3UL3A

Structural insights into thioredoxin-2: a component of malaria parasite protein secretion machinery
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
103
structure length
103
Chain Sequence
RLQQNGSNIINGVNMKNTVIVLYFFAKWCQACTMQSTEMDKLQKYYGKRIYLLKVDLDKNESLARKFSVKSLPTIILLKNKTMLARKDHFVSSNDLIALIKKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural insights into thioredoxin-2: a component of malaria parasite protein secretion machinery
doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
molecule keywords Thioredoxin
total genus 29
structure length 103
sequence length 103
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ul3A01
2O7KA 1EWXA 2AV4A 2YOIA 2IMDA 5IOWA 2DJJA 2L6CA 4HJMA 3GKMA 4IELA 4LL4B 1M2AA 4MH3A 4K8MA 2PU9C 5L71A 4AJ7A 3EWLA 2WS2A 4NWYA 1AW9A 2GZPA 1O8XA 5F06A 2GSRA 2ON5A 2VO4A 1PA3A 2B7KA 2VCTA 2L6DA 2XPEA 5IPGA 2CX4A 2N5AA 1V9WA 2HYXA 4HJ2A 3GSSA 1HNBA 3R2QA 1UVZA 5HR0A 1A8LA 1ZCPA 5H5SA 4MJBA 2HT9A 1E6BA 2EIRA 2OE0A 3K8NA 2GQMA 2MMNA 4HS1A 5HFKA 4F82A 3SBCA 3KMNA 2DIZA 4EF0A 3GUSA 4NXIA 1OC9A 1Z7RA 1ACVA 1QMVA 3GKNA 2V32A 4XRDA 6GSUA 20GSA 2ZCTA 4O32A 4PXOA 4RI7A 4IS0A 1TRVA 2C3NA 5DJMA 4BL7A 1BAYA 5ELAA 1M9AA 2YV7A 5DBQA 3GL5A 1GUHA 1NSWA 3FY7A 4HEA2 2H0GA 1OKDA 3EU3A 2K9FA 2LUSA 3FZ5A 2C3QA 3QOUA 2LQOA 1TU8A 1I9DA 2QSIA 2WJUA 3ERWA 3C8EA 2IPAA 4YAVA 2CVDA 3O76A 3MSZA 2VOCA 2XC2A 4AF2A 4MCUA 1OC3A 4TXOA 1X5EA 4HDEA 1YDKA 4FYUA 3D21A 1M9BA 3GSTA 3TJKA 2A4VA 1AAZA 3ZFBA 5ECMB 1DE1A 2H0IA 3RPPA 5HFGA 4N11A 2YWIA 2VL9A 4KX4A 5AN1A 3G7YA 3LWAA 5IQYA 4ZIJA 1FW1A 1OYJA 1XOBA 1GLQA 2C0EA 3M8NA 4POMA 1X9WB 2O87A 1URMA 3ZITA 5B7CA 2JU5A 2FA8A 2GSQA 2MZCA 2H72A 1R5PA 4XIHA 1MTCA 1FVKA 2WGRA 4KNDA 2RIIA 5CNWA 5B8AA 4EO3A 3GV1A 2GZZA 5G30A 1TRWA 3QFAC 2IFQB 5IMFA 1JZRA 2CVKA 3G7JA 1ERTA 5FHIA 4IN0A 3E3EA 1SENA 2YZUA 3D5JA 3HJOA 2H73A 1EGOA 1DSBA 1Z9HA 2VL3A 3P7XA 2TIRA 18GSA 5DVBA 4GSSA 3H79A 2B1KA 1DE2A 4FH8A 3GURA 3A2WA 1O73A 3FYGA 19GSA 3FR9A 4DEJA 2RM6A 1Z6NA 4BWSA 3TJBA 1SD9A 3UL3A 1JZOA 1PD21 4JRRA 5CRWA 5B6MA 11GSA 4XS6A 13GSA 3QDNA 3DKSA 3GIXA 3TB2A 2C8UA 3LXTA 4DVCA 2P0GA 3M3MA 1XWAA 4G9HA 5GSSA 3LGCA 1JLVA 1FHEA 3VI5A 1A2MA 1EV4A 3F63A 3QAGA 1GSFA 2VAFA 2OBKA 4MJCA 1K0OA 4I6XA 4IJIA 4HI7A 1GUMA 1H4OA 1NHOA 2HZFA 2VM1A 1XIYA 1U6TA 4J56E 1O81A 2IJYA 5INYA 3CYNA 1WRYA 1A2LA 3ZVJD 3F8UA 4OWYA 4ACSA 1YQ1A 2H8LA 1Z7PA 1K0BA 2B5YA 4MPGA 4DSSA 2YJHA 2YWNA 4GF0A 2K8VA 2HI7A 1R4WA 1MD3A 2OKAA 4IP1A 2VCVA 1B9XC 2G0FA 2L5LA 3C1SA 4IQAA 4MLYA 4BVXA 1F3AA 3KMOA 1PL2A 5D93A 4MJEA 1K3OA 3LQ7A 5IMCA 1TK5B 4KDYA 1A0FA 3Q18A 1TP9A 1XCCA 2DSAA 5HQPA 2LRCA 1T4ZA 2N5FA 3IRAA 5AIVA 1X9SB 2LRNA 3CSIA 5F8BA 3IOSA 5D9XA 4KH7A 4XHMA 3FEUA 2OJLA 1GSQA 1A24A 3FKFA 1B9YC 5IO0A 1IYIA 3BCKA 2HLSA 5J41A 1PX7A 1OE7A 2EC4A 1G7OA 5FT3A 1QK8A 5ECLB 2QC7A 4HU9A 3GKKA 3KEBA 1T4YA 3TOTA 3LFLA 4IKHA 2V1MA 4OFTA 1VF2A 3DVWA 2H70A 4KUNA 2OBIA 2J9HA 5GAPD 2C4JA 1XWKA 1K0MA 2CAQA 4RQXA 3G9BA 4TN8A 2PPTA 5IPHA 3LYPA 4OO4A 2JL4A 1WJKA 2DBCA 2OE3A 2OACA 2N5BA 4YQMA 3RAZA 1JHBA 1R7HA 4LA1A 1XW5A 1KNGA 5JCGA 1NM3A 5G31A 2IMFA 1JZDA 2XBIA 2HRFA 3DYRA 5IMDA 3A3TA 3I6AA 2IMEA 4EDYA 1A23A 5DDLA 2PERA 2YWMA 5DQYA 4AJ8A 2H76A 5ECIB 3FZAA 2KHPA 4WEYA 1AQXA 2VD1A 4HQSA 3LYKA 4NPBA 5ID2B 3EURA 1FOVA 3QPMA 2IMKA 1XFLA 2CAIA 4Q5NA 3ZMKA 4E8EA 3FZ4A 3IHQA 1OKTA 5EY6A 3HZ4A 3US3A 2B1LA 5ECKB 2X99A 1GNEA 2XBQA 4PQIA 3AY8A 2FWFA 5KN1A 1SYXA 5G1LA 6GSWA 5HR3A 1S3DA 3HZ8A 4H86A 1NW2A 4RUVA 1YF0A 4NHWA 3MNGA 5CREA 1YKAA 1VF3A 2NVLA 2FD3A 1ZZYA 4IJ3A 3L9UA 2LKUA 1TTZA 1F6MC 2C3TA 1Z5YE 4HOJA 1QXHA 1GTBA 2YCDA 3FHKA 1TRUA 4NV2A 5KEJA 4J2FA 1S3AA 4JU5A 4TR1A 3GTUA 4D73B 2X64A 1NHYA 4E8HA 4NAXA 4GSNA 4L8EA 2QGVA 3EC3A 3ERFA 1J08A 3IE3A 3LXZA 1ABAA 4WR5A 2JSYA 1RK4A 5DAKA 3EYTA 5LNKe 1TK0B 2X8GA 4TW5A 2PUKC 2MMOA 3IBHA 3LJRA 1HNAA 3F6FA 4KGIA 2R2JA 5LD0A 2B7JA 5C00A 1THOA 1UC7A 5DQSA 1IYHA 4O7HA 2VCWA 5EPFA 2IL3A 3UJ1A 1T7PB 3E0UA 4GXZA 5HFIA 3TKRA 2DJ3A 5J5NA 3CBUA 4I2UA 5FWGA 3FRCA 2VCQA 1ZL9A 5G5EA 1TI3A 1XWCA 1F37A 3HA9A 2P5RA 5EVOA 5J4UA 4K0NA 1PL1A 5GAND 4MF6A 4F0CA 2LTKA 4JZQA 4F9ZA 1X5DA 1YKCA 3QD9A 4ML1A 3P8WA 3L0HA 3MDKA 4Z7XA 2CX3A 1V98A 4CDOA 2JACA 4MZBA 3HYPA 1BG5A 2F8FA 1MDJA 4TKYA 1V40A 4V1Ap 5ABRA 3BD2A 2H1BA 4PX1A 2DLXA 4EDZA 3LORA 1PN9A 3W6GA 2CZ3A 4QL9A 1HYUA 3E9JB 4ML6A 4ILFA 2C1YA 1Y25A 5LCZA 3GN3A 3IK9A 4I5QA 1XBSA 2HXKA 1ZYEA 3HVXA 1XWGA 3C73A 2IMIA 2CVBA 2CQ9A 1V2AA 4MP4A 1E2YA 1PSQA 3CSHA 4V2NA 2GT6A 2FLSA 3GMFA 4NMUA 1EGRA 4ZB8A 3QAWA 2YANA 1PX6A 3H4KA 3TRQA 3DGQA 1WMJA 2QKEA 4RI6A 3PINA 4O5RA 4XRAA 3CTGA 3HVSA 5ENUA 2I81A 1PKWA 2GQKA 1SU9A 4ZB9A 5KN0A 3F3QA 3Q74A 4N0VA 1FAAA 2R3XA 2MMAA 1LU4A 1THXA 4P3YB 1BJXA 2VUPA 3UARA 2B5EA 1RW1A 2H01A 2JZTA 3GH6A 4POBA 4CHSA 3W8SA 1SKWB 3QR6A 17GSA 1G6WA 3L9VA 1A0RP 1K0CA 4K0GA 2GQLA 3ZVJA 2AHEA 1ZGNA 4FIWA 3SWLA 3GKXA 4EC0A 1TRSA 2C80A 2FWEA 5D9WA 3GL3A 1W4VA 4F2IA 2R4VA 4ZB6A 2XPDA 4GTUA 2H66A 3GH9A 2V6OA 4V2LA 4Q5QA 1K3LA 1GP1A 3HY2A 3FK8A 4Q5RA 5D96A 2XHFA 1O85A 1TDIA 5G5FA 4IVFA 2JSZA 1ERUA 3I69A 1I5GA 2CZ2A 1N2AA 5CYYA 3PH9A 4OCFA 4Q5FA 3RBTA 3BBYA 4HQZA 2FUG2 1H75A 3ZL5A 2V6KA 5ECSA 2YPMA 3DRNA 3VURA 1TU7A 4I97A 1G6YA 1O6JA 1HD2A 5CAXA 5CRHA 4HZ2A 1ST9A 2E2GA 3DEXA 5H5QA 3WGDA 1GLPA 2FGXA 3C7MA 3DWVA 3KH7A 1U3IA 3EU4A 5IM9A 5IMAA 1TKDB 2L4QA 1OE8A 3TKPA 1FO5A 5B8BA 4WF5A 4MMMA 2KP2A 4PQ1A 4OO5A 3N5OA 3GFKA 2KP1A 4K6XA 5B6NA 4ZXGA 2VLUA 3IK7A 9GSSA 1U3AA 2WZ9A 3WYWA 2C0DA 2HZEB 1USBA 3VI7A 1QUWA 1M7TA 4WKWA 3UVTA 4TR4A 2CA8A 3W8JA 3FW2A 1EV9A 2VD0A 3JCML 3ED3A 3I9V2 3TGZA 3CRUA 3L9SA 12GSA 3UBLA 5D9VA 3ERGA 2DJ0A 4L0UA 2H1GA 1KEBA 4AGSA 3UVHA 5CO3A 3TRPA 4ECJA 1JZWA 1KTEA 3PR8A 1KBNA 1G7EA 3A2VA 1DBYA 1T1VA 1W89A 2A2RA 1V57A 3ME8A 1GSSA 2AYTA 1XVWA 5G2ZA 3N9JA 1GULA 5A4VA 4XS4B 5ECQB 2CT6A 2IFQA 2PBJA 2LEGA 4YQVA 1XW9A 3A2XA 4K7IA 1SJIA 5DJLA 16GSA 4XTSA 1G0TA 4YQUA 4HU7A 4G2EA 3EINA 1SK2A 1GWCA 1XWBA 3TRXA 2GS3A 3IC4A 5HR2A 2FNOA 4FO5A 4JR6A 4V2MA 3DXBA 4N0ZA 2REMA 2FA4A 3QCPA 3HKRA 2ZNMA 1SL2B 3VWWA 3DIEA 1A8YA 4KCAA 3VPQA 1B4PA 2AUVA 1U88A 4N10A 3ISOA 2PN8A 4JE1A 4K7NA 3A5WA 4L5OA 3KCMA 5F0GA 4WR4A 2I3YA 2I9HA 3Q6OA 4KDUA 1YJ6A 1VGLA 2LJAA 3UBKA 4MF7A 5IIZA 4YAPA 3CMIA 1VF4A 10GSA 2DMLA 1YEXA 3M9KA 3GNJA 4WBRD 2H75A 4ULXA 4KW6A 4TR0A 1ON4A 5J9BA 4ECCA 4MZCA 4TXVA 3O3TA 5D9TA 3DVXA 4DSRA 1CQHA 3P2AA 3H93A 3KIJA 1PKZA 2E0QA 2DJ2A 4GCIA 3PGTA 1OC9B 4IW9A 1O7UA 2ALBA 1B4QA 2CV4A 1YY7A 2NBSA 5F07A 4KDXA 2GT5A 2H0HA 4EVMA 2L5OA 4JBBA 1SK0A 4ID0A 2PVQA 2BJXA 1TXXA 4IP6A 3HDCA 1TI1A 4L0WA 2JZSA 2JZRA 1N8JA 4WETA 2MBSA 5DCHA 4F03A 3KXOA 2YJ7A 2PWJA 5CRDA 5C04A 1GSUA 5D73A 4ECIA 4BWQA 3TKSE 3HD5A 2LSTA 1YZXA 2FWGA 2L57A 1TW9A 2A2SA 5IOXA 2E2MA 1XXUA 1PQNA 4K9ZA 4OCEA 3DD3A 2GSTA 2V41A 2K6VA 4TXOB 1EEJA 1UA5A 4XS4A 5COHA 2HRNA 3F4RA 3P90A 3QMXA 2IN3A 6GSYA 4I2TA 3KP9A 22GSA 3NIVA 5ECNB 4PNGA 3VK9A 5AIXA 1F3BA 3GX0A 3EMPA 4V1Ag 1VRSD 1Q98A 5J9CA 5A4UA 5JWRB 5ELGA 1LJRA 4MF5A 2LRTA 3NZNA 1WE0A 3DMLA 3APSA 6GSXA 1Z6MA 5AGYA 5E4WA 1PGTA 3RPNA 5KN2A 2DJ1A 4MJAA 4TRXA 3M9JA 3UAPA 3VWUA 2IWTA 3LG6A 3L78A 3FR6A 4OMVA 8GSSA 2F8AA 3LSZA 3BCIA 3M0FA 2YNXA 3L4NA 4KE3A 4POKA 2LNTA 3IDVA 1SL0B 3ME7A 2WFCA 4GLTA 2LV3A 3ZRDA 4WF4A 2KUCA 3H1NA 5H5RA 3WT1A 3V1WA 1XZOA 3HJPA 5A5KA 2R6KA 1QQ2A 4MDCA 1AXDA 3ZIJA 4L5LA 3U6VA 2WCIA 1QFNA 3ZLPA 3D22A 4HZ4A 4RQRA 3TCOA 1FB0A 2FCHA 2EIQA 2VCZA 1T8EB 3D4TA 2DC5A 4YH2A 5IO2A 5ID2A 3GYKA 4N30A 2K8SA 1B48A 3GA4A 2DIYA 4KB3A 1X5CA 1EEMA 1OC8A 2B6MA 1EP7A 4ZL9A 4OFNA 2H6YA 3KJYA 1B8XA 2RLIA 1SKRB 3KTBA 1S3CA 4MA9A 5JWQB 1M99A 1R5AA 1V58A 1AC1A 2HFDA 1JFUA 2RUEA 5CRGA 2ES7A 4AJ6A 2FY6A 2HSHA 4QQ7A 3F0IA 1SL1B 1GH2A 3KGKA 2K18A 3D6IA 4X0XA 2GVPA 4GQFA 1ILOA 1O8WA 3VFIA 2PVOC 3ZMLA 1K0DA 4GWRA 2HE3A 2D2ZA 3APQA 3WT2A 5JCWA 2P31A 5DCGA 3D0ZA 2MBTA 3O6TA 3ZIVA 5G1KA 3F4TA 3HHVA 1SJZA 3TKSA 2PMTA 4DSSB 4D73A 1SYRA 1MEKA 4LMVA 4EUYA 5E59A 1WIKA 2GGTA 2LNSA 3EE2A 1YEPA 4O92A 2DMMA 2VIMA 1SKSB 4PUFC 1A2JA 3J7Yk 2VM2A 4FYBA 2F9SA 3UMAA 4J57E 4OD7A 3RHBA 2GSSA 1QGVA 1M2DA 4ISDA 5HR1A 2HSYA 2KLXA 3IXRA 1BQ7A 3KM6A 2H6ZA 4OFMA 2LJKA 3HCZA 4ZBDA 2L59A 4K1FA 2VL2A 5GZZB 4LMWA 5IMZA 3I43A 3WGEA 1YF1A 2G2QA 3M1GA 4WXTA 3ZREA 2O85A 3C1RA 2LJRA 4IGJA 2O89A 3GX8A 2YP6A 3CSJA 2PGTA 1M0UA 5A4WA 2ZUPA 3CXGA 2H71A 2WRTA 2BTOT 3S9FA 1GL8A 1X0RA 4QL7A 4IHUA 2X8CA 2M72A 1WWJA 2FHEA 4MZWA 14GSA 1WPIA 4F0BA 2AJQB 4JEDA 4PQHA 2WB9A 2M80A 3GRXA 4I8BA 3TKQA 3H8QA 1VF1A 1HNCA 5J3RA 3C71A 4TR3A 2R5GA 4PUAA 2LQQA 2NDOA 4EKZA 1MDKA 3F4SA 2V2GA 1F2EA 3UIWA 1RQMA 2AAWA 5JCUA 4POLA 1GNWA 1X9MB 2NTOA 1GSYA 2C0GA 1TJDA 1ML6A 4KAEA 3TKSC 1GTAA 1EZKA 1F9MA 2P5QA 2RM5A 1K0AA 3ZTLA 3FZ9A 3KP8A 3U5RE 1PRXA 3VPTA 4ZL8A 2VCXA 1J9BA 2TRXA 2GZYA 3IR4A 4TVEA 4BVYA 1ERWA 2GTUA 1Y6EA 5F05A 2LS5A 2FWHA 1M2BA 3WGXA 4PURA 1FVJA 3TDGA 2H1AA 1LBKA 3KZQA 4BPYA 2H74A 2VLVA 3KH9A 3ZYWA 2YZHA 1XPVA 1WOUA 1AIUA 1U87A 2VL2C 2H1DA 4LLRA 2H30A 2GLRA 3F9UA 3EMXA 3UEMA 4ZBBA 2BMXA 2DJKA 3HVVA 3D4MA 2YN1A 1SJ6A 5KN3A 4LL1B 1R26A 1AUCA 1EOGA 2B5XA 3F3RA 4HUAA 2H6XA 4K7OA 2H19A 3G7IA 4ZL7A 2KOKA 2L4CA 3CRTA 2I1UA 4NV5A 2WULA 2MMZA 4X1UA 1FB6A 2IIYA 2HNLA 2JADA 3TJGA 1XVQA 3BOAA 3IV4A 5ECOB 3TOUA 3QFBC 2ON7A 4TR1B 4MK3A 3GTUB 5GSTA 4EL1A 4ECBA 4G19A 1MDIA 5ECHB 1SK1A 3TJFA 1C72A 5DALB 4PNFA 3IAM2 2C0FA 4GQCA 2RUFA 2E7PA 1T3BA 1ERVA 5CP1A 4EXJA 3QAVA 4ZBAA 5DAKB 1AQVA 2I4AA 4GSTA 4WBJA 2EIOA 3TUEA 3J7Yb 1ZYQB 1BYEA 1WP0A 2OA7A 4XS1A 2VLTA 3IPZA 3VWXA 4MPFA 1UN2A 1ZMAA 4X43A 4DSQA 1T00A 2F51A 1GUKA 3RDWA 3VWVA 1SD8A 4FYCA 4MABA 6GSTA 2NPBA 1MD4A 3LEFA 4NHZA 3VLNA 1HQOA 1FG4A 2M46A 5AISA 2YV9A 3HXSA 3GHAA 3KD0A 1BX9A 3MAKA 4JR4A 4MH2A 1TK8B 1EP8A 2Z9SA 1BEDA 2HZEA 1CQGA 1J0FA 2YWOA 2TRCP 4BA7A 2OADA 2R37A 1GSEA 5ECRB 2GDRA 5ECPB 3OR5A 4TOPA 3WD6A 3TJJA 1Q4JA 2OE1A 4KA0A 3ZZXA 2F3MA 5D8IA 1OAZA 7GSSA 1Z3EA 3KTLA 2MYGA 1DUGA 5EL8A 3F6DA 4KSOA 1TOFA 3APOA 6GSVA 4K2DA 1EOHA 1JLWA 2AB6A 1K0NA 3MWHA 2B3SA 4PGTA 3ZFLA 2J23A 4XCSA 3CTFA 2O8VB 3IA1A 1AQWA 4EE0A 3EVIA 2X8HA 1GTUA 4KCEA 3FR3A 3HJMA 5JWOB 4G10A 3BJ5A 1XOAA 1GTIA 3IAS2 3NOFA 2WDUA 4CW9A 1GRXA 1GSDA 4IBPA 1K3YA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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