4JR6A

Crystal structure of dsba from mycobacterium tuberculosis (reduced)
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
198
structure length
198
Chain Sequence
GDAVRVTSSKLVTQPGTSNPKAVVSFYEDFLCPACGIFERGFGPTVSKLVDIGAVAADYTMVAILDSASNQHYSSRAAAAAYCVADESIEAFRRFHAAMFSKDIQPAELGKDFPDNARLIELAREAGVVGKVPDCINSGKYIEKVDGLAAAVNVHATPTVRVNGTEYEWSTPAAMVAKIKEIVGDVPGIDSAAATATS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Structure analysis of the extracellular domain reveals disulfide bond forming-protein properties of Mycobacterium tuberculosis Rv2969c.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Possible conserved membrane or secreted protein
total genus 63
structure length 198
sequence length 198
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4jr6A00
4G9HA 3DGQA 5ELGA 3CSJA 3WT1A 2PBJA 1DBYA 3VI5A 3APOA 1SKSB 1K0OA 3F9UA 4CDOA 2AJQB 3MWHA 4K8MA 3HKRA 3F4RA 2VCTA 4POKA 2AV4A 3SWLA 4IS0A 1GTBA 4OMVA 2WB9A 2NPBA 4NAXA 1TU7A 1DE2A 4JZQA 3MAKA 5J9BA 1SKRB 5D96A 2CVKA 1AXDA 4K7NA 5A4VA 6GSXA 2R3XA 1K0BA 1GSUA 1Z7PA 2JL4A 3M0FA 4EF0A 3QPMA 1A2LA 3VI7A 3DEXA 5JCGA 2DIYA 1GH2A 2GSSA 3BJ5A 1XXUA 4NWYA 3ISOA 4HZ2A 2I4AA 1QXHA 4DSQA 3ZRDA 2NVLA 3QFBC 17GSA 2HI7A 4N0ZA 2PPTA 2RUEA 1ZOFA 4PXOA 1U3AA 4MJEA 3GSTA 2VL9A 4KSOA 1BAYA 3GKXA 5KN0A 4WR5A 1M9BA 1HD2A 3IAS2 4XS1A 1X9SB 2V32A 4V1Ap 3IK7A 2BMXA 3HCZA 4L0WA 5F0GA 5DDLA 2DSAA 4IBPA 4YQVA 3LJRA 3LWAA 2AB6A 5IMVA 3IHQA 4I6XA 5ECMB 4TXOA 1SJ6A 4P3YB 1A23A 1O8WA 4ILFA 3A2XA 4GTUA 3A2VA 6GSUA 5HR2A 3P2AA 3EE2A 2FNOA 5ECLB 2LJAA 2ES7A 5CRWA 2M80A 3CTGA 3JCML 1ERWA 2B7KA 4EL1A 1AQWA 3HJOA 2BTOT 1PSQA 3GV1A 3M3MA 1XWCA 1FG4A 1G7EA 3TKSA 4N0VA 2M46A 4MJBA 3NIVA 4KH7A 3EU4A 