3ZVJD

Crystal structure of high molecular weight (hmw) form of peroxiredoxin i from schistosoma mansoni
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
168
structure length
168
Chain Sequence
MVLLPNRPAPEFKGQAVINGEFKEICLKDYRGKYVVLFFYPADFTFVCPTEIIAFSDQVEEFNSRNCQVIACSTDSQYSHLAWDNLDRKSGGLGHMKIPLLADRKQEISKAYGVFDEEDGNAFRGLFIIDPNGILRQITLNDKPVGRSVDETLRLLDAFQFVEKHGEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE
publication title Moonlighting by Different Stressors: Crystal Structure of the Chaperone Species of a 2-Cys Peroxiredoxin.
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma mansoni
molecule tags Oxidoreductase
total genus 33
structure length 168
sequence length 168
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
D PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3zvjD00
3H4KA 1SL2B 1DBYA 3KTBA 5F06A 2ES7A 3LYKA 2OE1A 2GGTA 2PN8A 1OYJA 5ECRB 4KW6A 1K0OA 5B6MA 1EOGA 2C0FA 2HXKA 2B7KA 4PQIA 3DVXA 5F05A 2H1DA 3GL5A 5ABRA 1TW9A 5LNKe 5A5KA 1PGTA 3CTGA 5IIZA 2L4CA 2JL4A 3LFLA 1T4YA 5B6NA 5ECKB 4OO5A 1AW9A 2JACA 3HVSA 2VO4A 2GSRA 4MF7A 5GAND 4PUFC 3DRNA 1N8JA 1Z9HA 3IOSA 4GWRA 1WOUA 3FR6A 2DJ1A 1UN2A 1ZMAA 2GQLA 4ZL9A 5ECPB 5DALB 22GSA 3GH6A 1A24A 4I2UA 4K1FA 4V2LA 8GSSA 2CVKA 1EV4A 3HKRA 1M2BA 1SYRA 5D96A 2EIOA 2LQOA 4X1UA 1WWJA 4KDYA 3PGTA 4I97A 5ID2B 4GTUA 3QDNA 4KCEA 2ZUPA 2P31A 2N5AA 5D93A 1M2DA 5G5FA 2PUKC 1XCCA 3VWUA 2FWEA 2MMNA 5EPFA 4XRDA 2H70A 3F9UA 3IRAA 1EEMA 1NHOA 2OA7A 3L9UA 14GSA 4YQMA 2CX4A 3NZNA 3TOUA 2HRFA 1K0DA 2G0FA 1IYHA 4ID0A 4XRAA 1THXA 1Z7PA 2YV7A 2LRNA 1SJIA 3L78A 1GWCA 2B5YA 3C1SA 1DUGA 4MZWA 2P5RA 5JWOB 1DSBA 3BCKA 2LS5A 2HT9A 1SKSB 1TRUA 3D5JA 5CRWA 3UVHA 5EY6A 3FZ4A 