4JR6A

Crystal structure of dsba from mycobacterium tuberculosis (reduced)
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
198
structure length
198
Chain Sequence
b'GDAVRVTSSKLVTQPGTSNPKAVVSFYEDFLCPACGIFERGFGPTVSKLVDIGAVAADYTMVAILDSASNQHYSSRAAAAAYCVADESIEAFRRFHAAMFSKDIQPAELGKDFPDNARLIELAREAGVVGKVPDCINSGKYIEKVDGLAAAVNVHATPTVRVNGTEYEWSTPAAMVAKIKEIVGDVPGIDSAAATATS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Possible conserved membrane or secreted protein
publication title Structure analysis of the extracellular domain reveals disulfide bond forming-protein properties of Mycobacterium tuberculosis Rv2969c.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule tags Oxidoreductase
total genus 63
structure length 198
sequence length 198
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4jr6A00
2VCWA 1KNGA 1J9BA 3BOAA 1JZRA 2ON7A 1XWAA 4HI7A 1HYUA 1N8JA 4QQ7A 4TR4A 3A2VA 5IMFA 5IOWA 2G2QA 4DSSB 2V6KA 4J2FA 5E4WA 3GN3A 1ZGNA 2X8GA 1WRYA 3LG6A 4G9HA 4WBRD 4YH2A 2REMA 3HVSA 4RQXA 1ST9A 5A5KA 1FG4A 4K7IA 1XZOA 3KJYA 4NHZA 4L5OA 4X1UA 2H0HA 1M2BA 1TW9A 3EE2A 1YY7A 3FR9A 1SK0A 2MMNA 5AN1A 4XS1A 1PN9A 1ACVA 1M9AA 4IP6A 1A8YA 2JZRA 5ECQB 1X5DA 4MPGA 5B8AA 1Z5YE 4GXZA 3KMOA 1XPVA 1NW2A 2KUCA 2P5QA 4GF0A 4NPBA 2CX4A 1K3YA 4XS4B 3BCIA 4KE3A 3ISOA 4IS0A 4IHUA 2DJ0A 4HZ4A 1Z6NA 4Q5RA 1VRSD 1EV9A 5FT3A 5IPHA 2DJ1A 4ILFA 3BCKA 4XRAA 3HJMA 4V2LA 4MABA 1T4ZA 1SJ6A 3FKFA 2CZ3A 2VOCA 2H30A 3H1NA 4O5RA 4BVXA 2C0EA 1A0FA 1JHBA 1F2EA 2H01A 2OA7A 3WD6A 4IKHA 4F03A 1AQXA 4RUVA 4TN8A 1Q4JA 4MJBA 4POKA 2HRFA 3HJOA 1BJXA 1OC9B 3F6DA 5D9TA 1SKRB 1MDIA 3L4NA 5ENUA 2GS3A 5DQSA 2CVDA 4RI6A 2O8VB 1DUGA 1W89A 4HJ2A 4KSOA 1M2AA 2J9HA 4KCAA 5B8BA 5IMZA 2HZEB 2R2JA 4X0XA 4FYUA 1XVQA 4L0UA 1EP7A 4PURA 4FO5A 3Q18A 7GSSA 1GTUA 3M9KA 4PNFA 1DE2A 1PRXA 4HDEA 4MJCA 1G6WA 1SL0B 4KDYA 1PL2A 1NM3A 5ECOB 2VAFA 1GSQA 4EDYA 3LYKA 4ECBA 2DJ3A 2XBQA 1F6MC 4K1FA 1JZDA 3WGXA 1YF1A 4GTUA 3UOMA 3H4KA 2HLSA 1GWCA 11GSA 1M2DA 3D4MA 2OACA 3GNJA 2HYXA 4MH2A 2YJHA 1A23A 1TI3A 2CVBA 2C0GA 1HNCA 3C1SA 1RK4A 4TXVA 3GIXA 5JWOB 1SL2B 4ISDA 4NAXA 1ILOA 1TXXA 3KXOA 1KEBA 4XHMA 1V2AA 2FCHA 3UIWA 3M3MA 3KCMA 2C80A 2VM1A 3TJGA 3IR4A 4DSRA 3QFAC 5CNWA 3TRPA 1SKWB 3ERFA 1TRSA 2F9SA 2YN1A 2L6DA 5IMAA 1O8XA 4G10A 4X43A 4PUAA 3EVIA 2YWIA 4KAEA 12GSA 2L4QA 2EIOA 5IO2A 5B7CA 3L0HA 5A4WA 1O85A 3F6FA 1U3IA 2HT9A 2PVOC 4BPYA 1XW5A 4HJMA 1WE0A 5HQPA 2GQLA 4GRFA 3VI7A 4POMA 22GSA 2FUG2 1SJIA 4BWQA 5GZZB 1TK0B 4TXOA 2JL4A 1PKZA 1SD9A 3C8EA 1PL1A 2VL2A 3VPQA 4HQZA 4GWRA 4OO4A 5A4VA 3MWHA 4NHWA 3LQ7A 3UJ1A 3HVXA 2V32A 3HD5A 4OD7A 4KCEA 1SL1B 1O7UA 1YKCA 3TUEA 1Z3EA 1TK5B 5HR1A 4AF2A 3HDCA 8GSSA 3CRTA 3ERWA 1K0BA 2E2GA 1TJDA 3IV4A 2VD0A 2GSSA 2AUVA 3GX0A 4KB3A 3DVWA 3A5WA 3GTUB 3DXBA 1EZKA 5D96A 1X5CA 2H74A 3KTBA 4V2NA 3ZITA 1U88A 6GSYA 3IA1A 3ZTLA 10GSA 4MJEA 1J0FA 2LRCA 3GUSA 1B4QA 2HZFA 1BX9A 4ZBAA 2H1BA 3ZLPA 2KOKA 4ECJA 1THXA 5DVBA 4PX1A 2ES7A 1XOBA 3TGZA 4PQIA 2H0IA 4POBA 2WULA 2LRNA 1I9DA 4K7OA 1DSBA 4H86A 1EV4A 2B3SA 3EMXA 5C00A 1T7PB 3ZYWA 4D73A 3WT2A 2GQKA 2WFCA 3A2XA 2F51A 3C1RA 3F0IA 4WEYA 1K0OA 3ME7A 2H1GA 1VF2A 1GTIA 1WWJA 4XIHA 3GRXA 1GUKA 5IM9A 2VCTA 1ZZYA 4F9ZA 4NXIA 5ECLB 1RW1A 1TDIA 5J5NA 1X9WB 2R6KA 4GQCA 4ZBDA 1BAYA 1HNBA 2GZZA 4IJIA 3VWVA 1TP9A 3V1WA 5HFKA 3VWWA 5IMVA 3QAWA 4LA1A 1JLWA 1V98A 2TIRA 3CSHA 2MMOA 5ECKB 2HXKA 4DEJA 3FW2A 1OE8A 3VWUA 5KN1A 5ECPB 2WGRA 5CYYA 1O6JA 4E8EA 4NV5A 1A8LA 2VCXA 3GA4A 2YWNA 1WMJA 3BJ5A 2IMKA 2WZ9A 1VF3A 2CX3A 1GP1A 2C0DA 1AUCA 3UBLA 1UVZA 4YAVA 2GZPA 4BVYA 1XW9A 4MZCA 4HUAA 1F37A 1TRWA 1BG5A 1GNWA 2FGXA 2DLXA 3VWXA 4EE0A 2L5OA 4Q5QA 2C3TA 2ZCTA 4ZL9A 4F0BA 3PINA 3ZIJA 2KP2A 4I6XA 5ID2A 2P0GA 5JWQB 3HY2A 4V1Ap 3FR3A 3HHVA 4MZBA 3FZ4A 3RHBA 5G2ZA 1YQ1A 4K8MA 4TRXA 2QC7A 3KMNA 4NWYA 1URMA 4O7HA 4OFNA 5GSSA 1T3BA 3GL3A 3ZMLA 2IWTA 5AISA 4IELA 3RHCA 5AIXA 6GSTA 3SWLA 1S3DA 1X9MB 3PR8A 2I4AA 4K0NA 2MBSA 2C3QA 2IJYA 4IQ1A 1SD8A 3UAPA 9GSSA 4K9ZA 2PPTA 2C1YA 2EIRA 1ZMAA 4YQUA 2RLIA 2HE3A 1OKTA 3PGTA 2VLTA 2YJ7A 3MSZA 2YNXA 3TKSE 4CHSA 3GYKA 2I9HA 4DSSA 2NBSA 2DBCA 4WR5A 2WS2A 3IPZA 5H5RA 3I43A 5IMDA 3ZRDA 1A2JA 1KTEA 1PGTA 3M8NA 1FW1A 3IXRA 2GZYA 4AJ7A 3EU4A 2N5BA 1AAZA 2HRNA 1MDKA 2H1AA 4TR3A 2FWFA 1B48A 1AW9A 2KHPA 2X8CA 2FHEA 1QXHA 5DDLA 2KP1A 2G0FA 1KBNA 3J7Yk 3TJBA 4G2EA 5JCWA 2B7KA 1OYJA 1K0MA 2XPEA 2DMLA 4ZB9A 3TKSC 4HOJA 1QK8A 3QDNA 4F2IA 2FY6A 3TDGA 2XPDA 4ACSA 2DJ2A 2I81A 4DVCA 3CSJA 2JU5A 19GSA 3HA9A 2LTKA 2WB9A 3CSIA 4MCUA 3EMPA 4L0WA 3US3A 2CT6A 4N30A 3TJJA 2CAQA 4IVFA 3I6AA 5COHA 1F3AA 1R26A 3TKRA 4V2MA 5GSTA 1GLQA 1SENA 5D9VA 1FVKA 3D6IA 2MMZA 1E2YA 1SJZA 3EC3A 3EU3A 4J57E 4LLRA 1XXUA 5KN0A 1YEPA 14GSA 1TTZA 3RPNA 3VURA 1PMTA 4KGIA 4TOPA 4FYCA 3D5JA 5DJLA 4KA0A 3L9SA 2DSAA 1YDKA 3BD2A 3KTLA 5G5EA 4IW9A 1I5GA 4WF5A 1SKSB 2GQMA 3NOFA 4OCEA 3QD9A 3DYRA 2NVLA 3Q74A 3P2AA 2RM6A 2HZEA 2H6ZA 1U6TA 1XWBA 2H75A 1ML6A 18GSA 1N2AA 3QFBC 5G31A 2DMMA 3ERGA 1B8XA 3GV1A 2CQ9A 3LYPA 1T1VA 4EF0A 5KEJA 3WGDA 4EO3A 4MF7A 1DE1A 1WIKA 4MPFA 1BYEA 3NIVA 2PN8A 1JLVA 3VPTA 3HZ8A 4K7NA 1M0UA 2M46A 1G0TA 5A4UA 5CRGA 5FWGA 3W6GA 4ML6A 5GAND 5DALB 1Q98A 5CRDA 2R3XA 3GKMA 17GSA 4MH3A 1FAAA 2YANA 5F07A 5DAKB 3O76A 1HQOA 4EXJA 2O87A 1QQ2A 2P5RA 1AC1A 4TW5A 4LL1B 2K9FA 4JR6A 3TKPA 4CW9A 5ECMB 2WDUA 2VD1A 4MK3A 4EVMA 4BA7A 3UEMA 1U3AA 3KD0A 1X0RA 5EPFA 2X64A 1TU7A 2TRCP 4WXTA 4EC0A 4PQHA 1GSEA 2CVKA 1J08A 2WRTA 2GTUA 1OE7A 4K6XA 1ERTA 2YWOA 2LKUA 4IBPA 2N5FA 4L5LA 2DJJA 2WJUA 2BJXA 2CV4A 4ZIJA 4KH7A 1K3LA 4P3YB 1SU9A 3LJRA 5DCHA 4FIWA 1TI1A 3GKNA 1A24A 3N9JA 1EWXA 2K8VA 3R2QA 3I9V2 5DJMA 2FA4A 3HJPA 3ZFBA 1MD3A 2OBKA 2YZUA 4CDOA 1X5EA 5HFIA 4TR0A 3SBCA 2MMAA 5GAPD 4KW6A 2RM5A 2PVQA 2PBJA 1OC8A 4JEDA 3BBYA 3E0UA 2GSQA 1QMVA 5D9WA 1UA5A 1XWKA 2B1LA 2JZSA 1B9XC 2YOIA 3E9JB 3UVHA 5JWRB 2VLUA 4MF5A 3C7MA 3IHQA 4O92A 2LNSA 2GT6A 5DBQA 3Q19A 5EY6A 1GRXA 2GVPA 3GSTA 5F0GA 2VIMA 1XW6A 2H6YA 2F3MA 3P8WA 1K0CA 3ZIVA 4ML1A 4GCIA 2K6VA 4GSNA 4PQ1A 2IFQA 4ZB8A 1MTCA 4OWYA 3APSA 1B9YC 2V2GA 1R7HA 1XWGA 2O85A 2ZNMA 5H5QA 4RI7A 2C3NA 4HS1A 1LU4A 3PH9A 4QL7A 3TRQA 3HXSA 2CZ2A 1ABAA 2B1KA 1R5PA 1Y6EA 1SYRA 5D8IA 2VM2A 2B5XA 1PX6A 1AIUA 1TRVA 3DGQA 2FWEA 1PSQA 3IK9A 1BEDA 1GTBA 3HYPA 5HR2A 2RUFA 2BTOT 2XHFA 1GSFA 2B7JA 1XCCA 4ZILA 1V9WA 4WETA 3KZQA 2PUKC 1U87A 3ZFLA 3D21A 2JZTA 5ECIB 1ERUA 2L4CA 4EDZA 3P7XA 16GSA 1XVWA 3OR5A 2YZHA 4TVEA 1NHYA 3QOUA 1LBKA 4AJ8A 2OE3A 3TCOA 3IBHA 1O81A 2XBIA 4XTSA 3E3EA 2F8FA 2JADA 3KH9A 4E8HA 1M9BA 5J41A 3MDKA 4LMWA 2JSYA 5B6MA 2JACA 4GSTA 3UBKA 3QR6A 5J3RA 2A2SA 4EKZA 3FHKA 1G7OA 1XOAA 3KGKA 5IMCA 1S3CA 1PA3A 3IK7A 2NTOA 3EINA 1O73A 3DWVA 1SK1A 4O32A 4TR1A 4Z7XA 4Q5FA 3UMAA 2VCVA 3TKSA 5CO3A 3W8SA 3Q6OA 3FEUA 2B5YA 1SK2A 3GURA 3FZ9A 1HD2A 1NHOA 1MEKA 2OADA 2IIYA 1THOA 1CQHA 4WF4A 2IPAA 3HKRA 3UARA 3F63A 3TJFA 2VL9A 5G30A 1GSUA 3N5OA 1SYXA 1BQ7A 3M0FA 1ZL9A 1JZWA 1FO5A 5LCZA 4IQAA 2DC5A 3ED3A 2H73A 3HVVA 4K0GA 3TOUA 3F9UA 5KN2A 3VI5A 1JZOA 3I69A 1FOVA 3UL3A 4HU9A 3ZL5A 5ID2B 3GKKA 2L6CA 1LJRA 3G9BA 2LEGA 3CXGA 2R5GA 4JBBA 5DQYA 5INYA 5L71A 5JCUA 1EEMA 2HSYA 1FB6A 5ECNB 4WBJA 2CAIA 4RQRA 1V40A 1XBSA 3FZ5A 4WKWA 2O7KA 2AAWA 4F0CA 1TKDB 3ZMKA 2GLRA 1ERWA 2P31A 3CTGA 2ON5A 1OVNA 4OCFA 3RBTA 1MD4A 2MYGA 4GQFA 4HZ2A 3G7JA 2HI7A 3UVTA 2B5EA 5EL8A 4MP4A 3GL5A 4KDUA 2FLSA 3LWAA 1AQVA 3HZ4A 4KUNA 1GTAA 1EOHA 1Z7PA 2L59A 2WCIA 3CYNA 1XWCA 1ZCPA 3F3QA 3CTFA 4Q5NA 4ZXGA 3D0ZA 1Z9HA 2XC2A 3D22A 4PNGA 3L78A 2QGVA 4KDXA 3IAM2 2ALBA 5IOXA 2A2RA 2ZUPA 2H6XA 1F3BA 3TOTA 4LL4B 4ZL8A 2OKAA 3DVXA 2FNOA 3K8NA 4K2DA 5F06A 3RDWA 2H66A 4JR4A 3IE3A 2MZCA 4NV2A 3F4TA 1GLPA 4NMUA 2M72A 1G7EA 1EP8A 1HNAA 2C8UA 1QUWA 1K0DA 2E7PA 1W4VA 1ZYEA 5J9CA 4XS4A 1K3OA 3DEXA 3CMIA 4JZQA 2YV7A 1OAZA 2H72A 3EWLA 4LMVA 1GL8A 2H1DA 4HU7A 3RAZA 2GSRA 3EURA 3J7Yb 3DD3A 1MDJA 3G7IA 1YEXA 2H76A 3DMLA 4TKYA 1M7TA 4MMMA 4J56E 4XCSA 3ZVJD 2DIZA 2QKEA 3A3TA 3M1GA 1M99A 2YWMA 2LUSA 3LEFA 3QPMA 1TK8B 1VF4A 4N10A 2LJAA 2LQOA 2GGTA 4YQVA 1QGVA 3A2WA 2YPMA 5HFGA 2I1UA 1CQGA 5ELGA 1F9MA 1OC9A 3KP8A 20GSA 3CRUA 2R4VA 4MZWA 1DBYA 2GSTA 3APQA 5HR3A 2L5LA 3JCML 1T8EB 2LJKA 2R37A 1EGOA 1GUMA 3GH9A 6GSUA 5D9XA 3L9UA 2FWHA 1WJKA 3H8QA 4JE1A 4HQSA 5IIZA 2PU9C 3WT1A 5ECHB 2AYTA 1IYIA 1PX7A 4XS6A 3VLNA 2VCZA 1WOUA 1JFUA 2F8AA 4IGJA 3GHAA 2X8HA 5CAXA 2IN3A 1A2LA 2LJRA 3KP9A 5IO0A 2PWJA 4MF6A 3FR6A 3MAKA 4FH8A 5ECRB 1ON4A 4QL9A 3D4TA 3LSZA 2LV3A 1R4WA 3IAS2 2VCQA 3L9VA 3IC4A 2HFDA 1GSSA 2V6OA 2IMIA 1EOGA 1ZOFA 2VUPA 4JRRA 5G1LA 1B4PA 4BL7A 6GSWA 3S9FA 5DALA 5CP1A 4IN0A 5G1KA 2J23A 2LS5A 2C4JA 4I2TA 5DAKA 5G5FA 2AJQB 1K0NA 1PD21 2Z9SA 1VGLA 4MJAA 4AJ6A 1XFLA 1H4OA 1K0AA 1TRUA 2I3YA 2EIQA 6GSVA 2H8LA 3GSSA 5JCGA 13GSA 1GSYA 1UN2A 2RIIA 5KN3A 1T00A 3GFKA 1USBA 5CREA 2C0FA 2X99A 5D93A 3FK8A 4YQMA 4G19A 2E0QA 3DIEA 2H0GA 4ECIA 2PMTA 1YF0A 1H75A 2NDOA 1PKWA 3LGCA 1RQMA 1OKDA 3GH6A 3H79A 3ZZXA 2N5AA 1FB0A 2AB6A 2TRXA 4EUYA 5ABRA 3RPPA 2AV4A 3O6TA 3WGEA 4KSMA 4EL1A 2D2ZA 3F4SA 2V1MA 5FHIA 2V41A 4ZB6A 3QMXA 4TXOB 1FVJA 3ZREA 4OFTA 3U6VA 5J4UA 1G6YA 1A0RP 3VK9A 3U5RE 2YCDA 3CBUA 3IDVA 5ECSA 4JU5A 3MNGA 2VL3A 2IMEA 3LORA 3ZVJA 4AGSA 3GMFA 1XIYA 1R5AA 2AHEA 2M80A 3LFLA 1GH2A 2B6MA 5EVOA 4OO5A 2H71A 2IMFA 1EGRA 2A4VA 3M9JA 5CRWA 2IFQB 5B6NA 4WR4A 4MLYA 2KLXA 2YV9A 3F8UA 3ME8A 3GTUA 2YP6A 1C72A 1NSWA 4V1Ag 2FWGA 2QSIA 1AXDA 2OE0A 2O89A 1PQNA 4ZL7A 2IMDA 3DKSA 4IJ3A 2K18A 4OMVA 4GLTA 2BMXA 2GDRA 1QFNA 1GNEA 1S3AA 3H93A 3F3RA 5LNKe 3QCPA 2FA8A 3GX8A 3KH7A 5J9BA 1ERVA 3LXZA 4D73B 2LSTA 4I5QA 3FYGA 2EC4A 3FY7A 1TU8A 1WPIA 3VFIA 1X9SB 3KM6A 5HR0A 2PGTA 4OFMA 2L57A 1UC7A 1Y25A 3APOA 3KEBA 2VO4A 2H70A 3G7YA 2IL3A 4ZBBA 2RUEA 1OC3A 2PERA 1A2MA 1ZYQB 5ELAA 3KIJA 4IP1A 1E6BA 1WP0A 4DSQA 2OE1A 4BWSA 1YZXA 5DCGA 1GULA 1YJ6A 2OBIA 3IRAA 5IPGA 4MDCA 3F4RA 1EEJA 1Z7RA 3NZNA 1T4YA 4YAPA 4PGTA 4I97A 5AGYA 4TR1B 3QAVA 5AIVA 2H19A 2OJLA 2LQQA 3FRCA 4GSSA 3C73A 5C04A 4KNDA 1YKAA 4I8BA 2NPBA 3QAGA 3TKQA 3LXTA 3AY8A 3WYWA 2GT5A 1V57A 1Z6MA 2VL2C 4N0VA 1GUHA 2K8SA 2E2MA 6GSXA 2LRTA 2MBTA 1TOFA 1IYHA 4I2UA 2FD3A 2VLVA 1V58A 5LD0A 3TB2A 2DIYA 2HSHA 3W8JA 3O3TA 4ECCA 3C71A 6GSSA 4KX4A 5IQYA 3HCZA 4N11A 4FYBA 4N0ZA 3P90A 2HNLA 3GKXA 2JSZA 5F05A 3EYTA 3TRXA 4ULXA 2DJKA 5F8BA 1O8WA 1AQWA 5H5SA 4ID0A 2CA8A 5E59A 4MA9A 4PXOA 3DRNA 1VF1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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