4JR6A

Crystal structure of dsba from mycobacterium tuberculosis (reduced)
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
198
structure length
198
Chain Sequence
GDAVRVTSSKLVTQPGTSNPKAVVSFYEDFLCPACGIFERGFGPTVSKLVDIGAVAADYTMVAILDSASNQHYSSRAAAAAYCVADESIEAFRRFHAAMFSKDIQPAELGKDFPDNARLIELAREAGVVGKVPDCINSGKYIEKVDGLAAAVNVHATPTVRVNGTEYEWSTPAAMVAKIKEIVGDVPGIDSAAATATS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Possible conserved membrane or secreted protein
publication title Structure analysis of the extracellular domain reveals disulfide bond forming-protein properties of Mycobacterium tuberculosis Rv2969c.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule tags Oxidoreductase
total genus 63
structure length 198
sequence length 198
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4jr6A00
4AGSA 2A2SA 5C00A 1CQHA 5JCUA 1U88A 4IS0A 2BMXA 3HCZA 3GV1A 1SYXA 1JZWA 1B4QA 1ZGNA 4ZB8A 2EIOA 3LYPA 2TRXA 2PGTA 4MZBA 3FK8A 3LG6A 1SKSB 5ABRA 2ZUPA 3GA4A 2B1LA 2VM2A 5IMDA 3P8WA 2C0GA 2YOIA 1XBSA 1EP7A 1VF2A 2VLTA 2H1BA 6GSVA 1IYHA 3GH6A 4KB3A 1Z7PA 3TKSA 5IMVA 2LUSA 5ECRB 4XRDA 1BAYA 4IQAA 1Z9HA 5CAXA 5DVBA 3BBYA 2XBQA 4MK3A 1XWCA 2L5LA 5B7CA 1Z3EA 1NHYA 1TRUA 3LQ7A 4EDYA 4WETA 1AQVA 3RPPA 1M2BA 4XCSA 3ED3A 4OCFA 4DSSA 2YZHA 4WKWA 19GSA 5A4UA 3UJ1A 3TUEA 1PGTA 2DJKA 4G19A 1BEDA 2HZFA 1WE0A 3HY2A 3KMNA 2R3XA 3HXSA 4WR4A 2HRNA 1MD3A 4AJ7A 2MMZA 4IELA 4WR5A 1T8EB 2VD1A 1JZRA 1YEPA 2NBSA 2PERA 4FH8A 1RW1A 1SJIA 1GRXA 4HU7A 3HHVA 2DIZA 5G1LA 2V32A 1J08A 3IBHA 2ES7A 2K9FA 2FCHA 1N2AA 4MJBA 3ZIJA 1AAZA 4E8EA 4FO5A 3TRPA 4JBBA 2KUCA 2YWMA 2ON7A 3KH9A 4ECIA 3P2AA 3EU3A 2H76A 1HNAA 2LKUA 1G7EA 2LEGA 4BA7A 3GURA 4XRAA 2YZUA 2GQKA 