1QFNA

Glutaredoxin-1-ribonucleotide reductase b1 mixed disulfide bond
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
MQTVIFGRSGCPYSVRAKDLAEKLSNERDDFQYQYVDIRAEGITKEDLQQKAGKPVETVPQIFVDQQHIGGYTDFAAWVKENLDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport/oxidoreductase
molecule keywords PROTEIN (GLUTAREDOXIN 1)
publication title Binding specificity and mechanistic insight into glutaredoxin-catalyzed protein disulfide reduction.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 24
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-04-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1qfnA00
4L0WA 3F4RA 4XS6A 3UBLA 4PURA 3QFAC 2VD1A 5G2ZA 5EPFA 2O89A 5ECOB 2CVBA 2L59A 2GQMA 4KA0A 2LQQA 2WB9A 3LJRA 1SKSB 1EV9A 1O8WA 4ZL7A 2LKUA 5KN0A 2XHFA 4RI6A 2E7PA 2RLIA 5HFKA 1CQHA 1O81A 4HJMA 2IMKA 2CA8A 1U3AA 3TKPA 4MF5A 1OYJA 1AC1A 2DJ3A 4DEJA 4KDYA 3GKXA 4FH8A 1SENA 3DWVA 1N8JA 1R7HA 1EGRA 3CSIA 4WEYA 4OFNA 3MDKA 2WJUA 2H1GA 6GSYA 2L5OA 4XS1A 2C3TA 3M9JA 5IO2A 2H01A 3HZ4A 1H75A 1YF0A 1GNWA 3MAKA 1SD9A 1XZOA 2HXKA 3EU3A 1YJ6A 3HJOA 2PVQA 2FHEA 1VF4A 2I1UA 2H6YA 1SL0B 4WF5A 2C3NA 4RQRA 3EMPA 2PPTA 2OADA 22GSA 1SK2A 2CZ3A 4ZIJA 3UJ1A 4POLA 1OAZA 3G7JA 2ALBA 1YKAA 4FYUA 2IMEA 4TW5A 1M2DA 5D9WA 2DIYA 1ERTA 1DUGA 1ZOFA 2GS3A 3ISOA 5F8BA 1PGTA 3IC4A 3F9UA 1WMJA 1WE0A 2OJLA 2HSHA 3CRUA 2N5AA 1G7OA 4L8EA 3L9UA 5CAXA 1PX6A 1XIYA 4V2LA 1YEPA 3GMFA 2GLRA 10GSA 2GDRA 3A3TA 5F0GA 5ECMB 4V2NA 4O5RA 2VCQA 3TUEA 4KE3A 1THXA 5ID2A 3HVSA 4F2IA 14GSA 4WBRD 4IP6A 1SD8A 1Z6NA 2V41A 3VWUA 13GSA 3E0UA 4L0UA 1S3DA 4K2DA 3KH7A 4ZILA 1VGLA 3EWLA 2F8AA 3DMLA 4IN0A 3QFBC 5DDLA 5C04A 3KD0A 1F9MA 3UAPA 1B9YC 5G31A 3BOAA 3EU4A 3I9V2 2OE3A 4P3YB 5KN2A 3ZRDA 5DAKB 5H5SA 2F51A 2PBJA 3RAZA 3LGCA 1DE1A 4PQHA 1R5PA 5CRDA 4F0CA 4NXIA 2M80A 1K3OA 2REMA 1T4YA 4MZBA 1WIKA 3GH9A 2CVKA 1SL2B 3L9VA 4MJCA 3FR9A 4TXOA 3M1GA 1OC9A 3IBHA 3KGKA 2H6ZA 1TI1A 3ERGA 2YWMA 4KH7A 4LMWA 5ECIB 4RQXA 2H74A 6GSTA 9GSSA 4OD7A 2GZYA 4J57E 3GNJA 5ABRA 2IFQB 5INYA 2FA8A 1K0AA 3KP9A 3D4TA 2EIRA 1K3YA 2IWTA 2WZ9A 1U3IA 3RHBA 3FZ4A 1GRXA 4WR5A 4YAVA 2MMNA 3ZZXA 1ERVA 1S3AA 1SKWB 1VF1A 2MMOA 1XFLA 3VWXA 1T4ZA 4MCUA 1Z6MA 2PVOC 3KP8A 3HKRA 2X64A 4JRRA 7GSSA 2PUKC 1GSQA 1EP8A 5D8IA 3KXOA 5F07A 2C1YA 2XBQA 5IOWA 4X1UA 4IJ3A 2H70A 2KLXA 3MSZA 3TCOA 2TRCP 1J0FA 1T3BA 3P90A 2GSRA 3GL3A 4O92A 4GSTA 2VLVA 4HOJA 3WT2A 4KNDA 3D0ZA 1TRSA 1UVZA 1W4VA 3Q74A 3ERWA 3L4NA 4GWRA 2F9SA 2O85A 2DJ0A 3I69A 1E2YA 1RK4A 2CX3A 3GX0A 2B5XA 1R26A 5B8AA 3QPMA 1TRVA 3NIVA 4EUYA 1GH2A 8GSSA 1O8XA 2AHEA 4N11A 1BEDA 1Q4JA 5AISA 2MBTA 1F37A 3LWAA 4PGTA 3FR3A 1PN9A 4F03A 3PH9A 1M0UA 4I2UA 2X8GA 4ML1A 1F6MC 5D9XA 3W8SA 2VO4A 4KDUA 4FYCA 4Q5FA 2YV9A 4KUNA 2K9FA 4E8EA 5J5NA 4XRAA 1G0TA 5CREA 3VFIA 4EDYA 3QD9A 3VK9A 2QKEA 1OC3A 3ME7A 1YF1A 2JZSA 3FK8A 3LG6A 1Z7PA 2XC2A 4TRXA 2HZEA 2DBCA 5CNWA 2AUVA 4I2TA 5L71A 1A0RP 4MLYA 4ECCA 3WD6A 1SYRA 3H1NA 2WS2A 1M2AA 3IV4A 2ES7A 3CSHA 1XBSA 3JCML 5FT3A 3UL3A 4IP1A 1SK0A 2PGTA 2FY6A 3GKMA 4EKZA 1RW1A 2H1BA 4NWYA 2FA4A 3QOUA 3IPZA 4IW9A 1XW9A 3CBUA 2HSYA 4DSRA 3GTUA 4FYBA 4EO3A 3SWLA 3TRQA 2HZFA 2RM6A 3N5OA 1PMTA 3GN3A 3TRPA 2H30A 3LXZA 1XWGA 4WKWA 1X5DA 1ZZYA 2O7KA 5GZZB 4GCIA 5ECLB 5G1KA 1SK1A 1ERUA 4HZ4A 3ME8A 4YH2A 4ZL8A 3TJGA 2KP1A 1KTEA 3C7MA 1GL8A 2LJKA 4GSNA 1JFUA 3APQA 4O7HA 1TXXA 3DGQA 1J9BA 3DEXA 3IOSA 3LORA 4XTSA 3UVTA 1ACVA 4DSSA 5DCHA 4NMUA 3DKSA 4PQ1A 1AUCA 3S9FA 1V98A 3IR4A 2CT6A 2YOIA 5KN3A 2AJQB 3US3A 5ELAA 3KMNA 2DSAA 5HFGA 2VAFA 3U6VA 1MDKA 3OR5A 3ZFBA 4MJAA 4CW9A 1U87A 3CTFA 4ZBBA 3LYPA 1CQGA 2H0IA 3G7YA 1YDKA 3E3EA 4POMA 5HQPA 2YCDA 1QGVA 3UOMA 4TR1A 4JU5A 2QGVA 3C71A 6GSXA 3CXGA 4D73A 1EGOA 4KCEA 4N30A 2OE0A 1T00A 4GQFA 4JEDA 2OKAA 1GTBA 3M3MA 4WF4A 1GWCA 3EINA 4TR0A 1GSSA 4IHUA 1HQOA 5G1LA 4HDEA 1AQVA 1VF2A 1SKRB 4AGSA 1UN2A 3DD3A 1FAAA 2I9HA 3K8NA 1MDJA 3GYKA 5FHIA 4DVCA 5B8BA 3AY8A 2M46A 4MZWA 1S3CA 4I6XA 3KIJA 1Y25A 5JCWA 5ID2B 1SJIA 4IKHA 3TKSE 2VLTA 3ERFA 1O7UA 3IK9A 3KH9A 5HR3A 3UEMA 1JHBA 3E9JB 2H71A 4GLTA 4HZ2A 5H5RA 1K0NA 1F3AA 3M0FA 4WETA 4YAPA 5DJLA 3BD2A 2JZTA 1ML6A 19GSA 1SL1B 2VM2A 2WULA 4OFTA 2OBKA 1PL2A 2YWNA 1ERWA 2LNSA 1F2EA 3ZMLA 2V6KA 3QMXA 3VI5A 3ZL5A 5J4UA 4HQZA 4J56E 2ZUPA 3EYTA 4XCSA 1PKWA 1IYIA 3F8UA 3M9KA 4BWSA 1C72A 1J08A 4JE1A 2LRTA 3A2VA 4XS4A 4POKA 5ECSA 4HU9A 2YJHA 4KCAA 4TXOB 5JWRB 2VL3A 3ZYWA 4KAEA 2J9HA 5D73A 2DJ1A 1GULA 3C1SA 2HYXA 1XWCA 2YZUA 1FB0A 4MF6A 2VCTA 2VUPA 1X5CA 1QXHA 1GTIA 3HVXA 3FY7A 1TRUA 1BJXA 1K0MA 2IMDA 4O32A 2N5BA 2MMAA 1SJ6A 4MA9A 1DE2A 4NV5A 1IYHA 3W6GA 1NHYA 1GP1A 1TK0B 3F63A 2FWEA 4KW6A 3FZAA 1TU7A 1TOFA 1YQ1A 4XIHA 1OVNA 1TJDA 2C0DA 1GSDA 1XVQA 2R4VA 1WRYA 2C4JA 2RIIA 5D93A 1TKDB 3C1RA 4RI7A 1E6BA 3EVIA 2H73A 4LMVA 4MJEA 2H0GA 4ILFA 1U88A 2YJ7A 5IMCA 3KMOA 3M8NA 4FIWA 5F05A 4EVMA 2C0GA 2HT9A 4EDZA 5LD0A 2B1KA 2L4QA 2I81A 3TJFA 2OA7A 1GLPA 1G6YA 5ECKB 4PNFA 1TW9A 3D22A 1SU9A 1HNAA 4ZB9A 1EOGA 2YZHA 1EEJA 1FW1A 1TRWA 1G7EA 2CAIA 4TXVA 4F82A 2VOCA 2RUFA 1Z7RA 3D4MA 2AYTA 4F9ZA 1X9SB 4N10A 1HYUA 2J23A 3P8WA 4TN8A 3GUSA 1V40A 1PA3A 4L5LA 1ON4A 4RUVA 3CMIA 2R37A 1BYEA 4XRDA 2LUSA 4NHZA 4IQ1A 3V1WA 2LV3A 4NPBA 4WBJA 3N9JA 4K9ZA 3G9BA 4ECIA 2CZ2A 1PRXA 4BL7A 1TK8B 3F6FA 5IIZA 2C3QA 3IAM2 2FUG2 2DMMA 3IRAA 2AV4A 2G2QA 5IPGA 3HA9A 2XPEA 2IN3A 1XWAA 5HFIA 2VCWA 4ECBA 3HVVA 1EOHA 2AB6A 4JR6A 4K7NA 2YANA 2B1LA 5DVBA 1N2AA 5G5EA 4K1FA 3LXTA 4HJ2A 2A4VA 4YQMA 3KTLA 2ZNMA 4IGJA 2L57A 2P5QA 4MZCA 4BVYA 3VPQA 3CTGA 4K0NA 4PNGA 1FO5A 2LRCA 1A0FA 1M2BA 3HZ8A 6GSUA 2DIZA 3GSSA 2CV4A 1PX7A 3O76A 5DALB 4MJBA 2E2GA 1JLWA 4IJIA 2LJAA 3MNGA 1SJZA 3HCZA 3UARA 3GX8A 4MH2A 2IL3A 3D21A 1ABAA 4FO5A 1SYXA 2YN1A 4X43A 1XW6A 3H4KA 1LU4A 3PR8A 3FZ9A 1X9WB 3O3TA 3GTUB 4NAXA 2NPBA 1FG4A 1RQMA 2N5FA 5J9BA 4K8MA 3VPTA 3TGZA 5DAKA 1X5EA 2B5EA 1HD2A 1BAYA 1TI3A 1GUHA 2GQKA 4GTUA 1GSEA 2CAQA 2E0QA 2HLSA 3TJJA 4ULXA 1B8XA 1A2JA 1QK8A 3VWVA 5ELGA 2GSTA 1ZYQB 4TR3A 4OCEA 4V1Ag 2JZRA 2BMXA 2V2GA 5IMZA 2DJKA 4NHWA 1GTAA 2I3YA 5EY6A 4PQIA 3L0HA 4QQ7A 3W8JA 2IFQA 2LQOA 5G30A 4KDXA 3F3QA 5JCGA 3HD5A 3TB2A 3Q18A 3QCPA 1Q98A 4OO5A 2LNTA 5JCUA 2JL4A 1DSBA 3IE3A 4TKYA 2H72A 3KEBA 2A2SA 3UIWA 4V1Ap 2FWHA 2B3SA 3F4TA 2R2JA 2IPAA 3BCIA 2B7KA 1XXUA 1VRSD 5A4VA 3RDWA 4D73B 5CP1A 2JADA 1EV4A 1PSQA 2ZCTA 5J3RA 3QAGA 2HFDA 1NHOA 2VCZA 3PGTA 4CHSA 1TTZA 1TU8A 5DBQA 5CYYA 1VF3A 3ZREA 2LTKA 4HS1A 2MYGA 2F3MA 4ML6A 2KHPA 1F3BA 4EC0A 1GUKA 1WJKA 4OCFA 1A8LA 2YNXA 4ZXGA 1EP7A 1XW5A 2DLXA 4TVEA 1OE8A 3TKQA 2JSYA 3TDGA 1T1VA 2FD3A 3GKNA 1MD4A 3FW2A 2VM1A 4X0XA 1TP9A 5JWOB 2C0EA 3P2AA 2XBIA 5CRHA 4ISDA 3F3RA 2P0GA 5IMAA 5IMVA 1LJRA 3R2QA 3HJMA 1GLQA 3HDCA 2B5YA 2C80A 3LQ7A 2WDUA 2EIOA 3RPPA 4ZB8A 1URMA 3QAVA 2FNOA 2YV7A 4KGIA 2VCXA 3C73A 3FKFA 4GQCA 2P31A 2GT5A 5AIVA 2K6VA 4MMMA 1K0OA 1T8EB 2JU5A 4BPYA 4I97A 4MP4A 1PKZA 2X99A 3TOTA 1GNEA 4OFMA 2KOKA 4IELA 5GAND 3PINA 2M72A 1A2LA 2GZPA 4EL1A 3VURA 2VLUA 5H5QA 4Q5RA 4KSOA 5J9CA 1HNCA 5ECHB 3H93A 2GTUA 3HXSA 1A8YA 4JBBA 5ECPB 1R4WA 3IA1A 3VWWA 1UA5A 5J41A 2HI7A 2OBIA 1M9AA 2BTOT 2R5GA 4WR4A 4GSSA 2IMIA 1BQ7A 2WRTA 4GF0A 3FR6A 2WFCA 5IQYA 3EE2A 2I4AA 4QL9A 3EURA 3A2WA 5IMFA 5A4UA 2V32A 2DJJA 3EMXA 1YY7A 1QUWA 1AQWA 2NTOA 2ON5A 1B4PA 3C8EA 1NM3A 1X9MB 2K8SA 1G6WA 3F6DA 2GSQA 1Z3EA 1XOAA 2CX4A 5IOXA 3FRCA 3KCMA 2O8VB 1JZDA 4JZQA 2OACA 1GSUA 1NW2A 4AJ7A 1JLVA 2GVPA 1GSFA 3IHQA 1FB6A 4LL4B 4K7IA 3ZTLA 5B6MA 4BA7A 3FHKA 3LEFA 3ZIJA 5GSSA 5E4WA 2H6XA 1GSYA 5D9TA 5IO0A 3DYRA 2H75A 5KN1A 2EC4A 1KBNA 5AN1A 4ECJA 2VL9A 1WWJA 3TKSA 1YZXA 5IMDA 5F06A 4BWQA 3WYWA 1K0DA 4MDCA 6GSWA 3CRTA 1FVJA 2FGXA 1OC9B 2L5LA 1M99A 2V6OA 1OE7A 3O6TA 4MPFA 3L9SA 1QMVA 1K0BA 4OO4A 3GIXA 4HUAA 3F0IA 2GQLA 4TOPA 5CRWA 2GGTA 2HRNA 2R3XA 1JZRA 1QFNA 1BX9A 2FCHA 1V9WA 2R6KA 5B7CA 4ZL9A 1LBKA 4AJ6A 1ZYEA 3UVHA 4MPGA 4I8BA 2PN8A 3TKSC 3GH6A 2LEGA 4HI7A 4N0ZA 2VCVA 5AGYA 4GRFA 5GAPD 4JR4A 3UMAA 1K0CA 1A23A 4MF7A 5IM9A 1OKDA 2G0FA 2GZZA 3F4SA 3SBCA 6GSSA 1Z5YE 1PL1A 1ZL9A 4WXTA 3TJKA 1AQXA 4AF2A 2LRNA 4LL1B 3WGDA 1TK5B 5EL8A 1FVKA 1MEKA 3APSA 5D9VA 4NV2A 1EZKA 4TR4A 5KEJA 2X8HA 2DMLA 4IBPA 4QL7A 2L4CA 2V1MA 2F8FA 1ZMAA 1BG5A 3A5WA 2H66A 3I43A 2PWJA 2Z9SA 1OKTA 2RM5A 3ZLPA 3HY2A 2IMFA 3WGXA 4EF0A 3IXRA 4G19A 5DJMA 4YQVA 4IS0A 2P5RA 4YQUA 1B4QA 2K8VA 3GV1A 2HE3A 4AJ8A 1XCCA 1AW9A 5LNKe 3G7IA 1WPIA 2FLSA 2FWFA 1XWKA 2PU9C 1X0RA 2X8CA 3KJYA 4MK3A 5A4WA 3WT1A 1UC7A 3KTBA 1I9DA 1EEMA 5GSTA 3P7XA 3I6AA 4G2EA 2CVDA 2H19A 3U5RE 3GFKA 2D2ZA 1Y6EA 4LLRA 3ZMKA 5FWGA 17GSA 4PX1A 2VD0A 5LCZA 1M9BA 2NDOA 2QSIA 4ZBDA 3LFLA 4G9HA 1R5AA 1O73A 2FWGA 5HR2A 3RBTA 1V2AA 1AIUA 3DXBA 3VLNA 1T7PB 1MDIA 3ZITA 4CDOA 1KNGA 2XPDA 4L5OA 2H0HA 3KZQA 3HJPA 1ZCPA 3MWHA 3Q6OA 2WGRA 5ECQB 4V2MA 2HZEB 1M7TA 3NOFA 4Q5NA 3CYNA 1ST9A 3HYPA 4BVXA 1H4OA 1XPVA 5AIXA 11GSA 3Q19A 1XWBA 3QAWA 3QR6A 4I5QA 5A5KA 2VL2A 20GSA 2RUEA 2KUCA 2JACA 2MMZA 1WOUA 3TJBA 1JZOA 1THOA 4K7OA 4PXOA 1U6TA 2YWOA 4HQSA 1O6JA 3HHVA 3J7Yb 3FYGA 2VIMA 2MZCA 2NVLA 3VI7A 2LSTA 2PERA 2H1DA 3D6IA 4ZBAA 4KB3A 1YEXA 3ZIVA 4IQAA 1HNBA 3FEUA 4EE0A 1KEBA 1A24A 3DVXA 3LYKA 2KP2A 3ZFLA 3WGEA 2TRXA 2H8LA 5B6NA 2VL2C 6GSVA 4ZB6A 5CO3A 1TDIA 1NSWA 2PMTA 5CRGA 5ECRB 4HEA2 2YP6A 2IJYA 2WCIA 1O85A 12GSA 3BCKA 3GRXA 1YKCA 16GSA 4E8HA 2L6DA 2OE1A 4ACSA 1USBA 2ON7A 4DSSB 2K18A 4OWYA 5C00A 1K3LA 3TRXA 2B6MA 4POBA 4J2FA 2B7JA 1AXDA 4MH3A 3H79A 5IPHA 1QQ2A 1AAZA 2H1AA 1MD3A 3BJ5A 1ZGNA 3L78A 3FZ5A 1XOBA 3ZVJD 5DQYA 1FOVA 4N0VA 2NBSA 2E2MA 2LS5A 1PQNA 2EIQA 3TOUA 2DC5A 1Z9HA 3APOA 3H8QA 3KM6A 1MTCA 1EWXA 1V58A 4TR1B 2H76A 2IIYA 2HRFA 1PD21 3GKKA 2A2RA 5EVOA 4IVFA 4H86A 1OC8A 3LSZA 5JWQB 1FHEA 2CQ9A 4DSQA 2BJXA 4LA1A 5DALA 3DRNA 3CSJA 4OMVA 5ECNB 2JSZA 3QDNA 2LJRA 4Q5QA 3RHCA 2AAWA 2QC7A 1XVWA 1DBYA 5DCGA 1W89A 3EC3A 1B9XC 2DJ2A 4MABA 5COHA 3GL5A 3NZNA 5ENUA 2C8UA 1ILOA 3D5JA 2YPMA 4KX4A 3TKRA 3GA4A 2MBSA 4PUFC 1V57A 5HR1A 4EXJA 2YWIA 2HNLA 3UBKA 18GSA 1GTUA 3IK7A 4F0BA 4KSMA 3GURA 3ED3A 1I5GA 4K0GA 5HR0A 1JZWA 2GT6A 3GSTA 4G10A 3ZVJA 3BBYA 1B48A 2TIRA 5D96A 3IDVA 4XS4B 2O87A 5G5FA 2L6CA 3GHAA 1A2MA 5DQSA 1GUMA 3J7Yk 2C0FA 3A2XA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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