2BMXA

Mycobacterium tuberculosis ahpc
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
169
structure length
169
Chain Sequence
PLLTIGDQFPAYQLTALIGGDLSKVDAKQPGDYFTTITSDEHPGKWRVVFFWPKDFTFVCPTEIAAFSKLNDEFEDRDAQILGVSIDSEFAHFQWRAQHNDLKTLPFPMLSDIKRELSQAAGVLNADGVADRVTFIVDPNNEIQFVSATAGSVGRNVDEVLRVLDALQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords ALKYL HYDROPEROXIDASE C
publication title Structure and Mechanism of the Alkyl Hydroperoxidase Ahpc, a Key Element of the Mycobacterium Tuberculosis Defense System Against Oxidative Stress.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule tags Oxidoreductase
total genus 46
structure length 169
sequence length 169
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2005-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2bmxA00
2PUKC 3ZL5A 3EVIA 3UEMA 2HZEB 2NPBA 4D73B 2ES7A 3GH6A 1TK0B 1TXXA 4GTUA 3PR8A 4G9HA 1M0UA 1TI1A 3UBKA 2H66A 2L4CA 3GX0A 2J9HA 1BG5A 4GRFA 2FD3A 2R6KA 6GSWA 3D5JA 1CQGA 1U3AA 5ECQB 2WFCA 4O5RA 2C80A 4IP6A 1H4OA 4MABA 5D9WA 4POLA 1VF3A 2VAFA 4MP4A 3WGDA 3GKXA 2H0IA 5B7CA 2YPMA 2WB9A 3ED3A 4QL9A 4MJEA 3G7IA 5G5FA 4ECCA 4MZBA 4J2FA 4MPGA 1ZYQB 6GSUA 2WRTA 5LCZA 5ECRB 3HHVA 5KN3A 2JADA 2DIYA 3LYKA 1XPVA 5F07A 1X9MB 1DSBA 3IRAA 4BVXA 1GTBA 1SU9A 3A2WA 12GSA 5J5NA 4ECJA 1XXUA 3KCMA 4IP1A 3D0ZA 4PUAA 3LORA 4WBRD 3Q18A 4TKYA 4DSRA 3DRNA 1JZWA 1SK0A 3HKRA 2JSYA 2ON7A 1Z5YE 5HFGA 3LFLA 1JHBA 4JRRA 5JWQB 5IMCA 4MH2A 4WKWA 3IHQA 1TK8B 3TKRA 4RI7A 2C0EA 3GKKA 3CSHA 2FWHA 3EU3A 4IQ1A 4XHMA 3AY8A 3H4KA 2OE1A 4ILFA 2EIOA 1PN9A 4YAVA 2H30A 3M9KA 2RUFA 1SL1B 2HNLA 1A23A 5ECOB 3IK9A 3ZYWA 3TOTA 1GSFA 4DEJA 3DD3A 5H5RA 1HNAA 2MBTA 5ELAA 2VO4A 