4GSNA 2CZ2A 2X8HA 4E8EA 1JZDA 2AUVA 3W8JA 2AV4A 1A0RP 5E4WA 2HZEA 3D22A 1O8XA 4O5RA 4K9ZA 4L5OA 2OACA 3IA1A 4NWYA 2B1LA 2CVBA 4Z7XA 4EKZA 4ZB9A 1U87A 5INYA 1BAYA 1LBKA 3TJFA 4OD7A 5DCHA 3WT1A 2BTOT 1ZCPA 1PX7A 1FHEA 3UEMA 4EE0A 1B9YC 3L4NA 1S3CA 4EF0A 1PKWA 4EO3A 3J7Yb 3D4TA 4EDYA 5JWQB 4LL4B 1UA5A 3IE3A 2C3QA 1WIKA 2PVQA 4PX1A 4MF6A 4N11A 3WT2A 1DE1A 4BVYA 1A2JA 2WCIA 2MMZA 2H30A 1AQVA 2WGRA 1M0UA 2O89A 2KLXA 5FT3A 1MD4A 1GNWA 3CYNA 5D9XA 4EVMA 3DVWA 4MJCA 3IHQA 1Z6NA 1T3BA 4MA9A 3F6FA 2JZRA 1G7OA 2VM1A 2XPEA 4TR1A 2PWJA 1AIUA 1OKTA 2YANA 3IC4A 2GQMA 3ZFLA 4IJIA 2GTUA 5J9BA 3GYKA 3C73A 3ZIJA 1GH2A 3QD9A 4QL7A 3IR4A 4JEDA 4L8EA 2LKUA 7GSSA 4MJBA 2ZNMA 5KN0A 2VIMA 4FYBA 5HFKA 5GZZB 2J23A 4NV5A 4ZBDA 5G30A 3GSTA 1F6MC 2O8VB 2GLRA 5ECOB 3CRUA 3RBTA 4KE3A 3RHBA 4HJ2A 1SL0B 3TOTA 3CMIA 3I69A 5HFIA 3VPTA 1FB0A 5F8BA 2AB6A 1SK2A 4OFTA 4MJAA 3I9V2 2B7JA 2L4QA 2X8GA 4ULXA 2KP1A 3D4MA 2FA4A 2VL2A 2DIZA 4YQVA 3KXOA 3UIWA 1ZZYA 1JZRA 5B8BA 1VRSD 2YPMA 5IPGA 5DAKA 3HZ4A 3WGEA 4JE1A 3KCMA 2YOIA 4KA0A 3GHAA 1MEKA 5ECHB 1FG4A 3F8UA 4IQ1A 5IMVA 1R5AA 2DJ2A 1JZOA 2DJKA 2PGTA 4J2FA 5ECSA 5L71A 4BPYA 2HYXA 2YN1A 2IWTA 5KN3A 2F3MA 2V6KA 3M1GA 4KGIA 2H75A 1XBSA 3GSSA 4KH7A 4KCAA 3A2XA 2CV4A 1F3BA 1HNCA 4GSTA 3E9JB 2O7KA 2WB9A 3G7IA 5HR1A 5J5NA 3LWAA 2ALBA 4XHMA 4G10A 5A4UA 1Y6EA 4POLA 4BA7A 2YWMA 3A5WA 2JSYA 2QGVA 1H4OA 5CO3A 4BWSA 5J41A 5LD0A 2H1BA 2VD0A 2DBCA 3NIVA 1XWCA 3H79A 3TJGA 3UVTA 1GUHA 1V98A 3QCPA 4ZBBA 1T1VA 4V2MA 1GUMA 4KSMA 3TUEA 3M0FA 1YEPA 3P7XA 5CAXA 3UOMA 4IW9A 2R3XA 2CVDA 6GSTA 1ABAA 1HNAA 5GAPD 2K6VA 4NHWA 1EGOA 6GSYA 6GSVA 4WBRD 1G0TA 2KOKA 2G2QA 1AAZA 1W4VA 2MMAA 4WETA 1V57A 2VLTA 1TK8B 3ZZXA 2VCVA 1O8WA 3CXGA 3MAKA 4XS4A 5HR3A 1R26A 1M99A 2PU9C 4N10A 4KDXA 2PVOC 2B6MA 3G7JA 1TRSA 2LNSA 3ZYWA 3DIEA 3HD5A 4I8BA 4O7HA 2FHEA 3HY2A 2V32A 2FA8A 4TXOB 4CDOA 3EMXA 2JZTA 3QAWA 1OC9B 1QXHA 2I9HA 1T00A 2C3TA 2IMEA 1B4PA 3J7Yk 1BX9A 3U6VA 3UARA 4HU9A 4WXTA 3LQ7A 4MABA 4OO4A 2M46A 4ACSA 2H6ZA 3D6IA 4HJMA 3APOA 2J9HA 1A2MA 4G2EA 4RQRA 3BBYA 2XC2A 1E6BA 3HXSA 4HOJA 4L0WA 3IAM2 4OFMA 1J08A 3UBLA 4NXIA 3TKSA 1EWXA 3TJBA 1J0FA 2P0GA 1RW1A 1TTZA 2OE0A 1XPVA 4FH8A 2QKEA 5IO2A 2B3SA 4ZILA 1ON4A 3QOUA 2VOCA 3TKSE 1XWGA 3EU4A 4ZB6A 1NSWA 1EV9A 5IOXA 1PSQA 1GL8A 3EINA 4JR4A 4LMWA 5AIXA 5DJLA 4HZ4A 1X5DA 3VI5A 2AAWA 4G9HA 3KH7A 4GLTA 2B5EA 1ERUA 3UAPA 4L0UA 1VF2A 1SJ6A 5H5QA 1X5CA 1X9MB 2VLVA 5G5EA 3TRXA 3GTUA 2H01A 1S3AA 4WF4A 1R7HA 4ZXGA 1PX6A 2FNOA 3GKNA 4AJ7A 20GSA 1OC8A 3TJJA 4F0CA 4GSSA 5HFGA 4HEA2 2H8LA 1HNBA 2L6CA 1I5GA 3IXRA 2F51A 2H6XA 3IK9A 3VWWA 4MH2A 2H0HA 4RI6A 4CHSA 2LUSA 4K8MA 1O7UA 1R4WA 1X9SB 2HRNA 3RHCA 1WRYA 3KMNA 2VCWA 2LSTA 16GSA 2H1GA 12GSA 4AGSA 4GXZA 3ERGA 4JZQA 1CQHA 1R5PA 2RM6A 1QK8A 2VAFA 3AY8A 1QMVA 3TKRA 5IMCA 2OE3A 4TRXA 3APSA 4K0GA 2LJAA 4N0ZA 1U6TA 3U5RE 1ML6A 1YJ6A 3C7MA 1JLWA 3KTLA 2GZZA 4IHUA 4ISDA 4LA1A 4F9ZA 5COHA 2IFQA 3IK7A 1HD2A 4JBBA 3F4TA 1THOA 1M2AA 3CTFA 4XCSA 1GUKA 2YWIA 2GVPA 2JZSA 4MZCA 2XHFA 11GSA 5GSSA 1QFNA 2I81A 1HYUA 4I2TA 1U3IA 3US3A 1SK1A 2VL2C 4K2DA 3SBCA 1BJXA 2HSHA 2RM5A 5IOWA 3FR3A 2WRTA 1AXDA 4EUYA 5J9CA 4JRRA 9GSSA 2GZYA 1GLQA 1LU4A 3WGDA 1EGRA 2C3NA 1QUWA 4ILFA 4POBA 1K0NA 2FY6A 1F3AA 2IPAA 2QC7A 3D0ZA 1GTAA 4KDUA 4PQHA 2L6DA 3P2AA 4IP1A 2LJRA 4TR0A 5IMAA 3ZIVA 1MDIA 1MD3A 2WJUA 1ZL9A 3Q6OA 3UBKA 1GNEA 4MPFA 5JCGA 4GF0A 4GQFA 4ECIA 3GKKA 1BYEA 4MDCA 3DGQA 4OCFA 3RPNA 2FGXA 2H19A 2V2GA 2K18A 4PGTA 1A0FA 3KEBA 4WF5A 3ZFBA 2AHEA 1FW1A 5HR0A 1E2YA 3M9JA 4I6XA 1SKWB 2FUG2 5H5RA 4IN0A 2R4VA 5CP1A 5D9WA 3F0IA 4V1Ap 2AYTA 2HZEB 3ZTLA 1YEXA 2E7PA 1SL1B 4N0VA 3VK9A 2GQKA 2E0QA 2EIQA 3HCZA 2JSZA 3M3MA 2CT6A 4HZ2A 2DJJA 1V2AA 3GN3A 6GSSA 5G1KA 4EL1A 4F03A 3FW2A 1QQ2A 2PMTA 5J4UA 2OBIA 2RUEA 4K7IA 1Z5YE 1B4QA 3LSZA 1WJKA 3MNGA 1EP7A 1VF1A 4K7NA 3KM6A 4ECBA 1M9AA 2IL3A 2NBSA 1XZOA 4ZBAA 1V40A 2C4JA 2F9SA 3C1RA 4P3YB 3LXZA 2VL9A 3TRQA 3FR9A 4H86A 1A2LA 4NMUA 4KSOA 1BEDA 5ECIB 5ECLB 2IIYA 4POMA 2VCTA 1RQMA 1ZGNA 1JLVA 18GSA 3RDWA 2N5FA 4HQSA 3JCML 4HUAA 4TR1B 3CSHA 2IMKA 4Q5QA 3MDKA 3TKQA 3LG6A 1B8XA 1YKAA 2IN3A 1OAZA 4D73A 3FK8A 3F3RA 2HZFA 3MSZA 3KGKA 2M80A 1F37A 2H72A 17GSA 4OCEA 1TKDB 3IBHA 2YCDA 1SD8A 3HJOA 3P8WA 2GSTA 3TKSC 4TW5A 3H8QA 1GSYA 1AQWA 2QSIA 1QGVA 2MMOA 5DVBA 2B1KA 3N9JA 2LRTA 4MMMA 2HE3A 2MBSA 2XBIA 3IAS2 4DSSA 1OE8A 3DWVA 3IV4A 5ECMB 3TDGA 1GLPA 4MH3A 4PUAA 1X0RA 1YF0A 4NHZA 2C8UA 4YH2A 3G9BA 2RUFA 2OBKA 2R2JA 5ENUA 4TR4A 1SD9A 1X9WB 1JHBA 1U88A 1AQXA 1FO5A 1V9WA 4ECJA 2GS3A 2FWFA 3CSIA 3NOFA 1Y25A 3CBUA 3PINA 4EDZA 1XW9A 2GZPA 3FRCA 2V6OA 5A4WA 4YAVA 1ILOA 3GMFA 5DAKB 4QQ7A 3E3EA 1ERVA 4TN8A 3O6TA 1A23A 4MCUA 1J9BA 4XS6A 5C00A 2YV9A 3Q18A 1MDKA 1NHYA 2LV3A 5LCZA 3GRXA 1EEJA 1GP1A 2NVLA 3GX8A 4KAEA 4CW9A 5IMDA 3KJYA 4ZB8A 1XOAA 2LJKA 3ZMKA 1GSFA 2VLUA 1PA3A 2H66A 4RUVA 1XVQA 3GL3A 3VURA 2YP6A 2ON7A 3GIXA 2TIRA 2HI7A 2K9FA 5DJMA 2OJLA 2CA8A 3GH9A 4O92A 3LYPA 1TDIA 3F6DA 2CAQA 2C0EA 2H1AA 4ML6A 1GSEA 1YKCA 1SENA 4OFNA 1ERWA 5CRDA 5D9TA 4MLYA 1T8EB 3M8NA 4TKYA 3HYPA 5CREA 2OADA 1T4ZA 3TKPA 4O32A 3N5OA 4KX4A 3FZ9A 5ECNB 1Q98A 3O3TA 2PPTA 4PNFA 3L9VA 1TOFA 3DKSA 2GT5A 3HZ8A 2MYGA 4DSQA 4MF5A 3P90A 2GT6A 4DSRA 2K8SA 