5CREA

Human skeletal calsequestrin, d210g mutant low-calcium complex
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
347
structure length
347
Chain Sequence
b'GLDFPEYDGVDRVINVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFEMEELILELAAQVLEDKGVGFGLVDSEKDAAVAKKLGLTEVDSMYVFKGDEVIEYDGEFSADTIVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDEIKLIGYFKSKDSEHYKAFEDAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPGKPNSEEEIVNFVEEHRRSTLRKLKPESMYETWEDDMDGIHIVAFAEEADPDGFEFLETLKAVAQDNTENPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFDIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEMDDEEDLPSAEELEDWLEDVLEG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Calsequestrin-1
publication title Characterization of Two Human Skeletal Calsequestrin Mutants Implicated in Malignant Hyperthermia and Vacuolar Aggregate Myopathy.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Calcium binding protein
total genus 80
structure length 347
sequence length 347
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5creA03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5creA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5creA02
2M46A 5ECKB 1H4OA 3GNJA 3PR8A 1DE2A 4WEYA 3UMAA 3VURA 5A4UA 1XW6A 1O8XA 3FR6A 5KN1A 1XZOA 2HNLA 2YWMA 2LTKA 3GTUB 2DBCA 4PNGA 4JU5A 1PMTA 1J08A 1QGVA 2H6YA 2PWJA 4MF7A 2XBIA 2RM5A 1AQWA 2OE0A 2IJYA 1FAAA 3HVVA 4QL7A 3HZ8A 2H72A 3DVXA 2IN3A 2VL2A 5JWQB 2DJ3A 2PVOC 3RHCA 5D9XA 9GSSA 1XPVA 3CRUA 2HT9A 3ZMKA 2YZUA 2G2QA 5CREA 4PURA 4KGIA 3D22A 1QUWA 2VAFA 3BBYA 1A23A 4YH2A 4LLRA 1Y25A 1EGOA 4BWQA 4WKWA 3ZL5A 5IMAA 2CAIA 1HNCA 2PGTA 4V2NA 1MD3A 4DSSB 1GSQA 2H6XA 3FW2A 4XRDA 5DAKB 3JCML 4NWYA 1TU8A 1GSFA 5JCUA 2AYTA 2HYXA 4PNFA 1T4ZA 1PRXA 