4JR6A

Crystal structure of dsba from mycobacterium tuberculosis (reduced)
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
198
structure length
198
Chain Sequence
GDAVRVTSSKLVTQPGTSNPKAVVSFYEDFLCPACGIFERGFGPTVSKLVDIGAVAADYTMVAILDSASNQHYSSRAAAAAYCVADESIEAFRRFHAAMFSKDIQPAELGKDFPDNARLIELAREAGVVGKVPDCINSGKYIEKVDGLAAAVNVHATPTVRVNGTEYEWSTPAAMVAKIKEIVGDVPGIDSAAATATS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Possible conserved membrane or secreted protein
publication title Structure analysis of the extracellular domain reveals disulfide bond forming-protein properties of Mycobacterium tuberculosis Rv2969c.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule tags Oxidoreductase
total genus 63
structure length 198
sequence length 198
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4jr6A00
4CDOA 1PD21 3IK9A 2PGTA 2KP2A 1K3OA 5ECIB 2YJ7A 4MH2A 2FWGA 2B3SA 1RW1A 3F4RA 1T1VA 2WFCA 3ZMKA 4DVCA 2OE0A 9GSSA 2R37A 1KBNA 3HA9A 4MJCA 2E0QA 4NHWA 5JCWA 2AUVA 3IK7A 3KP8A 4MA9A 1SL0B 3F4TA 4ILFA 3TGZA 5J4UA 2FLSA 1KTEA 1THOA 2ON5A 2C8UA 3EVIA 4AGSA 4ECIA 4GRFA 4MABA 1W4VA 5HQPA 4EXJA 2JZTA 1PMTA 3GFKA 1TRSA 1TU7A 2YV9A 1DBYA 3L0HA 3HJOA 3IA1A 3GL5A 5IMVA 4ECCA 3GH9A 3EYTA 3HVXA 3QDNA 4JR4A 4KH7A 3QAWA 2VL2A 3A2VA 1GTAA 2CQ9A 11GSA 1K0NA 5GSTA 1M7TA 3QAVA 1O8XA 3CTFA 3IHQA 3F0IA 1AUCA 3U6VA 2F51A 4IELA 2FHEA 3TKPA 3IRAA 4YAVA 2LUSA 2HNLA 2DIZA 4KCAA 3UBLA 4ZBDA 5G2ZA 2QKEA 2NTOA 4N0ZA 2RLIA 3FZ9A 3HDCA 3CBUA 1M9BA 4GQCA 4JU5A 4ZB6A 5G5EA 5EPFA 4IS0A 1K0BA 2F8FA 5IIZA 3H8QA 5ECQB 1TI3A 1NM3A 3ERFA 3CSIA 1DUGA 3QR6A 1GWCA 14GSA 2K9FA 4KDUA 2V6KA 5ID2A 2K18A 1F2EA 4RQRA 2VCXA 2C0GA 3ERWA 3BD2A 2LTKA 4IGJA 2L4QA 2YWNA 3EC3A 1BEDA 2GZYA 2G2QA 3K8NA 5ECMB 1OE8A 2J23A 2H30A 3SWLA 1VRSD 5F07A 13GSA 3VFIA 2IMEA 2HZFA 2EC4A 3HJMA 2H74A 3VWUA 1BYEA 4AJ7A 3C7MA 1QUWA 2LRNA 3ZRDA 2PMTA 2BJXA 2CT6A 3QD9A 1XW6A 5KN2A 2QC7A 2FWFA 2A2RA 4MZCA 5KN3A 1SJIA 3F3RA 4F0BA 4GSSA 2O89A 1GSQA 2WB9A 4K7NA 5KEJA 3WGXA 3PINA 3SBCA 2O87A 5AGYA 2LJRA 3QCPA 4KSOA 2FD3A 1V58A 5HFGA 1URMA 4PUAA 4TR1B 3L9SA 1ZZYA 1TKDB 4EF0A 1RQMA 2PVOC 1PKZA 1TU8A 3FR9A 1YQ1A 1JLWA 1DE2A 4EL1A 1XOBA 3G7JA 2IPAA 3ZTLA 3CTGA 1F3BA 1NHYA 1VF1A 4GSTA 2OBKA 3VURA 5EL8A 3GX0A 1EEMA 3GTUA 2VM2A 5D93A 3VI5A 3KTBA 1XW9A 2FWHA 4L8EA 4F03A 2I1UA 4MF7A 2OKAA 3OR5A 1GULA 4N30A 3FK8A 2VOCA 2CVDA 20GSA 5CRGA 2LRCA 3P8WA 5DBQA 1GTUA 4NAXA 3WGEA 3PGTA 4F0CA 3N5OA 3D4MA 2CAQA 2YANA 4DSQA 5IQYA 1K0AA 2DIYA 2XHFA 2YWMA 3UBKA 1UN2A 4J2FA 4IQAA 2VUPA 2H0IA 4ID0A 4NPBA 2HSHA 2H73A 4I6XA 4WR5A 2EIOA 4K9ZA 3BBYA 1XWBA 2ZUPA 1Y25A 1AQVA 2M80A 2JSYA 1GNEA 1YEPA 1TW9A 4K7IA 4FYCA 4XTSA 1F6MC 1HNAA 4POMA 2YN1A 3GN3A 1BQ7A 3DIEA 2MBTA 3RBTA 1TK0B 3IAS2 3RPPA 1X5CA 1GRXA 2HYXA 3QOUA 5F0GA 5DALA 2H70A 3GH6A 4ZBBA 5F05A 4YQMA 4OCEA 1FG4A 2CX3A 4WF5A 2B6MA 3C1RA 4XS1A 1A8LA 4OD7A 2YZUA 1GNWA 2Z9SA 2YNXA 4KAEA 2ALBA 1WIKA 2DBCA 3MSZA 4J56E 3P90A 4XS6A 4O32A 2H8LA 3GHAA 1LJRA 1LU4A 1M0UA 1PL1A 1Z7PA 2GTUA 4DSRA 3D6IA 1ZYEA 3I43A 5IOWA 4PUFC 4L5LA 2MMOA 3ZITA 2DJJA 1K0CA 4PURA 1XXUA 4IKHA 3EMXA 3BJ5A 3KP9A 4LLRA 4WKWA 1TOFA 1B9XC 1QQ2A 2H6ZA 4LMWA 2EIRA 2YOIA 4XS4B 1U88A 4NV2A 1YY7A 2WS2A 2VCQA 3FR6A 1JZWA 4I97A 3Q18A 5B6MA 3ISOA 2OE1A 1XPVA 5G1LA 1SJ6A 1E2YA 2GGTA 1V9WA 2GQKA 1PKWA 1U87A 4LL1B 3H1NA 3ZVJD 3D4TA 3KMOA 1Y6EA 3C73A 3APOA 2X8CA 4Q5FA 3A3TA 3FY7A 1NW2A 2YWOA 2PERA 3C71A 1FVKA 2D2ZA 1YKCA 1HYUA 2VCTA 4OFNA 3I69A 1IYIA 1S3CA 3RHBA 1Z7RA 2IFQB 1GH2A 4QL7A 5IO2A 5J9BA 2GQLA 4HU7A 4MDCA 5CNWA 2LSTA 3HJPA 2B5EA 1SJZA 3TDGA 1HNCA 1SK2A 5GAND 1J0FA 3LJRA 2CV4A 2IMDA 2VCZA 1EOGA 2OE3A 2EIQA 4MJAA 2KHPA 2GSRA 3M8NA 3UEMA 1VF3A 3BCKA 3TOUA 3EWLA 3IXRA 4EVMA 4MZWA 2O8VB 1OKTA 3L9VA 3QMXA 4ACSA 2YP6A 2OJLA 1SYRA 4RQXA 3F4SA 1GP1A 4TOPA 5HR0A 1ZGNA 2QSIA 2MBSA 2XPDA 4DSSB 4BVYA 3KZQA 5D9VA 3W8SA 2DSAA 2B1LA 1TXXA 4POBA 1BG5A 2XPEA 4K8MA 4KSMA 1X9SB 5IMZA 1M2BA 2HRFA 5D9TA 2V6OA 4MJBA 1W89A 3UAPA 3E3EA 1GSSA 2G0FA 4EDZA 2H19A 3TCOA 1HQOA 2FWEA 3KCMA 4PNFA 3JCML 3RAZA 4POLA 1XWAA 1ML6A 4KDYA 3DXBA 4Z7XA 3E0UA 1V98A 2P31A 3VI7A 1EGRA 3KXOA 3D21A 1SKRB 5LNKe 2L59A 1ST9A 4OCFA 4TRXA 1TRWA 6GSXA 4MPGA 1U3AA 2VL9A 1NHOA 1B9YC 3F6FA 3PH9A 2FUG2 4IW9A 1BX9A 1ZOFA 3IV4A 3LYPA 3EMPA 5AIXA 5J5NA 1MEKA 5DDLA 3WGDA 1MDKA 1J08A 1ZMAA 3D0ZA 2L5LA 2R6KA 3KMNA 1OC9A 1YKAA 1GLQA 4AJ6A 4I2TA 4XRDA 3CXGA 2P5QA 2VIMA 4OFTA 2JSZA 5CREA 3GKXA 4ZL8A 5A5KA 5IPGA 2RM6A 5F8BA 2M46A 1M9AA 4KX4A 3GIXA 1OC3A 4MP4A 1XVQA 3FR3A 2JADA 3DGQA 5B7CA 1N2AA 3BCIA 2NPBA 4G10A 5ECKB 1DE1A 4MMMA 5J9CA 2HLSA 5B8BA 3O6TA 4TR0A 2B1KA 1NSWA 3FRCA 2OBIA 4FO5A 1XFLA 4EC0A 5IMCA 4GWRA 2YWIA 4MCUA 2VCWA 2J9HA 4MF6A 5ABRA 3LYKA 1SENA 2DMMA 1AQXA 4OWYA 2MMZA 2PBJA 5DJMA 5DAKB 1I5GA 4TXOB 3UOMA 4PX1A 2LJKA 4HI7A 4RUVA 3UMAA 2NDOA 1A8YA 2V2GA 1GSFA 2X64A 2E2GA 1R26A 3C8EA 5INYA 2VD0A 4XS4A 5H5RA 1RK4A 2B5XA 4PQIA 3M9KA 1B8XA 5CP1A 5D9XA 2DMLA 5HFKA 3VWWA 2L5OA 2NVLA 3F6DA 2K6VA 1OVNA 2JACA 3ZMLA 4PQHA 3TRPA 2LJAA 4YAPA 3LFLA 3LEFA 4V2MA 3TRQA 1T00A 3UVTA 5ECSA 2GSSA 3GNJA 5ENUA 3APSA 1VF2A 3A2XA 1WJKA 5IMFA 3ZVJA 2PUKC 4JR6A 3GUSA 1A2LA 1Z9HA 1K0OA 1USBA 3VWVA 2L4CA 2R5GA 1TTZA 1JLVA 18GSA 2TRXA 4OO4A 1XBSA 1YF1A 2HRNA 4TN8A 2FA8A 1ON4A 1DSBA 4KB3A 3TKSC 3TRXA 4TVEA 1MDJA 1GUHA 1O7UA 4ECJA 4L5OA 5HFIA 3Q6OA 4G19A 3TJFA 1K3YA 1V57A 3ZZXA 1GUMA 4OO5A 5ECHB 1IYHA 5KN1A 2PN8A 1SD8A 1H4OA 4V2NA 2IMFA 3TJGA 5J3RA 16GSA 3TB2A 2YZHA 3WT1A 4WXTA 1XW5A 6GSTA 3APQA 3ZFBA 1PX7A 1V2AA 1SK0A 1WRYA 4WEYA 3UARA 2WCIA 1ERWA 3TKRA 2I3YA 1MTCA 5A4WA 2GDRA 2LEGA 3IR4A 1MD3A 4J57E 3EU4A 3HHVA 1G7OA 2CAIA 1S3AA 3N9JA 2H6XA 3QFBC 2P5RA 4DSSA 1XWCA 4ML1A 4FYUA 2PU9C 4GTUA 2BTOT 5D96A 2RUFA 4O7HA 4RI6A 2I81A 3WT2A 10GSA 2KP1A 1FAAA 1PN9A 3GRXA 4MZBA 5ECPB 4MF5A 1YJ6A 3IOSA 3F9UA 1ZYQB 1R5PA 2YPMA 3ZYWA 1EV9A 3TKQA 4OFMA 3DMLA 2MYGA 1YF0A 4YQUA 4V1Ap 2QGVA 2WZ9A 17GSA 4O92A 2REMA 1YEXA 5J41A 1XZOA 3F63A 1TI1A 3IAM2 3HD5A 2L57A 1O6JA 1K0MA 2WGRA 2ZNMA 4N11A 19GSA 3Q19A 3J7Yb 4XHMA 2H0HA 2H75A 1GL8A 3KH7A 1F3AA 3DYRA 4FYBA 4HZ4A 2ZCTA 4LMVA 5JCGA 3LGCA 1ZCPA 4HJ2A 3GV1A 2H71A 2CZ2A 2GS3A 2E7PA 2K8SA 2PVQA 2VLTA 1WE0A 4X43A 2HZEB 3VK9A 4MJEA 2IMKA 3IE3A 1O8WA 1PL2A 3GL3A 4IJ3A 5G30A 3ED3A 3HXSA 4KE3A 3A5WA 4NWYA 3A2WA 8GSSA 3CSHA 3O3TA 4ZIJA 2LV3A 2HSYA 2H72A 4HEA2 5DQSA 4L0UA 3ZIJA 1EOHA 2PPTA 1PQNA 4IP6A 1ACVA 3LXTA 4NMUA 1QGVA 1VGLA 2CX4A 1AXDA 3DKSA 1SD9A 5G1KA 4EUYA 4P3YB 4ZB8A 2AYTA 2GSQA 2AJQB 4JRRA 4PXOA 3LSZA 5B6NA 4N10A 3GKNA 2VL2C 2KUCA 2C80A 1K3LA 2DC5A 5AN1A 3UJ1A 2H0GA 5IMDA 1XWKA 1B4PA 3TOTA 1G7EA 1EP8A 2VAFA 3FZAA 3GTUB 2GSTA 5A4UA 3FKFA 5JWOB 3ZREA 5FHIA 4GSNA 3HVSA 3FW2A 3CYNA 2LKUA 4KCEA 3KGKA 1U6TA 2OACA 5G5FA 3GX8A 4TXOA 3F3QA 3AY8A 3M0FA 1XOAA 4GF0A 5F06A 1WWJA 2DLXA 1CQGA 4ZB9A 5KN0A 5JWRB 4ULXA 2P0GA 2WJUA 4CW9A 1GSYA 5L71A 3NZNA 1WPIA 2C3NA 2GT6A 1EEJA 4OMVA 1X5DA 5ECLB 2B5YA 6GSUA 5IPHA 3GYKA 3HZ4A 1T3BA 5HR2A 4N0VA 4ISDA 5HR3A 4E8EA 2HE3A 2LNSA 2WULA 4K2DA 2N5AA 2MMNA 3RDWA 4TR1A 4G9HA 5CYYA 3FHKA 2E2MA 2VM1A 4MPFA 3J7Yk 4ML6A 5COHA 5A4VA 3IPZA 1THXA 3VPQA 1EP7A 1OAZA 1E6BA 2C0DA 5FWGA 2VLUA 3EE2A 1TRVA 4F82A 1PA3A 2DJ1A 3FYGA 5DALB 1S3DA 2C4JA 2LQQA 2R2JA 3H4KA 2YCDA 22GSA 4CHSA 4KNDA 2H1AA 2I9HA 4HQZA 2X8HA 3L4NA 2PWJA 3M1GA 1PX6A 2GZZA 1EV4A 2YV7A 4GCIA 4TW5A 1OYJA 1M99A 2MMAA 4IHUA 4D73B 5CO3A 4Q5NA 3VWXA 2N5FA 3H93A 4E8HA 1O73A 1GSDA 4K0GA 5DVBA 4BL7A 1A23A 1SYXA 1Z3EA 4QL9A 2C0EA 4K6XA 1G6YA 1A2MA 1SKSB 3KIJA 1GTIA 4I8BA 4FIWA 5LD0A 4ECBA 2DJ3A 2IIYA 1SU9A 4BPYA 4BWSA 2CVKA 2JZRA 3DEXA 2KLXA 1ABAA 1JZRA 2X99A 4NXIA 1JHBA 4XCSA 5ECRB 5DJLA 4ZBAA 1MD4A 5ELAA 5C00A 2H01A 2VCVA 5D9WA 2FA4A 1N8JA 1O85A 2V1MA 12GSA 3I9V2 3QAGA 1TP9A 4ZILA 4G2EA 2GZPA 2C3QA 2LS5A 1OKDA 4IP1A 1T8EB 2O7KA 3ZLPA 3DVXA 4I2UA 3S9FA 2GT5A 3GSTA 4HOJA 3LG6A 1AW9A 6GSVA 1YDKA 1A2JA 4HU9A 1UA5A 1G0TA 3KTLA 1UC7A 2CZ3A 1M2DA 2LRTA 1T7PB 2XC2A 2OA7A 1F37A 4LL4B 2XBQA 4PGTA 4WBJA 5C04A 2F9SA 1SL1B 3TJKA 5CRHA 3TJJA 2AB6A 4EDYA 1Q98A 1ZL9A 5IMAA 4PQ1A 2CVBA 3WYWA 1J9BA 2A4VA 1SKWB 3LXZA 1FW1A 3VLNA 4JE1A 3KJYA 2B7KA 5B8AA 2RM5A 4V2LA 2HZEA 4POKA 1X9WB 2M72A 2TIRA 4HUAA 5EVOA 3US3A 2JZSA 2RIIA 4NHZA 4I5QA 2DJKA 1Z6NA 4Q5RA 4WBRD 4WR4A 3F8UA 1BJXA 1UVZA 1QFNA 2C0FA 1ILOA 5H5SA 4F2IA 3LWAA 3IDVA 4BVXA 1KNGA 5GZZB 5AIVA 5H5QA 3KM6A 4AF2A 4EE0A 3WD6A 1TJDA 4EO3A 1VF4A 2O85A 3IBHA 4NV5A 2RUEA 2JU5A 4BWQA 5IM9A 1KEBA 4IQ1A 1TDIA 2L6CA 2TRCP 1QMVA 3ME7A 3W6GA 3GURA 5CRWA 3U5RE 1LBKA 3MAKA 2IFQA 1SK1A 3FZ4A 3R2QA 1XWGA 5DCGA 1FO5A 1MDIA 5G31A 3FZ5A 1QXHA 5LCZA 4X1UA 3MDKA 3HCZA 1JZOA 5JWQB 2WDUA 2CA8A 2H1DA 1FB6A 3NOFA 1C72A 1M2AA 2HXKA 2IN3A 4JEDA 2FNOA 2V41A 1PGTA 1EWXA 2OADA 6GSSA 3RPNA 2ON7A 4KDXA 4TKYA 2A2SA 2DJ2A 4GQFA 3KEBA 3ZFLA 3GKKA 2F3MA 3GA4A 4IN0A 1B4QA 5D73A 2WRTA 3ZIVA 1XIYA 4KGIA 4TR3A 2HT9A 3G7YA 4HDEA 4YH2A 1Z6MA 3P7XA 2GLRA 5CRDA 1TRUA 1F9MA 3RHCA 1XCCA 4ZXGA 4RI7A 1OC9B 4HS1A 4O5RA 1O81A 1HNBA 3G7IA 3H79A 1FOVA 3W8JA 3EU3A 3BOAA 3LORA 3ZL5A 3DWVA 1Z5YE 2HFDA 3DVWA 1BAYA 1FHEA 2XBIA 1A0FA 2IWTA 1WMJA 3HVVA 7GSSA 3G9BA 4JZQA 3Q74A 5E4WA 5JCUA 4HQSA 2IL3A 1GLPA 5HR1A 4PNGA 5ID2B 4V1Ag 1X9MB 2H76A 3FEUA 1FVJA 5DCHA 4H86A 3HKRA 1GUKA 1JFUA 2IJYA 4JBBA 4K7OA 4X0XA 4KA0A 5FT3A 3DD3A 2LQOA 1XVWA 4MH3A 3EINA 2VLVA 2R3XA 2FY6A 3KH9A 2LNTA 1R5AA 2FGXA 2VO4A 2K8VA 4D73A 2I4AA 1OE7A 2BMXA 3IC4A 4F9ZA 1QK8A 3QFAC 2C3TA 1PRXA 5EY6A 1T4YA 3MNGA 3HY2A 2NBSA 1T4ZA 3GMFA 4K1FA 4L0WA 2DJ0A 4QQ7A 4BA7A 5ELGA 2JL4A 6GSWA 3D5JA 3GKMA 2H6YA 1CQHA 3TKSA 3CMIA 2N5BA 4EKZA 1GTBA 1EGOA 3VPTA 2HI7A 2AV4A 2B7JA 2H1GA 1ERUA 5CAXA 3O76A 4FH8A 1WP0A 2IMIA 3C1SA 3QPMA 4KUNA 3TKSE 4IBPA 5IO0A 2KOKA 5D8IA 2ES7A 1JZDA 1GSEA 3L9UA 3ERGA 1Q4JA 1GSUA 1WOUA 2YJHA 3M9JA 4WF4A 2H1BA 1FB0A 4MK3A 1HD2A 1AIUA 5GSSA 2R4VA 3V1WA 3M3MA 1X5EA 5ECOB 2L6DA 4HJMA 2GVPA 3LQ7A 2X8GA 1AAZA 5ECNB 3HZ8A 1OC8A 1G6WA 1R7HA 2MZCA 4IJIA 3CRUA 4ZL7A 3KD0A 1A0RP 3CSJA 4ZL9A 3PR8A 4XIHA 3GSSA 3D22A 3DRNA 3MWHA 2AAWA 3NIVA 4KW6A 1ERTA 5DQYA 2FCHA 3I6AA 4TR4A 3EURA 1K0DA 2F8AA 1PSQA 1SL2B 3TUEA 5DAKA 5AISA 3UL3A 2V32A 4DEJA 4TXVA 1AC1A 1I9DA 4WETA 1H75A 5IOXA 4LA1A 3L78A 1B48A 3CRTA 5E59A 1AQWA 1R4WA 4GXZA 4AJ8A 1X0RA 3UVHA 2AHEA 4K0NA 4XRAA 1ERVA 3TJBA 2VD1A 3P2AA 4YQVA 3ME8A 1A24A 3UIWA 1TK8B 2C1YA 5GAPD 4GLTA 1U3IA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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