1UVZA

Structure of human thioredoxin 2
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
HGSTTFNIQDGPDFQDRVVNSETPVVVDFHAQWCGPCKILGPRLEKMVAKQHGKVVMAKVDIDDHTDLAIEYEVSAVPTVLAMKNGDVVDKFVGIKDEDQLEAFLKKLIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Oxidized and Reduced Forms of Human Mitochondrial Thioredoxin 2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 32
structure length 110
sequence length 110
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1uvzA00
2H1GA 4I6XA 4E8HA 3TKRA 2DMLA 1ILOA 2H1AA 1AW9A 1OKDA 3M9JA 4FIWA 3WGXA 1U6TA 1MDJA 2VM1A 2VD0A 4LLRA 1B48A 1ZZYA 3GKKA 1YZXA 1V57A 2O87A 2IMKA 2VLVA 1XVQA 5HR0A 1B9XC 4JR6A 4GWRA 4MZBA 4X43A 1OKTA 3VWUA 1FG4A 2F51A 5G2ZA 1AQXA 3FW2A 5L71A 2VIMA 3LFLA 2GQLA 2LV3A 3GSTA 1TDIA 2RM6A 2M72A 2PMTA 1O8XA 4F0CA 1PX7A 1THXA 4Q5NA 1YJ6A 2YPMA 1SKSB 5COHA 2YOIA 2KP2A 3GKXA 3VK9A 1EOHA 4TXVA 4WETA 4IKHA 4F9ZA 2LSTA 5A5KA 4AJ8A 4IVFA 1FHEA 1JZRA 4BPYA 3UARA 4I8BA 2K18A 3G7JA 3VWWA 3NIVA 1QGVA 3L4NA 1TKDB 1T7PB 3R2QA 1E2YA 5CRGA 1WWJA 3CBUA 2P5RA 3F6DA 3TKSA 4TW5A 3F4RA 5CAXA 2I9HA 1K3OA 1K3LA 2NVLA 4PNGA 3G7YA 2HI7A 5LCZA 3GH6A 4HS1A 5IO0A 1M2AA 3GL5A 1BG5A 1A0FA 1VF1A 2HT9A 3FYGA 14GSA 2F8FA 3TRPA 1WMJA 2GDRA 4MH2A 4K7IA 2VD1A 1Z9HA 1GNEA 3F4TA 19GSA 1TXXA 4TR1A 2C3TA 2HNLA 1YQ1A 4F0BA 3TCOA 1ST9A 2LNSA 5EVOA 3KTBA 1JFUA 2DJ2A 5G5EA 1V40A 1EP8A 3CTFA 3ZTLA 1F37A 2FWGA 4HOJA 3HY2A 5IM9A 3L9VA 1TI1A 4LA1A 1X5CA 1OE7A 4TVEA 3H8QA 4ACSA 3KZQA 1OC8A 2JSYA 2HE3A 3HZ8A 3ZVJA 4KSMA 3JCML 3BD2A 1XXUA 5CREA 1B8XA 2CAIA 4OD7A 2TRXA 1GRXA 3IHQA 1KNGA 2OE3A 4XRDA 3ZMLA 4WR5A 4EXJA 2L5LA 10GSA 3ZL5A 4FYBA 2K8VA 1A2JA 1PKWA 3LSZA 2E7PA 2H0GA 4MJAA 2WGRA 3HHVA 5EL8A 4F03A 4EDZA 4IJIA 1JZDA 1TJDA 1LBKA 4NMUA 2H6YA 3O6TA 2L57A 2PGTA 1PN9A 5J41A 1G7OA 1DBYA 1M2DA 2VM2A 3PH9A 1CQGA 1B4QA 3P8WA 4ZB8A 5F07A 5KEJA 1A8LA 4G2EA 1TW9A 4BWSA 3F0IA 18GSA 1O73A 1Y25A 4NV5A 2HSHA 4Q5FA 1X0RA 2GGTA 4OCEA 3RHBA 4EUYA 1WOUA 3ERGA 1ON4A 1PX6A 3ZRDA 1BX9A 2HSYA 2VL2C 2VO4A 2I81A 2VAFA 2VLUA 1FAAA 2K8SA 1FVKA 5EPFA 1MEKA 2I3YA 4MF6A 2OACA 1JHBA 2RIIA 2GT6A 2OA7A 3CSHA 5AGYA 3DEXA 2LJKA 5IIZA 3DWVA 4EE0A 2B1LA 2WDUA 4MP4A 3KMOA 3GKNA 2PU9C 1XWGA 3BJ5A 2C80A 2B6MA 3NZNA 3HD5A 2XHFA 2OE0A 5B6NA 1PKZA 5B8BA 1SD8A 3FZ4A 2I4AA 3QAVA 2CVKA 3F4SA 3W6GA 2NTOA 3OR5A 4KCEA 5INYA 1SL1B 4ZBDA 1M2BA 3N9JA 2CX4A 5JCWA 5GAPD 1KBNA 4ECCA 2JZTA 5IMDA 3FK8A 3GURA 2B7JA 1ERVA 4GSTA 3F8UA 2P5QA 4GXZA 2TIRA 1WPIA 3FKFA 2B5XA 2H8LA 1TU8A 4K9ZA 3ZFLA 2LRCA 1G0TA 2KHPA 4KGIA 4WBJA 1PRXA 1O85A 4KAEA 3TRQA 3G9BA 1OAZA 3VPTA 3GTUB 2L4QA 3UJ1A 3LYPA 4KE3A 1VGLA 5HFIA 3P7XA 1ZL9A 3TGZA 2DSAA 4XIHA 2VOCA 1X9MB 2ON5A 4G10A 3F9UA 2YANA 2K9FA 2QGVA 1YF1A 2O8VB 1X5DA 1SU9A 1XBSA 4Q5RA 22GSA 2XBQA 4L8EA 3K8NA 2IFQB 2GZZA 2XPDA 5IMZA 4K1FA 5F06A 2Z9SA 2VUPA 4KNDA 3EC3A 4OO5A 2LRTA 2CQ9A 4I2UA 1V2AA 3C7MA 4L0UA 4NV2A 3F3QA 1HD2A 2PVQA 2M46A 3TJBA 1U3IA 2L4CA 4IHUA 2YNXA 2HRNA 1Q98A 1KEBA 4JRRA 2CVDA 1MDKA 1TI3A 2VL2A 3H79A 1K0NA 5CNWA 1PQNA 2JSZA 1UA5A 3QPMA 3UEMA 3BCKA 1H75A 5ABRA 4BL7A 1M9AA 3GHAA 2LJRA 2GQMA 5IMCA 4V2LA 2DIZA 3HJPA 4KB3A 4KSOA 2D2ZA 3RPNA 3ZVJD 3GTUA 4POLA 1EEMA 1AAZA 1R7HA 5G1LA 2ES7A 3ME7A 2CV4A 2YWNA 5DJLA 2HXKA 1BAYA 3IAM2 5CRWA 4X1UA 4K7NA 4KX4A 2EC4A 1X9SB 4F2IA 3IDVA 1K0DA 4JEDA 3VI5A 3WT2A 3LXTA 5C04A 3FR9A 5AIXA 1E6BA 2H01A 1TRUA 4ZB9A 1EWXA 2IIYA 4J57E 1T4YA 3D6IA 2TRCP 5D73A 5ID2B 2FWEA 4KA0A 1M9BA 1XOAA 4TKYA 1EOGA 2C0EA 3HKRA 2YCDA 1S3CA 3UMAA 1GSDA 5IPGA 3M9KA 4DVCA 3BBYA 1FW1A 2VCZA 4IQAA 1SYRA 1NW2A 3D21A 3EU4A 5JWRB 1R4WA 3LQ7A 5JCGA 4IGJA 1A0RP 2GLRA 3UBKA 4KH7A 4JR4A 3F63A 5DQYA 5ECPB 1UC7A 3SWLA 1PSQA 3VPQA 3VURA 3J7Yb 3Q19A 1A23A 2HFDA 3APQA 1HNCA 3TOTA 1FB6A 3KXOA 4AJ7A 3A2VA 5DCGA 3KH7A 2AUVA 2ZUPA 3EYTA 4ZILA 2VCXA 3ZIJA 4V2MA 2JL4A 3EVIA 5DVBA 2CVBA 3TDGA 3U5RE 1SJ6A 5HQPA 3RHCA 1PL1A 1F6MC 2C0GA 5LD0A 2RUEA 1N2AA 2O85A 2DLXA 4PUAA 1ZGNA 2F3MA 4OO4A 4N11A 4TR1B 2XBIA 2DJ3A 1MTCA 2H0IA 2VCTA 5D9WA 2LTKA 3H4KA 4ZL8A 5D8IA 2KP1A 5ID2A 1Q4JA 4PQ1A 2ZCTA 2XC2A 2R6KA 1QUWA 3IXRA 3QDNA 3DYRA 2L6CA 2RM5A 2MMOA 4JZQA 4PNFA 2YV7A 3A2WA 1SYXA 1M7TA 5B6MA 2P0GA 1J9BA 1RK4A 5H5SA 2HYXA 3EWLA 5A4VA 1WP0A 3ME8A 4MJEA 5FHIA 4NHZA 2A4VA 4ZL9A 2A2RA 3VI7A 2E2MA 4YQUA 3P90A 3CRUA 3D5JA 3C73A 3RAZA 4NPBA 3D22A 3DGQA 1T8EB 5FT3A 3APSA 1GLPA 2GSQA 3FRCA 2YWOA 2GSTA 1TK0B 3CYNA 1HQOA 5AIVA 4GLTA 2FLSA 3GFKA 3IE3A 4ECBA 4IP6A 5A4WA 1PA3A 4D73B 1R26A 3BCIA 1EZKA 3MSZA 1GUHA 5GSTA 3VFIA 2FD3A 3LEFA 2GVPA 3FZAA 1PD21 1SD9A 1C72A 2LUSA 5DALA 5IMAA 1TU7A 3TKPA 4AGSA 1AXDA 4V1Ag 2NDOA 4ZL7A 3NOFA 4BVXA 1V98A 1F2EA 4XCSA 2O7KA 4MLYA 1QMVA 2MYGA 4L0WA 3Q74A 2AAWA 4AJ6A 3PR8A 2EIQA 3EMPA 4Z7XA 1DE1A 5JWOB 3N5OA 4O32A 4N0VA 1GULA 3KIJA 1USBA 3IK7A 1FOVA 3P2AA 1ACVA 2V41A 1BJXA 2IJYA 3QFBC 16GSA 4N30A 2CAQA 5IPHA 3A2XA 4MA9A 3O76A 1K0BA 5H5RA 2PVOC 1NSWA 1TP9A 3HVXA 1TRSA 5D93A 3TJFA 1W89A 1TK8B 1GWCA 2H6ZA 3MDKA 3UOMA 4WR4A 4ECIA 1XIYA 2FUG2 4XHMA 4BA7A 1YEPA 3LXZA 2H1DA 2R3XA 5IQYA 3DVWA 4D73A 3L78A 2HRFA 4RQXA 2LJAA 2CT6A 5B7CA 4KW6A 1O7UA 2FY6A 2X99A 4GTUA 3HYPA 1WRYA 2G2QA 1V58A 1Z6MA 3CMIA 1JLWA 4QQ7A 4MJCA 1S3DA 3UIWA 5KN1A 2OBKA 4NHWA 2EIRA 3QAGA 4ZBBA 3M1GA 4HDEA 4KDUA 1SL2B 5F8BA 2IL3A 3D4MA 5KN3A 4XRAA 2ALBA 4RQRA 2X8CA 1GTUA 2OADA 5ENUA 2MMAA 2JZRA 3M8NA 2DBCA 3L9UA 4RI6A 8GSSA 1BYEA 3L0HA 4POKA 5ECSA 2FA4A 1T3BA 1XWCA 3H93A 1MDIA 3PINA 4LL1B 1HYUA 4PX1A 2FWFA 4X0XA 2YP6A 3HJMA 1XWAA 4IP1A 2AB6A 4PXOA 5E4WA 2C8UA 3HA9A 3TJGA 3UAPA 2VCVA 2IPAA 3RBTA 3IR4A 1EP7A 1IYHA 4HJ2A 3IC4A 17GSA 5KN2A 1RQMA 3DIEA 2H74A 2YWIA 3TB2A 2H30A 2H76A 4V1Ap 2YJ7A 5ECIB 5G5FA 3QOUA 1UN2A 2B7KA 2GZPA 1GL8A 2FNOA 2N5FA 5DCHA 4O5RA 2VL9A 6GSVA 7GSSA 1EV4A 1T1VA 5DBQA 4KDXA 3GIXA 3I6AA 3F6FA 4K0NA 1ZCPA 2L59A 2YZHA 3FR3A 3E0UA 3IOSA 2X8GA 3I9V2 2RUFA 3QR6A 1THOA 4GQCA 3Q18A 3UL3A 2R2JA 1PGTA 3GMFA 1K0CA 4TRXA 5ECHB 1M0UA 1TRVA 1JZOA 2X64A 3GKMA 1UVZA 2FCHA 1LU4A 2LRNA 1F3BA 1ERWA 1B9YC 4MDCA 1H4OA 4I97A 2CA8A 2BTOT 2GSSA 4YH2A 2VLTA 5J9CA 2GSRA 4ML1A 4MK3A 3LORA 3HVVA 2E0QA 4NXIA 5ECLB 3C71A 3UVTA 2QC7A 3CSIA 1U87A 5EY6A 13GSA 2AV4A 2GQKA 3RPPA 3KTLA 4V2NA 3RDWA 3AY8A 2H71A 2WZ9A 3C8EA 4OFMA 4EKZA 4HUAA 4GQFA 4K2DA 3F3RA 5J5NA 1XOBA 1AC1A 4XS4A 1XVWA 5J9BA 4IELA 4EL1A 1M99A 3FZ9A 3KD0A 2WB9A 2PBJA 3MAKA 5H5QA 1WE0A 1A8YA 3TOUA 3GUSA 2ON7A 3GRXA 4TXOB 2JACA 2V6OA 5LNKe 3ZYWA 6GSXA 1V9WA 3ED3A 4Q5QA 1R5PA 2PWJA 3KP9A 4NWYA 3D4TA 3WYWA 5CRDA 2KOKA 1XWKA 3GV1A 4HI7A 5G30A 3ERWA 1EV9A 1TRWA 2H1BA 2IMDA 5F05A 3ZITA 1ERUA 5ECMB 3DXBA 3ZMKA 1BQ7A 1SKRB 4N0ZA 1GUMA 1WJKA 3ZFBA 4PGTA 2I1UA 1GP1A 6GSTA 1GSQA 2H70A 2IN3A 1OVNA 1SKWB 4MPFA 3TKSC 3UVHA 3M0FA 3KCMA 1GSSA 1I9DA 2R37A 3O3TA 1I5GA 3EINA 2YWMA 4J2FA 1TK5B 1EEJA 4YQMA 2VCWA 4NAXA 3VLNA 3IBHA 5ECOB 2IWTA 5GZZB 2C4JA 1X9WB 1SJZA 4HZ2A 1GSYA 1SENA 2H0HA 4JU5A 3BOAA 4DSSA 2HZEB 1TTZA 4RI7A 4BWQA 3VWXA 3PGTA 3J7Yk 3KM6A 2CZ3A 1O6JA 2EIOA 1RW1A 2PUKC 1KTEA 3ZREA 1YF0A 5DAKA 3KGKA 4MMMA 4TXOA 2AHEA 5DALB 2WULA 3Q6OA 2WRTA 4WKWA 2WS2A 4AF2A 2H66A 2HLSA 1NHOA 2FWHA 3EMXA 1Y6EA 2GZYA 1GH2A 1N8JA 3IAS2 2LNTA 2H75A 3U6VA 2P31A 4MZWA 1A24A 3VWVA 4WEYA 1VRSD 3EURA 3QCPA 4K8MA 2H19A 5ECKB 4YAVA 2R5GA 3W8SA 5G31A 3WT1A 1YY7A 4E8EA 1K0OA 12GSA 4WXTA 2V6KA 1J08A 1K3YA 4XS6A 3KJYA 4WF5A 3A5WA 1XWBA 1OC9A 1B4PA 4MCUA 3QD9A 3DD3A 5ELAA 4HEA2 3EU3A 4MF5A 4EDYA 2VL3A 1EGOA 2FA8A 6GSUA 1K0AA 2MBSA 5GAND 4F82A 1AQWA 4GSSA 4OWYA 3MWHA 2C3NA 1XZOA 3LWAA 2ZNMA 2KUCA 2N5AA 2HZEA 4DSQA 3IPZA 4GSNA 1SK1A 4CHSA 4IJ3A 1TOFA 1O8WA 1Z5YE 3HZ4A 1AUCA 5ECQB 4TR3A 4QL7A 1QFNA 1ZMAA 5DDLA 4J56E 5IMFA 2AYTA 1OE8A 4GF0A 4L5OA 4TN8A 1HNBA 5D9XA 3FY7A 1U88A 4JBBA 1XPVA 2DJJA 5J3RA 1U3AA 2RLIA 1ZYQB 5D9TA 9GSSA 4QL9A 2JU5A 3G7IA 3I43A 3W8JA 4PQHA 4G9HA 4ZIJA 5B8AA 2XPEA 5D96A 2B5EA 3A3TA 4PQIA 5IOXA 2REMA 1Z7PA 4IN0A 1AIUA 4G19A 1XW6A 3ZLPA 4HU9A 4OFNA 3QAWA 2FHEA 1SK0A 4CDOA 3KP8A 1FB0A 1R5AA 2BJXA 2J23A 4TOPA 3E3EA 5HR1A 2OKAA 2GS3A 1VF2A 4PURA 3H1NA 4ZXGA 2B5YA 4WF4A 4KDYA 5IOWA 4FH8A 6GSWA 5AN1A 2YV9A 1GNWA 4FYUA 5CYYA 3HXSA 4ISDA 2CZ2A 3IA1A 4GRFA 2GT5A 2OBIA 4IW9A 1GSFA 4IQ1A 2CX3A 3GX0A 2H73A 4POBA 3MNGA 1YKAA 2MBTA 2B1KA 2R4VA 4HQZA 1GTIA 3GN3A 3KEBA 1O81A 1BEDA 2DIYA 3ZIVA 1FVJA 2MMZA 2G0FA 3QMXA 1URMA 4K0GA 5IO2A 1CQHA 3CTGA 3L9SA 1PL2A 2K6VA 2F9SA 1HNAA 3CXGA 3LYKA 1VF3A 2LS5A 2LQOA 2M80A 1Z3EA 1F3AA 1VF4A 3D0ZA 1EGRA 2LQQA 1NHYA 2HZFA 3GSSA 3APOA 4JE1A 2VCQA 5HR3A 1GLQA 1GSUA 3WD6A 5FWGA 1T00A 3DRNA 5DQSA 4FO5A 1G6WA 4WBRD 4EO3A 1DSBA 1SK2A 1ABAA 4IBPA 3US3A 3FR6A 3IV4A 1QK8A 5AISA 3TJJA 3LG6A 3DVXA 4POMA 2NPBA 1OYJA 4H86A 4I2TA 2C3QA 4O7HA 5CP1A 2MMNA 2OJLA 3TUEA 2QSIA 2B3SA 2C0DA 1AQVA 5JWQB 5KN0A 4LMWA 4DEJA 5ECRB 3CRTA 1DE2A 1JLVA 2JZSA 4O92A 3V1WA 2PPTA 3TKSE 6GSYA 4HU7A 1MD4A 2C0FA 1MD3A 2PERA 1XCCA 2DJ0A 1W4VA 4XS4B 4EVMA 2YN1A 2GTUA 2YZUA 4K7OA 4ML6A 1Z7RA 2X8HA 3LGCA 1T4ZA 5GSSA 2IMFA 4MH3A 3HVSA 4RUVA 3SBCA 2MZCA 2WJUA 5D9VA 3IK9A 4P3YB 3S9FA 3TKQA 4HJMA 1GTAA 1SJIA 3DMLA 1YEXA 2V1MA 1J0FA 4YQVA 2YJHA 4OMVA 4ULXA 2PN8A 4LMVA 4OCFA 5ECNB 4N10A 4ILFA 3WGEA 3FHKA 1A2LA 1WIKA 5ELGA 1ERTA 4MPGA 3TRXA 3WGDA 1PMTA 3TJKA 3GYKA 2V32A 4GCIA 2O89A 2C1YA 1GSEA 3FZ5A 2L5OA 1OC3A 4MZCA 2OE1A 1DUGA 5CRHA 5CO3A 1IYIA 1F9MA 4I5QA 4KUNA 1X5EA 4DSSB 4IS0A 1ZOFA 4TR0A 2DJKA 3GL3A 3QFAC 4FYCA 3ZZXA 1XW9A 4ZB6A 1YKCA 4MF7A 4HZ4A 2LKUA 4BVYA 2QKEA 4XS1A 4MABA 5G1KA 3M3MA 2KLXA 4PUFC 3DKSA 1YDKA 1Z6NA 5J4UA 2NBSA 1JZWA 5DAKB 5F0GA 4ECJA 3EE2A 4ID0A 2DC5A 1GTBA 1G7EA 1GUKA 3GX8A 1SL0B 4K6XA 2L6DA 1A2MA 5HFGA 3C1RA 1G6YA 2WCIA 2WFCA 2IMIA 1LJRA 4MJBA 2IMEA 2N5BA 1K0MA 2DJ1A 3ISOA 4XTSA 2V2GA 3GH9A 3IRAA 20GSA 3GA4A 2JADA 4LL4B 3HCZA 3KMNA 4YAPA 1FO5A 2IFQA 5DJMA 3ERFA 4EF0A 4OFTA 1QXHA 3E9JB 2BMXA 1QQ2A 5IMVA 1OC9B 2J9HA 3C1SA 2H72A 3FEUA 3I69A 3UBLA 5C00A 1ML6A 3KH9A 1S3AA 2FGXA 3GNJA 2LEGA 4DSRA 5E59A 3HJOA 1XW5A 1NM3A 2F8AA 4EC0A 4TR4A 5HFKA 6GSSA 4L5LA 5A4UA 2AJQB 4ZBAA 3CSJA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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