3EMPA

Crystal structure of the s-acetanilide modified form of c165s ahpc
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
LINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Cysteine pK(a) Values for the Bacterial Peroxiredoxin AhpC
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Salmonella typhimurium
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
total genus 46
structure length 161
sequence length 161
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2008-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3empA00
1W4VA 3HKRA 4ECBA 5G2ZA 3HZ4A 1GSUA 3ZVJD 3FYGA 2X64A 4EDYA 3LSZA 3CBUA 4WBJA 5GSSA 3W6GA 2OJLA 5ECMB 1XIYA 9GSSA 1AQVA 4XRAA 4IJ3A 1ZCPA 4OWYA 2CVBA 1SK1A 2LUSA 2YV7A 2VCVA 4X43A 4IJIA 2NBSA 5JWRB 1GH2A 1U3AA 4HQSA 4PQ1A 1K0MA 1TXXA 1PA3A 4KDXA 1YDKA 2K18A 1Z9HA 2FHEA 4EC0A 2YV9A 5IMCA 2QSIA 1B9XC 2R6KA 1WPIA 5B6MA 2XPDA 2IPAA 4FYCA 2C8UA 2E2GA 4IVFA 6GSTA 5CAXA 3ZREA 2YJHA 3W8SA 2P5RA 2LJAA 2VAFA 3Q74A 2K9FA 1U87A 1HD2A 4IQ1A 4OCFA 1G7OA 4YH2A 1H4OA 4NXIA 2OBIA 1S3DA 2GT6A 2AJQB 4NV5A 2PWJA 3H4KA 2GZPA 2E0QA 3GRXA 4HI7A 4N10A 2YWMA 5L71A 5JWOB 10GSA 1BYEA 2IMKA 3APSA 1YF0A 1M7TA 2OBKA 4JBBA 4DVCA 1OE7A 3BJ5A 2H72A 3A2VA 4K6XA 3WD6A 1NHYA 3NOFA 5LD0A 2B6MA 5G5FA 1U6TA 3QR6A 3D22A 2VLUA 1VF1A 4DSRA 5AGYA 5FWGA 7GSSA 1T1VA 2ALBA 2GSRA 4JU5A 2FWHA 2LQQA 4O7HA 4NHZA 5JCUA 4K0GA 3ZYWA 3TKSE 2H30A 3H8QA 3TKSC 1A24A 4MLYA 3S9FA 5JCWA 4QL7A 1USBA 2H0GA 3Q6OA 2MYGA 4AJ8A 3P7XA 4BVXA 4O92A 3VI5A 3BD2A 1V2AA 3L9UA 4TXOB 3ED3A 4V1Ag 4IHUA 4ILFA 1JZRA 4EO3A 3QCPA 2RM5A 3FZ9A 5J3RA 2NPBA 3ZMKA 4IW9A 3RAZA 19GSA 4X1UA 1GRXA 5A4WA 4Q5NA 3GX0A 2DJJA 4X0XA 1DBYA 2H6ZA 1PMTA 1SL0B 3LJRA 6GSUA 4DEJA 4CHSA 1M2AA 4I8BA 1YZXA 2HZEB 2DJKA 4GSSA 2B5XA 5ENUA 5IMZA 3ZVJA 2JL4A 2K6VA 2H0HA 3APOA 2HT9A 4TR1A 3KCMA 1IYHA 3ZIJA 2H1AA 5KN1A 3G7JA 3LORA 4MCUA 1JHBA 4WF5A 1GTBA 1MD3A 4PQIA 5B8BA 2YOIA 3GFKA 1SKRB 1GSSA 5DBQA 4FYBA 5A4VA 1UA5A 1LU4A 2HSHA 2CZ2A 2DJ1A 4FYUA 4MA9A 4E8HA 3FZ4A 4K8MA 3GSSA 5KEJA 5D9WA 3KH9A 4AJ6A 4D73A 4GSTA 2PERA 1PQNA 4KX4A 3GTUB 2VCQA 4XTSA 2VL2A 1XWAA 3EC3A 3UAPA 3QPMA 2C3TA 2VCTA 1MEKA 4XS6A 3DXBA 1M9BA 2KP2A 1AAZA 3D0ZA 1K0OA 3F63A 2DC5A 4IP6A 3ZRDA 4XIHA 1GSFA 5CNWA 4YAPA 4ISDA 1SJ6A 4OCEA 3W8JA 2B7KA 3H93A 5DALA 2PN8A 4CW9A 5HR0A 1T4ZA 1SJZA 4AGSA 2X8GA 2VM2A 3TRQA 3QOUA 2WCIA 2DJ0A 4H86A 3CYNA 2JZRA 5HFIA 5AIVA 4HUAA 4MJEA 1XWKA 2J23A 5ECQB 2LSTA 4MH2A 4G9HA 4LL4B 3BBYA 2M72A 3J7Yk 4XS4B 2EC4A 5F0GA 2C3QA 1F3BA 20GSA 2FA4A 4G10A 5ELAA 2H1GA 1WOUA 3CSIA 4I6XA 5CRDA 3KTLA 2RUFA 1PX7A 2FD3A 1AQXA 4EVMA 4DSSA 2GLRA 3EVIA 3R2QA 4RI7A 2HSYA 4HJMA 4JR6A 1YEXA 3LXZA 4TXOA 2VD0A 5F05A 5JWQB 1U88A 3D6IA 1HYUA 1MD4A 2VD1A 4XCSA 3TRXA 2ON5A 1M99A 2GZYA 3LYPA 2LV3A 2JZTA 5A5KA 1OC9B 1F3AA 3VK9A 4KDUA 4EKZA 1X9MB 3CMIA 4O5RA 4GRFA 1DSBA 3ZFLA 4IS0A 3ZITA 3FR9A 1Y25A 3RPNA 3TJFA 1SYRA 2VLTA 4MPFA 1N2AA 1BX9A 1FHEA 2JSZA 3V1WA 1FB0A 1Z7RA 1EGRA 2MMOA 2L6DA 1FW1A 1A23A 4I5QA 4P3YB 2P31A 5DAKB 3TGZA 1V40A 3DEXA 1A2LA 5GSTA 1ZMAA 1X5CA 4MABA 1FVJA 4MJBA 3HD5A 4N0ZA 4ZB8A 5B8AA 4PNFA 5H5SA 2WFCA 3N5OA 1TK8B 1X0RA 1HNBA 4KCEA 2EIQA 5B6NA 1TRSA 3ZTLA 3BCKA 1HQOA 1I5GA 3MSZA 4GSNA 4GQFA 2DIYA 4RQXA 1S3AA 2PPTA 1EV4A 3M9JA 3L9VA 1PKZA 3ERGA 3F3QA 2WZ9A 1N8JA 4J56E 1QQ2A 2AHEA 3QDNA 3LXTA 1FAAA 4PNGA 4OD7A 4HZ2A 3IPZA 4QL9A 5C00A 3EWLA 3HYPA 3QMXA 1T8EB 1O73A 4TR0A 1X5EA 2GQMA 2CT6A 3FK8A 2RM6A 3UBLA 1TP9A 2HRNA 3VPTA 1HNCA 4I2UA 6GSVA 3IRAA 4MZBA 3QAWA 3WT2A 3C7MA 2YWIA 4TR4A 4LA1A 4OFTA 1MDKA 3TJKA 3FW2A 3UOMA 2C0FA 3VI7A 3QFAC 3L9SA 4JE1A 3CRUA 5IMVA 4OO5A 1SD8A 2L5OA 4HOJA 1O8WA 1LJRA 2CZ3A 1SKWB 3HJMA 1U3IA 2GS3A 5CYYA 2NTOA 4FO5A 3RHCA 2LKUA 3Q19A 5IIZA 3F4SA 3ZMLA 2MMAA 3UVHA 3NIVA 3VWXA 5GAPD 4J2FA 4DSQA 1W89A 2V41A 5F06A 1ZYEA 2XBQA 2JADA 3DVWA 1J08A 2IFQA 3L4NA 2V6KA 2GDRA 2LJRA 4KSMA 3VWVA 3CRTA 3UARA 2JZSA 5HR2A 2H1DA 2FGXA 1SK2A 5F8BA 3F9UA 3KMOA 4G2EA 4IBPA 1PGTA 1ZYQB 2IIYA 4L5LA 2O8VB 3LQ7A 1G6YA 2QGVA 3J7Yb 3A2XA 4TR1B 3C71A 1EOHA 2O7KA 4MDCA 