2BMXA

Mycobacterium tuberculosis ahpc
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
169
structure length
169
Chain Sequence
PLLTIGDQFPAYQLTALIGGDLSKVDAKQPGDYFTTITSDEHPGKWRVVFFWPKDFTFVCPTEIAAFSKLNDEFEDRDAQILGVSIDSEFAHFQWRAQHNDLKTLPFPMLSDIKRELSQAAGVLNADGVADRVTFIVDPNNEIQFVSATAGSVGRNVDEVLRVLDALQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords ALKYL HYDROPEROXIDASE C
publication title Structure and Mechanism of the Alkyl Hydroperoxidase Ahpc, a Key Element of the Mycobacterium Tuberculosis Defense System Against Oxidative Stress.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 46
structure length 169
sequence length 169
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2005-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2bmxA00
4FIWA 2FWEA 2E2GA 2V1MA 2XHFA 1FVKA 1SJ6A 1FB0A 3KEBA 3KP9A 1WOUA 1FOVA 2FWGA 3CSIA 5DALA 2YCDA 4RI6A 3WGXA 5ECPB 3GYKA 5ENUA 4TXVA 1GTUA 1XXUA 2JZTA 1FG4A 1Z7RA 1SK1A 1S3AA 3LG6A 4GSNA 2FGXA 1OYJA 1QUWA 3N9JA 4WXTA 1GL8A 2LRTA 3HCZA 3TB2A 3IA1A 2H70A 5ECRB 4NAXA 3QFBC 3IE3A 2H1AA 3M8NA 2O7KA 2AUVA 2N5AA 1K0NA 5ECLB 3PGTA 1OKTA 2VM2A 1BEDA 4AJ6A 3GH9A 3H1NA 1XWGA 2H75A 2QKEA 4L0UA 2WULA 2KUCA 2PUKC 3H8QA 1F3BA 5J5NA 4KSOA 4X0XA 5DQSA 1TK5B 5GSSA 4POMA 2XBIA 3Q19A 3GIXA 1K0CA 5JWOB 3ZVJA 1A2JA 4AJ8A 2WRTA 2B3SA 5IO0A 3F6DA 3C1SA 2VL3A 1DUGA 3TKSC 4NV5A 3UIWA 4QQ7A 3GKXA 3ZYWA 4OO5A 2YWOA 5D9WA 5DQYA 2F9SA 2WGRA 4IQAA 5FHIA 2PERA 4BA7A 5DJMA 2OBKA 1HD2A 3ZZXA 3K8NA 3ZL5A 2HZEA 12GSA 1G6WA 1TKDB 3TRQA 2B1KA 1M99A 5IMCA 1Y25A 3CRTA 2YOIA 2L4CA 3IAS2 2IN3A 5CRWA 2OA7A 2VL2A 1FAAA 4MJBA 2AYTA 5KN1A 2CVKA 4EXJA 1ERUA 4MF5A 1UVZA 2OE0A 1KNGA 2YV7A 1QMVA 1OE7A 5J4UA 1G6YA 1HNBA 5JCWA 4XS6A 3EE2A 3CBUA 3VWXA 2QC7A 5G5EA 4NV2A 2LNSA 4PNGA 4ML1A 3KH7A 1BQ7A 4AJ7A 3CTGA 2LTKA 3FHKA 2HXKA 1TJDA 1FVJA 5IMAA 4FH8A 3ZIJA 4TOPA 3W8JA 1FHEA 3GHAA 3KIJA 2LNTA 4HQZA 3HZ8A 5B7CA 3G7IA 2EIQA 1OAZA 2GSRA 4OD7A 2IWTA 5A5KA 3F6FA 3RAZA 5GSTA 2E7PA 2I9HA 4I2TA 2PMTA 2N5FA 2IJYA 5EPFA 2VCZA 2CX4A 2HLSA 2QSIA 5J9BA 1B9YC 1WE0A 1GSQA 4WKWA 3IPZA 3Q18A 1VRSD 1M7TA 2H1GA 1SD8A 2HI7A 1JLWA 1WJKA 3HVXA 1OC9A 5HR0A 4HUAA 11GSA 3PR8A 2N5BA 2C0DA 2WDUA 3EU4A 2PBJA 3O3TA 1B4PA 1K3OA 2X64A 3TGZA 3FK8A 1JZRA 4JEDA 4IQ1A 5ID2A 4XRAA 3TKRA 4BPYA 3I6AA 2IMDA 3Q6OA 5IMFA 2FHEA 5B8AA 4N0ZA 3IRAA 2ZUPA 2E2MA 3ERGA 3L78A 2AHEA 3D6IA 2NPBA 2H66A 1T7PB 4MLYA 4WETA 1ZYEA 3CXGA 2K6VA 3G7JA 1V9WA 3HA9A 1Z6MA 2CQ9A 4O5RA 3D5JA 1TP9A 3D21A 2BMXA 6GSXA 2DJ3A 3TRPA 4I2UA 2ZNMA 1A2LA 2L59A 5G31A 5G1KA 5J41A 2A4VA 3VWWA 3QAVA 3ZMKA 4KB3A 1B8XA 2PN8A 1UC7A 6GSVA 2JSZA 5FT3A 4TXOB 1T4YA 3VK9A 1XIYA 4MJAA 4HQSA 4EL1A 4OFMA 3C1RA 2DJ2A 2QGVA 2EIRA 4KUNA 3UARA 4Q5QA 3HYPA 5AISA 2DMLA 2IFQA 4N10A 2FWHA 4CDOA 2NVLA 3DWVA 3WD6A 1GLPA 2R3XA 1I5GA 5KN3A 3KGKA 3M9JA 2J23A 4ECBA 2VIMA 4YQUA 2VD0A 1I9DA 4JE1A 3FZ9A 3ME8A 4FO5A 1K0BA 4GSSA 5A4UA 3DRNA 4ZB6A 4EDYA 2HSHA 4OCEA 3A2WA 2CT6A 1XWBA 1RW1A 2GQMA 1WMJA 1V98A 7GSSA 1LJRA 2VCWA 2GZZA 2Z9SA 3VFIA 2DSAA 2LQQA 3FY7A 3IV4A 1WPIA 1BG5A 5G5FA 3DIEA 3RHBA 1E6BA 2HZEB 3EINA 3TKSA 2C8UA 2LEGA 4KNDA 1QFNA 3IK7A 3APSA 5CNWA 2H6XA 1JZWA 1TK0B 1M2DA 1QXHA 4ZL7A 2LV3A 2B6MA 3E0UA 3H79A 2H0HA 3C71A 4V2MA 3M3MA 2L4QA 3KXOA 2DIYA 3IK9A 3BCKA 1XOAA 2H6ZA 4MH2A 1GUMA 3TCOA 2L57A 2CZ2A 3EU3A 1PQNA 3QD9A 2LQOA 1NSWA 5HR1A 3UVHA 3UJ1A 1A23A 1X0RA 2VM1A 2KOKA 4KE3A 5CRGA 4PURA 5IM9A 4N11A 4NMUA 5D9XA 2AV4A 3OR5A 4GWRA 3G9BA 4TN8A 5D8IA 3L9UA 3F4SA 3NZNA 1TU7A 4LL1B 2KHPA 1AC1A 3QDNA 1K3YA 5CO3A 4MF6A 1SL2B 2C3NA 4PNFA 2RM6A 3MDKA 1R5AA 4IW9A 1PMTA 4XTSA 3F4TA 6GSWA 3RHCA 1A0RP 1TI3A 1EP7A 4IJIA 5F06A 3I43A 1GWCA 2C3TA 1TXXA 2OBIA 2IMIA 3HVSA 2YJ7A 2KP2A 1SKRB 4OO4A 4BWSA 5LNKe 4MPGA 3D4MA 1QK8A 4F0BA 5C04A 3F0IA 4L0WA 2MZCA 1ZZYA 5CREA 1BJXA 2VCQA 2NDOA 3TJBA 4NWYA 4HZ4A 1IYHA 2I81A 2EC4A 5DDLA 1YQ1A 3FRCA 3O6TA 1GSFA 5CP1A 5ID2B 3L4NA 2GSSA 2CA8A 1SL0B 4ZILA 3BJ5A 3KTBA 2HZFA 5ELAA 4MJEA 4RUVA 4OCFA 2LKUA 2XPDA 3EMXA 4IJ3A 4EDZA 1AQXA 1A24A 3P8WA 2O8VB 2V41A 2H71A 3I9V2 1EGOA 2ON7A 4JBBA 1F37A 3E9JB 3CMIA 5A4VA 2B5EA 5GAPD 1AQWA 2C1YA 2FA4A 2H8LA 3ED3A 1YDKA 3W8SA 3P2AA 5DJLA 4TXOA 4PXOA 4LA1A 2YNXA 3U6VA 3F8UA 3DVWA 1VF1A 20GSA 1YY7A 1YJ6A 4LMWA 3P90A 3UMAA 4G9HA 4PQIA 5F8BA 2ZCTA 2F3MA 2P31A 4V2NA 4XHMA 1K0MA 4WF5A 3KMNA 2IFQB 1X5DA 3GMFA 3ZMLA 4HJMA 1XWAA 1ERVA 22GSA 2CAIA 4IHUA 1X5CA 4ECIA 2K8VA 3TJJA 1PKZA 3KJYA 2MBTA 3FZ5A 4GXZA 1XCCA 3BOAA 2R6KA 3DEXA 3RDWA 1YZXA 18GSA 2RUEA 3HHVA 1U6TA 4POBA 3TUEA 2LRNA 2G0FA 1N8JA 1K0AA 5D9VA 3HKRA 4KCEA 4QL9A 2C4JA 1XFLA 3O76A 1SYXA 5H5SA 2HRFA 1IYIA 1EOHA 4K0NA 5J9CA 3GFKA 2I4AA 1ZL9A 2DBCA 4PGTA 3IDVA 2BJXA 3TKQA 2VCVA 4YAVA 4O32A 4ML6A 1J0FA 4MK3A 2X8HA 3LEFA 13GSA 5AIVA 1MDKA 3A5WA 3ZVJD 2J9HA 1EWXA 4OWYA 1RK4A 3UBLA 4ECJA 1G0TA 2DJKA 2VL9A 4Q5RA 1JZOA 1Z6NA 5H5RA 3GTUA 3VPQA 1F9MA 4EO3A 1SD9A 5EL8A 1KBNA 2VLTA 5JWQB 4JZQA 1K0OA 1X9WB 4FYBA 2GGTA 4KX4A 2DMMA 1T3BA 1GTAA 4KSMA 1TTZA 1DE1A 1AIUA 3D0ZA 1EZKA 2IIYA 6GSYA 2GT5A 1T8EB 1GP1A 2REMA 3VPTA 2H74A 3TJKA 4ZXGA 3QFAC 3RPPA 3GRXA 4IP1A 5KN0A 1ST9A 4WBRD 2H73A 2IMFA 1XOBA 1PRXA 3SBCA 2O89A 3E3EA 4WF4A 3QPMA 3ERWA 5LCZA 3GKMA 1V58A 1RQMA 1ZMAA 2YWIA 4CHSA 2IPAA 2H6YA 4O7HA 17GSA 3DD3A 2GTUA 2GZYA 3ISOA 4V1Ag 3JCML 4IP6A 1XWCA 2GS3A 1XZOA 3CSHA 4ZIJA 5ECQB 2XBQA 3LSZA 3ZTLA 4MMMA 1QGVA 2PVQA 5J3RA 3TJGA 2ES7A 4HU7A 4MPFA 3HZ4A 4K1FA 1YEPA 1TRVA 2VCXA 2CAQA 1SJIA 2GQLA 3FZAA 3EVIA 2MMOA 4WEYA 2JU5A 3ZFLA 2HRNA 1GULA 2YWMA 1ZYQB 4DEJA 3EMPA 1TRWA 2M80A 4HOJA 1G7OA 1SENA 3CTFA 1E2YA 4NXIA 4MH3A 2OE3A 1GSSA 1EGRA 4NHWA 2OE1A 4ZBBA 1U3IA 5ABRA 3FR3A 1O81A 1OVNA 2AAWA 1MDJA 3ZRDA 2YWNA 2RM5A 2MMZA 1O8WA 3TRXA 3D4TA 2X99A 3WGDA 4MF7A 2H1BA 4TW5A 1B9XC 2HFDA 4GF0A 1EV9A 1Z3EA 3FZ4A 1XW9A 1HYUA 4ISDA 4KCAA 3J7Yk 4GCIA 4TVEA 4G10A 3IXRA 1M2AA 3IBHA 1T1VA 3GX0A 8GSSA 3RBTA 2PWJA 3DYRA 2FWFA 4TR0A 4RQRA 2TRXA 1XPVA 1XWKA 1WWJA 4K0GA 3EYTA 3F3QA 3KH9A 2HNLA 3IHQA 14GSA 5HR2A 3WT1A 5AGYA 2VLVA 4I97A 5D9TA 1DBYA 1GLQA 4EVMA 2JZSA 2FNOA 1M0UA 2G2QA 1BAYA 3F3RA 2WFCA 4OMVA 3QR6A 3ZFBA 2GT6A 2GVPA 1XVWA 1V2AA 1ZOFA 5G2ZA 2K18A 2M72A 1N2AA 1W4VA 1A8YA 4XS1A 4J57E 5ECNB 1K0DA 2JADA 5IOXA 2LJAA 5IO2A 1ERTA 1S3CA 3LYKA 1EV4A 2F8AA 2C3QA 2H01A 4GQFA 1PKWA 2VUPA 5CRDA 4XIHA 2C0EA 4ZL8A 1WRYA 4ID0A 4MCUA 5CYYA 2CVBA 2CX3A 2DJ0A 1TI1A 1PX6A 4MZCA 3ME7A 4J56E 2LS5A 4ACSA 1GUHA 1O6JA 1ZGNA 2NBSA 4DSSA 1LU4A 3LXTA 4BVYA 4ZBAA 1SL1B 5HFKA 4Q5NA 5E59A 5DCGA 2H76A 3GTUB 1VF3A 2X8GA 1K3LA 2RLIA 1PA3A 3M9KA 4ULXA 4I5QA 4KAEA 1CQHA 4IVFA 4P3YB 3IR4A 1AAZA 4PX1A 4YQVA 2KP1A 2JACA 5ECOB 1UA5A 5HFIA 4XRDA 3KCMA 1GRXA 2HT9A 4GQCA 1GNEA 1SK0A 2GLRA 3D22A 6GSUA 1EEMA 2RIIA 3SWLA 3MNGA 3QMXA 4F2IA 5ELGA 3LYPA 4CW9A 2V32A 3KMOA 4H86A 4LMVA 4N0VA 4GRFA 1AW9A 2V6OA 2WB9A 4Z7XA 2MYGA 2DIZA 4HEA2 5E4WA 1THXA 4ZBDA 3GUSA 3BD2A 1XBSA 1XW6A 5COHA 2LUSA 1SK2A 4ZB8A 4HDEA 1Q98A 1UN2A 5F07A 3EC3A 1CQGA 3GSTA 4FYUA 4TR1A 2V2GA 2FCHA 1EEJA 3FR6A 4DSQA 1T00A 5HQPA 4ECCA 2PVOC 1JLVA 2GSTA 4WBJA 3WYWA 2B5YA 5FWGA 2LJKA 1PD21 2VCTA 3M1GA 2B7KA 4POKA 4QL7A 2C0GA 3APQA 3V1WA 3GKKA 1V57A 1EP8A 1PL1A 2IL3A 1J08A 3UOMA 3ZIVA 2HYXA 1U88A 3GL5A 2FD3A 2R4VA 4X43A 5EVOA 3TJFA 5IMZA 4MJCA 3MWHA 4PUAA 1SJZA 3HD5A 1ILOA 1GSYA 2GSQA 1JHBA 4NHZA 1YEXA 4YAPA 4ILFA 1TDIA 1TRUA 3LORA 4MZBA 5ECSA 2GQKA 3F63A 3BCIA 4BWQA 3DVXA 3M0FA 3VURA 1Z7PA 2H0IA 1Y6EA 2MMAA 4IBPA 1ACVA 2LSTA 1R26A 4MDCA 5B8BA 1MDIA 4KDUA 2AB6A 1FW1A 3PINA 2P5QA 4HZ2A 2GDRA 5D73A 2VO4A 2FA8A 4ZL9A 4FYCA 1A0FA 4F03A 3KP8A 1NW2A 3LGCA 3HY2A 2VAFA 1PL2A 3R2QA 4HJ2A 4K9ZA 3LJRA 2YN1A 5KEJA 1FB6A 1GTBA 4OFTA 3ZREA 1TW9A 3TKSE 4GLTA 1SU9A 2DJJA 3ZITA 2YANA 3KTLA 1ZCPA 3L9SA 2H72A 1THOA 2M46A 1FO5A 3LXZA 1OKDA 3FW2A 5B6NA 4KGIA 1ABAA 1WP0A 3L0HA 3GSSA 3Q74A 2JZRA 4DSRA 4G2EA 5CRHA 2VOCA 4D73B 3VWUA 4MABA 4TR4A 3KD0A 2MBSA 4RQXA 4XS4B 2IMEA 1SKWB 4V2LA 2R37A 3MAKA 3UBKA 2C80A 4E8EA 3IOSA 2L5OA 3F9UA 2X8CA 3GH6A 3KZQA 5IQYA 4PQ1A 4WR5A 1MD4A 4DSSB 3DKSA 5ECMB 3GX8A 1X9SB 4DVCA 4I6XA 2K9FA 3GL3A 4LLRA 1H75A 4IS0A 2LRCA 1XVQA 3N5OA 2PPTA 3GA4A 3HVVA 5JWRB 2C0FA 4K7OA 4K7NA 2A2SA 1GH2A 1NHOA 2XC2A 5DBQA 3DGQA 5DVBA 5DAKA 4IN0A 3MSZA 2WS2A 3CSJA 3QAWA 1ON4A 2O87A 1VF2A 1O7UA 3GURA 4JR6A 2DLXA 2EIOA 1R4WA 5JCGA 5HFGA 3LWAA 2NTOA 4V1Ap 5ECHB 1MEKA 3US3A 1T4ZA 4EE0A 1M9BA 2F8FA 3QOUA 1LBKA 1NHYA 1B4QA 4WR4A 5GZZB 5INYA 1AQVA 4MZWA 3VLNA 3CRUA 1GNWA 3QCPA 3FR9A 2JL4A 3HJOA 2R2JA 1ERWA 4OFNA 3NIVA 16GSA 1YF1A 5HR3A 5H5QA 2CZ3A 2RUFA 2PGTA 2VLUA 1M2BA 4TR1B 5G1LA 2R5GA 1VF4A 1URMA 1GSDA 1Z5YE 1OC8A 2DJ1A 1PN9A 2D2ZA 2YZHA 1AUCA 1X5EA 2IMKA 2FY6A 2H30A 2YPMA 1H4OA 3UVTA 2OKAA 3PH9A 2GZPA 4PQHA 1ML6A 1R5PA 1M9AA 3WT2A 1KEBA 4JRRA 3L9VA 1F6MC 1G7EA 1Z9HA 2YV9A 2OADA 1OC3A 3G7YA 6GSTA 2L5LA 4YQMA 4J2FA 3QAGA 3F4RA 1GUKA 4KH7A 3A2XA 5IOWA 4EKZA 4ZB9A 1DE2A 1S3DA 2I3YA 2O85A 2CVDA 4K7IA 2V6KA 5DALB 5A4WA 1C72A 1GTIA 5AN1A 3UEMA 3GKNA 4JU5A 3UAPA 1OE8A 2MMNA 4RI7A 3HXSA 2WCIA 1GSUA 5DCHA 1TRSA 2YZUA 1NM3A 10GSA 3S9FA 3P7XA 5G30A 1YKAA 3ERFA 4L8EA 2FLSA 2BTOT 1WIKA 4K2DA 2B7JA 4MA9A 4TKYA 1USBA 3NOFA 5GAND 4K8MA 4GTUA 1TU8A 1MTCA 1PX7A 4BVXA 2A2RA 3TOTA 4NPBA 1A8LA 3GN3A 1PSQA 4HI7A 2L6CA 4BL7A 4O92A 3EURA 4XCSA 3EWLA 5AIXA 2I1UA 3FEUA 5D96A 4L5LA 4E8HA 1J9BA 3C8EA 4EF0A 2DC5A 2WJUA 5F05A 19GSA 4Q5FA 2VL2C 1AXDA 2H1DA 2H19A 4AF2A 3WGEA 5C00A 1BX9A 5CAXA 2E0QA 3VWVA 4D73A 3GV1A 2F51A 2LJRA 4IGJA 3GNJA 4EC0A 4G19A 3TKPA 1TK8B 3VI5A 4XS4A 1SYRA 1DSBA 1W89A 2JSYA 2HSYA 1O8XA 4I8BA 3A3TA 2VD1A 2B5XA 4LL4B 1MD3A 2K8SA 4YH2A 4IELA 2PU9C 3C7MA 1EOGA 5LD0A 5D93A 4KDYA 1O73A 3H93A 3AY8A 1HNCA 1QQ2A 3HJMA 4HU9A 4AGSA 3LFLA 4TRXA 2YJHA 4HS1A 3W6GA 3DXBA 3KM6A 2OJLA 5DAKB 1U3AA 2KLXA 2WZ9A 3LQ7A 2FUG2 1JZDA 4K6XA 5IMVA 6GSSA 1Q4JA 1R7HA 3TOUA 1XW5A 5EY6A 1HQOA 9GSSA 2B1LA 4TR3A 3FKFA 4F82A 1HNAA 3HJPA 2H0GA 2YP6A 5KN2A 3APOA 1YKCA 3ZLPA 1O85A 1V40A 5IIZA 2L6DA 4KW6A 3CYNA 4F0CA 1BYEA 3DMLA 3IAM2 5ECIB 4L5OA 5IMDA 3FYGA 5ECKB 1F2EA 5F0GA 1KTEA 2OACA 4X1UA 2ON5A 3I69A 3H4KA 4N30A 1SKSB 3J7Yb 4JR4A 3VI7A 4PUFC 3BBYA 1U87A 2P5RA 3TDGA 5IPHA 4POLA 5L71A 5B6MA 1GSEA 4GSTA 2ALBA 3U5RE 1OC9B 4KA0A 3IC4A 4F9ZA 1A2MA 2CV4A 1X9MB 4KDXA 1F3AA 2HE3A 4IKHA 4EUYA 5JCUA 1YF0A 1PGTA 1TOFA 2AJQB 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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