4JR6A

Crystal structure of dsba from mycobacterium tuberculosis (reduced)
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
198
structure length
198
Chain Sequence
GDAVRVTSSKLVTQPGTSNPKAVVSFYEDFLCPACGIFERGFGPTVSKLVDIGAVAADYTMVAILDSASNQHYSSRAAAAAYCVADESIEAFRRFHAAMFSKDIQPAELGKDFPDNARLIELAREAGVVGKVPDCINSGKYIEKVDGLAAAVNVHATPTVRVNGTEYEWSTPAAMVAKIKEIVGDVPGIDSAAATATS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Possible conserved membrane or secreted protein
publication title Structure analysis of the extracellular domain reveals disulfide bond forming-protein properties of Mycobacterium tuberculosis Rv2969c.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 63
structure length 198
sequence length 198
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4jr6A00
2C0FA 3AY8A 3DVXA 6GSWA 3A3TA 1NHYA 3NZNA 5GZZB 3GV1A 3VK9A 3HD5A 4K6XA 1FOVA 1XOAA 5EL8A 6GSUA 1TKDB 2L57A 4FYBA 3UVHA 2GSSA 2K6VA 5FWGA 2YOIA 3GNJA 5KEJA 2GZPA 5HFGA 4HUAA 2E2GA 4NAXA 2C0EA 3HJPA 18GSA 3IK7A 1SL2B 3F63A 1X5CA 4DSSB 2HNLA 3IOSA 4KCAA 4NV2A 5H5RA 4EL1A 1B9YC 2B7JA 1SKSB 2KLXA 4MF5A 4DVCA 4EXJA 1QK8A 1GTUA 1TRWA 3TCOA 2DJJA 4PUFC 2YV9A 3GH6A 4BVXA 1YF1A 1TU7A 1VF4A 4CDOA 4N30A 1GNEA 3A2VA 14GSA 4IP1A 4BWSA 2N5AA 5F07A 3ZITA 2C0GA 2LUSA 1DE2A 1TK0B 1GSDA 2VM2A 2BTOT 1B4QA 1R26A 5D9VA 4ZIJA 3LWAA 2K9FA 4EE0A 2LRTA 4YQVA 1M9BA 2H6ZA 3RPPA 2R37A 3RBTA 3GKXA 3P90A 1XXUA 2C4JA 3IR4A 4OFNA 4K9ZA 1MD3A 3MDKA 4V2LA 4KSMA 2VCQA 4X43A 4EO3A 4ZL8A 4GF0A 4O32A 5CRDA 4ZBAA 1AIUA 1ZL9A 5J9BA 3ZFBA 2LJKA 3OR5A 4HS1A 5ECOB 2H1DA 2RLIA 3GTUB 3PINA 4N0VA 3TOUA 1OE7A 2B5XA 3ERWA 5DJMA 1EP7A 2JZTA 2NTOA 4POMA 1Z6MA 3EE2A 3L9UA 2VL2C 4KE3A 4J56E 4ML1A 3F0IA 