3IOSA 2DIZA 2FA8A 6GSYA 5ABRA 1JHBA 1B4QA 5D96A 4ID0A 1SD8A 4JRRA 4KCEA 2E7PA 4L5OA 4E8EA 3KXOA 3IA1A 1TW9A 2H0GA 2R4VA 3FHKA 4YQMA 4I6XA 3MAKA 4AF2A 2V6KA 3PINA 3HVSA 3LJRA 5B6NA 4KNDA 1U3IA 3F6FA 2B3SA 2H76A 4KDXA 3UBKA 2VL2C 2VIMA 2ALBA 2H0IA 2YWIA 2OACA 1U6TA 5GAND 1B9XC 2F51A 4PQIA 4F03A 4MH2A 2WRTA 3ERFA 4TVEA 3N5OA 5F07A 2MZCA 3OR5A 3IR4A 4QL9A 5IMVA 5JCGA 1GULA 1GLQA 1T4YA 3TKSC 1ILOA 1XBSA 1G7OA 2GZPA 4ZBDA 5J41A 2KHPA 3A2XA 2IPAA 1G6YA 2NTOA 4XTSA 3CSIA 1XWCA 1GTAA 2HZFA 1UA5A 1OE7A 2RUEA 4IQAA 1Z7RA 4Z7XA 4X1UA 3E9JB 2EIQA 1VF4A 2TRXA 2IMKA 1H75A 1IYIA 4HS1A 4V2LA 2PVQA 4MPGA 1EOHA 3C1RA 4N0VA 1O7UA 2JZTA 4EKZA 3GMFA 3ZMLA 3KP9A 22GSA 1JZWA 5EY6A 5ENUA 3GUSA 3LORA 2YOIA 2QGVA 1KTEA 2LQOA 1M0UA 3D4TA 1GL8A 1BYEA 2CV4A 1F9MA 1X5DA 2EIRA 3DRNA 4X0XA 4JR4A 3VLNA 5EPFA 2BMXA 5AISA 1EP8A 2F8AA 2K18A 1Q4JA 2PPTA 2H1GA 2WB9A 3VWWA 6GSUA 3N9JA 4F9ZA 3WGXA 2IMIA 4LMWA 1PQNA 1PKZA 4MH3A 3GKKA 3K8NA 2CAQA 3QMXA 5ID2B 1WWJA 6GSTA 2L4CA 2WS2A 1OYJA 5AIVA 1T1VA 5HQPA 1PGTA 1S3CA 3GFKA 4TXOA 3CSHA 1MDKA 4ZL7A 2C0EA 2VCXA 4TRXA 2B7KA 4PUAA 2AUVA 2H6ZA 4NHZA 3ME7A 1JZRA 1OC9B 3ZFBA 3NOFA 5DALA 1AAZA 4TXVA 2O7KA 1SL0B 3EWLA 5D93A 2FHEA 3VI5A 2CX4A 5CRHA 1C72A 5ECPB 2RLIA 3PGTA 4OFTA 3HKRA 3S9FA 3IPZA 3KD0A 2IMEA 5D8IA 5JCWA 1MTCA 2FUG2 3ED3A 2DIYA 4XHMA 5B6MA 4KDUA 1GUHA 2I9HA 2VCQA 4ZL9A 2VM1A 2WFCA 3IAM2 1GUMA 1U87A 2LNTA 2NPBA 3IHQA 3KMOA 4V1Ap 1TRUA 5DQYA 4MDCA 2VUPA 3DGQA 1CQHA 4OCFA 4KUNA 5G2ZA 1UVZA 2HZEA 5ECMB 3HCZA 2L6CA 1XW5A 3TJBA 1K0AA 2X99A 1WIKA 2VCZA 4N0ZA 2YPMA 1GRXA 4YAPA 5B7CA 5DJLA 2JZRA 4DSRA 3O3TA 4PUFC 1YEPA 18GSA 2JACA 3DXBA 4JEDA 5D9TA 2XPDA 4K7NA 3GH6A 3UAPA 1TXXA 4WXTA 5IOXA 4MPFA 5FHIA 2VOCA 1Y6EA 2R37A 2H74A 2V32A 4ZBBA 1OKTA 3TKQA 3US3A 1HQOA 4AJ8A 3UVTA 4L0UA 3M9KA 4J57E 2VCWA 1AW9A 2DLXA 1B4PA 5CRGA 4MZWA 1K0DA 1VGLA 1FVKA 2C4JA 3L9SA 1KEBA 2C0FA 3M9JA 1TK8B 1ZYEA 1GP1A 3HA9A 1J9BA 1KNGA 2HSYA 1NHOA 3ZIJA 4ISDA 3ZLPA 4TR3A 4Q5RA 1TP9A 2NVLA 2L5OA 4ECCA 2NBSA 4OO4A 3EC3A 1EV4A 3DMLA 4HZ4A 1YF0A 2VO4A 1V58A 3GX0A 1PKWA 4EDZA 2FWFA 1GTBA 4MJCA 2DJJA 2OJLA 4V2MA 5B8BA 1PN9A 2DJ2A 2GLRA 2J23A 1R26A 1OKDA 11GSA 5CRDA 4XS6A 5CP1A 3F4RA 1BX9A 2FLSA 4FYCA 4Q5FA 4POBA 2MBTA 4K8MA 1HD2A 2YP6A 3QCPA 5IO2A 4GWRA 4K2DA 3A2VA 4HUAA 2K9FA 3GN3A 2FD3A 1XOAA 2QKEA 3EYTA 2MMZA 3IV4A 3IBHA 2PUKC 2GSSA 2Z9SA 3Q74A 4RQXA 1A24A 4KSMA 3GURA 2VL3A 2XHFA 4N11A 2N5AA 3ZZXA 5GZZB 2AB6A 3GTUA 1SK2A 3UL3A 3LG6A 1X9SB 2V2GA 4G10A 4MMMA 1GSYA 1QXHA 2VLTA 1O73A 4TR0A 2FWHA 4IKHA 1HNAA 3KCMA 1ZL9A 3TRXA 1QQ2A 2O8VB 4E8HA 3H8QA 3L78A 3DKSA 3H1NA 4ZB8A 1GH2A 4P3YB 3GL5A 5ECQB 5LNKe 4GTUA 2VCTA 1LU4A 2MYGA 2VL9A 3ZIVA 5J9BA 4ZB9A 1I5GA 3QOUA 4POMA 2REMA 1FB6A 2FY6A 2YZHA 3W8JA 3KIJA 4YQUA 4D73B 4DSSA 4ML1A 1XWAA 1PA3A 5D73A 4DSQA 3GV1A 1EGRA 1SKRB 5B8AA 5DAKA 4CDOA 2B5EA 16GSA 1RQMA 2OE1A 4QQ7A 4IN0A 2YANA 1Z6MA 4F0BA 4ECIA 5E4WA 1BG5A 2YV7A 4MJAA 4EUYA 1Z3EA 4WBJA 3TOUA 4HU7A 1QMVA 5IPHA 3GKNA 3MWHA 3G7JA 3IK9A 2PERA 4IBPA 1W4VA 1V40A 3TKSA 1O85A 1W89A 3L0HA 3HZ4A 5J5NA 3GX8A 3ZTLA 5A5KA 3IAS2 2H66A 1M2BA 1GUKA 4IP1A 5HR1A 1F6MC 3P8WA 1U3AA 3C1SA 2C0GA 1PX6A 3Q6OA 1R4WA 2HRNA 2MBSA 1PD21 3TRQA 4IHUA 4KX4A 2IWTA 1T00A 2WDUA 3DEXA 5AGYA 2B7JA 4LL4B 4CHSA 2D2ZA 4IS0A 3A2WA 5HR2A 1TRWA 3F4SA 4GSSA 5FWGA 1J0FA 3CBUA 1M2AA 4J2FA 3LEFA 4ACSA 3AY8A 4WR5A 2X64A 4K7IA 3KP8A 2LKUA 3FZ5A 3M8NA 2H0HA 1USBA 1XIYA 4ML6A 2H19A 2RUFA 1CQGA 2OBKA 2LRNA 4NAXA 4NMUA 3ERGA 1A2LA 3HD5A 2O89A 2GDRA 3BJ5A 4AJ6A 3TOTA 2AJQB 2L6DA 2LRCA 2KP2A 3GRXA 4MABA 3WT2A 2F3MA 4EC0A 1ON4A 2OADA 1OE8A 