4HU7A

E. coli thioredoxin variant with pro76 as single proline residue
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGACKMIAAILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNAGTAAKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Thioredoxin-1
publication title (4R)- and (4S)-Fluoroproline in the Conserved cis-Prolyl Peptide Bond of the Thioredoxin Fold: Tertiary Structure Context Dictates Ring Puckering.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Oxidoreductase
total genus 30
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4hu7A00
5H5SA 2C0DA 1THXA 4OCFA 2VLTA 2HXKA 1THOA 3HYPA 1ILOA 4D73B 2H1AA 1Z6NA 4EC0A 2QSIA 2ALBA 1QUWA 1LU4A 3GH9A 1PSQA 3UVHA 5ABRA 1V9WA 4Q5FA 4WBJA 2HE3A 1HYUA 3ME7A 3C1RA 1O8XA 2DMMA 4IQ1A 2OKAA 3UMAA 3EMXA 2LSTA 2TIRA 5IMDA 1Z7PA 2CQ9A 3QD9A 2HI7A 1UA5A 1YDKA 2N5FA 4P3YB 18GSA 1TW9A 1R5PA 2B7KA 3SWLA 2B5EA 1BJXA 4TVEA 1X9WB 4MA9A 1TRWA 5HQPA 5AISA 2YWMA 2GTUA 5F0GA 4HU9A 2C8UA 1PD21 4Z7XA 1SD9A 1K0DA 4K1FA 1Z6MA 5ENUA 4IQAA 1GTIA 4HI7A 2IJYA 5ELGA 1KBNA 2WJUA 1B48A 2RUFA 2O8VB 3GRXA 4KCEA 2MBTA 2YV9A 1FVKA 3HCZA 5FHIA 2N5BA 3ZTLA 1ST9A 4ZILA 4JZQA 1PKWA 1SU9A 2OE0A 1G7OA 4PUFC 4GXZA 4QL9A 1H75A 4HQSA 4OO4A 1OC9B 3M8NA 2XC2A 2FWEA 1A8YA 1EOGA 5IO0A 1Z3EA 1PQNA 4MF5A 4J56E 3EVIA 2CX4A 4WR5A 4PGTA 3TJJA 3ZMLA 5J9BA 4IHUA 1ERUA 4LL1B 3RAZA 4I2UA 2HZEA 1U3IA 5ECSA 5CO3A 1TTZA 2IMFA 4PQ1A 4XS1A 4MJEA 4NXIA 1UC7A 1YKCA 4TXOA 3KZQA 2GSQA 5J9CA 4KX4A 1FW1A 1VF4A 4K0NA 3H1NA 3IXRA 4BPYA 4MZWA 3DYRA 5GAPD 2CX3A 3WD6A 4RI7A 3HKRA 1XWAA 4F2IA 4F9ZA 1IYHA 1O73A 3G7YA 4HEA2 1ZCPA 1QFNA 1MTCA 1QK8A 1FVJA 2FCHA 3W8JA 4ZL7A 2MMZA 2V1MA 3IBHA 1XWCA 2B5XA 1PMTA 4H86A 2CZ2A 5J41A 1ACVA 4TR1A 3FEUA 2H70A 4TN8A 2LJRA 4WKWA 3ZLPA 2GQKA 1T1VA 4XS4A 1K0NA 5GSSA 1F9MA 1TP9A 4KGIA 1TK8B 3P8WA 1M9AA 3ZZXA 3HY2A 2FNOA 1GSFA 4IJIA 1X5EA 8GSSA 1EZKA 2IMIA 2CV4A 4XHMA 1PL2A 1HNAA 3MAKA 2WS2A 4YQMA 3CSIA 1G6YA 2N5AA 1R5AA 3GX8A 5AGYA 5IQYA 2H66A 5J3RA 1KNGA 4E8HA 4KE3A 