4HS1A

High-resolution crystal structure of glutaredoxin like protein nrdh from mycobacterium tuberculosis.
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
84
structure length
84
Chain Sequence
TVTVYTKPACVQCSATSKALDKQGIAYQKVDISLDSEARDYVMALGYLQAPVVVAGNDHWSGFRPDRIKALAGAALTAHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title The Crystal Structure of Mycobacterium tuberculosis NrdH at 0.87 A Suggests a Possible Mode of Its Activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin NrdH, putative
total genus 22
structure length 84
sequence length 84
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4hs1A00
5J9CA 1PQNA 3GN3A 2VLVA 4I2UA 2WCIA 1PA3A 2HRFA 3DRNA 4KDXA 2HE3A 3TRPA 4G19A 1X0RA 1GSDA 5G31A 5ABRA 2CAQA 4GLTA 3ZYWA 2Z9SA 3FR6A 1TP9A 4BVYA 5CRHA 4IQAA 4ZXGA 1YF1A 12GSA 3A3TA 3KEBA 4Z7XA 2V2GA 2FNOA 5D9WA 2RLIA 2CX3A 4O32A 2IMEA 3C7MA 3VFIA 5ID2B 5IOWA 2LV3A 5D93A 5DCGA 3TGZA 5ECMB 1EGRA 2EC4A 3CRUA 1J08A 1MDJA 4LL4B 2B5XA 3BCIA 5DALB 4MA9A 4PURA 2YZUA 3KCMA 1EOGA 3GSTA 2M46A 2O7KA 2M80A 1X9WB 3UEMA 3IAM2 2RM6A 5DDLA 3TDGA 5B6MA 3H93A 2TIRA 2GQLA 4GQFA 1AUCA 4WEYA 3VK9A 5ECLB 3VWUA 3L4NA 4IVFA 5DQSA 4GWRA 2AJQB 5C00A 1T4YA 3WGDA 5DVBA 1C72A 5A5KA 2FHEA 2CVKA 1M2AA 2AHEA 3E3EA 1MEKA 4HEA2 4O92A 4NV5A 2TRXA 4BWSA 2JSYA 1A8LA 5ID2A 4GF0A 4I2TA 1TJDA 3EVIA 5B8BA 1HNBA 3FZ5A 2XPDA 2X8HA 1EEJA 4AF2A 2DC5A 1XVQA 2YWOA 2KLXA 1KTEA 3KD0A 4LMWA 4EO3A 1PGTA 5DALA 5INYA 5IMFA 3TKQA 3E9JB 4MP4A 3D5JA 3K8NA 1Z3EA 1F9MA 3TKSC 3MDKA 2K6VA 2HYXA 3CYNA 3KM6A 3P8WA 1TOFA 1PSQA 5FHIA 2ALBA 1VGLA 3U5RE 4PNGA 2CT6A 2JSZA 3UJ1A 3ZRDA 2B1KA 4IJ3A 2F3MA 4X0XA 2WULA 2PGTA 3TB2A 2PUKC 1SKRB 1EOHA 4HUAA 1GTBA 3H4KA 2O89A 3HCZA 3Q6OA 2VL9A 4XRDA 1EWXA 1JZDA 4GCIA 5JWOB 3N9JA 5HFKA 4HDEA 3FY7A 5ECHB 3QAVA 4V1Ag 4EF0A 3KTBA 4LL1B 3C73A 2FGXA 3TCOA 2PN8A 1EV9A 2MBSA 4EL1A 5LCZA 1SU9A 1VF1A 2GLRA 3HJMA 4GXZA 2A2RA 2H66A 1TRUA 3QCPA 4AJ6A 2KHPA 2WZ9A 1V57A 1QMVA 2VOCA 1ON4A 2DIYA 3HJPA 4XCSA 3FR3A 1OE7A 1TU7A 4RQRA 3DWVA 4KE3A 1SL1B 2CAIA 1FW1A 2AAWA 3F9UA 1PL2A 3TJGA 4HQSA 5CRWA 5B6NA 2DJ0A 2FWFA 2DSAA 1SKSB 3GL5A 1XIYA 4MLYA 1XXUA 1MD4A 1LJRA 1GTAA 1K0DA 2N5FA 2PMTA 2JZRA 2VCWA 4MZBA 2C3QA 5IPHA 1K3LA 1QUWA 2DJKA 3NIVA 1GL8A 4XHMA 1A2JA 2GDRA 11GSA 3APOA 2L4CA 1GRXA 5G1LA 2HI7A 1WE0A 2YN1A 1AAZA 2YOIA 2I81A 5JCGA 3QOUA 6GSSA 4N0ZA 1VF4A 1YEPA 5D73A 5ECRB 1DBYA 1GSYA 3UVHA 2HSYA 1SD9A 3KIJA 4OD7A 3GL3A 5FWGA 4HU9A 2VL2C 4IQ1A 4TR1B 2HSHA 4IS0A 1SL0B 2J9HA 3ZIJA 5IQYA 3TJJA 4PUAA 2WRTA 1THOA 3IE3A 4ZIJA 5LD0A 3EU4A 4ILFA 5G2ZA 2B7KA 1TKDB 3GV1A 3VI5A 4BA7A 3HVXA 4MCUA 2GS3A 2H1AA 2RUFA 2YWMA 1X9MB 5IMAA 1SL2B 2HZFA 2FLSA 2V6KA 1ERTA 2NPBA 2YV9A 2IN3A 2L5LA 4O5RA 5D8IA 4QL7A 5E59A 3M3MA 5ECNB 1XW9A 3GIXA 4G9HA 1XWGA 2K8VA 5F07A 4XS4B 5AN1A 3LORA 1F2EA 1GLQA 2QC7A 4N11A 2V6OA 3OR5A 3KH9A 3F4RA 4I5QA 3F6DA 3IOSA 3EC3A 4IW9A 1Z7RA 3A2WA 5DCHA 3D6IA 1EV4A 4GTUA 3LSZA 2LQOA 5DBQA 1XWBA 5KN3A 2OE0A 3FK8A 3HY2A 2JZSA 4K7NA 2LUSA 4OO5A 1ZYQB 2H0HA 2E7PA 3D0ZA 1DE2A 2LKUA 4WETA 3PGTA 5CREA 1QGVA 3GUSA 5GAPD 3UL3A 4PQHA 3CRTA 4XTSA 3UOMA 3BD2A 2P5RA 3QFAC 1LBKA 5KN0A 1B48A 3PR8A 1QFNA 1XOAA 3P2AA 3D4TA 3F0IA 4NAXA 1FVKA 4K7OA 1Y25A 1NHYA 4WBRD 4XS4A 2H1GA 4OCEA 1QXHA 4POBA 4GSTA 1VF2A 3F3RA 4PGTA 3TKSA 1OKDA 2FA8A 1OKTA 3QPMA 5IMVA 4MJEA 1OC8A 2GT5A 2O8VB 3HZ8A 5A4VA 2FY6A 4WF5A 4ZB6A 4ZBAA 2PVOC 3GKMA 2VM2A 2OBIA 14GSA 3DXBA 1MTCA 2VCZA 2WS2A 3FR9A 5HR0A 2JADA 3GNJA 5B7CA 1H4OA 1M7TA 1BEDA 4ZILA 4L8EA 4HJMA 5C04A 1T3BA 1B9YC 4EE0A 3GX8A 5F8BA 2H75A 2PU9C 3MNGA 4O7HA 3VURA 1R4WA 4F2IA 3H79A 3I9V2 3D21A 2LJRA 1ILOA 1V9WA 4BPYA 18GSA 1R5PA 4PXOA 5CP1A 4F9ZA 3RAZA 3RBTA 3L9VA 4TKYA 4JBBA 3FZ9A 3HVSA 4MJCA 4F0CA 1BQ7A 4RQXA 2GTUA 2WFCA 1K0OA 3WGEA 1F37A 4D73B 3M0FA 1PMTA 1OC9B 1N8JA 2QGVA 3TOTA 2BJXA 3EINA 1B4QA 4E8EA 3ED3A 3C1RA 3Q74A 2L59A 2LJKA 2IL3A 22GSA 3O6TA 2ON5A 3CTFA 5ECKB 4EXJA 4L5OA 2H0IA 5CRDA 4BL7A 2DJ2A 2HT9A 5CO3A 1Q4JA 4ECCA 5L71A 3ZLPA 1HNCA 2R6KA 2O87A 4OFNA 2XHFA 5HQPA 3QR6A 1Y6EA 2BMXA 2FWGA 2H0GA 1J0FA 3LQ7A 2FWHA 3GX0A 4PX1A 4HZ4A 2KUCA 3H8QA 1GTUA 1GUKA 1MD3A 1FHEA 3HD5A 4XRAA 3EURA 3A5WA 5D9TA 3LGCA 2V1MA 2IMDA 3EE2A 3J7Yb 4ZB8A 5E4WA 4YQMA 3DYRA 3CSIA 4RUVA 4I97A 3QMXA 6GSUA 3FZAA 3GSSA 3GH6A 2MYGA 4YQVA 4JE1A 3CSHA 2YANA 1OC3A 1K0NA 1GSSA 5JCWA 3F63A 2R4VA 1G6WA 1OYJA 3TKPA 3KGKA 4POKA 4YQUA 2YNXA 1S3DA 3TJKA 4TXOB 3KTLA 3W6GA 4CDOA 4MH3A 4F82A 5IOXA 3P90A 1XVWA 1TTZA 5F06A 1FAAA 2H6ZA 2H01A 3ME7A 4OFTA 4GSNA 2I9HA 2IPAA 1ZYEA 4F0BA 2GZZA 1WMJA 2VO4A 5EY6A 4JZQA 2LEGA 2B7JA 4MZCA 1MDKA 1V98A 3RHCA 1TI1A 1JZWA 2CVBA 5KN1A 3O76A 4K0NA 2H1BA 2REMA 1M99A 3DIEA 1ST9A 3V1WA 2CVDA 4FH8A 3SBCA 2LTKA 3UVTA 5D96A 2NVLA 1U6TA 5HR1A 2MZCA 2LRNA 4CW9A 1K0BA 2C0DA 1XZOA 2CZ3A 4QL9A 1TDIA 1M9BA 4TXOA 2A2SA 2P5QA 3PINA 2H76A 3QDNA 2YWIA 3G7IA 10GSA 3I6AA 3IPZA 5IO2A 4KCEA 1XWCA 3F6FA 3M1GA 4IELA 2E2GA 1V58A 4OWYA 2C3TA 2O85A 2P31A 4K7IA 2GSSA 3F4SA 3TKSE 5COHA 2VCQA 2VLTA 1RQMA 2MMOA 3IR4A 2L6DA 4DEJA 4IHUA 3I69A 2K8SA 4K1FA 1PX7A 3EU3A 1Z5YE 1K0MA 2LRTA 3HZ4A 3RHBA 4DSRA 2C3NA 5G5FA 4K9ZA 1E2YA 1GWCA 3ZTLA 5IIZA 1KNGA 5B8AA 3W8SA 1B4PA 4OFMA 4EKZA 1CQHA 2NBSA 5FT3A 1W89A 13GSA 3ZMLA 3DD3A 1SJZA 4J56E 2RIIA 4I6XA 2CQ9A 2VD1A 2FWEA 4ZBDA 3IV4A 2DJ3A 1XPVA 4MH2A 3BOAA 1EP7A 1QK8A 4K0GA 4MDCA 1HQOA 2E2MA 1WOUA 4P3YB 1XWAA 1JFUA 1SYXA 1PD21 1DSBA 8GSSA 2X8GA 1U3IA 5GSSA 4HJ2A 4OMVA 3ZMKA 2NTOA 5D9XA 1NHOA 4HU7A 3D22A 4J57E 1A23A 1AQVA 3CMIA 1A8YA 1AQWA 3FHKA 3ERFA 5AISA 6GSVA 2LNTA 3KJYA 3VPQA 3IHQA 1S3AA 3L9UA 4JR4A 1Z7PA 3O3TA 4V2LA 5ELAA 5G30A 2IMFA 1R7HA 2WDUA 1K0AA 2I1UA 3W8JA 4TVEA 3CTGA 1SYRA 3HKRA 5F05A 1UA5A 2JACA 2D2ZA 5H5SA 2H70A 3R2QA 4HOJA 1TRVA 4NHZA 1BG5A 2XPEA 3CSJA 4WKWA 2QSIA 4IKHA 1SJ6A 2YWNA 1DUGA 3QAGA 4HZ2A 1BAYA 3GKXA 1TRWA 1LU4A 1OE8A 2ZUPA 1YY7A 1A0RP 2M72A 2R3XA 1TXXA 2LNSA 1XBSA 4EUYA 3MSZA 3C71A 3AY8A 4X43A 3IBHA 4KCAA 3UIWA 2VCXA 17GSA 1NSWA 1XW6A 3FEUA 1O6JA 5DJLA 4K8MA 1O8XA 1GTIA 2H6YA 4TR1A 2OACA 1K3YA 2B6MA 1AIUA 5A4WA 4TXVA 1JZRA 4V1Ap 1FVJA 5A4UA 4XS1A 1I5GA 2WGRA 4G2EA 1EZKA 3ZZXA 4DSSB 2B1LA 4MABA 1MDIA 4RI7A 2MMAA 5ECIB 2OKAA 2OE1A 4EC0A 20GSA 2B5YA 1ML6A 1TK8B 1GLPA 2JZTA 5AGYA 2IWTA 3UMAA 3JCML 2GSRA 1GH2A 3LYPA 3LXTA 4ULXA 5J41A 6GSTA 3GKKA 5HFGA 2K18A 1WRYA 2TRCP 1K0CA 1QQ2A 2CX4A 4NPBA 3GH9A 4FYUA 4AJ8A 3G7JA 3D4MA 3WT1A 1ZZYA 3TJBA 2F9SA 4E8HA 4ZB9A 1IYIA 2H6XA 4MPGA 1XWKA 3ERWA 5CYYA 4TR0A 3ZREA 1URMA 2IMIA 1CQGA 5IPGA 1HNAA 2IFQB 5CAXA 2ZCTA 1BJXA 3IXRA 4KB3A 3VLNA 4EDYA 4DSSA 2EIOA 3MAKA 4WR4A 1V40A 5ENUA 3KP9A 4NHWA 4XIHA 3L9SA 2X99A 1FOVA 2PPTA 3DKSA 5KN2A 2YJHA 4K2DA 5ECOB 3ISOA 2KP2A 3ZVJA 3HVVA 4V2MA 5ECPB 4ML1A 2ZNMA 2DMLA 4RI6A 4MPFA 1KEBA 1VRSD 2PERA 2VCTA 2KOKA 2DJ1A 1Q98A 4I8BA 4TR4A 3QAWA 1GULA 2FA4A 1T00A 4IJIA 3IK9A 2JL4A 3E0UA 4WXTA 2LS5A 5IM9A 2CZ2A 2A4VA 2IFQA 4IGJA 1O85A 4L5LA 5IO0A 3TRQA 2VIMA 1V2AA 4Q5RA 2L5OA 3WD6A 1RW1A 2R37A 1TK5B 2AUVA 4PNFA 1G7OA 1TW9A 2PVQA 3HYPA 1AXDA 3M8NA 6GSXA 3DVWA 1VF3A 1O73A 5IMZA 1R26A 1X5CA 3VWWA 1HD2A 2L4QA 1WJKA 4ZL8A 6GSYA 1EP8A 2HXKA 5ELGA 4TN8A 3S9FA 1F6MC 1TK0B 2HZEB 1HYUA 5CNWA 4YAPA 2QKEA 1NW2A 2C1YA 3ZIVA 5J4UA 5LNKe 2C80A 3IRAA 1Z9HA 2VL2A 4AJ7A 5ECQB 2H1DA 2H71A 1Z6NA 4ZL7A 1W4VA 3RPNA 4D73A 4EDZA 3HJOA 3IDVA 1OC9A 4WR5A 4OCFA 4NMUA 3KMOA 1Z6MA 5JWQB 1KBNA 2MMZA 1B9XC 3G9BA 1ACVA 3ME8A 3WT2A 4GRFA 1E6BA 3HDCA 2VCVA 4POMA 1AW9A 2IJYA 1ZMAA 5EVOA 3HA9A 4L0WA 1JHBA 4LLRA 3C8EA 2CA8A 5EL8A 4JR6A 2VLUA 2GGTA 3P7XA 3GA4A 3VWXA 2HZEA 2I4AA 4WBJA 3QFBC 4N10A 2GQKA 1XW5A 2C0GA 4MF7A 4EVMA 2F8AA 2GVPA 4KSOA 4CHSA 4MJBA 2GSQA 5J3RA 3TUEA 3F3QA 3DEXA 3I43A 5J9BA 1JLWA 5AIVA 1TRSA 3FRCA 3IA1A 1AQXA 1N2AA 2GQMA 2OJLA 3HHVA 3G7YA 1M0UA 2F8FA 1ZL9A 2PWJA 1ERUA 2GZPA 4G10A 1XCCA 1ABAA 2DBCA 1A2LA 1G7EA 1T8EB 3TKRA 1SKWB 2YP6A 1UN2A 5AIXA 4JRRA 2ES7A 3M9KA 2WB9A 4KAEA 3ERGA 4IN0A 3EMPA 2AYTA 5F0GA 4DSQA 1TI3A 2VUPA 3KH7A 3UBLA 1M2BA 5JWRB 4JEDA 2KP1A 5EPFA 1OAZA 4FYBA 3GHAA 3CXGA 2YJ7A 4TOPA 5J5NA 1SD8A 2VM1A 1ERVA 2WJUA 2JU5A 5H5QA 3MWHA 1B8XA 3U6VA 3F4TA 1PL1A 2I3YA 2AV4A 2DMMA 3RPPA 1YJ6A 2OBKA 1YQ1A 1YF0A 3H1NA 3APQA 3LEFA 2H8LA 2HLSA 2VAFA 3ZVJD 4H86A 1I9DA 3UAPA 1UC7A 1JLVA 4PUFC 1U87A 4KDUA 3KXOA 3M9JA 3VWVA 5D9VA 1IYHA 3GURA 1T1VA 1PN9A 2RUEA 1JZOA 1WWJA 4K6XA 2LQQA 1ERWA 1GSEA 1ZGNA 2G0FA 1O8WA 2H74A 5GAND 2DLXA 4TR3A 3PH9A 1GSQA 3EMXA 3GMFA 3TRXA 1RK4A 2K9FA 2YV7A 2B5EA 3UBKA 5G5EA 5HR3A 3WYWA 1THXA 4KH7A 1XOBA 1YKCA 2XC2A 5ECSA 1R5AA 3KMNA 2CV4A 3Q19A 4DVCA 4YH2A 2C4JA 2LSTA 3IK7A 4ISDA 1T4ZA 4L0UA 3SWLA 3DGQA 2VD0A 3ZFBA 3GRXA 1M9AA 2HFDA 1YKAA 3Q18A 5IMDA 1A24A 1M2DA 3ZL5A 2X64A 3FYGA 1K3OA 4IP1A 1BX9A 2G2QA 4MF5A 4MMMA 4NXIA 1SK2A 2H19A 4ACSA 3APSA 2B3SA 4PQIA 4NWYA 4IP6A 3A2XA 6GSWA 4F03A 4Q5QA 2N5AA 3F8UA 2F51A 4HI7A 1X5DA 2X8CA 3GYKA 2VL3A 1WIKA 3BJ5A 1U3AA 1WPIA 1G0TA 2BTOT 2HRNA 2AB6A 3EYTA 4BWQA 3DVXA 1GNEA 4ID0A 3CBUA 4XS6A 2C8UA 1PRXA 4TRXA 4HS1A 1WP0A 1G6YA 2EIRA 4ECBA 3LXZA 2V41A 3L78A 1S3CA 4AGSA 4BVXA 2R2JA 2OADA 1A0FA 2YZHA 3BBYA 4JU5A 1GUHA 2OE3A 3RDWA 16GSA 3LYKA 3US3A 2C0EA 3FW2A 3GFKA 3C1SA 3N5OA 4KUNA 4YAVA 3TJFA 2HNLA 4GSSA 1ZCPA 2YCDA 3ZFLA 3GTUB 4MK3A 4KA0A 2R5GA 2J23A 3QD9A 1F3BA 4N30A 3WGXA 3HXSA 1EGOA 3TOUA 5GSTA 1F3AA 5H5RA 4MF6A 2GZYA 4KSMA 4KDYA 4X1UA 1SK1A 1FB6A 19GSA 4QQ7A 5DJMA 3ZITA 4FYCA 2E0QA 3BCKA 9GSSA 5GZZB 3LFLA 4POLA 1J9BA 1X9SB 4HQZA 2FUG2 2V32A 1PKZA 1XFLA 3FKFA 5DQYA 1O7UA 2XBQA 4ECJA 1YZXA 2NDOA 2GT6A 2IMKA 4KNDA 2RM5A 2H73A 2IIYA 2OA7A 2H72A 3GKNA 2N5BA 5DAKB 4J2FA 2L6CA 2ON7A 3LWAA 2H30A 4WF4A 3LJRA 4FO5A 3NZNA 2PBJA 4MJAA 4V2NA 2MBTA 1SJIA 1A2MA 1X5EA 4ECIA 1GSFA 5G1KA 1GUMA 3GTUA 1OVNA 5HR2A 2MMNA 1GNWA 1FO5A 2P0GA 4KW6A 4TW5A 2LJAA 5HFIA 1UVZA 3VI7A 4MZWA 4LA1A 4FIWA 1YDKA 3DMLA 1GP1A 3J7Yk 1H75A 1YEXA 1O81A 4ZL9A 4ZBBA 1AC1A 4PQ1A 1GSUA 1TU8A 4KGIA 1FG4A 4KX4A 1DE1A 3KP8A 1ZOFA 2DJJA 4N0VA 3NOFA 2FD3A 4IBPA 1U88A 1BYEA 4ML6A 4OO4A 5DAKA 1PKWA 4Q5NA 1PX6A 1T7PB 7GSSA 3L0HA 1SENA 3IAS2 5JCUA 1EEMA 3A2VA 2GSTA 2EIQA 2L57A 5IMCA 3VPTA 5KEJA 3KZQA 3LG6A 1USBA 5CRGA 2DIZA 4LMVA 1FB0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite