4HQZA

Crystal structure of the pneumoccocal exposed lipoprotein thioredoxin sp_1000 (etrx2) from streptococcus pneumoniae strain tigr4 in complex with 2-hydroxyethyl disulfide
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
141
structure length
141
Chain Sequence
VGKDAPDFTLQSMDGKEVKLSDFKGKKVYLKFWASWCGPCKKSMPELMELAAKPDRDFEILTVIAPGIQGEKTVEQFPQWFQEQGYKDIPVLYDTKATTFQAYQIRSIPTEYLIDSQGKIGKIQFGAISNADAEAAFKEMN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Thioredoxin family protein
publication title Molecular architecture of Streptococcus pneumoniae surface thioredoxin-fold lipoproteins crucial for extracellular oxidative stress resistance and maintenance of virulence.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule tags Oxidoreductase
total genus 42
structure length 141
sequence length 141
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4hqzA00
2AYTA 1GTUA 2R5GA 1XWBA 1GWCA 2PERA 4I2UA 3ZTLA 2I4AA 1KNGA 1TRUA 1SKSB 5IPGA 3FHKA 3TRQA 5EY6A 2X99A 3VWWA 4LL1B 5KN2A 1A8LA 2NVLA 2VIMA 2P5QA 2PUKC 1AW9A 2JSYA 3G7IA 4ZB8A 1T3BA 3OR5A 1ZZYA 1ZMAA 5G5FA 5ABRA 2GVPA 1ZCPA 2MMAA 2GS3A 1FG4A 4IW9A 2YCDA 5J5NA 4OFNA 4Q5NA 5L71A 2FUG2 1BYEA 4YH2A 2OA7A 2MMNA 3ZFBA 2GSTA 2C3QA 5GAPD 1TK8B 3EYTA 4CDOA 4OWYA 5ECLB 2N5FA 2N5BA 2LSTA 3WT1A 2GZYA 4O5RA 2BMXA 2VCTA 1XBSA 1URMA 3UEMA 1H4OA 2X64A 5JCGA 2I81A 2VCWA 1GULA 2DJ3A 3KGKA 2VL2C 2IFQB 2CA8A 4JZQA 3H8QA 2H8LA 5IMZA 5IIZA 4MLYA 2F8FA 4DVCA 1X9WB 2PPTA 2HXKA 1G6YA 2LV3A 1OVNA 2PU9C 1H75A 4V2NA 3F6DA 2DIYA 1B8XA 2H1GA 1R5AA 2O8VB 4KSOA 3KD0A 4HEA2 1X5CA 3EMPA 4XHMA 3GA4A 3APQA 1XXUA 4ECIA 5DCHA 5IMVA 2GZZA 3KTBA 4E8EA 4N0ZA 5ECQB 2OADA 2MBTA 2JZTA 5CNWA 2YV9A 3C7MA 1JLWA 4ZIJA 1ZOFA 2X8GA 1I9DA 5AIXA 4DEJA 1FOVA 3EINA 4MZBA 4KDYA 1JZRA 5H5QA 4EVMA 5B7CA 2F8AA 2GQLA 3VWXA 1Z6MA 2B1KA 4MDCA 3LQ7A 3QMXA 3TJFA 2WB9A 5ID2B 1MEKA 3G7JA 1PD21 3C1RA 1GH2A 2ALBA 2C4JA 2RUEA 4LMWA 1OE8A 1JZWA 2B7KA 2VLUA 2RM6A 1WE0A 3UAPA 3KP9A 5G1LA 2GQKA 3E9JB 4AGSA 2MBSA 3KIJA 3H1NA 3O3TA 1RK4A 3HA9A 3W6GA 1QUWA 5ECSA 1K0MA 3KP8A 3KEBA 5IMCA 3IE3A 5DAKB 2H6XA 2TRCP 2V2GA 3HJPA 1J08A 1BJXA 4ZBAA 4TVEA 1UVZA 1HNAA 3DVWA 3LG6A 4V1Ap 3VI7A 3QAGA 2YV7A 5DJMA 1XOAA 2GTUA 1PA3A 1R4WA 5G5EA 5IOWA 3GV1A 2MMZA 4WR5A 3VLNA 4G9HA 1ZGNA 2Z9SA 2PGTA 1A23A 2TIRA 1SYRA 3CBUA 2OJLA 2KP1A 4D73A 2TRXA 3VWUA 1F9MA 3EE2A 3ERGA 4YAVA 2YWIA 4CHSA 2QGVA 3GUSA 2CZ2A 1M2BA 1EP7A 5IQYA 2LQOA 2GT5A 1J0FA 3DYRA 2PN8A 2DBCA 4Q5RA 4BWSA 1S3CA 3NZNA 1B4PA 1G0TA 3ED3A 2JZRA 4HJMA 2NDOA 2HNLA 1JFUA 1Y25A 4K7NA 1SKWB 2L4CA 1XOBA 3GX8A 1ZYQB 5CYYA 1CQGA 1VGLA 4FYBA 3TJBA 3HDCA 5DQYA 3P90A 1OC8A 4PNFA 1YDKA 2LJAA 2E0QA 4K1FA 3GKMA 4AJ8A 3KZQA 1X5DA 1Y6EA 5GZZB 3UVTA 4HOJA 4L0UA 3VFIA 2WDUA 5DJLA 1AAZA 3D21A 2B5XA 4N10A 4K7IA 1A8YA 5CREA 2JACA 1XZOA 4NV5A 5HR1A 2O7KA 4RI7A 2ZUPA 1SL2B 4ECJA 1K0NA 2FWFA 1TOFA 4TR0A 3IAM2 5G1KA 3TKSC 5AN1A 3I9V2 1T7PB 3FR6A 3QFAC 3VI5A 3CXGA 2CQ9A 3UOMA 3RAZA 3FK8A 4IVFA 5B6NA 1GSEA 3S9FA 3H79A 2HRFA 4Z7XA 3CRUA 4K7OA 1I5GA 1GRXA 4ZBBA 3IPZA 1BX9A 2K8VA 5C04A 4EL1A 1EV4A 5IO2A 2KP2A 2IJYA 4HI7A 3CTGA 3Q18A 1XW9A 3N5OA 4DSQA 1K0OA 4BA7A 1TI1A 1GL8A 3GL3A 5DQSA 4TRXA 1SENA 1JHBA 3LORA 3CSIA 3R2QA 4HDEA 1PX6A 4L5LA 1V2AA 3IA1A 4BWQA 3ZIVA 2EIQA 1ACVA 2E7PA 3MNGA 1NHOA 3I43A 4EDZA 4POLA 3CYNA 1X9SB 5ELAA 2I3YA 3EMXA 3HXSA 5A4UA 4NPBA 2FA4A 1FVKA 1USBA 3WGEA 3IK9A 4HZ4A 5EVOA 3O76A 3DGQA 1ZL9A 1BG5A 3CTFA 4FH8A 1WIKA 3LYKA 3IK7A 5CO3A 1MDJA 4MMMA 1QQ2A 4XIHA 4F82A 4KGIA 2OBKA 2KHPA 2VM1A 2IMDA 1AQVA 1NSWA 1TRSA 3PH9A 3IC4A 2HE3A 5ECIB 2BJXA 2H30A 1OC9A 2C8UA 3IHQA 1FHEA 2LEGA 3N9JA 4HUAA 3ERFA 2GGTA 1K0DA 4L0WA 3GKXA 4WF5A 5AIVA 19GSA 1EP8A 3UARA 1HNBA 4AF2A 5COHA 3UBLA 1XWCA 3GTUA 1X5EA 1S3DA 2VAFA 1BEDA 3U6VA 3TKRA 3HY2A 1GUHA 3TDGA 2XHFA 3DKSA 4KDXA 1SKRB 1O73A 4EDYA 1CQHA 3QAWA 1XFLA 3PINA 1A2MA 3JCML 4ULXA 5JWQB 1WJKA 1T4ZA 1M9BA 2E2MA 2WRTA 1U6TA 2HZEB 2G2QA 2H6YA 3F63A 3M8NA 2L5LA 4FYCA 1WOUA 5E59A 3HJMA 1EEMA 2V6KA 1FB0A 4I6XA 1G6WA 4NHWA 5J3RA 1F3AA 2FGXA 4XRDA 8GSSA 3IDVA 4OO4A 2CAQA 1WRYA 1ZYEA 1FVJA 4TXOA 4PQHA 14GSA 1C72A 2GLRA 4F9ZA 11GSA 1XW6A 3C71A 1GUMA 2H1BA 1NW2A 2OBIA 2A2SA 2IMIA 2CT6A 5CRHA 1EZKA 1Z6NA 3MSZA 1M2AA 1DE2A 3D0ZA 5J9BA 2PBJA 4G10A 3QR6A 2H0HA 2B3SA 1A0FA 3HD5A 4RQXA 3TOUA 1YF1A 1QXHA 3F0IA 3ZRDA 3LJRA 3FRCA 5KN1A 4GSNA 2H74A 4HQZA 4XS4B 2OE0A 1XIYA 4G19A 3LEFA 2ZCTA 2M46A 4TR3A 3GKNA 3I69A 2VL2A 1DBYA 3D6IA 1RQMA 3V1WA 4NWYA 2K8SA 4JE1A 3F4TA 2DMMA 3IOSA 3RPPA 3ZIJA 1GSFA 2DSAA 2VD1A 1UA5A 4MPFA 4K2DA 3IRAA 2VCQA 3PR8A 2L5OA 3ZL5A 2IMKA 3ISOA 1M9AA 5EPFA 3EVIA 3ZLPA 4KA0A 5G31A 1W4VA 2CAIA 1TU8A 1GSUA 4ECCA 1PKWA 2VD0A 2LUSA 2WCIA 3Q19A 1ON4A 1K0AA 4AJ6A 1M2DA 3APSA 5DALB 1A2LA 4GSSA 4IN0A 2IIYA 5DCGA 4LLRA 2H70A 1DUGA 1TRWA 5ECKB 2HZFA 2FWEA 2FWGA 2OE1A 3GURA 5CAXA 1TU7A 1OAZA 5F05A 3BD2A 3HVXA 4KNDA 4PURA 1SJZA 2MYGA 4GXZA 4MJCA 3EU3A 1LU4A 2A2RA 5ECOB 1JZOA 3ZITA 4RQRA 3DEXA 2GQMA 2YWMA 5G30A 5IMFA 2YOIA 1LBKA 2BTOT 2FY6A 13GSA 1YEXA 3KMNA 4X43A 2CX3A 5D93A 4K6XA 3C8EA 4BVYA 4GTUA 1SK0A 1SD9A 17GSA 3J7Yk 4PNGA 3SBCA 4GSTA 3PGTA 2DMLA 1EOGA 1GUKA 1IYIA 2H01A 4MP4A 3VPTA 1Q98A 1MD4A 2E2GA 5IOXA 5LD0A 5D9WA 4GCIA 2YJHA 4OCEA 1ILOA 4OO5A 2H72A 5CP1A 5EL8A 2FCHA 2IMEA 4GRFA 3HZ8A 4IGJA 3HVVA 4IJIA 4TKYA 2QKEA 1O7UA 4NMUA 4XS6A 4MH3A 2GSQA 1O85A 2EIOA 4TR1B 1G7OA 2XBIA 4NHZA 2JZSA 12GSA 20GSA 3ZVJD 3KM6A 2JL4A 1YKAA 2LNTA 4J56E 4JBBA 3EC3A 1K3OA 1GSYA 3KJYA 2FA8A 1GSDA 2LKUA 2XC2A 1OE7A 1WWJA 1SL1B 1OC9B 5D9TA 4KAEA 4XS1A 3F3RA 3GIXA 4MPGA 4PX1A 1YF0A 4X0XA 4HJ2A 6GSUA 4LMVA 6GSVA 4NAXA 1YZXA 2P31A 4KUNA 3BJ5A 2P0GA 2AV4A 2C0DA 4KCAA 5AISA 5HQPA 2R6KA 5A4VA 4XCSA 1OC3A 4POBA 1PN9A 2YZHA 4DSRA 2O87A 5HFGA 1KBNA 3TGZA 3FR9A 3W8JA 2DJJA 2XPDA 2XPEA 5FWGA 2J9HA 4CW9A 2O85A 4XTSA 2LNSA 4L5OA 1NM3A 2IFQA 3IV4A 3ME7A 4I5QA 3F9UA 4LA1A 2YN1A 5A5KA 4WF4A 2AJQB 5HR0A 4K9ZA 1B4QA 4ML1A 4IP1A 2B6MA 4IS0A 2M80A 4N0VA 4G2EA 1TW9A 4OFTA 1JLVA 4X1UA 1SK2A 2EC4A 4ZBDA 1SU9A 3HJOA 1XW5A 2L6DA 3IXRA 1GTIA 3LFLA 3F6FA 1AQWA 3GN3A 5B6MA 1T00A 4YQMA 4ZILA 3UVHA 4BPYA 4ZL8A 4H86A 5H5RA 5DDLA 4NV2A 4PQIA 3TCOA 2YNXA 1PL2A 3UL3A 4JR6A 2PVQA 5JCWA 2LTKA 2VLVA 4MJAA 4HU7A 3DVXA 4N11A 1K3YA 5ID2A 3FR3A 3IAS2 4WR4A 5AGYA 4TW5A 1R7HA 4J57E 2K9FA 4FYUA 4TN8A 2I9HA 3KTLA 1Z7PA 3Q74A 5F0GA 2PVOC 1MD3A 2CVDA 1O8WA 2DJ2A 4KCEA 7GSSA 5FT3A 4MJBA 4L8EA 1AUCA 2YWOA 16GSA 2H73A 2YANA 5CRDA 1HNCA 1F3BA 2ON5A 2LRTA 2VLTA 2PWJA 4POMA 1M99A 5DAKA 2AAWA 3WD6A 2VM2A 1QMVA 2LRCA 3UBKA 4MK3A 1XVQA 3G9BA 3DXBA 4QL7A 3DMLA 1V57A 1TXXA 3L78A 3TJJA 4OMVA 2VO4A 3DWVA 1EEJA 3CSJA 1THXA 2PMTA 4P3YB 1TTZA 1EV9A 3QFBC 3RHBA 4JR4A 5F8BA 2RIIA 1VF1A 4HS1A 1UC7A 2C0GA 1Q4JA 1O8XA 1GSQA 2FHEA 1N2AA 2FNOA 2L6CA 4MA9A 1VF3A 2X8CA 5IO0A 3ZFLA 5D96A 2G0FA 3VWVA 3DD3A 1F2EA 4BVXA 3TJGA 3QPMA 3TKPA 5IMAA 3WGDA 2AUVA 2LRNA 3CMIA 2CX4A 2IMFA 3DIEA 3KXOA 3L4NA 2O89A 2JU5A 4PGTA 2YPMA 3J7Yb 4BL7A 4MF6A 5J9CA 1PQNA 2FWHA 4WEYA 2I1UA 1XWAA 4HZ2A 1V9WA 4PQ1A 2V1MA 1GLQA 3HCZA 4KB3A 3QOUA 1HD2A 2IWTA 5ECRB 2WZ9A 4JU5A 4O92A 2B7JA 2V32A 4IJ3A 2A4VA 5FHIA 6GSYA 5ECHB 2VUPA 3HHVA 4TOPA 4KX4A 3GX0A 2LJRA 4OCFA 1B9YC 2DC5A 2C1YA 2HSHA 2JADA 3M9JA 4K0GA 1MTCA 3GFKA 5C00A 5HFIA 3H4KA 2L4QA 2J23A 3HVSA 2DJ0A 1QGVA 2REMA 1QK8A 2H19A 3TKQA 3BOAA 3HZ4A 5JWOB 5IMDA 2H1AA 4EKZA 3GSTA 3KCMA 4EXJA 4MF7A 4D73B 3LYPA 4EF0A 4GQCA 1O6JA 1V98A 1X0RA 3HKRA 5H5SA 3GHAA 4KE3A 5D9VA 1KTEA 1GP1A 1FO5A 2GDRA 4J2FA 3F8UA 3M1GA 1K3LA 1W89A 1TI3A 3P8WA 2L59A 5E4WA 3L9UA 3QDNA 4WBRD 1K0BA 3GH6A 3EU4A 4OFMA 4FO5A 2V6OA 1K0CA 3M0FA 2YP6A 4QQ7A 5LNKe 4F2IA 6GSXA 3P7XA 2VCXA 2RLIA 4WBJA 4IP6A 4K8MA 1XWKA 3LXTA 5GSTA 1SJ6A 5D9XA 1OKDA 2V41A 1FAAA 3RHCA 1SJIA 2YWNA 1Z9HA 1AIUA 4KSMA 1SD8A 3K8NA 4V2LA 3MDKA 1TKDB 1MDKA 3A2VA 4XRAA 2LJKA 4RI6A 5CRWA 2FD3A 2H1DA 2HT9A 3VURA 5ECPB 1PKZA 2C0FA 5IM9A 4IHUA 3UMAA 3TRXA 4TXVA 1TRVA 4WXTA 2L57A 1UN2A 3BCKA 2H0IA 3GYKA 2D2ZA 3ZREA 3DRNA 1THOA 3D4TA 1XVWA 2KOKA 1ABAA 1TDIA 2YZUA 4MH2A 4JEDA 3QD9A 4GF0A 2YJ7A 4TR4A 1E6BA 3TRPA 2HYXA 3F4SA 1WP0A 1YEPA 3P2AA 2LQQA 2QSIA 3BCIA 3TJKA 4HU9A 1LJRA 5D73A 5DBQA 4ZXGA 4DSSA 3D5JA 5B8BA 1ERVA 3WYWA 1QFNA 2GSRA 3W8SA 3KMOA 1GLPA 1YKCA 4ISDA 1PMTA 1Z3EA 2HI7A 1TK0B 2CVBA 3FEUA 4YQVA 4AJ7A 2HZEA 4GLTA 1Z7RA 2ES7A 4NXIA 1V58A 1TK5B 3F4RA 1JZDA 1V40A 10GSA 5D8IA 1XCCA 1A0RP 1EGOA 4F03A 3NIVA 1FW1A 5IPHA 5J41A 1SK1A 2JSZA 3VK9A 4EE0A 2OE3A 4ML6A 2DJKA 5G2ZA 5HR3A 1DSBA 3FKFA 1J9BA 4ZL7A 3SWLA 5JWRB 4IQ1A 2C80A 5CRGA 2ZNMA 1NHYA 3GRXA 3A2WA 4MF5A 2MZCA 1F37A 3ZZXA 1AXDA 2WULA 3TOTA 2C3NA 1PX7A 5DVBA 4XS4A 2KLXA 4YAPA 1OKTA 3M9KA 6GSTA 3E0UA 1MDIA 2FLSA 5KEJA 1F6MC 5ECNB 1BQ7A 1EOHA 2AB6A 3F3QA 3HYPA 5B8AA 4RUVA 4ZB6A 2VCZA 1GTBA 4N30A 1U87A 1G7EA 2F3MA 4EC0A 3RBTA 1VF4A 4WETA 3TKSA 2WS2A 3GTUB 5J4UA 3FZ4A 2IPAA 1T4YA 2DIZA 3H93A 1KEBA 3UJ1A 2HSYA 4IELA 3WT2A 1X9MB 5KN0A 2HLSA 3AY8A 1TP9A 3G7YA 1S3AA 3FZAA 22GSA 1ML6A 4MZWA 4ID0A 5GSSA 1M0UA 3ERWA 3IR4A 4WKWA 3U5RE 5LCZA 4EUYA 3L9SA 2C3TA 2H0GA 1BAYA 3C1SA 1B9XC 1O81A 4MJEA 2OACA 5DALA 1WPIA 3GKKA 4F0BA 3GH9A 1PL1A 3EURA 2GT6A 2M72A 5HFKA 1T8EB 3GMFA 2MMOA 3BBYA 3ZMKA 2AHEA 4ACSA 2F9SA 2R3XA 4KDUA 4TXOB 1IYHA 2H71A 5GAND 2K6VA 5ECMB 3E3EA 4ECBA 3M3MA 4V2MA 1R5PA 3LSZA 1OYJA 2B5YA 2IL3A 2KUCA 4MABA 2CVKA 1PRXA 3FYGA 5ELGA 2VCVA 1WMJA 4MZCA 4YQUA 3FZ5A 4FIWA 4OD7A 3O6TA 6GSWA 2LS5A 2RUFA 1GNEA 4F0CA 4I2TA 3ZMLA 6GSSA 18GSA 1U88A 1T1VA 2VL3A 3A3TA 2B5EA 4Q5FA 5F07A 4GWRA 1E2YA 3RDWA 3ZYWA 1AC1A 4K0NA 4O32A 3LWAA 4POKA 2VOCA 3LGCA 2P5RA 3A5WA 1VRSD 2H75A 2HRNA 2NTOA 2R2JA 4MCUA 1M7TA 4PUFC 5KN3A 9GSSA 2OKAA 3APOA 1U3IA 3Q6OA 2RM5A 1N8JA 3MAKA 2NPBA 3GNJA 2NBSA 1Z5YE 2WFCA 3GSSA 1U3AA 2C0EA 4TR1A 1PGTA 4Q5QA 2GSSA 3FY7A 5INYA 1VF2A 2ON7A 3NOFA 1GNWA 3MWHA 2HFDA 2B1LA 3EWLA 3QCPA 1YY7A 1XPVA 3IBHA 1TJDA 3LXZA 1FB6A 3ME8A 1ERWA 2VL9A 3CRTA 3TUEA 4IBPA 1YQ1A 4HQSA 1B48A 2H76A 5A4WA 3I6AA 2XBQA 1HQOA 5HR2A 4V1Ag 3TKSE 3RPNA 2IN3A 1PSQA 1GSSA 4EO3A 4I8BA 1ERUA 1AQXA 3GL5A 4KW6A 2N5AA 2DLXA 2GZPA 5JCUA 1ST9A 3KH7A 3QAVA 1A2JA 2QC7A 4KH7A 4LL4B 4GQFA 4JRRA 4DSSB 2EIRA 2F51A 2WGRA 4O7HA 2R4VA 2R37A 1YJ6A 1EGRA 2WJUA 3TB2A 3C73A 3UIWA 2H66A 2CV4A 1A24A 3FZ9A 2CZ3A 3L0HA 1GTAA 1SL0B 4E8HA 4PUAA 4ZB9A 1HYUA 3D22A 2K18A 1RW1A 1ERTA 2H6ZA 5F06A 4QL9A 4ZL9A 4IQAA 1SYXA 2DJ1A 4I97A 3WGXA 3US3A 4PXOA 3L9VA 3VPQA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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