE1A 3LB8A 5FS7A 4HA6A 5JCMA 3UP5A 2XFUA 4I59A 2GQFA 4YSXA 4NEWA 3UKPA 1GRBA 4GCMA 2R0PA 4MJWA 4PABA 4EIPA 2CDUA 3CPIG 3GMCA 1ZMDA 2EQ6A 2R45A 3DMEA 4GDPA 1KDGA 4DSGA 1PXCA 3AE9A 2C3CA 3G5QA 3FMWA 2YR4A 4H2PA 1KNPA 4H2NA 1F8SA 3SFEA 2QAEA 2Z5XA 3CNPA 4M52A 3B6DA 1PJ7A 3ICTA 1LQUA 4B1BA 4N9XA 4CNJA 4ZCDA 4A6NB 4C74A 1CF3A 3AE3A 4RSLA 3UOYA 2BK3A 2R4JA 1CBOA 2WU5A 4OPUA 3ZDNA 4FK1C 1AOGA 4UDPA 2WOWA 2TPRA 3QVPA 2XLUA 4U8LA 3ISHA 3UKFA 1ONFA 4IV9A 4B66A 4OPCA 3UTEA 2C65A 1Q1RA 2BABA 1GTHA 2JAEA 1DXLA 1B37A 1E1MA 2HQMA 2AAQA 4H2RA 1PJ5A 4USQA 1XANA 1GREA 1PS9A 2E4GA 4OVIA 1S2YA 1GERA 4UP3A 4AOSA 4YSZA 3QFAA 1H84A 5L46A 2X8GA 1H83A 2V5ZA 2OALA 2YLSA 3AEBA 1Q9IA 3BI5A 3NGCX 3NK2X 5U63A 4E0VA 4XWRA 2B9YA 4OCGA 1DOBA 3AE7A 2ZBWA 4J57A 3P4PA 4DSHA 1IUTA 2NVKX 2XVIA 2YWLA 4UDQA 4YXDA 1PDHA 1VG9A 2C66A 2GV8A 1EL7A 1TYPA 3AWIA 2WESA 1UKVG 5U25A 4K2XA 2APGA 1D4EA 4CRTA 4NTCA 4Y4NA 4NTDA 4CY6A 1D7YA 3CGCA 3DH9A 3AE5A 3QSEA 4RG3A 2VVMA 2WP9A 1NDAA 1L0VA 1ELIA 2BCGG 5KOWA 2X8HA 4J34A 2CFYA 2B7RA 5HXIA 3GYJA 1VQWA 4X9NA 1LTXR 1KFYA 4A5LA 1S3BA 2VOUA 4WCTA 4K5RA 1FL2A 2Y6QA 3RNMA 2GF3A 2R9ZA 4A65A 4B68A 1D7LA 2YVJA 2O9ZA 2TMDA 3CNSA 4Z25A 1Y56A 3P4SA 4YWOA 2GRTA 4U8JA 4U8IA 3H8LA 4GRTA 3K7QX 1PBFA 2GB0A 2XVEA 2FBWA 2Z5YA 5M0ZA 2NPXA 1E6EA 3NK1X 3DJDA 1N1PA 1D4CA 1N4UA 2IVDA 2Y6RA 2E1MA 1TDNA 1JU2A 1OJ9A 2IIDA 2V61A 2C3DA 4AP3A 4EMIA 1GSNA 1FEBA 1H6VA 3F8RA 5DBJA 2Q6UA 2WPCA 3V3OA 1YQ4A 2V3BA 3UOXA 1COYA 1DODA 1GRHA 3AXBA 2YG7A 1KF6A 1YKJA 2WOVA 3CN8A 5EOWA 3S5WA 3O0HA 3LOVA 3GWDA 4U2TA 4A79A 3GSIA 1B5QA 4YKGA 2H88A 2RABA 2BA9A 4JQ9A 1DJNA 4GDEA 3I6DA 2GH5A 1ZOVA 3AYIA 3COXA 2BYBA 3R9UA 1GT8A 2PYXA 3BI4A 3ABVA 4BURA 3VR8A 3FIMB 3QFBA 1N4WA 3NHOX 3NN0X 5J7XA 2E5VA 5IQ4A 2JBVA 2OLOA 3LADA 4H4PA 4J36A 2B76A 1OJTA 2BCPA 1CJ4A 1OJDA 2XFPA 4K7ZA 4RG4A 3JSKA 3KVEA 4H4QA 1JRYA 1IUWA 5KVIA 4AP1A 4H4ZA 1D4DA 3AB1A 5FS6A 3AE8A 1H82A 1M64A 1GETA 3REDA 3AE2A 3I3LA 1H7WA 2C75A 4A99A 2OA1A 2XDOA 3SFDA 4JY2A 5GSNA 5IQ1A 1F3PA 2C67A 2Q0KA 2FJBA 3AD9B 2WQYA 5KXJA 3UTHA 1E1LA 4UDRA 1CJ3A 2C72A 2V60A 1JEHA 1K0IA 3EPTA 1O95A 3T37A 4B67A 1IJHA 1CJCA 2OAMA 3DK8A 3SQPA 2AQJA 2C73A 3G5SA 2W0HA 2WP6A 4H4SA 4PAAA 4BK2A 1F8WA 5LV9A 3IHGA 4LU6A 1YQZA 1BGJA 2GR2A 4B65A 3BNMA 4CNKA 1MO9A 2GMHA 4H4VA 3SGLA 2XLPA 2BS2A 4ICYA 5FS8A 3NN6X 4B69A 2GAGB 4D04A 5BRTA 2X8CA 5TR3A 4BJYA 1F6MA 1PJ6A 1ZX9A 4JY3A 3ZYXA 3GDNA 3CPJG 3FBSA 4A6NA 3OC4A 3UTGA 3CNJA 3BNUA 4FDCB 1ZKQA 3VRDB 1FEAA 2YG3A 4GF7A 5IPYA 5BVAA 2C70A 4B64A 1IUVA 1K4QA 1TDOA 2BXSA 2X3NA 3KD9A 1B8SA 3ALLA 2ZZCA 1ZMCA 3NTDA 5FMHA 4GUVA 4U2LA 4AT0A 2XFNA 3RHAA 2ACZA 2WBAA 3BI2A 1NHQA 4O5UA 1VG0A 2XLSA 2YR6A 1JOAA 2YLZA 2AR8A 2Q7VA 2YG5A 3NH3X 4Z24A 1V59A 5C3JA 3NLCA 3DJGX 1VRQB 1TDEA 3NG7X 4OPLA 4FX9A 4C3XA 3C96A 2BK5A 1RP0A 1Y0PA 2YM2A 3AEDA 4LA1A 5JCIA 2A89A 1O94A 2FJAA 3C4AA 5EBKA 2BXRA 1LJ1A 4H4RA 5J60A 2VZ2A 1ZDLA 4C5OA 3AEEA 1BZLA 4YTNA 3NTAA 4TM4A 4K5SA 1CL0A 3GDPA 4OPIA 3VRBA 1Q1WA 4XWZA 2WOIA 1NENA 2XLTA 3C4NA 3F8DA 3KA7A 3ALJA 3VRAA 3DJEA 3AEFA 3GD3A 1PBBA 2XYOA 3K7TA 3VR9A 3CPHG 4APNA 1NAAA 2ZZBA 3II4A 2X99A 4C77A 1GEUA 1TYTA 1PBDA 1KSSA 5JCNA 2OLNA 3UP4A 3NIXA 3RP6A 1DOEA 1OJCA 1F8RA 1X31B 5U1OA 2A8XA 3L8KA 4J2WA 1KNRA 2I0ZA 4CCRA 5CQFA 1GPEA 3P4QA 2GAHB 4JN9A 5CKUA 4OPTA 1H7XA 3WE0A 2GEWA 1GTEA 1E1KA 1JRZA 4Y4MA 1E7PA 1JNZA 4OPDA 3DGHA 3H8IA 3KLJA 2R46A 1N4VA 1JRXA 3UKKA 3UKLA 2BC1A 3P4RA 1GRGA 1DJQA 1TDKA 2YLRA 4FK1A 3GYIA 1NEKA 4CCQA 4REKA 3CIRA 2YVFA 5C2TA 1EL5A 1XDIA 4H7UA 2ZZ0A 4EMWA 3NRNA 2VQBA 1QJDA 5M10A 4Z44A 1LQTA 1Z6LA 3CNTA 4U8OA 1P2HA 3IHMA 2CULA 4U2SA 1DNCA 3L1RA 1L9CA 1IUSA 3KPFA 4LIIA 2A87A 1D5TA 5HYMA 3Q6JA 4Z43A 2VVLA 2WETA 4U8MA 1OJAA 4J33A 1E1NA 1TDFA 4BV6A 2GMJA 3CGDA 3LXDA 1SEZA 1KSUA 2WHDA 4IVOB 2VVLG 3DK9A 2B7SA 2H89A 1CC4A 2VRMA 4C3YA 2B9XA 1BKWA 1GV4A 3PS9A 1ZOYA 1NG3A 3LZWA 5FS9A 4Z2TA 1FECA 4U8NA 1NHPA 3EAOA 2YAUA 4ECHA 1PBEA 4EM3A 4YTPA 3NYCA 1K0JA 4EQWA 1RSGA 1H86A 2XLRA 3AYLA 2BACA 3D1CA 2C64A 4IA5A 1GOSA 4H4TA 5KOXA 4BJZA 1K0LA 2BK4A 2XVJA 4A9WA 4BK1A 3UTFA 2BS4A 3AD7B 3DGZA 2R0GA 2YR5A 1E39A 2R4EA 3DK4A 4HB9A 2RGJA 4JNQA 4ZCCA 4X4JA 1H81A 2YLWA 4H2QA 4YKFA 2YG4A 3UOZA 4KX6A 2PHHA 1FCDA 1S2QA 2DKHA 2QA2A 2WPFA 4CBQA 1FOHA 1PXAA 2BS3A 4YSHA 1YY5A 4DNAA 2RGOA 4IVMB 2XFOA 4H4XA 4KPRA 1BWCA 4JNAA 2WEUA 2XFQA 3OZ2A 2GQWA 4TLXA 4EQSA 5KWFA 2JKCA 4WX1A 1PHHA 2DKIA 2EQ7A 4J56A 2IVEA 2BC0A 4H4YA 2R0CA 2X50A 2YLXA 3DA1A 3ATQA 3LZXA 2J3NA 4YSYA 3NT6A 2CVJA 3QVRA 2UZZA 4EIQA 2VQ7A 1BF3A 4Z2UA 1B4VA 4X9MA 2GR1A 4BK3A 3AD8B 3V76A 4EQRA 2Q0LA 3LJPA 1ZK7A 4GR1A 1MOKA 1NHRA 1TRBA 2FJEA 1EL8A 2JB1A 4TLZA 2JB2A 3UKAA 4YT0A 3B3RA 1GALA 4USRA 2QCUA 4NTEA 1LV0A 3NNEA 3IC9A 3QSSA 3GRTA 2GR0A 3PO7A 2JB3A 3S61A 1EL9A 1DOCA 3AE6A 3ICRA 3K30A 2WPEA 2FJDA 3NYFA 3M0OA 1GNDA 3M13A 2WS3A 3V3NA 4NZHA 2F5ZA 3ADAB 3AE4A 1NG4A 5HHFA 3EF6A 2WU2A 3G5RA 2C7GA 5JCKA 1JNRA 3QSMA 4K22A 5EB4A 1IUUA 5GRTA 4NEVA 4YTMA 5HY5A 4U8PA 1L9EA 2WP5A 4EMJA 4Z26A 1PBCA 3ITJA 3ALMA 4AT2A 3UKQA 1HYUA 3P9UA 2WDVA 1W4XA 3P1WA 1Y56B 5BULA 2EQ8A 4H4WA 1PXBA 2XCGA 2YLTA 3IWAA 4H50A 3NYEA 1M6IA 1L9DA 3RP8A 4JDRA 3IF9A 3D8XA 1EBDA 3UKHA 3M12A 2GVCA 4EM4A 3UCLA 3ICSA 1MXTA 4H4UA 4A7AA 1RYIA 4OPGA 4K8DA 3RP7A 2ARDA 1GRTA 1S3EA 1GXFA 1P2EA 3ATRA 3BHKA 1QLBA 1XPQA 2V3AA 3FPZA 4TM0A 3PVCA 1GRAA 2V6OA 3CGEA 4IA6A 3SM8A 5KVHA 1CC2A 1QO8A 3EANA 2C76A 3H4KA 3GD4A 4ADWA 2XVFA 2WDQA 3AEGA 3HZLA 1BGNA 4Z2RA 1CHUA 2B9WA 2VRLA 1PN0A 3VQRA 4EQXA 2YG6A 1LPFA 3GWFA 5KRQA 3Q9TA 3KU9A 3DJJA 1GESA 3URHA 1LVLA 2XVHA 3F8PA 4P9SA 2YQUA 4J31A 1IUXA 1NPXA 3NK0X 3CTYA 1ZP0A 2GR3A 4U8KA 4DGKA 4ZN0A 5JCLA 2JK6A 2RGHA 4B63A 1NHSA 3KKJA 5ER0A 4CY8A 4O5QA 1CC6A 2YM1A 3GMBA 5BUKA 3GRSA 1VDCA 2YVGA 4TM3A 1ZY8A 3AECA 4Y4LA 5EB5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3E1TA 3GL3A 4ECBA 3NKSA 4XXGA 1GRFA 3AYJA 5CYYA 1XHCA 4D03A 3FG2P 2HXKA 1TRVA 3LSZA 5FS7A 4EDYA 1Q4JA 4I59A 2OADA 4G0IA 1GRBA 4GCMA 4YH2A 3UKPA 4MJWA 4PABA 3BBYA 4QL7A 5HR0A 3KGKA 2R45A 2A2RA 