3DMLA 1HNCA 2D2ZA 1DUGA 2FWFA 1XWBA 4GLTA 1XIYA 1XWAA 2WZ9A 2VLUA 4POBA 2K9FA 2K6VA 2K8VA 2VOCA 2CZ2A 1R4WA 1ZYEA 1M2BA 1K0AA 4IBPA 2PBJA 4WR4A 3VPQA 3TDGA 4KDUA 4LL1B 2RLIA 2B1KA 2FA8A 1S3AA 3ERGA 1OC9B 4Q5RA 3APOA 4DVCA 1E6BA 4BA7A 2KUCA 3QD9A 2B3SA 2PN8A 1ERUA 4XIHA 3FZ9A 2CT6A 4AGSA 2DC5A 4IN0A 2F3MA 2MMNA 3EWLA 2VUPA 2MZCA 5H5QA 1LJRA 3TKQA 3IBHA 5G1KA 4KA0A 3ZVJD 1GSSA 3L0HA 1VF2A 4HJMA 3M9JA 4N30A 3LYPA 2L6DA 4ZBBA 4GF0A 2QKEA 4MK3A 4MDCA 1EP7A 4HZ4A 2H75A 2LRCA 2PPTA 2LNSA 2DMMA 4XS4B 1VF1A 3FY7A 1T3BA 1ILOA 3LEFA 3EMPA 3LG6A 3BJ5A 1X5CA 5IPGA 1XVWA 3TOUA 3LGCA 4L0UA 5HQPA 4TRXA 2FNOA 4ACSA 2VL3A 1PKWA 4EUYA 4OO4A 2DJJA 11GSA 1GL8A 3DVWA 3TKSA 2C0DA 4MF5A 2H74A 2VCTA 2FGXA 4TR1A 1O8WA 3CBUA 4NHWA 4K6XA 3OR5A 1TU8A 2YOIA 4HZ2A 5ECMB 3TRPA 2MBSA 1GNEA 5CYYA 2OJLA 2PVOC 4NV5A 2R4VA 5EPFA 1XW5A 5FT3A 2IFQA 3VK9A 1PX7A 3BOAA 3A3TA 1F3BA 3CXGA 1SD8A 3W8SA 4KE3A 5G2ZA 1ERVA 1YF0A 3F4TA 3F6DA 2IPAA 4I97A 2V32A 1GULA 3UMAA 2DJKA 4N0VA 1K0DA 4JU5A 4Q5FA 2K8SA 1XWGA 3UOMA 2XHFA 4BWSA 2ALBA 1SJIA 3WGEA 4HOJA 3TKSE 4MF7A 3UJ1A 3IPZA 2LJRA 2B5YA 3UIWA 1EOGA 2HI7A 4ZIJA 1WPIA 5JWOB 4FYCA 1M2DA 2B1LA 4K8MA 2YCDA 2VCZA 4EXJA 3KMNA 4ML6A 2AHEA 1GUHA 2CAIA 1THOA 2OKAA 2BJXA 2VD1A 1PL1A 4CDOA 3RHCA 2G0FA 3EINA 4NV2A 1OE8A 2PVQA 4EVMA 3ZTLA 2O89A 3F63A 2VCXA 5J9BA 4ZXGA 2VCWA 5H5SA 1EP8A 1T8EB 4I8BA 3ZLPA 4NAXA 1U6TA 3Q74A 5J9CA 3TB2A 5EL8A 1GLQA 3C1SA 3U5RE 17GSA 4E8EA 1J0FA 3I9V2 4HU9A 5B6NA 1N8JA 4MJBA 6GSSA 4GQFA 1GUMA 4L8EA 5ECPB 4K0NA 1F2EA 5DJMA 2DIZA 2LQOA 5FHIA 1NHYA 4OFMA 1YEXA 4GSTA 5B8AA 2AAWA 1RQMA 4PNGA 2XBIA 1SK2A 2C1YA 3IE3A 2HZFA 4XRDA 2LV3A 3L4NA 1YEPA 2O7KA 2WDUA 2DJ3A 1AUCA 6GSYA 1ZOFA 4TN8A 1GTUA 2WCIA 