3CXGA

Crystal structure of plasmodium falciparum thioredoxin, pfi0790w
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
123
structure length
122
Chain Sequence
SGRENLYFQGQSIYIELKNTGSLNQVFSSQNSSIVIKFGAVWCKPCNKIKEYFKNQLNYYYVTLVDIDVDIHPKLNDQHNIKALPTFEFYFNLNNEWVLVHTVEGANQNDIEKAFQKYCLEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
publication title Crystal structure of Plasmodium falciparum thioredoxin, PFI0790w.
rcsb
molecule keywords Putative thioredoxin
total genus 37
structure length 122
sequence length 123
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3cxgA00
2LKUA 2YANA 3ZREA 2H0IA 4KAEA 1DE2A 1MTCA 5AIXA 2X99A 2DJ2A 3FW2A 3GL3A 3ZL5A 2VCXA 4IELA 1DSBA 2C0FA 1AUCA 4O5RA 2X64A 5A4UA 2HRNA 1GSEA 3QCPA 4ML6A 3ZLPA 3GL5A 1XW9A 2JZSA 1G6WA 3GNJA 1KEBA 2WFCA 2XBQA 2V6KA 4E8EA 1ZL9A 2HZFA 5F06A 2V32A 2DSAA 4CW9A 1F37A 4WXTA 3GURA 1XXUA 1LBKA 1PL2A 1K3LA 4ZL7A 4K0NA 3H79A 2VD0A 5D9WA 2LTKA 1T00A 1XVWA 2IJYA 4OO5A 1ON4A 4V2NA 2PUKC 3AY8A 2BJXA 2VLUA 5D9VA 4K7IA 4I8BA 3ME8A 4OCEA 1XCCA 2VIMA 2CAQA 3UEMA 4F0BA 4KW6A 5B8AA 2R3XA 2H01A 1SK1A 4MJAA 3IE3A 1EP8A 3EYTA 2M46A 1A0FA 1TU7A 3GX0A 2WB9A 3LXZA 4MZWA 4TXVA 1PN9A 2CX3A 3EE2A 4EF0A 1FG4A 2FA4A 3DMLA 5B8BA 1FOVA 1WMJA 2NDOA 4J56E 1TK5B 2C3NA 2F9SA 4LL1B 4J2FA 1Y25A 4TXOB 3LG6A 1T4YA 2GSSA 1U3IA 4IP1A 3UARA 14GSA 4P3YB 2GQKA 3CSJA 5DAKA 3UMAA 3US3A 20GSA 3FZAA 3D5JA 3FR3A 5ID2A 5ECSA 2JSYA 3UBLA 3VWXA 5FHIA 3VWWA 5J3RA 2A2RA 2PBJA 3IR4A 3BCIA 2OADA 1EGRA 3CXGA 3GKXA 1FW1A 4GSTA 3ERGA 2YP6A 4D73A 5ECIB 1OC9B 2CAIA 4MJEA 5CP1A 5LD0A 1Q98A 2ON7A 3KH7A 1JLWA 2VO4A 1EWXA 3TRQA 1K0DA 3BBYA 2VD1A 2MBTA 1GSYA 3VI7A 3G7IA 1M0UA 3HA9A 3CYNA 3RPPA 4ZXGA 4TR1B 3ZMKA 1YKCA 1GUKA 4KSOA 2X8GA 2N5FA 3KIJA 17GSA 4QL7A 3UBKA 2IL3A 3UJ1A 1H4OA 3UAPA 4MF6A 1ZZYA 2C1YA 2HYXA 3P90A 1MDJA 2RM5A 3APOA 5ABRA 4HU9A 4ZBAA 2DJJA 5B6NA 1QMVA 1T4ZA 3DWVA 3I69A 4X1UA 4DSSA 2GS3A 4LL4B 1ERTA 3N9JA 1Z9HA 4ECIA 3D0ZA 3ZIJA 2XHFA 2V2GA 10GSA 1XFLA 6GSSA 13GSA 2VAFA 2KOKA 2XPEA 2I9HA 1SJ6A 3GTUA 5D96A 2JZRA 2CV4A 5CYYA 1EV9A 1YZXA 1ZYEA 2YPMA 2G2QA 1ML6A 4HDEA 4FYCA 3KTLA 3CTGA 1TRWA 3P7XA 2OJLA 5KN3A 3IV4A 3C1SA 3TOTA 3APQA 5G5FA 1M9AA 2HNLA 2L57A 2DIYA 3HZ4A 4HZ4A 4CHSA 4AJ7A 1S3AA 2L4CA 9GSSA 5ECOB 1PMTA 3EU4A 5ECNB 5HR3A 2REMA 1K0BA 5HR1A 3LORA 1SK2A 5JWQB 3GKKA 2YWNA 3QPMA 4WF4A 2X8CA 3E9JB 2DJ1A 1GSUA 2GDRA 5D8IA 2G0FA 1F9MA 3G7JA 3GV1A 2NPBA 3O76A 1ERVA 4JR4A 4F0CA 4OD7A 1TRSA 3KCMA 3F63A 1S3DA 3M8NA 1FVKA 3FEUA 4HU7A 4OFMA 4I2UA 3TJJA 2DLXA 2X8HA 1IYHA 5A4WA 5A4VA 1G0TA 4OFNA 5ECRB 2Z9SA 2JADA 3A2XA 5HQPA 4G19A 2VCQA 2VOCA 4IW9A 2HSHA 3TGZA 4L0WA 2CZ3A 3EURA 1KNGA 3UL3A 2E0QA 5J41A 3QMXA 1OYJA 3WGDA 1PRXA 5G2ZA 3D4MA 2WZ9A 2WRTA 4K8MA 5IPGA 1GP1A 3I6AA 2EIQA 1NM3A 4NHWA 1A2JA 1TTZA 3QOUA 2AJQB 5AISA 1JZRA 4KDUA 2FCHA 3LXTA 2YWOA 3ZVJA 4EVMA 3FY7A 2CVBA 4FYUA 2GT6A 4KE3A 4XS6A 1ZOFA 2B1KA 4IVFA 5AGYA 5IMVA 5F05A 5IIZA 2XPDA 3WGEA 1DBYA 4HI7A 4PQIA 1CQGA 1NHOA 1TP9A 1I9DA 2P5RA 3FR9A 4WR4A 4X0XA 4KB3A 1X5EA 2H0HA 5LCZA 2NVLA 2GQLA 4YH2A 5DDLA 3E3EA 3QAWA 5LNKe 1O85A 1J0FA 2JZTA 4NXIA 4FIWA 1MDKA 1NW2A 3BJ5A 5DALA 1GTUA 2DJ3A 3C7MA 4I2TA 1VF3A 3F4SA 2KLXA 4XS4B 5IMDA 1TK0B 3M9KA 2XBIA 5B7CA 3F4RA 2WDUA 1EEMA 2OA7A 1TW9A 3EU3A 2D2ZA 3GHAA 1A23A 2PVQA 18GSA 4CDOA 2GTUA 3K8NA 1WJKA 3KZQA 2AUVA 3KD0A 2GSRA 1C72A 1A0RP 4KCAA 4ZBBA 3CSHA 2HZEB 1U88A 2IMIA 4K7OA 1SKRB 2LV3A 2FLSA 3I43A 4LMWA 1PKZA 3A5WA 3PR8A 5HR0A 2E2GA 4IJ3A 2V6OA 3CTFA 5EVOA 1A8YA 1BG5A 5J9BA 2LNSA 1FB0A 7GSSA 2LSTA 4OFTA 2F8AA 3F6DA 1KTEA 3L9VA 12GSA 3KJYA 1T7PB 1AC1A 3F4TA 4Q5RA 4POBA 4G9HA 3G9BA 3CBUA 4ML1A 3LFLA 3KMOA 2V41A 4RI6A 4N0ZA 4K0GA 3BCKA 3GSSA 2LNTA 5D93A 1AXDA 3WYWA 1TRVA 4EC0A 5IM9A 11GSA 3F9UA 3F0IA 3Q6OA 5IOXA 3ZRDA 2IMFA 4RI7A 3ZFBA 3EC3A 1SYXA 2ALBA 2C0DA 3IOSA 2LJRA 4EDZA 4ZB6A 4YAVA 3PINA 1YF0A 2VL9A 2MMOA 4LLRA 3NZNA 1THXA 3MNGA 2L5LA 3ZIVA 3CMIA 2GZYA 1XVQA 8GSSA 1YKAA 2FWHA 4WKWA 2DMLA 3EMXA 1TK8B 2B1LA 2LRCA 4HQSA 4MK3A 3KEBA 4RQRA 3ZITA 2LRNA 2FGXA 4MF5A 2C3TA 3PGTA 4J57E 5CRDA 2RLIA 1DUGA 1TI3A 1GNWA 2JSZA 3KH9A 3NOFA 2FD3A 2M72A 2YJ7A 4QL9A 1TU8A 3KXOA 1SD8A 1UC7A 1YEXA 2TRXA 1MDIA 1Z7RA 2N5AA 4IBPA 2I3YA 4BVXA 4GLTA 1Z6MA 1GULA 2WCIA 3DKSA 4MH2A 3EVIA 3MDKA 3RAZA 1WP0A 1MD4A 4D73B 4OO4A 5COHA 1PL1A 1JZDA 1A24A 5IO0A 3HJOA 2OE0A 1HNBA 3U6VA 1IYIA 1DE1A 3F6FA 2DMMA 4OMVA 1O7UA 4QQ7A 1EP7A 2OBIA 1G6YA 3S9FA 1GSQA 4XRDA 2I1UA 4AJ8A 4MP4A 3LGCA 2R37A 3NIVA 1PX6A 1TKDB 4TOPA 4WEYA 2H72A 1FVJA 2CA8A 1SYRA 5GSTA 3IRAA 3IXRA 4E8HA 1X0RA 1JLVA 1B4PA 4MDCA 4TR0A 3MWHA 1BYEA 2L59A 4XHMA 2OE1A 1TJDA 3O3TA 2AB6A 4KA0A 4ZB8A 3IA1A 2QSIA 1PSQA 1PX7A 3C73A 1XZOA 4JZQA 4V2LA 1TI1A 1MEKA 3W8JA 3Q18A 5JCGA 1G7EA 4TN8A 4BWSA 4ECCA 5J4UA 2NBSA 4GQCA 2L6DA 2I4AA 3IPZA 3IC4A 2AYTA 4ULXA 3MAKA 3IK7A 4WBJA 2FUG2 2HRFA 3TB2A 4K2DA 3TKSC 3RHCA 1O8WA 3Q74A 3GRXA 3E0UA 5IPHA 2ES7A 3ERFA 1GLQA 4AJ6A 3TKPA 2BTOT 3HHVA 3IBHA 4WETA 4IS0A 1F2EA 1GSDA 5AIVA 1W4VA 1GRXA 3HXSA 2VCVA 3DYRA 5F07A 1BQ7A 1GTAA 1R5AA 3KP8A 2ZCTA 2HSYA 3L78A 4PUAA 3N5OA 3LYPA 1THOA 3D21A 3ZYWA 4H86A 4XTSA 4JBBA 4NV2A 1PA3A 1SL1B 2GZPA 2K9FA 3LQ7A 1LJRA 3HY2A 3QR6A 5IMCA 4XIHA 2IMKA 3H93A 1SU9A 4HQZA 1WPIA 4GRFA 4HUAA 1E2YA 2GGTA 2RUEA 1T1VA 5E4WA 2H6ZA 1TRUA 2MYGA 1F6MC 2GLRA 4TW5A 3EWLA 2IMDA 3CRUA 2L5OA 2VL2C 4MA9A 4EKZA 2DIZA 4KDYA 4ZB9A 1RK4A 2A2SA 5DQSA 1GNEA 3DD3A 1SKSB 5DCHA 5FWGA 3DIEA 1FAAA 3KGKA 4HJMA 2LQQA 2VCTA 4IGJA 5IQYA 5ENUA 1SD9A 1V9WA 5KN1A 1OC3A 1AW9A 3QD9A 4N11A 2YNXA 5ELAA 2GSQA 5G31A 1BX9A 4L8EA 3GKNA 3FYGA 2WJUA 4BVYA 2ZNMA 1GUHA 3C8EA 5CREA 2I81A 3QAGA 2M80A 5F8BA 4JEDA 1GTIA 2J23A 5ECMB 1URMA 1ST9A 3RBTA 3HZ8A 6GSWA 3M3MA 3QFAC 3FRCA 1E6BA 4IHUA 1Z5YE 4ECJA 4IQ1A 2HXKA 4KUNA 3GYKA 5AN1A 5DALB 3TJKA 1OAZA 1ERWA 3TJFA 1VRSD 3QDNA 3PH9A 4TR4A 4EO3A 3RHBA 2AAWA 3IDVA 4F82A 4V2MA 1BAYA 3VURA 3O6TA 3ZTLA 1SJIA 1SL2B 4GXZA 5DJMA 5E59A 4ZIJA 1YQ1A 2B5XA 4FH8A 2MMZA 4PURA 4Q5QA 5GSSA 1J08A 4F03A 3WD6A 1Y6EA 1CQHA 1A2LA 2IWTA 2RIIA 1OE7A 1M2DA 3HCZA 2IPAA 4ZL8A 4OCFA 3J7Yb 2PMTA 1HNCA 1ZMAA 1O6JA 2DC5A 4XS1A 1YF1A 4XCSA 4ILFA 5JCWA 2L4QA 4I97A 5C04A 4KSMA 3HVXA 2KHPA 3TKSA 1K0OA 3L4NA 4PNFA 3QFBC 2EIOA 3UOMA 4KCEA 3H1NA 2IFQA 3SWLA 5IMZA 1R4WA 1B9XC 3DRNA 4O32A 4FO5A 1G7OA 1SENA 1O8XA 4POKA 3VPQA 2BMXA 2H70A 2VM2A 3U5RE 1RQMA 2HI7A 1SL0B 2WGRA 3A2VA 3UVHA 3D6IA 1X5CA 3TRXA 3L0HA 3I9V2 2O8VB 4JR6A 1AQWA 3TKRA 2KP1A 2CQ9A 3G7YA 1R5PA 4MF7A 1OE8A 3M0FA 2K8SA 3D4TA 1JZWA 4HJ2A 4MJCA 1JFUA 1USBA 2O87A 1VF4A 2VCWA 4PXOA 5DCGA 3P2AA 3UVTA 3VFIA 1B4QA 4GTUA 2H30A 4NMUA 5ECHB 3SBCA 3M9JA 3ME7A 1ERUA 3HYPA 1AAZA 3UIWA 1H75A 4K6XA 1PD21 1TOFA 3VLNA 2C0GA 2B5EA 3HDCA 5ELGA 2HT9A 3ZZXA 5G30A 4WR5A 5ECKB 2VL2A 2PN8A 3LJRA 2GVPA 2YWMA 2H73A 3W8SA 2GSTA 2PWJA 2TRCP 1GTBA 3HJPA 1X9MB 3IAM2 4KH7A 1PGTA 2H1GA 2CT6A 4MZCA 4RUVA 1HD2A 3C71A 1XWCA 2ZUPA 4PX1A 5L71A 4HEA2 2H71A 1YEPA 3TRPA 1HNAA 2KP2A 5DQYA 4PQ1A 2H1BA 2HZEA 3BD2A 3VWUA 1ILOA 6GSXA 2MMNA 2MMAA 3GMFA 4TR3A 4XRAA 3FHKA 2WULA 2YWIA 3W6GA 2LRTA 1BEDA 4K7NA 2QKEA 3TOUA 5DAKB 1VGLA 3TDGA 1M2AA 2NTOA 2P31A 2XC2A 1WE0A 2YCDA 3CSIA 3KMNA 3FZ5A 2PU9C 2LEGA 3A3TA 5J5NA 2PERA 1B9YC 5ID2B 4Z7XA 1A2MA 2FY6A 4NWYA 1K0CA 2QGVA 3HKRA 5IOWA 3KM6A 4K1FA 2B3SA 1U6TA 5JCUA 4DEJA 1B8XA 5DVBA 5JWOB 2RM6A 22GSA 4ZL9A 6GSUA 1X9WB 2VLVA 2GT5A 3Q19A 2JL4A 1I5GA 1GH2A 2OBKA 5G1LA 1SK0A 3WGXA 2K8VA 2TIRA 4POMA 2FWEA 3A2WA 4KGIA 4L5OA 4JRRA 3P8WA 1XWGA 4AGSA 2VLTA 3DXBA 4BPYA 5KEJA 4ID0A 2C0EA 1XWKA 1AQXA 1YDKA 1WIKA 1QK8A 1W89A 4DSRA 4IJIA 4AF2A 3MSZA 5HR2A 3TUEA 2IMEA 3ERWA 1X9SB 3CRTA 2H75A 4DSSB 3DEXA 1YY7A 1XPVA 1EZKA 1M9BA 3GSTA 2WS2A 3TKSE 6GSYA 3LYKA 4GSSA 1ZGNA 4MJBA 2H6YA 2YOIA 2LQOA 1B48A 2DJKA 2YV7A 3FR6A 3GTUB 1FO5A 5H5QA 5GAPD 4O7HA 2FWGA 2ON5A 4EXJA 5D9XA 2H1DA 4G2EA 2F3MA 4Q5NA 1QXHA 2JU5A 4K9ZA 4IQAA 4MMMA 3F8UA 1AIUA 1O73A 1OKDA 1LU4A 2A4VA 2VL3A 1RW1A 2IN3A 1OVNA 2HE3A 1SJZA 3VWVA 3L9UA 1AQVA 2FA8A 4IN0A 2K6VA 1HYUA 2MZCA 2O89A 5KN2A 2K18A 3FK8A 1V40A 3ISOA 1M2BA 4TXOA 5C00A 2AHEA 4EL1A 4PQHA 16GSA 4L5LA 2O7KA 2CX4A 2B7JA 3KP9A 2H6XA 4JU5A 4ZBDA 5HFKA 1JHBA 3F3QA 2H66A 3HJMA 1ZYQB 1XW6A 1M7TA 5IMFA 2P0GA 5INYA 2F8FA 4GQFA 1M99A 2FNOA 2JACA 1V98A 2H74A 3EMPA 1OC9A 3DGQA 1T3BA 4NHZA 5G1KA 5KN0A 2F51A 4V1Ap 5DJLA 4I5QA 4KDXA 2IIYA 3VI5A 3WT2A 3M1GA 3IK9A 3F3RA 3TJGA 3GIXA 1XW5A 4NPBA 2GZZA 3GH9A 5H5SA 4TR1A 3LEFA 2DBCA 2H1AA 1XOBA 1K3OA 4MCUA 4ACSA 4TRXA 3TJBA 4NV5A 2AV4A 1K0MA 4HZ2A 2LUSA 1V58A 4Q5FA 4OWYA 2B6MA 5CNWA 1KBNA 1N2AA 5JWRB 3L9SA 1HQOA 1EOHA 1NSWA 3DVWA 4LMVA 3ZMLA 2CVKA 2GQMA 3H8QA 1QQ2A 3VPTA 4DSQA 4WF5A 2B5YA 2EC4A 1N8JA 3KTBA 4O92A 5GZZB 1FB6A 1Z7PA 2PVOC 2CZ2A 2MBSA 1QFNA 4TKYA 4L0UA 4DVCA 4I6XA 2IFQB 4RQXA 3FZ9A 1R7HA 2C4JA 5B6MA 4HOJA 1R26A 5CRGA 4ECBA 2L6CA 6GSVA 4BL7A 3RPNA 2R4VA 5HFGA 1GUMA 1GWCA 2J9HA 4PUFC 2YV9A 4KX4A 3GX8A 5D73A 2C80A 1F3AA 1WRYA 2E7PA 5IMAA 1U87A 3JCML 3IHQA 2FWFA 5DBQA 3C1RA 1ZCPA 5CO3A 4YQUA 4F9ZA 2VM1A 1O81A 1XWAA 1X5DA 1EV4A 4N0VA 4YQVA 1K3YA 1EOGA 2YZUA 1XWBA 2LJKA 3GN3A 1Q4JA 2QC7A 2E2MA 3GA4A 3TCOA 4PNGA 3QAVA 2LJAA 2PGTA 5G5EA 4V1Ag 3TKQA 5CRWA 2P5QA 3VK9A 2CVDA 4GF0A 3FKFA 5J9CA 5FT3A 1Z3EA 3HVSA 2EIRA 4G10A 2R2JA 2HLSA 5CRHA 1UN2A 4TVEA 1WWJA 4YQMA 5IO2A 1WOUA 1NHYA 4EE0A 1YJ6A 4IP6A 4POLA 5GAND 2R6KA 3ED3A 2KUCA 3D22A 1GL8A 4MH3A 2OKAA 5ECLB 4GCIA 1QUWA 4JE1A 3V1WA 1F3BA 1V57A 3HD5A 3WT1A 4WBRD 2H8LA 5A5KA 1EEJA 4FYBA 4YAPA 1JZOA 2H19A 1GSSA 1XBSA 3EINA 4KNDA 3J7Yk 1UA5A 2V1MA 1PQNA 2DJ0A 1GSFA 2R5GA 2YJHA 1U3AA 4GSNA 1Z6NA 2PPTA 1K0NA 3APSA 5HFIA 1J9BA 4MZBA 4BA7A 2H0GA 1A8LA 4X43A 2LS5A 4LA1A 3GUSA 1OC8A 1TDIA 4EDYA 4N10A 3LSZA 2B7KA 19GSA 1FHEA 4MPFA 3GKMA 4MPGA 1TXXA 4PGTA 5CAXA 4ZILA 1EGOA 5EL8A 2N5BA 1OKTA 2RUFA 3IAS2 1VF2A 4IKHA 1T8EB 1GLPA 1BJXA 3FZ4A 3LWAA 4NAXA 5D9TA 2YZHA 2OE3A 3GFKA 3OR5A 2YN1A 1VF1A 3GH6A 3ZVJD 5ECQB 2HFDA 2C3QA 4ISDA 2FHEA 1ABAA 4MABA 4N30A 1K0AA 4MLYA 2H76A 4GWRA 6GSTA 1QGVA 1S3CA 1XIYA 4EUYA 4XS4A 1V2AA 5ECPB 1MD3A 5F0GA 3H4KA 4BWQA 3DVXA 3ZFLA 5EY6A 3BOAA 2OACA 5H5RA 2VCZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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