2YPMA

Crystal structure of ancestral thioredoxin relative to last animal and fungi common ancestor (lafca) from the precambrian period
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVIQVTNKDEFESILSEADKLVVVDFTATWCGPCKMIAPKFEELSEEYPDNVVFLKVDVDEVEDVAAEYGISAMPTFQFFKNGKKVDELTGANQEKLKAMIKKHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords LAFCA THIOREDOXIN
publication title Conservation of Protein Structure Over Four Billion Years
pubmed doi rcsb
source organism Synthetic construct
molecule tags Oxidoreductase
total genus 32
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2012-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ypmA00
1EEJA 1T3BA 2KHPA 2RLIA 4XCSA 2H73A 4WETA 5G5FA 1SL1B 2AJQB 5G30A 5H5SA 3F3RA 2B1LA 2H66A 4K6XA 1FVKA 4IHUA 4F0BA 2PBJA 2CV4A 3VPTA 3GL3A 4HUAA 4GSTA 3C1RA 2V2GA 1T7PB 4L0UA 1GSUA 5HFKA 3L9UA 1PN9A 3LG6A 2X8GA 4JZQA 2VOCA 3GV1A 1ZYEA 2DIYA 3HJMA 4TRXA 1X0RA 3GNJA 2PUKC 3HYPA 4OFTA 4JBBA 4PGTA 2VUPA 2JSYA 5D9VA 5DCHA 12GSA 4KUNA 1OC9A 1WIKA 3APSA 2R3XA 1K0CA 4NAXA 4I8BA 2VCXA 2VM1A 2C0EA 4X1UA 5EPFA 1YDKA 3VWVA 2J23A 2HXKA 2I4AA 5FT3A 3KZQA 4MA9A 1NM3A 1ML6A 3NIVA 3V1WA 2H6XA 3VWUA 5JWOB 2C1YA 1B4PA 1CQHA 2C3TA 1O81A 2KP1A 3VLNA 4ZXGA 1TRWA 2CZ3A 2I1UA 3FR9A 4NPBA 5ID2B 3RHBA 4PQIA 4F82A 4HJ2A 1PQNA 4AF2A 5IPGA 2IWTA 5B8AA 3KCMA 4WEYA 4ECIA 1F3BA 4PNFA 2H71A 4OO5A 5ELGA 4F9ZA 3ZFBA 2VD1A 3P7XA 3Q6OA 4NHZA 4OCEA 4TXVA 3L0HA 2RUFA 1ZMAA 1F37A 2L5LA 1HNCA 2JACA 2GDRA 2G0FA 1NHYA 3QPMA 4HEA2 3FZAA 1GL8A 6GSWA 4YH2A 4ZL8A 4JR4A 2K18A 2H70A 2FGXA 2VD0A 1PGTA 5EVOA 3S9FA 4J57E 4EKZA 4TW5A 1GUKA 1XZOA 4K0GA 2MBSA 5G2ZA 4PX1A 4TR1A 1PL2A 3QFAC 5DJLA 1YY7A 3CTGA 5B7CA 4F2IA 2X8HA 5ECOB 3IK9A 2YCDA 4EC0A 1TU7A 4POBA 2JZTA 2XHFA 4KSOA 2WFCA 2R5GA 3ERGA 5HR3A 5IMCA 5J5NA 4OWYA 1SD9A 2MMNA 3VPQA 1Q4JA 3GHAA 2V41A 5LD0A 2OKAA 1RW1A 1OC8A 4IN0A 4QL7A 4LA1A 4OO4A 1XW6A 2CVDA 2AB6A 2IMFA 5DAKA 3M9KA 3LEFA 1RQMA 4FYCA 5INYA 6GSYA 2GQLA 5G5EA 3IPZA 3P2AA 4HDEA 3ZITA 1OVNA 2VCZA 2GSTA 5DVBA 1FHEA 1WMJA 1HNBA 4OFNA 1GSFA 2MMZA 1JZOA 3L4NA 3D0ZA 4WF4A 2B7JA 3DGQA 3FZ9A 2O89A 3ZIVA 1EP8A 4GLTA 1VF1A 2OBIA 1QGVA 1ABAA 1TXXA 2VIMA 1R26A 4LL4B 4MMMA 1MD3A 4G2EA 2KP2A 1FB6A 1A23A 4N30A 3QAGA 1XBSA 3F6FA 2LSTA 1SJIA 3KP9A 3QMXA 3TUEA 3VWWA 1GSQA 2FA8A 2YWIA 2L5OA 1WOUA 4J2FA 3MSZA 2YZHA 1M99A 1GTIA 4ID0A 3GA4A 1QQ2A 2NVLA 3QFBC 4MZBA 2DJ0A 3QAWA 2O87A 1G6YA 1WJKA 4XHMA 5G1KA 4IS0A 3RAZA 3SBCA 3VI7A 1FG4A 4HJMA 1EWXA 4HZ4A 1B9XC 2VLVA 3ISOA 4G19A 4F0CA 1XWAA 1GLPA 2WS2A 4MDCA 5IO2A 3GH6A 1GLQA 1SL2B 3FW2A 2R4VA 5JWRB 5IMFA 3GKNA 1THXA 2GZPA 3LXZA 4NV5A 1K0OA 5IM9A 3F3QA 5HQPA 4ZL7A 4NHWA 4ZBDA 2MMOA 4LLRA 2GSQA 1J9BA 1XVQA 2C0FA 2DJ1A 4ECBA 10GSA 3ED3A 3I69A 1RK4A 6GSUA 5CRDA 3A3TA 2PVQA 4ZBAA 3HKRA 1H75A 4ECCA 3KMOA 5J9BA 4D73B 4K8MA 1HNAA 2WJUA 1GUMA 3M1GA 3TDGA 4E8EA 3TKSE 2GT5A 2H72A 1XW5A 3F63A 3ZRDA 1R5PA 2HI7A 1WRYA 5IOWA 5F07A 2FWEA 4MP4A 1AAZA 3IAM2 4BWQA 3HJPA 3HY2A 1YF0A 2KLXA 2GZYA 3ZVJD 2FWHA 1XIYA 4IKHA 3GTUA 4FYBA 1B48A 1U87A 3IK7A 1TRSA 3LXTA 6GSSA 4HU9A 1YKCA 1XWCA 1FW1A 4IW9A 4O7HA 1ST9A 3TRXA 5IMDA 1OKDA 1PD21 3AY8A 1WE0A 3D4MA 1AUCA 1SD8A 1U3AA 3D21A 4HOJA 3FK8A 3FR3A 2RM5A 3EINA 4ML1A 5IMZA 2VCQA 2XPDA 2YP6A 2CZ2A 4RQRA 3TOUA 4L5LA 2TIRA 3ZYWA 5ECLB 3TKRA 5AGYA 2V6OA 3GKXA 2CX4A 1GWCA 2C4JA 1IYHA 4BVXA 4MPFA 3FEUA 5DQSA 1A2JA 1EEMA 3M8NA 5DJMA 2GLRA 2X99A 2H01A 1NHOA 2IMKA 4IQ1A 2VL3A 1G7OA 2NBSA 2LEGA 2OBKA 3KIJA 1KEBA 3DKSA 3GL5A 4DSSA 1A2MA 3LSZA 4MJAA 3E0UA 4XS4B 1J0FA 4MZCA 2C0GA 4HZ2A 1ZGNA 3FY7A 3MWHA 3FRCA 1JFUA 3UVHA 1X5DA 2HSHA 3L9SA 1B9YC 2QGVA 1BEDA 1Z6NA 3HVVA 2ON5A 3F9UA 4N0ZA 4KW6A 2YJ7A 3E3EA 3ME7A 3TKPA 3UOMA 3ZIJA 4EE0A 5C04A 1TDIA 1S3DA 1A8LA 3O3TA 2B3SA 1THOA 4ACSA 5D9TA 4TXOB 3W8SA 5DCGA 1OC3A 3FZ5A 1TW9A 4AJ8A 1OE7A 1M0UA 2NPBA 3J7Yb 2ALBA 2VLTA 2GT6A 5C00A 1V9WA 5JWQB 1QUWA 4MH3A 1YKAA 3CMIA 3RDWA 1KNGA 2GTUA 3TRQA 3W8JA 2DIZA 3KH7A 3HZ8A 3LYPA 2YANA 3RPNA 4PQ1A 1AQVA 3FZ4A 4HS1A 2OACA 2CVBA 1WP0A 3TRPA 1Y6EA 3F4TA 4K2DA 4KA0A 4AGSA 1UA5A 5GSTA 3RHCA 5IIZA 5IOXA 1R4WA 4KDXA 1G7EA 2IJYA 1LJRA 4MJBA 4JEDA 5A4WA 3UVTA 1XPVA 1SYXA 3GIXA 3ZVJA 5D73A 1TJDA 2HZEB 2AYTA 3IAS2 3WYWA 2H76A 3KM6A 2KUCA 2YN1A 2E2GA 3WGDA 5E4WA 2VM2A 2YNXA 2B5YA 4V1Ag 1GSDA 3E9JB 3BJ5A 2GQKA 2IMEA 3C71A 4HU7A 1B4QA 1ZCPA 4KAEA 3UBLA 5CRGA 2TRXA 3Q74A 2GS3A 7GSSA 2AUVA 1B8XA 3IBHA 5CP1A 1UN2A 2VO4A 3GURA 4GSSA 1M2AA 2B5XA 2CA8A 2DSAA 1DE1A 1T1VA 2EC4A 2I81A 4IJIA 2YV9A 4IP6A 3WT1A 2MMAA 1JLVA 3TJKA 4IJ3A 2O7KA 1PX6A 3KEBA 4Z7XA 1NW2A 3P8WA 3HCZA 5IPHA 3CXGA 3H1NA 11GSA 1TK5B 4KSMA 3IE3A 2I9HA 4K7OA 1AQXA 4LMVA 3RPPA 4G9HA 2K8SA 3G7JA 3IR4A 1DBYA 3HDCA 2X8CA 3EE2A 5DALB 4Q5QA 2P31A 1H4OA 2LNSA 3PR8A 2LS5A 3GN3A 1KBNA 1M9AA 2YPMA 2H74A 4Q5RA 2HRNA 5EY6A 2DMLA 4XRAA 2GZZA 1EGRA 3HHVA 2JADA 1BX9A 2E7PA 4GF0A 2H75A 1A24A 3DWVA 1V2AA 2F3MA 2MBTA 2HLSA 2A2SA 3HD5A 3CBUA 1E6BA 4PQHA 2M80A 4ISDA 4O92A 4GWRA 2FY6A 3GX0A 3NOFA 3SWLA 1JZDA 1XW9A 2WB9A 3MAKA 2H0IA 3HZ4A 3EWLA 4POKA 2K8VA 1G0TA 1YQ1A 5HFIA 3LORA 1SKRB 2N5FA 4IBPA 4FH8A 8GSSA 3US3A 2B6MA 4K7IA 3TJFA 1QMVA 3EURA 2FD3A 2HT9A 2O8VB 4H86A 1S3CA 1F6MC 1SJ6A 4L5OA 5KEJA 4N0VA 1M2BA 5CO3A 1BQ7A 1N2AA 2H0GA 2X64A 3DIEA 2OADA 1I9DA 1SK0A 1V58A 3D5JA 2DJ3A 3CRUA 2YZUA 5DBQA 3GSTA 4HI7A 4O32A 4PUAA 5IO0A 3IV4A 4KDUA 1PKWA 3KJYA 3U5RE 3GRXA 1JHBA 2K9FA 3EMXA 1XWKA 2YWNA 1K3OA 1YJ6A 3CSJA 5ECKB 1A8YA 2E0QA 5ECHB 3I43A 3UL3A 3VI5A 1FVJA 5AISA 4EF0A 1NSWA 1SKWB 4WR4A 2HYXA 2FCHA 4TR1B 4BA7A 4KDYA 1V40A 4GQCA 2MZCA 2CAQA 2WRTA 5J41A 5JCWA 3FKFA 1V98A 5KN1A 2GSRA 2R37A 4YAPA 2RUEA 1ERUA 3APQA 1CQGA 3CSIA 2YOIA 2LQOA 2I3YA 2QC7A 3EC3A 1Z7RA 1PX7A 1FB0A 2NDOA 1X9WB 5ABRA 1QXHA 3IRAA 20GSA 3UEMA 2IFQB 5JCGA 1FOVA 3KTBA 2HNLA 3N9JA 1ILOA 3C73A 3GYKA 4MF5A 3HA9A 5F06A 4L8EA 2IPAA 3H4KA 2YV7A 4LL1B 2FUG2 2H1GA 1O8WA 5FWGA 3TKSA 2PMTA 3GFKA 1EP7A 5HR0A 4GXZA 4EUYA 2L59A 1GUHA 2ON7A 5GAND 2LJKA 3GUSA 2YWMA 3J7Yk 2DLXA 2G2QA 4DEJA 2FLSA 1PA3A 1T4ZA 2N5AA 1MTCA 4MF7A 5G31A 5A4UA 1R5AA 3M9JA 4K9ZA 1JZRA 4K1FA 3QOUA 13GSA 1X9MB 3GH9A 1XWBA 2DJJA 1O8XA 3ERFA 3MDKA 5IQYA 2VL2A 3PINA 3UIWA 1MDKA 2Z9SA 2MYGA 4RUVA 2CVKA 3GX8A 3ZZXA 1USBA 3CTFA 3QD9A 2PGTA 2C3NA 6GSVA 4PURA 1ZYQB 1LBKA 4TXOA 2H1BA 1AW9A 2QKEA 1K0AA 4KNDA 1GTUA 3G7IA 2EIQA 1AQWA 4MPGA 5L71A 1OAZA 2REMA 1YZXA 1TU8A 3UARA 3D4TA 5ECIB 4XS1A 5D93A 1K0BA 3ME8A 3KMNA 3TJBA 2H1DA 1TKDB 3UJ1A 1ERWA 3TKSC 1XVWA 5JCUA 3ZTLA 1GRXA 3IDVA 1VGLA 1E2YA 1DUGA 1EZKA 3DD3A 1PRXA 3O76A 3U6VA 2VCWA 1Z3EA 2C8UA 3LYKA 2PVOC 3EU4A 3D6IA 2DC5A 3I9V2 9GSSA 3WD6A 2AV4A 4MH2A 3WT2A 5G1LA 3HVXA 1U6TA 1PKZA 2B1KA 3DEXA 3A2WA 2B5EA 3BBYA 3LQ7A 4EL1A 5IMAA 1O85A 5CYYA 1SENA 1PL1A 4V2NA 3IXRA 2P5QA 2H8LA 2VL2C 5CRHA 3Q19A 2WGRA 4ULXA 3KGKA 4KX4A 2C80A 1X5CA 2PN8A 3UMAA 1OKTA 1SK2A 5ECMB 3DMLA 1TOFA 3IC4A 3QCPA 4KCAA 1X9SB 4ZB8A 3F0IA 2OE1A 4YQUA 2LUSA 4AJ6A 4J56E 4PXOA 5GSSA 4QQ7A 3GTUB 4I2TA 1VF4A 1XFLA 3APOA 3M0FA 5ECPB 1F2EA 2V1MA 4POLA 6GSXA 5ELAA 5D8IA 2PPTA 5ID2A 2YWOA 3C1SA 4JRRA 3D22A 3TJJA 3ERWA 2DMMA 2LJRA 3C7MA 4BWSA 1JLWA 5A4VA 5ECRB 3LWAA 5F8BA 3DVXA 4KCEA 3DVWA 18GSA 2P5RA 2LV3A 4K7NA 2F51A 2EIRA 2F8AA 1AIUA 2WZ9A 4JU5A 5IMVA 1S3AA 5DALA 4IELA 3GMFA 2GQMA 1SYRA 4TR3A 4TR0A 1GULA 3IOSA 4WR5A 3VURA 2FHEA 3GKMA 4NWYA 1K3LA 2VAFA 3RBTA 4KE3A 4V2MA 2WULA 3EYTA 5DQYA 4WXTA 1Z7PA 4YQMA 1PMTA 1O73A 4DSSB 5GZZB 5HR1A 2VCTA 3H93A 4QL9A 2HZFA 4I97A 1PSQA 2FA4A 2F9SA 1VRSD 1DE2A 4MJCA 4XS6A 4I2UA 2WCIA 2RM6A 2LTKA 1HYUA 1GNEA 5D96A 1U3IA 4GCIA 2JU5A 3JCML 3L9VA 2GGTA 3ZLPA 3WGEA 1A0FA 4MZWA 1K0DA 2D2ZA 4KGIA 4RQXA 2N5BA 1VF3A 3TJGA 22GSA 4TR4A 3BCIA 1ZOFA 5A5KA 1EOHA 1MD4A 2L6CA 5AN1A 2XC2A 1YEPA 1AC1A 2IIYA 4NMUA 2IMDA 1J08A 4IQAA 4GSNA 5FHIA 2M46A 3ZL5A 1ERVA 1TTZA 1SKSB 5J3RA 6GSTA 2BMXA 19GSA 2LNTA 2L4CA 4MLYA 1XOBA 4I5QA 4F03A 2A2RA 1Z9HA 2R6KA 4WBRD 1JZWA 1MDJA 1GH2A 4XRDA 4OD7A 5E59A 4ZILA 3NZNA 4V1Ap 2RIIA 1FAAA 3O6TA 2H30A 1GNWA 2VLUA 1OE8A 5DDLA 1GSYA 3KTLA 3VFIA 1BYEA 2OA7A 2H1AA 4OMVA 1HQOA 5AIXA 1LU4A 1WWJA 2L57A 2LRTA 1XCCA 1TRVA 4BPYA 1OC9B 3LJRA 4GRFA 2LRNA 4CDOA 1QFNA 1Z5YE 3PGTA 4MCUA 1K0NA 3FR6A 3G9BA 4G10A 3BOAA 2IMIA 1TRUA 3EU3A 4TKYA 3F8UA 2NTOA 1WPIA 4OCFA 2JL4A 2H6ZA 2DJKA 2KOKA 5ECQB 2XPEA 4AJ7A 3MNGA 4EVMA 2L4QA 5B6NA 1SJZA 3TGZA 3KD0A 2LJAA 2OJLA 2LQQA 2ZCTA 3FHKA 4MF6A 2V32A 3H79A 2JZSA 3HXSA 1MDIA 4IGJA 2CX3A 2HSYA 5CNWA 2HFDA 3CSHA 5KN2A 3ZMKA 2L6DA 2H19A 1N8JA 4E8HA 2IFQA 3VWXA 1EV4A 4ILFA 4X0XA 4XIHA 1Q98A 4N10A 1GSSA 1MEKA 1XWGA 2C0DA 5B6MA 3TOTA 4HQZA 2QSIA 1UC7A 4Q5NA 4IP1A 2ZUPA 4WKWA 4P3YB 1Y25A 5B8BA 2FWFA 1O7UA 4TN8A 2HRFA 1GSEA 4PUFC 2BTOT 4MJEA 4CHSA 2OE0A 4FO5A 1GTAA 2CAIA 4X43A 4D73A 4DSQA 4WF5A 5EL8A 2OE3A 14GSA 4FIWA 3QAVA 1EV9A 3FYGA 2PU9C 4Q5FA 1SU9A 1EGOA 1X5EA 2C3QA 3ZMLA 4O5RA 4POMA 1KTEA 4EDYA 3DRNA 4IVFA 1T00A 1M2DA 3R2QA 5LNKe 3TB2A 1GTBA 2XBQA 3A2VA 1QK8A 1R7HA 3UAPA 3LFLA 2H6YA 1A0RP 5ENUA 1FO5A 3QDNA 2PWJA 4BVYA 1M9BA 2AAWA 1TK0B 1K3YA 1TI1A 5HFGA 5DAKB 1Z6MA 1XOAA 5CAXA 4YQVA 5GAPD 2FWGA 1YF1A 2J9HA 3ZREA 5D9XA 4ZIJA 3N5OA 2EIOA 2JSZA 1V57A 3IHQA 2YJHA 2FNOA 3L78A 1YEXA 4N11A 3LGCA 3ZFLA 4RI6A 5F0GA 16GSA 2CQ9A 4KB3A 3KXOA 2JZRA 1M7TA 4V2LA 4EDZA 4EO3A 2M72A 3I6AA 3Q18A 4MK3A 1BJXA 3VK9A 4XS4A 1U88A 1ACVA 1TK8B 3OR5A 1IYIA 4TOPA 2P0GA 1SK1A 2GVPA 2XBIA 2ES7A 3HJOA 4JR6A 4YAVA 4I6XA 4KH7A 3K8NA 4PNGA 4L0WA 1ERTA 3EVIA 2CT6A 1T4YA 5J4UA 3BD2A 4DVCA 5LCZA 4K0NA 3BCKA 4GQFA 1W4VA 2IN3A 5COHA 2GSSA 4NXIA 3PH9A 3CRTA 3TCOA 4EXJA 1W89A 4XTSA 4LMWA 3W6GA 3GSSA 1K0MA 2LRCA 5CRWA 2R2JA 5H5QA 3H8QA 1I5GA 3C8EA 2TRCP 4BL7A 3HVSA 1G6WA 4GTUA 2BJXA 3DYRA 4MABA 17GSA 5HR2A 5ECNB 1ON4A 1XXUA 1DSBA 4CW9A 2E2MA 1GP1A 4OFMA 4RI7A 5AIVA 2ZNMA 3A2XA 2O85A 3DXBA 1SL0B 3GKKA 1EOGA 1F3AA 2IL3A 3QR6A 3CYNA 2LKUA 1F9MA 2K6VA 1TI3A 3A5WA 2H0HA 5J9CA 5KN3A 1ZZYA 4HQSA 3F6DA 3KP8A 5CREA 2DBCA 1A2LA 2AHEA 1UVZA 1BG5A 5KN0A 2HZEA 2F8FA 5H5RA 2PERA 2A4VA 4ZBBA 1C72A 1OYJA 4ZL9A 3IA1A 2DJ2A 1TP9A 3F4SA 3F4RA 1URMA 2VCVA 2V6KA 2VL9A 3KH9A 1BAYA 4WBJA 4NV2A 4TVEA 3TKQA 1T8EB 2HE3A 1O6JA 2B7KA 4DSRA 3UBKA 3G7YA 4JE1A 4ZB6A 3P90A 1HD2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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