1F3AA 1O8WA 3QR6A 5ECPB 1TU8A 1BJXA 5IMZA 4MZWA 3UJ1A 1YKCA 4MMMA 2YP6A 2TRCP 4EDYA 3KJYA 4MF6A 2QC7A 1SD8A 2M80A 1WPIA 3O3TA 3QPMA 4KNDA 2HYXA 2LJRA 1ERVA 1F2EA 2OBIA 4K7NA 2AJQB 2YJHA 3GSTA 3G9BA 9GSSA 4AF2A 2VCZA 3KM6A 3U6VA 5JCWA 3IPZA 2B5YA 2NVLA 4WR5A 4ZBDA 1VGLA 1M99A 1XOBA 2I3YA 3ZZXA 1LBKA 4IKHA 3H4KA 2K18A 3DIEA 3W6GA 1M2AA 2AAWA 4IJIA 3FHKA 3G7YA 2P31A 3HCZA 3CRUA 1K0OA 4EDZA 5G1LA 2BMXA 3ZIVA 1WMJA 1AUCA 3F4TA 2FWEA 2D2ZA 2FWGA 3FZ5A 4DEJA 5IPHA 2H0IA 3C73A 4O5RA 2MZCA 4L5LA 2RM6A 4IHUA 4L8EA 5G5EA 2PVQA 3ZRDA 2ON5A 6GSSA 3GURA 3HVSA 1XVQA 2GGTA 2EC4A 2JSZA 1PL2A 4JBBA 2GVPA 1SYXA 1MD4A 3WGDA 1Q98A 1M7TA 3D5JA 2LNTA 1Z5YE 4ZILA 3GKNA 3WGEA 5AGYA 5HFKA 2GQLA 2IMKA 4OWYA 2L5LA 5ECIB 2LEGA 2B3SA 2WULA 2PPTA 2K8SA 3ZYWA 4ECIA 1QXHA 2VLTA 2JADA 4GRFA 1XWCA 1XWAA 5ELGA 2XBQA 3KP8A 1U6TA 2DJ0A 2C0DA 3HXSA 4ECCA 4TXOB 3HZ4A 1GLPA 2FWHA 3VLNA 1ACVA 1TRUA 4WETA 2OADA 2V6OA 2YV7A 2YJ7A 4PUAA 3DEXA 1H4OA 1FVKA 2B7KA 3FRCA 3TJFA 1JLWA 1SJZA 2CZ2A 1PN9A 5A5KA 1WRYA 3EURA 3UL3A 3C71A 3APSA 5DALB 1RK4A 3WGXA 4ML6A 2EIQA 1PRXA 3CTFA 3F3RA 3TJGA 1V9WA 1GH2A 5KN3A 2R6KA 1EOHA 4G10A 1O7UA 4LMVA 5IQYA 1YDKA 4G2EA 1OAZA 3TJKA 2CX3A 5COHA 3ZFLA 5DCGA 2KHPA 3E9JB 5CRWA 1VF3A 2X64A 3ZMKA 1G0TA 4MJCA 1NW2A 2B6MA 3EYTA 4OD7A 5J5NA 3NIVA 1MTCA 5JWQB 4XS4B 4NV5A 4IGJA 4QL9A 2OBKA 1IYIA 5IMCA 3F4RA 1U87A 1OC9A 2GQKA 3UVTA 1MEKA 2E7PA 4TXVA 2CX4A 1WP0A 3RHCA 3KCMA 1GULA 1B4PA 5D96A 2HXKA 5D9WA 5J3RA 3CTGA 1T7PB 2YZUA 3QMXA 3VI5A 5ENUA 5H5QA 2O7KA 1VF2A 3M0FA 3GX0A 2FNOA 3QFAC 3UBLA 1XPVA 2WZ9A 2CAIA 5FHIA 4N0ZA 1LU4A 3GHAA 1Y25A 3N5OA 2MMNA 3GSSA 3TKSA 1Z6NA 1TDIA 2TRXA 1RQMA 5D73A 3IDVA 2GZZA 1PX6A 3O6TA 3L78A 4KX4A 3CMIA 4F0CA 