4I8BA

Crystal structure of thioredoxin from schistosoma japonicum
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
SNVLHIETDDDFDSFLKENKDKLIVVDFFATWCGPCKKIAPAFEALSADRSALYVKVDVDKLEETARKYDVSAMPTFIVIKNGEKVDTVVGASIENVEAAIRKHK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Thioredoxin
publication title Expression, characterization and crystal structure of thioredoxin from Schistosoma japonicum.
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma japonicum
total genus 32
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.1.8: Protein-disulfide reductase.
pdb deposition date 2012-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4i8bA00
2TIRA 2LQOA 2VAFA 3IRAA 2E2GA 3A2XA 3ZYWA 1Z5YE 4OCEA 3G7IA 3A5WA 2LUSA 4ML6A 2CV4A 3KXOA 3FR6A 3RBTA 2H66A 3MNGA 1O6JA 4J56E 1FVKA 3RPNA 1GTAA 1MEKA 3EINA 3ERGA 5J3RA 3EYTA 3TOUA 4Q5NA 4HU7A 5J4UA 4HZ4A 4NV5A 2H6YA 3HHVA 4FYUA 1OAZA 2FGXA 2HNLA 2CZ2A 3L4NA 5IQYA 1MD3A 2PBJA 3QMXA 1H75A 4WETA 2MYGA 3EURA 4JU5A 5IOWA 1QMVA 1HYUA 1U6TA 5ECIB 4FH8A 2H74A 4JE1A 1BAYA 4RQRA 3F3RA 3QAWA 4LMWA 5DJLA 1U88A 1V2AA 3VK9A 1F9MA 4BWQA 3CTGA 2C3NA 2H71A 3HZ4A 2RM5A 5DJMA 5IPGA 3M8NA 2L5OA 1GSQA 1SK1A 1V9WA 2H0HA 3GV1A 2CA8A 2XPEA 1QK8A 2R4VA 4PQHA 3LXZA 1WJKA 1FOVA 2TRXA 3QR6A 2JZSA 1U87A 1SJZA 4JR4A 4ECBA 1Z7RA 2BTOT 2GQKA 5HR3A 2R5GA 2O87A 2DSAA 3A3TA 1TK5B 2YWMA 2FWFA 5JWOB 5DALA 2L57A 4YAVA 4PXOA 2JZTA 3FW2A 3UAPA 3ZVJA 2IMDA 3RHBA 3L9SA 4EF0A 1S3DA 3GKNA 5ECPB 1GTIA 1SD9A 3P7XA 3D22A 4TXOA 4HU9A 3HKRA 4HJ2A 3M0FA 5AGYA 1TU8A 3ZRDA 1VRSD 1TRSA 1M2BA 3ME7A 1XWBA 1SENA 4O32A 5D93A 4NHWA 2FY6A 2PGTA 2DBCA 3N5OA 1R5AA 3LYKA 5IM9A 3J7Yk 4FYCA 4NXIA 1GTUA 1GSYA 4DSSB 1N2AA 3TJFA 1MTCA 4PNGA 3ZIJA 2YOIA 2GQLA 4EKZA 4EO3A 2YPMA 5B6MA 4TR4A 1PD21 3APSA 4JEDA 3CXGA 1SKWB 1S3AA 2KHPA 2OACA 1XXUA 3CRUA 5DVBA 4JZQA 1X9SB 4KA0A 4WEYA 3Q18A 2A2SA 3ZMKA 3D6IA 3MSZA 4XS4B 3KCMA 2KLXA 4POLA 1A2JA 3KMOA 4FIWA 20GSA 2MMZA 5D9WA 5IIZA 1OKDA 5ECMB 4EE0A 4IS0A 1B9YC 4RI7A 2LEGA 3HDCA 2HZEB 1GNEA 2F8FA 4ZB8A 4TOPA 4EUYA 5EY6A 2PERA 4YQUA 1T00A 2K9FA 4GTUA 4MZCA 2FA8A 4K6XA 1XVQA 4CHSA 1OC8A 3EC3A 4XTSA 2DJKA 3NZNA 1B4QA 1GLPA 2OE0A 3JCML 2ZCTA 1O8WA 3C73A 3UARA 2X8CA 5D9XA 1B4PA 1ST9A 4HUAA 5IPHA 3FR9A 1S3CA 1AQWA 3M9JA 5ECHB 5H5RA 1OC9A 4KCEA 1BX9A 2LKUA 3DKSA 1PL1A 3LG6A 1PSQA 3V1WA 1EGRA 4V1Ag 3APOA 4ZBAA 4PUFC 4JBBA 3P8WA 3ED3A 5JCWA 4L8EA 2YJ7A 5DALB 2H1BA 1W89A 1ML6A 1TRWA 1PKWA 4MJCA 3QAVA 1VF2A 1MD4A 4XHMA 2CAQA 1EV9A 4MA9A 1AAZA 2BJXA 4MF6A 1SL2B 4H86A 2IMEA 2X8HA 4ECIA 4F9ZA 3UOMA 1I5GA 4TXOB 5LNKe 4EDYA 1ERUA 2HT9A 3TOTA 3A2VA 3H93A 3R2QA 3BCKA 4LL1B 3VWUA 5HR2A 1TRVA 5DDLA 1QFNA 3GX0A 2C4JA 2Z9SA 3D0ZA 2GSTA 1OYJA 4O92A 2J23A 3VLNA 2YANA 3ZLPA 4GLTA 3EMPA 2AAWA 2OE1A 4IN0A 3TDGA 6GSXA 3MDKA 4F2IA 2XC2A 2JSZA 1YEXA 3CSIA 1MDIA 3GSSA 4KNDA 3IV4A 5KN3A 1BG5A 2B3SA 1XIYA 3IAM2 2EIRA 3HCZA 2ALBA 3I43A 5KN2A 2D2ZA 2WS2A 4IQAA 1A8LA 3F8UA 3L9UA 4BL7A 3F63A 1SK2A 1K0NA 3RDWA 4YAPA 4F0BA 4RI6A 4D73B 4V2MA 4AJ6A 5KEJA 3ME8A 3F3QA 1DBYA 2CVBA 2YZHA 3IA1A 4OFNA 3TCOA 2C1YA 2GS3A 3HVXA 5CRGA 4N10A 1ON4A 2L4QA 5ECOB 4AJ8A 2N5FA 5IMZA 3AY8A 4KB3A 2B1LA 5EVOA 2LJAA 1T8EB 3BCIA 2VL9A 1SL1B 3F4TA 3BBYA 2X99A 1F6MC 4NWYA 2F8AA 5ECNB 2E0QA 2ZUPA 3KTBA 5DCGA 2C0GA 3C8EA 3Q19A 19GSA 2FA4A 4G19A 4OFMA 4HS1A 2VCTA 3APQA 4MH3A 3LJRA 2GT6A 1SKSB 3CTFA 1AIUA 1C72A 3IE3A 1YKAA 2PU9C 2MBTA 4KDYA 3QPMA 2GT5A 4MJEA 1E6BA 3D21A 4G9HA 3GRXA 5JWQB 3IHQA 2H0IA 5HFGA 2V1MA 3HA9A 3TJKA 3TJJA 3L9VA 3FZAA 4MZBA 1M9BA 4MPGA 5FHIA 5CP1A 3E9JB 4MF5A 4EDZA 3GYKA 4HOJA 2H1DA 2H70A 4NAXA 5A4WA 4FO5A 4BPYA 2L5LA 3NOFA 1WOUA 3WD6A 2NPBA 1SL0B 2PN8A 2B5XA 1XWCA 1HD2A 5B8BA 2JZRA 1PRXA 4QL7A 1JZRA 4EXJA 4MK3A 3U6VA 3IK7A 1DE2A 3QCPA 4IVFA 5FT3A 4TRXA 4OO4A 3KIJA 3KJYA 4MH2A 2CZ3A 3GNJA 2B7KA 3UMAA 5GSSA 3G9BA 5DAKA 4GQFA 2MBSA 3D5JA 1ILOA 1Q98A 1X0RA 2NDOA 4TW5A 2YNXA 1H4OA 2N5BA 4BVYA 5B6NA 3A2WA 3HJMA 2B5EA 1QQ2A 1ACVA 4RUVA 2I81A 1TDIA 3VWXA 2JSYA 1VF1A 5CYYA 3ZZXA 4XRAA 3UJ1A 4L0UA 1FAAA 1ZOFA 4YH2A 2IN3A 2PMTA 2IMKA 1G7OA 5A5KA 2H73A 3ZFBA 2FNOA 3TKPA 2RIIA 3TRQA 2ON5A 3H8QA 2R6KA 2L6CA 4PUAA 4ULXA 1K3LA 3RAZA 3W8SA 3I69A 2PUKC 1PGTA 1UN2A 3IXRA 3UL3A 2MMNA 1Y6EA 5F0GA 1X5EA 1GUMA 2C3QA 3W8JA 1TW9A 2NTOA 4J2FA 4O7HA 1TP9A 1J0FA 5KN1A 2GQMA 5ELGA 2JU5A 5E4WA 5GZZB 2J9HA 1EEMA 1ERVA 2H30A 3H79A 3MWHA 1USBA 2CX4A 4NV2A 1EV4A 1UA5A 3QFAC 4KDXA 4IW9A 1SYXA 3G7YA 2R3XA 4L5LA 1K0AA 1IYIA 2DLXA 1GL8A 1EP8A 3DGQA 1YF0A 5ID2A 4TVEA 2DIZA 4ZBDA 3ZIVA 3HY2A 14GSA 1THXA 2PVQA 5FWGA 1BJXA 3GKKA 2FD3A 4I2UA 1AW9A 4CDOA 2GGTA 1K3YA 1A0RP 2O8VB 2L6DA 4OO5A 3L78A 3S9FA 5HR1A 2LTKA 4GF0A 5B8AA 3VI7A 4IGJA 5KN0A 1YDKA 5H5SA 1R5PA 1FB0A 2F51A 5F05A 3HVSA 4KSMA 2DJ0A 4Q5QA 4L0WA 2AHEA 4XS6A 4RQXA 5DBQA 4ZILA 1SD8A 4ML1A 4ZL8A 3EVIA 2H0GA 5DAKB 5CREA 3TJGA 2LJRA 5C04A 1XZOA 4MCUA 2XHFA 2QKEA 3SWLA 5GAPD 1V57A 1YF1A 1ZCPA 2FLSA 4HQZA 3UEMA 1TXXA 5G31A 3BJ5A 3IR4A 3PH9A 4N0VA 1GSSA 1ZYQB 2P31A 1R7HA 3GL3A 2H72A 3GN3A 1A8YA 1EOHA 1SYRA 2O89A 3I6AA 4G2EA 4MMMA 4Z7XA 2YJHA 1O85A 2R2JA 3IAS2 1SU9A 4MPFA 1PQNA 4OFTA 1G6WA 5E59A 1GUHA 5AIXA 1M7TA 2LNTA 1A24A 3CSJA 1B8XA 1NW2A 4F03A 4DSQA 5CRWA 1BYEA 2V6KA 4HI7A 4PURA 1CQHA 4HQSA 5D96A 4KW6A 2K6VA 4NMUA 2LNSA 4QQ7A 1ZMAA 4OCFA 4DVCA 3CSHA 1GLQA 3GH9A 1PL2A 4I8BA 1A0FA 3RPPA 3F0IA 2FCHA 18GSA 1AUCA 2B1KA 1URMA 4WR5A 1O81A 4BA7A 3PGTA 5IMVA 1Z6MA 4N11A 1B48A 3CBUA 4MJBA 2OA7A 1JZOA 2GZZA 5ELAA 4X0XA 1ZL9A 4F82A 4ACSA 3RHCA 3GKMA 1FO5A 3TKSE 1K0DA 2CQ9A 3QAGA 5ECQB 1QXHA 3PR8A 4Q5RA 1YY7A 1U3AA 1GH2A 4OD7A 3DEXA 2VD0A 2G0FA 1X5DA 4CW9A 2WULA 1HNAA 2OJLA 4ZBBA 4ZIJA 2JACA 3FK8A 2F9SA 2NBSA 4IKHA 3DD3A 3KZQA 1WWJA 4KSOA 2K8VA 3DIEA 5A4VA 2HI7A 2VCZA 1XCCA 2H76A 8GSSA 5J9BA 2YV7A 4F0CA 4I97A 1ERWA 3IPZA 3VI5A 5G1LA 11GSA 2OBIA 2MMOA 4NPBA 1XPVA 3VWVA 1R26A 4KGIA 1FHEA 1V40A 4N0ZA 3GKXA 2I1UA 2OBKA 5COHA 1TK8B 1Z7PA 2XBIA 3GL5A 3F9UA 4ILFA 1YQ1A 3QFBC 1IYHA 2IPAA 3FRCA 2QC7A 1AC1A 5LD0A 4WR4A 3GMFA 5G1KA 4MLYA 5G30A 4ZXGA 4EL1A 1M99A 1XVWA 1TTZA 2K8SA 4LLRA 4GSSA 2N5AA 3WT2A 1JHBA 4K0GA 3DRNA 4HZ2A 1TRUA 1O73A 2WZ9A 4XRDA 2AUVA 2ON7A 5F8BA 1GTBA 4ECJA 4ECCA 4X1UA 4MDCA 1AXDA 4KDUA 1FVJA 2RUEA 1WRYA 2CVKA 3E0UA 2KUCA 3ERFA 2FWGA 4AF2A 4YQVA 3SBCA 1OC9B 1RW1A 4DSRA 2MZCA 5AIVA 1BQ7A 1K0MA 3TRXA 3LORA 2M72A 4HJMA 3J7Yb 1JZDA 2DIYA 2E7PA 1EZKA 2BMXA 1W4VA 4V2LA 1AQXA 2DMLA 5HFIA 2F3MA 5L71A 1EEJA 3GFKA 2HLSA 3HJOA 1GSDA 5D8IA 3KMNA 1TI1A 5IO0A 1R4WA 1EOGA 2C0EA 4MZWA 5INYA 2VUPA 1KBNA 4K2DA 2AYTA 2P0GA 2P5RA 1G6YA 3DWVA 1T4YA 5F07A 3M3MA 2FUG2 2KP2A 2VLTA 1YJ6A 3LEFA 3KD0A 1VGLA 1GSFA 5J9CA 3KGKA 1DE1A 2E2MA 4PQ1A 4K7OA 4GQCA 3O3TA 5A4UA 2KP1A 1TJDA 1BEDA 2VL2C 3UVTA 4JR6A 5CRDA 5HR0A 5AN1A 3TRPA 4GRFA 4JRRA 3L0HA 4WBJA 2V32A 4TKYA 4E8EA 4MF7A 4V2NA 3DMLA 1SJIA 5EL8A 4GWRA 3WT1A 3HYPA 5ECSA 1WP0A 4I2TA 1KTEA 1HNCA 4O5RA 3GX8A 2V2GA 3E3EA 6GSYA 2AB6A 1RK4A 1PN9A 3EU3A 2HRFA 2KOKA 1HNBA 1NHYA 2IL3A 1SJ6A 4IQ1A 5CNWA 2WB9A 2YN1A 2YWOA 3UBKA 3ISOA 2VCVA 2HZFA 1GWCA 1NM3A 1JFUA 2QGVA 4TR0A 2H01A 1X9WB 4POBA 2M80A 3FKFA 4K7IA 2RM6A 2HRNA 2LRCA 3DVWA 3Q6OA 1X9MB 3D4MA 3VFIA 1XOAA 1VF4A 2IFQA 4XS4A 2VL3A 4IJ3A 1LJRA 2VIMA 4KUNA 2H6XA 5G5FA 1T7PB 2HZEA 3FZ9A 1T4ZA 3O6TA 1K0CA 1PKZA 3LXTA 2FWHA 1A23A 1TK0B 2HE3A 5D9VA 1OKTA 1Z6NA 4PNFA 3LQ7A 6GSSA 2GTUA 3TKSC 4WKWA 1GULA 2OKAA 4ZB9A 1ZGNA 1V98A 5ECLB 1YKCA 1GP1A 4BVXA 2VM1A 4WXTA 2GLRA 2DJ3A 3FZ4A 1F37A 3LFLA 2DJJA 1XWGA 3CRTA 2LJKA 3D4TA 1THOA 4BWSA 1Q4JA 2ES7A 3M9KA 2GSQA 2RUFA 1TKDB 5J41A 1TOFA 3I9V2 3TJBA 5ECRB 3TKSA 1PMTA 3EE2A 4TN8A 1XBSA 5DQSA 5IMAA 2P5QA 4X43A 5F06A 1TI3A 1JZWA 4Q5FA 3P90A 3VPQA 3N9JA 1T3BA 4MABA 2CVDA 3IBHA 2YP6A 4XCSA 3KEBA 2EC4A 1K0OA 4GSTA 4DEJA 5G2ZA 1JLVA 1YZXA 2GVPA 1PX7A 1OE8A 2REMA 1B9XC 2WJUA 1DUGA 2PVOC 5IMCA 4XS1A 1K3OA 2K18A 2AJQB 4G10A 3FY7A 4KCAA 5EPFA 3KH9A 2G2QA 3FR3A 1TU7A 2LRNA 4MP4A 3BD2A 5JCUA 1MDKA 1ZZYA 4K9ZA 5DCHA 3F4RA 2B7JA 1KEBA 4I5QA 5J5NA 1O8XA 6GSWA 2VM2A 3TKRA 3HZ8A 4KAEA 4WBRD 2CT6A 4J57E 1N8JA 4FYBA 5GSTA 2HSHA 2LSTA 3HJPA 22GSA 3TGZA 2MMAA 3WGEA 4K0NA 2WCIA 1E2YA 3C7MA 3HD5A 2ZNMA 1WPIA 5D73A 10GSA 4D73A 5CAXA 2NVLA 2IFQB 4KE3A 3TUEA 3WYWA 3ZREA 5IMFA 2OE3A 1J9BA 3FEUA 3HXSA 5DQYA 3KM6A 3NIVA 3Q74A 1FW1A 5HQPA 2CX3A 4PQIA 3GSTA 3US3A 4HEA2 4I6XA 4POMA 2HYXA 3CYNA 1ABAA 1V58A 4K1FA 3G7JA 3UBLA 5LCZA 3EMXA 1VF3A 2FHEA 2WGRA 2EIOA 4PGTA 3F6DA 5HFKA 2L59A 3IOSA 2RLIA 5CO3A 3FYGA 1F3BA 2TRCP 1QUWA 2O85A 2A2RA 2LV3A 4OWYA 3GURA 2HSYA 1FG4A 13GSA 4L5OA 4WF5A 4TR3A 1HQOA 5ID2B 1I9DA 5AISA 4IJIA 3GH6A 4TR1A 2GSSA 2H8LA 2IWTA 3H4KA 3F4SA 2IMIA 4P3YB 1JLWA 1K0BA 1FB6A 4POKA 4XIHA 3IK9A 2VOCA 1WE0A 5B7CA 1UVZA 4EVMA 2JL4A 2DJ2A 3GA4A 2M46A 1PA3A 2DC5A 3QOUA 1YEPA 2VLVA 4E8HA 3F6FA 2YWNA 4GSNA 5CRHA 4ZL7A 3KH7A 1GSUA 1M0UA 1UC7A 3GTUA 3ZFLA 2EIQA 2WFCA 1WMJA 3MAKA 3LGCA 3HVVA 2VCWA 5ECKB 3FZ5A 3GIXA 3LWAA 3C1RA 2H6ZA 3WGDA 2X64A 2DMMA 2C0DA 3DYRA 2WDUA 3ZVJD 2JADA 2CAIA 4IBPA 2C8UA 1F3AA 3VURA 1LU4A 5H5QA 3FHKA 2YCDA 4ID0A 5C00A 4TXVA 5ABRA 3ZMLA 2H1AA 2LQQA 2VO4A 2VCXA 1KNGA 2R37A 4LA1A 4N30A 4MJAA 2X8GA 4WF4A 3LSZA 2O7KA 3U5RE 4IELA 3KTLA 1XW6A 1XOBA 2GDRA 3IDVA 4IP1A 16GSA 3EWLA 2I3YA 4IHUA 1MDJA 2A4VA 3LYPA 2I4AA 5IO2A 1WIKA 1SKRB 1CQGA 3ZITA 3ERWA 4OMVA 2XPDA 3IC4A 3UIWA 12GSA 4ISDA 2PWJA 4LL4B 4PX1A 1O7UA 2OADA 1OVNA 2XBQA 1F2EA 4KX4A 3C1SA 4K8MA 1XWAA 1OE7A 5IOXA 1EP7A 2AV4A 2V6OA 2LS5A 4YQMA 4AGSA 1T1VA 9GSSA 7GSSA 1M2AA 1A2MA 2IJYA 3OR5A 1PX6A 2H75A 3GHAA 3ZTLA 1LBKA 2H1GA 4GXZA 1QGVA 6GSVA 2H19A 1AQVA 1G7EA 1ZYEA 2QSIA 2VD1A 3KP9A 1EGOA 1GSEA 2B5YA 5IMDA 2VCQA 4TR1B 2DJ1A 2IIYA 1SK0A 4NHZA 1M2DA 1OC3A 2YWIA 1NSWA 3GUSA 3DXBA 5D9TA 3TKQA 4HDEA 1GUKA 6GSUA 3PINA 4ZB6A 3CMIA 2V41A 1X5CA 4AJ7A 2GZPA 4V1Ap 3TB2A 1NHOA 3DVXA 5JWRB 2YV9A 1GNWA 5ENUA 1M9AA 5G5EA 2B6MA 2C3TA 3UVHA 3H1NA 1XW9A 1DSBA 2I9HA 3QD9A 2C0FA 5GAND 4KH7A 2FWEA 2LRTA 3EU4A 1EWXA 3C71A 3GTUB 2PPTA 3P2AA 17GSA 2VLUA 1RQMA 3K8NA 1A2LA 6GSTA 4EC0A 1XFLA 3VWWA 4IP6A 3WGXA 3KP8A 3QDNA 3VPTA 2IMFA 2HXKA 3W6GA 1U3IA 1Z9HA 4ZL9A 4GCIA 1XWKA 2YZUA 3M1GA 4LMVA 2C80A 1XW5A 1Y25A 2WRTA 3ZL5A 2VL2A 3BOAA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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