4CHSA 4X43A 5IMDA 3L9VA 3FR6A 1V57A 2WJUA 1WP0A 3ERFA 4ISDA 1SYRA 2DLXA 5J41A 3GX8A 4IJ3A 3UARA 3FR3A 1EGOA 3NOFA 3HVVA 3N9JA 4KB3A 3P7XA 1JFUA 1J9BA 3F8UA 3QOUA 3RPNA 1DBYA 2B5XA 4Q5QA 4ZB8A 5IIZA 4IQAA 3D4MA 2R2JA 4V2NA 3F4RA 1GSEA 1URMA 4O7HA 3ZITA 2VL2A 3TKPA 1GRXA 1K3LA 2N5AA 5GZZB 1FB6A 3HA9A 3W6GA 1F9MA 3HJOA 5IO2A 1F37A 3L9SA 2OACA 1UA5A 3TKSC 1DE2A 1UVZA 3GRXA 3O76A 1CQHA 4HQSA 4F0CA 1HQOA 4HUAA 2FCHA 3D21A 1XW9A 1V2AA 5JCGA 1XWCA 1A0FA 2IMKA 2YJ7A 2GSRA 4JBBA 1K0MA 5DVBA 4LMWA 4IVFA 2JZSA 5DCHA 2L5OA 3LSZA 4V2MA 4ECIA 3C71A 2Z9SA 5EVOA 3C7MA 2LRTA 1NW2A 3C1RA 2HRNA 3QDNA 4NMUA 1PX6A 2E2GA 4ULXA 3V1WA 3DXBA 3FZAA 3F9UA 4K1FA 4V2LA 2DJ2A 3IDVA 3LXZA 4Q5NA 4NXIA 4HU7A 2VD0A 4TXVA 1QMVA 5DALB 5CRGA 5C04A 5G31A 3R2QA 5CNWA 1Z7PA 1ZMAA 4IW9A 1FAAA 3QFBC 2GQLA 3D6IA 5B8BA 1VF4A 2CV4A 4TXOB 4XRAA 3GKNA 1JLWA 3HD5A 4FH8A 1ML6A 1AAZA 3KGKA 4I5QA 1A24A 1TRVA 5DJLA 1M9AA 3WD6A 1SKRB 3IR4A 1VGLA 13GSA 4ZB9A 2DBCA 1SYXA 4WF5A 4K7IA 1FB0A 2DJ1A 1FHEA 2VCVA 1PRXA 3I69A 2AB6A 3TJKA 2MYGA 1H75A 4KDXA 1O73A 2KLXA 2H6YA 3DKSA 2F8AA 1QQ2A 5CO3A 3GL3A 1ERWA 5D9XA 1ST9A 4KGIA 5JCUA 4IHUA 3QCPA 2XPDA 3EU4A 2JZTA 4J57E 1K3YA 1Z6MA 4ZBAA 4EL1A 4KDYA 4MLYA 1G7OA 2JZRA 1BJXA 3KXOA 1ABAA 3M8NA 5INYA 2P5RA 1Q4JA 4HS1A 4MJCA 1K0CA 5KEJA 1WOUA 2GVPA 4JZQA 3ERWA 3IOSA 5AN1A 5IO0A 2I81A 2KHPA 4L0WA 4ID0A 2FWEA 3QAWA 3L78A 2M80A 3PH9A 2CAQA 4I6XA 3UL3A 3KD0A 5J3RA 4KSOA 3LWAA 1XCCA 18GSA 5AIVA 1S3DA 1XVQA 3ZFBA 3IK7A 1IYIA 1SL2B 4KSMA 4H86A 4NWYA 22GSA 2I1UA 3TJJA 1GUKA 3U6VA 3VWWA 2AJQB 5IMFA 3FRCA 4RQRA 4PURA 2VLVA 1OAZA 4BVYA 2H71A 5EY6A 5HR1A 3DIEA 1YKAA 2VL2C 3GNJA 1TP9A 1ZGNA 2QC7A 4XS6A 2L59A 2QGVA 2IWTA 5AISA 5GSSA 1ZL9A 2JACA 