2I9HA 2GTUA 3FK8A 1O8XA 1YF0A 5ECNB 3BD2A 2H01A 2O87A 1K3YA 2CAQA 4GXZA 1WJKA 1XVWA 4YAPA 2PN8A 3HHVA 2VCVA 2H66A 4Q5RA 4O92A 4WF4A 3FR3A 4HI7A 2H72A 4EF0A 3VWXA 2YWNA 2H30A 3UEMA 5D9XA 1K0DA 1N2AA 1K0CA 5D93A 1BX9A 3MWHA 4KDYA 1FW1A 3VPQA 3QCPA 1XW5A 3LXZA 1DE1A 2DC5A 2JACA 3TJJA 1S3AA 2E2MA 3FW2A 1JHBA 3EU4A 3VWUA 4GWRA 5IM9A 1AXDA 3GN3A 4TW5A 1LJRA 1OYJA 3D4TA 1TK5B 1XWGA 4Q5QA 1XBSA 4PQIA 2HZFA 1PSQA 4BPYA 4IQ1A 3CSHA 2P0GA 3U5RE 1T4ZA 3P8WA 3SWLA 4LMWA 1ILOA 4HU9A 1K0NA 2ON7A 2M46A 4IS0A 3L0HA 3QOUA 2MBSA 4N10A 3P7XA 4POKA 3TOTA 4HOJA 5IOWA 5ECHB 5AN1A 4L0WA 5DJLA 5KN2A 3IC4A 5ECQB 3IBHA 1GL8A 4LL4B 3HY2A 1KNGA 3E0UA 2H75A 1YJ6A 4XTSA 4KSOA 3WT2A 2FA8A 4ZBBA 1YY7A 4TR4A 1AQXA 3IRAA 2X8CA 2V2GA 4XIHA 3UBKA 2JL4A 3FZAA 2GSQA 4MF7A 3TRQA 2CZ3A 5C04A 4ID0A 4JU5A 3I43A 4KAEA 5CAXA 5KN1A 4JR4A 2ALBA 3VWVA 2VAFA 1URMA 3J7Yb 3DVWA 2EIRA 4GSTA 1ZOFA 3HA9A 5IMAA 1I5GA 1GSUA 4K2DA 2VL2A 5HR1A 4TKYA 3APOA 4PNGA 1Z9HA 2F8FA 4POBA 3GH9A 2VD1A 1SL1B 3Q74A 4BA7A 2BJXA 2OKAA 4ZB6A 1A24A 3TKSE 1PGTA 1ML6A 4K0GA 2YCDA 4YH2A 5JWOB 1W89A 5B6NA 5ECKB 3RHBA 5IIZA 2RUEA 2QGVA 1RW1A 3QAVA 1R7HA 1GTBA 1XCCA 2IPAA 1PQNA 3TDGA 3MAKA 5LNKe 1J0FA 4XHMA 1SKWB 1QGVA 2A2SA 1GSSA 1X9MB 1N8JA 4PX1A 4AJ6A 1O73A 5A4UA 2R5GA 1OC3A 5DDLA 4V2NA 3H79A 1SL0B 2HRFA 5IO0A 4ZXGA 3VI7A 3KGKA 3KXOA 1EEMA 1M2BA 2HSYA 4IELA 1IYHA 1OKDA 3ZLPA 2FA4A 5ID2A 2C8UA 1GSQA 2TIRA 3HZ8A 4FH8A 5HFIA 5JCUA 5JCGA 1T3BA 20GSA 2IL3A 2H73A 5ECRB 5DQYA 2KUCA 3LYKA 2O8VB 3DD3A 2GT5A 3KH9A 3RDWA 5C00A 2OE0A 2L4QA 6GSXA 1G7OA 1S3DA 2F9SA 1SENA 1X0RA 2RIIA 1JZDA 3BJ5A 5DAKB 1OC9B 2JSYA 5FT3A 4X0XA 2B1LA 3M3MA 2HLSA 4IQAA 4D73A 1UN2A 1PX7A 2C3NA 1X9SB 5B8BA 4KW6A 1S3CA 1XIYA 3FYGA 2F3MA 1HNCA 1AW9A 3F4SA 1XWKA 4MJEA 2WDUA 3F3QA 4MJAA 4PQHA 4N11A 2FGXA 1V57A 2DBCA 2IFQA 4TOPA 4J2FA 4TR1B 1GSEA 1W4VA 1GUHA 3GIXA 1M0UA 3F9UA 1R5AA 7GSSA 1GTIA 3EWLA 13GSA 4ACSA 4Z7XA 4DSQA 4HU7A 4V1Ap 2LJAA 2LNSA 4KUNA 1TP9A 3ERGA 1SK2A 2YN1A 4WEYA 3KEBA 2KP1A 1HNAA 2LQQA 3ERFA 4V2MA 4AJ8A 3M9JA 3GFKA 1Z7RA 2VLVA 4K7OA 3E3EA 2L6CA 5EPFA 1PMTA 4XS1A 1U3AA 4OCFA 1R4WA 1DSBA 4IW9A 2X99A 4MZBA 4I6XA 3D21A 10GSA 2EIOA 2VUPA 2H70A 2GSTA 1JZOA 3F8UA 1X5DA 3DKSA 1PD21 2IMDA 1VF1A 1GSFA 4WXTA 4WR4A 5ECLB 1Q4JA 2Z9SA 3US3A 4LA1A 1ERWA 1GUMA 2R3XA 4KDUA 1TOFA 5ABRA 2AB6A 4WBRD 5IPGA 5E4WA 1NHOA 2HE3A 3UAPA 4WBJA 3F6DA 5GAPD 1BAYA 4MABA 1ZYEA 4F9ZA 2VM1A 3QFBC 1T4YA 2I4AA 3V1WA 2CA8A 2V32A 11GSA 5HQPA 1HD2A 2YWMA 5CO3A 2C3TA 3EVIA 5HR0A 3KMOA 1EEJA 3D22A 1PL1A 2HZEA 4I5QA 5GSSA 2H6YA 1A8LA 4FIWA 1TJDA 1PA3A 4NMUA 1GTAA 1QFNA 5G1KA 2GZYA 4CW9A 4FYCA 1XW9A 4WKWA 3GTUA 2H74A 4RI7A 5G31A 2ZNMA 4HQZA 4V1Ag 2V6KA 2K8VA 3CRTA 2JZRA 5ELAA 1VRSD 2MMOA 5JWRB 5HR2A 3WT1A 3A2XA 1FVJA 3IAM2 2YNXA 1QMVA 3ME8A 1T8EB 4KDXA 4DSRA 1YEPA 2AYTA 1USBA 1V98A 3C7MA 3KTLA 1MDJA 1EGOA 17GSA 4JZQA 4RQRA 2KP2A 2WRTA 1WE0A 2HI7A 3M9KA 4IJ3A 5B6MA 4GSNA 2H6XA 2WJUA 3D6IA 4I2UA 3N9JA 3CYNA 3GRXA 1EZKA 2X8GA 3LSZA 3TRPA 2WGRA 2DJ2A 2LSTA 2VO4A 2XPEA 3I6AA 3EMXA 1K3OA 1CQHA 1ZMAA 1F37A 2YWOA 1K0AA 2L5OA 1QUWA 2NPBA 3WD6A 3LGCA 2IMEA 4JRRA 1A8YA 2FY6A 4MH3A 2LV3A 4KB3A 3UMAA 2H0GA 5E59A 4LLRA 4YQUA 1M9AA 2R2JA 3NOFA 5ECMB 3L9VA 4PNFA 1ERTA 3FY7A 3LQ7A 1ERUA 4AGSA 6GSYA 4F2IA 3FZ9A 3IXRA 4OO5A 3ZIJA 3IE3A 1XWBA 2J9HA 2J23A 3M8NA 2YANA 2OACA 5IOXA 3C8EA 1OVNA 2L4CA 4LL1B 4XS6A 5GAND 4OFTA 1A2JA 4OFMA 4XCSA 2PGTA 5ID2B 2I81A 3J7Yk 1EV9A 3GKKA 1X5EA 4Q5FA 