3LW9A

Structure of a cytoplasmic domain of salmonella inva
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
166
structure length
166
Chain Sequence
ETVPLILLVPKSRREDLEKAQLAERMRSQFFIDYGVRLPEVLLRDGEGLDDNSIVLLINEIRVEQFTVYFDLMRVVNYSDEVVSFGINPTIHQQGSSQYFWVTHEEGEKLREMGYVLRNALDELYHCLAVTLARNVNEYFGIQETKHMLDQLEAKFPDLLKEVLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Invasion protein invA
publication title A conserved domain in type III secretion links the cytoplasmic domain of InvA to elements of the basal body.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule tags Protein transport
total genus 44
structure length 166
sequence length 166
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.60 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3lw9A00
3A5IA 3MYDA 3MIXA 2X49A 4A5PA 2X4AA 3LW9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HNBA 4HU7A 3VLNA 4TR0A 3KMNA 4V1Ag 9GSSA 4MZWA 1K0MA 4MH2A 2VL2A 1AW9A 3EURA 3GFKA 4NWYA 1PQNA 3C71A 5BRTA 3ME8A 4XS6A 2QA1A 2P0GA 3L9VA 4EIPA 1OKDA 2AJQB 2YWNA 2GZZA 3FZ9A 3GKNA 4YH2A 3M1GA 1FOHA 1WE0A 4YQMA 3NIVA 3UIWA 2M80A 4FYBA 2IJYA 4ZXGA 5KN2A 2HRAA 2VCVA 2KLXA 3IAS2 2IPAA 5ABRA 2LNTA 3DVXA 3ED3A 3QOUA 3E9JB 4I6XA 2KHPA 3ERFA 4KNDA 1ZMAA 2C1YA 3Q18A 2VLVA 3H4KA 1ON4A 3QD9A 4WBRD 5KN1A 1XW9A 3G7YA 1U6TA 4IQAA 2MMAA 4KF9A 1FVKA 2YWIA 3SBCA 2R2JA 2H0GA 4KAEA 4GQCA 2HSHA 5D73A 2B5XA 5DAKB 1PL1A 3C73A 4CHSA 4AJ7A 2R0GA 1F3AA 3EMPA 3UL3A 1MDJA 4ZBDA 5J9BA 3D4MA 3H8QA 4EIQA 1R26A 5C04A 1GTBA 4ULXA 3QAGA 2PVQA 1F2EA 3A2VA 3FK8A 4CW9A 4BIKA 4PQIA 3KM6A 4DSSA 2I81A 3A3TA 1XWCA 4KX4A 3US3A 2L4QA 5IMCA 4HS1A 1A24A 2ZUPA 4HEA2 3L0HA 4EE0A 2HI7A 3TGZA 1GRXA 3CSIA 4JBBA 3H93A 1VF2A 1JLVA 1PN0A 3RHCA 1PX7A 3MSZA 4WEYA 1M3JA 1K3LA 1XG8A 2OE1A 3H1NA 1N8JA 3Q19A 2AHEA 4A5PA 