1HYUA

Crystal structure of intact ahpf
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
521
structure length
521
Chain Sequence
MLDTNMKTQLRAYLEKLTKPVELIATLDDSAKSAEIKELLAEIAELSDKVTFKEDNTLPVRKPSFLITNPGSQQGPRFAGSPLGHEFTSLVLALLWTGGHPSKEAQSLLEQIRDIDGDFEFETYYSLSCHNCPDVVQALNLMAVLNPRIKHTAIDGGTFQNEITERNVMGVPAVFVNGKEFGQGRMTLTEIVAKVDTGAEKRAAEALNKRDAYDVLIVGSGPAGAAAAVYSARKGIRTGLMGERFGGQVLDTVDIENYISVPKTEGQKLAGALKAHVSDYDVDVIDSQSASKLVPAATEGGLHQIETASGAVLKARSIIIATGAKWRNMNVPGEDQYRTKGVTYCPHCDGPLFKGKRVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVEHVTLLEFAPEMKADQVLQDKVRSLKNVDIILNAQTTEVKGDGSKVVGLEYRDRVSGDIHSVALAGIFVQIGLLPNTHWLEGALERNRMGEIIIDAKCETSVKGVFAAGDCTTVPYKQIIIATGEGAKASLSAFDYLIRTKIA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
source organism Salmonella typhimurium
publication title Structure of intact AhpF reveals a mirrored thioredoxin-like active site and implies large domain rotations during catalysis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALKYL HYDROPEROXIDE REDUCTASE SUBUNIT F
total genus 168
structure length 521
sequence length 521
ec nomenclature ec 1.8.1.-:
pdb deposition date 2001-01-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
A PF13192 Thioredoxin_3 Thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1hyuA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1hyuA04
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 1hyuA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 1hyuA03
3UOVA 1LV0A 4OO4A 2PHHA 1UKVG 3D6IA 1DBYA 3DK8A 2LRTA 3KLJA 2B9XA 1DOBA 2P5RA 3OR5A 2MMOA 4A5LA 2YR4A 4UP3A 4YKGA 1B9XC 1ZGNA 2L5OA 2P31A 4EKZA 2RABA 3O3TA 3UOZA 2GB0A 4K5RA 4WBRD 2TRXA 3M0FA 2VRLA 2B7KA 1Q98A 1TJDA 2B5YA 3ERWA 3NIVA 4Q5RA 3F3QA 3EURA 4E0VA 1TRSA 1Y0PA 5IPYA 5J5NA 1IUUA 3ZITA 2DBCA 2DLXA 1ERUA 2V2GA 3A2WA 4FK1C 4U8PA 2WS2A 4O5UA 3T37A 1XW6A 2XC2A 2C67A 5G31A 4V2MA 2AAQA 3BOAA 3CGCA 5DQSA 3UVHA 1WWJA 2GDRA 4EQRA 5EB4A 3EC3A 2PWJA 3AD9B 3F4SA 4IA6A 1H86A 4ZB6A 1XXUA 2IPAA 2WGRA 3ZMLA 3RPNA 1HD2A 4F0CA 4IN0A 4NHWA 1IUVA 3HJMA 2OAMA 1D4DA 5C04A 1PJ7A 2L6CA 4IBPA 2LSTA 3CNDA 1Q9IA 2VM1A 4IP1A 3IDVA 4EE0A 1KTEA 5CYYA 4EMJA 1ZOFA 3ZRDA 1LVLA 1OKDA 2HLSA 1U6TA 1XOAA 3TKSC 1G7OA 3AEBA 4CNKA 3VI5A 3KD0A 3GNJA 3NRNA 1TRBA 1BAYA 1Z6LA 4OPTA 1FECA 4KPRA 1GTAA 2CV4A 1XIYA 2Z5XA 4WEYA 5JCNA 1EEJA 2YV7A 3EINA 3NTAA 4YH2A 4Z2UA 3GURA 1GRGA 3A3TA 4IQAA 4EDZA 1PBDA 3TUEA 1YKAA 3GWDA 1F6MA 5DBJA 2OLNA 1GETA 2I1UA 4GRFA 3DD3A 1YQ1A 2H1DA 1SENA 3VR9A 1K0LA 3HJOA 1E1LA 2HRFA 3HVSA 2R9ZA 2R0GA 3P4PA 3FR3A 2W0HA 4J57E 1M9AA 3HA9A 2YZUA 2B9WA 3VQRA 3ZTLA 3FZAA 4GCMA 3ZVJD 1GWCA 5ENUA 3AEEA 1NENA 1TU8A 2CX4A 5IO2A 5DJLA 5U1OA 1V58A 5LV9A 3GL5A 3CSHA 4HQSA 2G0FA 4HS1A 5B8AA 2VCWA 3DRNA 2OADA 3L1RA 3IOSA 2YPMA 4USRA 4G2EA 4GF0A 2APGA 2UZZA 3EYTA 3LQ7A 2F5ZA 3TDGA 4JEDA 4N0VA 3I6AA 4D73B 2EQ7A 4H4TA 3IHGA 4OCFA 3HJPA 1NW2A 3IC4A 3HYPA 4FYUA 4MDCA 1DXLA 1O95A 1H6VA 2K8VA 3QOUA 4EM3A 2M72A 4A65A 4IHUA 5LNKe 3UAPA 4G9HA 3CTGA 3GN3A 4KAEA 2CVJA 4K0NA 1DJQA 2OE3A 3KVEA 3RP6A 3CSIA 3LWAA 2VVLA 3PVCA 4X0XA 2WPCA 3FR6A 1KBNA 1URMA 1D5TA 4ZCCA 1XVQA 4IJ3A 3WYWA 1T1VA 2CA8A 2E2MA 2MBSA 1GUMA 2WOWA 2ZZ0A 1KSSA 2I9HA 4WKWA 6GSUA 2N5BA 3GTUB 4FDCB 2AYTA 1GULA 5CRDA 3A2VA 4KUNA 3GH9A 4ACSA 4TN8A 5G5FA 4JR6A 4AP1A 1A24A 1PMTA 3IAS2 4JN9A 1NHOA 5FS6A 4C3YA 4H4UA 1EL7A 2VCZA 4IVFA 1SJIA 3GH6A 1B37A 5KN2A 3FG2P 1K3LA 2GEWA 4H4QA 4YTMA 1OC3A 3C96A 4MJAA 2DJ3A 4TM0A 4Y4LA 4RSLA 5ELAA 4WCTA 1WE0A 2V1MA 5JWQB 2EIOA 4TVEA 1E6EA 3CPIG 4GWRA 4YWOA 3M9JA 2XLRA 1SYRA 3GRXA 3VRDB 5H5QA 3S9FA 3RP8A 2H19A 4MPGA 2BS2A 2V61A 2CT6A 1X0RA 1TDOA 2NPXA 5GSTA 4H4VA 4ZL7A 1OJDA 1QUWA 5C00A 6GSYA 3DJDA 2TIRA 1JLVA 1IUTA 1YEPA 4Z2RA 1NM3A 1VGLA 1XOBA 1LQUA 4NMUA 2H8LA 2YQUA 3KPFA 4MLYA 4CDOA 1SU9A 4D04A 2HSHA 2C64A 3KP8A 3BCKA 3PINA 3DJJA 1GLQA 4QQ7A 4YTPA 5ID2A 3GMBA 3CSJA 5DCHA 4YT0A 1OVNA 2B3SA 2HT9A 19GSA 2LNTA 1XWKA 1S3BA 2WS3A 3CMIA 3LZWA 2H71A 1OE8A 22GSA 2XPDA 2VCTA 5EOWA 4IA5A 4LA1A 2AB6A 2PYXA 5GSSA 4U8IA 4H4ZA 2FCHA 3QSEA 1FOVA 1SL1B 4C74A 1E7PA 5J60A 3C4NA 4RQXA 1A2JA 1DSBA 3NH3X 2C3CA 2VLVA 1Y6EA 3HVVA 3KA7A 2FJEA 1JRZA 4F82A 2XBQA 1BYEA 1X5EA 3QCPA 4DSSA 3NKSA 2KP2A 3P4SA 2B1LA 4BV6A 5D96A 1YDKA 2C66A 3UTEA 3TCOA 1ZYEA 3DGZA 4ZIJA 3ZFBA 1YQ3A 5DQYA 4IJIA 2IMDA 1JLWA 2V6OA 3GIXA 3UOYA 4P9SA 1TI1A 1PBCA 3RDWA 4OFMA 5F0GA 4J34A 1GNDA 2JSYA 2EQ9A 4ULXA 1GSEA 4WR4A 2C3DA 4H4SA 4K5SA 5B8BA 1GERA 4DVCA 1PDHA 