2YPMA

Crystal structure of ancestral thioredoxin relative to last animal and fungi common ancestor (lafca) from the precambrian period
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVIQVTNKDEFESILSEADKLVVVDFTATWCGPCKMIAPKFEELSEEYPDNVVFLKVDVDEVEDVAAEYGISAMPTFQFFKNGKKVDELTGANQEKLKAMIKKHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Synthetic construct
publication title Conservation of Protein Structure Over Four Billion Years
pubmed doi rcsb
molecule keywords LAFCA THIOREDOXIN
total genus 32
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2012-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ypmA00
4ULXA 2R37A 1HNBA 3VWWA 1JZOA 5IMZA 1WP0A 2O85A 2YZUA 4BPYA 2FWEA 2B5EA 3LEFA 1Z6NA 2KOKA 2MMAA 3F4SA 1XW9A 1XVQA 2L5OA 2F8AA 2KUCA 3IV4A 2LRCA 4JE1A 4F2IA 4H86A 3A2XA 2VLTA 13GSA 5COHA 3ERGA 3GKNA 2PWJA 4N0VA 3FY7A 1ON4A 2JSYA 3GUSA 2FWGA 4ZBDA 3QFAC 4ZBBA 1R4WA 4Q5FA 3FR3A 2OJLA 3IAS2 3IDVA 2HZFA 5JCWA 2I81A 4KA0A 4NV5A 4TVEA 1O85A 2L57A 1O73A 1U87A 1YZXA 3L4NA 3MDKA 3PH9A 4RUVA 4TXVA 4K7OA 3N9JA 1GSUA 2H1BA 5IO2A 5J5NA 2VCQA 1TI1A 1Y25A 1E6BA 2IFQB 4E8HA 2RM5A 2EIQA 4KSOA 5HFKA 2IMDA 2YN1A 4HEA2 3KP9A 5IO0A 3CTFA 1WOUA 3RBTA 5JWQB 1SENA 3IR4A 2O87A 3G7JA 3QCPA 3WGEA 3MWHA 4F82A 1PQNA 3H93A 4PUAA 5IM9A 2K18A 2LTKA 5KN3A 2NPBA 3IBHA 2C0EA 3GKKA 4L5OA 1KTEA 5HFIA 5CRWA 4CW9A 1EP8A 3CRUA 2VL3A 4GSTA 2IMFA 1OC9B 1IYHA 4HUAA 2I1UA 3L9VA 2C0FA 4EDYA 3CXGA 1QGVA 1YKAA 4KDUA 1GTUA 1V98A 1K3OA 3D6IA 1RQMA 5G31A 3TKSC 4EKZA 1Z6MA 1U6TA 3GYKA 4AGSA 2FWFA 1XOAA 1M2DA 5ECOB 1EWXA 1DBYA 2H1GA 3SBCA 2ES7A 2H19A 3Q19A 4GCIA 4K7NA 4IHUA 4G10A 1X9MB 3GX8A 3KH9A 4BL7A 3KZQA 4MJCA 1VF1A 2I9HA 4WETA 5DCHA 4KDXA 1PX6A 4AF2A 1TKDB 3ISOA 1GNEA 3K8NA 3EMPA 2HZEB 1ERWA 1MD3A 4MCUA 1GULA 5CRGA 1UC7A 4AJ6A 5KN0A 3F63A 2P31A 2KHPA 3NOFA 1QK8A 4F0CA 1X9SB 4AJ8A 3GTUB 2L59A 22GSA 2XBIA 5GSSA 2LUSA 2LNSA 3I9V2 1V57A 3I69A 1AQWA 9GSSA 1HYUA 2A2SA 3ZMLA 4TR3A 5HR3A 3UVHA 3FYGA 1K0AA 2X8HA 2VCTA 1EEMA 2H6YA 3GSTA 1TI3A 4IGJA 2VM1A 3JCML 3TKRA 3TJBA 2H0HA 4DSRA 3VPQA 2A4VA 1SK2A 3BD2A 3HJPA 3ZTLA 1FW1A 1VGLA 3L9UA 3V1WA 2GZPA 1ZGNA 1UA5A 5ELGA 4HU7A 1X5DA 4ECBA 1H4OA 1A23A 3GSSA 6GSUA 4YQVA 1TRWA 3RPPA 4IP6A 2CZ2A 4X43A 1FO5A 3J7Yb 2DIYA 5KN2A 5D93A 1WPIA 5LNKe 4KB3A 2FGXA 1PRXA 5CAXA 3WGDA 5C04A 4GQFA 5F8BA 4OCFA 5ABRA 2V2GA 5GSTA 5HQPA 2XC2A 1AUCA 3F6FA 2JACA 4YAPA 2PPTA 3M8NA 2DJJA 2NDOA 3IRAA 4KW6A 2B5YA 5IPHA 2YANA 3H8QA 3IA1A 2E2GA 3RHBA 2O89A 4ISDA 4NMUA 2OE3A 3DEXA 4LA1A 4NV2A 5IOWA 3DVWA 3ZIJA 4MF5A 5AN1A 2F3MA 2IPAA 2YPMA 1AAZA 1DSBA 1G0TA 3D4TA 2H1AA 3LJRA 3GH9A 3F8UA 4WF4A 4HI7A 3EC3A 4JZQA 5ELAA 1U3IA 1XPVA 2MMNA 1YEXA 3US3A 3I6AA 3ZZXA 4PNFA 5G30A 2F8FA 14GSA 1B4QA 4EUYA 4WR5A 3HXSA 2B5XA 2PVQA 1XCCA 4BWQA 4WBRD 3ZLPA 5DJMA 4MLYA 2RLIA 4ML1A 4NHWA 5A5KA 3QD9A 2ON5A 2YP6A 2VOCA 3E3EA 2B3SA 4MPFA 3P8WA 2TRCP 2DJ1A 5IMVA 4JBBA 1N8JA 5E4WA 2FNOA 4ECIA 2E7PA 3M3MA 1T8EB 2X99A 5EPFA 4OO5A 5CO3A 2AAWA 1EEJA 4I97A 3C71A 4WR4A 1SKRB 1EZKA 1WE0A 5C00A 1GWCA 3ZYWA 2K9FA 3HJMA 2VL2A 1XWKA 4OD7A 2LJRA 1ABAA 4OO4A 5G5FA 4N10A 3GHAA 3A2VA 3GRXA 2G2QA 1GTAA 2VL2C 3CTGA 2VD1A 4L5LA 2M72A 5LD0A 2R4VA 2HE3A 2YWIA 3PINA 1X0RA 4DSQA 4F9ZA 4XCSA 1V40A 5DDLA 5DQYA 3EVIA 2GLRA 1RK4A 1XWAA 4WF5A 4MZCA 2HNLA 2O7KA 1FVJA 2OBIA 2P5RA 3ZREA 1NW2A 5F06A 1SKWB 7GSSA 3N5OA 3P90A 5F0GA 2G0FA 1SU9A 5CP1A 1O7UA 1Z9HA 4CHSA 4ID0A 4F0BA 4TR4A 3GL5A 5IIZA 2KP1A 1Q4JA 3APQA 2V6KA 4FYBA 1TJDA 3NIVA 2WULA 4DEJA 2OBKA 1ZYQB 2PN8A 5DBQA 4PX1A 2YV9A 20GSA 3UVTA 3FK8A 1E2YA 5G2ZA 3F4RA 2HT9A 6GSSA 5B8AA 1GTIA 4MDCA 4L8EA 1GSYA 4K9ZA 3HDCA 3F6DA 1U3AA 5IMAA 3VWVA 5ECSA 2GSRA 2H30A 2YJHA 2B7JA 2R2JA 5D9XA 4MPGA 2MBSA 3FZ9A 4MJEA 3EURA 1XXUA 3HYPA 2ALBA 1PX7A 4XHMA 4LMWA 2C3TA 2YOIA 4G9HA 4K8MA 3HA9A 4PQIA 2GT5A 4PQ1A 3IAM2 2X64A 4HZ4A 4NPBA 4I8BA 1WWJA 5A4UA 4OWYA 1A0RP 3D0ZA 4ZB6A 2L4QA 3QAVA 2YWOA 3UEMA 4GWRA 1R26A 5IMCA 1OE7A 3ZMKA 4MJAA 2C80A 2QKEA 2VO4A 1G7EA 4MZWA 1CQGA 3C1RA 2L6DA 4AJ7A 1V2AA 3UIWA 3FKFA 1TXXA 2YZHA 4QQ7A 2HRFA 4V2LA 3IC4A 1DE2A 2DJ3A 2LQOA 3LFLA 3F3QA 2QGVA 3DGQA 1GSSA 1PA3A 2YNXA 3TDGA 1YJ6A 5DALB 1U88A 3IPZA 2E0QA 1HQOA 4MK3A 4OMVA 3TJFA 1ERVA 2KP2A 2VD0A 1GSFA 5ECIB 2Z9SA 4OFNA 1R5AA 2GS3A 3J7Yk 3EE2A 4IQAA 1JZWA 3TB2A 3G9BA 2AYTA 1O81A 5J41A 3QR6A 4EDZA 4BVYA 2B1LA 2H70A 3HVXA 3QPMA 2RM6A 3TJGA 1JLVA 1GRXA 4RI6A 3TKSA 3ZVJD 4TW5A 3GTUA 2ZCTA 2C8UA 4FIWA 4POLA 1R7HA 3LQ7A 4MABA 5HR1A 5B6MA 3GMFA 4FH8A 1ZCPA 2MYGA 5AIVA 3IK9A 1A0FA 4PXOA 1XFLA 1EP7A 1TK0B 1UVZA 4ACSA 3MAKA 3W8SA 1B48A 5FHIA 4HU9A 3UMAA 3KXOA 1EV4A 4V2MA 3LSZA 2PUKC 2GVPA 3VK9A 2PGTA 1GUKA 2H0IA 2PVOC 1S3AA 1VF2A 4YQMA 1OC8A 4RQXA 3HVSA 4DSSB 1KNGA 4GRFA 3TJJA 3E0UA 2CVDA 1MDIA 1TU8A 4J2FA 2WRTA 4ECCA 1F37A 2IL3A 1GLQA 4POKA 3QOUA 18GSA 3F4TA 4OCEA 2LEGA 2DMLA 3BCKA 3U6VA 1Z3EA 2H76A 1YEPA 2GQLA 4XRAA 4L0WA 1MDKA 1Z5YE 1TU7A 1NHOA 1HNCA 5D9VA 2V1MA 5IOXA 4Q5RA 4YAVA 2H72A 3RHCA 3TOTA 2OA7A 1TOFA 1GL8A 5GAND 3A3TA 3L78A 1YKCA 2HSHA 3ZRDA 4LLRA 4N11A 4MJBA 3HZ4A 5DCGA 3IHQA 3H79A 2J23A 5G1LA 1YDKA 2B1KA 2C0DA 4KNDA 1ERTA 2B7KA 3MSZA 5ECHB 2RIIA 4MH2A 1RW1A 4JR6A 1SYRA 4OFTA 2DLXA 3VI5A 3HHVA 1ERUA 1K0NA 3CMIA 4PGTA 3FRCA 4WKWA 2H0GA 5H5QA 1OAZA 3H1NA 4PQHA 4PURA 2PU9C 3GFKA 3A2WA 2YJ7A 3ERWA 4HDEA 1GSQA 5EVOA 3QMXA 1I5GA 2WS2A 3CSIA 2C0GA 3TRPA 2AHEA 4IELA 1TDIA 4HQSA 2CX4A 3APOA 1SL2B 1G6WA 3G7YA 2C3QA 1PD21 2R5GA 3H4KA 6GSWA 2RUFA 4K0GA 4ZL9A 2D2ZA 5D9TA 5B7CA 2OADA 5ID2A 5JCGA 2A2RA 1A2JA 1SJIA 3W6GA 2IMIA 3GIXA 3FZ4A 3BOAA 2VCZA 1SKSB 4IW9A 1K0DA 3UARA 4TXOA 2VCVA 1OKDA 5DAKB 1THXA 2LJKA 1S3CA 2H6ZA 2LQQA 1T7PB 19GSA 4IVFA 1FG4A 1LBKA 5IQYA 3ZFLA 1YF0A 3P7XA 2PMTA 2XPEA 2R3XA 3ZFBA 5B8BA 3VWXA 2MMOA 1GUMA 4O7HA 2C1YA 2HLSA 1K3YA 3DVXA 5LCZA 3R2QA 3UJ1A 1TK5B 1PGTA 4N0ZA 2RUEA 2MBTA 2VUPA 2CVBA 2WJUA 1X5CA 11GSA 5HFGA 1JHBA 3DD3A 4I5QA 3SWLA 2VL9A 1CQHA 3PGTA 1USBA 1ILOA 3WT2A 5IMFA 3KTLA 2X8CA 1A2MA 6GSXA 2VLVA 5EL8A 4ZB9A 3TOUA 2GTUA 3DKSA 4XS4A 3TKPA 5ECNB 1XVWA 3GURA 3APSA 1SK0A 1X5EA 1JZDA 17GSA 1THOA 1FB6A 1AXDA 3DMLA 3EINA 4HZ2A 2PERA 3W8JA 5H5RA 1KBNA 1SL1B 1GLPA 2DC5A 4MZBA 5G5EA 1TK8B 3KM6A 4MP4A 2GSQA 5DQSA 2AV4A 3A5WA 4K6XA 5KEJA 2CVKA 4TR1A 5FT3A 1J08A 1C72A 3Q6OA 1GSEA 4NAXA 2N5BA 3CYNA 4EL1A 3KEBA 1T1VA 2H6XA 1BYEA 4EXJA 5ECRB 3WYWA 2FLSA 4KCEA 1WJKA 1HD2A 3M0FA 3BCIA 3HY2A 4TKYA 5CYYA 4KDYA 2N5AA 5AIXA 4BVXA 4HJMA 3QAWA 1QUWA 2IN3A 2DBCA 5FWGA 1TW9A 1A8LA 4K7IA 5AGYA 1XZOA 1O8XA 2OACA 4XIHA 4K2DA 2BJXA 1SK1A 1O8WA 4V1Ag 3EMXA 1JLWA 2JL4A 2NBSA 4OFMA 3GKMA 1B4PA 4WXTA 1O6JA 2JZRA 4KH7A 5D9WA 4TN8A 5F05A 3LORA 5DVBA 4BWSA 3KMOA 3G7IA 5J9CA 3LGCA 3M9JA 2YCDA 4QL9A 1QXHA 4NWYA 3P2AA 3EU4A 2DSAA 1SL0B 5L71A 4TR0A 3D4MA 2AUVA 4JEDA 1M7TA 3DXBA 1XBSA 4KSMA 2TIRA 1F9MA 2H75A 3D5JA 2LJAA 3UAPA 4TOPA 3ERFA 2TRXA 5CRHA 1AQVA 4ZL7A 2H74A 5D96A 2C3NA 5KN1A 2IFQA 1GP1A 4NXIA 1IYIA 1MEKA 3D21A 3U5RE 5GZZB 2I3YA 5HR0A 1LU4A 5DALA 3VI7A 4K1FA 4V1Ap 4XRDA 4QL7A 1ZZYA 1TP9A 4ZL8A 1BEDA 1B9XC 3VFIA 2HFDA 1WMJA 3MNGA 1GH2A 3GV1A 2LV3A 1T00A 1MTCA 5DJLA 2FUG2 4D73B 1I9DA 3TJKA 4EE0A 4KAEA 1PKWA 5JWRB 1NHYA 4ZIJA 2XPDA 2WZ9A 1JZRA 4IN0A 4IJIA 5ECMB 4K0NA 1OC9A 6GSYA 2EIOA 4GLTA 1FB0A 4X0XA 3UBLA 1EOGA 2MMZA 4GTUA 5HR2A 2DJ2A 4XS1A 1SYXA 1XOBA 2NVLA 2AB6A 1A24A 1NSWA 5F07A 3GN3A 2HYXA 2IIYA 2H8LA 1UN2A 2DMMA 3F9UA 2H66A 1BG5A 2K8SA 1FOVA 1F3BA 2H1DA 2YWNA 4DSSA 2FY6A 2M46A 4IBPA 2WGRA 3KCMA 5CNWA 2H01A 3KMNA 5JWOB 2N5FA 4ILFA 3I43A 4HOJA 4I2TA 2HZEA 5AISA 3IOSA 1ST9A 3KH7A 1Y6EA 1AC1A 2O8VB 6GSTA 1B9YC 5J9BA 2H71A 3Q18A 5IMDA 3TRQA 5D8IA 1GTBA 4GQCA 5CRDA 1K0CA 2L5LA 3CBUA 3O76A 4LL4B 1BX9A 16GSA 1AW9A 1G7OA 4ML6A 4JU5A 1TRUA 1R5PA 3GL3A 2YWMA 1ML6A 3CSJA 3TRXA 5ECPB 1PKZA 4ZB8A 1Q98A 3BBYA 1G6YA 4EF0A 5ECLB 3FHKA 1XW5A 3DRNA 4G19A 4WEYA 2K8VA 3C8EA 4POMA 4MF7A 3LYPA 4Q5NA 3WGXA 4L0UA 4YQUA 1M9AA 1A2LA 2LKUA 1TRSA 3ME8A 1FVKA 4J56E 1AIUA 2GZZA 2WDUA 3LG6A 1FAAA 4N30A 3KJYA 1VRSD 4RQRA 4ECJA 3DYRA 1WRYA 2NTOA 2V6OA 2H73A 4E8EA 1BQ7A 4JR4A 3KD0A 3GX0A 1K0OA 1ACVA 4P3YB 3KTBA 4FYUA 2F9SA 1K0BA 3GKXA 4HQZA 2FA4A 2REMA 4J57E 4ZXGA 4WBJA 4KUNA 2LRNA 4KGIA 2BTOT 1J0FA 4KE3A 4FYCA 4IJ3A 3F0IA 1YY7A 3VLNA 4EC0A 1GUHA 3DWVA 2JZTA 2EC4A 4IS0A 3WT1A 2R6KA 4GXZA 1F3AA 5ECQB 2CQ9A 5D73A 1NM3A 3S9FA 2GQKA 1PN9A 2VLUA 3M1GA 12GSA 2CT6A 1XW6A 2V41A 2WFCA 1A8YA 1XWCA 1VF3A 3GA4A 3HZ8A 1TTZA 5DAKA 3NZNA 3TUEA 1QMVA 4I6XA 2JADA 2VCWA 1MDJA 3C7MA 3LXZA 4KCAA 1SJZA 3DIEA 1B8XA 1F2EA 2CAQA 1GSDA 5H5SA 2IMKA 1K0MA 1PL1A 5E59A 5J4UA 1T4ZA 2KLXA 3QFBC 1VF4A 3BJ5A 1OVNA 2IWTA 4V2NA 3KP8A 5EY6A 4MMMA 5GAPD 4O5RA 1LJRA 3GH6A 1F6MC 1EGOA 2PBJA 4DVCA 4NHZA 1OKTA 2EIRA 3FR6A 4O32A 4EO3A 4LMVA 3D22A 3C1SA 6GSVA 1WIKA 1HNAA 1KEBA 2GQMA 2WCIA 3TGZA 2HI7A 1S3DA 4PUFC 2K6VA 3EU3A 1M9BA 2DJKA 4KX4A 5IPGA 3IK7A 5ECKB 4TRXA 2C4JA 3ZIVA 2VM2A 3VPTA 4GSNA 1YQ1A 5G1KA 3WD6A 4G2EA 3UBKA 1GNWA 1MD4A 1M2AA 4I2UA 1ZMAA 3VURA 3L0HA 3HCZA 1ZL9A 2ZUPA 4RI7A 1H75A 2AJQB 4IQ1A 3RDWA 1T3BA 1JFUA 2L4CA 4YH2A 1M2BA 3UL3A 4ZBAA 1PMTA 4XS6A 4O92A 2LNTA 2HRNA 3ZVJA 1M99A 1T4YA 3UOMA 5A4VA 1K3LA 1M0UA 2L6CA 3ZITA 4Z7XA 4BA7A 4POBA 3HKRA 5A4WA 8GSSA 1YF1A 2CA8A 3L9SA 3LYKA 3Q74A 1X9WB 2XBQA 3KIJA 5JCUA 4GF0A 1PSQA 2JU5A 3IXRA 2IMEA 2V32A 2VIMA 3M9KA 3AY8A 2DJ0A 1EOHA 1DUGA 2F51A 2LS5A 2GDRA 4Q5QA 2GZYA 2OE0A 1J9BA 4X1UA 1OC3A 1EV9A 1URMA 5J3RA 4MH3A 2J9HA 3ED3A 4EVMA 2P0GA 3CRTA 3QAGA 5ENUA 5CREA 3EWLA 5ID2B 2BMXA 3O6TA 2XHFA 4LL1B 2ON7A 2GSTA 3PR8A 2GGTA 2OE1A 3HVVA 2M80A 2QSIA 2DIZA 2OKAA 4TXOB 1W89A 1XIYA 2YV7A 1XWBA 2QC7A 3IE3A 1BAYA 1Z7RA 3RAZA 3TKSE 3HJOA 3LWAA 4XTSA 3TCOA 2LRTA 2JZSA 1SD8A 1XWGA 4IP1A 2VAFA 2GSSA 2HXKA 3O3TA 2FA8A 3CSHA 4JRRA 2X8GA 2FHEA 1PL2A 3FZ5A 4ZILA 5B6NA 1AQXA 2GT6A 4D73A 1Z7PA 1ZOFA 2WB9A 3LXTA 2JSZA 3QDNA 1BJXA 1N2AA 2CAIA 3C73A 1OYJA 1TRVA 2MZCA 1QQ2A 4HJ2A 3F3RA 3TKQA 2ZNMA 2CZ3A 4XS4B 2FD3A 1QFNA 1V58A 4FO5A 3RPNA 1SJ6A 3E9JB 3FR9A 3FZAA 1DE1A 2CX3A 3KGKA 1SD9A 3ME7A 3VWUA 4GSSA 2FWHA 10GSA 3GNJA 1OE8A 2B6MA 4IKHA 2CV4A 3OR5A 5INYA 2LSTA 3FW2A 4TR1B 1ZYEA 4MF6A 2VCXA 2IJYA 1FHEA 2P5QA 4PNGA 1V9WA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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