5IPHA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - c84s mutant
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGCTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFSAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 51
structure length 157
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5iphA00
2L5OA 2XC2A 2ON5A 3KH9A 1TTZA 2GLRA 4MJCA 3UAPA 3CTFA 4OMVA 1MDJA 5ID2A 3LYKA 4G10A 4PQHA 2X8HA 3A2XA 5CRGA 2VL9A 2ES7A 1ZCPA 2TRXA 3L78A 3WT1A 5JWOB 3GTUA 1HYUA 1GSQA 2YZUA 4KE3A 1SK2A 3APQA 4D73A 1EEJA 1WMJA 4ZBDA 4XIHA 2VO4A 2M72A 4MCUA 1QQ2A 2G0FA 4OFMA 2B5XA 2AJQB 1SK1A 3CTGA 4J57E 1PA3A 1TRVA 5ECQB 1U3AA 2VCTA 3LYPA 1G7OA 4NXIA 5G31A 4KDXA 4IJ3A 1TJDA 2YNXA 1O7UA 3U5RE 4KCEA 1FOVA 3TOTA 1SENA 3E0UA 1JZDA 1YDKA 2VCVA 4O92A 3ZRDA 4DVCA 2PBJA 1PL1A 2A2RA 2HRNA 1SJIA 4ACSA 1ERWA 4I6XA 5J9BA 4XCSA 2L5LA 2PVQA 3UOMA 2R5GA 3QD9A 4XS4A 3D4MA 4F82A 3KIJA 2ZNMA 5AISA 1B48A 2J9HA 3KTLA 3VURA 5ELAA 5DQSA 3LXTA 3TKSC 2B5EA 4RI7A 4DSRA 4MMMA 3VK9A 2JZSA 4I97A 4NHWA 3ERWA 2YV9A 1JHBA 3RAZA 5IPHA 5EY6A 4L5OA 1H75A 5JCGA 2DJ0A 1BYEA 4DEJA 2OJLA 4O32A 1FB6A 2CX4A 4FIWA 2NTOA 4ZBAA 4KA0A 4WETA 5H5QA 1IYIA 1THXA 4HZ4A 3TRQA 2EIOA 2VM2A 3D5JA 1ZGNA 1USBA 1R5AA 3UBLA 5IMAA 1ERVA 1ZZYA 4ZBBA 1TU7A 6GSVA 3QAVA 2CX3A 5J9CA 2K8SA 4HJMA 4IS0A 2OE0A 3VPQA 2WZ9A 3ZREA 4X0XA 4CW9A 2XPEA 2YWIA 2ZUPA 3RPNA 1GSFA 4HDEA 2CV4A 1SJZA 3IDVA 3KTBA 5DDLA 3HVSA 3TKSE 4N0ZA 4KUNA 5J41A 1Q98A 2IMDA 2HNLA 1EWXA 1GRXA 4MH2A 3UBKA 4N0VA 4ID0A 2IWTA 2RIIA 1FB0A 1NHYA 4KW6A 3HJPA 1GUHA 4F0CA 3ZMLA 3M8NA 3GH6A 3ZYWA 4G9HA 3RBTA 3ZFBA 4ILFA 3CSIA 4K7IA 1GTUA 4ECCA 1R26A 1HNCA 3W8JA 5H5SA 2WFCA 1RQMA 1A0FA 1GLPA 2LTKA 1GSYA 6GSTA 1YF0A 4MF5A 5ECRB 1Q4JA 2V2GA 4KDUA 3GX8A 3WGXA 1GULA 1M2BA 4G2EA 1BQ7A 1JFUA 4YQVA 2R37A 2KUCA 2BJXA 2OBIA 2HZEA 1A2LA 2B7KA 3HXSA 5EVOA 4MA9A 3TKSA 3UMAA 3K8NA 5ECKB 1BX9A 4HOJA 1TI3A 3GL5A 2VM1A 4Q5QA 4MDCA 1XOAA 2K8VA 1SL1B 2YJ7A 4DSSA 4XRAA 1ILOA 4WBRD 9GSSA 1BG5A 3GSSA 1YKCA 2YZHA 2DMLA 4GSTA 2IMIA 5FT3A 3DRNA 4HS1A 4RUVA 1QK8A 1M2AA 2VAFA 5DJLA 3VI7A 3RDWA 5DALB 2D2ZA 8GSSA 1YJ6A 5E4WA 2GTUA 4KX4A 3ZLPA 4TRXA 3IR4A 1FHEA 5G30A 1YQ1A 2ON7A 3FK8A 3CSJA 1JLWA 1GUMA 3ZZXA 2OKAA 4K6XA 1Z6MA 2N5BA 2H71A 4IN0A 2H73A 1PD21 4XHMA 4OCEA 1XVWA 3IV4A 1UN2A 3GL3A 2GDRA 5J5NA 2FA4A 3TB2A 4PNGA 3TCOA 3GV1A 3HY2A 1GL8A 3ZVJA 5ECLB 3TRXA 1Z3EA 4J56E 3QCPA 5A4WA 4N11A 5G2ZA 3UL3A 2N5FA 4DSQA 1I5GA 4HU9A 4K9ZA 2PUKC 1FG4A 1CQGA 4IP6A 2F9SA 2KP1A 2AYTA 1JZOA 3EYTA 5IMDA 1EP7A 1MD3A 5AGYA 1FW1A 2VLVA 3WT2A 2H0GA 4TR1B 3FEUA 5AIXA 2MBSA 2MMNA 2L57A 1A8LA 5CO3A 2JSZA 3SBCA 2A2SA 4EL1A 4POLA 1U88A 5F06A 2CVKA 1GTIA 5B8BA 3JCML 2REMA 2YWOA 3D0ZA 1XPVA 2NDOA 1IYHA 1N8JA 2E2MA 4CHSA 6GSWA 3J7Yk 2FWEA 2B1LA 1HNAA 4GCIA 3TJFA 3KD0A 2PN8A 3L9VA 3BD2A 5LNKe 4ZB6A 2GZYA 1SKRB 1EOGA 3EE2A 2DJJA 1AQVA 2H66A 1A0RP 1TK5B 2DBCA 3EINA 2IN3A 1V58A 1MD4A 3C73A 2CZ2A 2LJAA 1AQWA 2TRCP 1K0CA 4WBJA 6GSYA 5KN0A 4F03A 2V1MA 4AJ6A 2LQQA 2FWHA 2H19A 2O85A 4X43A 5J4UA 1K0DA 5IQYA 2IPAA 3F3QA 3F0IA 1TRWA 3FY7A 3EC3A 1UA5A 4I5QA 5J3RA 3ME8A 5ECMB 2E7PA 1FAAA 2KOKA 2RUFA 3NOFA 4ECJA 4OD7A 3VPTA 4TR4A 3S9FA 4PGTA 2MBTA 3GH9A 2C3NA 3MAKA 5IPGA 3HCZA 2C80A 4IELA 1F2EA 1ZL9A 2WGRA 3WGEA 3TJBA 3FR9A 1PRXA 2R2JA 3QOUA 1WP0A 4XS6A 2VUPA 1ZOFA 3GURA 1SKSB 2VLUA 1M99A 3FR6A 3RHBA 3EWLA 3HJOA 2H76A 2H01A 5CYYA 4OO4A 13GSA 4AGSA 1NSWA 3D6IA 1GWCA 4O5RA 1O6JA 2WJUA 3QFBC 1O81A 4NV5A 4NV2A 4BPYA 5L71A 1E6BA 3C1RA 2H6XA 2FWGA 3WD6A 3GYKA 3QR6A 3HYPA 1EV9A 4Z7XA 3GX0A 1QUWA 1E2YA 2CAQA 2P0GA 4KDYA 2PERA 1I9DA 5B6MA 4OWYA 2LS5A 3CBUA 2HXKA 1VGLA 2GZPA 1KNGA 1MEKA 2PWJA 1PGTA 4L0UA 2Z9SA 1LU4A 1YEPA 3P90A 3UEMA 4EC0A 2VLTA 3C1SA 3LQ7A 1FO5A 3UVHA 2V6OA 2BMXA 4OO5A 1O8XA 1DE1A 1PX6A 5CP1A 4GQFA 5CAXA 1GTAA 3Q6OA 2WB9A 5ECNB 2OE3A 4LL4B 3NIVA 1EGRA 4ULXA 4HI7A 1XW5A 3WYWA 4XS1A 4TVEA 1SKWB 3BBYA 5A4UA 3GKMA 4PQ1A 4MK3A 1EGOA 4HJ2A 1TOFA 2YWNA 1SJ6A 