2BTOT

Structure of btuba from prosthecobacter dejongeii
Total Genus 20
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
20
sequence length
103
structure length
103
Chain Sequence
IIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Cytoskeletal protein
source organism Prosthecobacter dejongeii
publication title Structure of Bacterial Tubulin Btuba/B: Evidence for Horizontal Gene Transfer.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TUBULIN BTUBA
total genus 20
structure length 103
sequence length 103
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
T PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2btoT00
1ON4A 4MF5A 3KTBA 2L4CA 1TRUA 2CAIA 2TRXA 3DVXA 1O8WA 2EIQA 4IKHA 5GSSA 2CVKA 3DXBA 5G5FA 3WT1A 2I1UA 5F8BA 2IMEA 4D73B 1YF0A 5DAKB 5INYA 1WJKA 10GSA 2LUSA 5ECMB 1A2JA 5ECLB 5EPFA 1E2YA 3EU4A 3G9BA 4JR4A 2FNOA 7GSSA 4I6XA 3TOUA 3F3RA 3EC3A 4Z7XA 2FY6A 2DJ3A 3FK8A 4MLYA 2VO4A 2L6CA 3L78A 1GTBA 4F82A 3LWAA 4HJMA 3IPZA 4K7OA 2DJ0A 4ILFA 4BVYA 5FHIA 3E0UA 4RQXA 3QPMA 3ZVJA 3NZNA 3O6TA 1IYIA 1DE1A 2M80A 6GSYA 19GSA 3VI7A 3GTUB 6GSSA 3PH9A 5CRWA 4K1FA 3Q74A 5EL8A 2B7JA 1F2EA 1BX9A 3P7XA 3LYPA 4FYCA 3VI5A 2E2GA 2DLXA 3VFIA 1G7EA 4PNGA 2VCWA 1DE2A 3GKNA 1XW5A 2H1DA 1TXXA 4GCIA 1AXDA 3FHKA 3EYTA 2H70A 1PQNA 1X5CA 4GSNA 4JU5A 1R7HA 1AQXA 2VM1A 3ISOA 2NTOA 4K0NA 1H75A 2C1YA 5JCWA 2C0GA 4ZL9A 3C1SA 1O8XA 4KUNA 4ZXGA 5GSTA 1GL8A 2WCIA 3F63A 2K8VA 3KMNA 4PUAA 2OE3A 2WGRA 2FLSA 2B3SA 4WXTA 1N8JA 1TI1A 2VCZA 4IELA 2KHPA 2KOKA 2C0DA 2WJUA 5A4UA 4OFMA 4TR1A 5ECRB 3A3TA 3FR9A 5DQSA 5E59A 4ZILA 5DBQA 1F37A 20GSA 3CSJA 3RPPA 3M8NA 2VLTA 2A4VA 1EP7A 5ECSA 2ZNMA 3GRXA 4L0WA 5FWGA 1Z5YE 4TKYA 1SL2B 1EOHA 1A23A 2XC2A 5J9CA 1Z7RA 2VM2A 1RQMA 2GSQA 2B7KA 2VLUA 2EIOA 1FB6A 5D9XA 2FA8A 1SJIA 1ZMAA 3KH9A 4NHWA 4ZL7A 1JZOA 2AAWA 2VIMA 4HI7A 4ZBAA 2D2ZA 1AQVA 4HZ2A 1GSDA 1MDKA 3EMXA 1PGTA 3D22A 4HU7A 2LRTA 3FW2A 3AY8A 5L71A 4V2NA 4MJCA 5ECHB 1OE8A 4XS4A 3F4RA 2OBIA 3M0FA 1TK8B 1E6BA 3FZ9A 4FYBA 1FW1A 2VCVA 2WB9A 