4TR3A 3KJYA 5A4VA 2N5FA 3ISOA 1EOHA 4EE0A 1AQXA 1A8YA 4HEA2 4J56E 3Q19A 16GSA 1XOAA 2E0QA 1W89A 2V1MA 2CX4A 2H72A 2PERA 2L57A 5A4UA 4BPYA 1KEBA 2P31A 4K7OA 7GSSA 3APSA 1GSUA 14GSA 4DSSB 3G7JA 4KH7A 5IMZA 3EC3A 4X0XA 1UC7A 2OE0A 5GAPD 1A2LA 5ID2A 9GSSA 1ACVA 3SBCA 1RW1A 1Q98A 3P2AA 3US3A 6GSTA 1A2JA 2ZNMA 1YY7A 3TCOA 3C73A 1VRSD 2GSSA 3ZIJA 3WGXA 4IS0A 3HVSA 2VM2A 4JR6A 5DAKB 4MPFA 2A2RA 5CREA 5DCGA 4L5LA 4I2TA 1I5GA 2X64A 3BCKA 3ZZXA 2F9SA 4KCAA 2YWNA 3F3QA 4HQZA 2LTKA 4N0ZA 2PU9C 4NPBA 4HI7A 5G1LA 4YQUA 2C3TA 2HZEA 1BEDA 3GTUB 1T4ZA 2BMXA 4D73A 3QAGA 1G0TA 3WT1A 3EURA 1MEKA 1EV9A 2R37A 1RK4A 3QAVA 4FIWA 4MH3A 5ECIB 1THXA 6GSXA 5ECKB 2A4VA 4ECBA 5ECNB 4PX1A 4G19A 1GNWA 4GSSA 2YANA 4TVEA 1GLPA 3E0UA 1GSQA 1NM3A 2FY6A 4PUFC 3O6TA 5JCWA 1TU7A 5J4UA 1R26A 1T4YA 3TJGA 2CQ9A 4LA1A 1HYUA 2IMIA 3CRTA 2G2QA 5CP1A 3VFIA 5ECHB 3GIXA 2F8FA 3LQ7A 4IELA 2X8CA 3BBYA 2H1DA 1XFLA 2X99A 1FVJA 4AF2A 2LQQA 3TGZA 2XBQA 2TRCP 3RDWA 1PQNA 5IQYA 1G7EA 3CMIA 2B6MA 5L71A 3HJPA 5C00A 2B5EA 1TKDB 3F4SA 3UVHA 2OA7A 2L5LA 3GKMA 5AGYA 4OCEA 3FK8A 3D4TA 2LEGA 3A2VA 2H1BA 2HSYA 2H0HA 2GGTA 3FHKA 2GS3A 3SWLA 5F8BA 4F03A 1LBKA 4N10A 5D73A 3VI7A 4GQCA 1SL0B 1X0RA 2LS5A 1WE0A 1YKCA 4CW9A 2REMA 4WBJA 2AYTA 5F06A 2NBSA 5ECLB 3IAS2 2FLSA 1JZOA 4GSNA 2ZUPA 3MNGA 4AJ7A 3TRQA 1SKWB 2L6CA 4XTSA 1FVKA 3GN3A 4FYUA 2RM6A 3ZIVA 2IMEA 2E2MA 4MF6A 5G30A 3GH9A 2MMOA 1AQVA 2O87A 2AUVA 2YWOA 3LJRA 2C3NA 5D93A 4POMA 5HR3A 3DWVA 4AJ6A 2JSZA 4KX4A 1AW9A 1XZOA 4TW5A 4OO5A 4ML1A 3EE2A 3RBTA 2GT5A 4ZL8A 2H6ZA 3TJBA 1WRYA 4WXTA 2JU5A 1KBNA 1OC9A 3BCIA 4ZBDA 1I9DA 2C3QA 5ELGA 1O7UA 2YJHA 3TJFA 1TK5B 3E3EA 5DBQA 3PINA 1KTEA 1T1VA 3HZ4A 4L5OA 2A2SA 3APQA 3HVXA 5IOXA 4JEDA 5A5KA 3M0FA 2V6KA 1PKZA 3KP9A 4GWRA 5CRDA 1FW1A 1A0RP 1ZCPA 3HXSA 1PL2A 1B4PA 1XOBA 1MDIA 1K3OA 1UN2A 4FO5A 4AJ8A 1WMJA 3IV4A 5IMAA 5E4WA 4YQVA 3GV1A 1ERTA 1Z3EA 4XS4A 5HR0A 1M7TA 3DEXA 2YNXA 2X8HA 4MMMA 2KP1A 4MCUA 2V6OA 3GSSA 3GHAA 3QMXA 1PGTA 4P3YB 4K0GA 2B7KA 4MA9A 1ZZYA 2OADA 4TR4A 4IKHA 1T00A 4IJIA 4K2DA 4TR1B 2M46A 4RI6A 4X1UA 1SK1A 4LMVA 3BD2A 1TOFA 1XBSA 3GYKA 3H79A 2NVLA 2GDRA 2CVKA 1TW9A 3J7Yk 2MMAA 4XCSA 2IFQB 1QXHA 2LJKA 3CRUA 5IMVA 4OMVA 3C8EA 3GL5A 4I2UA 2C4JA 2GT6A 1N2AA 2V2GA 2XPEA 3MDKA 1GWCA 3VWVA 2PWJA 3GTUA 2DJ0A 4ZL9A 2H1AA 3RPPA 4F9ZA 1QUWA 5G5EA 3GSTA 3ZRDA 2ZCTA 4FYBA 1AXDA 4KNDA 3DYRA 1OE7A 3HY2A 3FKFA 4TR0A 4BWQA 2RM5A 2WULA 3UBLA 1TRUA 5A4WA 2EIQA 3ME7A 1K0NA 1V58A 1AIUA 2NDOA 3KIJA 1SENA 1X5EA 20GSA 2NTOA 2YZHA 2BTOT 3GA4A 2AV4A 2PMTA 5IPHA 3S9FA 3KH7A 3W8JA 5LD0A 2VL9A 3KM6A 1FOVA 1X9WB 2HFDA 1O8XA 1X5DA 2GQMA 3ZFLA 1MDKA 1QGVA 1T7PB 3EYTA 2O8VB 2RIIA 3VLNA 2YV7A 4RUVA 5ECSA 4EDZA 1B9YC 4OCFA 4PGTA 2ON5A 1V40A 3UVTA 3EMXA 3UAPA 2LRNA 1R7HA 3G9BA 4KCEA 1OYJA 4MZWA 1BX9A 2YZUA 1B9XC 5KN0A 1AQWA 1OC3A 1OC8A 1ON4A 2FUG2 1OKTA 4RQXA 4IGJA 2IN3A 1JLVA 3J7Yb 4WEYA 6GSVA 1EEJA 4LL4B 5JWRB 1G6WA 5COHA 2LKUA 4QQ7A 2YWIA 2WS2A 2VIMA 3F6FA 1GTIA 1EGRA 1C72A 1SD9A 3N5OA 1YZXA 4E8HA 1JZRA 4V1Ag 3CTGA 1G6YA 3FR9A 1EEMA 1HNBA 1Z7RA 5HFIA 5GAND 3DGQA 2IMFA 3HJMA 3M1GA 4ZB6A 1HD2A 2H01A 3GURA 3ZMKA 3GUSA 1TDIA 1J08A 1U3IA 1Z9HA 3ZMLA 4G2EA 3ZREA 2H8LA 3CSIA 2JL4A 2HYXA 3QPMA 1NHOA 2CVBA 3VI5A 1K0OA 3IAM2 1AC1A 2HRFA 2LSTA 3NZNA 2C8UA 2H19A 4MJAA 5KN2A 2HSHA 2E7PA 5ABRA 1GP1A 1O85A 5DQSA 2YV9A 1S3CA 2IIYA 3K8NA 1M99A 3FEUA 2CZ3A 1M2AA 4G10A 5HFKA 2P5QA 2IMDA 1EZKA 3WT2A 4LLRA 2KP2A 3IC4A 1IYHA 3HYPA 4PXOA 2XC2A 1O81A 1BQ7A 1Z6NA 1BAYA 4TOPA 3VWUA 1LU4A 4HJ2A 2I9HA 4BL7A 2HLSA 1MD4A 1QFNA 1MTCA 2B7JA 2CVDA 4OD7A 3KH9A 1USBA 3LXTA 2DMLA 4N11A 3D22A 1V9WA 3NIVA 1GH2A 3P8WA 1B8XA 3M3MA 3CSJA 4DSQA 3JCML 3CTFA 3HDCA 1E2YA 5CAXA 2K18A 3RHBA 3KEBA 1U88A 4XS1A 1OVNA 4HDEA 2H6XA 5DALA 3QR6A 5KN1A 1OKDA 4F0BA 4OFNA 2C0FA 1WJKA 1F3AA 1EWXA 5F0GA 2FWGA 2GLRA 2HXKA 2GZPA 3TRXA 2OBKA 3A2XA 4TXOA 1TTZA 2VCQA 3FZ5A 4JR4A 3ME8A 4F82A 4EKZA 5D96A 3IA1A 2GTUA 3L9UA 1R5PA 4GXZA 1NSWA 2F51A 8GSSA 1PA3A 3I6AA 3ZVJA 1FG4A 1MD3A 3HCZA 4NHZA 2GSTA 3VPTA 1WWJA 1Y25A 2R5GA 1TJDA 2TIRA 5IOWA 1YDKA 3Q6OA 5IM9A 2GZYA 4OFTA 2EC4A 3IXRA 4GCIA 4WETA 2YN1A 4O32A 4ZILA 4KAEA 4PQ1A 2H70A 3KMOA 4WR5A 5DQYA 2R3XA 4PNFA 4OWYA 1PMTA 5LNKe 3FYGA 1SJZA 4JE1A 4POKA 2KOKA 1X9SB 2LUSA 2EIRA 4ZL7A 2OE3A 5DDLA 2FA4A 4WF4A 3H8QA 2H1GA 4YQMA 3I43A 4MZCA 3E9JB 2HE3A 1WIKA 3KTLA 5B6MA 2J23A 1K0BA 3KZQA 3F0IA 1MDJA 4K7NA 3KP8A 1O6JA 1R5AA 2N5BA 3GFKA 4EC0A 5D9TA 3VURA 2LJAA 1GSDA 1TRWA 4PQHA 2L4QA 1GTAA 2RUEA 1XWKA 1A8LA 3F3RA 3VWXA 1YQ1A 3A5WA 5ENUA 1SKSB 4YH2A 2O85A 2C0GA 2GZZA 4EF0A 3MAKA 2CA8A 2FHEA 4O92A 1YF1A 4KW6A 1M9BA 3O3TA 3GMFA 1U87A 1A2MA 1GSYA 5FWGA 3CYNA 1B48A 2WGRA 2I4AA 4YAPA 3H93A 3WYWA 4PQIA 1TI3A 5GSTA 1B4QA 2DSAA 3KTBA 1JZDA 3G7YA 3RAZA 2TRXA 1XW6A 2IJYA 2CX3A 1PSQA 1F6MC 2YP6A 2X8GA 1PD21 1BYEA 3FW2A 5HR2A 4Z7XA 2GSQA 4K9ZA 4V1Ap 2HT9A 10GSA 1EV4A 19GSA 5CRWA 1KNGA 3H1NA 5ID2B 4QL7A 1DE1A 2VLTA 4DSSA 5D8IA 2H76A 1YJ6A 2LNTA 2PGTA 2V41A 3QFAC 4KUNA 2H73A 5CRHA 5D9VA 3HZ8A 1TRSA 3DVXA 2OBIA 1QK8A 1W4VA 3P90A 1FO5A 5AIXA 2GQKA 2YWMA 2MMZA 4EO3A 1Y6EA 2VM1A 5DAKA 2IL3A 5F05A 3FZ4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite