3ZVJD

Crystal structure of high molecular weight (hmw) form of peroxiredoxin i from schistosoma mansoni
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
168
structure length
168
Chain Sequence
MVLLPNRPAPEFKGQAVINGEFKEICLKDYRGKYVVLFFYPADFTFVCPTEIIAFSDQVEEFNSRNCQVIACSTDSQYSHLAWDNLDRKSGGLGHMKIPLLADRKQEISKAYGVFDEEDGNAFRGLFIIDPNGILRQITLNDKPVGRSVDETLRLLDAFQFVEKHGEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
publication title Moonlighting by Different Stressors: Crystal Structure of the Chaperone Species of a 2-Cys Peroxiredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE
total genus 33
structure length 168
sequence length 168
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
D PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zvjD00
1QMVA 3CSJA 3ZITA 1H75A 2VL3A 4GF0A 3KCMA 3N5OA 2K8VA 3WT2A 2YWOA 3GTUB 3GFKA 1WPIA 1O6JA 1MTCA 4TR0A 4K6XA 3KH9A 5KEJA 2L6CA 4KB3A 4MABA 3IC4A 5CRDA 3VPTA 1TI1A 1EEMA 4KDYA 5DVBA 1V98A 3C7MA 4XTSA 2R6KA 2V6OA 1K0DA 1E6BA 3IK9A 3M1GA 1T8EB 4ML1A 3DXBA 2HNLA 2RLIA 1TU8A 1K0MA 4HU9A 2B1KA 3FZ5A 3GHAA 3ZVJD 5DJMA 1WMJA 2ZCTA 2TIRA 1WOUA 5INYA 3CTFA 5B8AA 2YNXA 4K9ZA 4IQ1A 4ECCA 5F06A 2LNTA 1T4ZA 3MNGA 2N5BA 1F9MA 2WRTA 1W4VA 1ZZYA 3O3TA 2PUKC 5HFGA 4GQFA 3RPNA 1JZWA 2TRXA 2PBJA 5ECIB 1OC9A 4PUFC 1VF4A 4JBBA 5B6MA 4V2LA 5D9XA 2PVOC 1PL2A 2JADA 8GSSA 3QOUA 2JZRA 3LGCA 3ZL5A 4PUAA 4GWRA 2V1MA 4GXZA 1Z6NA 3FY7A 3GN3A 1A24A 2QC7A 2YCDA 3Q18A 2VO4A 4DSSA 4K0NA 3O76A 1J9BA 3ZTLA 1MD4A 4ZBDA 2IN3A 5DAKB 3SWLA 2FHEA 4ZIJA 2QSIA 3GSTA 2VLVA 1TRWA 3CMIA 1B9XC 4BVXA 3LWAA 4DSRA 1BEDA 2FA4A 3HKRA 1TXXA 1V57A 2G0FA 3W6GA 2CA8A 3D4TA 2OJLA 1V40A 2D2ZA 3HVSA 3ERGA 1BAYA 4TR1A 12GSA 