4OCEA 2VLUA 2V2GA 2IMIA 3C1SA 3TRXA 3J7Yb 4POKA 3F63A 4PUFC 1K0OA 5IMVA 2H72A 2JZRA 4AGSA 2ALBA 5ENUA 3BJ5A 3I43A 1G7EA 5J4UA 3ZITA 4ZL8A 3WT2A 2B3SA 1SK0A 4MH3A 2FWGA 3UARA 5ECHB 3KMOA 3L4NA 1SKWB 2B7JA 4TOPA 4HI7A 1K3OA 1OKTA 3CMIA 4IS0A 1BX9A 2N5AA 3RPNA 2DJJA 1CQGA 6GSTA 4I97A 1SJZA 5EPFA 2V32A 4RUVA 5DALB 5DDLA 3LQ7A 2ZCTA 5GZZB 2XC2A 4O7HA 5C00A 1NM3A 3LEFA 3PPUA 3CTFA 4FYUA 2KP2A 3UBKA 3IRAA 1JFUA 5ID2B 2H74A 4K7IA 5IPGA 1A2LA 1T00A 1V9WA 2I3YA 3IAM2 4MA9A 1TI3A 5DAKA 1UA5A 5GSSA 3GH6A 1A8LA 4L5LA 2YZUA 4YAPA 5JWRB 2HRKA 1YY7A 3LYPA 3MWHA 1B9XC 1FB0A 2TRXA 2C3TA 4MF6A 2OE3A 1ERVA 2ZNMA 1TKDB 2JSYA 4Q5QA 2FWEA 1Z6MA 1ZZYA 2VIMA 1B9YC 2X4AA 5KOWA 2C0EA 17GSA 2JL4A 1O8WA 4ZB8A 3P90A 1XVQA 1XW5A 2C0FA 2X49A 3UVHA 2FHEA 4PNGA 4L5OA 1YQ1A 1EV9A 5COHA 4MJCA 5G31A 1OVNA 1J0FA 4JEDA 1Z3EA 4GF0A 1W4VA 1TRSA 5IM9A 1T4ZA 3IHGA 2KUCA 2P5QA 3EWLA 1Q98A 3LSZA 4XCSA 5KN3A 2L6CA 4KDUA 4MPGA 3Q6OA 1ZGNA 1DBYA 3HVSA 3H79A 1OAZA 4KB3A 1AUCA 4BPYA 4ZBAA 4EC0A 2MMNA 5CREA 4NPBA 3IC8A 4RQXA 3HJMA 2HLSA 2O87A 3QFAC 3DXBA 1VGLA 2WCIA 3RDWA 4ZBBA 3ZTLA 3IHQA 3M3MA 2AAWA 2VCXA 4KUNA 1Z6NA 1B4PA 1TK8B 5IOXA 3KEBA 4OFNA 4MPFA 3U5RE 3FEUA 5DCHA 5HR1A 3ERWA 4BWQA 3F4TA 2XPEA 3U6VA 2JADA 1AQWA 3FHKA 2TIRA 2OE0A 5DALA 2IIYA 4HUAA 3I9V2 1WPIA 4V1Ap 5ELAA 2MBTA 4ZIJA 3QMXA 5CRWA 1FW1A 2H1GA 1TW9A 3D22A 5L71A 5FT3A 5ID2A 3KZQA 2C0GA 1FAAA 4LMVA 2I1UA 4G10A 4XIHA 3IC4A 1O73A 1M7TA 3RHBA 4Q5RA 2DMLA 1KTEA 4TR1B 1SKSB 1OYJA 14GSA 3TUEA 4XS1A 5LCZA 5EVOA 3C1RA 3PH9A 1Y25A 2G0FA 4USSA 4HDEA 5CRHA 4DSQA 1TJDA 2VOCA 5AGYA 1GTIA 1G6YA 2OADA 3RAZA 1UVZA 2CT6A 3PGTA 3N5OA 2O85A 2H30A 2RUEA 5CYYA 1AQVA 4RQRA 4EDYA 2HZEB 5INYA 4Q5FA 2AYTA 4GCIA 1THXA 3FY7A 5AN1A 2H8LA 1DE2A 5G2ZA 3LWAA 2OBIA 1JLWA 5E59A 4RI7A 1SK1A 1H75A 2KP1A 10GSA 3EU3A 3K8NA 4POMA 