2EQ6A 2QSIA 1PXCA 2P5QA 1GSUA 2XBQA 3M9KA 2GZPA 4ZBBA 3LORA 7GSSA 2CVKA 4Q5NA 2YR4A 4H2PA 1KNPA 1F8SA 1NHOA 2VLUA 4EUYA 4M52A 3CNPA 3B6DA 1GLQA 1PJ7A 4N9XA 3PINA 4C74A 5CO3A 3BCKA 2R4JA 1CBOA 2WU5A 1THXA 4RQXA 3IE3A 5D93A 3C8EA 1PFOA 1GLPA 2JZTA 4WETA 1Q1RA 1V57A 1V58A 4G9KA 2O85A 2F8AA 1OKTA 1GREA 2LV3A 1PS9A 2NDOA 1CQHA 4OVIA 3RDWA 4EL1A 1H84A 2X8GA 1GUHA 1H83A 3MYDA 3UMAA 2F8FA 2YLSA 1Q9IA 3NK2X 3G7IA 4XWRA 1YY7A 5AN1A 3G9BA 1X5CA 3GH9A 3H8QA 1IUTA 3CRTA 2C0FA 2GSTA 4HZ4A 5D9WA 2YWLA 3DIEA 2WRTA 2GV8A 1EL7A 1K0CA 2WESA 1UKVG 1GSQA 5U25A 4I8BA 2TIRA 2WFCA 2WJUA 2EIRA 1D7YA 5INYA 5DQSA 4L0WA 3KTBA 6GSUA 1Z6MA 1NHYA 1PL1A 4DVCA 1LTXR 1K0MA 1Z9HA 2Y6QA 2R3XA 1DE1A 3CNSA 1OE8A 4IJ3A 4Z25A 2OE0A 4YWOA 1ABAA 5GAPD 1HNBA 1WIKA 4AF2A 4WEYA 2ALBA 1PBFA 2GB0A 2LEGA 2Z5YA 3OR5A 1U87A 2H6XA 3I9V2 1D4CA 3GURA 2Y6RA 2RIIA 5DBQA 1OJ9A 1K3YA 4EMIA 1GSNA 1K0AA 1GUMA 2Q6UA 2TRCP 1ZOFA 4KCAA 3V3OA 1YQ4A 2H72A 1QUWA 1COYA 1B9XC 2GDRA 2V3BA 1GRHA 2YG7A 5EOWA 2G2QA 3HYPA 5EL8A 3S5WA 5B7CA 3LOVA 3GWDA 5KMRA 3GSIA 1AIUA 2GZZA 2RABA 1AQVA 3F3RA 4GDEA 3DWVA 1SK0A 2BYBA 3GSTA 1ZYNA 3HD5A 4PURA 3RHCA 2ZUPA 3SXIA 3VR8A 2HNLA 3FIMB 3NN0X 4BL7A 2E5VA 3EU4A 1G6WA 1XWAA 3ZYWA 4K7ZA 1OJTA 1CJ4A 1JLWA 5J9CA 1QFNA 5IOXA 2VM2A 10GSA 3CYNA 3AB1A 1WWJA 1GETA 3ZRDA 1FB6A 1PSQA 4JY2A 5GSNA 5IQ1A 2C67A 2YWNA 4GTUA 3UTHA 3V1WA 1TRWA 2GQLA 4O32A 2C72A 1EOHA 1SD9A 2H6YA 12GSA 2JSZA 2OAMA 5J41A 2PMTA 4ZL9A 3W8JA 6GSWA 2W0HA 4H4SA 5LV9A 1YQZA 1BGJA 5J4UA 3ME7A 3Q18A 4O7HA 3BCIA 3ZVJA 2BMXA 5FS8A 4GQCA 1GTBA 3NN6X 3HCZA 4B69A 2X8CA 4BJYA 1F6MA 1PJ6A 1YEXA 3SWLA 3VRDB 3N5OA 1EZKA 2D2ZA 3UVTA 1FEAA 2YG3A 3C73A 4K2DA 1K4QA 2JU5A 1ERTA 1B8SA 4FQUA 3ZITA 1THOA 3VWXA 2X64A 1NHQA 4MA9A 1VG0A 2XLSA 2YR6A 2LKUA 2Q7VA 2FWHA 3IDVA 1V59A 1GWCA 2AUVA 2GT6A 1TDEA 4KDUA 1RQMA 4Q5FA 1WPIA 1RP0A 3QFBC 1Y0PA 3AEDA 5JCIA 5DCHA 1GSYA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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