1GRFA 2QCUA 5J41A 1OC9A 5U25A 1H75A 1OC8A 2VRMA 4WXTA 4XS4B 1MDIA 3D4MA 5IOWA 1QXHA 1ZY8A 4K1FA 3UBLA 1TK8B 2M46A 1K0IA 4U2TA 2H1GA 5F05A 4K0GA 1GNWA 1PBBA 1XWGA 4J31A 5GSNA 1K0DA 2L4QA 2OLOA 1WRYA 2O8VB 1TDKA 4K2DA 3S61A 3P2AA 2GZYA 1AQXA 3GL3A 3P9UA 5D93A 11GSA 2WB9A 1P2HA 1K0OA 2R4VA 2GQMA 5KOXA 3GKKA 3LXZA 3TOTA 2XVJA 5ECSA 4U8OA 4Z7XA 1H82A 1V9WA 5DALA 4EXJA 3LSZA 4JR4A 2F8FA 3K7TA 4EMIA 4BA7A 3I9V2 4JY2A 3P1WA 2L59A 2H0GA 1JRXA 2C73A 3QPMA 3KIJA 1VQWA 1OJTA 3MNGA 4TW5A 3C1SA 1GEUA 2BACA 2VOUA 4B68A 2DJ2A 4IP6A 3QFAC 3M9KA 4MJEA 5GRTA 2QKEA 3A2XA 2B76A 4B64A 5FMHA 1JZOA 1Q1WA 4EVMA 2X8CA 1F2EA 1KNPA 4JU5A 8GSSA 1O8WA 4U8LA 2XFQA 4JDRA 2Q0LA 1YY5A 4AOXA 3DMLA 5JWOB 3V76A 1EOGA 3UKLA 1AQWA 3CNJA 4XS6A 1MO9A 3LEFA 3CTYA 1K0AA 2NVLA 4ZBBA 1M2BA 2K8SA 2BCPA 1K0JA 4I2TA 4MF6A 5KEJA 5F8BA 2RM5A 3ZREA 1N4WA 3FBSA 4B67A 3NZNA 1O81A 1FHEA 2C80A 3GD4A 5KXJA 3BNUA 4HU7A 3IC9A 4POLA 1PN9A 2C8UA 3IRAA 1GTHA 3HY2A 2V3AA 3BHFA 1M2DA 1L9EA 2CVDA 4OD7A 5FS9A 1M9BA 3NYFA 2WRTA 1JNRA 4A79A 3F0IA 3DJGX 3EU3A 1OJ9A 3ATRA 2ZZBA 17GSA 5IQ4A 2EC4A 1WIKA 3C1RA 3F4TA 1NG3A 2IJYA 2GMHA 1A2MA 5B7CA 4TM3A 3IAM2 5L71A 3GYIA 2VLTA 1OKTA 3I3LA 4TR3A 1Z3EA 1F3AA 4GRTA 4TR0A 2B7RA 2GH5A 4KDXA 4NV2A 5ID2B 4B1BA 4AT0A 1E6BA 1SJ6A 1B4VA 4ZBDA 4DSQA 4WETA 4ZB8A 2OBKA 4ZL9A 3MDKA 2LV3A 4LL4B 3NNEA 4NTEA 3QJ4A 2BCGG 5FS8A 5J3RA 1SD8A 2O85A 3QFBA 2IWTA 4L5OA 3L0HA 2H01A 3WT2A 2YLWA 1CQGA 2FWEA 3OZ2A 3UOXA 1PJ6A 4GDEA 3SQPA 3E1TA 1B48A 1LU4A 1S3AA 2WZ9A 4Z24A 2HFDA 2O7KA 4H4RA 5IPGA 1XPVA 4DSSB 5G1KA 18GSA 1MDJA 1VF2A 1L9CA 4NTDA 4OMVA 3DA1A 4D73A 4H2QA 2HZEB 4PX1A 3QR6A 1J0FA 4J2WA 2H73A 3HCZA 3VR8A 2L57A 3D1CA 4WF4A 5L46A 5D9TA 4KGIA 1ZP0A 2ES7A 2D2ZA 4TM1A 1M99A 1H7WA 2KHPA 3CBUA 3TKPA 3G9BA 4QL7A 1WPIA 4OPCA 3W6GA 3F8DA 1ZCPA 2JZRA 2O87A 3WGEA 4H4XA 3RHCA 2H74A 4Q5QA 4BJZA 3UOMA 3EAOA 2C3QA 4TRXA 5GAND 3FEUA 4MJBA 1EL9A 1CJ4A 2OE1A 5CAXA 1H84A 4OCGA 1PL1A 2FA4A 1T4ZA 3APOA 1MD3A 2B7SA 1EV9A 5H5SA 1ZYQB 1LJ1A 3GTUA 2GV8A 1QGVA 5KN0A 1M7TA 3LFLA 4IGJA 2I3YA 1KNGA 2XVIA 3JCML 2AQJA 3BCIA 4LMVA 2WJUA 3FZ4A 1VF4A 3GMFA 5DALB 1V98A 1NEKA 3K7QX 1GTEA 4XTSA 2WESA 1PS9A 4EQWA 5IQ1A 3SWLA 2PGTA 5BUKA 2XCGA 2YG4A 2XLSA 3DGHA 4USQA 5TR3A 2R5GA 3NGCX 4MZCA 2IMIA 5M10A 3A5WA 5IMCA 1SYXA 4OPLA 2VQ7A 1M6IA 3UKFA 3APSA 2MBTA 2YOIA 5JCUA 3KGKA 2CAIA 1FG4A 3H4KA 2ACZA 2DKIA 5AISA 3GD3A 4J56A 3FMWA 3BJ5A 2BTOT 3RP7A 4HZ2A 4I59A 2FJAA 1X31B 3CNPA 4ECHA 2DJKA 1XWAA 3ZFLA 4TXVA 4K7IA 2DJ0A 3URHA 1ELIA 4KSOA 4ZL8A 4LL1B 4YSYA 1EWXA 2FNOA 2H6YA 4ID0A 4MP4A 1TYTA 4V2LA 1R5AA 5CO3A 4GQFA 2BS4A 4J2FA 1C72A 2X99A 1B8SA 2WPEA 5EB5A 3VFIA 1ERTA 3SFDA 4V1Ag 2IMEA 3BBYA 1D4CA 4I5QA 3EF6A 1BEDA 1G6WA 1P2EA 1EZKA 2A4VA 3IV4A 4BJYA 2C75A 4X9NA 4ADWA 2DSAA 1GOSA 4CCRA 1W89A 2XFOA 2XFPA 4DGKA 2GS3A 4KA0A 2DKHA 1GSYA 4JRRA 4GDPA 4Z25A 5EBKA 1GSUA 2PU9C 5A4WA 1TDNA 2BK4A 5M0ZA 4POBA 3VURA 4YSZA 1V40A 4FIWA 4HI7A 2XLUA 3AYIA 2KLXA 4KB3A 1TRUA 2OA1A 1WJKA 4TOPA 1UC7A 1LPFA 3FPZA 6GSTA 5IMAA 1CF3A 1YKJA 3MWHA 1B8XA 3D21A 3HZ4A 1NPXA 3E0UA 2GQWA 3K7MX 3BI5A 2FA8A 5ECMB 3CTFA 2O89A 3M0OA 3GFKA 5IPHA 1EEMA 3M8NA 2DIZA 3F8RA 4N30A 3GX0A 3AEFA 1JEHA 3IK9A 5IMFA 4U2SA 1K0NA 3OC4A 2TMDA 3DK4A 3QVPA 4XXGA 4O92A 4MH3A 2KOKA 2WOIA 1FVJA 2WP6A 4TR1B 4GTUA 2NPBA 3TRXA 1OJAA 5ECLB 2ZUPA 1PSQA 3ISOA 1USBA 5CNWA 2CAQA 3QVRA 4XS4A 3REDA 1K0MA 1DODA 4TKYA 3VWVA 3UP5A 1Z7RA 2R4JA 2PVQA 3FHKA 3R2QA 1GH2A 1TI3A 3ZLPA 3ABVA 1AAZA 3VLNA 1PA3A 2YJHA 5DCGA 2B6MA 5CRWA 3NK0X 1O6JA 1GTUA 4A99A 5IIZA 4XWRA 3TOUA 1Z9HA 6GSVA 1K4QA 1REOA 2BS3A 2R6KA 2I0ZA 5FS7A 4X43A 2MZCA 1IUSA 2YLXA 1A2LA 3G5RA 3DJEA 4Z2TA 3CRTA 2H76A 3J7Yk 3NK2X 3HZ8A 1NSWA 4J57A 2VL2C 1SJZA 2VVLG 2LKUA 1SKWB 4YAVA 3NIXA 4DSHA 2XFNA 2VAFA 2AV4A 5ECOB 3IPZA 2VQBA 1EP7A 1V2AA 3JSKA 1YF0A 3RPPA 5LD0A 1GSSA 1JFUA 3CN8A 4ZCDA 4GSNA 1D7LA 3KTLA 4ZILA 3CXGA 3S5WA 4U8JA 4Q5FA 4CBQA 4CRTA 2P5QA 5HR2A 1B9YC 4KE3A 1LBKA 1ACVA 2LQOA 1GL8A 2BXRA 4UDQA 3PR8A 1X5DA 1UA5A 3IE3A 3LOVA 4KCEA 2Q0KA 2DJ1A 2JKCA 2JACA 1N4VA 1PGTA 1X5CA 2B5XA 4FK1A 5JCMA 1H7XA 3IF9A 3CIRA 3KTBA 2YWNA 1TU7A 1T00A 2YM1A 2J9HA 1GRTA 1JRYA 3DYRA 2A2RA 3NTDA 2R0CA 5BVAA 3AD8B 5CQFA 4K7ZA 4I8BA 2AHEA 3VWWA 2ZBWA 3R9UA 4CHSA 2FJBA 4ML1A 3RHBA 4MA9A 2Y6RA 2R3XA 2H88A 7GSSA 2LEGA 1N8JA 3ZMKA 1YQZA 1Y25A 2GSQA 3COXA 4K6XA 3FY7A 2R4EA 2JAEA 1VG0A 2JB1A 3BD2A 4OFNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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