3F3QA 3CRUA 2X8CA 2YJHA 1YJ6A 2M46A 1A2MA 5KN3A 4EXJA 2O7KA 1ZGNA 4Q5FA 1TRSA 2P5RA 2CQ9A 2H1BA 1WIKA 4OO5A 5JCGA 1YEPA 5C00A 1EWXA 3ERWA 4TR1B 2YJ7A 5HR3A 4MZBA 1EGRA 3HVXA 1PKWA 2LJKA 4HU9A 1TTZA 4NXIA 5HR2A 1O85A 4O5RA 3WT2A 2CV4A 1BYEA 3UBLA 2WZ9A 1GUKA 5HFGA 1MD3A 1Y6EA 2VCQA 4LMWA 4V1Ag 2WS2A 3HHVA 3MSZA 4HDEA 4ECCA 3O76A 1KEBA 3H8QA 1RW1A 3TDGA 1J9BA 1GLQA 2I4AA 2AHEA 2BJXA 2QSIA 1J0FA 2MMZA 5GAPD 1GUHA 2VD1A 2O89A 1FO5A 2MZCA 1UVZA 3F6FA 1Z9HA 3PINA 4AGSA 4KAEA 1SJ6A 4P3YB 4EF0A 2K18A 2DMLA 5KN1A 3VWWA 5C04A 3D6IA 2K8SA 5D8IA 2FWEA 2HSYA 3GL3A 1XXUA 2YNXA 3GH9A 4ZB8A 3TUEA 5F05A 3MWHA 6GSUA 4DVCA 5J4UA 1MDIA 3I69A 3ZFBA 3APOA 5EY6A 1URMA 4FH8A 3WD6A 2N5AA 2CT6A 1XWBA 3GSSA 4ID0A 3J7Yk 1WMJA 2R37A 1M9AA 4HZ4A 4ZIJA 2GT6A 2XHFA 1U87A 5GZZB 5CREA 2HLSA 5ECQB 4Q5RA 2YV9A 4HEA2 2IMIA 1XZOA 2O8VB 1SK2A 2DIZA 3ERFA 3US3A 3P2AA 2OBKA 14GSA 1FVKA 2H0GA 3IV4A 2ZCTA 1SL1B 3H1NA 3HA9A 2LQQA 1K0AA 3IOSA 3KMOA 3IC4A 4CHSA 12GSA 3DMLA 3FYGA 3FZ5A 2IFQB 3HJOA 3M9JA 1BQ7A 2LEGA 3TJBA 3A2XA 4MZWA 4OFNA 1B4QA 4HUAA 4G10A 3WYWA 3ME8A 5D96A 1T8EB 5G1LA 22GSA 5IOWA 1JFUA 3L0HA 1GSUA 1Z3EA 4PNFA 1X9WB 3RPNA 5HQPA 4I97A 1ZOFA 2GZPA 1GSSA 1XW6A 3KM6A 1LU4A 1OYJA 2GLRA 1QQ2A 2L57A 3GUSA 1PA3A 4V2LA 1M7TA 2F8AA 3KD0A 1F3AA 1TK0B 3EE2A 4O32A 3W6GA 2WULA 3UARA 4TXOB 1GTIA 2H0IA 2LRNA 5F0GA 1QUWA 3TJFA 4BA7A 1AC1A 3EU3A 2NPBA 5ID2A 3HZ8A 4MZCA 1WWJA 4N0ZA 1ML6A 3L9SA 5B6MA 1VGLA 1A2LA 2GS3A 4OCFA 1O81A 5J3RA 4NMUA 4GTUA 5IMZA 1SKRB 1OKDA 1ZYEA 3F8UA 1JLWA 5D9VA 4KGIA 1Y25A 4QQ7A 2RLIA 4BWQA 1I9DA 1YKCA 2I81A 3CXGA 4XTSA 3ED3A 3GFKA 5J5NA 2X99A 2KP2A 3IRAA 2PVQA 1ZYQB 3UAPA 4KW6A 3LQ7A 3GA4A 4AJ6A 4XIHA 1CQHA 2VCXA 2PGTA 2YWNA 4EUYA 3VWXA 5H5SA 3G7YA 3UBKA 1XVWA 1DSBA 3CSIA 4ISDA 3BD2A 3GMFA 4ZB9A 2F8FA 4IJ3A 3RAZA 3GKMA 4HJ2A 1ILOA 1XWKA 4MMMA 3BCIA 2QGVA 1WOUA 4KCAA 4YQUA 1V40A 2FUG2 1XCCA 2BMXA 3GTUA 5IM9A 4IQAA 1SD9A 2LSTA 1B9XC 2PN8A 5HR1A 4NAXA 1AW9A 4BVXA 3ZIVA 2DC5A 2FGXA 4IQ1A 1LJRA 3TKSA 4I5QA 1YY7A 2ES7A 1OC3A 2LS5A 4AJ7A 