1E2YA 1XFLA 4LMWA 1S3CA 4HQZA 2WDUA 4N10A 2FY6A 4L8EA 1WP0A 3IK7A 4HOJA 2VL3A 1SL1B 1HNAA 2H19A 3IE3A 3HZ8A 3ZVJA 1R4WA 5GAND 1T4YA 1U88A 19GSA 3GKMA 1JZDA 3DVWA 2FA8A 5HR2A 3IDVA 1XOBA 1DUGA 3TKSA 5DBQA 2YV7A 5LNKe 4GSSA 2YANA 4XS4B 3GL5A 4IJ3A 1YKAA 2LEGA 4AJ8A 4EL1A 5CRDA 4HJMA 2YV9A 4MABA 2AV4A 2BMXA 2X99A 5F07A 2PU9C 2K8VA 1Z7RA 2B1KA 4G0IA 1J08A 2VM1A 4IKHA 2H1DA 2CA8A 2C0DA 2LRNA 4YKGA 2G2QA 4K8MA 2DLXA 2GGTA 2V6KA 3IXRA 4TR1A 2E2MA 4OWYA 5JWOB 1THOA 5ECMB 2RUFA 3MAKA 3VURA 3LW9A 5F8BA 2K18A 5D96A 3D5JA 1U3AA 1OC9B 2OACA 4PGTA 4BWSA 1AC1A 4MCUA 4L0UA 3MNGA 2OA7A 3UAPA 2HZEA 1M2DA 1KNGA 3A5IA 1EV4A 5F0GA 3DKSA 3DWVA 3APOA 2M46A 4G9HA 1ERUA 3QCPA 3ZVJD 2VCZA 3RPPA 3ZMKA 2C8UA 4BA7A 4LL4B 1BQ7A 3TJBA 3VWUA 4EO3A 2FLSA 5CO3A 1OC8A 1LBKA 1V57A 2FUG2 3VI5A 2GT6A 2VCWA 4GWRA 4X4JA 4PQ1A 3LXZA 1Z9HA 2CV4A 1PD21 5ECIB 2H70A 2DKHA 3GTUB 4MJAA 1EP7A 4POBA 4OFTA 4L0WA 4WF4A 2H1AA 4EDZA 5AISA 5B6NA 5A4VA 5IO2A 2ON7A 3GL3A 3LXTA 4OO4A 4V2LA 2FD3A 4Z2UA 4IVFA 2ES7A 2VD1A 4CY6A 6GSWA 1M9AA 4FH8A 4IELA 1GSEA 3DIEA 5JCWA 4LL1B 4G19A 4AJ6A 2V1MA 4EVMA 2IMKA 2VCQA 4MMMA 1T8EB 2A4HA 4TXOB 5CAXA 4BVXB 1K0BA 1F3BA 2PWJA 4KSMA 2YWMA 2E7PA 4JE1A 1N2AA 1SD8A 5D9TA 1GLPA 4GQFA 2RM6A 3TJFA 1V58A 3CQFA 3FR6A 2VAFA 1FG4A 1ILOA 2DMMA 5F05A 2F3MA 5G5EA 5DQYA 4FIWA 2R6KA 1SJIA 1M0UA 4K7NA 4F0BA 4KH7A 2A2PA 3TJJA 1OC9A 2GQLA 4GSTA 3GRXA 2H6YA 1BJXA 3HD5A 1TRWA 2REMA 4XRDA 2HNLA 1GSQA 2B5YA 1F37A 5JCGA 2ON5A 2MYGA 5J9CA 1WRYA 1WWJA 3M8NA 3LJRA 5D9VA 1EEJA 3FZAA 1T1VA 2WRTA 3GKKA 4PXOA 2IMEA 4KCAA 1GTUA 3VPTA 3PINA 2HSMA 2L57A 2VD0A 1EGOA 2L5OA 2LV3A 1XIYA 4F03A 2M72A 1WJKA 1A2JA 1X0RA 2R0CA 2GSTA 3M9KA 4ID0A 3NZNA 1BAYA 5B8BA 3O76A 4YKFA 2GZYA 1ZYNA 3HY2A 1TOFA 5G1KA 6GSYA 3CSJA 3GV1A 5IQYA 4O5RA 3TJGA 3E3EA 1GSUA 4OFMA 2EIOA 4IGJA 3FMWA 3HVVA 4QL9A 5JWQB 2VLTA 3ZL5A 2GSRA 1XW6A 4KGIA 4TXVA 1XXUA 5ECRB 4TN8A 1M9BA 1PSQA 3F9UA 4KE3A 4I8BA 1MTCA 1QMVA 3P2AA 3FRCA 2WFCA 2CX3A 3I6AA 3APSA 2YWOA 4TW5A 1V2AA 1EOGA 3W8SA 2F8FA 4V2NA 2B1LA 2VO4A 2HE3A 4BVXA 1EP8A 1WIKA 2BJXA 1TXXA 1JZRA 2P31A 1PRXA 4KW6A 4X1UA 3LORA 2VUPA 4EXJA 2F8AA 1LU4A 2HSYA 4KA0A 3L9UA 1MD3A 2PERA 3W6GA 4HZ2A 1M99A 1SENA 4HJ2A 1WMJA 5IIZA 3A2XA 3IV4A 5HFGA 1ERTA 2P5RA 1XWBA 5HQPA 4BL7B 3GMFA 2X8GA 3DRNA 3D6IA 3KP8A 2YNXA 5ECOB 2QC7A 2PBJA 2PUKC 3GUSA 1I5GA 1X5DA 1KBNA 3SWLA 5CNWA 2PPTA 2JZTA 4OMVA 3MYDA 1Q4JA 2FWFA 2WULA 22GSA 1S3AA 5IMAA 1SYRA 4NXIA 4D73B 2CAQA 3F6DA 2O8VB 1GUKA 1YZXA 1SYXA 4K2XA 1GSSA 2FGXA 1SK2A 4AF2A 2K6VA 3KXOA 2L5LA 5HR0A 2QA2A 1ML6A 2GTUA 2WZ9A 3HCZA 1PX6A 2DKIA 4HQSA 2H6ZA 2DJ2A 2LUSA 5IMFA 4J56E 2GSQA 2WGRA 2H0IA 3ZLPA 2LRCA 1IYHA 2BTOT 1XCCA 2VM2A 1FOVA 5HR3A 3EPTA 7GSSA 3DD3A 5KEJA 2JACA 3P7XA 3TOTA 4O5QA 2H71A 2LJRA 1A0RP 2CVBA 1X9WB 1BEDA 1TU7A 3IBHA 5DVBA 4PURA 4NV5A 5G30A 3HXSA 1GL8A 3F4RA 3CRTA 3EMXA 3BCKA 2GS3A 3DMLA 3FYGA 2DSAA 1Y6EA 3UBLA 4EUYA 4X43A 1YDKA 2XHFA 4DVCA 4WBJA 1H4OA 1K3YA 1SD9A 2GT5A 5ECNB 5DJLA 2GSSA 3CBUA 1ZCPA 6GSVA 1E6BA 1ABAA 3D4TA 3DEXA 1SJ6A 4CY8A 4GXZA 4BL7A 1HNCA 3O6TA 2WB9A 3ZMLA 3C7MA 2FA4A 4JR4A 1PKWA 2O7KA 1T3BA 1O85A 3EVIA 4HZ4A 1K0DA 4TVEA 2X8HA 2I4AA 2X8CA 2VL9A 1OE7A 1TI1A 3MIXA 3P8WA 5HFIA 3TRQA 2R37A 4F0CA 3QFBC 1TDIA 2I9HA 3F3QA 3I69A 1QXHA 1HQOA 5HFKA 3F3RA 2OKAA 3FR3A 3WYWA 3TKRA 4IBPA 1EEMA 3EU4A 1V40A 4QQ7A 2CVKA 2LJAA 4MJBA 1GNEA 2L6DA 1XWGA 1FVJA 4WKWA 8GSSA 4K0NA 2YZHA 1IYIA 4K7OA 1EGRA 1VRSD 2K9FA 4OD7A 1BYEA 4PTSA 3IA1A 3OR5A 5IPHA 2A2SA 3EINA 5B8AA 3VI7A 4G2EA 4NMUA 4N0ZA 4MJEA 1YEXA 4Z2RA 2HZFA 2IMFA 4NAXA 2LNSA 1ZYEA 3L78A 2H76A 3R2QA 4YQVA 1XVWA 2DIYA 1M2BA 3HJPA 2DJ0A 3IR4A 4TKYA 3Q74A 1SL0B 1X5CA 3ZYWA 1A2MA 2XPDA 2PMTA 3QDNA 1CQHA 1GSFA 2NPBA 4N30A 2JZSA 3GNJA 5ELGA 2MZCA 1NW2A 3VFIA 4KDYA 1YEPA 4K5SA 1TK0B 5ECKB 1SKRB 3KCMA 1KEBA 3R3EA 4K5RA 4F9ZA 3CYNA 1SL2B 4MZBA 4ECCA 3N9JA 2WJUA 2XBIA 2DBCA 5H5SA 2A4VA 5IMDA 3TKQA 5B6MA 3M0FA 2JU5A 4J57E 3WGDA 4ZL7A 1O81A 1A0FA 2C3NA 3A2WA 1GNWA 4POLA 2YJ7A 2H75A 5H5QA 3D0ZA 4K2DA 4WETA 2K8SA 4DSRA 3W8JA 4NHWA 2L59A 5GAPD 1OC3A 3M9JA 5ECLB 4X0XA 1EWXA 5ECPB 2RLIA 2O89A 3HKRA 2HT9A 5JCUA 4GTUA 3V1WA 3KP9A 5D9XA 4DEJA 3FR9A 4XS4A 4PNFA 2IL3A 1GSDA 6GSSA 4XRAA 4HU9A 2HFDA 2R0PA 4GSNA 1TK5B 1O6JA 4K9ZA 1XPVA 5FWGA 2AB6A 1R5PA 3BD2A 1M3IA 3EYTA 2LTKA 3APQA 5CRGA 3E0UA 2FWHA 2VCTA 1GULA 1B48A 1O7UA 1ACVA 2YN1A 1R5AA 1GH2A 3GHAA 4IP1A 2LQQA 2CAIA 3QPMA 3MDKA 4ZILA 2OBKA 1B4QA 1XWKA 1MD4A 2DJKA 3HVNA 3GYKA 5AIVA 4GLTA 4LLRA 4K1FA 1A8YA 1DSBA 1AIUA 6GSXA 4MP4A 1S3DA 1GWCA 2YPMA 3BBYA 3GSTA 3TB2A 3GH9A 1G7OA 3QAWA 1VF3A 1C72A 3F4SA 1PKZA 2C3QA 4N0VA 1TRVA 2CX4A 1K0NA 2UZ8A 1QFNA 1ZYPA 3HDCA 3PR8A 1WOUA 2GQKA 2R5GA 4O32A 5ECSA 3UOMA 1URMA 2Z9SA 3GN3A 1MEKA 2V41A 1B8XA 4PX1A 1TP9A 4K6XA 4ECBA 4O5UA 2YJHA 2MMZA 3ZFBA 5DQSA 4YAVA 1Z7PA 1GP1A 1XWAA 2H0HA 3ME7A 4NHZA 1OE8A 1PL2A 3ERGA 4N11A 2DC5A 1TTZA 2DIZA 12GSA 5DJMA 2GVPA 3ZZXA 2H73A 3L9SA 3ZFLA 3D21A 3UVTA 2DJ1A 2GLRA 4TR3A 5J3RA 4PQHA 1RK4A 3GTUA 4WXTA 3G9BA 1DE1A 1EZKA 4O92A 2IMDA 3WT1A 2QKEA 1FO5A 4MF7A 5J41A 4P3YB 1GSYA 1F9MA 2IWTA 1AAZA 1JHBA 3GX8A 5EY6A 3C8EA 3O3TA 4NV2A 3HA9A 3F6FA 4IN0A 4Z7XA 3KJYA 2IFQB 3GKXA 18GSA 1QQ2A 4GRFA 4H86A 2EIQA 1X9SB 1PMTA 5FHIA 3LYKA 3VK9A 4TXOA 3DGQA 3G7JA 1A23A 5A4WA 3GX0A 2AUVA 4XTSA 4I5QA 1EOHA 4ZB9A 1I9DA 2YOIA 1S3RA 2J9HA 2R3XA 2H01A 3JCML 1MDIA 5KOXA 3BOAA 2HRFA 1O8XA 3HHVA 5E4WA 2HRNA 4ECJA 4V2MA 4BVYB 4EF0A 2XBQA 3FZ4A 2TRCP 3ZIJA 5D93A 5IOWA 5G1LA 5LD0A 1QUWA 2NDOA 5A5KA 4ILFA 3GA4A 2H6XA 4PUAA 1HYUA 4ZL9A 3ISOA 4IW9A 1U3IA 3WGEA 3VWVA 3CRUA 1BG5A 2KOKA 1K0AA 2LRTA 2A2RA 3ZRDA 5G5FA 4Z2TA 4ML1A 4E8EA 3HJOA 4IHUA 3FW2A 4FQUA 4WR5A 2CZ2A 1ZOFA 3VWXA 5J5NA 5DCGA 3TCOA 2LJKA 3ZIVA 3AY8A 2V6OA 2GQMA 3KIJA 4ZB6A 1M2AA 3TKSC 2NVLA 4JRRA 4QL7A 4JZQA 2C80A 2H1BA 1FHEA 3HVXA 2WS2A 4ISDA 4RI6A 3CXGA 3NOFA 13GSA 1PFOA 2JSZA 2EC4A 6GSUA 4MF5A 4KDXA 1XOAA 2EIRA 3EC3A 1LJRA 2C4JA 2R4VA 1K0CA 5GSTA 3KH9A 4LA1A 4ML6A 3WGXA 3GURA 3ZREA 3IK9A 3FZ5A 2E2GA 1NHOA 4ICYA 5D9WA 1JZOA 1Z5YE 1YKCA 3F0IA 2PGTA 2YP6A 1W89A 5BMUA 4MDCA 3G7IA 3S9FA 1USBA 4I2TA 3RBTA 1QK8A 5D8IA 2IFQA 1AXDA 3F8UA 3HZ4A 1T7PB 4I2UA 1ST9A 2D2ZA 2MBSA 5ECQB 4WR4A 2B7KA 4HSCX 2LS5A 4FO5A 3LG6A 2GZPA 3KTBA 11GSA 4E8HA 1F6MC 2VL2C 3IOSA 1ZYQB 3GIXA 1ZL9A 1YF0A 3TKSE 4F82A 2QGVA 2H66A 4Q5NA 1GUMA 4BVYA 3CTGA 4CDOA 1NHYA 1PGTA 1UN2A 2PVOC 1X9MB 3KH7A 4G0LA 3TRPA 16GSA 4ECIA 2LQOA 2FCHA 4FYCA 4KCEA 2X64A 3QAVA 1TRUA 4OO5A 5CP1A 1XBSA 3TDGA 2DJ3A 4IP6A 1PA3A 4TRXA 1HD2A 5EL8A 4J2FA 4IJIA 2N5FA 1FB6A 1GUHA 20GSA 3GSSA 2NTOA 3UEMA 1VF1A 3UJ1A 2GDRA 2RIIA 3KTLA 2YCDA 2FNOA 3DYRA 2HXKA 2PN8A 4JU5A 1MDKA 4D73A 1X5EA 1U87A 2CVDA 3TOUA 1NSWA 2LKUA 1TU8A 2NBSA 4KSOA 3QR6A 1J9BA 2B6MA 3VPQA 2CZ3A 5B7CA 3UMAA 1G0TA 4MZCA 4XHMA 3CSHA 5F06A 2CQ9A 4TR4A 2MMOA 3J7Yk 1RQMA 3TJKA 5IMZA 2E0QA 4YQUA 4F2IA 1AQXA 3EE2A 1R7HA 1V98A 4OCFA 4WF5A 4JR6A 4ACSA 5IO0A 1YF1A 1QGVA 2N5BA 3VWWA 1RW1A 3WD6A 1GLQA 1UC7A 4DSSB 2QSIA 2OJLA 2IN3A 1ERWA 3TKPA 1PN9A 2RM5A 2HYXA 3HYPA 1SU9A 4EKZA 3IPZA 3LFLA 3FKFA 4MNNA 5KN0A 3BCIA 3A5WA 2LSTA 2F51A 4G0KA 4IQ1A 1GTAA 1XZOA 5AIXA 3LGCA 2L4CA 4K0GA 1YJ6A 3KD0A 5H5RA 2J23A 1VF4A 1G6WA 1JZWA 4MK3A 2B5EA 5A4UA 4MLYA 3KGKA 2F9SA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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