3F0IA 4I97A 3FZ9A 4MLYA 5DQSA 3ZITA 3TJFA 3FYGA 5ECNB 1SL1B 4NHWA 3CMIA 3L9VA 4K7OA 2YWNA 1A2JA 4HZ2A 2XBQA 2LJAA 2V1MA 6GSVA 3DWVA 2MMOA 3QAWA 1GLPA 1O81A 1Z7PA 5F05A 2P0GA 2YV9A 3C71A 4DVCA 1G6WA 2K8SA 3G7IA 1M7TA 2E2GA 1N8JA 1OVNA 2C80A 2R3XA 2C3NA 1SENA 4RUVA 2P5RA 13GSA 4K6XA 2G0FA 3F8UA 1WMJA 3HDCA 1DE1A 5ID2A 4OFNA 2DJKA 3EMPA 1MD4A 3I6AA 2VD1A 2O87A 3LXZA 4WR4A 1IYHA 2H1DA 4HEA2 2P5QA 2GT6A 4GCIA 2FA4A 1WE0A 2WZ9A 2YNXA 4TR1B 3LWAA 4WF5A 1X9WB 1YEXA 1XWGA 1JZOA 2KP1A 3RPPA 3M1GA 1EV9A 3MDKA 4I2TA 1OC9A 1NW2A 1DBYA 2OA7A 2PBJA 1XCCA 3LXTA 4TKYA 4OMVA 4G2EA 1VRSD 3E0UA 1BEDA 2ZNMA 5LD0A 2DMMA 2YJ7A 3QPMA 4ZB6A 2VCVA 2PN8A 7GSSA 5L71A 3FKFA 2N5BA 3DYRA 2FWEA 20GSA 2C3QA 5D9VA 2DC5A 5HFKA 2DMLA 3ZREA 5D9WA 1ZYQB 3CYNA 4OFMA 2JADA 1Q98A 2ON7A 3FR9A 3CXGA 3UBLA 1MDIA 2RM6A 1DUGA 4EO3A 1ERUA 3W8SA 4RQRA 1GSDA 3TJKA 1FVJA 3TJJA 3GSSA 4ZBAA 2H71A 3SWLA 2F9SA 1TTZA 3QFAC 5GSSA 1ML6A 2L59A 3ZRDA 3FZ4A 3UJ1A 3LGCA 2GQMA 4HJ2A 4K9ZA 3HYPA 2A4VA 2EC4A 1FG4A 3EINA 3FY7A 3KH7A 3TRPA 1YKCA 1A0FA 5GSTA 5H5RA 3VFIA 1AUCA 3KEBA 2B5XA 1SKSB 3ME8A 1WPIA 1XWBA 3O6TA 3RHBA 4ECBA 2X8HA 2MMNA 4ZL8A 8GSSA 1TDIA 3APQA 4MJBA 3TKRA 3CSJA 4GXZA 4BA7A 3KZQA 3MNGA 1SYXA 1EEMA 5COHA 1K0BA 1K3YA 1LBKA 4IQ1A 2E0QA 5G31A 1OC3A 6GSXA 2LRTA 3HJMA 17GSA 1K3LA 3HJOA 2C8UA 3IK7A 1SU9A 2B1LA 3GSTA 1RK4A 4TN8A 4F0CA 4Q5QA 4EDYA 4V1Ag 3D0ZA 2KUCA 4KSOA 5DDLA 2DJ0A 1SJIA 2E2MA 2C3TA 4POLA 2YCDA 1UC7A 3QDNA 2I3YA 3TKPA 4NPBA 2CX3A 2WGRA 2GZZA 5CAXA 3APSA 4N30A 1JZDA 4OWYA 3U6VA 4L5LA 2I81A 4AJ7A 4BWSA 1TRSA 3EVIA 1ZOFA 3RPNA 2LJKA 2ZCTA 3A5WA 4XIHA 3L4NA 4YAVA 1YJ6A 3LYKA 12GSA 2K6VA 1AQVA 3LYPA 2IFQB 4GF0A 3D21A 3KTBA 3GKMA 5DBQA 1SKWB 3Q18A 4XS4B 3VWUA 3GH9A 1ZGNA 4MZBA 1X9MB 2BJXA 4FIWA 3WD6A 1VF2A 2H30A 1WJKA 5F06A 5GAPD 3V1WA 3TDGA 2H1BA 3UARA 1GNEA 1WOUA 3BCIA 2GQKA 1K0MA 1EZKA 3FK8A 4ZILA 5IO0A 1A8YA 4MJEA 5IM9A 3G9BA 3HVXA 3UIWA 1X5EA 2JSYA 3HY2A 2LEGA 5IIZA 3D5JA 2F8FA 4EF0A 1NHYA 2GSTA 3ZFLA 2JU5A 1JLWA 2C0DA 1ABAA 4IGJA 1G7EA 4L8EA 4D73A 1ZZYA 5EVOA 2FGXA 2X8GA 2LJRA 1XVWA 2XPEA 4JBBA 4GQFA 2J9HA 1DSBA 2AAWA 5EL8A 1FB0A 2LV3A 2GGTA 3FZAA 3UEMA 2I4AA 1XWKA 4WETA 4KE3A 4OD7A 1WP0A 1F3BA 4I5QA 1MDJA 1XW9A 5JWRB 1K3OA 1YZXA 1TJDA 1AXDA 1HYUA 4EL1A 2B6MA 1Z6NA 1VF1A 5G30A 1EOGA 4BVXA 1N2AA 1R7HA 2ZUPA 5ECRB 4F82A 5A4VA 5IOWA 2LNSA 1SL2B 4JZQA 1GSEA 2HI7A 1YF1A 5J4UA 3F3RA 3F3QA 3ERWA 3KMNA 3RDWA 3GA4A 1PSQA 1SD9A 4GRFA 4O92A 4MCUA 1A8LA 1YKAA 1BAYA 1UN2A 3BD2A 1KBNA 2OE3A 4ZIJA 2X8CA 2VLUA 2CZ3A 1V57A 4XRAA 3FR3A 3VWVA 3EU4A 3RAZA 4WBRD 3EU3A 2TRCP 2H8LA 1MEKA 1OAZA 2GTUA 3PH9A 4LL1B 1EEJA 1T7PB 1X5CA 2TIRA 4O32A 1Z9HA 1SJZA 5ECSA 3Q19A 4JR6A 3BCKA 5H5SA 1M99A 3GYKA 3RBTA 5IPGA 2R2JA 2ES7A 2VLVA 2HRFA 2R6KA 2B5YA 5KEJA 1T8EB 5LCZA 4ILFA 4HQZA 4KAEA 4XS1A 1NSWA 5G5EA 5J9CA 1AQXA 2K8VA 2H1AA 1SJ6A 4Q5NA 1R5AA 4PX1A 5E59A 5H5QA 1TI3A 1F3AA 3A3TA 3M0FA 4IW9A 5DCGA 4O5RA 3H93A 3J7Yk 3IXRA 2MMAA 2CZ2A 4TR4A 4O7HA 2GVPA 1GNWA 3ISOA 2OKAA 2EIOA 2RIIA 1ACVA 5AN1A 2V6OA 1FO5A 2DJ1A 2LUSA 1YY7A 2GSQA 3F6DA 1AC1A 4PGTA 3KH9A 2QSIA 4KCAA 1XOBA 1V98A 1ZMAA 1M9AA 1B9YC 5IQYA 4AGSA 4ZXGA 3I9V2 2DSAA 3EURA 4KB3A 2L4QA 4ULXA 2M72A 2QC7A 3L9UA 3P7XA 2L5LA 6GSWA 3SBCA 4TR1A 1GSUA 1XXUA 1NM3A 1TRVA 3WYWA 1LJRA 4JE1A 1EP7A 1ERVA 2HLSA 3C73A 3G7YA 4EXJA 5A4WA 3R2QA 4DEJA 3W6GA 2HE3A 1V2AA 3F9UA 2IL3A 3ZVJD 3QAGA 4POKA 1FHEA 3LFLA 3VWXA 3TB2A 4PQ1A 4GQCA 2BTOT 3ZVJA 3MSZA 1E2YA 2OBIA 1PL2A 2JZSA 4G19A 3KM6A 2GSRA 4EVMA 1S3DA 3VK9A 2V41A 5KN3A 4MZCA 1V9WA 5DJMA 4NXIA 3LQ7A 4G9HA 3H4KA 1BQ7A 3APOA 1TU7A 1ERTA 5ELAA 2NDOA 3VPQA 5FT3A 5IMZA 3TCOA 4N10A 3CTFA 5G1KA 1VF3A 4F2IA 3J7Yb 2LQQA 2P31A 4GSTA 5J3RA 5KN0A 3C7MA 3GIXA 1TK0B 5G5FA 4I8BA 3DD3A 3CRTA 4MP4A 2IMFA 1ST9A 4HJMA 4MA9A 4X43A 4OCEA 1K0NA 2A2RA 4PXOA 3WGEA 4MF6A 3U5RE 4KW6A 5ECOB 3UVHA 4HDEA 1FOVA 4H86A 1QK8A 2GT5A 5G1LA 4IVFA 1SK1A 1G0TA 5DVBA 2FCHA 2I1UA 2FWGA 2H01A 3IC4A 2LSTA 3GL3A 1B48A 4XCSA 3HXSA 4TXOB 4RI6A 5HR0A 4KDYA 1QFNA 3TKSE 1THXA 2XC2A 3IRAA 5CO3A 4IELA 4KH7A 4TW5A 3QR6A 4ECJA 1U88A 3I69A 4MK3A 5JWOB 2HFDA 4PQHA 5IMFA 3TUEA 1M2DA 4BPYA 4LMVA 5DALB 4IJIA 4FYBA 5ECIB 1F2EA 2JL4A 3ZYWA 4EE0A 2H73A 1GWCA 2AHEA 5ECLB 1TKDB 2YJHA 5C00A 3HJPA 1X0RA 1PX7A 5INYA 1OC8A 2CT6A 1PL1A 4GLTA 1SK0A 3EE2A 1E6BA 3E3EA 5IMDA 4K0GA 3TGZA 5KN2A 1O8WA 1BJXA 2WJUA 1GTUA 3IDVA 2JSZA 3QFBC 1RW1A 2CVDA 1YDKA 1TI1A 3C8EA 1YQ1A 5F8BA 3KTLA 3P90A 4NV5A 1JLVA 2CVKA 1XVQA 3M3MA 2HZEB 4IP6A 2GS3A 5ELGA 4GSNA 2IFQA 3BOAA 2H75A 1THOA 1O6JA 2YN1A 3FEUA 4XS4A 2WCIA 1K0CA 4BVYA 2CQ9A 5AIXA 4J56E 2FNOA 1WRYA 2C1YA 3WT1A 1ERWA 2IMDA 3D6IA 2O85A 10GSA 3FRCA 5DCHA 3VPTA 1TK5B 3NIVA 2A2SA 4KA0A 4FYUA 2IIYA 3TJGA 5IMCA 4I2UA 14GSA 3EMXA 1GTIA 2R5GA 2CA8A 3DVWA 1S3AA 2L57A 2KOKA 5CYYA 1XFLA 4HQSA 1M9BA 1JFUA 1GSSA 2HSHA 3DIEA 3D4MA 4IJ3A 4YQVA 4TOPA 1A0RP 1FW1A 1EWXA 4FO5A 4NV2A 1K0OA 3F4TA 1I9DA 4HOJA 3QD9A 3CTGA 3VI7A 4LA1A 3NZNA 2HXKA 1URMA 4OO5A 5CNWA 4HI7A 2LS5A 3GKXA 4RI7A 4K0NA 3GHAA 1B8XA 3P2AA 2CVBA 2PU9C 4BL7A 4K1FA 4FH8A 2B1KA 4CW9A 2KLXA 3QAVA 2YWOA 1HNBA 2GQLA 1A2MA 4HU9A 2WULA 2VM2A 3O76A 19GSA 2M80A 3F63A 2GZYA 2VD0A 1SYRA 2ON5A 4WF4A 1Z5YE 3UOMA 1TOFA 1ZCPA 2H70A 1R5PA 5HFGA 4L0WA 5HFIA 4MF5A 3H79A 1T3BA 2PMTA 5C04A 2AV4A 1AIUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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