1O73A 1PD21 2DMMA 1TK0B 3KM6A 4POBA 4TRXA 17GSA 3F4SA 5ECSA 2JSYA 1XXUA 2NTOA 3EURA 2B7KA 3E0UA 3CTGA 20GSA 5ECRB 2VUPA 4BVYA 5JWRB 4ZL7A 4OO5A 2YZUA 2KUCA 2LTKA 3QMXA 1FG4A 4GTUA 5GAPD 2C0FA 3TDGA 4K2DA 5D9WA 3HZ8A 4KCAA 1QFNA 3ZRDA 4E8HA 1J0FA 5H5QA 2NVLA 4IJ3A 5IM9A 1AQWA 5CRGA 3TKRA 1PX7A 4EXJA 1FB6A 5F07A 5ECPB 2V41A 1UVZA 3BCIA 1FVJA 1AAZA 1RK4A 5FHIA 2CV4A 4TR3A 3D6IA 2VLUA 2P5QA 3TOUA 4MJCA 3BJ5A 4XS4A 5HR2A 2VL9A 1URMA 1AXDA 2F8FA 1GTUA 2HZEA 2H75A 5IMDA 1S3AA 1TDIA 4PX1A 3BCKA 4Q5QA 1EWXA 5CRHA 3GL5A 1GL8A 2MMOA 4F0BA 2FWFA 2GGTA 4LMWA 4K8MA 2HZFA 5DALA 3UEMA 1N2AA 1QXHA 5ECOB 5CP1A 4ZXGA 3U5RE 4EKZA 1K3OA 5E59A 1AC1A 3L9VA 1OAZA 1G0TA 2FWHA 3FZ9A 3BBYA 3TKSA 3KD0A 3KMOA 1ILOA 3DVWA 4HEA2 4LLRA 2F8AA 1XPVA 2RM6A 3LQ7A 4Q5NA 4AJ7A 3IHQA 5IMZA 2J23A 4OCFA 5DJLA 3WGEA 5C00A 2IFQB 4ZBBA 4OO4A 4AJ8A 4PURA 1MDJA 1THXA 1TK5B 3IAM2 1JFUA 3LYKA 3HJPA 3KGKA 5D9VA 2IL3A 1F2EA 2OKAA 1U87A 3J7Yb 2ZNMA 2V6KA 5ELGA 4BWQA 3VI5A 3QFBC 5KN0A 3CSHA 3AY8A 3EWLA 1MDKA 2I1UA 2FWGA 1BG5A 1WRYA 1FHEA 2I9HA 1V9WA 4J57E 2H0HA 2H01A 4JR4A 4G2EA 5COHA 1FO5A 1ERTA 1ERVA 2O87A 4V2MA 1O7UA 1ZCPA 2DIYA 1MDIA 2QKEA 2JSZA 3UVHA 4WR4A 3Q19A 2WJUA 1TOFA 1AIUA 1OKTA 4L8EA 4FYUA 2WS2A 2C4JA 4KH7A 2PU9C 3ZMKA 3DWVA 2B7JA 2H0IA 3F4RA 5IOWA 2AJQB 1KEBA 1GSFA 2IMEA 5JCGA 1YDKA 3G7YA 5IMFA 2RUFA 5AIVA 4ILFA 2OE1A 3M9JA 1NHOA 2H0GA 4QL7A 3IAS2 1OKDA 3TJKA 5EL8A 1RQMA 4F2IA 1JLWA 5F0GA 3EVIA 5AIXA 3WGXA 1PRXA 2QGVA 2CX3A 2LJRA 5A5KA 1U3AA 1R4WA 2HE3A 2A2SA 4KA0A 3GYKA 1G7EA 1PGTA 2VIMA 4I8BA 4FH8A 3C1SA 2X64A 1K0OA 5KN1A 3PH9A 4NPBA 4QQ7A 1IYIA 1ZGNA 4BA7A 2PWJA 3P7XA 4OWYA 2CVBA 2H66A 4EF0A 3VWUA 1XW6A 4RQXA 4RI6A 3HVXA 2M46A 3ZLPA 3FR3A 2B5EA 3IA1A 2O85A 3ZZXA 4IW9A 3F6FA 3W8JA 3US3A 2YWMA 3HY2A 4NV5A 2O7KA 4K1FA 1GUKA 2GQMA 4MH2A 5EPFA 5G30A 2M80A 2H6XA 3U6VA 4O92A 5ECMB 2L4QA 1SKSB 3F9UA 3FRCA 3L4NA 2R3XA 2X99A 2FA8A 3JCML 2AHEA 4ID0A 2YP6A 1XZOA 2H30A 3E9JB 3TJJA 2B6MA 2R37A 2DJJA 2FNOA 4TXOB 1OVNA 2B5YA 4OD7A 1A2MA 1GTIA 2IMKA 1EV4A 3ISOA 3IOSA 5KN3A 3ZFLA 2GLRA 3DD3A 2EIOA 2C3QA 4G10A 1EGRA 4L5LA 4FIWA 4BPYA 3ERFA 1R26A 2H19A 1GSYA 5B8BA 3KXOA 1GSUA 1PN9A 2E0QA 2IMFA 2VAFA 3HVVA 4NAXA 3DVXA 4FO5A 4O7HA 3FZ4A 2XBIA 2DBCA 1NSWA 3NIVA 5D96A 4IP6A 2HRNA 1A0FA 5CAXA 5G31A 3APQA 2GT6A 4EO3A 3MSZA 1SD8A 1DE2A 2LQQA 1H4OA 1QQ2A 3FR6A 1VF1A 2CVKA 3KIJA 4MA9A 4JZQA 5JCWA 4WBJA 5IO2A 4K0GA 1EOHA 3BOAA 1UC7A 4NV2A 3M9KA 4L5OA 1SU9A 4MPFA 4K7IA 3FHKA 2LV3A 3UVTA 2YWNA 3EE2A 4ULXA 5J4UA 1YEPA 2JZTA 3GA4A 4IQAA 2PVQA 3TGZA 5EVOA 1TW9A 1SJ6A 4DSQA 4I2UA 2LJAA 1SK2A 1GSEA 4WEYA 2LJKA 1EZKA 1ON4A 1PX6A 2YJ7A 1M0UA 1MD3A 2K8SA 2VCTA 3GKNA 4GSSA 2CZ3A 4G9HA 1JHBA 4EDZA 4TOPA 1S3CA 2J9HA 2V32A 2H74A 1BQ7A 2C8UA 2ON5A 2P5RA 4BWSA 3DIEA 4NWYA 1MEKA 1ERUA 2F9SA 2H71A 2L57A 2VL2A 3F4TA 1OE8A 2C1YA 1V58A 2P0GA 4ZL9A 1T7PB 3C1RA 2I3YA 1A2LA 4MZCA 4YQMA 2REMA 3VLNA 2RUEA 3LYPA 3EC3A 4IELA 3ZYWA 1PSQA 1TJDA 5D93A 1M2DA 3RBTA 4N0ZA 3IV4A 5J3RA 3TKSC 1X9MB 4HZ4A 3LJRA 4O32A 1GSSA 1LJRA 4WETA 5ECNB 1M2BA 3VWXA 2E7PA 2JACA 2H1AA 4YQVA 3IE3A 2AB6A 2PERA 2VD0A 3D21A 2MMNA 4KNDA 5HR0A 1K3YA 3PR8A 2CX4A 1SD9A 5J9BA 1XCCA 3KEBA 2AV4A 3GNJA 22GSA 2DJ2A 3L0HA 3QCPA 3LORA 1TRSA 1XOBA 2DC5A 2XPDA 2LEGA 3QFAC 1GLPA 2FWEA 2K6VA 1M9AA 3QAGA 4HDEA 3ME7A 4H86A 3GX8A 4F03A 1VRSD 1X0RA 3N9JA 3QAVA 1YF1A 4TN8A 2MMAA 5ABRA 4NHZA 3HXSA 2OBIA 2XC2A 3QPMA 4P3YB 3LXTA 2YOIA 3CXGA 2GQKA 5CYYA 5DCHA 3RHBA 3EMXA 3I6AA 2LRNA 1G6YA 1OC9B 4ACSA 3KJYA 2BJXA 3ZFBA 2WULA 2C3NA 3IDVA 4Q5RA 3TKPA 4MMMA 1GSDA 1ZL9A 1A23A 1ZYQB 3I9V2 3RPPA 2C80A 4HOJA 3EMPA 6GSTA 2PGTA 3UOMA 3S9FA 1TU7A 2F51A 4DSSB 1B9YC 2N5FA 1WP0A 1PMTA 2WDUA 1FOVA 1F3BA 6GSYA 4IP1A 4DEJA 2BMXA 4HQZA 3VWWA 2ALBA 1EP8A 4OFNA 3HJOA 2RM5A 2OE0A 1DSBA 3QDNA 2PN8A 1A8LA 4EE0A 4NXIA 2FD3A 3APSA 4O5RA 1DUGA 4GLTA 4TR1B 1XBSA 5DQSA 1SYXA 1JZOA 1SL0B 4MCUA 3UARA 1B4PA 2NBSA 1PKZA 4HUAA 2K18A 4G19A 2YWIA 3P8WA 3H93A 3UMAA 3TRQA 5C04A 1FVKA 3A5WA 2H1BA 4GQCA 2GZYA 5ID2A 1RW1A 2CT6A 4XHMA 1LU4A 1VGLA 3HA9A 5FWGA 1Y25A 4ZB6A 3FKFA 2O89A 3UBKA 2YV9A 4OMVA 1SK1A 4MZWA 2LNSA 3W8SA 2LUSA 2H72A 3Q74A 1GTAA 2B1LA 4YAVA 3UAPA 4F82A 3NOFA 1BYEA 2NPBA 6GSXA 1QGVA 1XVQA 4ZILA 5J41A 4HI7A 5JCUA 1GNEA 6GSWA 18GSA 4XS4B 1ZYEA 1F6MC 1X9WB 1KBNA 2IJYA 3F8UA 2HZEB 2X8CA 1B4QA 2C3TA 3CRUA 2HI7A 1X5CA 2WCIA 3F3RA 4XS1A 1KTEA 7GSSA 1YY7A 2C0GA 5KN2A 3IR4A 5DALB 1M99A 3QD9A 3TRXA 2GZPA 2MZCA 3F0IA 3ZIVA 2A4VA 2NDOA 2ES7A 3HJMA 1X5DA 1O8WA 4MF5A 2E2MA 3UIWA 2I81A 4LMVA 3UJ1A 4NHWA 5GAND 2YZHA 3KTBA 4YAPA 2GSRA 3F6DA 2X8HA 1SKWB 4TKYA 1PA3A 4D73A 3HHVA 3KMNA 1I9DA 4V2NA 2OADA 3TJBA 3PGTA 4LA1A 1M2AA 4GSNA 4TR4A 2PMTA 4I6XA 5JWQB 2P31A 2HT9A 3SBCA 4PGTA 4KDXA 3TCOA 2L5LA 1G7OA 3I43A 1XWCA 1IYHA 3VK9A 1K3LA 3EU4A 5J5NA 1YEXA 5G1KA 3CYNA 2R4VA 3DEXA 1C72A 4N11A 4TXVA 2MYGA 3RAZA 1YKAA 4TW5A 2MBSA 2HSHA 5HQPA 3APOA 4XRDA 1G6WA 2YV7A 3GUSA 1R5PA 3TB2A 3DRNA 1JZRA 1R7HA 2H70A 3QR6A 3HDCA 4IJIA 4FYCA 4YH2A 3ED3A 3R2QA 2LQOA 3LFLA 3M0FA 6GSSA 1A0RP 4E8EA 1Z6MA 4WBRD 3GTUA 5E4WA 3LEFA 3EYTA 2DJ1A 2EIRA 2H6ZA 5CREA 2OA7A 3GURA 5G2ZA 4HQSA 5D8IA 5HFIA 4MK3A 5JWOB 1LBKA 3HCZA 5GSTA 2LKUA 3P90A 6GSUA 5AGYA 3FEUA 2GTUA 4L0WA 2EIQA 4PNGA 3WYWA 1GUHA 1HD2A 3L9SA 1TP9A 1PQNA 2KHPA 2GSSA 1TRUA 2JZSA 2MMZA 3H1NA 13GSA 3ZIJA 3VWVA 3GKKA 4EDYA 3IRAA 1WIKA 4MP4A 1SL2B 4MF7A 5ECQB 1XW5A 2R5GA 2FGXA 4EC0A 4POKA 1VF3A 1O8XA 2G2QA 2H73A 1UA5A 2VCXA 1VF2A 3QAWA 1ZMAA 4AJ6A 2M72A 4MDCA 4MJEA 2LSTA 2Z9SA 1Z7PA 4X0XA 1XIYA 2YN1A 4QL9A 3CSIA 4KX4A 3TJGA 2C0EA 4IVFA 1HYUA 1SK0A 2KOKA 1A2JA 2FUG2 5D9TA 4EUYA 1AQXA 1U88A 5A4WA 4I97A 3LXZA 2IPAA 5G5FA 2DLXA 4F9ZA 4L0UA 5IQYA 1FB0A 1WE0A 4AF2A 5F8BA 5HR3A 1HNCA 2GQLA 3DYRA 1R5AA 4ECJA 1J08A 4MPGA 2KP2A 4DVCA 4FYBA 1XWKA 2PPTA 3VURA 4K7OA 3G7IA 3EINA 2XBQA 3D5JA 4I5QA 1YKCA 2GVPA 5DAKA 4WR5A 1EEJA 4CHSA 1T4YA 3IBHA 4J2FA 2TRCP 5FT3A 5IMAA 1CQGA 2GT5A 4N30A 1K0NA 2HLSA 2CAQA 5D73A 2CAIA 1TTZA 3KP9A 4LL4B 2CZ2A 2DMLA 3F3QA 2JL4A 1YJ6A 2IMDA 2DJKA 3D0ZA 1GP1A 3GL3A 5L71A 1PL1A 2KP1A 4WF5A 4ZB8A 4MF6A 3GKMA 4JR6A 4X1UA 2HRFA 3O6TA 3DKSA 3IK7A 3L78A 3WD6A 1EOGA 5CO3A 2OACA 2B3SA 5LD0A 1M7TA 1XOAA 3VI7A 3VPQA 1T1VA 1EV9A 1TRVA 1DE1A 1SENA 2DJ3A 4KDUA 1AQVA 3RHCA 4GCIA 2GS3A 5LCZA 1Z3EA 4F0CA 3DGQA 3ERWA 1M9BA 2L6DA 3IPZA 2A2RA 1GTBA 2IIYA 3A3TA 5GSSA 4Z7XA 4JRRA 1NW2A 1JZDA 3ZMLA 1Z5YE 5LNKe 9GSSA 2VD1A 4PQIA 5IPGA 4HU7A 4OFTA 4XRAA 14GSA 3FW2A 3H79A 5G1LA 1GNWA 3TKQA 5A4VA 2O8VB 3D4MA 2YANA 2C0DA 1CQHA 1OE7A 2FCHA 2LRCA 1FW1A 1O81A 2EC4A 4MJAA 1DBYA 3TOTA 3M8NA 1U3IA 1EP7A 2VCVA 4JE1A 3GKXA 3WGDA 3D22A 1Z7RA 4ISDA 1ERWA 4NMUA 4PNFA 5ECLB 3F63A 2L5OA 4V1Ag 4ML6A 3E3EA 5ENUA 3MDKA 3KH7A 1T3BA 4WKWA 1XVWA 1BX9A 1WJKA 5IPHA 4KSOA 19GSA 3C71A 3ZVJA 1GLQA 4POLA 5IO0A 5H5SA 2JU5A 2IFQA 3TRPA 4HS1A 4OCEA 3GIXA 3M3MA 3IXRA 1USBA 2OE3A 5GZZB 1A8YA 1W89A 5DDLA 2B5XA 1OC8A 2GSQA 1FAAA 4KCEA 2H1DA 3CBUA 4KAEA 4XIHA 4V1Ap 5DBQA 4KSMA 3DMLA 6GSVA 2GSTA 5CNWA 3GV1A 11GSA 2GDRA 2HSYA 3GX0A 2WZ9A 4ECIA 4IGJA 4KUNA 1Q98A 4TVEA 3C73A 1XW9A 1Z9HA 4IBPA 2H1GA 1E2YA 1SJIA 4CDOA 4MJBA 3GSSA 1XFLA 1TKDB 4PQHA 1K0BA 2HFDA 1X9SB 5B7CA 5HFKA 4KE3A 3PINA 5DQYA 3KP8A 3I69A 2KLXA 3A2VA 4KGIA 3GH6A 1GUMA 1NHYA 1YF0A 4RUVA 3HD5A 3VFIA 2HXKA 3G7JA 4AGSA 2N5AA 1KNGA 3H8QA 2X8GA 4RI7A 5IIZA 4LL1B 2AAWA 2XPEA 3L9UA 3FYGA 3HYPA 4K7NA 1HNBA 3LSZA 4WF4A 3FK8A 4IHUA 2DIZA 4KW6A 1I5GA 1U6TA 2F3MA 4ZB9A 2XHFA 2VCWA 1XWGA 4IKHA 5B6NA 3G9BA 4XCSA 4BL7A 4MZBA 2IMIA 4JU5A 4HJMA 4IS0A 2WFCA 4N10A 1F37A 4EL1A 4JEDA 16GSA 1PKWA 1K0CA 3FR9A 4MH3A 2LS5A 1THOA 3J7Yk 4ZL8A 1GSQA 1WWJA 1SKRB 2E2GA 4CW9A 2CQ9A 1GULA 5ELAA 2FLSA 5ID2B 2ON7A 4ZBAA 5DCGA 3A2WA 1B48A 2DJ0A 2K9FA 3ME8A 3OR5A 3EU3A 2OBKA 3KZQA 2AUVA 3H4KA 2IWTA 3MWHA 4Q5FA 4HZ2A 1ML6A 5IMVA 2R2JA 2HYXA 4TXOA 1XWBA 1HQOA 4N0VA 5F05A 4MLYA 1X5EA 2V2GA 2VCQA 1ABAA 3KTLA 3TKSE 3P2AA 1ZOFA 4OFMA 4EVMA 3GRXA 5IOXA 5AN1A 4RQRA 1QUWA 2RIIA 2VM1A 3FZAA 1AW9A 4J56E 4YQUA 1ACVA 3TJFA 1V2AA 3NZNA 1O85A 1EGOA 4POMA 2VM2A 4HJ2A 3GMFA 5J9CA 1OYJA 1F3AA 2VL2C 3UL3A 4I2TA 5IMCA 4IN0A 1SL1B 1T00A 2AYTA 5HR1A 3ZREA 2ZUPA 2BTOT 5ECHB 1Y6EA 2YPMA 1BJXA 2WB9A 2I4AA 4GSTA 5AISA 1HNAA 3MAKA 2VCZA 5EY6A 3C8EA 4D73B 3HZ4A 3Q6OA 4PQ1A 3BD2A 2MBTA 1AUCA 4XS6A 5A4UA 2FY6A 1YZXA 2YJHA 3TUEA 1GRXA 3V1WA 1OC3A 4WXTA 1SYRA 1GH2A 1UN2A 1Q4JA 5CRWA 4PXOA 10GSA 2GZZA 2L4CA 3RDWA 5H5RA 1XWAA 3CRTA 1TI3A 1QK8A 3WT1A 5G5EA 1B8XA 2VLTA 5ECKB 3UBLA 4X43A 1GWCA 2H8LA 2DSAA 3GH9A 3LG6A 2L59A 1YQ1A 2H6YA 4GRFA 4ECBA 1NM3A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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