4X4JA

Structural and functional studies of bexe: insights into oxidation during be-7585a biosynthesis
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
486
structure length
482
Chain Sequence
b'DAPVVIAGAGPAGLMLAGELRLAGIGVVVLERLPARTGESRGLGFTARTMEVFDQRGLLRRFGEVQTSDQGHFGGIPVDFGLLDGAHQAAKTIPQSATEAVLEAWAGELGADIRRGHELTGVRDDGDGVAVTVRGPAGEHVLRAGWLVGCDGGRSAVRKAVGFDFPGTAATREMFLADLRGVELEPRMSLPGGMVMVGPLPGGVTRIIVCERDAPPRRRTGPPPFHEVADAWKRITGIDISAAEPVWLSAFGDATRQVTEYRRGRVLLAGDAAHVHLPAGGQGMNAGIQDAVNLGWKLAAVVRGTARADLLDTYHGERHPVGVRLLMNTRAQGLLFLNGAEMQPLRDVLAELTGYPDVARHLAAMVSGLEIAYDVGGGSHPWLGRRLPRLELDRGGRPSSTAELLRPARGLLLDFAGNAALRDRAAPWAGRIDVVTARPAGRVPGATTAVLVRPDGHVAWAAPGTHADLPMALERWFGPAPR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Putative oxygenase
publication title Structural and Functional Studies of BexE: Insights into Oxidation During BE-7585A Biosynthesis
rcsb
source organism Amycolatopsis orientalis subsp. vinearia
molecule tags Oxidoreductase
total genus 134
structure length 482
sequence length 486
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4x4jA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4x4jA01
2B9YA 2WPFA 3AD8B 4H2RA 4JQ9A 1Y0PA 2V5ZA 4K22A 4K2XA 1MOKA 3O0HA 2YLZA 1H84A 1PS9A 5HHFA 3ZYXA 1XANA 1DOBA 2GQWA 3DK8A 3UKLA 3BI2A 1FEAA 3IF9A 3UOYA 3DMEA 4B64A 4OPUA 4C5OA 2WDRA 4JDRA 4U8MA 4IVOB 4J2WA 4OPGA 2BS2A 2I0ZA 3ICTA 1DJQA 3GMCA 2AAQA 2V61A 1EL5A 2YLXA 2YG4A 3VR9A 1H82A 1PBBA 3B3RA 3UKFA 2YR4A 1GETA 2V3BA 5GSNA 3AE7A 2WQYA 3BNUA 1FECA 1GRBA 3C96A 3CGDA 1IUTA 3C4NA 4H4WA 3SFEA 2Q0LA 4IV9A 4B67A 1CJCA 4NTDA 4U2SA 4H4TA 2RGHA 2BS4A 1E1NA 2NPXA 3KD9A 4O5UA 5IQ1A 2VZ2A 4GCMA 2C7GA 5KOWA 3ATRA 2B9XA 3CN8A 1Q1RA 2HQMA 5J7XA 3D8XA 5LV9A 2C3CA 3UKAA 3UOVA 5BRTA 3P4PA 4UDQA 4BK2A 2XDOA 3AB1A 3AE4A 5U25A 4NEVA 4GF7A 3F8RA 3K7QX 1CBOA 2EQ9A 