4K2DA 1QFNA 3IK7A 2XPEA 4N10A 2NVLA 4I2UA 5CRGA 3UVHA 5D9TA 1SK0A 4J57E 1WPIA 4MPGA 3IBHA 1XW9A 3H79A 2C3TA 5J41A 4FYUA 4KNDA 3F4SA 3RDWA 4KDXA 4JR6A 3O3TA 2E0QA 2HYXA 2L6DA 13GSA 2NBSA 2C0EA 3RHCA 1OE7A 1Z7PA 2LV3A 5CYYA 1K3YA 1PSQA 4GSTA 3U6VA 2OE1A 1UA5A 1K3LA 8GSSA 2L5LA 2R3XA 1DBYA 3UL3A 4TN8A 1NM3A 1TOFA 2OA7A 5IMDA 2GSRA 1ZL9A 2B5EA 4L0UA 2J9HA 2HXKA 3LJRA 1PX7A 1KTEA 3P8WA 1R5AA 3HJPA 3ZL5A 2DIYA 2MMNA 1JZDA 3A2WA 3FY7A 3TKQA 1GSYA 1R26A 1XVQA 3W8SA 2G0FA 3ERGA 5FT3A 1SK1A 2XPDA 5B8AA 5AIXA 5B7CA 2YWMA 1THXA 2IMDA 2HZFA 4I2TA 1AIUA 2PBJA 2VL2A 2YCDA 2DJ2A 5KEJA 1VF3A 3EVIA 1XFLA 4TVEA 5IOXA 4WF4A 3TRQA 4YAPA 5ENUA 1GUMA 1K0DA 3TJGA 4NV5A 4K9ZA 1AAZA 1BJXA 2YV7A 3UVTA 2C4JA 3H4KA 2FA4A 2O85A 3IR4A 1WE0A 2DJJA 4RI6A 3VWVA 1M99A 3KEBA 3ZFLA 4J56E 1S3CA 2GQMA 1YF1A 4X43A 2I9HA 1JZRA 3GIXA 1SJZA 2YANA 4V1Ap 5H5QA 2H76A 3TKSE 3PGTA 5ECKB 4G2EA 1ST9A 2H71A 1N2AA 3QDNA 2R2JA 5ECIB 4IP1A 3ZVJD 1ERTA 3G7JA 3ME7A 4ECBA 5CRHA 1GNWA 2F9SA 4GSSA 5IMFA 5ABRA 2EIRA 1NSWA 2IN3A 3ZITA 1O73A 3FKFA 1TDIA 1BG5A 2AV4A 1A0RP 1SENA 4ZL8A 2B1KA 4TR4A 4BL7A 4RUVA 4IGJA 3RBTA 2H19A 2F3MA 3TCOA 3VWUA 1EZKA 4F0BA 1VF4A 4DSSB 1DUGA 4IVFA 4XS1A 2AUVA 3I9V2 4CW9A 3I6AA 4TW5A 3ZMLA 4G9HA 2P0GA 4RQRA 1PX6A 1FAAA 1TRWA 2VOCA 2CA8A 1A24A 2HZEB 2O87A 2VL9A 2IL3A 2JU5A 2R6KA 2IFQA 1GLPA 3QCPA 2HRFA 1ERUA 3JCML 1EGOA 1CQGA 1ACVA 5COHA 4KX4A 2LKUA 1HQOA 1X5DA 1SU9A 5KN0A 3GH6A 4LL4B 3N9JA 1SKWB 3DRNA 4X1UA 1IYHA 4MF6A 4O92A 2GSTA 4E8HA 3GHAA 3MDKA 1C72A 4GF0A 2OACA 3KP8A 4YAVA 4MCUA 3GX0A 3IK9A 2CX3A 4XRAA 2TRCP 2H6XA 2JSYA 1Z6NA 4N0VA 3DIEA 1H4OA 2B1LA 2V32A 3UIWA 1GSEA 3E3EA 2PPTA 3RHBA 3PR8A 1M2DA 4LL1B 1XOBA 2HNLA 3LORA 1USBA 4TXOA 1O6JA 2B6MA 2V1MA 4RI7A 4TXVA 1FVJA 3TKRA 2KP1A 5B8BA 1GSQA 1PMTA 4KDYA 4PQ1A 3QD9A 5IMVA 1GP1A 2OKAA 1J08A 3A5WA 4JEDA 3KIJA 3ZIJA 5JWRB 3DVWA 3ZREA 2HT9A 5CP1A 3UOMA 3ZYWA 4F9ZA 2BTOT 1ERVA 3C7MA 3GX8A 3HDCA 5ECOB 2K9FA 5ELAA 1UC7A 1X9SB 3QOUA 3KP9A 4FIWA 3M1GA 2E7PA 3HY2A 3DKSA 1HYUA 1G6WA 4DSRA 1KNGA 4WKWA 4WBJA 1G0TA 3IXRA 4YQVA 3C71A 1M2BA 4K0GA 5D93A 3LG6A 1V9WA 2L4QA 4IBPA 9GSSA 5B6NA 5DJLA 3CMIA 3M3MA 4WR5A 1YKAA 4GWRA 4EVMA 2OADA 4XRDA 1XIYA 3HD5A 2VUPA 3UEMA 3KTLA 1TK5B 2H6YA 3QAVA 3ZLPA 2RIIA 4ML1A 5CAXA 3D4TA 4OCEA 3BOAA 3EURA 4ZB6A 2L5OA 4TR3A 5HR0A 3IAS2 1M2AA 2H1GA 2V41A 4ULXA 4MJAA 1QXHA 1GWCA 3SBCA 3LEFA 4KSMA 4KA0A 1YDKA 2MBSA 3D4MA 1U3IA 3KGKA 3QFBC 5DJMA 2HI7A 3EWLA 1B9YC 4E8EA 1THOA 4K7NA 1T3BA 2CVDA 2R5GA 5G30A 4MF7A 4L5LA 4BPYA 3QMXA 1A0FA 2QKEA 2A2SA 3GKKA 2OJLA 4NHZA 4V2MA 5DVBA 4PXOA 4MJBA 2KUCA 1K0MA 3DWVA 1OAZA 1F6MC 2H75A 3Q6OA 3K8NA 4JRRA 4DEJA 2GSSA 3C1RA 4OMVA 1U3AA 1ZZYA 3GURA 1GTAA 3OR5A 2VL3A 2NDOA 2DMMA 1PD21 1SKSB 2C3QA 2DSAA 2CZ2A 5ECPB 2R4VA 2C0FA 1XWAA 1HNBA 6GSTA 2JADA 4QL7A 5D73A 2KLXA 1JLVA 2IJYA 2LQOA 1MEKA 4PX1A 1PL1A 2DBCA 1T7PB 1S3AA 1SYRA 5G1KA 1M0UA 4KSOA 4O7HA 2RM6A 3HZ4A 3WGDA 5JWOB 3F6DA 1G6YA 4ZBDA 1QMVA 2VCTA 6GSWA 1FHEA 3UMAA 2GZYA 3H93A 4L8EA 2VAFA 1TW9A 4DSQA 2X8HA 2YP6A 5GAND 4GLTA 1GNEA 4OD7A 2LNTA 2GZZA 1OKTA 1EEJA 1HNCA 3BCKA 2FWFA 2IPAA 3TKSC 3FZAA 1Z6MA 5A4VA 5JWQB 2H30A 3SWLA 4MK3A 5AN1A 1XPVA 2GGTA 5DCHA 1TU8A 2G2QA 4EO3A 5G31A 3IHQA 1TI3A 2LTKA 3U5RE 1OC9A 3TGZA 3VK9A 1V57A 3QR6A 1PN9A 2H73A 2JSZA 2X64A 3APSA 1AUCA 3CTFA 5EVOA 1T1VA 4NWYA 1JHBA 1HNAA 4J2FA 5DALB 3C73A 4KE3A 2FWGA 3D5JA 2FCHA 2CAQA 1QK8A 5DDLA 5IO2A 5AIVA 3CRTA 2YPMA 4KB3A 5D9WA 1I5GA 4JZQA 4MA9A 4OO4A 5KN2A 1SD8A 3ZMKA 1B8XA 2PMTA 4MP4A 1GTUA 1LBKA 18GSA 1X5EA 4POLA 4N11A 1W4VA 4LA1A 4WETA 3LFLA 4JBBA 1B48A 4ML6A 4KCEA 5F06A 1S3DA 1YEXA 2P5QA 4TR0A 1K0BA 3LSZA 1BEDA 1OC9B 2JL4A 2XBIA 4FO5A 5DALA 1MDJA 2LJAA 2YZHA 2LJRA 5A4WA 3Q18A 3QFAC 1FB0A 5IMCA 4GXZA 2P31A 1OVNA 3BJ5A 3IAM2 5ECNB 1O7UA 4F2IA 4OFTA 2IMFA 3FEUA 2VL2C 4DSSA 2AB6A 1UN2A 4ECIA 4AF2A 1PKZA 3F4TA 5DCGA 3L9UA 1K3OA 1GSFA 3D0ZA 2HFDA 4POBA 5A5KA 3LYKA 5LNKe 3LXZA 3VURA 3KH7A 2HZEA 3HVSA 4BWSA 3Q19A 4KDUA 1R4WA 4WEYA 4EC0A 3WGEA 4PGTA 1T4ZA 2MMAA 3M9KA 1X9MB 4WF5A 1BAYA 17GSA 1A8LA 1B4PA 3FR6A 3GN3A 4K6XA 4KH7A 4TOPA 1VRSD 1NHOA 4IHUA 3G7IA 3L9VA 4ACSA 1EV4A 2WRTA 1MD4A 3TJKA 1QGVA 1ABAA 4N30A 4PQHA 5CNWA 1ZCPA 1OC8A 1V2AA 5LD0A 2YZUA 1TKDB 2H8LA 1YZXA 2AYTA 1EV9A 4IJIA 2QC7A 4PURA 4PUFC 4F0CA 2N5BA 1TRVA 11GSA 4K7IA 3WGXA 4JE1A 1JZWA 1PL2A 1FG4A 1K0NA 2PUKC 2HE3A 5G5EA 2H66A 2PWJA 3L4NA 3E9JB 2V6OA 2YOIA 1V58A 3FZ4A 2YWIA 4OWYA 3HCZA 3ZTLA 4IP6A 4XS4B 1SYXA 3GNJA 5G2ZA 2ON5A 6GSXA 3CSHA 4F03A 1Q4JA 2VLVA 3IE3A 4EL1A 3I43A 2RUFA 1ERWA 2MMOA 3NOFA 4XHMA 2HSHA 3GYKA 2JZSA 2XBQA 2GQKA 4L5OA 4GQCA 4WBRD 4XCSA 1MTCA 2N5FA 5F07A 2YN1A 6GSVA 2OE0A 1V98A 4POMA 4EE0A 3P90A 1EP8A 2EC4A 2V2GA 2L59A 4YQMA 2C8UA 2I3YA 2F51A 1Q98A 1T4YA 3HJMA 1EEMA 2IWTA 4TRXA 2PERA 4IS0A 3DD3A 2IIYA 2TIRA 4IW9A 1K0CA 3TRXA 2DJ1A 1VF1A 5IO0A 2B5YA 2M72A 4X0XA 1XWGA 2X8GA 1RK4A 4EDZA 2PU9C 4MABA 1GULA 2FWHA 2GDRA 2RM5A 5ELGA 1VF2A 5J9BA 2CZ3A 3HKRA 1SL0B 3ZZXA 5JCUA 2H0HA 2C3NA 3EMPA 3DYRA 4YH2A 4GRFA 5DQYA 3N5OA 4Q5QA 3IA1A 4ECJA 1AQWA 3NIVA 3HXSA 2A2RA 1TP9A 3DEXA 3VPQA 4IN0A 1K0OA 4NV2A 1YQ1A 1XWCA 1NHYA 1F3BA 1A8YA 1PRXA 5AGYA 3CYNA 2CVBA 5AISA 5IIZA 2LRCA 4MDCA 2FD3A 4LMVA 2VD0A 2GQLA 2E2MA 4GQFA 2ALBA 5CRDA 1FOVA 1T00A 3V1WA 4H86A 3QAGA 5HFIA 1U88A 3LXTA 3W8JA 4MJEA 2J23A 3GKXA 3FR3A 1F9MA 2GTUA 5IMAA 3J7Yb 3IDVA 2HRNA 2ON7A 4I8BA 3GSTA 2RUEA 1WRYA 2C80A 2H74A 2IMKA 3CBUA 4POKA 3QAWA 3HYPA 4XS6A 1XBSA 1EOGA 4EKZA 2MYGA 4Q5NA 1R5PA 2DJKA 2FHEA 2REMA 4CDOA 5LCZA 1WP0A 2PVOC 1X0RA 5E4WA 3HVVA 3APQA 3A2VA 3VLNA 3EINA 3TJJA 2H01A 3F0IA 3BBYA 3MAKA 5CO3A 3S9FA 1XOAA 2YWOA 1GRXA 1TJDA 4PQIA 1U6TA 3KJYA 3CTGA 1M9BA 2Z9SA 1HD2A 2WFCA 3R2QA 5IPHA 3TB2A 2GT5A 3VPTA 5IPGA 2AJQB 4AJ8A 3KXOA 2CX4A 4WR4A 2V6KA 4D73A 5DAKA 3DGQA 1W89A 2JZTA 4HOJA 3TKPA 3F9UA 2K6VA 4EDYA 4G19A 3GV1A 3TOTA 2H72A 16GSA 5HFKA 3C8EA 3GL5A 2GVPA 4MH2A 2H6ZA 2B5XA 5IQYA 3KZQA 2JACA 4ZBBA 1TU7A 3FRCA 3UJ1A 4MPFA 1NW2A 5ID2B 4NPBA 5H5RA 3KCMA 1GH2A 3LGCA 3TRPA 1G7OA 4HQSA 2LNSA 2MBTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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