2BMXA

Mycobacterium tuberculosis ahpc
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
169
structure length
169
Chain Sequence
PLLTIGDQFPAYQLTALIGGDLSKVDAKQPGDYFTTITSDEHPGKWRVVFFWPKDFTFVCPTEIAAFSKLNDEFEDRDAQILGVSIDSEFAHFQWRAQHNDLKTLPFPMLSDIKRELSQAAGVLNADGVADRVTFIVDPNNEIQFVSATAGSVGRNVDEVLRVLDALQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Structure and Mechanism of the Alkyl Hydroperoxidase Ahpc, a Key Element of the Mycobacterium Tuberculosis Defense System Against Oxidative Stress.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALKYL HYDROPEROXIDASE C
total genus 46
structure length 169
sequence length 169
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2005-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2bmxA00
3DXBA 3LXZA 2H1DA 5B6MA 3UL3A 4IELA 3MWHA 5ECNB 3IR4A 4MH3A 2YNXA 4MDCA 2IL3A 1A2LA 1YQ1A 1V57A 1M9AA 1GP1A 2JSZA 3U6VA 1Y25A 1YY7A 4RUVA 1PSQA 2H8LA 2CZ2A 2V32A 3IC4A 5ECMB 2C3NA 3QFAC 1X9WB 1SKRB 2L59A 4IJ3A 4YH2A 4Q5QA 3IXRA 2PN8A 4IGJA 4ISDA 2HE3A 4G19A 3W8SA 2M72A 3APOA 2OA7A 4NMUA 3HA9A 4Q5FA 5CRHA 2IPAA 1CQGA 4KNDA 4Q5NA 3LFLA 1GL8A 3ZVJD 2FCHA 4OO5A 5IO0A 4PNFA 4MZCA 3TJGA 2E7PA 3VWUA 4GRFA 4GXZA 3TKRA 2ON5A 2OJLA 4KW6A 2HXKA 4NWYA 5G2ZA 4GTUA 16GSA 3VI5A 4ZB8A 5F07A 3LQ7A 3D22A 2XC2A 1A0RP 2VIMA 3TOUA 4ECIA 4JBBA 5DAKB 1USBA 1V40A 2KOKA 4IW9A 4NXIA 4FO5A 3K8NA 1MDIA 2MBSA 1G7EA 1TK5B 4TR1A 2L4QA 3EU3A 2XHFA 1OC3A 4WF4A 3ZLPA 2GS3A 4WXTA 1TRVA 4HZ4A 2LRCA 5HR2A 1K0OA 4I6XA 4IHUA 2JADA 1I9DA 3HHVA 2OBKA 1Z6NA 3MSZA 2GSTA 3RPNA 2PWJA 4MABA 5INYA 4GQCA 3P8WA 3SWLA 2NBSA 2JACA 2XBIA 5D9WA 2H75A 4KA0A 1XWAA 1E2YA 1HNAA 4WEYA 3W6GA 4WKWA 1EP7A 1M2AA 5B8BA 2YANA 2C1YA 2JZSA 4PX1A 4FIWA 4KUNA 3FZ9A 2R6KA 2VM1A 5JWOB 2V1MA 4EL1A 1TRUA 3KXOA 4XS1A 4TRXA 1SK2A 1EV4A 2TIRA 2NVLA 1XWCA 5CO3A 3JCML 4BPYA 1AQXA 1GLPA 3TKPA 3H8QA 3G7IA 4KAEA 1JZWA 2NDOA 4NHWA 2H74A 1ZL9A 2DIZA 1ERUA 3IA1A 5IQYA 4I2TA 4HEA2 2GSQA 2YP6A 3HVVA 4ULXA 2VM2A 3APQA 1EP8A 1XBSA 5HR1A 4PQIA 2DLXA 2LJAA 3MNGA 1ABAA 3GKNA 3EMPA 1B4PA 4TW5A 3E9JB 1Z5YE 2GVPA 4OWYA 3CBUA 5J4UA 5KN3A 1YKCA 3QR6A 5CRGA 3QPMA 3QOUA 3DVXA 1WRYA 4CDOA 10GSA 20GSA 2FY6A 3LG6A 4O7HA 4POBA 2HI7A 1WMJA 1FVKA 3IBHA 4KH7A 2H01A 3L4NA 1G0TA 1TK8B 3HCZA 3KP9A 4KCEA 3ZYWA 5ELGA 3WT1A 2H66A 2JL4A 3QFBC 2X99A 2BMXA 3IAM2 4L8EA 1GULA 4YAVA 4ZBDA 1TDIA 2F51A 4XHMA 3VPTA 2CZ3A 5ECIB 4CW9A 1Z6MA 4KDYA 4K8MA 4GCIA 4WBRD 5ID2B 1O6JA 2HZFA 1U87A 2A4VA 1THOA 2PBJA 2GT5A 2RUFA 3I69A 5HFKA 1GUMA 1THXA 2CA8A 5G5EA 3TKSE 1B48A 3HKRA 1RK4A 2DJ1A 3G7YA 3L0HA 1DSBA 1SK0A 4MCUA 2ALBA 3M3MA 4J56E 2KUCA 5DDLA 4OFTA 2PERA 3H4KA 3KTLA 4KCAA 3AY8A 2YJHA 1YEXA 2GDRA 2B6MA 1XW6A 1JFUA 1M2BA 3TGZA 5LCZA 1NM3A 1K3LA 3ZRDA 3GL3A 2DSAA 2RLIA 2K6VA 1YF0A 2FNOA 3EYTA 5DALB 2E0QA 1B9XC 5H5RA 5IPHA 3KH7A 3QMXA 2O8VB 2NPBA 4CHSA 3G7JA 3FR9A 2WCIA 5IM9A 1O85A 1ERVA 3LJRA 2YWMA 2MMAA 4ZBAA 1SJZA 3DMLA 3FZAA 5J5NA 1AW9A 1QGVA 2LJKA 2VL2A 1PL1A 11GSA 4XRAA 1GSUA 3EWLA 3P2AA 3SBCA 2AHEA 2YPMA 3IAS2 2O87A 3E0UA 2DC5A 2WFCA 4KDXA 3KCMA 2H6ZA 2KHPA 1T3BA 4JR6A 3QD9A 1ILOA 2MMZA 3M9JA 1WPIA 1XWGA 5CREA 5GAPD 1ERTA 5CYYA 3TJKA 1ML6A 1VF2A 1PMTA 2X8CA 1GTBA 2FLSA 1VGLA 4K1FA 1C72A 4EDYA 4ZL8A 3M1GA 1SL2B 3LGCA 4L5LA 4G2EA 2RUEA 3L78A 5IMCA 1WOUA 17GSA 5JCWA 1ON4A 3TB2A 1T4ZA 5KN0A 3IE3A 2AB6A 1PRXA 6GSYA 3TKSC 2FWHA 3P90A 4OCFA 2CX4A 4DSSA 1X5CA 3FK8A 4FYCA 3HD5A 2Z9SA 