4KA0A 3VLNA 2GQLA 1ACVA 1GUKA 2WRTA 1AQWA 5KN2A 2OE1A 2LNSA 5DJMA 2E7PA 3FRCA 3TKRA 3RDWA 4ZIJA 3VWWA 4F03A 4AJ7A 4HU9A 3I69A 1XBSA 5EY6A 3IHQA 1SU9A 1OC3A 1ERTA 2B5EA 4D73B 2QKEA 2F3MA 1XWBA 5J4UA 2LQOA 4RI6A 5DJLA 4LL1B 2MMNA 2N5BA 4K9ZA 2PVQA 1TRWA 3BOAA 5G30A 2M80A 3IAM2 3IC4A 3GURA 4HDEA 2FWEA 5ECRB 5HQPA 2IL3A 3GKKA 3IK7A 4TVEA 3HVXA 1E6BA 1XVQA 4OO4A 5CO3A 3TOTA 3PGTA 5DALB 5D96A 4OFNA 3TJGA 4POKA 4KGIA 4ECJA 3M0FA 2F9SA 4Q5RA 4JR4A 3IV4A 3F8UA 4ZL9A 1LBKA 4E8EA 1GL8A 5IQYA 4PURA 1R5AA 1XOAA 1F9MA 2XPEA 3U6VA 4HQZA 6GSSA 2XHFA 1YJ6A 3FZAA 2PUKC 3M3MA 4ZBDA 3CTFA 1PSQA 1GSQA 4ZILA 1CQGA 4KCAA 2FCHA 4OMVA 5IMFA 2E2MA 2RUEA 2VL3A 3DWVA 4DSSB 2XBIA 6GSXA 5EVOA 3E9JB 3DKSA 1WWJA 2LS5A 4IQAA 4ZL8A 2WJUA 3D4MA 3DRNA 1BG5A 1CQHA 1V9WA 4KB3A 3KH7A 2YN1A 3A3TA 2KLXA 4MPGA 1TRVA 3PH9A 5G31A 2M46A 3EE2A 1XXUA 3D4TA 3EU3A 2L5LA 4NWYA 1ILOA 1XWGA 2GSTA 5ECLB 2PU9C 2ZUPA 3CSJA 1XW9A 2OADA 1G0TA 1TTZA 1GWCA 2WULA 1V98A 4TW5A 1T7PB 3M9KA 1TDIA 2V6OA 4POLA 2MBTA 3EMPA 3KM6A 1O85A 1ZGNA 3IAS2 2AYTA 4Q5QA 3ISOA 2H73A 3GUSA 4ML6A 1G7EA 4J57E 1YKCA 3GH9A 2R37A 5ECIB 3KD0A 2BTOT 2FUG2 2LJKA 1A8YA 1A0RP 1Q4JA 3GX8A 1RK4A 2H66A 2OKAA 4PQHA 1K0NA 4HJ2A 3Q18A 2X8HA 1G6WA 1WP0A 1TI1A 1TW9A 5IM9A 4BPYA 3EURA 2X99A 5J5NA 1B8XA 3SBCA 3CSHA 1EP7A 2GSSA 1HNAA 1OKDA 4BL7A 2VLVA 1THOA 4PGTA 3TDGA 3IOSA 3FR6A 1GSDA 3ME7A 5AIXA 1XWCA 2CVKA 1A8LA 3HJOA 5AN1A 5COHA 1EZKA 1EGOA 2N5FA 3DMLA 4GQCA 5G1LA 5F07A 1XVWA 2QC7A 4FH8A 5KN0A 4EDZA 5DVBA 2DIZA 4N11A 3UL3A 1GNWA 2TRXA 3KP9A 2HZFA 2C4JA 3TB2A 5ECHB 2ZCTA 3WYWA 2YWOA 5E4WA 1ZZYA 3UMAA 3LEFA 3IE3A 4Q5FA 3D21A 4MF7A 4HU7A 4ACSA 4N0VA 3LYKA 2VL2C 4EE0A 2IFQB 3HZ8A 2LTKA 5CREA 1B4QA 4O32A 3HXSA 2IWTA 2BJXA 2AV4A 3HVSA 1WRYA 3GMFA 4IGJA 2L4CA 1AUCA 3LGCA 1XCCA 2K8SA 4ZBAA 1Y6EA 3GNJA 1SL1B 4K0NA 2CAQA 2VIMA 5DDLA 5A4UA 3SWLA 3F0IA 1K0CA 2H19A 2FNOA 2N5AA 17GSA 3APQA 5CP1A 2VOCA 2ZNMA 3UJ1A 4MJCA 3FZ5A 3I43A 3GKXA 5ID2A 1QXHA 11GSA 2PVOC 3QAVA 1PKWA 5CRGA 3TJBA 4PUFC 1PD21 2FLSA 3LG6A 4PUAA 2R3XA 2BMXA 2VM1A 4ID0A 3GN3A 3UEMA 2R4VA 2B1KA 4XHMA 1R5PA 1MTCA 4ECIA 4V1Ap 1DUGA 2DSAA 1DE2A 3PR8A 1PL1A 3F6FA 2TIRA 2V1MA 4K7NA 4IELA 3RHBA 3GH6A 5HFGA 5FHIA 5IPGA 4MF5A 4KDYA 1EV9A 3DIEA 1NHOA 4KUNA 4K2DA 4TOPA 3F4RA 4V2NA 1X5DA 3GSTA 4ZXGA 1T3BA 2AAWA 5ECOB 5D9VA 2F8FA 2C0DA 4WEYA 1NSWA 3DYRA 1GSYA 2GZZA 3AY8A 3H1NA 4KE3A 3GV1A 1Z5YE 2KP1A 2KUCA 3WGDA 2L4QA 1T00A 2LRNA 1XPVA 1NM3A 2LNTA 1AW9A 2JACA 1GUHA 2H6YA 2GT5A 5D8IA 1SL2B 4EUYA 3F6DA 4LMWA 1E2YA 3QAGA 2C1YA 1TOFA 2CV4A 4HZ4A 1BEDA 5J41A 1ZOFA 3E0UA 2YPMA 2YWNA 2OACA 5ECKB 1A0FA 2OA7A 2HNLA 1BJXA 4NHWA 4YQMA 5H5RA 3DGQA 4PXOA 4AF2A 4EF0A 2PBJA 5ABRA 3KMNA 2MZCA 1VF4A 1VF3A 1R7HA 4L8EA 3O76A 1RQMA 3GA4A 3IA1A 4MJAA 4WXTA 3FR3A 1O8XA 1ST9A 5JCGA 3TJJA 5ELGA 4TR3A 1GTIA 2B3SA 3EU4A 2VCXA 3UIWA 5LCZA 3GKNA 2HXKA 4WF4A 4BA7A 1ERWA 4JEDA 4YQUA 3KP8A 3HY2A 2HI7A 1TI3A 1C72A 2H0IA 1QK8A 3FHKA 1WMJA 1SENA 5E59A 3TRPA 5KN3A 4HEA2 1FG4A 5IOXA 5HR1A 5J9CA 3F4TA 4CDOA 4POMA 3HCZA 3IK9A 1FB6A 1GP1A 3TKSA 1QFNA 8GSSA 1F6MC 1PN9A 14GSA 2A2SA 1SJIA 4NAXA 1JZDA 2HFDA 1K0AA 2IMDA 1QUWA 1J9BA 1DE1A 3E3EA 1EEJA 2NDOA 2I9HA 3C1RA 2CA8A 3EINA 4GWRA 5IMAA 1WIKA 3U5RE 4F9ZA 3FEUA 2C0EA 4MP4A 3MNGA 3VURA 1TRUA 5J9BA 1ZL9A 4WKWA 3WGXA 2XC2A 1OE8A 5B7CA 4LLRA 3GL3A 1J0FA 3US3A 4JRRA 5IO2A 3VPQA 1SD9A 2REMA 3C8EA 1A2MA 3ERFA 2EIRA 5ECSA 2H71A 4RQRA 2NVLA 3UBKA 1JLWA 1O7UA 2DJ3A 1UN2A 2PMTA 1EEMA 1K3YA 1PX6A 4MZWA 1R4WA 3TOUA 5DCGA 4KAEA 4EXJA 2O85A 1JFUA 2MBSA 2GSQA 5IPHA 4MF6A 3A5WA 2H76A 3L0HA 1JZWA 6GSYA 4GF0A 3O3TA 1B9YC 2H01A 18GSA 2G2QA 6GSWA 4L0WA 4K1FA 5FT3A 2EIOA 2L59A 3FY7A 1XW6A 2H74A 2G0FA 1Q98A 4KNDA 2VCZA 1XW5A 2B5YA 5HFKA 4TN8A 2YJ7A 2FA8A 2J9HA 3PINA 5EL8A 1Z7PA 1X9WB 1WE0A 4L5OA 1X9SB 4TRXA 4G19A 2OE0A 4GXZA 4Z7XA 2DLXA 3TKPA 2H75A 3F3RA 4BWQA 2H6XA 1YKAA 2A2RA 4IKHA 4NPBA 3CXGA 5IOWA 1XFLA 3IBHA 4GCIA 2V32A 3M8NA 2GGTA 5CRWA 4ZBBA 3ZLPA 1SYXA 2O87A 2WGRA 2CAIA 1OVNA 3EMXA 3I6AA 2H8LA 1TJDA 2JSYA 2VUPA 4ML1A 3VFIA 3NZNA 1EP8A 