2XVHA 2OA1A 1H81A 4BK3A 1H7XA 2WDQA 2XVIA 2IIDA 5CKUA 4YSYA 4Z2TA 4K8DA 1QLBA 3S61A 1Y56B 1IUVA 4B63A 2YG7A 3UKPA 4C3YA 3GRTA 4YSZA 3UTFA 4Z25A 1GPEA 4UDRA 4GRTA 1M64A 3QVRA 3RHAA 4HA6A 4H7UA 4K5SA 4CNJA 1JEHA 3AE9A 2APGA 4B69A 1TDNA 3URHA 3R9UA 1O94A 4D03A 2ZBWA 4NTEA 2XCGA 4OPLA 3BI5A 1YKJA 1PHHA 5HYMA 2XFUA 2YVJA 1QJDA 4H4XA 4USRA 4ECHA 3AD7B 3VRBA 1PN0A 2R4JA 1M6IA 4P9SA 2RGJA 3LJPA 2B7SA 2WHDA 3KLJA 4EIPA 4ZN0A 1GRHA 2X50A 1B8SA 2GRTA 2XLTA 1YQ4A 4U2LA 1TRBA 4UDPA 1GTHA 1PJ7A 2XVFA 1TDOA 1REOA 2C73A 2YQUA 2B7RA 4WX1A 2QA2A 5GRTA 4CCQA 1CJ2A 3AEAA 1IUSA 3DJGX 4TM1A 3UOZA 3P4SA 1BGNA 2XFNA 1PBDA 4H4SA 3DJJA 4Y4MA 4AOSA 2OLOA 2GMJA 4LU6A 3C4AA 3M13A 2TPRA 3UOXA 2ACZA 4U8LA 3VQRA 3AEBA 3AEFA 5BULA 1OJ9A 3CIRA 2Q7VA 1KSUA 1VDCA 2H88A 2IVEA 3I6DA 4DNAA 2C72A 4CNKA 4B1BA 3UCLA 4XWRA 4BURA 1OJTA 4EQWA 3AYJA 2VVMA 3P1WA 5DBJA 1GXFA 3CGEA 3NG7X 4LIIA 4TM4A 1E6EA 4CY8A 4RSLA 4EM3A 4FX9A 1KDGA 3V3OA 4D04A 4CY6A 2R45A 1ZK7A 3NK1X 1VG0A 2X3NA 2OLNA 3EF6A 4EMIA 4X9MA 1NHPA 2WPCA 2GV8A 3AE6A 3DJDA 1FL2A 3LZWA 1L0VA 3GYJA 3FPZA 4JN9A 2ZZBA 2C67A 4X9NA 3K30A 2V6OA 3AE2A 1ZX9A 1ZY8A 5CQFA 1BGJA 4H2NA 1PXCA 4A65A 5M10A 4MJWA 3AE5A 1E1KA 4C74A 4U8KA 2WDVA 4EIQA 2A8XA 5U63A 3EANA 3I3LA 3KKJA 3NLCA 5C3JA 1FOHA 2X99A 3GYIA 4FK1A 1S2YA 2WS3A 4YKGA 3NK2X 4M52A 3NRNA 4GDEA 1GTEA 1N4WA 1GEUA 1RSGA 1ZDLA 3LXDA 3P9UA 1H6VA 5C2TA 2XVJA 4TM0A 1GNDA 4A6NB 1RYIA 1V59A 2VOUA 2EQ8A 3F8DA 4DGKA 3CNDA 2GQFA 1PXBA 1F6MA 3BNMA 3PVCA 2BK5A 1PBFA 2H89A 3SM8A 2BYBA 2BXSA 3LOVA 5JCKA 1PJ6A 2TMDA 3JSKA 1DXLA 2YG5A 4ZCDA 1VQWA 2VVLG 4Z26A 4JY3A 4J36A 4C77A 1PDHA 5KVIA 3L1RA 2XFOA 5EBKA 1B37A 1TYPA 2V60A 4GDPA 1JNRA 5L46A 3SFDA 1LV0A 1H86A 3AE8A 1JRZA 5IPYA 3AECA 1ZMDA 4TLZA 4BJZA 1NPXA 5BVAA 2GAGB 4I58A 4OPIA 3ICSA 4YTMA 3II4A 2Z5XA 2C65A 1EL8A 3IHMA 3ITJA 4Z2UA 2WOIA 2Q6UA 1ZOVA 2WEUA 4JNQA 