5G1KA 1FVJA 5F8BA 1HNAA 5B6MA 4J57E 2O7KA 5H5QA 2XC2A 4GQCA 4ECCA 4YAPA 5HFGA 5DVBA 2O8VB 4XS4B 2FGXA 2VD1A 1RW1A 5EVOA 1T4YA 5IPHA 4LLRA 2D2ZA 4LA1A 1TI1A 4IP6A 5D93A 3IXRA 5F07A 3CRTA 1R5AA 1R7HA 1V2AA 4I5QA 4QL9A 2C0EA 2H76A 4I2UA 2IMEA 2PN8A 2BJXA 1GSEA 4OD7A 3W8JA 1YDKA 4O7HA 3KGKA 1THOA 3LYPA 2GT5A 4X0XA 3IPZA 2YPMA 3HD5A 2VCXA 3KEBA 3APQA 1R4WA 5DQYA 4XS6A 2JACA 4BVXA 2PU9C 3CMIA 4GF0A 3TKSE 1GSSA 3I9V2 5ECOB 3IV4A 5KN2A 3ED3A 2AYTA 1Q4JA 4POBA 1BEDA 1MDJA 3ERWA 3TOTA 1ACVA 3D22A 2VCZA 3IE3A 3TJGA 2A2SA 2G0FA 2X99A 2H30A 2VL3A 5IMDA 3I6AA 4F03A 4GLTA 1B4QA 1M2DA 3LG6A 4LMVA 2FCHA 4XHMA 3KMOA 14GSA 1FO5A 3U6VA 1SK1A 2L4QA 4L0UA 1VF1A 1T4ZA 2TRCP 2GGTA 13GSA 3D4TA 3VWVA 2VM2A 3HXSA 2JU5A 3O76A 3GYKA 4FH8A 2K6VA 2FWHA 2R5GA 3TKRA 2OE3A 5A4WA 1XPVA 2RM5A 3WYWA 1TOFA 2HRFA 1KTEA 3TUEA 2CQ9A 1XWGA 1K0MA 4XRAA 2FA4A 2VIMA 1X9WB 4GRFA 4EDYA 4JBBA 2YWMA 1Z6MA 1WE0A 2EIQA 2N5BA 3K8NA 2PVOC 2YANA 3UARA 2X8HA 1LJRA 2JSZA 2KUCA 2V6KA 3J7Yb 6GSTA 4ZBDA 4GWRA 3F63A 1NSWA 3Q74A 1PL1A 1N8JA 4F2IA 4OFTA 4ML6A 4FYUA 3WGDA 2HSHA 3CXGA 3PR8A 3N9JA 2H75A 3HVXA 4OCEA 1CQHA 4BVYA 2KOKA 4HS1A 2H0GA 2FD3A 2H71A 1Z6NA 2DLXA 3TOUA 1ZYEA 3HZ8A 5AISA 4V2NA 5DALA 1XCCA 5IO2A 5A5KA 4PX1A 2GLRA 5G5EA 2YWIA 4JEDA 3DWVA 5DCHA 1X5EA 2YZHA 3GL5A 4NV2A 2F8AA 5ECSA 3IR4A 4WF4A 2CVDA 2RLIA 3EMXA 3VPTA 3AY8A 1YKAA 2GS3A 1WJKA 1UN2A 4G19A 4ID0A 2DJ3A 5ECQB 2YWNA 1TJDA 3GTUA 3DVWA 4MJCA 4PQ1A 3HDCA 3L9UA 2E7PA 2GZPA 1EEMA 3VWWA 4O92A 1ERUA 3TGZA 1NM3A 3J7Yk 3EURA 3CRUA 1TRVA 4ZBAA 3L0HA 3VWUA 1TU8A 5ECHB 5A4UA 5C04A 3C8EA 4NPBA 3RPNA 5JWQB 3FK8A 3ZTLA 5ECRB 4CHSA 2IMDA 4Q5QA 2AAWA 1T00A 3GH9A 4PQHA 5IPGA 4XRDA 5G5FA 1M2AA 2J9HA 1U3IA 4G10A 3M9KA 