2CVDA 2BJXA 3FK8A 1M7TA 3UIWA 5D96A 1BYEA 3UEMA 3LYKA 3IHQA 1EOHA 4MZCA 1UN2A 5JWRB 4PQHA 4DVCA 2PERA 5EL8A 3HD5A 3TOUA 2REMA 3TRPA 16GSA 4GQCA 6GSUA 3GKKA 2GQLA 3TJKA 2Z9SA 3APQA 3VPTA 5B6MA 5DVBA 3F4SA 1SL2B 3FY7A 5D93A 3GKNA 3D22A 5G30A 2GQMA 4D73A 1PRXA 4HJ2A 6GSTA 1SD8A 5ID2B 2AAWA 3HZ4A 5DAKB 4KDUA 1LBKA 2VUPA 2GSTA 3VI5A 2PGTA 3P2AA 4FIWA 4HZ4A 4F0BA 7GSSA 4AF2A 4AGSA 2OADA 4ILFA 2EC4A 1V57A 3LFLA 4KA0A 2JSYA 2WB9A 5IMAA 1A0RP 3US3A 1XVQA 1OC8A 5FWGA 5IO2A 3FR3A 2CAIA 3P7XA 1N8JA 3EWLA 4KSMA 5HR0A 1F2EA 2VLUA 3WT1A 3DVWA 4EVMA 4MK3A 1WJKA 4NMUA 2DLXA 4IKHA 4YAPA 3P90A 3TCOA 3TKSE 2I1UA 3O76A 4ECBA 1TK0B 1S3CA 4MP4A 4JR6A 2H0HA 3ISOA 2VOCA 2LQQA 1T00A 3KP9A 1X5DA 1OYJA 3E9JB 3PH9A 1SK0A 2HLSA 2H6ZA 3S9FA 4JU5A 3M1GA 2H1BA 4G9HA 5D8IA 2R5GA 2AB6A 4ISDA 4XRAA 1XW9A 1U87A 2PVQA 3TJBA 2LJKA 1OC9A 2KUCA 3TKSC 4MABA 2VCQA 2PVOC 2VD0A 4K9ZA 2IIYA 4N11A 1YEPA 1OKTA 5G1LA 2X64A 2NTOA 3CYNA 3UBLA 20GSA 2OA7A 1XVWA 4JEDA 2LRTA 4O7HA 3UL3A 3LGCA 2L6CA 3CSJA 3KIJA 1WRYA 2HRNA 3F0IA 4TOPA 1NHOA 1YQ1A 3H4KA 1JZDA 1I5GA 5B8AA 1PL1A 3KCMA 4BL7A 1K0MA 2HYXA 1FO5A 5IPHA 2KP1A 3WGXA 2AJQB 5HFGA 2FD3A 3A2WA 3TKRA 1QQ2A 5KEJA 1YZXA 2NVLA 4NV5A 1XOAA 1YEXA 3D4TA 4O92A 3HVVA 5DALB 2PU9C 1Z5YE 2O89A 2H6XA 2A2SA 1GTBA 2WZ9A 4ZB8A 2VL9A 1EGRA 2H30A 2BTOT 3UARA 5AN1A 1X5CA 1NHYA 1GP1A 2ES7A 2GDRA 3GKMA 5ECQB 1TOFA 4X1UA 5H5QA 4Q5RA 4PQIA 1GULA 4HJMA 3TJFA 4OFNA 1E2YA 2XPDA 2CA8A 1M99A 2YPMA 4L0UA 2MZCA 4WEYA 1GNEA 1WPIA 1HD2A 1ERWA 4V2LA 1V58A 4OWYA 2H75A 1FAAA 2L4CA 4ECIA 2B5YA 3ERGA 4BWSA 3QMXA 5EVOA 4EL1A 2B1KA 2R2JA 1MDJA 1O81A 4DSSB 3Q6OA 3CXGA 3UAPA 3GFKA 4IS0A 3K8NA 1AW9A 5IMFA 2MMNA 1GSEA 1YF1A 2XPEA 4PX1A 4JBBA 4EKZA 4I8BA 4N10A 3N9JA 1F6MC 4YAVA 4MDCA 1TU7A 3WGDA 4K7OA 1XWKA 4HOJA 3F63A 2K8SA 3F3RA 1VF3A 3F6DA 2MMOA 4ZL9A 3FZAA 5A4UA 3DXBA 4WR4A 3D4MA 1AXDA 4EE0A 2P31A 5ID2A 1BEDA 1OE7A 2E7PA 3H79A 4K8MA 2FWGA 4CW9A 1SKRB 2F51A 1TI3A 1EEJA 3IA1A 5ECHB 4KCAA 4OFMA 5G2ZA 4MJCA 3F4RA 1A2LA 4G2EA 1SJIA 1YJ6A 1JZOA 1K0AA 3G7JA 3QCPA 1ABAA 2MMAA 1XXUA 2E0QA 4MJAA 5LD0A 5CAXA 4GSSA 4ULXA 3CRUA 1MDIA 3TJGA 3I9V2 1K3LA 5IMZA 5CRWA 3F3QA 1XCCA 2VO4A 3UJ1A 2OACA 2DJJA 4IJ3A 3D0ZA 4MF7A 3CRTA 3O6TA 2GZYA 2J9HA 2LUSA 3MSZA 4EUYA 2GSSA 4XRDA 4I97A 3NZNA 3I43A 2QC7A 1K0CA 2WFCA 1GSYA 2YANA 1SYRA 1BQ7A 3CTGA 5ECKB 5J5NA 4AJ7A 3VFIA 4ECJA 3BOAA 2FLSA 3TKSA 2TRXA 3HJMA 4K7IA 1K0OA 3GX0A 4KDYA 2YWIA 1FOVA 3PINA 2R4VA 2X99A 4O5RA 4LMVA 4OMVA 1T4YA 4KAEA 3C1SA 5HR2A 2VCZA 1TKDB 3TRQA 3G9BA 1PN9A 13GSA 1PX6A 4ZB9A 3ED3A 3WGEA 3ERFA 2AHEA 1NW2A 3D6IA 2KLXA 4QQ7A 2EIQA 1EEMA 3LWAA 4ID0A 4N30A 1EV4A 3RDWA 5L71A 2GZZA 1MEKA 3GL5A 4N0ZA 2YJ7A 1ML6A 5CRDA 1SK1A 1GTAA 2P5RA 1TU8A 1LJRA 3IK9A 4GTUA 4XCSA 4TW5A 3FZ5A 2DBCA 3ZITA 3DEXA 1CQGA 3QOUA 5CRHA 4K0GA 3IRAA 5DALA 1FB6A 2PBJA 3APOA 4ECCA 3QAWA 2C0GA 1GUHA 2RLIA 3GA4A 3L9UA 1QGVA 1ZL9A 4I5QA 1H4OA 5HR1A 5IMVA 5HFKA 1ZOFA 4ZBAA 1GL8A 1EP8A 4WF4A 4OO5A 3HJPA 2GT6A 2I81A 3C7MA 1TXXA 3WT2A 1A2JA 1XWGA 2V41A 4EF0A 3RBTA 1TI1A 5GSTA 3TUEA 2L59A 3GNJA 1XW6A 4EO3A 1VF1A 2YZUA 3W8SA 1GSSA 1M2BA 1I9DA 1WE0A 1A0FA 5ECMB 2LNSA 2GT5A 2B6MA 3MNGA 2H8LA 3C73A 3VK9A 3FRCA 5IIZA 1IYIA 2RIIA 2DJ2A 3FR6A 2NPBA 1FG4A 4RI6A 1G6WA 2DJ1A 1R7HA 3KM6A 2K8VA 3DMLA 2R3XA 2LS5A 4RQXA 5J4UA 3HHVA 4L8EA 4FYBA 3C71A 4XS6A 4TKYA 1WWJA 2VL3A 1CQHA 3O3TA 5KN2A 2KP2A 5HR3A 3F6FA 5A4VA 3J7Yk 1FHEA 3U6VA 4WXTA 3VWWA 1GLQA 2IWTA 3GSSA 1URMA 3CMIA 2NDOA 3UBKA 3JCML 1G7EA 3GKXA 1XW5A 1WOUA 1V98A 1A2MA 5IPGA 4AJ6A 3NOFA 4KSOA 3IDVA 3EURA 3DIEA 1MD4A 4I6XA 3L78A 3N5OA 4IN0A 2R37A 4KB3A 4ZL8A 3APSA 1B4QA 1R4WA 5KN3A 2OJLA 1Y25A 1OAZA 1RK4A 2XHFA 4L5LA 2ON5A 4LA1A 3HXSA 3GMFA 2PUKC 1K0BA 4TR4A 4F0CA 1XWBA 5AIXA 1KTEA 2DC5A 1SKWB 3HVXA 4K6XA 2WDUA 4DEJA 5C04A 5KN0A 10GSA 4DSQA 1OKDA 3KJYA 4RUVA 3FR9A 2XBIA 4IELA 1FB0A 2FA4A 3CSHA 3FHKA 3IAM2 1T8EB 2PMTA 3KH9A 5DJMA 1JHBA 4IGJA 3ZMKA 4PURA 1GNWA 2F8AA 4JRRA 2CAQA 2K9FA 4LL4B 2CZ3A 2JACA 1GUKA 1PA3A 1K3OA 4V1Ap 2H01A 3VWUA 4BVXA 2YP6A 5LCZA 3M9JA 1X0RA 2M72A 2LV3A 5G1KA 3C8EA 3KGKA 3WYWA 1JZWA 2BMXA 1O85A 2KOKA 1DSBA 2B7JA 3E3EA 1EWXA 4L5OA 4QL7A 1W89A 3LQ7A 2ON7A 2M46A 4ZIJA 3BCKA 3TKPA 1EV9A 2OBKA 3IR4A 3J7Yb 4GSNA 4Q5NA 3ZYWA 2HZEB 3GTUB 4V1Ag 1A8LA 2LQOA 5COHA 4TXOB 3ZL5A 4TXVA 1ZMAA 22GSA 2OBIA 3EMPA 4PNFA 2JSZA 1YKAA 1GWCA 1XPVA 2H1GA 2RM6A 3Q18A 3KEBA 4NAXA 1B9XC 2VM1A 2HRFA 3H8QA 2KHPA 1DBYA 5DBQA 2JU5A 5D9TA 3IOSA 1TRSA 2HNLA 1Y6EA 3DGQA 5CREA 1T4ZA 4MLYA 3SBCA 4PNGA 1ZGNA 1JLWA 3KP8A 1TRVA 3GSTA 3TDGA 2AV4A 6GSSA 1GSQA 2JADA 4ZB6A 2JZRA 1C72A 3PR8A 2YWOA 5G5FA 5B8BA 2DIYA 2C80A 4KNDA 3FKFA 4CDOA 2H1DA 2PN8A 4GF0A 4MH3A 4ML6A 3TB2A 4N0VA 4GCIA 2FWFA 4POBA 2D2ZA 1SENA 4LMWA 3LXZA 4X0XA 1XZOA 3VPQA 2IPAA 4TRXA 1AUCA 1RW1A 4Q5QA 1O7UA 3ME8A 3E0UA 3KTLA 2IMEA 2OE1A 1AQVA 3QPMA 3KMOA 1OVNA 4POLA 2HT9A 5LNKe 5CNWA 5ECPB 2K18A 3UOMA 1AC1A 3F8UA 1X9MB 2C1YA 3QR6A 2F8FA 2YNXA 4OCEA 1HQOA 4MPFA 5D73A 2B3SA 3L0HA 1ZYEA 6GSWA 5DAKA 2GZPA 3HZ8A 2E2GA 5JCGA 4KH7A 5B6NA 5IOXA 1MDKA 5GZZB 3R2QA 3IK7A 2V2GA 2LNTA 1XOBA 5F06A 3FZ4A 3DD3A 1O6JA 3KMNA 1GSDA 4IP1A 4V2NA 4EDYA 5IOWA 2GSRA 3D21A 1U6TA 3ZFBA 1UVZA 5CP1A 3QDNA 3IV4A 2LRNA 1MD3A 3ERWA 5F05A 3LEFA 2OE3A 3EU3A 4EDZA 1AAZA 4AJ8A 3GL3A 3UVTA 4ZXGA 12GSA 2ZCTA 3Q74A 2O85A 5B7CA 5H5RA 2WCIA 5DQSA 1ZZYA 5F8BA 4X43A 2CVBA 3Q19A 4IW9A 2H73A 1Q98A 2GLRA 2GGTA 4O32A 1GTUA 1TDIA 2RM5A 11GSA 3RPNA 2MYGA 2WGRA 3GIXA 2RUEA 2DJKA 4V2MA 1QMVA 2YJHA 2IMKA 1JLVA 4XTSA 2EIOA 4HQZA 2DJ3A 3LSZA 2F9SA 5A4WA 5D9WA 5DCHA 4ML1A 1F3BA 3LG6A 1OE8A 3H93A 4POKA 2ZNMA 1E6BA 2LEGA 2H6YA 2VCVA 4IP6A 3DKSA 2YV7A 2DIZA 1J08A 2VLVA 2H71A 2FHEA 19GSA 1XIYA 4YQUA 2EIRA 2JZSA 2VL2A 3EYTA 4MZBA 3LORA 3QFAC 2C4JA 3VI7A 2C0FA 2L5LA 2I9HA 1WP0A 4MH2A 1M9BA 3HDCA 1YF0A 3GTUA 4PXOA 3GHAA 1Q4JA 3ZREA 2X8HA 5DJLA 1S3AA 2LTKA 2AUVA 1GLPA 4BVYA 2VM2A 6GSYA 5HFIA 2DJ0A 3I69A 3M9KA 5ELAA 3FZ9A 4HU7A 2QKEA 2NBSA 1T7PB 17GSA 2A2RA 1TJDA 3ZFLA 2IN3A 2L57A 5CRGA 2LKUA 4NHWA 2YCDA 1B8XA 2HZFA 2VAFA 1TK5B 4F82A 3TRXA 3IPZA 3VWXA 2FGXA 2JZTA 1SL0B 2IL3A 4JR4A 4XIHA 2FUG2 1DUGA 2R6KA 4KUNA 1X9SB 1TRUA 5JWOB 4LLRA 1USBA 5ECNB 1SYXA 2V32A 1V40A 5DCGA 3HJOA 4ZBBA 4DSSA 2LRCA 1AIUA 3EC3A 3I6AA 4BWQA 1A24A 3BCIA 3EINA 4HUAA 3BJ5A 1G0TA 5IMCA 4NPBA 1B9YC 5EY6A 4NWYA 1HNBA 3W6GA 1GSUA 4TR0A 2H0IA 4L0WA 2IFQB 3A5WA 3D5JA 3GUSA 4WBRD 3GH6A 1GH2A 1O8WA 4BA7A 2VD1A 3GYKA 2PWJA 3KXOA 2J23A 3GN3A 3A2XA 3F9UA 2L5OA 3ZIJA 3A3TA 1U3AA 2DSAA 2M80A 1QXHA 4JE1A 3TOTA 4RQRA 5ECRB 3PGTA 1OC3A 3QFBC 1VRSD 1JFUA 3CTFA 3QAGA 2K6VA 3DVXA 2FA8A 3LYPA 4FH8A 3L9SA 4GLTA 1BX9A 1M2DA 2MBSA 2WRTA 1SK2A 3GURA 1J0FA 4G19A 3FW2A 2L4QA 4E8EA 3EU4A 1V2AA 4WETA 2FWHA 3GV1A 2V6KA 4J57E 1DE2A 2CT6A 2X8CA 4G10A 2WULA 5F07A 5INYA 2V6OA 1KEBA 2YWNA 3L9VA 3BD2A 6GSXA 3VURA 1ZYQB 3ZVJA 1U88A 3V1WA 2C3QA 3CBUA 4HS1A 3LJRA 4GWRA 3RHCA 4MPGA 3QAVA 2FY6A 2H19A 2L6DA 3ZIVA 3BBYA 4K2DA 2F3MA 3HA9A 5E4WA 1Z9HA 1GRXA 4FYCA 3RHBA 5AIVA 9GSSA 4DSRA 1SJ6A 2O87A 5DQYA 3A2VA 3NIVA 4FYUA 2H74A 2P0GA 3F4TA 1PGTA 4PUAA 4J2FA 3TKQA 6GSVA 3VWVA 4ACSA 2HSYA 2HSHA 2AYTA 3MDKA 4IVFA 2X8GA 5IM9A 1W4VA 2VIMA 3U5RE 1PKZA 1BG5A 4HZ2A 1ON4A 2TRCP 2GVPA 5CYYA 1XFLA 5ECLB 5EPFA 2IMDA 4IBPA 2P5QA 3M3MA 1PX7A 1SL1B 4TR3A 1R26A 5G5EA 4I2TA 3OR5A 1XBSA 2A4VA 1F37A 4NV2A 5D9XA 5JCWA 2VL2C 5KN1A 1M2AA 1NM3A 2CVKA 2VCTA 2LJAA 3IE3A 3IAS2 3DWVA 2E2MA 2ZUPA 1F3AA 4FO5A 5JWQB 4GRFA 1T3BA 2GS3A 2YOIA 1WIKA 2YN1A 4MJBA 2O7KA 2H0GA 1ERVA 3KTBA 4ZBDA 4OFTA 3VLNA 5E59A 5D9VA 3M0FA 2H76A 4YQVA 2JL4A 3ZRDA 1WMJA 2HFDA 2I4AA 1M0UA 4KDXA 1J9BA 1N2AA 2DMLA 1EP7A 3IC4A 3L4NA 1RQMA 3KH7A 1DE1A 2H72A 4TR1B 1YY7A 5ECIB 4EXJA 3DRNA 14GSA 1VF2A 5A5KA 3ZVJD 1NSWA 1SKSB 2I3YA 4XS4B 4GQFA 4NHZA 2VCWA 1SJZA 1GUMA 4F03A 1AQWA 4POMA 1ERTA 4HDEA 1S3DA 4MCUA 4OD7A 3HVSA 3FYGA 4MF6A 2IFQA 5G31A 2XBQA 2VCXA 2G2QA 1AQXA 4WF5A 2B1LA 1A23A 4K7NA 3MWHA 5JCUA 4YH2A 2QGVA 1K3YA 5ECOB 3AY8A 1HNCA 1JZRA 2C0EA 3G7IA 4KW6A 5C00A 2C3TA 2G0FA 3KD0A 2PPTA 5GAND 2YZHA 3LXTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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