4GR1A 3LADA 3IWAA 5U1OA 3RP8A 3KA7A 4BV6A 4H4PA 1KSSA 3SQPA 4AP1A 3NK0X 4YT0A 1F8RA 1JU2A 3E1TA 1NHSA 2JB3A 2GR3A 2VRLA 2VVLA 3CNSA 1QO8A 3GWFA 3OC4A 1D5TA 3REDA 3ALMA 3QFBA 3AE1A 4KX6A 2B9WA 1RP0A 3NYCA 4YXDA 1IUUA 3CPHG 4RG4A 3UTHA 4B65A 1EL7A 2JB2A 4REKA 1CC2A 3H8LA 3L8KA 3UTEA 3HZLA 1XHCA 4CBQA 2E1MA 5ER0A 1CC6A 1DNCA 1L9DA 2BA9A 1D4DA 3P4QA 5FS8A 3H8IA 4U8OA 2C64A 2YWLA 3CGBA 4RG3A 4Z24A 1NHQA 4AT2A 3NT6A 3ATQA 1GOSA 2EQ6A 3QSMA 1NHRA 2W0HA 1L9EA 1DOCA 2J3NA 2YLWA 3H4KA 3UP4A 3WE0A 4FDCB 1F3PA 4U8NA 1HYUA 1CF3A 1JRYA 1IUXA 3NH3X 4TM3A 4AP3A 1ZOYA 2JB1A 4AOXA 4J34A 3OZ2A 4ICYA 1OJCA 2C3DA 1XDIA 1YY5A 2BACA 1FEBA 5J60A 3DK9A 2YVFA 2C70A 3ADAB 3DK4A 1BF3A 2PHHA 1K4QA 4ZCCA 1CC4A 4X4JA 1NEKA 5M0ZA 3F8PA 1TDEA 2R0PA 2AR8A 2WOWA 2FJAA 3AYLA 4EQSA 5FS7A 1K0JA 2XLRA 1EBDA 1S3BA 1H83A 1Z6LA 3NYEA 4NEWA 1N1PA 3G5RA 2XVEA 4EQRA 3ABVA 3G5SA 4LA1A 4Z44A 2F5ZA 1P2HA 1GT8A 4H4QA 2YLSA 4ADWA 1E1MA 3CGCA 2A87A 3QJ4A 1GRGA 1GRTA 4FK1C 2XLPA 4CCRA 2R4EA 1ZP0A 1JOAA 2BC1A 2WPEA 3EPTA 1GSNA 1KFYA 4KPRA 4I59A 5JCNA 2CFYA 3QVPA 1F8WA 2GR0A 1NDAA 3CPJG 3K7TA 1F8SA 1Q1WA 1GALA 2BK4A 2C66A 3NTAA 4NZHA 2GEWA 1FCDA 1SEZA 5FMHA 3SGLA 4A7AA 1PBEA 4TLXA 1IUWA 4H2QA 1TDKA 3NTDA 3NYFA 3UKQA 2DKIA 1K0LA 4H4ZA 4H50A 4IVMB 1LTXR 2YG6A 4J56A 1L9CA 2FJDA 3EAOA 3FBSA 3NNEA 2BABA 4APNA 3Q6JA 2XLSA 3K7MX 1CJ3A 1GRAA 2RABA 4YSHA 1KNPA 3BHKA 3RNMA 4OPDA 1DOEA 3FIMB 3CNJA 5TR3A 4EQXA 2EQ7A 5KOXA 5JCLA 3NN6X 3UP5A 2WU5A 4H4RA 1OJDA 1JNZA 1GESA 2GB0A 1N4VA 3COXA 3ISHA 1KNRA 1KF6A 1D4EA 2FJBA 2X8HA 3QSEA 1K0IA 2YLTA 4Z2RA 3GDNA 1CHUA 4NTCA 1B4VA 1GV4A 2XLUA 1MO9A 4U8IA 3AXBA 1S2QA 1H7WA 1MXTA 2WETA 4J33A 4XXGA 3NHOX 1X31B 2Z5YA 3LZXA 2V3AA 2WP5A 1ONFA 4OPTA 1D7LA 4EM4A 3GSIA 2BXRA 2C75A 3IC9A 1AOGA 2DKHA 2QCUA 3VRDB 3CPIG 3V76A 4A9WA 2GVCA 2BCGG 2PYXA 2YG3A 3GRSA 2QA1A 2FJEA 2Y6QA 3GD4A 3QSSA 4J57A 2YLRA 5JCIA 2XYOA 2YAUA 1NG3A 3AWIA 1XPQA 4EMWA 1GREA 2YM2A 3S5WA 4U2TA 2WBAA 4Y4NA 4A99A 4JNAA 4B68A 3UKKA 4YSXA 2ZZCA 5KVHA 2YVGA 2JBVA 3UKHA 3CTYA 3PS9A 3RP6A 1OJAA 5JCMA 2X8CA 3B6DA 3NKSA 4PAAA 1NG4A 4J31A 4OVIA 5EOWA 2RGOA 2VQBA 4O5QA 4XWZA 1BWCA 2CVJA 2CULA 4WCTA 5KWFA 1VRQB 1ELIA 1IJHA 2WOVA 3FMWA 3M0OA 2JAEA 3AEGA 4UP3A 5FS6A 2GR2A 3QFAA 4Y4LA 5KRQA 3ALLA 2GR1A 1PBCA 5EB4A 1D7YA 3DGZA 4U8JA 2R0GA 4A6NA 1LQTA 3M12A 1CJ4A 1EL9A 1N4UA 2WP9A 4USQA 5KXJA 3ALJA 4A79A 4H4UA 4OCGA 2XFQA 2YR6A 4H2PA 4EMJA 2Q0KA 2AQJA 2E5VA 1B5QA 4H4YA 1LJ1A 2A89A 3BHFA 1VG9A 2GAHB 4YTPA 1E39A 2R46A 3NN0X 1BKWA 3P4RA 4BJYA 3UTGA 4PABA 5IQ4A 2WU2A 2NVKX 2YR5A 2XFPA 3ICRA 4CRTA 4DSHA 1JRXA 3NGCX 2CDUA 4YKFA 4N9XA 1YQZA 1E7PA 1P2EA 5EB5A 4K7ZA 4C3XA 3AEDA 1W4XA 3DA1A 4K5RA 1DJNA 4IA5A 4AT0A 1Y56A 2JKCA 2GF3A 4GUVA 4B66A 1GRFA 2GMHA 3KVEA 4DSGA 2C76A 2Y6RA 4A5LA 2YM1A 2WP6A 2IVDA 2BK3A 1LVLA 3AYIA 3GDPA 1Q9IA 2O9ZA 1PXAA 3ZDNA 3V3NA 1TYTA 3AE3A 3KPFA 3AD9B 1CL0A 4HB9A 3DJEA 2FBWA 4H4VA 5HXIA 2R0CA 1NAAA 1S3EA 3CNPA 4BK1A 2BS3A 2VRMA 3CNTA 3RP7A 3T37A 1LQUA 3IHGA 2ZZ0A 3Q9TA 2GH5A 2QAEA 1ZMCA 1O95A 2UZZA 3AEEA 3FG2P 3BI4A 3KU9A 1BZLA 4YWOA 4JY2A 1UKVG 1ZKQA 2BCPA 2OALA 3GMBA 5FS9A 4IA6A 4OPCA 5HY5A 2WESA 1O5WA 1E1LA 1PJ5A 1D4CA 2VQ7A 2B76A 1TDFA 1GERA 1DODA 2ARDA 3PO7A 1NENA 3D1CA 4E0VA 3LB8A 1COYA 3DH9A 3G5QA 2BC0A 5BUKA 1YQ3A 3NIXA 4U8PA 2R9ZA 2E4GA 4Z43A 3VRAA 2X8GA 3GD3A 3GWDA 3VR8A 4YTNA 2OAMA 3DGHA 2JK6A 1LPFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KH9A 2B9YA 1UC7A 3AD8B 1XWBA 1Y0PA 1TRUA 4K22A 3GNJA 4K2XA 4ZL7A 9GSSA 3O0HA 4ID0A 2KLXA 5KN0A 2WULA 3GN3A 1PS9A 5HHFA 3ZYXA 1XANA 4IHUA 3BCKA 1DOBA 3UKLA 3BI2A 1R5AA 2H73A 4GSNA 4DSSB 3DMEA 2I81A 4FQUA 4U8MA 4GWRA 3GMFA 5G31A 4IVOB 2C3NA 4OPGA 3ERGA 3KD0A 2DIYA 4K8MA 5IPHA 3L78A 2YG4A 3VR9A 2GSTA 1H82A 1PBBA 