4HJ2A 4DSSA 2LS5A 3FZ5A 5LNKe 1BG5A 2LEGA 3ZFBA 1ZL9A 1A2MA 5AIVA 5D8IA 3UL3A 5IM9A 2Z9SA 2C8UA 1QK8A 2FY6A 2P5QA 3HA9A 1S3AA 4WR4A 4HUAA 3MNGA 1JZOA 4KE3A 4KDYA 4KDXA 1EZKA 1A24A 2GDRA 2DJ1A 5DJLA 1XVWA 1HNCA 5ECNB 4QQ7A 3DYRA 3IC4A 2VOCA 1J0FA 1FHEA 5B6NA 3G7IA 1QUWA 1V98A 3KTLA 4K0GA 3SBCA 3HVVA 2NBSA 4AGSA 2YNXA 4GSTA 3R2QA 1B48A 16GSA 1AW9A 2XHFA 4GSSA 3UBLA 2MYGA 4YQMA 2E2MA 3E3EA 3QD9A 1EEJA 1SU9A 3ZL5A 1ILOA 3GIXA 3V1WA 20GSA 2WFCA 2IL3A 2VUPA 3TRXA 3FKFA 3MSZA 4BWQA 1T7PB 2GVPA 19GSA 4ZILA 3GH6A 3KXOA 4KSMA 4MK3A 2C3NA 3E9JB 1VGLA 2CAQA 3FY7A 1U88A 1YQ1A 1O8XA 3IBHA 4IJ3A 4NXIA 2YV7A 4PGTA 3GKNA 3LXTA 4IELA 2H1AA 2IFQB 4N11A 4KNDA 5INYA 4DSRA 5GSTA 1M2BA 4XCSA 3TRPA 2E2GA 2EIRA 1JLVA 1R5PA 3H4KA 3Q6OA 4MPFA 3ZZXA 5HFKA 4TR1B 4KB3A 5FWGA 1N2AA 3C71A 3M8NA 2QGVA 5KEJA 3GNJA 4LMWA 3GFKA 3UBKA 1HQOA 2YN1A 4BWSA 2FA8A 4ECBA 3TB2A 4KUNA 4ACSA 5H5RA 1Q98A 5ENUA 3A2WA 1RQMA 5IMAA 1A8YA 4MABA 1HNBA 3BD2A 1AIUA 1UA5A 2L5LA 4IQAA 3OR5A 4KAEA 2OBKA 4WKWA 5E4WA 2MMAA 1Z9HA 1TP9A 3HHVA 3FHKA 1AUCA 1OAZA 4ECJA 1VRSD 3PINA 1PRXA 2I1UA 4Q5FA 1ERTA 2EC4A 2HT9A 2IJYA 2R6KA 4DEJA 3H1NA 5COHA 3DMLA 2ZCTA 4EC0A 3MDKA 2OE0A 4HZ4A 2TRXA 2MMZA 4ZIJA 4MF5A 1SENA 5DBQA 3O6TA 4G2EA 5B8BA 1MD3A 4NV5A 1GTUA 3UVHA 1WMJA 2OKAA 3QAGA 1KNGA 1TK5B 1BYEA 3HY2A 3G7JA 2PERA 1SL0B 3TJJA 3RBTA 1TRUA 2AUVA 4Q5RA 3QDNA 1URMA 2I9HA 3KP9A 4PUFC 5IMFA 4FYBA 4RI6A 1LBKA 3TKQA 4X43A 1TRWA 4FIWA 5HR0A 3LSZA 1XZOA 1NW2A 2YV9A 1B8XA 3F3RA 3RPPA 1GNWA 2ZUPA 3F0IA 5E59A 3QFAC 5DCGA 3ZMLA 5JCWA 1WIKA 4XS4A 1O6JA 4O5RA 2H0HA 1G6YA 2GSTA 3DXBA 1M9AA 3W8SA 1JFUA 2LUSA 1FOVA 1YKCA 1X9MB 10GSA 1QQ2A 2VL2A 3U5RE 1FW1A 3VK9A 1M7TA 2GTUA 1AQXA 3ME7A 1B9XC 4I97A 3O3TA 3KMNA 3VWXA 4K1FA 4TXVA 4ZB9A 1R26A 2P0GA 4RUVA 4NHWA 2E0QA 4J56E 3EVIA 3FZ4A 1B4PA 1GULA 4I2TA 3UMAA 2X8GA 1PX6A 3F6FA 2LV3A 4V2LA 4D73B 3GMFA 1W4VA 4IN0A 1O7UA 3LFLA 4IGJA 1OC9B 1MDKA 1ZZYA 3FR9A 3NOFA 3TKSC 3HYPA 2JZTA 3GL3A 1XOBA 1K0AA 5ID2B 1YEXA 1OKDA 1Z3EA 5HR3A 4WEYA 2QC7A 1VF2A 1F3AA 5J41A 4ZXGA 5IQYA 5IIZA 2HZFA 2C4JA 3EYTA 2H1GA 2H6ZA 4HU9A 4JR4A 2K9FA 1PL2A 1XW6A 4D73A 3ZYWA 3UOMA 2H70A 4Q5NA 1U6TA 3GKMA 2C0GA 3VFIA 1PQNA 4MDCA 5LD0A 3GX8A 2C0DA 1B9YC 1EP7A 3TJFA 3W6GA 2KP2A 1KEBA 1FB6A 2IMIA 1MTCA 2AHEA 3WT2A 2IMFA 2C1YA 1VF4A 5CYYA 5IMZA 5D9VA 4POMA 1SL2B 1PKZA 2PWJA 1ZGNA 5GAND 2WDUA 1MDIA 2L57A 3TJBA 1AC1A 2GZYA 4KGIA 8GSSA 3F4SA 2GQMA 1TRSA 3E0UA 2LTKA 1SD8A 2VL2C 4I8BA 4TOPA 2FWFA 2QKEA 4AJ8A 2DJJA 5FHIA 4V1Ag 2DJ0A 1WP0A 3DVXA 3GX0A 1XWKA 2X64A 2DC5A 1SJIA 1F2EA 2A2RA 3RHBA 1O81A 3Q19A 4OWYA 4TN8A 2DJKA 5F06A 2FLSA 2ZNMA 3BCKA 1ZYQB 5G30A 5DAKB 3CBUA 2V1MA 3P8WA 2N5AA 2DIZA 4RQRA 1FAAA 2YJHA 1WRYA 4XIHA 4V2MA 22GSA 3EMPA 1OVNA 3KZQA 1XWAA 2L4CA 1SK2A 2I3YA 4WXTA 3ZITA 2HLSA 3UJ1A 2GSRA 1I5GA 1XIYA 2OE1A 2WS2A 4ZB6A 3RHCA 1J9BA 2C80A 4N10A 5G31A 2GSQA 3L9SA 2HZEB 1WWJA 4PNGA 3IDVA 4GSNA 1J08A 3DRNA 3H8QA 5CAXA 1PX7A 4IW9A 2H1DA 4E8HA 4JE1A 3CSIA 1USBA 2HYXA 3FEUA 3KM6A 1UVZA 2O87A 1EV9A 1XVQA 4AJ6A 1I9DA 5EL8A 1AQVA 1HYUA 3FRCA 1GP1A 2V41A 4MZCA 4NHZA 3UVTA 3ZIJA 1AAZA 3CYNA 3WD6A 5J3RA 4IKHA 4HOJA 4J2FA 1K0CA 2XPDA 5B8AA 3IRAA 4MMMA 2X8CA 1PA3A 1GUKA 1EOGA 2KLXA 3F6DA 5F05A 3GRXA 4L8EA 3IAM2 6GSVA 3APSA 4PUAA 4HEA2 4KDUA 3ZMKA 1F37A 2NDOA 1K3OA 2C3TA 2HFDA 4E8EA 2VCQA 2IPAA 2MBSA 2HRNA 1O85A 3GURA 2DMLA 1WOUA 5AN1A 3KD0A 1GSFA 3TDGA 2MMOA 1OYJA 2HE3A 1GUHA 1YF1A 4O32A 3ZLPA 2B5YA 4ULXA 4MLYA 3QAWA 3FZAA 1K0NA 5IOWA 3DIEA 2LQOA 3ZFLA 4HI7A 2LNTA 3KJYA 3QAVA 2YZUA 3NZNA 1DUGA 2LJRA 2OADA 3FR3A 2VCWA 2WGRA 1KBNA 1E2YA 1FVKA 5JCUA 1GUMA 1Z5YE 1T8EB 1GTAA 2J23A 2LSTA 1EOHA 4MZWA 1GWCA 5G2ZA 1BX9A 2L59A 3C1RA 1ON4A 2LRCA 3A5WA 1GTIA 1OE7A 2DMMA 5HR1A 4AJ7A 2IWTA 1H4OA 2H0IA 3IOSA 2CAIA 4RQXA 3PH9A 2A4VA 4YQUA 4ZBBA 1ML6A 2VM1A 4K9ZA 2REMA 1V58A 3I69A 1IYHA 5CRHA 4JRRA 1SL1B 2RM6A 2P31A 2B3SA 4KX4A 4K6XA 5GAPD 2YP6A 1THXA 3HVSA 4YH2A 3ERFA 4QL7A 2L6DA 1QMVA 1SD9A 2LQQA 5H5SA 4DVCA 4ML1A 3D5JA 3CSHA 2VO4A 5AGYA 5LCZA 4IJIA 4IP1A 1PGTA 5DQSA 1JHBA 4MCUA 1V40A 3LXZA 5ECPB 2IMKA 3D0ZA 1RK4A 3M1GA 1VF3A 1JZRA 2GT6A 1EGRA 1GL8A 4HQZA 2YCDA 3F8UA 2TIRA 3L9VA 1A0RP 3Q18A 5JWOB 2WCIA 6GSWA 1BQ7A 3FZ9A 4K2DA 3LYKA 4K7OA 1YF0A 3C1SA 2IFQA 1PD21 2HNLA 4ECIA 5CO3A 3S9FA 2OBIA 3L78A 1IYIA 5B7CA 1NHYA 5HQPA 4TXOB 4HJMA 1X5DA 5IO0A 1XWBA 4OCFA 2WZ9A 3RDWA 3P90A 4MPGA 1BJXA 3WGXA 1V57A 5AIXA 4ZL9A 1Y25A 2EIOA 1M0UA 1K3LA 5EY6A 4KA0A 1C72A 3VLNA 4TR1A 2CZ2A 3KTBA 4TRXA 4BPYA 2F3MA 2XBQA 3WGEA 4KW6A 1GLPA 2PVQA 6GSSA 4IVFA 1OKTA 3UEMA 4LL4B 5D9TA 2F9SA 2LJKA 2O85A 4F82A 3UIWA 1ERVA 4WBRD 5CP1A 3VPQA 5J4UA 4TR3A 4POLA 4OO5A 1LU4A 5KN3A 4TW5A 1T1VA 4MF6A 1FB0A 3HJMA 3ZVJA 1YJ6A 3GA4A 3M9JA 1GSQA 1OC3A 4TR0A 5J5NA 4L5OA 1EV4A 3D6IA 4ZL7A 1PMTA 1W89A 4EUYA 18GSA 2PUKC 2WJUA 1V9WA 5D73A 1G0TA 2MMNA 5IOXA 11GSA 1GSYA 3FR6A 2HSYA 4KCAA 3F4TA 4WF5A 1A2JA 3DD3A 2VLUA 1Y6EA 2QSIA 2R4VA 3P7XA 3CTFA 2K8SA 5ECKB 2H1BA 1F9MA 5CRGA 3D4MA 2CT6A 2B1KA 3EC3A 1SYRA 2PGTA 1F3BA 5D9WA 1PKWA 1SYXA 2H72A 1DE1A 1ABAA 2VCVA 2DBCA 2LRNA 2WRTA 5FT3A 1WPIA 3KIJA 1QFNA 3DKSA 4HDEA 2ON5A 4EXJA 3QR6A 1GNEA 3TRQA 1JZWA 1Z7RA 2K8VA 1OE8A 3QCPA 4EVMA 2ALBA 4IQ1A 3ERGA 2H74A 1TKDB 4WBJA 2H73A 2IN3A 4IHUA 5CREA 1S3DA 2H19A 4EE0A 1A8LA 3H93A 3N5OA 3HJPA 6GSYA 5ELAA 5ECIB 4TKYA 2XPEA 2B5EA 3F3QA 2GZZA 2V6OA 4AF2A 3GN3A 5JWRB 5EPFA 4MJAA 2PMTA 1GSDA 3LGCA 2B1LA 3I43A 2H01A 2DJ2A 2H66A 5ABRA 7GSSA 2ON7A 4OO4A 3TCOA 2C3QA 4CW9A 1X0RA 2N5FA 1F6MC 3FYGA 1OC9A 4Z7XA 1DSBA 2KHPA 4ZL8A 3ZREA 2CA8A 4RI7A 4MA9A 1NHOA 5ID2A 1S3CA 2KP1A 3H79A 3QOUA 2I81A 4TVEA 5DJMA 5CRDA 4GCIA 3HZ4A 1T3BA 5CNWA 4BL7A 4HQSA 2XBIA 2B5XA 4EO3A 1SKWB 4MZBA 2GQLA 2L6CA 2LRTA 1TI3A 5KN1A 3US3A 5DALB 3EINA 4GQFA 1JLWA 5D9XA 2MBTA 1M99A 3BOAA 2FWGA 4N30A 2FWEA 4BA7A 3LEFA 12GSA 1U87A 4FYCA 3LORA 1O73A 2JZRA 5GZZB 4NMUA 4TR4A 4YAVA 1XW9A 2F51A 1TK0B 3IK9A 2FHEA 5IMCA 3TJKA 3GTUB 1TDIA 2MZCA 2R2JA 1X5CA 1PN9A 4MP4A 3IA1A 3G7YA 2OJLA 5GSSA 2VD0A 1CQGA 5J9CA 1XOAA 4X1UA 4F0BA 1TW9A 3RAZA 2CX3A 1K3YA 2VLTA 5DAKA 4L5LA 2P5RA 3EU3A 3BCIA 2CZ3A 4LL1B 4XTSA 1ZCPA 2CX4A 1YY7A 3D21A 4MH3A 3EWLA 1XBSA 1E6BA 4OFNA 4F9ZA 1QGVA 3KP8A 2JADA 2K18A 4K0NA 4GXZA 2FUG2 3ME8A 3ZVJD 4EDZA 4F0CA 1G7OA 2V2GA 2M72A 4JU5A 1ZMAA 4JR6A 4PNFA 1YEPA 3GHAA 2JZSA 2H8LA 2HZEA 1XFLA 3KH7A 2B6MA 3TKPA 1G6WA 4DSSB 1MD4A 2IIYA 1XW5A 1EP8A 2CVBA 3C7MA 3PGTA 2YJ7A 1GLQA 2LKUA 4MF7A 1MEKA 3A3TA 2HXKA 2WULA 2CV4A 2L5OA 4K7IA 2RIIA 2YOIA 1TXXA 4H86A 4ZB8A 1A0FA 3GKKA 3KCMA 4EKZA 4PURA 3VURA 1GRXA 2F8FA 4WETA 3QMXA 1YZXA 4HU7A 4OFMA 2B7JA 2VAFA 1EGOA 2OA7A 2OACA 1TTZA 4ISDA 1UC7A 3GUSA 2LNSA 1EWXA 1OC8A 2G2QA 2JSYA 1SK0A 3FW2A 2C0FA 1K0DA 1TK8B 1JZDA 2O89A 3L4NA 4KCEA 9GSSA 5HFIA 2NTOA 5L71A 4MH2A 3ZIVA 3G9BA 2R37A 2VLVA 2YWOA 2GQKA 1H75A 3UAPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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