3TB2A

1-cys peroxidoxin from plasmodium yoelli
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
219
structure length
218
Chain Sequence
GYHLGATFPNFTAKASGIDGDFELYKYIENSWAILFSHPNDFTPVTTELAELGKMHEDFLKLNCKLIGFSCNSKESHDKWIEDIKYYGKLNKWEIPIVCDESRELANKLKIMDEQEKDITGLPLTCRCLFFISPEKKIKATVLYPATTGRNAHEILRVLKSLQLTYTTPVATPVNWNEGDKCCVIPTLQDDEISKHFKNEITKVEMPSKKKYLRFVNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural genomics,unknown function
source organism Plasmodium yoelii
publication title Genome-scale protein expression and structural biology of Plasmodium falciparum and related Apicomplexan organisms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 1-Cys peroxiredoxin
total genus 64
structure length 218
sequence length 219
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain2 3tb2A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tb2A01
4PUAA 4KW6A 3VLNA 1EZKA 1A23A 1WIKA 3H1NA 3D0ZA 4OO4A 4POMA 2LNTA 2VCQA 4KAEA 4Z7XA 3F0IA 1MDIA 1YF1A 2TRCP 3EVIA 3RBTA 3GKKA 1SL1B 5G1KA 3NOFA 2PMTA 1SENA 4HEA2 2FWFA 3SBCA 1NSWA 4HQSA 4LL4B 3ZFLA 1JZWA 1QFNA 4ZBAA 1S3CA 2ON7A 4KGIA 4HS1A 2R5GA 1DUGA 2CAIA 3QPMA 2JACA 2L57A 1B9XC 2GSRA 4K7IA 5ECHB 3GX8A 4NWYA 1ZZYA 3SWLA 4MF6A 2MMZA 3I43A 5J9BA 1TOFA 1GTAA 2XBQA 2OKAA 2H6XA 2C3QA 4XCSA 3EE2A 1E6BA 2QC7A 5DCGA 3HDCA 2B7KA 1J08A 3IDVA 3KGKA 4POKA 1ACVA 3ZRDA 5FHIA 3CMIA 3G7JA 2YNXA 5IM9A 4WETA 4MA9A 1R5AA 2K6VA 4K7NA 2H1GA 1JLVA 2V1MA 3TKSA 9GSSA 4IN0A 1M9BA 2LKUA 1SYXA 6GSXA 1I9DA 2I9HA 3GURA 2L6DA 1ERUA 1JFUA 7GSSA 2B1LA 2TIRA 2VOCA 4D73A 3IA1A 3D5JA 2C0GA 2OBKA 4J56E 2AHEA 4NXIA 2VAFA 1U3AA 5JWRB 4RI6A 2EIRA 4GXZA 4E8HA 4X0XA 1XWBA 2XHFA 1A2MA 5GAND 2P31A 3IE3A 3ZLPA 3C8EA 3E0UA 1UVZA 3Q74A 2LRTA 2KP1A 2X99A 1TI3A 3EC3A 5JWOB 4D73B 4TR1A 2AJQB 2ZNMA 2VCZA 1YEXA 4RI7A 5DJMA 2OE3A 3GRXA 4O32A 17GSA 1Q4JA 3GHAA 1WJKA 4BVXA 3MDKA 3WGDA 2R37A 2DMLA 4TN8A 2LRCA 1T3BA 1GRXA 4FIWA 4OO5A 1FG4A 4JR4A 2DC5A 4F0CA 2FLSA 1K3OA 2HYXA 3I9V2 3GUSA 2JZSA 4TR1B 3IOSA 2GGTA 1GSUA 1EGRA 2YOIA 2O8VB 4ZL7A 2VL9A 5G1LA 2OADA 1G7EA 3L9UA 3LJRA 5GZZB 5G5FA 1B9YC 3LQ7A 3LXZA 2CT6A 2YJHA 4ZBBA 3FZ4A 5IOWA 2OACA 3W6GA 1OE7A 5J3RA 5J5NA 4OWYA 5EY6A 1TK8B 4LMWA 1WPIA 3GKMA 4EO3A 2O85A 5AISA 3QD9A 1NHYA 5DQSA 2VCVA 2WJUA 1TDIA 2PN8A 2XPDA 1FVKA 2JSZA 3QDNA 3HVVA 3EU4A 4JU5A 5IO0A 5IIZA 1CQGA 2RM6A 4EC0A 3S9FA 4TW5A 1NM3A 3H79A 3C73A 1GUMA 2OJLA 2L4QA 4TVEA 3QMXA 2IFQA 4TXVA 3UBLA 3VWVA 2RIIA 2H75A 1WE0A 4IP6A 5D9TA 2VCWA 2CVBA 2YV7A 2HSHA 4MDCA 4JBBA 4F9ZA 2O7KA 2PVOC 2CZ2A 4TRXA 3TDGA 2IMDA 2KUCA 3Q19A 3UJ1A 3UMAA 2B1KA 4ECIA 3M9JA 2YWIA 4TR0A 2OE0A 3U6VA 2IFQB 1B8XA 1ERWA 4EVMA 1O8WA 1EOHA 3M1GA 4KNDA 3ZMKA 4L0WA 6GSSA 1VF1A 4KCEA 1GUHA 2F8FA 4HJ2A 1A0FA 3FZAA 1XWCA 3A2VA 3MNGA 2IJYA 3DXBA 4WR4A 4WR5A 4BWQA 3UOMA 4MJBA 2B5YA 2X8HA 4KDUA 2YV9A 22GSA 4K8MA 3PGTA 2ZCTA 5L71A 3BOAA 2FA8A 3GN3A 3DWVA 2GZZA 2JSYA 5F07A 3GH6A 3TKSC 1HQOA 3PINA 2D2ZA 4XRDA 4CDOA 1V57A 1VF2A 3EMXA 3LEFA 4NPBA 2V6OA 2WFCA 3HD5A 2LS5A 1PKWA 5A4UA 5J41A 3F6FA 2V32A 4MZBA 2X8CA 1AUCA 2CZ3A 2VCXA 3UVHA 4GWRA 3EURA 1YY7A 1RK4A 5GSSA 3CRUA 1ML6A 1URMA 2FY6A 5INYA 4IKHA 3MWHA 4G9HA 3O3TA 1A8YA 4DSSA 5F05A 1BX9A 1M2BA 2ZUPA 3KTLA 3IBHA 3EINA 6GSYA 3TRXA 1F9MA 2DLXA 3W8SA 4IS0A 2H1BA 2YZUA 4V2LA 2KP2A 4EDYA 5IO2A 1GULA 5CP1A 1O85A 3ERFA 3TKQA 2WZ9A 2H76A 4G10A 3P8WA 2JADA 4N30A 3MAKA 2AV4A 2FUG2 1SK1A 4TKYA 5DJLA 1EP7A 4DSSB 2HXKA 4GF0A 1Z6MA 3GX0A 2M46A 3DGQA 2C80A 3APOA 12GSA 3PR8A 4AJ7A 1O81A 2E0QA 1ZYQB 2FCHA 3KMNA 1GP1A 5B6NA 3LWAA 1TJDA 2JL4A 3FHKA 1YJ6A 1IYIA 2DIYA 4GTUA 3BCIA 3E3EA 6GSTA 2B3SA 4ZL8A 1HNBA 3DMLA 3FKFA 2GVPA 2B7JA 2FWEA 1SKRB 2LUSA 3VURA 3TOTA 1JHBA 2H71A 1AC1A 1RW1A 2WRTA 3O76A 2YN1A 4OCFA 2F51A 4MPGA 2HLSA 1PGTA 3A2XA 1XOBA 5C00A 1UN2A 1S3AA 2CVKA 3H8QA 4QL9A 4N11A 2GSQA 3KJYA 1K0MA 2VUPA 4LLRA 2DMMA 1TK5B 1V9WA 2VD0A 4ULXA 5F0GA 1U6TA 3TJGA 3KCMA 4JZQA 5CO3A 3HJMA 1M7TA 4HU9A 1OAZA 4L5LA 2H0GA 5CAXA 3VPQA 2C3NA 1QUWA 2WCIA 4K1FA 1SK0A 1VF4A 3ZYWA 1XW6A 1BG5A 2DSAA 4IJ3A 3M0FA 1Q98A 3GV1A 2WS2A 1M99A 1V40A 2GSSA 5G2ZA 4XS1A 1OKTA 5HR1A 1SL2B 4N0VA 1N8JA 3KD0A 3ZFBA 4ID0A 5ENUA 2VLVA 3IAM2 1PKZA 3P7XA 2HT9A 4MMMA 1YKAA 1MDJA 3H93A 4MLYA 2C1YA 2DJ1A 4WBJA 5CRDA 3HYPA 3F9UA 2HE3A 3WGXA 5IMCA 3UBKA 4MZWA 1X9SB 3ED3A 1G6WA 1SL0B 2Z9SA 5B8AA 2QKEA 2FD3A 3KTBA 4ACSA 4ZILA 3JCML 1T1VA 5IPHA 3ZZXA 3D4TA 1J9BA 3TJKA 4QL7A 4ECJA 2RUFA 4PUFC 4ILFA 3LYPA 1TRUA 2NDOA 3F8UA 2P5RA 4AJ8A 5ELAA 1M2DA 2KHPA 1R26A 2JZTA 5GSTA 1U88A 3LORA 2A2SA 3IHQA 4ZB9A 3F6DA 3GTUB 1HNAA 20GSA 1XPVA 3D21A 3ZMLA 4KDYA 1TW9A 3UIWA 4O7HA 6GSUA 3QAVA 1SU9A 1X9MB 3TRPA 1PRXA 3RPPA 5LD0A 4WBRD 2FHEA 4FO5A 5DALA 18GSA 3TGZA 1GSFA 3LGCA 5JCUA 1EOGA 1UA5A 3CBUA 1GWCA 3VFIA 4Q5FA 2RLIA 2YZHA 4IQ1A 1DE2A 3CTGA 1QMVA 4POBA 1DE1A 4MJAA 1G7OA 1BQ7A 2GTUA 1Z5YE 8GSSA 3FR3A 1A2JA 1KEBA 1Z7RA 3C71A 3FR9A 5DALB 3VI7A 2FGXA 3C7MA 1A0RP 4FYBA 2IMFA 2PERA 3TJFA 2GDRA 1HD2A 3TOUA 3UEMA 1SKSB 4KSOA 1GSSA 3FW2A 4OD7A 2HRFA 3RAZA 2G0FA 3A2WA 2HI7A 2VM2A 5A5KA 2MYGA 4MF7A 4F03A 3FK8A 5DDLA 1M0UA 2K9FA 1YDKA 5H5SA 2A2RA 4OCEA 4NHZA 3IV4A 2OBIA 3DVXA 11GSA 3LXTA 3P90A 1WOUA 4MABA 2HFDA 5IMZA 2IMEA 1A8LA 1GSQA 2REMA 4ZL9A 1V58A 1XWGA 4NV5A 4GQCA 3NZNA 5HFIA 4I8BA 2DIZA 2ON5A 1OVNA 4TR3A 4HUAA 2B5EA 2DBCA 3FEUA 1EGOA 3P2AA 4ECBA 4EDZA 1F37A 1SD8A 3F4TA 5ECNB 2V41A 1U3IA 4PGTA 1X0RA 2GZYA 5G31A 4I2UA 4ZIJA 2L5OA 4ML1A 3ERWA 1GH2A 3ISOA 2PBJA 2X8GA 2NVLA 1PN9A 3TJBA 2P0GA 4YQVA 6GSWA 3L78A 5AN1A 5AIXA 2I81A 3HKRA 2H6ZA 4XTSA 4KB3A 2YANA 1EV4A 5CYYA 2ES7A 4DSQA 2O87A 1HYUA 1TU8A 1PMTA 2DJ0A 3LYKA 2RUEA 3BJ5A 3KP8A 2YP6A 1AQWA 3L4NA 4MJEA 4HI7A 1ZOFA 3HXSA 2F8AA 1AQXA 5CNWA 4K0NA 4MP4A 5AIVA 3LG6A 4IW9A 5D9VA 1BEDA 4OMVA 3Q6OA 1TK0B 3K8NA 3D6IA 2CX3A 16GSA 3C1SA 2FWHA 5FWGA 3U5RE 3E9JB 2YWNA 4K0GA 2VD1A 1ERTA 2CV4A 1FB0A 1HNCA 1GL8A 2FWGA 1TTZA 3M9KA 5A4VA 4MPFA 5ELGA 1R7HA 4HZ2A 2GLRA 5D73A 3V1WA 1F6MC 2R2JA 3QR6A 1XZOA 1QGVA 1SK2A 2IMKA 2F9SA 6GSVA 4OFMA 2N5FA 2PU9C 4L0UA 2GS3A 1GNEA 3ERGA 1WWJA 1OKDA 3KH9A 4KA0A 2J23A 19GSA 4DSRA 3HVSA 2LV3A 1LJRA 2C8UA 3LSZA 1W89A 2C3TA 4MH2A 1OC3A 4I6XA 4F2IA 2IN3A 1QK8A 4GQFA 3VWWA 5IMAA 1XFLA 2AB6A 3TB2A 5KN1A 2AYTA 2NPBA 4YAVA 1FAAA 4HDEA 5ECMB 3F63A 4JE1A 3GKXA 4KSMA 5DQYA 3RHCA 5CREA 1OE8A 3GSTA 1JZDA 2MMAA 5ECRB 1PL1A 1K0AA 3KIJA 2BTOT 2EIQA 3AY8A 2OA7A 3HY2A 1DSBA 4AF2A 3TKPA 4PNFA 1G0TA 4YAPA 1K3LA 2QGVA 4XS4A 5H5QA 2WGRA 1PX7A 1U87A 3N5OA 2JZRA 3UVTA 4NV2A 3WYWA 5KN2A 5D9WA 3H4KA 4MCUA 3TRQA 4V1Ag 5LNKe 2VIMA 4PQHA 3GL5A 4JRRA 4K2DA 1PQNA 3KEBA 4MZCA 1Y6EA 4IELA 2HSYA 5HR2A 1Z3EA 5E4WA 3IC4A 1PX6A 4XS4B 1XWKA 4GSSA 1EEMA 2L4CA 2I4AA 2VM1A 1I5GA 4HZ4A 2GQKA 3QAGA 5F06A 3APQA 2OE1A 3EMPA 2WDUA 5DCHA 1V98A 5FT3A 2YPMA 4TXOB 1YQ1A 4POLA 1FW1A 4F0BA 3CXGA 4J2FA 4Q5RA 2IIYA 1QXHA 2PGTA 1ST9A 2GSTA 2LNSA 3GFKA 4TR4A 3HCZA 4X43A 4NAXA 3UAPA 1M2AA 1A24A 5KEJA 5D93A 4P3YB 3HZ4A 2L5LA 4RQXA 2K8VA 5J9CA 2M72A 3TJJA 1AW9A 2X64A 3DVWA 4GSTA 2GT6A 4I2TA 4FH8A 4XRAA 4AJ6A 1O6JA 4H86A 1GLPA 2WB9A 2VL2A 4G2EA 2H1DA 2CQ9A 4HQZA 4XIHA 4O92A 2J9HA 3OR5A 1TRWA 1GTBA 2XBIA 2XPEA 4ISDA 4EF0A 3PH9A 1KTEA 4MJCA 1OC9A 1SYRA 3RDWA 4PQIA 4ZB8A 2WULA 2HZEA 1XBSA 2HZFA 4PX1A 5ECPB 1WMJA 3ZREA 3HHVA 4BWSA 2I3YA 5IQYA 2CVDA 3W8JA 2PWJA 2LQOA 5HFKA 3F3RA 4PQ1A 2MMOA 2BJXA 4KX4A 1LU4A 1GUKA 2C0DA 1R5PA 1OC9B 5IMVA 1Z9HA 2HZEB 5ECLB 1K3YA 2PPTA 3KM6A 4TOPA 3US3A 5A4WA 4ML6A 4BPYA 2VCTA 3ZIJA 4NMUA 1JLWA 4L5OA 4PXOA 4WXTA 3EWLA 3QFAC 1MDKA 2YWOA 4YQUA 3EYTA 5HR3A 1H4OA 3GTUA 4XHMA 1LBKA 1FVJA 1GSEA 3Q18A 2VO4A 2DJJA 4EL1A 3EU3A 5D8IA 2CA8A 1RQMA 4OFTA 4HOJA 3VWXA 1XVWA 4RUVA 4I97A 5EPFA 2GZPA 4Q5NA 2HRNA 3WD6A 1VF3A 2ALBA 3O6TA 1T7PB 1AAZA 4KDXA 1SJZA 5ECQB 1XWAA 4GLTA 4KCAA 5D96A 1H75A 4N10A 3FRCA 4IJIA 4MK3A 5HR0A 3VWUA 3ME7A 2H0IA 4IQAA 4KH7A 1T4YA 3KZQA 5ID2A 3HA9A 5ECKB 3TUEA 3DIEA 1OC8A 2R6KA 1IYHA 2H8LA 2YWMA 1EEJA 1FB6A 1F3BA 3DEXA 1BYEA 2JU5A 1OYJA 4CW9A 3L0HA 3GA4A 4YH2A 2A4VA 4IP1A 2VLTA 4JR6A 3DYRA 3FZ5A 5HQPA 2R3XA 5ECSA 1G6YA 5ID2B 4LL1B 3ZVJA 2H0HA 1FOVA 2E2GA 5LCZA 4XS6A 5DAKA 1VGLA 4WEYA 3NIVA 3CTFA 2M80A 5KN0A 4J57E 3F4SA 3IRAA 2TRXA 5ECOB 1JZOA 2H74A 1T8EB 3L9VA 1B48A 4EUYA 3BCKA 1AXDA 2C0EA 4DVCA 4IVFA 1NW2A 3FZ9A 3QCPA 3DKSA 5E59A 1K0BA 1USBA 4DEJA 4BA7A 5DAKB 4MF5A 4EE0A 2MMNA 1GLQA 2H19A 2MBSA 2C4JA 4V2NA 2NTOA 3GMFA 14GSA 1K0CA 4LA1A 4ZXGA 3IK7A 5CRGA 1O7UA 2VL2C 2H1AA 3GNJA 1ABAA 3GH9A 2PVQA 1GSYA 1F3AA 2QSIA 2PUKC 4IBPA 1YZXA 5JWQB 3IK9A 1ZGNA 4F82A 1N2AA 4G19A 2LJKA 1MTCA 3CSIA 1XW5A 1K0DA 3ZL5A 2H73A 2VL3A 3QAWA 2N5AA 2K18A 2LRNA 1V2AA 3CYNA 1AQVA 3RHBA 3ZVJD 5DVBA 2IWTA 3F4RA 2LTKA 1VRSD 1X5CA 1EV9A 3ME8A 3BD2A 3TKSE 1TKDB 2E2MA 2R4VA 1ZL9A 1T00A 1NHOA 3ZITA 3WT1A 1J0FA 3G7IA 5KN3A 4PNGA 1O73A 4E8EA 1DBYA 3UARA 4Q5QA 1TXXA 4IHUA 2V6KA 3VI5A 3CRTA 2GQMA 3GKNA 4BL7A 1FO5A 1EP8A 1KBNA 4K7OA 10GSA 4HJMA 4O5RA 1WRYA 3F3QA 2CAQA 5EVOA 1Z6NA 3FY7A 5D9XA 5GAPD 2AUVA 3I6AA 1TU7A 1GNWA 1GSDA 3TCOA 2FNOA 4FYCA 1UC7A 3VK9A 4EXJA 4RQRA 3G9BA 2B6MA 1SJ6A 1ZYEA 1TP9A 2IPAA 4QQ7A 1GTIA 2GQLA 5COHA 4K9ZA 5G30A 2KOKA 2DJKA 4I5QA 4EKZA 5IMFA 3FYGA 3A5WA 1TRSA 2LJAA 1XVQA 2MZCA 5JCWA 4KUNA 1E2YA 2DJ2A 5H5RA 3IPZA 4ZBDA 2YCDA 1XCCA 3APSA 1SD9A 1C72A 2MBTA 1KNGA 2DJ3A 4HU7A 2AAWA 5G5EA 2VLUA 1B4QA 3WGEA 2EIOA 4N0ZA 2H6YA 2NBSA 2I1UA 2H72A 1T4ZA 3HZ8A 4IGJA 5HFGA 5EL8A 1WP0A 4KE3A 1SJIA 5DBQA 2H01A 3D4MA 1S3DA 1SKWB 3HJPA 2C0FA 1PL2A 4ZB6A 3KXOA 3R2QA 2O89A 3QOUA 1AIUA 2GT5A 2LEGA 5ECIB 1B4PA 1Z7PA 4JEDA 1K0OA 1YEPA 2LQQA 4V2MA 4WF5A 1X5EA 3LFLA 4TXOA 1GTUA 3GIXA 2V2GA 2F3MA 3L9SA 3GYKA 4YQMA 1CQHA 3I69A 5C04A 3IR4A 4X1UA 2L6CA 3ZIVA 3QFBC 4WF4A 3N9JA 2RM5A 3GSSA 1XOAA 5IPGA 1TI1A 5CRWA 2H70A 2KLXA 1ILOA 1THOA 1THXA 5B8BA 2L59A 3M8NA 13GSA 4GCIA 2P5QA 5AGYA 2H30A 4WKWA 4CHSA 4BVYA 3HJOA 1K0NA 5J4UA 2IMIA 2H66A 2G2QA 1EWXA 3ZTLA 1PD21 2E7PA 3J7Yb 3MSZA 3CSHA 1F2EA 2LSTA 5B7CA 2N5BA 2K8SA 3RPNA 4ECCA 2IL3A 1MD3A 2HNLA 2LJRA 4NHWA 1BAYA 2CX4A 4LMVA 2YJ7A 1X5DA 2XC2A 3HVXA 4GSNA 3BBYA 2B5XA 2EC4A 1O8XA 3GL3A 1W4VA 1X9WB 3WT2A 2BMXA 1MEKA 1PA3A 1R4WA 1PSQA 5IMDA 1ERVA 5B6MA 1XW9A 3TKRA 1M9AA 4FYUA 5CRHA 1XXUA 3G7YA 3KH7A 3CSJA 3FR6A 2FA4A 1XIYA 1Y25A 5ABRA 5IOXA 1ZCPA 3KMOA 3VPTA 3C1RA 1ZMAA 1MD4A 3UL3A 4PURA 1YF0A 3D22A 1JZRA 4MH3A 1A2LA 3A3TA 4GRFA 4OFNA 1QQ2A 3KP9A 1BJXA 5F8BA 4AGSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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