1A0RP 1QGVA 2I9HA 5J3RA 3QFAC 2B7KA 1SYRA 4MA9A 3M0FA 2K8VA 4TXOA 2JSZA 2F3MA 4YH2A 4PUAA 1M2AA 4KUNA 5B6MA 2C3QA 2JL4A 1M7TA 1W4VA 4L5OA 5CRDA 2H01A 4YQMA 3GTUA 1WOUA 2H0GA 4ECCA 1EOGA 2OBIA 3UMAA 1OC9B 3WD6A 4E8HA 2FNOA 3KP9A 1GUKA 1GSUA 4TN8A 2R5GA 4GRFA 2PWJA 4NMUA 1VF3A 4TW5A 1M9BA 3E9JB 5INYA 4GTUA 5AN1A 4ZXGA 4YQUA 5J9BA 1DE2A 3ZL5A 4AF2A 2H1GA 3ZZXA 4X43A 4MH3A 2H8LA 4F0CA 2YWOA 3GSTA 4MH2A 4KDXA 3P90A 2HLSA 3W8JA 3A2VA 1ILOA 5DALA 4NXIA 1IYIA 3VI5A 4K6XA 5FWGA 6GSTA 4V1Ap 5J4UA 2RUEA 5IOXA 2PMTA 2VCXA 2VL3A 3F3RA 3F6FA 3MDKA 1JHBA 3KZQA 2PN8A 3FZ4A 4DVCA 3NZNA 2E7PA 3O76A 2V2GA 2IWTA 6GSUA 3LWAA 1GSSA 2PVQA 3QAWA 1GSEA 5JWRB 3A5WA 3P7XA 2NDOA 1GTUA 3SBCA 1SL2B 2ZNMA 1AQXA 3L9SA 3IR4A 5ECOB 2VL2C 3APOA 4ZL8A 2DJ2A 2LJKA 2AUVA 5EL8A 4FIWA 1ERWA 3M9KA 1MEKA 2FLSA 3EVIA 5IO2A 1R26A 3TRXA 4KGIA 3HKRA 4TOPA 1A24A 2LSTA 3NIVA 2L59A 3FKFA 3J7Yk 1Z6MA 3ERGA 3I6AA 1E6BA 5KN3A 5AISA 3ZMLA 5A5KA 1DE1A 3CRTA 2DJ1A 2GSTA 1KTEA 1BQ7A 1JFUA 3VWUA 3AY8A 3TKRA 3UARA 2L6CA 5IQYA 3J7Yb 1Q98A 1HNBA 3EYTA 5D9TA 1ZZYA 2GT6A 1ERTA 2EIRA 1PX6A 5IIZA 1V40A 1AUCA 5ELGA 2B5EA 4KAEA 3ZRDA 1T4ZA 2GQLA 2XC2A 1O8WA 3ZFBA 4MDCA 4TR1B 2IIYA 3APQA 4IJ3A 2I4AA 5ECKB 3D5JA 1AQWA 3S9FA 2CT6A 2AAWA 4I97A 4K7NA 2L6DA 4ZL9A 3M1GA 4WF4A 5HR0A 3C1RA 4RQRA 5G1KA 3KXOA 3ZTLA 3QCPA 1XOAA 2DJJA 1AC1A 1Q4JA 2H0HA 3R2QA 4HI7A 4ZL7A 3F0IA 2G0FA 3ZVJA 3CSJA 2DIYA 4D73A 2Z9SA 2X99A 5D73A 2VCWA 3TJFA 3CXGA 2IFQA 5GZZB 2CQ9A 2JZTA 5CO3A 4IP6A 1TKDB 4I2UA 1GUHA 3GIXA 1GNWA 2HZEA 1FHEA 4HDEA 4ZB6A 1PRXA 1XIYA 2FWFA 4V1Ag 4V2LA 3VFIA 2RM5A 2GZYA 3QPMA 3WGDA 4G9HA 3FYGA 4LA1A 1RQMA 1XVWA 2GVPA 2GZZA 1TK8B 2V6KA 2GGTA 2LS5A 5D9VA 4MJAA 1JLWA 2NVLA 3PR8A 4PNFA 3C7MA 3IV4A 5D93A 4TVEA 3GL5A 3W6GA 4DSQA 1EGRA 4IW9A 3MWHA 6GSWA 2K8SA 1GUMA 3WYWA 2WDUA 4NPBA 1TRSA 4L0UA 1ZYQB 3IOSA 5JWOB 3VURA 4KW6A 1CQGA 2GSRA 2M80A 4GSSA 4JEDA 1R4WA 3G9BA 2WULA 3IAS2 3QAVA 2F51A 1QMVA 7GSSA 3MNGA 2LV3A 2N5AA 1NSWA 4OWYA 3VPQA 2P5QA 2I3YA 2WB9A 3CBUA 4LLRA 4KX4A 4POKA 4RQXA 4MF5A 2ZCTA 3GX0A 4KCAA 3ZLPA 2MBSA 1EV9A 2VCQA 1TI1A 1JLVA 2IMIA 3UL3A 5CRWA 4DSSB 2CAQA 1YKAA 3GFKA 1R5PA 1EWXA 1USBA 1EOHA 2YNXA 5IPGA 5DBQA 2LRCA 4MF6A 1WPIA 4HJMA 1SK0A 3RHCA 3FZ5A 3KTBA 1GLPA 5F0GA 3LFLA 4EL1A 2O8VB 1B9YC 3JCML 4Q5FA 4TRXA 1FVJA 1PSQA 1B4PA 4I6XA 4ML6A 2YWNA 4K7IA 1K0NA 3M8NA 5E4WA 3UAPA 5JCWA 3TJJA 5ECNB 4HS1A 1ZMAA 1OC3A 4MLYA 1V2AA 1XWBA 2CZ2A 1SJZA 1T00A 3CRUA 5DAKA 2PU9C 3HJPA 3DWVA 2CX4A 2AHEA 2H1AA 1FO5A 5A4WA 5JWQB 2J23A 1X5CA 3DMLA 2GDRA 3U5RE 4IHUA 4MMMA 5J5NA 2L5OA 3EMPA 2VLUA 2DJ0A 4OO5A 4Q5RA 2KLXA 1MDIA 3F9UA 2VO4A 1O73A 3VWXA 1B8XA 4TXOB 1A2JA 2AV4A 3O6TA 2O89A 1YKCA 2P31A 1XWGA 2HE3A 3GTUB 1PMTA 1BX9A 2H70A 2LRNA 2IPAA 4LMWA 2C3NA 2KP2A 3HZ8A 4EO3A 1PKZA 1KNGA 1O81A 1OVNA 3FR3A 1OE7A 1VRSD 2D2ZA 5LD0A 2FWGA 3TKPA 4ID0A 5LCZA 1ACVA 1O85A 4TXVA 4EDZA 2LNSA 3QFBC 3BCKA 4X1UA 4PQ1A 4L5LA 2X8GA 2X64A 3KJYA 2OACA 1S3AA 2VCVA 5IMAA 4DSRA 4N30A 5DALB 3PH9A 2GS3A 4MPFA 3ERWA 1ST9A 1T4YA 3KH7A 1TU8A 3ZMKA 1KBNA 1HD2A 1XWKA 3ZIVA 1SJ6A 3QAGA 3D6IA 4Z7XA 4PGTA 1SKWB 4ZIJA 2IMEA 3DRNA 3IE3A 3ZFLA 2WFCA 1FOVA 1X5EA 3FR6A 1J9BA 5DQSA 5EPFA 1EEJA 2YANA 1MDJA 2CA8A 2M46A 3A2XA 1SD9A 3F4RA 4FYCA 1GSFA 4MP4A 1E2YA 1K3LA 3U6VA 4AJ6A 3VWVA 2H75A 4KCEA 3IK7A 1XPVA 2L57A 1M9AA 3F63A 1XCCA 2V6OA 3IPZA 5HQPA 2L4QA 4F03A 2E2MA 4V2NA 3C71A 5ECMB 1RK4A 1O7UA 3PGTA 1ERUA 1WJKA 1SENA 3DD3A 2YV9A 4EUYA 1B48A 4K0GA 2X8HA 2H30A 4MPGA 3EINA 2FA8A 3CSIA 2M72A 1BYEA 4OD7A 1T1VA 1TK5B 3GUSA 1PN9A 3RDWA 1HNCA 1ML6A 3EURA 1DBYA 4IBPA 3HVVA 1K0DA 5IM9A 5J41A 3Q74A 1H4OA 2HNLA 4HZ4A 5G5EA 5D96A 3G7JA 2QSIA 2AYTA 4PQIA 3CTGA 3D22A 1GNEA 1YEXA 3H4KA 2B3SA 4MJEA 4NV5A 3HJMA 4NWYA 3H79A 3HA9A 12GSA 1JZDA 4GCIA 3IDVA 1ZOFA 4I2TA 3RBTA 4EKZA 8GSSA 1J0FA 3UVTA 2PBJA 1K0AA 4KA0A 4XS1A 5DCHA 5CRGA 4D73B 1TDIA 1TRWA 2LRTA 5L71A 2DLXA 2OE0A 3DVXA 2IFQB 1FB6A 4YQVA 4IVFA 2HZEB 5C04A 3TJBA 2MZCA 1M99A 2BTOT 2YCDA 3H1NA 2JU5A 3DVWA 1X5DA 3FHKA 1S3DA 4JRRA 3EWLA 3KEBA 2CVBA 3G7IA 1SL0B 4POMA 4OFTA 1EEMA 2I81A 1FVKA 4PURA 4ULXA 1OKTA 2FWHA 3N9JA 2C4JA 4O7HA 4POBA 1AXDA 1EP8A 3APSA 1XFLA 2IJYA 3QMXA 4GXZA 4ZBDA 5ECLB 1HYUA 1A0FA 1SK1A 2REMA 3A2WA 3A3TA 1EV4A 3TB2A 1URMA 4YAVA 4OO4A 3KD0A 3LYKA 2C0EA 1K0MA 5ELAA 1YF1A 2TRCP 2H74A 3IK9A 3UIWA 1YQ1A 3EE2A 1X0RA 2XPDA 1SU9A 2BJXA 2C0FA 4HUAA 4WEYA 4MZCA 2C80A 3EU4A 2H66A 3TCOA 2JACA 1VGLA 2P0GA 3HVXA 5G5FA 1U87A 5GSSA 1K0OA 5B6NA 2VM1A 3KTLA 1H75A 4ZB9A 2PUKC 3SWLA 3LXTA 3CYNA 4EE0A 2F8AA 5AIVA 1THOA 2VAFA 1K0BA 5IPHA 5ECSA 2YJ7A 4N11A 3HVSA 5ID2A 4OFNA 1F6MC 3DEXA 2IMDA 2MMAA 5IMZA 1W89A 3QD9A 3L9VA 5HR3A 4KH7A 6GSYA 1GP1A 1UVZA 3D4MA 2H6ZA 3MSZA 2B5YA 4QL7A 1WP0A 2HXKA 2WS2A 1YY7A 5EVOA 2TIRA 5F07A 4JZQA 2VCTA 3D0ZA 4L0WA 3GSSA 1G0TA 1O8XA 3NOFA 2K18A 2YP6A 4NHWA 2R4VA 1WRYA 2HYXA 2G2QA 2DMLA 1THXA 1VF4A 2LQOA 3C1SA 4N0ZA 4HOJA 2VCZA 1F3BA 3GH9A 5HR1A 1SKRB 1U6TA 5IMCA 4BWQA 1PD21 4WBRD 5DAKB 1R5AA 3TOTA 1Y25A 3KIJA 3FZAA 5HFGA 4KSOA 4GSTA 2H1DA 5A4VA 3KMOA 1GH2A 3FRCA 3EMXA 1TRVA 4POLA 5IO0A 1GTIA 4K9ZA 2R37A 4YAPA 4PXOA 3CTFA 2PVOC 1DSBA 4ISDA 3F8UA 6GSSA 2V41A 1ZCPA 3GMFA 3ZREA 4KE3A 2VLVA 4XS6A 1Z7RA 1QXHA 2OJLA 2B7JA 4PUFC 3QR6A 3ME7A 5D9XA 2RUFA 4HJ2A 5B8AA 1FW1A 1A2LA 1XW6A 5HR2A 1F2EA 2CVDA 5ECQB 2IMFA 3D21A 3F4SA 2VUPA 3BCIA 5H5QA 1C72A 2MMNA 3M3MA 5G31A 1F37A 1AW9A 11GSA 1K3OA 2J9HA 2C3TA 2N5BA 2V1MA 5B8BA 4EF0A 1U3IA 2JZSA 1JZOA 1EGOA 3UOMA 4FYBA 3F4TA 3L9UA 1X9MB 2E2GA 3H8QA 5DJMA 2QC7A 3TJGA 4J57E 3HYPA 3DGQA 3VWWA 3F6DA 2HI7A 2MMOA 1XOBA 4K0NA 5IMFA 3DXBA 2WZ9A 2RIIA 3I9V2 4N0VA 1M2DA 3GHAA 3IHQA 2C1YA 4WF5A 2H73A 3KCMA 2KHPA 3UBLA 5JCGA 2RLIA 3GYKA 1ON4A 3H93A 2H71A 1SD8A 4EVMA 1WWJA 2GTUA 3RPNA 1F3AA 18GSA 1A2MA 3TKSC 3LGCA 5ECIB 2C8UA 4F82A 5HFKA 1UA5A 4TKYA 3TGZA 4FYUA 3GN3A 1BG5A 5CREA 1SL1B 5FHIA 4BPYA 3RHBA 2EIQA 4XHMA 2DMMA 1GLQA 4TR3A 1YF0A 5F06A 2B1KA 1QQ2A 2HRFA 3HD5A 2YV7A 3DIEA 3IA1A 1XWAA 4GWRA 2KP1A 3W8SA 4KDYA 3TKSE 4I8BA 1YDKA 3BJ5A 2GQMA 5IOWA 2B6MA 2CV4A 1TXXA 1GTBA 4ACSA 3ISOA 4DEJA 4K8MA 1OC8A 4BVXA 2HSYA 2FWEA 3BD2A 4XS4A 4ZBAA 3ZITA 10GSA 3Q19A 4X0XA 1MD4A 1FAAA 3D4TA 2H0IA 4QQ7A 1Z5YE 1HQOA 3UVHA 2XHFA 5KN0A 1BJXA 1UC7A 2C0DA 4KDUA 3UEMA 1G6YA 1MTCA 4P3YB 1G6WA 2H6XA 2YJHA 5AGYA 5AIXA 1GL8A 1LBKA 2E0QA 1TOFA 4JU5A 5CRHA 1Y6EA 4OFMA 1PKWA 4QL9A 2FA4A 3VLNA 1R7HA 1GSYA 4TR4A 2F8FA 3L4NA 3IC4A 2CVKA 5ECPB 1GSQA 2FUG2 4HU9A 3KGKA 3LSZA 3GKNA 2LJAA 5GAND 2DSAA 1Z6NA 3C8EA 4HQZA 3WGXA 5G30A 5D8IA 1V9WA 2B5XA 1SK2A 1UN2A 1X9WB 1V98A 3Q18A 20GSA 3GKKA 4XIHA 5D9WA 1MDKA 2WGRA 3E3EA 5H5RA 3DKSA 1AIUA 1VF1A 3HDCA 3E0UA 1OE8A 3IXRA 2GT5A 1TJDA 2H19A 3KP8A 4V2MA 4IGJA 3PINA 4ECBA 1I9DA 1A8YA 1TU7A 2HFDA 3KM6A 3M9JA 3GL3A 3TRQA 3K8NA 5KEJA 4HQSA 3QDNA 4J56E 4KNDA 2R2JA 1NM3A 2JSYA 5ID2B 2OKAA 2EC4A 1GULA 5CYYA 4O5RA 2DJ3A 5HFIA 3EC3A 2WRTA 3I43A 4GLTA 2CAIA 3N5OA 3OR5A 5LNKe 4PQHA 4O32A 5H5SA 22GSA 1NW2A 4BWSA 3VK9A 4BL7A 4H86A 5F05A 2DBCA 4AJ8A 1G7OA 2CZ3A 3LXZA 1GSDA 1LU4A 4HEA2 5DDLA 3FR9A 3UBKA 2AJQB 5COHA 2HT9A 1TI3A 3O3TA 1NHOA 4IP1A 5DCGA 3HZ4A 4N10A 2FGXA 4I5QA 13GSA 2CX3A 1YZXA 2NPBA 2GZPA 2KOKA 4GQCA 5CNWA 3FZ9A 5F8BA 4XTSA 2JADA 2VL2A 2AB6A 4G2EA 4ECJA 3GX8A 5E59A 2A4VA 2O87A 1K3YA 5G2ZA 1M0UA 3GNJA 4CDOA 3V1WA 4NV2A 4KSMA 4CW9A 3WGEA 1T3BA 1V58A 4MJCA 3ME8A 1XW9A 3DYRA 1OC9A 4O92A 3LJRA 1ABAA 2P5RA 3FEUA 1PL2A 4F2IA 1XZOA 2XPEA 4WBJA 2LNTA 4Q5QA 3CSHA 4NAXA 3BOAA 2O85A 1FG4A 2ALBA 2H6YA 4RI7A 16GSA 3TOUA 4PX1A 4MABA 5DJLA 1TP9A 2GLRA 1X9SB 2OE1A 3LORA 5ENUA 1A8LA 4ZILA 3ZVJD 9GSSA 4F0BA 4BVYA 3G7YA 2VD0A 2VOCA 3VPTA 3C73A 2F9SA 2JZRA 1V57A 2L4CA 4J2FA 2OE3A 2I1UA 4LMVA 3WT1A 3MAKA 4TR0A 4JR4A 5GSTA 3GKMA 4K2DA 3ZYWA 3L78A 1QK8A 1S3CA 2MYGA 1DUGA 3HJOA 4CHSA 3IAM2 1EZKA 2O7KA 3TDGA 4L8EA 3TJKA 4K7OA 4EC0A 17GSA 4GSNA 2WCIA 2IN3A 3QOUA 4K1FA 2OA7A 2LTKA 2YPMA 3F3QA 1WMJA 1XXUA 1PL1A 4NHZA 1LJRA 3WT2A 4JE1A 2VL9A 4JR6A 1GTAA 1ZL9A 4LL1B 2FY6A 1I5GA 2GSQA 3US3A 4MZWA 2GSSA 1FB0A 1OKDA 4HZ2A 2FD3A 3ERFA 4WXTA 5ECHB 3LEFA 1U3AA 2QKEA 6GSXA 1K0CA 4GF0A 4MCUA 1O6JA 4ILFA 1GWCA 1OYJA 2NTOA 2MBTA 2DC5A 4F9ZA 4IN0A 2YWIA 3CMIA 2RM6A 4LL4B 2PPTA 3TKQA 2A2RA 4IKHA 4MF7A 1ZYEA 2K6VA 1TW9A 2WJUA 4ZBBA 2R6KA 5EY6A 2VIMA 2LJRA 3FW2A 3FY7A 5GAPD 3RAZA 2FHEA 1A23A 1PA3A 3VI7A 1KEBA 3GKXA 3Q6OA 2N5FA 3I69A 4TR1A 14GSA 3GRXA 5KN1A 4G10A 1XW5A 4PNGA 1T7PB 1PX7A 2XBIA 4Q5NA 1N8JA 1TTZA 5CP1A 4RI6A 1TK0B 4OMVA 5DQYA 2H72A 5FT3A 1OAZA 4XS4B 1B9XC 2IMKA 2OADA 4OCEA 1QFNA 5J9CA 1F9MA 1PQNA 2LQQA 2IL3A 1XVQA 4IQ1A 2OBKA 1WIKA 4GQFA 4EXJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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