4OFTA 2LRTA 3KEBA 4G19A 1AQXA 2QGVA 4LA1A 1PMTA 6GSXA 3BJ5A 4MF6A 1QMVA 3BOAA 2C1YA 3DKSA 2FHEA 5IO2A 1A8YA 1O85A 1M9AA 3LEFA 2H6YA 3IAM2 3L4NA 2PGTA 5D8IA 3LFLA 3FR3A 1NHOA 2F3MA 1PN9A 4HQSA 3P2AA 4PX1A 2B1KA 4V2NA 3GKXA 2HRFA 4OFNA 2YJHA 1OAZA 2B5YA 2I4AA 3VLNA 5G5FA 1PQNA 5HQPA 2ZCTA 2O87A 1W4VA 4K2DA 4EKZA 5GAPD 1XWCA 3GN3A 1F3BA 1S3DA 3QPMA 4TR0A 5CRDA 3A2WA 3KCMA 4XRDA 1V57A 3Q74A 4IJIA 3QFAC 3ME7A 2C4JA 3L0HA 2DIYA 2DC5A 4TR1A 3LG6A 1M0UA 2H74A 2GQLA 1K0BA 1WPIA 2YN1A 1M9BA 4ZIJA 2J23A 6GSSA 5DAKB 1FVJA 3GSTA 4BL7A 3LWAA 2HZFA 2E2GA 1WRYA 2DMMA 4LMWA 1G7EA 17GSA 2NVLA 2C3QA 2ALBA 3CYNA 5LCZA 3EMXA 1TU8A 3E9JB 1VRSD 4K8MA 3CRTA 3ZIVA 1XWKA 2CVDA 5COHA 3CSHA 5D9VA 1K0NA 2LKUA 3M0FA 5DBQA 3HKRA 4QL7A 3NZNA 1Z7RA 3O3TA 4F2IA 4MJAA 4TXOB 3H4KA 4KH7A 2MMZA 4GSNA 2DLXA 2VCQA 5KN3A 5ECOB 2FY6A 3ZIJA 3U6VA 4IGJA 3UARA 2H70A 1O8WA 2XPDA 2JADA 1WE0A 1PL2A 3ZITA 3ZMKA 1AXDA 4WEYA 2YOIA 3EU3A 2C0EA 4YAVA 1VF1A 5KN1A 4LMVA 3W6GA 2OADA 3HHVA 4ISDA 3P8WA 4GSSA 5A5KA 3CMIA 3F4SA 5INYA 2VCWA 5IIZA 1ERTA 3AY8A 3GMFA 3QDNA 3QAGA 4PXOA 2NBSA 3HA9A 4E8HA 3QAWA 5CRWA 3V1WA 4BVYA 1RK4A 1YKAA 5IO0A 4MJEA 3GIXA 1J0FA 2HYXA 5H5RA 2IL3A 2CVBA 3A2VA 3G7IA 4V2LA 1LJRA 4AJ8A 3G7JA 1T4YA 3VWVA 2LNTA 18GSA 2LQOA 2DJ3A 4Q5FA 5AN1A 2H1BA 1BJXA 1V40A 1UVZA 2C8UA 1A24A 5KEJA 1MTCA 3FKFA 3DEXA 22GSA 2JSYA 1U87A 1SK0A 5IMCA 1M7TA 1OKTA 4PUAA 1XWGA 3BCIA 4GQCA 4FYUA 4WF4A 1GP1A 4WXTA 5ID2B 4NMUA 4ZB9A 5HFGA 2DIZA 2IMEA 1TRSA 1AIUA 1THOA 2HLSA 3GHAA 2B3SA 3EURA 4MJBA 3DIEA 2L4QA 3RHCA 2FA8A 2RM5A 4D73B 5D93A 2IFQB 2GQKA 1GSSA 2VCZA 2TIRA 3TJKA 1NW2A 3H93A 2FCHA 2H0IA 4L0WA 3HVVA 3RPPA 1YEXA 2PVOC 3HZ8A 3I43A 1PSQA 3KGKA 4JU5A 1WWJA 3FZAA 3EU4A 5JWQB 4IQ1A 4JZQA 2MZCA 5HFIA 3FZ4A 2MMAA 1EZKA 1A23A 5GAND 2WS2A 1S3AA 3VWWA 2XHFA 4O7HA 1GUKA 1WOUA 1EP8A 1W89A 1TRUA 1QXHA 1YY7A 1QFNA 2P5QA 1T7PB 4K7NA 5D73A 2EIQA 5CNWA 2GZZA 2HI7A 3PGTA 1XXUA 4F9ZA 4XS4B 2MYGA 2GVPA 4PNFA 4ZL8A 1X9MB 2GT5A 2KHPA 1RW1A 1JZWA 1TDIA 2FWFA 1X5EA 2C3TA 1A2MA 2YCDA 3TOUA 4OCFA 1KEBA 3C71A 4KSOA 3HZ4A 3F6FA 4ML6A 3KP9A 4WF5A 2VD1A 3MWHA 3FZ9A 4BA7A 2P31A 1U3IA 2PU9C 2GSRA 14GSA 1Z6NA 4ECBA 3M9JA 1DSBA 4JBBA 3SWLA 2O7KA 3TJGA 1XWAA 3IAS2 4RQRA 4EDYA 4YQMA 2PMTA 19GSA 4EUYA 1N2AA 1SD9A 4EXJA 1X9SB 2V6KA 4IQAA 4K7OA 1R7HA 1V98A 2X64A 2XBQA 3VI5A 2RLIA 1XZOA 5LD0A 1YF1A 3M1GA 2X8GA 1A2JA 2JZTA 3FRCA 4HEA2 5DQYA 3US3A 2OA7A 2DJ2A 3VFIA 4QL9A 4EF0A 2I3YA 3GFKA 2LEGA 1T3BA 3IBHA 5G1KA 1WIKA 3I9V2 2AV4A 1F6MC 4TKYA 4K1FA 4Q5NA 5ELGA 1R5PA 1G6YA 3IK9A 5G5EA 1ACVA 3J7Yb 1T00A 2DSAA 2GGTA 2JZRA 3VWUA 2PPTA 3HVXA 1ZYQB 3LXZA 2F51A 2G2QA 1H4OA 1SD8A 1F9MA 3GRXA 3LGCA 3HDCA 5AIVA 2YWMA 3C7MA 1B9XC 4AJ7A 5HR1A 5F8BA 1GH2A 2I9HA 4BVXA 3DVXA 2AB6A 4RQXA 4GTUA 7GSSA 5D9WA 1TI1A 4HU7A 4N10A 3P7XA 2DJKA 4I8BA 1Z5YE 1X0RA 4MZBA 2HZEB 2JACA 1TK8B 2OBKA 2AHEA 1FVKA 2BTOT 3A5WA 2OE1A 3F6DA 1Y6EA 1B8XA 3TRPA 4J2FA 3PINA 1TW9A 2RM6A 3MDKA 1AC1A 5DCHA 2H75A 5ECPB 3C8EA 5DCGA 3OR5A 4CDOA 3TKRA 1O73A 2HE3A 1ZYEA 4TOPA 5DALA 4ZILA 4GLTA 2QC7A 3ZTLA 2MMOA 4MZWA 1EV4A 2CT6A 2K18A 2X99A 3F9UA 1TK0B 1B9YC 4TW5A 1K3OA 2IFQA 2AUVA 1XFLA 3KJYA 5CRHA 1MDIA 2C0FA 2F8FA 4GF0A 3KZQA 3H8QA 1DE2A 3HD5A 1OYJA 2H1GA 3L9SA 4PQIA 3DGQA 3EMPA 3KM6A 11GSA 3TKQA 2LRCA 2LV3A 3I6AA 4HZ2A 1OVNA 2K9FA 5FWGA 2HT9A 1PKWA 4FYCA 4JEDA 5HR2A 4K0GA 5HR3A 1V9WA 4JR6A 2WDUA 3M3MA 2CQ9A 3FYGA 2O8VB 2A4VA 3D21A 2X8CA 5GSTA 5G1LA 3IK7A 5A4VA 2R3XA 3APSA 4GWRA 3ZFLA 5HFKA 1GTBA 1T4ZA 3GKKA 4HQZA 1URMA 4XTSA 4YAPA 1AW9A 1PKZA 5D9XA 1XW6A 3TUEA 2V41A 2I81A 4FYBA 5CREA 4MH3A 1DUGA 2LJKA 1OE8A 2WULA 2GSQA 4GXZA 2R4VA 1OKDA 2YANA 1TP9A 3LJRA 3CXGA 5ECHB 2C0GA 4EVMA 2GSSA 4N30A 5C04A 4EO3A 4P3YB 3IHQA 1XW9A 1OC9B 4MP4A 1XOBA 1SU9A 5B7CA 2FNOA 3IOSA 5C00A 3DYRA 2EIRA 2LNSA 1B4PA 2IJYA 2KLXA 3F4RA 2WRTA 3LORA 4I2TA 3TDGA 5ECSA 5JCWA 5IOXA 3GNJA 2YP6A 2H0HA 2YPMA 4WR5A 1LBKA 2H1DA 1OC8A 5ENUA 1GLQA 4POKA 1U6TA 4X1UA 1OC3A 1HNBA 3UJ1A 2QKEA 3ERFA 3GKNA 3KMNA 3DXBA 1AUCA 2DJ1A 5JCUA 2RUEA 3DMLA 4V1Ap 3IPZA 1MDKA 5F0GA 4QQ7A 1J08A 1M2DA 1PX7A 1T1VA 1JZRA 1XVQA 2CAIA 2VD0A 4ECIA 1X5CA 1DBYA 2IMFA 2JL4A 2VIMA 5GZZB 1HD2A 2WCIA 2F8AA 2V32A 4NWYA 4E8EA 2B6MA 2LRNA 4WKWA 4KB3A 4PURA 5IM9A 2CA8A 3KXOA 3G7YA 3CRUA 3KMOA 4ZB8A 1TKDB 4IW9A 4V1Ag 1J9BA 3Q19A 4IKHA 2L4CA 3IE3A 2XBIA 2GSTA 4IP1A 4POBA 4MPGA 1Z9HA 2AAWA 2CZ3A 4F0BA 16GSA 4GRFA 4YH2A 5D9TA 3D22A 1CQHA 4KSMA 4L8EA 1TXXA 1XCCA 3G9BA 5FHIA 1VF3A 1ABAA 1ZMAA 4JE1A 2VL2C 1WJKA 3FZ5A 3GTUB 1GSDA 2L59A 3N9JA 3ERGA 4IBPA 4ML1A 3O6TA 1C72A 2HSYA 2IMKA 1KTEA 1XIYA 4KNDA 1SYXA 2NPBA 5EPFA 3M9KA 4TN8A 1ERUA 4JRRA 3KH7A 1VF4A 3APOA 1QGVA 1K0AA 2VL3A 3W8SA 3IA1A 1XBSA 1GSUA 3LSZA 3DWVA 3IXRA 3H1NA 2M80A 2GQMA 3TJJA 2H72A 4PUFC 3IRAA 20GSA 4BWQA 2VCXA 1BEDA 2JU5A 5ABRA 1G6WA 1UC7A 5GSSA 3ED3A 3PH9A 3UVTA 4V2MA 1HQOA 2KP2A 4LL1B 2GS3A 1YZXA 1F37A 3GUSA 5E59A 3TGZA 2IIYA 2H1AA 5D96A 2B7JA 1V2AA 3PR8A 4ZL7A 4EE0A 2FUG2 1X9WB 5B6NA 3F63A 4IHUA 10GSA 2LUSA 3QMXA 3D4TA 5DAKA 3ISOA 6GSUA 1XWBA 1JLVA 4YQUA 1G0TA 4L5LA 2H30A 3WGDA 2OACA 1K3LA 3DD3A 2I1UA 1AAZA 3ZVJD 1B4QA 4KCAA 4MF7A 2C0DA 4HUAA 3TKPA 1X5DA 1Z7PA 2HFDA 2L6CA 4NHZA 5IMVA 2FGXA 5JWRB 3BCKA 1S3CA 4FO5A 4H86A 3H79A 4ZL9A 4Q5RA 1GNEA 1Y25A 1ON4A 5IMZA 1OC9A 3L9UA 3R2QA 4TXOA 4LLRA 4TR3A 2VL2A 1EEMA 2E0QA 4RI6A 5DJMA 2M46A 5EL8A 5IOWA 3Q18A 4KAEA 2QSIA 2P5RA 4NPBA 2L6DA 3N5OA 3F8UA 3KP8A 2HSHA 1GSEA 2EC4A 2FD3A 1BAYA 5IMFA 4POMA 2VOCA 4BWSA 2LSTA 2GT6A 3EVIA 2H6ZA 5ECIB 4EDZA 4KGIA 1ML6A 1OE7A 4I2UA 2LJRA 1K0OA 4WR4A 4JR4A 4AF2A 2K6VA 2H8LA 5HR0A 1SL2B 4MPFA 1K0MA 1SYRA 2YV7A 1NM3A 1K3YA 2R6KA 1EOHA 1SL0B 3DVWA 5KN2A 3ZL5A 3F4TA 2O89A 4TXVA 1F3AA 3MSZA 1T8EB 1R4WA 12GSA 4FH8A 5B8AA 4MZCA 3FHKA 3A3TA 2FLSA 3VWXA 3MNGA 4IVFA 3O76A 4K0NA 3UIWA 5F07A 3IC4A 1KBNA 4NAXA 3F3RA 4DSSB 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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