1S3DA 3N9JA 5ABRA 3F4SA 1X5DA 2B3SA 3CSHA 4MJBA 1UN2A 1FB0A 4MPGA 2HZEA 5G5FA 3HY2A 3WYWA 4MF6A 3H1NA 1NHOA 1R4WA 2N5AA 3D21A 1VF1A 2AV4A 4XS4B 1VF3A 3TRQA 4X1UA 1SU9A 5KN2A 3HJMA 5B7CA 2YV9A 5A4UA 4AGSA 2DJ3A 5AIXA 3M0FA 5CNWA 2WS2A 5JCUA 1GLQA 1R26A 3O3TA 1O8XA 1UA5A 1G6WA 5GSSA 4JU5A 5KEJA 1ST9A 1GTAA 3GTUA 3FEUA 6GSUA 5DJMA 3IPZA 5J41A 1AAZA 4KSMA 4MJAA 1GSFA 1O81A 1SD8A 2C0DA 4N0VA 2WJUA 5AN1A 3ERGA 5EY6A 3VWVA 4AJ7A 2HSYA 1JLVA 1XIYA 5EL8A 3FHKA 4NPBA 4OFNA 4PQHA 2ZNMA 4HQSA 3GH9A 4OMVA 3DWVA 1MEKA 3GA4A 4I5QA 1FAAA 3KTBA 4KE3A 4OCEA 1WE0A 5ECQB 4TOPA 3GUSA 2RM5A 1HNBA 5JWQB 1Q4JA 1SD9A 1GSQA 2GZZA 2HLSA 1KEBA 5DQYA 1GNEA 2CVDA 2GSRA 3KMNA 1A0FA 2EIOA 2VLTA 3CXGA 3BOAA 2LQQA 2IFQA 4MMMA 4ZXGA 2B5YA 1YZXA 4WR5A 5EPFA 1HNCA 4AF2A 5A5KA 2DJKA 1XVWA 3ZMLA 2QKEA 1U88A 2P31A 6GSTA 1H4OA 3HYPA 4KX4A 1VF4A 3H79A 4PNGA 2VCTA 2FWEA 4TKYA 2C3QA 4F03A 1WJKA 3LYPA 3QAGA 4EE0A 2O85A 3C71A 4EC0A 5ECOB 5ECHB 5HQPA 4TXOB 2H0HA 8GSSA 2FHEA 2GLRA 3GYKA 1EOGA 3LWAA 4DSRA 2V6KA 1SYRA 1XOAA 1LU4A 3D6IA 3HZ4A 4N30A 4EVMA 3C8EA 4XIHA 1KTEA 2JU5A 1W4VA 3RBTA 1GSDA 5HFIA 3A2WA 4X43A 1NSWA 5IO2A 3DKSA 4K2DA 2H1GA 4IS0A 2I81A 3V1WA 3O76A 2PMTA 5F05A 3CSJA 3Q19A 4BA7A 1PD21 3FR6A 3VURA 3C7MA 2PGTA 1X9MB 5H5QA 1QK8A 1WP0A 5GSTA 3KGKA 2F3MA 1R5AA 4D73B 1PX6A 5KN1A 3CRUA 4O32A 1K0AA 1B8XA 1MD4A 3FYGA 1O73A 3CYNA 3UVTA 1J9BA 3BCIA 2E2GA 5E59A 3IDVA 3ZIJA 4KGIA 3ZFLA 3GRXA 3LYKA 2CX3A 2L5OA 2KP1A 3H93A 4YQVA 2VD1A 3EINA 1VRSD 2ZCTA 5J9CA 1J08A 2R3XA 1XXUA 3F63A 2L57A 2H1AA 2YWIA 2C3TA 4ECCA 4PQ1A 4F2IA 5J9BA 4ILFA 2BJXA 1F37A 3VK9A 2FUG2 4FYBA 4POMA 2CQ9A 1RQMA 3D4MA 4G9HA 3VPQA 3E3EA 5IPGA 1BJXA 2EIQA 2VCXA 3EE2A 1SKSB 2JZTA 2LNSA 