1SL2 | Genus

Total Genus 28

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	28
sequence length	105
structure length	105
Chain Sequence	KIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase/electron transport/dna
source organism	Enterobacteria phage t7
publication title	Nucleotide insertion opposite a cis-syn thymine dimer by a replicative DNA polymerase from bacteriophage T7. pubmed doi rcsb
molecule keywords	5'-D(CPGPAPAPAPAPCPGPAPCPGPGPCPCPAPGPTPGP*
total genus	28
structure length	105
sequence length	105
ec nomenclature
pdb deposition date	2004-03-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
B	PF00085	Thioredoxin	Thioredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1sl2B00

3R2QA 4EC0A 5C04A 1ACVA 1A0FA 3CMIA 2EIRA 5GSTA 1O7UA 3DXBA 3BCKA 5INYA 1WRYA 2YV9A 2CA8A 2ON7A 4HJMA 2IWTA 2C3QA 3FR3A 2DBCA 2R3XA 3F4RA 2WB9A 5ECRB 1X9MB 2LEGA 4IW9A 2AV4A 1PMTA 1AW9A 2FLSA 1DUGA 1G6WA 1Q4JA 2H75A 3EVIA 3QCPA 1F9MA 1XVWA 5ECLB 3ZIVA 2LJAA 2GZYA 1VF1A 2R2JA 4IBPA 1F37A 3Q74A 5GAND 3PGTA 3N9JA 1EEMA 4K0GA 1J08A 3HKRA 4PNFA 3QOUA 3D0ZA 5HFGA 4K8MA 2AAWA 1PX7A 1Z6NA 3DVWA 3Q19A 2FWHA 1M2AA 5CYYA 4ILFA 5ECNB 3GSSA 2HFDA 1XXUA 3ZMKA 3BD2A 3F0IA 1OVNA 2OJLA 4DSSA 3UIWA 1K3YA 1ST9A 2R37A 2GZPA 5ECIB 4GXZA 4J56E 1FAAA 2BJXA 2C3NA 2JL4A 2VLTA 3APQA 1O6JA 4NPBA 2DIYA 4ZL8A 3ZRDA 5LD0A 3WGDA 4EF0A 3IDVA 4Z7XA 3G7IA 2GQMA 4TN8A 2FA8A 4IN0A 1HNBA 1YF0A 5J4UA 1KBNA 5AN1A 4PURA 5D8IA 4IQAA 1THOA 1SYRA 1JZDA 4TW5A 4HZ4A 2KUCA 4IGJA 2PN8A 4OFMA 1LU4A 2H0IA 2H30A 2VL2A 2OADA 3KH7A 3TRPA 2GTUA 4CW9A 8GSSA 3QR6A 1GSSA 2DMLA 2WFCA 5DALA 4GWRA 1GWCA 4KW6A 5LNKe 4POLA 4ML1A 4IP6A 1IYHA 1V9WA 1K0CA 2HZEB 1TJDA 4I97A 2WULA 5ELAA 2IMKA 2P31A 2VCWA 1NHYA 2WDUA 5ECKB 4JR6A 5CP1A 3E0UA 2B7JA 3GYKA 3LORA 5IIZA 12GSA 3CRUA 4WBJA 3VLNA 3HVXA 1X0RA 3BOAA 2PU9C 1ON4A 4HUAA 2GGTA 1GLQA 3F8UA 3A3TA 3ZZXA 4Q5NA 2VM1A 4PGTA 3LYKA 2H6ZA 4NAXA 3FR9A 4YQUA 1RQMA 5HQPA 5DJLA 5DAKB 5F05A 5GSSA 2D2ZA 1GULA 4PX1A 1PX6A 1J0FA 3P2AA 4DSRA 1MTCA 1JHBA 1EV9A 3DD3A 1VF4A 2NVLA 4NV2A 3L4NA 1WOUA 1AIUA 1NW2A 1OKDA 2CVDA 2P0GA 1GTUA 1M9AA 2R5GA 3GTUB 3KMOA 5IOWA 3UVHA 3ME7A 1ZMAA 2M72A 1R7HA 3AY8A 3C1RA 2ON5A 3KTBA 1TU8A 3IC4A 1HNAA 3I6AA 5IMZA 1NM3A 1E2YA 2CAIA 1GH2A 5ECQB 5H5SA 4F0BA 3Q6OA 1DE1A 4YQMA 2H1GA 4GF0A 2MBSA 2GT5A 3LG6A 3GN3A 5D9VA 3F3RA 3VWXA 2XBQA 5DDLA 1QMVA 3DIEA 2QC7A 1SL2B 3M1GA 3TKRA 2H19A 4N30A 5L71A 3IAS2 5ELGA 3ZYWA 4I6XA 4KAEA 2VAFA 1AQVA 1X5DA 3LGCA 3L78A 3ZVJD 2DIZA 5IO2A 3W8SA 3UOMA 4ECBA 3G7JA 2IMIA 2MBTA 1T7PB 3WYWA 3ERWA 2CV4A 4IS0A 4AGSA 3TJKA 4XS1A 4F2IA 2PVOC 1B4PA 4G19A 2RIIA 1PSQA 1Z7RA 3C71A 2AUVA 1F2EA 4QL9A 3FKFA 4MA9A 3RPNA 4NWYA 2FCHA 2FUG2 3IHQA 3GKXA 2B6MA 6GSVA 3FZAA 5B8BA 1M0UA 3KCMA 3WGEA 1K0AA 2F9SA 5FT3A 5ECPB 1F3BA 2EC4A 1VRSD 2FWGA 1ZCPA 5KN3A 5IQYA 3VI5A 4GCIA 3FEUA 2HNLA 4MABA 4XRDA 4L0UA 4GQFA 5CO3A 2HXKA 2LJKA 1SKWB 5A4WA 3E9JB 3CSIA 3J7Yk 4BVXA 2BTOT 1LBKA 5ECSA 3KJYA 4GSSA 4O7HA 3ZMLA 2IIYA 3C73A 2DJKA 2C0GA 1X5EA 1QXHA 4F82A 2YANA 3LQ7A 2M80A 4K0NA 1HQOA 2EIOA 4YQVA 1B4QA 2AHEA 4MPGA 4WR5A 4XCSA 2YNXA 2VL9A 1SJIA 2JSYA 2PUKC 4AJ7A 1MDKA 4LLRA 1WP0A 4ZB8A 2YCDA 2PWJA 2V6OA 3QAGA 1WIKA 3TJGA 1T00A 5DCHA 6GSXA 2GLRA 1OKTA 2MMZA 4HS1A 3HZ4A 3UBKA 4K2DA 4FH8A 2KLXA 3GH6A 4EE0A 3P8WA 4I8BA 4N0ZA 4KUNA 1AQWA 1TW9A 2FWEA 3LYPA 3D21A 3GX0A 1XVQA 1JLWA 2CQ9A 2OE1A 1Q98A 3IXRA 3C8EA 1BYEA 1ZL9A 3F4TA 3D6IA 3VK9A 1BAYA 2JU5A 2YWIA 3I9V2 3QMXA 1SJZA 4RI6A 4WBRD 1Z3EA 2O87A 3UJ1A 3P90A 1XCCA 5G31A 2L59A 5IM9A 2VLVA 5ID2B 1I9DA 5KN1A 1R4WA 2FHEA 1GSQA 3GKKA 4TR3A 4ZBBA 4E8HA 2FNOA 5DQYA 2A4VA 1U6TA 3DKSA 1K0OA 1XW6A 2REMA 3IAM2 4EVMA 2K8VA 2ZNMA 3H4KA 5D9WA 1USBA 2MMAA 1A24A 1YDKA 4KE3A 3TB2A 4JBBA 2IMFA 3KH9A 4LMVA 1DE2A 1R26A 1ZZYA 2FD3A 4PNGA 3HHVA 1XWAA 2VCQA 1QGVA 2LRTA 1U87A 3TCOA 2LJRA 1SK0A 5KN2A 4MZWA 1C72A 3ZVJA 4X43A 4D73B 4V1Ag 3IPZA 3UARA 3O76A 3DMLA 3GURA 1JFUA 1YEPA 3ZREA 3DRNA 1PL2A 3SWLA 2LRNA 3EINA 4PQIA 2E7PA 4IJ3A 4QL7A 1RW1A 1ERUA 1TDIA 2ALBA 1XWKA 2VLUA 2IL3A 4F0CA 1CQGA 1HYUA 1PD21 2C3TA 2LSTA 2PMTA 2ZCTA 5ID2A 2YWNA 2V41A 4AJ8A 1SKRB 4JU5A 4G9HA 2CT6A 5G1KA 5IOXA 5D96A 2HZFA 2VL2C 2JZSA 4HZ2A 2DLXA 2DJ0A 6GSUA 1QQ2A 5A5KA 3RHBA 2CVKA 4OCEA 2K18A 1XZOA 1AQXA 1PA3A 4K6XA 2LQQA 5HR1A 2OBKA 1H75A 1AUCA 1JZOA 4K7IA 3KXOA 1A23A 3M0FA 1GRXA 1YF1A 1PL1A 1ZYEA 4TR1A 2AYTA 3GNJA 5ECHB 2GQLA 7GSSA 1V40A 3GA4A 2H01A 2DSAA 2YPMA 1WWJA 19GSA 2K9FA 4PXOA 1TRVA 18GSA 3QDNA 1XOAA 5HR0A 5ECMB 4NV5A 1U88A 5ECOB 3C7MA 1Z7PA 3DWVA 2H6YA 2L6CA 4NHZA 1JZWA 3PR8A 1O8WA 1MD3A 4E8EA 5A4UA 3IOSA 3IBHA 5KN0A 5CRHA 4FYBA 3WT2A 5IPGA 2QKEA 2A2SA 4ZL7A 1EP7A 1V2AA 3RHCA 3CSJA 2GS3A 1FW1A 2C1YA 1PKZA 3TRXA 3GIXA 3TKQA 4ECJA 4HQSA 1V58A 2C0DA 3CTGA 3GMFA 4K9ZA 4I5QA 4JZQA 9GSSA 1LJRA 4O5RA 3L9SA 5D9TA 4CHSA 1T4YA 3TKSE 4I2TA 4OFTA 2HRNA 3A2VA 2WS2A 1SL1B 5JCWA 2J9HA 1K0MA 3RDWA 1O81A 3VWVA 5DQSA 4V1Ap 1OE7A 4GTUA 4WEYA 3NZNA 2FGXA 2K8SA 5COHA 5IMVA 1GLPA 2WRTA 4J57E 1TRWA 3EC3A 3KM6A 3WGXA 2O89A 1B48A 2WGRA 4ID0A 1A2JA 4MH2A 3QAVA 3FW2A 1X9WB 3ED3A 3GSTA 3VWWA 1M99A 3ZITA 1Z6MA 2B5EA 5EVOA 2VCXA 2YJ7A 3F3QA 2Z9SA 3QFAC 2CX4A 3M9JA 3D4TA 3I69A 2NBSA 1PGTA 4POKA 2XC2A 5G1LA 2IMEA 4MJAA 4GRFA 1X5CA 2HZEA 1VF2A 1I5GA 1VF3A 2R6KA 2LTKA 5DJMA 4DVCA 4KGIA 1OE8A 3W6GA 1SD8A 2F8AA 2CAQA 4N0VA 1ZOFA 2VM2A 4BWQA 2WCIA 3M9KA 2JZTA 2AB6A 1XW5A 20GSA 3HXSA 5ABRA 5EL8A 2C80A 3HCZA 4V2LA 3CRTA 1RK4A 4K7NA 1AC1A 4BVYA 1MDJA 2WZ9A 5DAKA 4QQ7A 2RUFA 4KDXA 4G10A 1J9BA 3D4MA 3IR4A 2WJUA 3M3MA 5G5EA 4POBA 2H66A 2N5AA 2I1UA 1XBSA 4XS6A 2XPEA 4XS4B 2OA7A 1Z5YE 1YJ6A 2DJJA 1YQ1A 3GTUA 4Q5QA 4IJIA 3PH9A 2HSHA 2RUEA 4JEDA 1YKCA 4YAVA 4PQ1A 2NPBA 2XBIA 5DBQA 5CRDA 2KP2A 4IHUA 4IVFA 2C0EA 6GSSA 2LS5A 4LA1A 2LQOA 1F3AA 4MJEA 2IFQB 2X8CA 5AIXA 5E59A 5J9CA 1XWCA 2GVPA 4OO5A 1PKWA 3GL5A 3H79A 1BX9A 5DVBA 1FHEA 4MLYA 1GSDA 2DJ3A 4EDYA 3H8QA 1IYIA 3HJPA 3GKNA 5AGYA 4MMMA 2DJ2A 2L57A 3V1WA 5FHIA 3KEBA 3DGQA 1K0DA 3KMNA 3HVVA 1DSBA 4MCUA 4X0XA 1M2DA 2YOIA 4GSTA 2VL3A 4HDEA 4TR4A 2GDRA 1TI1A 3TDGA 4ZB9A 2V32A 3A2WA 3A5WA 3MNGA 4TXOB 1T8EB 4KA0A 1S3CA 4K7OA 1JLVA 3EE2A 2MZCA 5J9BA 1N2AA 5G2ZA 2GSTA 2JZRA 5D9XA 4MK3A 5F07A 3FR6A 2E2GA 2OE0A 1ZYQB 1K0NA 3US3A 2N5FA 4YH2A 2LNSA 4KCEA 2VD1A 3ERGA 3I43A 4ACSA 3APOA 1GSUA 4BWSA 1TK0B 3E3EA 4XTSA 1SJ6A 4V2MA 4PQHA 3KGKA 1GNEA 3BJ5A 3CBUA 1YKAA 1ILOA 2G0FA 3IV4A 4DEJA 5B6MA 4OO4A 3UAPA 1WE0A 4F03A 4WXTA 4ECIA 1NSWA 1URMA 1GSYA 3TOTA 3RBTA 1EWXA 1X9SB 2L5OA 6GSYA 2JACA 3K8NA 3GHAA 4Q5FA 1ABAA 3W8JA 5GAPD 2C4JA 2IMDA 1Z9HA 1U3AA 2I4AA 5CRGA 3HA9A 3FK8A 4RUVA 3GUSA 1TOFA 2GSRA 4N11A 4NHWA 3O3TA 1TK5B 1ERTA 3KZQA 4Q5RA 2OACA 3F4SA 1N8JA 3ZTLA 1DBYA 4OMVA 2PPTA 3M8NA 1UA5A 3GRXA 3DYRA 2GT6A 5IO0A 3HD5A 5HFIA 3LXTA 2NTOA 2OE3A 2VOCA 4J2FA 2DJ1A 3H93A 3VURA 2XPDA 3ERFA 2X64A 5H5QA 1T3BA 5KEJA 4XHMA 1OC9B 2P5RA 1XFLA 3WT1A 4LL4B 4MZBA 5AIVA 1R5PA 1S3DA 5CRWA 2I81A 3TJJA 4HJ2A 4YAPA 2A2RA 1BEDA 2HI7A 5F06A 2KP1A 2YWOA 2RM5A 2HLSA 3IE3A 4MF5A 1A8LA 2LUSA 2XHFA 4ZL9A 3NOFA 1UN2A 2FA4A 2MYGA 4JR4A 2V1MA 4DSSB 1BJXA 4TKYA 3OR5A 1GTBA 3MDKA 1O8XA 1OYJA 2RLIA 1Y25A 4WF5A 2V6KA 4PUAA 2VUPA 3LEFA 3L9UA 4CDOA 5B8AA 3TKPA 1S3AA 2X8HA 4WETA 4D73A 2PERA 1K3LA 3KP8A 5E4WA 1OC9A 4FYCA 2OBIA 2VO4A 3KP9A 1PRXA 2ZUPA 1TU7A 2J23A 1GTAA 4WR4A 1FB6A 1SKSB 2QGVA 2JSZA 4LMWA 1A0RP 3LWAA 2IN3A 3ISOA 3FHKA 1W89A 2E2MA 5DALB 1FB0A 1U3IA 1BQ7A 2L4CA 1PQNA 3TKSA 4EL1A 2E0QA 1XIYA 4TVEA 3LFLA 5A4VA 2R4VA 5D73A 3TJBA 5D93A 2YP6A 3ZFLA 4EDZA 5GZZB 5CREA 2GSQA 1A8YA 5JWOB 4JE1A 4MJCA 3TOUA 2B3SA 3EMPA 13GSA 4EKZA 2DMMA 3APSA 1V57A 2H76A 2X8GA 4V2NA 3GFKA 5CAXA 1AXDA 2I3YA 1B9XC 1M7TA 1SENA 2H0HA 4HU7A 2FY6A 4TXVA 5J3RA 4K1FA 11GSA 2G2QA 4MZCA 1TK8B 3ZLPA 2LKUA 3IA1A 1GSFA 4GQCA 3G7YA 4GLTA 4MF7A 1ML6A 2LNTA 4KCAA 3HJOA 2O85A 5IMFA 3HJMA 5G5FA 3EU4A 4JRRA 2OKAA 22GSA 3VPQA 4P3YB 1FVKA 3CYNA 3FZ5A 4MJBA 3UMAA 3ME8A 5ENUA 5B6NA 4ISDA 2VCTA 1GUKA 1MEKA 1B8XA 1TI3A 16GSA 1FVJA 2H74A 1WJKA 2B5YA 4IP1A 4ZILA 2HE3A 2C0FA 4EXJA 1GUHA 1THXA 3LJRA 3RPPA 1G0TA 1AAZA 3MWHA 4O32A 4ECCA 5HR3A 5J5NA 3UEMA 1XWGA 3A2XA 5C00A 3CXGA 4RQRA 1GSEA 2F51A 4OWYA 1T1VA 1FOVA 3GV1A 2B5XA 3KTLA 1BG5A 2H71A 3VI7A 4PUFC 1G7OA 2PVQA 3MSZA 1F6MC 4IKHA 4KNDA 3VPTA 5H5RA 3HVSA 4XRAA 3L9VA 1HD2A 1TXXA 1XWBA 1EEJA 3UL3A 3FYGA 2AJQB 3L0HA 2GQKA 2I9HA 5FWGA 1W4VA 3G9BA 1GL8A 1TP9A 4HI7A 2TRCP 4BPYA 3GKMA 1CQHA 1E6BA 1GTIA 3FZ4A 2LV3A 6GSTA 1TTZA 3TUEA 2TRXA 1OC3A 1QK8A 1SD9A 4BA7A 2HT9A 1Y6EA 1SYXA 3PINA 5IMAA 1EV4A 2K6VA 1SK1A 3QFBC 4HOJA 1ERVA 5B7CA 3D5JA 3N5OA 3EU3A 2O7KA 4ZB6A 1K3OA 2L5LA 2H70A 4ZBDA 2HSYA 3EWLA 3BBYA 1QFNA 3P7XA 4ZIJA 10GSA 2PBJA 1O85A 1YZXA 4IQ1A 1PN9A 2P5QA 3O6TA 3GL3A 4FIWA 1KEBA 3C1SA 1UVZA 3DVXA 4RQXA 1MD4A 5LCZA 3EYTA 4TR0A 14GSA 4G2EA 2CX3A 4HQZA 4ULXA 5JCUA 4KB3A 2L6DA 4MPFA 3HYPA 4KX4A 2MMOA 4O92A 2HRFA 4EUYA 2DC5A 1HNCA 1M2BA 2IPAA 5J41A 4KDUA 1XPVA 4KH7A 1EGOA 4HEA2 2VIMA 3LSZA 1OAZA 2B1KA 2H8LA 4MDCA 1V98A 2N5BA 1GNWA 4XS4A 4DSQA 1OC8A 2FWFA 4WKWA 2RM6A 2IJYA 1TRUA 2YZHA 4LL1B 3CSHA 4NXIA 3HDCA 1R5AA 17GSA 3IK7A 1KNGA 1VGLA 3DEXA 3CTFA 2O8VB 5AISA 1K0BA 4KSMA 3ZIJA 2ES7A 3QPMA 3NIVA 2H1BA 4MH3A 2H73A 2B7KA 3TGZA 2B1LA 3EMXA 5JWQB 1FO5A 1FG4A 1GP1A 2H1DA 4HU9A 3RAZA 1GUMA 2YV7A 3MAKA 2IFQA 2TIRA 4IELA 5JWRB 3Q18A 2H1AA 4RI7A 3U6VA 5G30A 3U5RE 5EPFA 4MP4A 4OFNA 4ZBAA 3F6FA 4NMUA 5DCGA 1SU9A 1YEXA 1A2LA 4N10A 1M9BA 3WD6A 4ML6A 2GSSA 2X99A 4ZXGA 4L5LA 3FY7A 2BMXA 3HY2A 4L0WA 2M46A 4I2UA 3F9UA 3IRAA 3FZ9A 1EZKA 4L8EA 3KD0A 5IMDA 1KTEA 1QUWA 4FYUA 1O73A 3S9FA 3FRCA 2EIQA 1TKDB 2NDOA 1T4ZA 4OD7A 3SBCA 1TRSA 5IMCA 4F9ZA 3UVTA 2YN1A 3QAWA 3F6DA 2H6XA 4TXOA 2V2GA 2H0GA 1MDIA 1JZRA 3ZFBA 1B9YC 1EP8A 5F8BA 3GH9A 2CZ2A 5EY6A 1NHOA 5IPHA 1XOBA 2YZUA 5F0GA 3JCML 4EO3A 1ZGNA 2HYXA 2MMNA 2VCZA 2CZ3A 1G7EA 2YJHA 2JADA 2F8FA 4TOPA 5HFKA 5HR2A 1G6YA 2VCVA 1SK2A 4OCFA 2L4QA 2KOKA 3TJFA 2KHPA 1XW9A 4GSNA 3IK9A 1EGRA 3HZ8A 4FO5A 2YWMA 5JCGA 2F3MA 4AJ6A 1EOHA 3VWUA 4WF4A 4H86A 3ZL5A 4POMA 1ERWA 4XIHA 3F63A 3LXZA 5CNWA 3TRQA 4X1UA 3KIJA 3D22A 2PGTA 4BL7A 1WMJA 2H72A 2QSIA 2GZZA 4TRXA 3EURA 1WPIA 4KDYA 1A2MA 1EOGA 1SL0B 3TKSC 3GX8A 2VD0A 2LRCA 4MF6A 1H4OA 3BCIA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1SL2B

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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