2VCWA 2DMMA 2C80A 1UVZA 2CQ9A 4F82A 1V57A 1FOVA 4ZB9A 5ID2B 1GULA 1O81A 1O6JA 1V58A 1F2EA 5D9TA 4I2TA 4YQVA 4K7OA 1GLQA 4JZQA 1YF1A 3MWHA 5CRHA 1H75A 1GUMA 5AISA 2I4AA 3WT1A 3ZIVA 3GYKA 4XS1A 3OR5A 4YAVA 1Z3EA 4BWSA 1KEBA 2P5QA 5LNKe 4KSOA 1ON4A 4KW6A 4XRDA 2RLIA 3VWUA 1VRSD 1SKSB 2CX3A 1BQ7A 2CVDA 4WR4A 1TU8A 4V2LA 3WGEA 2VO4A 2B7JA 3C1SA 3LWAA 2PGTA 4IP1A 1AIUA 4BVYA 3IXRA 1THXA 2D2ZA 4LMVA 1IYIA 4L0UA 3K8NA 3TCOA 2HLSA 5D93A 3KGKA 1KTEA 4V2MA 1ML6A 5G5EA 3G7YA 1UC7A 3P90A 4MK3A 4EL1A 3ZZXA 5IMDA 1BAYA 2IMEA 3P8WA 2KHPA 2TRCP 1YEPA 3RBTA 3MAKA 2ES7A 3N9JA 2DMLA 5H5QA 5DQYA 2YCDA 1M2BA 3L78A 5GAND 1OYJA 2R5GA 4QQ7A 3KZQA 2L6CA 3IDVA 1ABAA 1Z6MA 1K0DA 2HRFA 2HE3A 1AXDA 3ME8A 3ZFBA 5INYA 1OAZA 2WB9A 3KJYA 1JLVA 1Z6NA 3IR4A 1T4YA 2B1LA 1MDJA 2Z9SA 1GLPA 4ZL7A 4ZB6A 2FWGA 3MDKA 4NV2A 5IO0A 3GL5A 3TUEA 4HS1A 5ECNB 1TK5B 1MDIA 2YZHA 3GHAA 2AB6A 5ECPB 1FO5A 1M2DA 1YY7A 1ERUA 3C73A 4F2IA 3BCIA 2O89A 1RW1A 2HZEA 4GLTA 1QGVA 3KIJA 1XZOA 1WJKA 1B48A 1KBNA 1PL2A 1K3LA 4I97A 4TXVA 3O6TA 2R2JA 1K0BA 1I9DA 2X8CA 1GSEA 1M9AA 1GNEA 2F51A 13GSA 5G1KA 1JZOA 2OE3A 2FWFA 2GVPA 3RPPA 1EWXA 1XOBA 1TKDB 4POBA 2C0GA 2LEGA 1B4PA 4WETA 2DBCA 2WS2A 3HDCA 3GTUA 3KXOA 2ON7A 2IJYA 3HJPA 4N30A 4ULXA 3ERWA 1ERVA 2LRTA 2AUVA 2P0GA 1GTUA 2VL9A 2HYXA 3M1GA 2C3NA 3EYTA 2K8VA 1URMA 3DD3A 3P2AA 4PX1A 4RUVA 5GZZB 3FKFA 3HA9A 1GTAA 5D73A 3LFLA 3I9V2 3HHVA 1FVKA 4WR5A 3G7IA 2H70A 2I81A 2RIIA 4F0BA 1OC8A 5HR3A 4GTUA 2DJ2A 2GTUA 3TKQA 1VGLA 4ECCA 4TKYA 2IMFA 2GQKA 3A2WA 4NMUA 1R26A 3QD9A 4MH3A 3H79A 2LRCA 1KNGA 3ZL5A 4OFMA 2YZUA 2MMZA 2YP6A 2H1BA 2L57A 4XS4A 1K3OA 3G9BA 4MMMA 2WDUA 5DQSA 2V2GA 3KTBA 1F37A 1M0UA 1S3CA 3DVXA 3CTGA 2IMIA 12GSA 2A4VA 2JU5A 5EPFA 2YNXA 4FIWA 1TK0B 5C04A 4KH7A 2IN3A 3JCML 3KEBA 4IN0A 1QMVA 3HVVA 2FY6A 4K7IA 2CX4A 1EOGA 2I1UA 4MZCA 22GSA 1OC9A 1PRXA 1NW2A 1YQ1A 1A2JA 4F0CA 2YANA 3UVTA 1TU7A 3GIXA 3D5JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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