4HQZA

Crystal structure of the pneumoccocal exposed lipoprotein thioredoxin sp_1000 (etrx2) from streptococcus pneumoniae strain tigr4 in complex with 2-hydroxyethyl disulfide
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
141
structure length
141
Chain Sequence
VGKDAPDFTLQSMDGKEVKLSDFKGKKVYLKFWASWCGPCKKSMPELMELAAKPDRDFEILTVIAPGIQGEKTVEQFPQWFQEQGYKDIPVLYDTKATTFQAYQIRSIPTEYLIDSQGKIGKIQFGAISNADAEAAFKEMN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Streptococcus pneumoniae
publication title Molecular architecture of Streptococcus pneumoniae surface thioredoxin-fold lipoproteins crucial for extracellular oxidative stress resistance and maintenance of virulence.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin family protein
total genus 42
structure length 141
sequence length 141
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4hqzA00
1Y25A 2X8GA 4NAXA 4GSSA 2VLTA 4MF7A 3IK9A 3ZMKA 2C4JA 2KLXA 3BJ5A 1M2AA 1XOAA 2PPTA 1SL0B 3FR3A 2H1AA 10GSA 4F0CA 1FAAA 3MNGA 2DC5A 3VLNA 3L9VA 5CREA 1VRSD 2KHPA 1G7OA 1O73A 1QK8A 4I2UA 3ERGA 3VK9A 3M1GA 2OBIA 1U3AA 5DALB 4Z7XA 4TRXA 1SJ6A 2DMLA 4OD7A 2ALBA 4AJ6A 3DD3A 2HSHA 4QL9A 4YQUA 1GSFA 2YPMA 3A2XA 3EU3A 2QGVA 4IBPA 2JZSA 1HNBA 6GSUA 3L4NA 1B4QA 4PURA 4BA7A 1EGRA 3ME8A 1EP8A 3H8QA 5ECNB 5EY6A 3F4SA 2A2SA 2RM6A 3W6GA 1GNEA 4EC0A 5ECHB 2K8SA 1JZOA 4HJ2A 1Q98A 2L4CA 1QUWA 3EINA 4KUNA 3GFKA 3IBHA 2G2QA 1AIUA 4Q5RA 3A5WA 1XXUA 3L0HA 1DE1A 1VF3A 3J7Yk 5H5SA 3C7MA 5J5NA 3TKRA 4WR5A 3HD5A 2QC7A 2F8AA 2K6VA 1YJ6A 4N0VA 1C72A 3A2VA 1SK0A 2A2RA 4X1UA 5DBQA 1NHYA 2H6YA 1RW1A 2YWIA 3HY2A 4XTSA 3IR4A 5A4WA 3QFBC 4HUAA 4FO5A 2H1BA 2AHEA 1UA5A 1O6JA 3DVWA 5IMDA 1XVWA 3UOMA 5GZZB 1KNGA 3HJMA 4OCFA 4AJ8A 2C0DA 5DQSA 5L71A 1T4ZA 5J3RA 4I97A 6GSWA 5J4UA 5HR1A 4EXJA 5D9WA 1YQ1A 1GWCA 4EO3A 3TJFA 3N5OA 1PX7A 3TCOA 4K7OA 3TOUA 2FY6A 4DEJA 5KN0A 3GKXA 1A0RP 1X9MB 5AISA 2H75A 1YEXA 3QAVA 1X5EA 2H1DA 2VD1A 3Q18A 6GSVA 2R3XA 2CA8A 3QPMA 4G10A 4F82A 3TDGA 3RPNA 1KBNA 2TRXA 2V41A 1T7PB 1QGVA 1A23A 3TRPA 2VLUA 1J9BA 2CZ2A 3F6FA 2O8VB 5AGYA 1TXXA 1V98A 5IMAA 5JCGA 3NZNA 2PUKC 1DUGA 1ZYQB 2ZUPA 4IJIA 5FT3A 1CQGA 4MA9A 4ECCA 4POBA 2LNSA 2LQQA 1XW6A 1K0OA 1Z6MA 1WMJA 1T4YA 3Q74A 1O8WA 1TOFA 4K9ZA 4NMUA 3TJGA 3EYTA 2WFCA 5ECIB 3LSZA 3QAWA 1G6YA 1JLVA 2C0FA 3IK7A 4J56E 2AUVA 1U87A 4I8BA 3G7JA 3HJPA 1SJZA 4IN0A 5G5EA 2YCDA 5D9TA 3CTGA 4FYCA 4LMWA 2K18A 1OC8A 5ENUA 3PH9A 3ZLPA 1WWJA 1AC1A 1ZL9A 3TRXA 4NV5A 2IPAA 3ED3A 4LMVA 4IP1A 1B9XC 4HQZA 1EV9A 1TU7A 1EP7A 5IMFA 1XZOA 3TKQA 1Q4JA 2XPEA 5IMZA 2VL2A 5ECOB 2LJAA 1XWGA 3GSTA 1BAYA 4HJMA 4WETA 2VL3A 1EOHA 2PWJA 3DXBA 1YKAA 3FZAA 4ECJA 3KM6A 2HFDA 4K7IA 1WPIA 5F07A 3IC4A 4TR0A 5AIVA 2LNTA 12GSA 3WT2A 4K0GA 2OKAA 3RAZA 1TK5B 1XFLA 3P8WA 4N0ZA 4IP6A 4YH2A 3ZMLA 3D6IA 4GSNA 4H86A 1NM3A 5A4VA 4NWYA 2LQOA 3WGXA 2KOKA 4MJCA 1EGOA 1HQOA 1K0DA 2J23A 2VM2A 4ZB9A 2R2JA 4FYBA 4V2MA 5CP1A 1YEPA 1GSUA 1R5PA 3DWVA 1SKSB 5ID2A 5DAKA 4ZB8A 2DJKA 2FGXA 2LUSA 3GA4A 3LXZA 3C73A 1JLWA 5HFIA 2P0GA 5IIZA 3CRTA 3KXOA 4CHSA 2E7PA 1K3OA 4XS6A 2FLSA 2IMFA 3IAM2 1OE8A 2DLXA 2N5BA 2JL4A 5ELAA 1TDIA 4X0XA 1WP0A 1KTEA 2H30A 4HI7A 2WJUA 4JBBA 2VAFA 3M8NA 1FO5A 2CT6A 4RUVA 2GTUA 2GQKA 1K0AA 2LSTA 5F8BA 1WIKA 3VI5A 3M3MA 1YDKA 1Z7RA 2GSRA 5GAPD 1PL1A 1B48A 3FHKA 4OCEA 4XRDA 1K0MA 1XWBA 1HD2A 1JZRA 4O32A 3UBLA 2H0IA 2VCTA 3D0ZA 4TR1B 2GS3A 1GTUA 3CRUA 1ML6A 3M9JA 1AXDA 2FWGA 2FA4A 4KE3A 2C0EA 1SKWB 2DJ3A 3CBUA 2V2GA 5B7CA 4MPFA 2H72A 5LNKe 3M0FA 4KNDA 1R4WA 1LJRA 1K3LA 4HQSA 4KA0A 5LCZA 2I81A 2VUPA 3EMXA 3HA9A 3ERFA 1V58A 3BBYA 3PINA 1GTIA 2V1MA 2H6XA 3IV4A 4G9HA 1OKTA 4JEDA 4ILFA 1PL2A 3N9JA 1PSQA 1GSSA 3I69A 3EMPA 1Z7PA 1PRXA 2M46A 5CYYA 3MAKA 2H01A 3EURA 1OC3A 2B1LA 3FK8A 1SENA 1K0CA 5KN1A 2GZYA 2OA7A 1NHOA 1JHBA 2C8UA 5C04A 3F9UA 3M9KA 3ZITA 1S3DA 1GLQA 2OE1A 4WR4A 4KCEA 1R26A 2OACA 4RI7A 3KZQA 2NPBA 5G30A 4ZL7A 5EL8A 2WRTA 3LG6A 4I6XA 4BPYA 4GQFA 4ID0A 4MJEA 5ECRB 3P7XA 5ECLB 3GMFA 3IXRA 1ST9A 1THOA 1O8XA 2PERA 3TKPA 1XWCA 3KEBA 2E2MA 6GSSA 3QMXA 1OC9A 5ABRA 1X9SB 2HT9A 3VWVA 2RM5A 5ECSA 2FCHA 2H73A 2IFQB 2TRCP 2RLIA 2GSSA 2GT5A 4DSQA 3W8JA 1PA3A 2JZTA 1U3IA 2PU9C 2B5XA 2H71A 4JR4A 1ERWA 4EDYA 1MTCA 4FYUA 2JU5A 4ZL8A 4MF6A 4MZCA 1GUHA 2HLSA 2P5RA 4QL7A 4V2LA 1RQMA 4KDUA 5JCWA 2IL3A 3GSSA 1GLPA 2EIOA 4ZILA 4HOJA 3ZYWA 5HR2A 3CXGA 2JZRA 4OFTA 1W4VA 4E8HA 2N5FA 4KX4A 4MZWA 2H70A 4Q5FA 2PVOC 3CMIA 1BG5A 2FA8A 3GX8A 6GSTA 3C1RA 3KTLA 3LWAA 1XCCA 2C3QA 5IQYA 3V1WA 2VCQA 2H0HA 1G0TA 5A4UA 4L5LA 1MEKA 3IA1A 3EE2A 3P2AA 3FEUA 4RQRA 2AV4A 4Q5NA 4KDYA 2QSIA 1I9DA 3KH9A 4OMVA 3KP9A 5GSTA 1FB0A 4D73A 4ZB6A 2V32A 3UARA 1PMTA 1X0RA 5F06A 1FHEA 2XC2A 2JADA 1N8JA 2CVDA 1TRSA 2YZUA 1F37A 2E2GA 4PGTA 5INYA 3K8NA 1SD8A 4ML6A 1LBKA 2CX4A 5D9VA 1A2JA 2MYGA 4TR4A 2MMAA 3O76A 2H8LA 1DSBA 1GSDA 4J2FA 1CQHA 1PKZA 3HKRA 4XHMA 1NW2A 5JWOB 4K6XA 1S3CA 2VL2C 1IYIA 2IMIA 1Z3EA 1GSYA 1ABAA 4WEYA 1OYJA 1ON4A 1MDKA 3U5RE 3ZFLA 1YZXA 2FWEA 4LLRA 4ZL9A 1GL8A 2B1KA 2F9SA 5D9XA 3ZIJA 1R5AA 3O6TA 4LL4B 3ME7A 3GIXA 4F9ZA 1ZCPA 3HVXA 3MSZA 3DYRA 3HVSA 1TJDA 3VWWA 5DQYA 4XS4B 3L9SA 3RDWA 1XBSA 1QQ2A 1SL2B 1MDIA 1G7EA 2JACA 1A2MA 1GULA 4WXTA 3DIEA 2VIMA 3IPZA 5AN1A 4ACSA 17GSA 4MMMA 2WCIA 2GSQA 1V40A 2OE0A 4WBRD 3WYWA 4POMA 1ILOA 3IE3A 1PKWA 4YAVA 3GYKA 2OE3A 4K1FA 2A4VA 3FY7A 1XW5A 2FWFA 2DBCA 1TKDB 1N2AA 1UN2A 4K0NA 2FWHA 4KSOA 3LJRA 2KP1A 3HHVA 3RBTA 1S3AA 2YOIA 5DALA 3VPQA 5HR0A 4IW9A 3UIWA 2YV9A 13GSA 3DGQA 3G7IA 2I9HA 5G1LA 2XBIA 2EIRA 1GRXA 2XPDA 1SD9A 4K7NA 3ZFBA 1A2LA 1TI1A 3UEMA 2GQMA 4TKYA 1E6BA 3AY8A 2REMA 3ZTLA 5ECMB 2MMNA 4KAEA 3TOTA 2X8HA 3UMAA 2K8VA 2YJHA 1TRUA 1EZKA 2HI7A 3KGKA 1F3BA 4GRFA 4GWRA 3W8SA 4HDEA 2FHEA 3G9BA 1Y6EA 2PMTA 3VWXA 3GL5A 3KTBA 5GAND 3GKNA 3CTFA 3QFAC 2R4VA 4MCUA 1URMA 5DJMA 2DJ0A 5D96A 4EL1A 4HZ2A 1MDJA 3NIVA 4ZIJA 5J9BA 5CRDA 4CDOA 2F8FA 4KW6A 4OO5A 4EVMA 2E0QA 2AAWA 1BX9A 4HU9A 3BCIA 1THXA 3C1SA 1GSEA 3VURA 1TI3A 2RIIA 2B5EA 4PXOA 3ZREA 3SBCA 2O87A 5IOXA 11GSA 2GZZA 4GCIA 3OR5A 4CW9A 1VF2A 2GDRA 1EV4A 2IWTA 2WZ9A 3FW2A 4EKZA 3HXSA 2HZFA 3QDNA 4MJBA 3GH6A 2B5YA 1U88A 5COHA 2YWNA 3GTUB 5GSSA 1PQNA 3RPPA 3UL3A 4OO4A 1OE7A 4I2TA 1Z6NA 1M7TA 4MK3A 2YWMA 1TRWA 2ZNMA 1USBA 1XW9A 3VWUA 1G6WA 5CRHA 4Q5QA 2B3SA 1X9WB 4HU7A 1M9AA 3HDCA 3APQA 2H19A 4J57E 3KMOA 3GKKA 3ZRDA 3HYPA 2IMEA 5IMCA 2HRFA 2J9HA 2CQ9A 2ON5A 2AJQB 3TJKA 3QR6A 2MMOA 2IIYA 1T00A 4DVCA 5IMVA 3F63A 5B6MA 2VM1A 3ERWA 5B8BA 2BTOT 2H6ZA 1AAZA 3I43A 4HS1A 3UVTA 2ON7A 4O5RA 3UAPA 4PUFC 2YN1A 4FIWA 4NHZA 1VF4A 2GZPA 2L5OA 4WF4A 3TGZA 3VPTA 2F51A 4MP4A 1YKCA 2BJXA 2GVPA 2WULA 4TW5A 1JZDA 2FD3A 3H79A 1W89A 1B4PA 2YP6A 1GUKA 3GRXA 3IOSA 4N30A 1V57A 3GL3A 4O7HA 5KN3A 1K0NA 2MBSA 1QMVA 2LTKA 3D22A 3E9JB 2IN3A 1VF1A 3LYKA 8GSSA 3WGDA 4EUYA 2CZ3A 2ZCTA 3GHAA 2B7JA 3WGEA 5HR3A 1PN9A 5AIXA 2NDOA 1F6MC 2V6KA 2R6KA 3KMNA 5H5RA 1AQVA 2FUG2 3QAGA 5DVBA 3S9FA 4GQCA 2HZEB 2OJLA 5JWRB 1WOUA 3NOFA 2YV7A 3TKSA 1K0BA 5HQPA 3KP8A 3F3RA 3LXTA 2O7KA 1SYXA 1WJKA 1HNAA 5G31A 1X5DA 4PNGA 1XWKA 4POKA 3VFIA 1TK8B 2RUFA 3BOAA 1AUCA 3IAS2 1M0UA 4ZBDA 4EDZA 4N10A 5DJLA 18GSA 1Z9HA 5G2ZA 3FKFA 3D4TA 1B9YC 1PX6A 3HVVA 4XIHA 3QOUA 5E4WA 2L4QA 4K8MA 4YQMA 4XRAA 4IQ1A 1UVZA 1BYEA 4EF0A 1YF1A 3EU4A 3MDKA 4WBJA 2VCXA 4PUAA 1H4OA 1PGTA 2WB9A 3LORA 1TW9A 3VI7A 2CV4A 2JSYA 4IGJA 5CNWA 4V1Ap 2MZCA 3EWLA 2Z9SA 4NXIA 5DDLA 5CAXA 2EIQA 5D93A 1Z5YE 1ACVA 2CVKA 3SWLA 3LYPA 1I5GA 1AQXA 4ML1A 1SK1A 4FH8A 4G2EA 1TTZA 4ULXA 3D4MA 4GLTA 4HZ4A 1V2AA 2IJYA 4P3YB 2WGRA 3H93A 1AQWA 3F3QA 4YAPA 2O85A 3PGTA 4IS0A 2MBTA 2KUCA 2YJ7A 3FRCA 4QQ7A 2H74A 2C0GA 4V1Ag 2P31A 1SYRA 5EPFA 4TR1A 2CVBA 4PX1A 1MD3A 2LKUA 3ZVJD 1SKRB 3C71A 4I5QA 5E59A 1O85A 3IRAA 1J0FA 1HYUA 2VCVA 1WRYA 5G5FA 3L9UA 3F4RA 2VL9A 1JZWA 4XCSA 1YY7A 3LGCA 6GSYA 2HE3A 5FHIA 2D2ZA 4EE0A 2VO4A 5B6NA 3BCKA 2GT6A 3H1NA 4KCAA 1AW9A 3GKMA 4BWSA 3L78A 4L5OA 5CRGA 1KEBA 5DCHA 2LJKA 3GURA 4V2NA 4OFNA 1F3AA 2G0FA 1GTBA 2LRTA 4TXVA 2DJ2A 2CX3A 4E8EA 5KN2A 3BD2A 3KH7A 2C1YA 2CAQA 2H66A 4JU5A 4MLYA 3ZVJA 1M2DA 1RK4A 3E3EA 3FR6A 1M2BA 2HZEA 3MWHA 4RI6A 3Q6OA 1TRVA 2EC4A 5JCUA 4IJ3A 2PGTA 2GGTA 3US3A 1XIYA 1ZMAA 4IHUA 3RHBA 4L8EA 1PD21 1ZZYA 22GSA 4PQ1A 5IPGA 4MF5A 3UJ1A 2LJRA 5ID2B 1FB6A 2N5AA 4IKHA 5DAKB 3EC3A 2YANA 3QCPA 5HFKA 1FVJA 2V6OA 2IFQA 4GXZA 5D73A 4OWYA 1SL1B 2QKEA 1GSQA 1QXHA 2YWOA 3UBKA 1FOVA 2X99A 3FR9A 2O89A 4KSMA 2HRNA 7GSSA 3GH9A 4KB3A 1B8XA 1MD4A 2DMMA 3DEXA 4POLA 5B8AA 2OADA 2C3TA 4AJ7A 3KIJA 5IO0A 2OBKA 3PR8A 5ECPB 5CRWA 4DSSB 5IOWA 3IHQA 5D8IA 1NSWA 4NPBA 1O81A 4L0UA 5C00A 1XVQA 1GNWA 4N11A 3U6VA 2WS2A 3TRQA 1YF0A 3ZZXA 2P5QA 4MDCA 4AGSA 5A5KA 5F05A 1O7UA 1V9WA 1XWAA 2DJ1A 1XOBA 2L5LA 1E2YA 2R37A 3CSJA 3R2QA 4TXOB 1ERVA 2GSTA 3D5JA 2YZHA 1EEMA 2HNLA 3TUEA 2RUEA 2DIYA 4BVXA 3A3TA 4TVEA 2DJJA 1IYHA 5IPHA 3GX0A 2JSZA 2FNOA 3F6DA 2PBJA 3F4TA 3HZ4A 4MPGA 2K9FA 2H0GA 4ECIA 1M99A 2LEGA 2LS5A 3GN3A 1A8LA 4TR3A 3ZL5A 4WKWA 5KEJA 1GUMA 4NHWA 3GV1A 2TIRA 1X5CA 4IVFA 4PQIA 4F0BA 2R5GA 1XPVA 5H5QA 1UC7A 2DSAA 2PVQA 2C3NA 3WD6A 2MMZA 1T3BA 3ZIVA 2LRNA 2NVLA 4JRRA 1ZGNA 1JFUA 1SJIA 4PNFA 1DBYA 4F03A 1ZOFA 4MH3A 2VLVA 2GLRA 5CO3A 4MABA 3HZ8A 1BQ7A 3F0IA 1J08A 4YQVA 3E0UA 1M9BA 2C80A 1GP1A 4JZQA 1OC9B 3TKSC 3TJJA 3P90A 1TP9A 1A8YA 5F0GA 2CAIA 4GF0A 4ZBAA 4HEA2 4L0WA 1GTAA 4ISDA 2I1UA 3DRNA 4MZBA 2L6DA 3D21A 4MJAA 3UVHA 4GTUA 4X43A 3APSA 1ERUA 2KP2A 4DSRA 1SU9A 2GQLA 4NV2A 4XS4A 2VD0A 4KGIA 6GSXA 1DE2A 4IELA 2DIZA 1WE0A 3APOA 2I4AA 2H76A 3FZ4A 4TN8A 5EVOA 1TU8A 5G1KA 3TB2A 4BL7A 1QFNA 4ZBBA 2M72A 2VOCA 2YNXA 3CSHA 2B7KA 1K3YA 4ZXGA 2AYTA 3TJBA 4BWQA 1EOGA 2L57A 3J7Yb 3FZ5A 3LQ7A 1A24A 3JCML 2B6MA 4K2DA 16GSA 2X8CA 2VCWA 9GSSA 4DSSA 5LD0A 1U6TA 1OAZA 4O92A 3I9V2 3RHCA 2I3YA 3KCMA 4JR6A 5HFGA 2X64A 1BEDA 2NBSA 1VGLA 4WF5A 4LA1A 4ECBA 1SK2A 1FVKA 5JWQB 4IQAA 3O3TA 4F2IA 3FZ9A 3LFLA 5ECKB 4MH2A 2L59A 3WT1A 4D73B 4TXOA 3KJYA 4PQHA 4XS1A 1HNCA 3CYNA 5J9CA 2HYXA 3GUSA 1EEJA 3ISOA 1T1VA 4AF2A 2IMKA 3H4KA 1TK0B 1OKDA 1A0FA 3A2WA 3I6AA 4GSTA 2LRCA 2ES7A 3KD0A 4JE1A 1EWXA 1BJXA 2L6CA 3HJOA 3IDVA 4OFMA 3HCZA 1GH2A 1H75A 3C8EA 2PN8A 3DKSA 4LL1B 1R7HA 2H1GA 1F2EA 3Q19A 3DVXA 19GSA 1OVNA 5IO2A 5FWGA 5IM9A 4KDXA 1F9MA 2F3MA 5DCGA 5ECQB 3TKSE 3G7YA 3CSIA 2HXKA 1ZYEA 1FW1A 2NTOA 2M80A 1FG4A 3DMLA 5J41A 3LEFA 2BMXA 2XHFA 3FYGA 3QD9A 2AB6A 3EVIA 2VCZA 3F8UA 4G19A 14GSA 1ERTA 20GSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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