2F8AA 1PKZA 2C1YA 3BOAA 2FUG2 2LKUA 4K7IA 2H76A 2CT6A 2CVBA 2H8LA 2I1UA 2C80A 3KMNA 2XC2A 3KD0A 4XRAA 4G9HA 1FHEA 1SJIA 3EINA 4TXOA 1THXA 2JU5A 2QKEA 5AIXA 5GSTA 3D4MA 4YQMA 4ILFA 3M1GA 1XFLA 4ZB9A 2QSIA 4L0UA 1TRVA 5DALA 1GRXA 4NHWA 5D9TA 2OA7A 4K0NA 4ISDA 2VCWA 5F0GA 1EV4A 2G0FA 4QL7A 1C72A 3MNGA 4G19A 4I8BA 3TKRA 1GP1A 1SK0A 3LFLA 2H1AA 1FAAA 2IFQB 3CXGA 4K8MA 2DLXA 1F3BA 1TK8B 3FR6A 3LG6A 3BCIA 3QDNA 3ZMLA 1X9WB 2LRCA 2RM5A 4IP6A 4XS4A 3EU3A 2DIYA 1ZZYA 2OE1A 2FWFA 5DBQA 4ZL7A 1B9XC 2GLRA 1YEXA 2HSHA 5CNWA 4QQ7A 2CVDA 2DIZA 1MDKA 3IAS2 3KTBA 4H86A 1JLVA 4XRDA 1NSWA 3DWVA 2WS2A 1Z3EA 2R4VA 2ES7A 2RUFA 4PGTA 1GSYA 5CRGA 3HVXA 2FCHA 1A2LA 2IN3A 4L5OA 1FB0A 5J41A 3DYRA 2IWTA 3C1RA 3ZL5A 1H75A 1SK1A 3KIJA 1F9MA 3DRNA 4ULXA 3FKFA 4EVMA 2GDRA 1G6WA 4MLYA 1GNWA 3FZ4A 4HJ2A 5CRHA 2VIMA 4POLA 3GL5A 1AQWA 2DJ1A 5B7CA 4RUVA 1SJ6A 3A5WA 4BWQA 2HFDA 3GKMA 2PMTA 1SKRB 1V2AA 2H19A 3H1NA 5DQSA 3ZVJD 2MMAA 3IHQA 1OC8A 4JR6A 4MCUA 2YWIA 22GSA 3IA1A 3TKPA 2E0QA 3ISOA 4MJBA 2ZUPA 2PUKC 4NXIA 3JCML 3CSIA 1DUGA 1Z7PA 1XW6A 3UOMA 3O76A 4TR0A 3SBCA 1G6YA 1SD9A 2HZEB 1T1VA 1E2YA 2VL3A 3KH7A 1EOGA 3PH9A 4MPFA 5J9CA 3ZTLA 1ABAA 1HQOA 2L59A 3FR9A 2IJYA 4FO5A 3C1SA 4MPGA 2XHFA 3ED3A 4HZ2A 1WIKA 3HJMA 3D0ZA 4MK3A 3P2AA 4I2TA 3TGZA 3TJBA 1GWCA 4I97A 4E8EA 1J9BA 5EY6A 2CQ9A 3UARA 2F51A 3EMPA 3HDCA 4TN8A 1AQVA 3TUEA 2NDOA 3FEUA 3H8QA 1A23A 4PXOA 5A4VA 3CSJA 1BEDA 4HJMA 4BVYA 1U88A 2YPMA 5B8AA 2PBJA 3KP9A 1UVZA 3IK9A 4CHSA 4ECBA 1V58A 1U3IA 2H71A 3VURA 4FYUA 2WB9A 3PGTA 4JEDA 4F82A 4RI6A 1ZCPA 4KA0A 1JZWA 3GL3A 2OE3A 4IN0A 2VLUA 3TKQA 3ME7A 3DMLA 1PKWA 3KZQA 5INYA 1AAZA 3QAWA 1HNBA 2O85A 1UA5A 2P5RA 4GQCA 1QQ2A 4JE1A 4DSSA 1XZOA 3QAGA 4MP4A 1KTEA 2KOKA 2V1MA 5D8IA 1F6MC 1CQGA 1A2MA 3HYPA 3VWWA 1FG4A 3LORA 4GCIA 2C3QA 2OJLA 1K3LA 1O85A 3A2WA 1KEBA 5LCZA 3MSZA 5HR3A 3HJOA 3EC3A 3QD9A 2H1GA 3I9V2 3RPNA 4F0BA 4MDCA 4ZL9A 2GS3A 2MBTA 2VL9A 1JFUA 1SYRA 2NBSA 4RQXA 2VCXA 3S9FA 19GSA 1ZYQB 3BBYA 1Y6EA 4PQ1A 1BYEA 4NWYA 2GSRA 2LRNA 2AV4A 1O81A 4GTUA 3DGQA 5F06A 3K8NA 4NPBA 3LXTA 1J08A 2LTKA 4HZ4A 1B48A 1YZXA 5L71A 3VPTA 3GMFA 4MH2A 5H5SA 4TR3A 1K0MA 1TXXA 5J4UA 2IMIA 1K0BA 3F6FA 2GQMA 16GSA 1A0RP 5AIVA 12GSA 4E8HA 4P3YB 3PR8A 2A4VA 2DJ3A 2HRNA 2M72A 4X1UA 3LEFA 2MMZA 3G7JA 4MZCA 4EC0A 4OO4A 4O7HA 3Q19A 2G2QA 3TB2A 3GX8A 2FHEA 1WWJA 1KBNA 2FLSA 2FD3A 3VFIA 5KN0A 4IVFA 1V40A 1YKAA 2GT6A 2MYGA 3LYPA 2WCIA 1WOUA 2N5FA 3CBUA 1ZGNA 3RAZA 5CYYA 6GSVA 1TRSA 3L9SA 3APQA 5IMDA 2REMA 4K1FA 5CREA 4KH7A 2IIYA 4TVEA 2B5EA 2V41A 3GYKA 1E6BA 2LS5A 1B8XA 2DJKA 2PVOC 4PURA 3HVVA 5DAKA 4TRXA 4AJ7A 2CVKA 5ECSA 1FB6A 4IBPA 5G2ZA 2H0HA 4F03A 1TTZA 5AISA 1EP8A 1OKTA 2YZHA 4GQFA 2ZCTA 3W8JA 2IMFA 5IO2A 4NHZA 4EUYA 4ZB8A 1EWXA 3GA4A 3ZVJA 3IV4A 5G5FA 1R5PA 3L4NA 4GSSA 3R2QA 2DMLA 4TR1A 5A4WA 8GSSA 1AC1A 2VD0A 5DVBA 5EVOA 1OE8A 4HDEA 3GUSA 5G30A 6GSTA 2WFCA 4KCEA 2L6DA 1BQ7A 3W8SA 1EGRA 2CV4A 3Q6OA 4J57E 5LD0A 1UC7A 2B1KA 3H93A 4MA9A 1SU9A 4YAVA 1TW9A 1ON4A 4OMVA 1BG5A 3BCKA 2H1BA 1A0FA 2A2RA 2PU9C 2VCTA 1FO5A 1GUKA 3TRXA 2DSAA 1T00A 1THOA 1YQ1A 1TI1A 2X8HA 4HQSA 3DXBA 2PERA 3Q18A 1ST9A 4EKZA 4GLTA 5CP1A 2P5QA 2N5BA 1O6JA 3TKSC 2HT9A 4OCEA 3UIWA 1TI3A 5F05A 3I69A 2AHEA 1GLQA 4KGIA 4BL7A 1G7EA 1JZRA 2AUVA 1I9DA 4ECJA 2DMMA 1HYUA 1NM3A 5IMVA 4WF5A 2VOCA 5IMFA 4HEA2 3WYWA 2PWJA 5F8BA 2XPDA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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