1QFNA

Glutaredoxin-1-ribonucleotide reductase b1 mixed disulfide bond
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
b'MQTVIFGRSGCPYSVRAKDLAEKLSNERDDFQYQYVDIRAEGITKEDLQQKAGKPVETVPQIFVDQQHIGGYTDFAAWVKENLDA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Binding specificity and mechanistic insight into glutaredoxin-catalyzed protein disulfide reduction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (GLUTAREDOXIN 1)
source organism Escherichia coli
molecule tags Electron transport/oxidoreductase
total genus 24
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-04-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1qfnA00
1MDIA 1ZMAA 4KDUA 4AJ7A 3QDNA 5GAPD 3H1NA 2YV7A 4DEJA 1GH2A 4FYUA 4WEYA 3CXGA 4WKWA 3E3EA 1K0MA 2CT6A 3F6DA 1AQVA 1W89A 5FWGA 2YOIA 3V1WA 1C72A 3DYRA 3KMOA 4TR1B 2M46A 4HS1A 4E8HA 4J56E 4POMA 3D0ZA 1OC3A 3M9JA 3GTUB 1GSFA 2P0GA 5ECQB 2NBSA 4POKA 1GSSA 2E0QA 5DJLA 4TXVA 3FR9A 1DE1A 1JZRA 4CHSA 3C1RA 3IOSA 3ME7A 5D8IA 2C0EA 3GH6A 3HJMA 2IMFA 6GSXA 1YF1A 3S9FA 2AJQB 1YKCA 4LLRA 1ZYEA 2LRTA 5CREA 3UL3A 1ML6A 4Q5RA 4LL1B 5J5NA 3FW2A 4EUYA 2OACA 4MPGA 3PH9A 3WD6A 3LGCA 3KTLA 5JWOB 2IMIA 1GULA 4HZ4A 3J7Yb 5AIVA 3I43A 1ERUA 3W8SA 1RQMA 1F37A 1AIUA 2GZYA 2B6MA 4MMMA 4HJ2A 1YY7A 3FYGA 4KDXA 2JSZA 1PRXA 2CZ2A 4N0ZA 5F0GA 4QQ7A 2I4AA 3FZAA 3IV4A 4K6XA 4RI6A 1I5GA 2VLVA 5B7CA 3WT1A 2JADA 2AB6A 2LQQA 5DQYA 1PX7A 1QXHA 10GSA 3QOUA 1O73A 4XS4A 4DSSB 4NWYA 3UJ1A 1X9MB 2LJRA 5D9VA 2VM2A 1J0FA 1A2LA 2OE1A 3F4TA 3GH9A 4MCUA 4ZB9A 2EIOA 3GSSA 4IP1A 5ECLB 1IYIA 3TKSA 3Q18A 3BJ5A 1ZYQB 1GLQA 4GQCA 2MMNA 3TOUA 3MAKA 1XPVA 2X99A 3PINA 2LSTA 5ENUA 1TP9A 3HZ8A 1GTIA 3KGKA 4EO3A 5A4VA 2H76A 3F63A 2VL2A 4I8BA 1Z5YE 5ECHB 3DKSA 2L6DA 2H30A 2O87A 2L5OA 2CVBA 4ZBDA 2VCXA 2DSAA 4GCIA 5IPHA 3WGDA 2H8LA 6GSTA 5CRHA 2LS5A 2KOKA 3GV1A 1FW1A 4AGSA 3IA1A 1UN2A 2R2JA 4I2TA 3HVSA 3LXTA 3IK7A 1K3LA 3L9SA 4EKZA 3MWHA 3VFIA 4XTSA 2AHEA 4HU7A 1SL1B 3EURA 4WETA 4F9ZA 2I1UA 22GSA 1GL8A 3MSZA 1V40A 1OE7A 1R26A 4WF4A 2V1MA 2MYGA 1THXA 5HFIA 1X0RA 4BVXA 2GVPA 4FYCA 5DALB 2IIYA 3UOMA 5LCZA 3QD9A 4OFTA 1SKSB 4ML6A 3WYWA 3KMNA 2RLIA 4L8EA 2MMZA 4K0NA 4MPFA 1CQGA 4MF5A 4POBA 1H75A 4HQZA 3PGTA 5IMZA 9GSSA 5D9WA 2IMKA 1JLWA 12GSA 1B48A 2C0FA 4PNGA 2N5AA 3TJGA 4F03A 4MJEA 4D73B 1PD21 3KP9A 5IMAA 4GXZA 1KBNA 4NV5A 5C00A 1J08A 5ECPB 2YN1A 1V9WA 5JCWA 5G5EA 1OKTA 1XWBA 2XBIA 2HFDA 5ID2B 3N5OA 1KTEA 3EC3A 3CTGA 4DVCA 1TK8B 3DD3A 4K0GA 1NSWA 16GSA 2WULA 4BWQA 5ECIB 4KCEA 1THOA 4NPBA 3BD2A 4G9HA 1T4YA 4HUAA 4K1FA 1YJ6A 1M0UA 2M80A 2L5LA 5D9XA 3HHVA 2EC4A 2LRNA 5IOXA 5HFKA 3GSTA 2FHEA 4HZ2A 3M8NA 2YCDA 3RDWA 1PQNA 2EIRA 1DUGA 1PX6A 1TU8A 4CDOA 5KN1A 3KH7A 2JU5A 3HJOA 3GL5A 2DJKA 5AISA 5IO0A 2K8VA 1HQOA 4FYBA 3HDCA 1A0RP 2HSYA 1TRVA 1YQ1A 3KEBA 2HSHA 5ECMB 1M2BA 1T00A 1GTUA 3KIJA 2G2QA 1A24A 5ECSA 3L4NA 2PUKC 3TJJA 4O32A 1NHYA 4Q5NA 5D96A 4L5OA 5HR3A 4KH7A 2PGTA 1AAZA 4GQFA 3CSHA 1OC9B 1ERTA 2VLUA 3D22A 4MH2A 2ES7A 1SD9A 2BJXA 2VCVA 5G5FA 1EWXA 2RM5A 5JWQB 1VF3A 4FH8A 2OE0A 1WJKA 1GTAA 3WGXA 1ZL9A 2YNXA 1DSBA 1E6BA 2O8VB 1I9DA 3GRXA 4KCAA 1B4QA 4EF0A 4ACSA 3I9V2 4V1Ag 4KDYA 3P2AA 2CVDA 3UBLA 1TRWA 1M9AA 1PN9A 4OWYA 1BG5A 3FRCA 4IJIA 1SJIA 2VOCA 3BOAA 2YV9A 2P5RA 4LMVA 4WF5A 4GSNA 2OA7A 2V41A 3TB2A 1URMA 2IMDA 1TJDA 3LQ7A 3TJFA 3QFAC 1KNGA 3FEUA 5EVOA 2H19A 2HZEA 5IO2A 2LQOA 1YF0A 5ECRB 5GZZB 20GSA 1AQXA 4HEA2 5DDLA 2DLXA 3NIVA 3TKQA 2CAQA 4N30A 3P8WA 5C04A 3C73A 2FWHA 2LTKA 3EVIA 3M3MA 1A23A 3ZFLA 5G31A 6GSWA 2C0DA 2VUPA 3TRQA 2B5YA 4EE0A 1K0NA 5CYYA 1XCCA 4K7NA 5D9TA 2WFCA 2GT6A 1K0DA 2CQ9A 3RHCA 1DBYA 4K9ZA 1BJXA 2YWOA 2R6KA 1U3IA 2M72A 1ERWA 1Z7PA 3QAWA 1GNWA 3F3QA 1WP0A 1Z3EA 3D5JA 3DIEA 1N8JA 4PXOA 3GFKA 5H5QA 4V1Ap 5CAXA 3L0HA 4EDYA 1KEBA 4GTUA 1XVWA 4BWSA 5IPGA 4ZB6A 2DJ1A 2FA4A 2MBSA 2V6OA 2FWEA 1GSEA 2DIZA 2GQLA 4ZB8A 2O7KA 1LBKA 4OFMA 1PL2A 1YDKA 4V2LA 2WJUA 3IPZA 3MNGA 3ZYWA 3EYTA 6GSUA 2H01A 2VAFA 3ZITA 1Z6MA 1W4VA 5FHIA 1K3OA 4G10A 2KP1A 2H0HA 4ZL8A 4DSQA 4RQXA 1EP8A 4JR4A 5LD0A 1AQWA 1BX9A 4G19A 4ECIA 3ME8A 2R37A 4RI7A 4TXOA 3U5RE 4MA9A 2H6ZA 1Y25A 1TI3A 4TR1A 3GKXA 5JWRB 3AY8A 1JFUA 3TDGA 2GLRA 4YAPA 4KW6A 4ECJA 2KP2A 2A2RA 2VCQA 2HYXA 1T7PB 5GSSA 4ML1A 3UVHA 1NW2A 4BA7A 1AXDA 1QFNA 1AUCA 2ALBA 2FWGA 4QL7A 1EEJA 3ZZXA 1ABAA 6GSSA 3HVVA 4PQ1A 2B7KA 4I97A 2H0GA 1K0AA 1T8EB 1TRSA 3HJPA 3P90A 1B4PA 1EP7A 4QL9A 1F3BA 4YQVA 2MBTA 1XZOA 1B9YC 3LSZA 1EZKA 2G0FA 3ZIVA 4K8MA 1PMTA 3C7MA 1Y6EA 1UA5A 1SENA 4MF7A 2FGXA 3M0FA 1MD4A 5J4UA 3D4TA 3TKPA 2GDRA 2PBJA 3ZREA 4JR6A 3ZVJA 1XBSA 4NHZA 1R7HA 2QGVA 1MEKA 2DIYA 2E2GA 4Q5FA 1AW9A 1O8WA 5F06A 2ON5A 1Z9HA 4MJAA 1QMVA 2ZCTA 2B3SA 3DWVA 4K7OA 3LFLA 4OO5A 4KNDA 1S3AA 1FO5A 2HZFA 1M2DA 2IPAA 3K8NA 1OKDA 3D6IA 2VLTA 1SKRB 4F82A 1DE2A 1M9BA 3ISOA 2OBIA 1A8YA 4HQSA 2HE3A 3G9BA 4IELA 4IHUA 2OE3A 4IN0A 19GSA 3W6GA 1VF2A 3RBTA 3C8EA 4XRDA 4XS1A 3W8JA 4YAVA 1U6TA 1UVZA 4MZWA 2XBQA 2F9SA 4PGTA 4ZBAA 1YEXA 3BCKA 5KEJA 2CVKA 3GNJA 3WT2A 4L0WA 3TJKA 4MABA 4MK3A 3TRPA 3A2XA 1T1VA 1GWCA 2PN8A 3DVXA 2F3MA 3KCMA 2FWFA 2DMLA 1GSDA 1B9XC 4WR4A 6GSVA 2A4VA 3DEXA 1H4OA 2IFQA 3UIWA 1XW9A 5B6MA 3VWXA 2FY6A 4EVMA 5G30A 3QAGA 3BBYA 3IE3A 1TRUA 3H79A 5ECKB 3IK9A 1MDJA 2RIIA 1WE0A 5G1KA 2CX4A 3GX8A 1K3YA 3DVWA 4XS4B 4IGJA 5ELAA 1XWGA 1G6YA 3VURA 5HR2A 2WS2A 3LORA 1TI1A 1Z7RA 2QKEA 4J57E 5DQSA 2GQKA 1X5DA 3F8UA 5DALA 2YANA 4GF0A 1SK2A 5ELGA 5FT3A 2KHPA 2D2ZA 1LJRA 3LEFA 4ZL9A 3D4MA 3E0UA 3M9KA 4HU9A 1JZWA 4I5QA 3TKRA 2B1KA 3CYNA 3PR8A 4JZQA 1GP1A 3F4RA 4ID0A 3VI5A 1HD2A 2IMEA 2HLSA 3ZLPA 4V2NA 2WRTA 3ZVJD 3F3RA 3KP8A 5GSTA 2H71A 3IXRA 1Z6NA 5DCGA 4IQAA 4FO5A 1OVNA 1ZGNA 5IMCA 2QC7A 3VWWA 2VCTA 4MH3A 5B8AA 2LKUA 2LJAA 1ZZYA 1U87A 4POLA 3WGEA 2XC2A 1PL1A 3HCZA 3QR6A 2YPMA 4XCSA 3CMIA 4DSRA 2VM1A 1XFLA 3I6AA 2H1BA 8GSSA 1E2YA 1IYHA 5ABRA 3DRNA 3ZMKA 2F8FA 1ST9A 2WDUA 2P5QA 1WRYA 4F2IA 1K0BA 2JSYA 4JU5A 2ZUPA 3G7YA 2F8AA 3TOTA 3KJYA 6GSYA 2GGTA 3IR4A 2CZ3A 5DJMA 5KN0A 3C1SA 4TVEA 5J3RA 2V6KA 1GUMA 2HNLA 2ZNMA 2AV4A 3VWVA 1R4WA 5CP1A 5ECOB 2VO4A 2K18A 4LA1A 2GSQA 2C80A 5LNKe 3RHBA 3L9VA 4PUAA 3EU3A 4JRRA 1SYXA 1OC9A 4ECBA 3ZTLA 2TRXA 5J9CA 4KUNA 2YJHA 3GUSA 5IMDA 4KSOA 1NM3A 3A3TA 3IAM2 1K0OA 4JBBA 2PU9C 5DAKA 1JHBA 13GSA 3KD0A 3KZQA 2IJYA 1WIKA 4ZIJA 4FIWA 4K7IA 3H4KA 5J9BA 4HOJA 2L4CA 4O5RA 2YZHA 2H66A 3HVXA 1ACVA 4ILFA 3US3A 5A5KA 1ZCPA 3LYKA 3IBHA 2RM6A 1MTCA 1SJZA 2WZ9A 4OFNA 3C71A 2DMMA 1TW9A 3EMPA 4MJCA 1F9MA 1TOFA 2F51A 4YH2A 1QQ2A 2YJ7A 3ERFA 4TR3A 5IQYA 2VD0A 3LXZA 1M7TA 3O76A 3FHKA 4Z7XA 3G7JA 1JLVA 2VCZA 4WBJA 4K2DA 3TKSE 2LNSA 1ZOFA 4KA0A 1FVJA 2XPDA 2VCWA 4PX1A 4IBPA 3TRXA 2AYTA 3GMFA 3CSJA 3GKNA 2RUFA 3RAZA 4IS0A 3A2WA 1GRXA 4E8EA 2O85A 1M2AA 2L59A 2OBKA 4TOPA 5IOWA 3FZ9A 2N5FA 1EGOA 2J23A 1FOVA 2FA8A 1R5AA 3GYKA 1HNAA 1NHOA 1VF4A 2GZZA 3O3TA 4YQUA 3SBCA 2LUSA 4BL7A 3I69A 3QMXA 2HRNA 1TK5B 3EE2A 4MZCA 1RK4A 5IIZA 4MP4A 3H8QA 5B6NA 1GTBA 1TU7A 4AJ6A 1K0CA 2GSTA 3APSA 3ERWA 4TN8A 1FB6A 4CW9A 2K8SA 4TR0A 1JZOA 2Z9SA 1BYEA 4GWRA 4XHMA 3VPQA 3OR5A 4HDEA 3QPMA 3ZIJA 3VWUA 4PQHA 2H72A 4XS6A 3ERGA 18GSA 3FR6A 5DCHA 3F0IA 1WWJA 5A4UA 1SL2B 1SU9A 3EU4A 3GTUA 4ZBBA 3RPPA 3APOA 3TJBA 4TRXA 2QSIA 1OE8A 3L78A 3A5WA 1GLPA 2IWTA 2JL4A 4IJ3A 1GUHA 4NHWA 2VIMA 4IP6A 4GLTA 3HXSA 5ECNB 2NDOA 4GSSA 4OD7A 1EOGA 1ON4A 3SWLA 2H75A 2YWMA 2WB9A 4AF2A 4L5LA 3CBUA 4AJ8A 4TXOB 3F9UA 1BQ7A 1GUKA 1U3AA 4EC0A 3L9UA 3N9JA 1MD3A 2X64A 1FAAA 2GTUA 3HZ4A 2MMOA 4ULXA 1V98A 1HNCA 1XOBA 2MZCA 4MF6A 1QUWA 3GIXA 1A2MA 3GKMA 1PA3A 4OCFA 1G0TA 4TW5A 1RW1A 2B5XA 2NPBA 1OYJA 2JZSA 3FK8A 3UBKA 3H93A 1O85A 5HFGA 5AGYA 3UEMA 4P3YB 1BAYA 4KAEA 1TTZA 1FVKA 4ZL7A 1O6JA 4WBRD 3TGZA 3VI7A 1XWAA 2GSSA 1EEMA 2DJ2A 3FR3A 4GSTA 4BVYA 2YWIA 2JZRA 3J7Yk 1VRSD 5IM9A 3CSIA 3IC4A 4DSSA 2FCHA 3LYPA 4N10A 1TXXA 3HKRA 3CRUA 5HR0A 3DMLA 2PPTA 3IAS2 4EDZA 2PVOC 4OO4A 4YQMA 2C3TA 2X8CA 1XXUA 2R4VA 5D73A 4F0BA 5AIXA 3EMXA 1CQHA 1EV9A 1A8LA 2J9HA 3TCOA 1TK0B 2HT9A 1HYUA 3UAPA 1V2AA 2L4QA 5KN2A 2R3XA 1XOAA 3HA9A 3GKKA 4O92A 3GURA 4F0CA 2AAWA 2I81A 1QGVA 1BEDA 5CRDA 2FLSA 4ZXGA 2A2SA 3KXOA 2BTOT 1HNBA 2L6CA 5J41A 2LNTA 4BPYA 2C4JA 2GS3A 3TUEA 2GSRA 4LL4B 5H5SA 17GSA 1XIYA 3VK9A 1FB0A 2DC5A 2REMA 2MMAA 4MJBA 2ON7A 4H86A 3TKSC 2C0GA 3D21A 5F05A 1GNEA 2KUCA 1WPIA 2CA8A 3NOFA 5HQPA 5JCUA 4KSMA 3IHQA 2FD3A 2V32A 1YKAA 1EOHA 5G1LA 1O81A 2HRFA 2VL2C 4IW9A 1YEPA 2LV3A 4WR5A 2IFQB 3ED3A 3DXBA 3QFBC 1PGTA 2PERA 1F2EA 1X9SB 5DBQA 5CO3A 2GQMA 4WXTA 5CNWA 4N11A 2GT5A 4J2FA 1X9WB 1Q4JA 5E4WA 2DJJA 3MDKA 11GSA 4G2EA 2AUVA 2C3QA 4D73A 2JZTA 1SKWB 2H6YA 1FHEA 4NMUA 1FG4A 3APQA 2CX3A 1TDIA 2OADA 3DGQA 3GL3A 1S3DA 2PWJA 5ID2A 4NV2A 3VPTA 3F4SA 1WOUA 1U88A 2HI7A 3QCPA 2EIQA 1X5EA 2N5BA 3CTFA 2O89A 4ECCA 1F3AA 1SK0A 2DJ3A 1XWKA 3F6FA 2E2MA 4I6XA 3FZ5A 1T3BA 2L57A 5EPFA 3IDVA 5A4WA 3G7IA 2LRCA 3HY2A 4NXIA 1PKWA 4PURA 3KH9A 2H73A 1SJ6A 1A2JA 4Q5QA 4XIHA 1S3CA 2C3NA 3HYPA 2H74A 2H1GA 3P7XA 1O7UA 1XW5A 1M99A 1EV4A 1ILOA 1OAZA 3EWLA 4EXJA 1GSUA 5DVBA 4X43A 1XVQA 1J9BA 2P31A 3Q6OA 3VLNA 5B8BA 1GSQA 5CRGA 5F07A 2RUEA 1EGRA 1V57A 4PQIA 2I3YA 1AC1A 4PUFC 3CRTA 1USBA 2NTOA 1TKDB 4XRAA 2C1YA 5COHA 1VGLA 4LMWA 1PKZA 1N2AA 5H5RA 2X8HA 5EY6A 3UARA 2YWNA 3Q74A 3RPNA 5HR1A 1SL0B 2HXKA 4MLYA 1UC7A 4X1UA 3E9JB 2FUG2 1MDKA 1YZXA 1G7EA 3O6TA 4IVFA 4MDCA 4IQ1A 5GAND 4KGIA 3U6VA 1T4ZA 2VL3A 5L71A 3GA4A 4ZILA 4X0XA 2BMXA 1B8XA 4HJMA 3UMAA 4GRFA 1Q98A 5AN1A 5EL8A 5IMVA 2E7PA 2WCIA 3HD5A 1G6WA 2DBCA 3LJRA 2VL9A 2C8UA 3GN3A 4OCEA 1A0FA 4RUVA 7GSSA 2YP6A 3UVTA 4EL1A 2FNOA 5D93A 2PMTA 1SYRA 1PSQA 2CV4A 5DAKB 1VF1A 4KE3A 2OKAA 4TR4A 1R5PA 4NAXA 1F6MC 2VD1A 5KN3A 3JCML 2K9FA 1OC8A 3QAVA 2B5EA 2B7JA 4TKYA 4V2MA 3ZMLA 2H6XA 2IL3A 4IKHA 3ZL5A 2XHFA 3FKFA 2H0IA 1V58A 1WMJA 2X8GA 2IN3A 2LJKA 1X5CA 1ERVA 5E59A 2B1LA 4I2UA 4KB3A 2HZEB 2I9HA 4JEDA 1LU4A 2V2GA 5CRWA 2JACA 4PNFA 3M1GA 3LG6A 1GSYA 2GZPA 3IRAA 4N0VA 1QK8A 4HI7A 1XWCA 3NZNA 2H1AA 3BCIA 3R2QA 3Q19A 5IMFA 5JCGA 3ZFBA 1G7OA 2YZUA 3GHAA 2H70A 2R5GA 3KTBA 5INYA 1XW6A 4JE1A 1JZDA 3GX0A 2LEGA 4RQRA 14GSA 1O8XA 1SD8A 2DJ0A 3FZ4A 2NVLA 4OMVA 5G2ZA 3EINA 5F8BA 4O7HA 3KM6A 2TRCP 4L0UA 2PVQA 2CAIA 3ZRDA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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