5IPHA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - c84s mutant
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGCTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFSAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
total genus 51
structure length 157
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5iphA00
2PGTA 3WGDA 4HS1A 2VCVA 2LJRA 1IYHA 1S3AA 2IJYA 4HI7A 4BA7A 1YJ6A 1A24A 1K0DA 4NPBA 4O5RA 1MDKA 1YDKA 2P0GA 5J9BA 3LG6A 2MBTA 1PN9A 2M72A 1FOVA 2YANA 3GUSA 4EDYA 3H79A 1SENA 1PX6A 5LCZA 2FY6A 3I9V2 3GH9A 4PNFA 4MF7A 1URMA 2PN8A 5B8AA 3M9KA 2DMLA 3DGQA 2WJUA 4YAPA 12GSA 1V57A 5H5QA 3IAS2 4HJ2A 1NHYA 4OCFA 4V2MA 5F8BA 2YZUA 1YEPA 1ZZYA 3H93A 1TK8B 4OFMA 5DJLA 2I9HA 3GL3A 1PMTA 2TRCP 5COHA 1T8EB 3TKSE 5GAND 3LSZA 2GSSA 3EYTA 4CDOA 2MMOA 4TR4A 1Q4JA 5B7CA 6GSVA 1HD2A 2L57A 2OJLA 1SKWB 4AF2A 4JR6A 2TIRA 2LRNA 4KDYA 2JADA 4HZ4A 2WFCA 4MJAA 4IBPA 2KOKA 1GUMA 4PUFC 5DAKA 1ZMAA 1GUKA 2O87A 1TKDB 4IJIA 3MSZA 4DSQA 4KNDA 4P3YB 22GSA 5EPFA 3GA4A 4I6XA 2AHEA 2X8HA 3F6DA 5D9TA 2GQLA 3OR5A 2A2RA 1XBSA 3DEXA 4POKA 4MH2A 4OO4A 2AAWA 2PU9C 1FO5A 3A3TA 1PQNA 3O76A 2WZ9A 2PVQA 4WXTA 3GL5A 2OE1A 3UEMA 1GL8A 3IK9A 1Z6NA 5CP1A 4WEYA 1ERUA 2AUVA 1IYIA 2X8GA 3HCZA 5IM9A 2B6MA 2J23A 2JSYA 2DJKA 1JZWA 5ECQB 2OE0A 3GYKA 3TRXA 1GSSA 2HZEB 4J2FA 4TR3A 3KEBA 2GVPA 2KP1A 4XHMA 5CAXA 4IP1A 3QPMA 3TGZA 5EL8A 4FH8A 4JZQA 3GTUB 3UVHA 2PMTA 4IKHA 4MF6A 2VLUA 1M99A 4TXVA 1ML6A 4RUVA 1KBNA 3H4KA 2K18A 4V2NA 1G6WA 4YQMA 2CT6A 3F6FA 2JZSA 3R2QA 1OAZA 3NOFA 2LNTA 4F9ZA 16GSA 1ERWA 3RHCA 2WS2A 1MTCA 5AIXA 1TTZA 4PXOA 5ECLB 1GULA 2CZ3A 4NHWA 3IAM2 4IJ3A 1B9YC 14GSA 4K7NA 1VF2A 4NAXA 1O6JA 4TXOB 2N5FA 2GZPA 5DALB 2ZUPA 2LTKA 1WE0A 3WT1A 1Z9HA 3LWAA 2CV4A 3DVXA 1JZOA 2H19A 2YV9A 1E2YA 3G7IA 2VD0A 3P90A 3G7JA 5KN3A 4IQ1A 5FHIA 4KDUA 4O32A 5JCWA 4DSRA 1RW1A 2IWTA 3IK7A 3Q19A 3FHKA 1O7UA 3GH6A 1VF1A 2LUSA 5IMZA 3BCIA 1DBYA 1R7HA 4EC0A 1K0BA 3LYKA 2OE3A 1PA3A 4EXJA 1EGRA 1GTAA 3TDGA 5D73A 4LMWA 2VM2A 2V1MA 2VLVA 1V2AA 5ELGA 1ST9A 3Q74A 1X9WB 5A4WA 3M0FA 3C71A 2B5EA 3J7Yb 4K0GA 2L5LA 4MJCA 2C8UA 4PQ1A 1TU8A 3MNGA 3ZFLA 4IVFA 3VI7A 2YP6A 4E8EA 1GRXA 4JEDA 1FHEA 3C7MA 5ECKB 4LL1B 1AW9A 4F82A 1B4PA 3HVXA 4IW9A 4BWQA 2L4CA 5FT3A 3ZMKA 5IMDA 4G9HA 4KGIA 2WB9A 2HSHA 2JZRA 2H74A 2GT6A 3FR6A 3U6VA 2QSIA 3UARA 5DAKB 3F8UA 1QQ2A 4MPFA 1T1VA 1SD8A 1TK0B 3H1NA 2C80A 4PX1A 4YQVA 2CVKA 3QOUA 2QGVA 3FZ9A 4MF5A 1N2AA 2FWFA 4WBJA 2X64A 3ZRDA 1YQ1A 5A5KA 1M7TA 4L0WA 4TR1A 5IMVA 4GQFA 2B7JA 2JZTA 1EV9A 2R5GA 1A0RP 4F0CA 4N11A 3ZVJA 1N8JA 3FKFA 4POLA 3O6TA 1I5GA 2I3YA 1MEKA 3LQ7A 2TRXA 1LBKA 2REMA 5B8BA 2F8AA 3WD6A 1GNWA 3KXOA 4MDCA 3KTLA 6GSSA 2XC2A 5G1KA 2IMDA 4PNGA 2ZNMA 1A23A 5ECOB 1K0NA 1R5PA 1U88A 3HKRA 3W8JA 3KJYA 3IHQA 4TVEA 5AN1A 1XPVA 3ZIJA 3F4SA 2YJHA 4N30A 3K8NA 2FNOA 2L6DA 1NW2A 1X5CA 5IIZA 3LYPA 1W4VA 2YWOA 1M2BA 4XRDA 3HYPA 2D2ZA 4GRFA 3EE2A 3FEUA 3L9VA 1USBA 2AYTA 1UC7A 1OE8A 3P2AA 1QFNA 5ID2A 1EWXA 2GT5A 2H0GA 3WYWA 3EURA 1QK8A 2HNLA 1F3AA 5DBQA 2P5QA 1QGVA 3DIEA 1ZCPA 4EKZA 2V6KA 1OC8A 1TP9A 5E59A 4ZB6A 2HRNA 19GSA 1RQMA 1XZOA 2V41A 2CQ9A 3ZLPA 1XWCA 4JU5A 4CHSA 2CAIA 1GNEA 5HR3A 2CX4A 4HJMA 5GSSA 5JCUA 1KTEA 1CQHA 1Z3EA 2DC5A 2G0FA 3SBCA 1OKTA 3GNJA 1XWKA 2GLRA 2GZZA 2K6VA 4ILFA 1MD4A 3EU3A 2GDRA 4TW5A 1K0OA 1HQOA 3BCKA 2VL9A 3ZZXA 1AQXA 4ZL8A 3KGKA 1ZYEA 4N10A 1KNGA 3PGTA 3C8EA 4GCIA 2FUG2 3KMOA 2LQQA 1K3YA 5KN0A 4LL4B 2H1GA 2BJXA 1TJDA 3FW2A 4MZCA 5F07A 3TCOA 1SYRA 1YY7A 5DQSA 2GTUA 3IV4A 4ISDA 3TKRA 3LFLA 1GTIA 1TRUA 4OO5A 4IHUA 4G10A 4N0VA 2NDOA 1WIKA 5IPGA 2HSYA 1OE7A 4K8MA 3CRTA 1QXHA 4Z7XA 4ZIJA 1OC9A 4K7OA 1FW1A 3QAWA 3EC3A 4L5OA 4BVYA 3HZ8A 2F9SA 3CSJA 4ZL7A 3TKSC 1I9DA 5CREA 4WF4A 5JWOB 1FB0A 2FWHA 2ON7A 4OFNA 1GH2A 5DCGA 5EY6A 1SJ6A 4ZILA 4H86A 3FR3A 3ZIVA 5HFKA 4ULXA 3TJGA 4YH2A 4TR1B 1PKZA 3P7XA 3EVIA 3IR4A 1X5EA 2RM6A 5H5RA 4Q5FA 1A2LA 4QL7A 5HFGA 2EIRA 4IN0A 3QCPA 1NHOA 2HXKA 4I97A 5LD0A 1X9SB 1HNBA 1SL0B 5G2ZA 1XWBA 2C3QA 2DJ1A 3HJOA 2WDUA 2O85A 5DVBA 1K3LA 4GLTA 5J4UA 3TOUA 3QAGA 4AJ7A 2KLXA 4MZBA 2ON5A 3QMXA 5F0GA 2XPEA 3D21A 4HU9A 2V2GA 3GKKA 3GURA 5DQYA 1XW6A 4ECJA 2A4VA 3MDKA 4I5QA 2LJAA 6GSUA 2C0DA 4GSSA 4POMA 1WP0A 2NVLA 3PINA 4ML6A 4ECIA 4OWYA 3SWLA 1K0MA 3F9UA 2F51A 4ACSA 2I4AA 4KSMA 3GV1A 2WCIA 2H66A 2XBIA 3CTFA 2CA8A 2HI7A 1LJRA 4KA0A 5B6MA 4BL7A 4MA9A 5ID2B 2B5XA 1AC1A 1B8XA 2GGTA 3MWHA 1B4QA 3GRXA 1XW5A 1C72A 1UN2A 1U3AA 3GKNA 1EP7A 4K6XA 1GSEA 2LQOA 4DEJA 4V1Ap 3ZREA 1B9XC 3ME7A 4FO5A 2MMAA 3L78A 3F4RA 2OBKA 1M2AA 1ON4A 4OD7A 5KN2A 1TI1A 2IMEA 4IP6A 1JFUA 4L0UA 3ISOA 1BAYA 3VURA 4JE1A 4AGSA 4BWSA 2B7KA 5G30A 3TJBA 3US3A 4NV5A 2C4JA 3E3EA 3ZL5A 6GSWA 2FA4A 1Q98A 2H8LA 1SL2B 4GSTA 2DJ2A 4WBRD 4XIHA 1YZXA 5D93A 1R4WA 1EEJA 4QL9A 1O8WA 1Z5YE 5CRHA 1M2DA 1GSQA 5D9WA 2R4VA 1H4OA 2C0FA 2R3XA 1EZKA 4ECBA 3LGCA 3N5OA 7GSSA 2KP2A 1ACVA 4NWYA 2J9HA 3G7YA 5AISA 3BJ5A 4KDXA 1PSQA 1TDIA 3HJPA 1GSUA 5IMCA 5F06A 3TJKA 3TKSA 4NV2A 3UBLA 2HRFA 4KAEA 4XS4A 4Q5RA 2I1UA 2KUCA 3F4TA 4KW6A 1EOHA 2VUPA 2YN1A 2YWMA 3IBHA 2CVDA 1V40A 3W6GA 3QDNA 3UIWA 4MPGA 1ILOA 5CRGA 1A0FA 1FVKA 1DSBA 4ZB9A 2HZFA 4MP4A 2ZCTA 2VL2C 2K8VA 3CYNA 4WR5A 4X43A 1U3IA 5IOWA 1OKDA 1OC9B 1WMJA 1GLQA 4KSOA 4JRRA 3CRUA 5HR0A 5HFIA 2DIZA 4POBA 1YF0A 1SK1A 1THXA 1BEDA 3F3QA 1U87A 3J7Yk 2RIIA 1FG4A 1J08A 2N5BA 4GF0A 3CMIA 2EIQA 3APSA 4KCEA 1EP8A 5IMFA 2JU5A 2ES7A 3M8NA 20GSA 1M9AA 1TOFA 1GTBA 4L8EA 3M1GA 2E7PA 2DMMA 3WGEA 4MH3A 3L9UA 4OCEA 2H76A 2R6KA 5IQYA 3A2WA 4MMMA 3D6IA 1SJZA 2V32A 3ZMLA 3RHBA 1YF1A 1W89A 8GSSA 2JACA 2GSRA 3CSIA 4KE3A 3NIVA 1O81A 2NBSA 2FWGA 4ZBAA 2B5YA 2H30A 5ECPB 2A2SA 3RPNA 3AY8A 4DSSA 3GIXA 2VCZA 2PBJA 1X0RA 3M9JA 2Z9SA 4ECCA 2LRTA 2C0EA 1ZL9A 3Q18A 3CBUA 3KTBA 3O3TA 3HA9A 1EV4A 2H0HA 2NTOA 5AIVA 5DCHA 3QFAC 3F3RA 3ZITA 1ERVA 3QR6A 2DJ0A 3KH7A 2CZ2A 3TB2A 1ERTA 4K7IA 3GHAA 4TOPA 2XBQA 3ZVJD 1GP1A 4FIWA 4XS1A 3GN3A 3IDVA 5LNKe 1NSWA 1HNCA 1T00A 2GZYA 2LJKA 3RPPA 1UVZA 1QUWA 3D0ZA 2EIOA 3A2VA 2IFQA 5KN1A 1YEXA 3TJJA 13GSA 2IIYA 2IN3A 4WKWA 1AQVA 1XOBA 4X1UA 2RLIA 1SYXA 2JL4A 3UL3A 3KIJA 1JHBA 1SJIA 3UOMA 4HUAA 18GSA 4KB3A 1PRXA 3G9BA 3UJ1A 4J57E 1JZDA 1Z6MA 2PVOC 2H75A 1O8XA 3EMXA 5CYYA 3VWVA 1DE2A 1OVNA 2H1BA 3E0UA 2VCQA 3DXBA 1VRSD 2VL2A 1GSFA 5ECIB 2HT9A 3HJMA 3HHVA 1T3BA 2IL3A 3ERWA 1OC3A 2H1DA 3KD0A 5AGYA 5J5NA 4XS4B 3QFBC 1SD9A 2BTOT 3WGXA 2H01A 3ZFBA 5ENUA 2WGRA 2H6XA 2L5OA 1VF3A 4WETA 3CXGA 1K0AA 2IMFA 3UBKA 1BX9A 3GSTA 4BPYA 1U6TA 2RUFA 2C1YA 3FRCA 2AB6A 3DWVA 1JLWA 5HR1A 3HVSA 1A8YA 2GS3A 5CRDA 4E8HA 1XWAA 3P8WA 1FB6A 2ALBA 2YV7A 5J3RA 1GSYA 3WT2A 4KH7A 5ECMB 1FAAA 10GSA 1F6MC 3HZ4A 2PPTA 5INYA 4EO3A 4LMVA 5C04A 2VLTA 4O7HA 1K0CA 2RM5A 1AAZA 3KCMA 4EUYA 2L6CA 3EMPA 2X8CA 4K2DA 1TRVA 4FYCA 3PH9A 1GLPA 5DDLA 5ECHB 4OMVA 4FYBA 4MJEA 3A2XA 1MDJA 5G31A 2X99A 4V2LA 4XRAA 3IA1A 5CRWA 2PERA 3GKXA 4K9ZA 2H73A 3H8QA 2CAQA 1SU9A 1ZOFA 5HR2A 4ZB8A 3GX0A 3RDWA 2RUEA 1J0FA 1A2MA 1ZGNA 4FYUA 1GTUA 3BD2A 1M0UA 4DSSB 11GSA 3DRNA 1QMVA 6GSYA 4LLRA 3TOTA 4GWRA 3L9SA 3L4NA 2LV3A 3FYGA 1F2EA 2NPBA 2VAFA 1XW9A 4Q5QA 4I8BA 4HQZA 1PL1A 5KEJA 2FA8A 2E2GA 4MK3A 3A5WA 1PL2A 1XVQA 4IS0A 1WRYA 1CQGA 4GXZA 3GSSA 2IFQB 1V98A 2C3TA 1O85A 1XOAA 5FWGA 2VM1A 2FCHA 1G7OA 1SK0A 4JBBA 5L71A 4MZWA 1TRSA 2HE3A 3JCML 3GKMA 1THOA 4DVCA 1X5DA 2K8SA 3KH9A 4WF5A 5IMAA 3APOA 3EU4A 1TI3A 5ECRB 5ECSA 2OACA 3IRAA 1XXUA 1AQWA 5GAPD 4V1Ag 2MBSA 1BQ7A 1TXXA 4NXIA 1JLVA 5JWQB 3FR9A 2C3NA 4ZBBA 2VO4A 5D9XA 5A4UA 4ML1A 3VWXA 4PQIA 4YQUA 1RK4A 1LU4A 1Y6EA 3IOSA 3VLNA 2GSTA 4MCUA 5GZZB 2DSAA 5DJMA 4IGJA 3BOAA 1T4YA 1OYJA 1J9BA 3HVVA 2E0QA 3KZQA 3ZYWA 4Q5NA 2DBCA 4MABA 3E9JB 3CSHA 1T7PB 2AV4A 2VIMA 2H0IA 5H5SA 4MLYA 3HXSA 2GQKA 1PKWA 4YAVA 1TRWA 1SK2A 3TKPA 4IQAA 2OADA 2H1AA 1K3OA 2F3MA 1WJKA 2LNSA 5IOXA 3VK9A 3FY7A 1G0TA 2C0GA 2VCWA 3IPZA 2VCTA 4HQSA 4EDZA 2MYGA 3LEFA 2B1KA 2G2QA 2FLSA 1MD3A 1TK5B 1H75A 4HEA2 3LJRA 4K0NA 2WRTA 4RQRA 5EVOA 4WR4A 3D4MA 2MMZA 2YZHA 3I43A 4BVXA 2CX3A 2WULA 3I6AA 3IE3A 4EF0A 3DVWA 1XIYA 2DIYA 2BMXA 1XVWA 1Y25A 4KX4A 4I2TA 4GTUA 2R37A 1SKRB 2FHEA 4HU7A 2L59A 1NM3A 1DUGA 3TUEA 3DMLA 3HY2A 1HNAA 2LKUA 5ELAA 2XHFA 1B48A 1BG5A 3ZTLA 1MDIA 4ID0A 4XTSA 4IELA 4LA1A 2KHPA 3TRPA 2F8FA 1PGTA 2MMNA 4TRXA 4EVMA 5CO3A 3KM6A 2FD3A 3EINA 4N0ZA 3N9JA 1XWGA 1JZRA 2IMKA 4TKYA 2YOIA 4RI6A 1KEBA 1WOUA 4KCAA 1V58A 2QC7A 2LRCA 4F03A 2IMIA 5D8IA 3FK8A 1R5AA 1WWJA 1M9BA 3GMFA 2B3SA 5ECNB 1X9MB 4TN8A 3D5JA 3HDCA 4K1FA 1V9WA 3VWWA 1G6YA 4D73A 1TW9A 2YCDA 3W8SA 4GQCA 1FVJA 3C1SA 5B6NA 5G1LA 1XFLA 2OKAA 2JSZA 3TKQA 1EOGA 1F37A 2O7KA 5IPHA 3ERGA 2O8VB 3M3MA 3GFKA 2EC4A 4O92A 5C00A 2VCXA 1GWCA 1S3DA 4AJ8A 5D96A 3I69A 4ZXGA 2YPMA 3DD3A 3Q6OA 2YWIA 3CTGA 2OA7A 4EE0A 3PR8A 6GSXA 1R26A 4F2IA 2LSTA 2DLXA 1TU7A 5ABRA 2I81A 1HYUA 4JR4A 2FGXA 4QQ7A 3D4TA 1G7EA 3FZAA 2QKEA 3VI5A 4PURA 1Z7PA 2GQMA 2VL3A 2E2MA 4PQHA 9GSSA 1O73A 1Z7RA 3IC4A 1DE1A 5CNWA 2B1LA 2PWJA 3ED3A 4RI7A 4HZ2A 1VF4A 1EEMA 3ME8A 3F63A 5G5FA 1AIUA 3FZ5A 4OFTA 3ERFA 3KMNA 5IO0A 2YWNA 3QD9A 3C73A 5IO2A 4EL1A 4I2UA 2O89A 3RAZA 2DJ3A 2H71A 2K9FA 2XPDA 2LEGA 2DJJA 3UVTA 3RBTA 2P5RA 2VOCA 2HFDA 3FZ4A 2N5AA 3KP9A 1BYEA 1SL1B 1AUCA 4F0BA 3MAKA 3VPTA 5JWRB 2H6ZA 1EGOA 2H6YA 1ZYQB 4MJBA 1WPIA 1YKCA 5HQPA 3APQA 3KP8A 1XCCA 2GSQA 4G2EA 3C1RA 2P31A 4ZL9A 3DKSA 2V6OA 2CVBA 3LORA 17GSA 3VWUA 3TRQA 2H72A 3UAPA 2M80A 1T4ZA 2YNXA 1AXDA 4PUAA 3S9FA 1A2JA 2FWEA 3V1WA 3LXZA 6GSTA 1GUHA 3QAVA 2HLSA 3F0IA 5GSTA 2AJQB 3VFIA 4RQXA 2IPAA 4NMUA 5J41A 2HZEA 2YJ7A 5E4WA 2R2JA 5F05A 1YKAA 4G19A 3IXRA 4L5LA 3EWLA 3GTUA 1PD21 3GX8A 3NZNA 4AJ6A 3VPQA 2HYXA 2VD1A 4GSNA 3LXTA 4J56E 1UA5A 2H70A 3DYRA 4XCSA 4NHZA 4KUNA 4TR0A 4X0XA 4PGTA 1A8LA 1E6BA 2PUKC 5G5EA 3HD5A 3BBYA 1BJXA 5JCGA 5J9CA 1VGLA 1ABAA 4CW9A 3L0HA 1F3BA 4XS6A 1SKSB 4HOJA 1GSDA 5D9VA 4D73B 3TJFA 2OBIA 2MZCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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