3KIJA 5D73A 1GSDA 3Q19A 5CNWA 4DVCA 4IS0A 2NPBA 2WS2A 1GRXA 5DQYA 2D2ZA 3EE2A 3QAVA 3DMLA 4F2IA 5AN1A 3F4RA 5EVOA 1WE0A 2IJYA 3O76A 5F0GA 1GSQA 4XS4B 1XVWA 2YNXA 1XWBA 1K3LA 1MTCA 2FCHA 3EU3A 3EMPA 3D21A 3VPQA 5CYYA 2H0GA 3LGCA 2VM2A 5AGYA 1A8LA 13GSA 4Q5NA 1DE2A 3QFBC 3GA4A 3TJKA 1ZOFA 5DQSA 1V58A 5D9VA 1ACVA 2FD3A 1PD21 4XIHA 5AIVA 2C80A 1OE7A 4GQCA 2O87A 1EZKA 3V1WA 1SJZA 3WD6A 1PMTA 5IQYA 3GFKA 2H76A 4IQAA 1PKZA 5DALA 3WYWA 4FO5A 2DJ0A 4L5LA 4PQ1A 4Q5RA 1G6YA 1PN9A 1GULA 2LEGA 2CAIA 2YJ7A 4TVEA 3VFIA 4ZL7A 2N5BA 1SU9A 5AISA 2C1YA 1H75A 5ID2A 2JU5A 3QAGA 3Q74A 2OKAA 2A2SA 4Q5FA 4FYCA 3BCIA 1TRWA 5GSTA 1XW5A 3W8SA 4JU5A 1FB6A 1FVJA 3RPPA 1BQ7A 1XWAA 3UL3A 1SKRB 2F8AA 5G1LA 1TI1A 2CQ9A 1NW2A 3E0UA 3KP9A 1YDKA 3ZMLA 3TB2A 4MPGA 3GTUB 3GKMA 5FWGA 4TOPA 1K3OA 3ZREA 3C71A 4NAXA 4YAPA 1UC7A 3HVXA 3EURA 4AJ8A 4K0NA 1G6WA 1WPIA 4J56E 2IMFA 4HU7A 4X43A 4IP6A 3W6GA 2KUCA 3FY7A 4N30A 2WZ9A 4BL7A 4NPBA 1WP0A 1FVKA 3LEFA 3MWHA 2B5XA 4ECCA 3GKXA 4MJEA 3KZQA 1YQ1A 1A8YA 4BWQA 1XW6A 1I9DA 2M72A 2IMDA 1MDJA 1G7EA 5JCUA 2WDUA 1SYXA 5HR2A 1M9BA 2R6KA 4TR3A 4HS1A 1AUCA 2XPDA 3A2VA 3PR8A 2WFCA 2KP2A 2IFQB 3OR5A 1EP8A 2MZCA 1TP9A 2CZ3A 3HDCA 1JFUA 4TXVA 4PURA 4DEJA 3WGXA 4POKA 3VWXA 4PNGA 3HJMA 1XXUA 3DEXA 4AJ6A 3ZVJD 3R2QA 2DIYA 2L5OA 5DBQA 5ELGA 2X8CA 5ELAA 5KEJA 1O81A 5CRHA 3EWLA 1U3AA 2PBJA 4OWYA 5H5SA 1PRXA 4AF2A 2DMLA 1XWKA 2K8VA 4RQXA 2TRCP 1N2AA 2R37A 1KEBA 2AJQB 1VF3A 2F8FA 2WULA 3H93A 5JCWA 3FZAA 5G2ZA 4LL1B 2YZHA 1SK0A 3F4SA 4K7OA 10GSA 5IM9A 2RIIA 2YWNA 2LQQA 2HFDA 5B8AA 1HQOA 2H73A 4GCIA 1K0BA 1NM3A 2FLSA 3F3QA 2NTOA 2H74A 1AC1A 1UVZA 1RK4A 4ML1A 4QL9A 2A4VA 5KN1A 1VGLA 4V1Ag 2C0DA 2DSAA 2TRXA 2VCQA 2VL3A 2H6YA 1FOVA 1KNGA 4PXOA 3BJ5A 2HLSA 3EC3A 3PH9A 2REMA 4IGJA 2HSYA 1TK5B 3FKFA 1Z7RA 5IPHA 3HVVA 4IKHA 4V2NA 2XBQA 3UMAA 3ZVJA 2GSQA 3M9KA 3A2WA 1JZWA 1O73A 2HNLA 2O85A 3ZLPA 3ZRDA 3FEUA 3S9FA 1Z6MA 1IYIA 2V41A 2DMMA 5HQPA 2VD1A 3TRPA 5FHIA 3ME7A 2E2GA 1Z3EA 1ZYEA 1TRVA 1KTEA 3HHVA 4FYUA 3EYTA 2NDOA 1PL1A 1W89A 2E2MA 1O6JA 1GSUA 2P5QA 1KBNA 2JADA 3ISOA 1GTIA 1K0CA 4HQZA 1F2EA 3BOAA 1YF1A 5ECQB 4GRFA 1ST9A 1ERTA 2A2RA 3VLNA 3GURA 2L5LA 1C72A 1XOBA 1OKDA 2I3YA 4E8HA 1B48A 2BMXA 4RI7A 5J3RA 3L0HA 1YZXA 2KHPA 2ON5A 5CRGA 4LLRA 3ZITA 1X5EA 1S3DA 2GDRA 4ZIJA 3GX0A 3GUSA 1FAAA 4YQUA 3QPMA 3ZL5A 2YJHA 3HJPA 3I43A 2L57A 4MZBA 3GV1A 2PERA 2YZUA 4D73B 2VCZA 1T7PB 1GTUA 3KMOA 4WBJA 2Z9SA 3G7YA 2GSSA 3H1NA 4OMVA 4HI7A 6GSWA 2X64A 2C0GA 3BD2A 3ERWA 3ERFA 4NV2A 1TU8A 2RLIA 3HA9A 4XTSA 3TCOA 4DSSB 5G31A 4XS1A 3QMXA 3L9SA 3LJRA 4BVXA 2LRCA 3C8EA 4WKWA 1USBA 19GSA 2DJ3A 5F07A 2CX3A 3A3TA 2EC4A 3SWLA 1VF4A 3FZ5A 3RAZA 6GSXA 4KB3A 1K3YA 3KD0A 5C04A 4IVFA 6GSUA 3TGZA 2V1MA 2I1UA 1TI3A 4WR5A 3ME8A 5KN2A 4LMVA 2LNTA 5IMZA 1O85A 4MP4A 3KP8A 5IO0A 5A4VA 2VUPA 1YY7A 5EL8A 1M7TA 4JR6A 3ED3A 1PQNA 4WR4A 1ZYQB 3CRTA 3K8NA 1TU7A 3EVIA 1TJDA 4TXOA 2MBTA 1OVNA 2VCXA 1B9XC 4G19A 3DYRA 4HDEA 3FHKA 1OC9A 1XIYA 1URMA 3LXTA 3CSJA 1LJRA 1WMJA 2IMIA 3QFAC 5DDLA 4I5QA 2I4AA 1BG5A 5JWRB 4IBPA 2R5GA 2EIRA 2YWOA 4KNDA 2DLXA 1F9MA 1Q4JA 2DC5A 3I6AA 2H0IA 4KUNA 3IPZA 5E59A 2LTKA 2FWGA 1XFLA 4EC0A 1CQGA 1TK0B 2FWHA 4J57E 3APQA 3KH9A 2X99A 4WEYA 4F0BA 5DCGA 4EXJA 1TXXA 2H71A 4X0XA 1GSSA 4MK3A 1OC3A 3FYGA 4K6XA 1PL2A 2ZCTA 5B7CA 3DD3A 3F63A 3UJ1A 5D8IA 3LORA 2L59A 3GNJA 3VI7A 4F82A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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