3LYPA 3QFAC 4V2MA 5GSNA 2B6MA 3CGDA 2WQYA 3BNUA 1EGOA 4O5UA 1O8XA 1GTAA 2VZ2A 2CVDA 2VUPA 3F9UA 1MDKA 2P0GA 2LSTA 1JLVA 2QSIA 3UARA 3F8RA 3K7QX 1CBOA 1H81A 6GSWA 5F06A 3TRQA 2IIDA 2L5LA 4BVYB 3F4TA 3D4TA 4WF4A 1Y56B 1FHEA 3J7Yb 2YG7A 2HZEA 2HLSA 4Z25A 1GPEA 4UDRA 2GGTA 4GRTA 1M64A 1GSDA 1EP8A 1JEHA 4B69A 1T7PB 2G0FA 3R9UA 4OPLA 1SJZA 3BI5A 2L6CA 4L0UA 4WR4A 1WOUA 1Z3EA 2FLSA 5ELAA 4HU9A 4ZILA 2GT6A 2YV9A 3H8QA 4K6XA 4USRA 4ECHA 3GV1A 2VAFA 1O85A 3O6TA 4P9SA 4MF7A 4EIPA 1GRHA 1VF4A 4IVFA 5KNLA 2C73A 4EO3A 5HR2A 2B7RA 4EVMA 5IMCA 1VF2A 2C0FA 1VRSD 5ECHB 3UOZA 2H72A 2VCQA 5BMUA 5IOWA 4H4SA 4Z7XA 2QC7A 4POBA 4MK3A 3C4AA 3M13A 4F82A 2MBTA 2ON7A 2DIZA 3VQRA 1FG4A 1KSUA 1VDCA 2H88A 5IIZA 2IVEA 2LQOA 2B1LA 4B1BA 2HNLA 2NBSA 1NHOA 2N5BA 3P1WA 4PQHA 4OFNA 1OYJA 1ZZYA 4RSLA 4EM3A 3HCZA 1HD2A 1THXA 2R45A 14GSA 2WJUA 1H75A 2ZCTA 4L8EA 3AE6A 3ZMLA 1FL2A 3LZWA 2JZRA 1QXHA 2H30A 2C67A 2VCTA 1QK8A 1K3YA 3PINA 1ZY8A 16GSA 3UAPA 4MJWA 3ERWA 4BWSA 3KKJA 3NLCA 5C3JA 1XXUA 2MMZA 2X99A 4GAVA 3GYIA 4FK1A 2UZ8A 3FW2A 2FWHA 1S2YA 2WS3A 2JADA 2L57A 2LJKA 3ERFA 2I3YA 3LXDA 4CW9A 4MJCA 2VOUA 2A2RA 3F8DA 4GXZA 2GQFA 1PXBA 1PX6A 2H8LA 3M9KA 2DJJA 2BK5A 2H89A 2O85A 1GUHA 2DMMA 5JCKA 1E2YA 1DXLA 2LRNA 4ZCDA 1XG8A 2L6DA 4TVEA 4J36A 3QD9A 3TOTA 2H0GA 4IP1A 5ID2B 3L1RA 2XFOA 1MD4A 4FYUA 1B37A 3KGKA 1GNEA 3N9JA 3Q6OA 3SYIA 1LV0A 4BJZA 1F3BA 1PA3A 2C3QA 4OPIA 1JZOA 5IQYA 3II4A 3SZ0A 3FK8A 5LNKe 3RP8A 2VCXA 3KA7A 5JWOB 1JFUA 2VLUA 4TXOB 4XS6A 1JU2A 1TXXA 1NHSA 5EL8A 1Z6NA 1GL8A 3OC4A 3TRPA 1ERVA 1EOGA 3VFIA 2GZYA 3HJMA 1RP0A 3ZIVA 3LYKA 1IUUA 3LORA 1MD3A 4CBQA 4XS1A 4WXTA 1CC6A 1DNCA 1SD9A 3G9BA 4BA7A 4U8OA 2WGRA 2RUEA 3FRCA 3CBUA 4ML6A 3ATQA 1TDIA 2EQ6A 2A4VA 1L9EA 3WE0A 5KEJA 1B9XC 1CF3A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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