1GWCA 2C4JA 4HI7A 3VFIA 5CRWA 3FKFA 1A24A 1S3AA 1GRXA 4K0GA 3US3A 2XPEA 4X0XA 1DE2A 2H19A 4FYUA 1V58A 2I4AA 3RAZA 1TI1A 2B1KA 4L0UA 2R4VA 4WR4A 4MH2A 1A8YA 2OACA 3APSA 4GSNA 1QMVA 4F0CA 1SK1A 4K7IA 2J23A 2K18A 4MJCA 2VOCA 3VWWA 4POLA 4IQ1A 1M9BA 4N0ZA 2F9SA 1U6TA 1B9YC 4ZL7A 4MF7A 2H70A 2WRTA 1X5EA 4K7OA 1OKDA 5IMZA 2IN3A 1B4QA 2I3YA 2IMDA 5C04A 4JR4A 5FT3A 2JSYA 2C8UA 4TR4A 4HUAA 4ECBA 3FW2A 1ZGNA 2LJRA 1ERWA 2XPDA 2FD3A 3DEXA 4HJ2A 1XWKA 5HFGA 3GV1A 5D8IA 2VCVA 3C73A 1ZMAA 4LL1B 3N5OA 1JZOA 1H75A 1V98A 4QL9A 3NZNA 1EEJA 2GQLA 3F3QA 5EVOA 1BG5A 1HYUA 1A2MA 2M46A 4LLRA 2RM6A 4MLYA 1DE1A 3PGTA 2CT6A 3KH9A 4WETA 3FZ5A 1XCCA 5IIZA 3EMXA 3DD3A 5ECPB 3MDKA 3TUEA 2LNTA 5COHA 3ED3A 2DJ0A 3PINA 5F8BA 5B6NA 4P3YB 2EIRA 1XVQA 2N5FA 4G10A 1SYXA 4HZ2A 3GIXA 4XCSA 7GSSA 1F2EA 1T00A 2C0FA 2LUSA 2FWFA 3HVXA 5IMAA 4KSOA 2YOIA 3KEBA 5H5SA 3L9SA 4V1Ap 2OE3A 4IVFA 2MBTA 3KM6A 3J7Yb 4BL7A 1SKWB 2ON7A 1XZOA 1OC9B 2V41A 3BD2A 2P0GA 1IYIA 3ZIVA 1EZKA 3F6FA 3F0IA 4ML1A 2WULA 3TJBA 3LSZA 4MZBA 4QL7A 1TTZA 1YDKA 4NV2A 5FHIA 3GX0A 1K0NA 4BVXA 2B7JA 1BAYA 2O89A 5ECRB 1XPVA 1QUWA 4IP1A 3IK7A 1LBKA 1S3CA 5D9TA 3OR5A 3HJOA 2MMNA 1TI3A 4ACSA 3UMAA 3Q74A 1I5GA 2WDUA 3ZVJA 1PKWA 2VD0A 3QDNA 2HRFA 2KP2A 3UJ1A 12GSA 4AJ8A 2V2GA 3KP8A 3ZTLA 3TKSA 1F3BA 4E8EA 2MMOA 3GKKA 2JZRA 2HYXA 3D5JA 2QGVA 4PGTA 4PURA 4V2MA 3GL5A 1FB6A 3MAKA 3Q6OA 5HR3A 3HDCA 1EOHA 2IJYA 1FO5A 1M99A 1K0BA 2QC7A 1BX9A 3A3TA 3EU4A 3WGDA 9GSSA 3QAVA 2X8HA 6GSWA 2C0GA 1GUKA 3ME8A 2FWGA 2R37A 2OE0A 1ZYQB 2WZ9A 1HQOA 1EGRA 1AXDA 1TK0B 1URMA 1A2JA 3F9UA 2H76A 3RHCA 2DIYA 2EC4A 2MZCA 3F3RA 3RPPA 2B7KA 5JWRB 2C80A 2REMA 2RIIA 2VAFA 1XWBA 3KMOA 4F9ZA 1KNGA 3PR8A 4RI6A 3TRPA 3EC3A 3VI7A 2DMLA 1BQ7A 3S9FA 1PKZA 3UBKA 2F8AA 2YCDA 6GSXA 3C1SA 3VLNA 4LMWA 3KIJA 1JZDA 3WGXA 2TRCP 3F4RA 3DIEA 2AUVA 4XS4A 2PUKC 4OFMA 2H0IA 2TRXA 3HZ8A 5A4VA 4LL4B 3DRNA 1EV9A 2LTKA 2P5RA 2J9HA 2LEGA 2B5XA 3D0ZA 4ECJA 2IFQB 2AAWA 1AQVA 1FG4A 2L6DA 5D93A 4NV5A 2OKAA 5AISA 3P7XA 2IMFA 1GUHA 4PUAA 1X0RA 2CVBA 2A2SA 2MYGA 4DSQA 1GSEA 4J2FA 4HJMA 4TN8A 4EXJA 2LS5A 5G1KA 4IBPA 1OC8A 2A2RA 3A2XA 4IQAA 1OE8A 4KDUA 1T4YA 4ZBBA 2LKUA 4ZIJA 5DQSA 2YWOA 5C00A 2B5EA 4TR1B 3BBYA 4IN0A 3ZREA 2L6CA 2YN1A 1AQWA 1K3OA 2DJJA 4MF5A 3G9BA 2X8GA 3UIWA 18GSA 2GTUA 1R5PA 2H0GA 3L9UA 2PVQA 1XW5A 5LD0A 4EKZA 2H6YA 1TW9A 4QQ7A 1MD3A 3A2VA 1Z7PA 1TXXA 2GZYA 1EWXA 3O6TA 4YAPA 1F9MA 4E8HA 4J57E 4XTSA 4LA1A 4DEJA 4EUYA 4N11A 3IHQA 1G7OA 1X9SB 1N2AA 1PGTA 1PA3A 2H6XA 1YF1A 5FWGA 1M2DA 2CV4A 3NIVA 4BVYA 3HXSA 2XBQA 5DAKA 2GZPA 2H73A 3C1RA 5IOWA 4ZILA 1WIKA 1GH2A 14GSA 1T8EB 3TKQA 1MTCA 2LQOA 1EEMA 4H86A 5ECLB 1E6BA 1W89A 5G1LA 5F0GA 1TJDA 4BWQA 1ZCPA 1UC7A 3J7Yk 2PPTA 4TXOA 4HDEA 2FGXA 5B8AA 2I1UA 4GF0A 1FVJA 4IP6A 4GSTA 1RW1A 5F06A 1AC1A 1FW1A 5G30A 2YWNA 5IOXA 3ZFBA 4RQXA 4O92A 3IRAA 1R7HA 1YKAA 3EURA 3TDGA 3KZQA 2H1BA 3F8UA 3TCOA 3RHBA 3UAPA 5ECKB 1XW9A 5AGYA 2KLXA 1SENA 2F8FA 5CAXA 2BTOT 5D73A 1ACVA 3CRTA 2I9HA 1K3YA 4D73A 1SJIA 4JEDA 3DVWA 3M9KA 4GLTA 3IK9A 2IMEA 1OE7A 3EVIA 4L5OA 2WB9A 3GN3A 3ERWA 2DJ2A 5D96A 2QSIA 2NTOA 2CVKA 2VLVA 2GQMA 1YJ6A 1TP9A 3GSSA 3FRCA 2L4CA 4I8BA 1PN9A 2ES7A 1Q98A 3U5RE 1SL1B 1NW2A 4ZB9A 5ENUA 2OBIA 3TRXA 3GMFA 3L9VA 2K8VA 3Q18A 1IYHA 5ECSA 5JCGA 3I43A 5J3RA 3CTGA 2YJ7A 4PUFC 1UVZA 4HU9A 4GWRA 4I97A 3M8NA 3F4TA 1T1VA 22GSA 3F6DA 5L71A 1OYJA 2VO4A 1TKDB 3DYRA 4XRDA 4TXVA 1QFNA 4IKHA 4JE1A 1JHBA 2P5QA 3HJPA 1Z9HA 2HT9A 4GQFA 1TU7A 1Z7RA 3GH6A 3IOSA 4K7NA 4MA9A 2D2ZA 3TOTA 3GFKA 3D4TA 3GX8A 5LNKe 2O7KA 3RDWA 2YZHA 1SL0B 4NAXA 1BEDA 4MPFA 1NHYA 2VUPA 2R2JA 2H30A 2X64A 4GSSA 3FZ4A 4ID0A 4POKA 2H72A 4LMVA 2G0FA 1DBYA 2N5BA 6GSVA 1PL2A 5HR0A 5IMFA 3CSIA 3BCKA 3WT2A 3I6AA 4FH8A 1GSSA 3GSTA 4I2UA 2OADA 5E4WA 3TJJA 5DJLA 1F3AA 4K9ZA 2LRNA 2LV3A 1MDJA 1V9WA 3ISOA 4WF5A 3ZITA 1KBNA 1TRSA 2HNLA 3WD6A 2OE1A 4K6XA 3ME7A 2IIYA 5ID2A 4JRRA 2VL3A 2ZUPA 1SJ6A 2B1LA 4F82A 4OD7A 4PXOA 4EF0A 5A4WA 4IJIA 4Z7XA 3HVSA 1OKTA 1BYEA 4KB3A 3PH9A 4MK3A 2PVOC 1U3AA 1FOVA 4TR3A 1AIUA 3UARA 5DVBA 4MP4A 2GT6A 3LXTA 3FY7A 1EGOA 4V2LA 5G31A 1TU8A 2AJQB 3R2QA 5IMVA 13GSA 2K9FA 2YV7A 3GURA 3ZL5A 3QCPA 4DVCA 2HRNA 3LORA 2VL2C 1K0DA 4MZWA 2IMKA 3TJFA 5DALA 3W8JA 5CP1A 4XS6A 3ZZXA 1F6MC 2CAQA 1QQ2A 5GAND 4ZL9A 1JZRA 1WWJA 2IWTA 5AIVA 2H71A 2LRTA 2LSTA 3ERFA 1YEPA 3DGQA 1V2AA 4V1Ag 1DUGA 2CAIA 3IV4A 4N10A 3GKXA 4BWSA 2C0EA 1A8LA 3LEFA 2YZUA 1QXHA 4DSSB 2IMIA 1ZZYA 3WGEA 3CTFA 2V6OA 3KD0A 1AUCA 1OC9A 4HQZA 2DBCA 4HU7A 2GSSA 4F0BA 19GSA 2VL9A 1Y6EA 1LJRA 1GSYA 4JZQA 1J0FA 1HD2A 3GHAA 1A23A 3CMIA 2GQKA 4ML6A 5DBQA 1FHEA 3I9V2 1T7PB 1GTIA 2HZEB 1ZYEA 4YQUA 3UVHA 4L0WA 2L5LA 3A5WA 3NOFA 3QAWA 5ELAA 1XFLA 4MJEA 1PX7A 1TRWA 2VCZA 2HSHA 1MDKA 4V2NA 2DMMA 4NHZA 1O7UA 4TR0A 1JLWA 2M80A 1N8JA 2HFDA 4RI7A 1O8WA 5D9XA 3KJYA 3ZMKA 5GZZB 2PU9C 1OAZA 2GGTA 1G6YA 4WBJA 1U3IA 4HOJA 1K0MA 1ZOFA 2FA4A 5DCHA 5IMDA 1Z3EA 4OO4A 5CRDA 3BJ5A 3GTUB 4K0NA 2G2QA 2E2MA 2VCQA 3GKMA 2VCWA 2FA8A 3UOMA 4RQRA 2AYTA 1TOFA 6GSSA 4O5RA 1M7TA 3FR3A 4ZB6A 4AJ6A 2R5GA 1M0UA 4Q5RA 1GTUA 4HS1A 5D9VA 4YQMA 1K0CA 1CQHA 3UEMA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite