3LW9A

Structure of a cytoplasmic domain of salmonella inva
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
166
structure length
166
Chain Sequence
ETVPLILLVPKSRREDLEKAQLAERMRSQFFIDYGVRLPEVLLRDGEGLDDNSIVLLINEIRVEQFTVYFDLMRVVNYSDEVVSFGINPTIHQQGSSQYFWVTHEEGEKLREMGYVLRNALDELYHCLAVTLARNVNEYFGIQETKHMLDQLEAKFPDLLKEVLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Protein transport
molecule keywords Invasion protein invA
publication title A conserved domain in type III secretion links the cytoplasmic domain of InvA to elements of the basal body.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 44
structure length 166
sequence length 166
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.60 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3lw9A00
4A5PA 2X4AA 3MYDA 3A5IA 3MIXA 3LW9A 2X49A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GFKA 4P3YB 3MYDA 3L9VA 4PUFC 4F82A 3LQ7A 3GYKA 1XFLA 2FD3A 5ECQB 3TKSA 4ZIJA 1V40A 4FH8A 1GSFA 1M2DA 1OKDA 3LW9A 2H0HA 3DWVA 4NPBA 2I1UA 4MP4A 4ULXA 2H0GA 3WT2A 4BWQA 5ECOB 5F06A 4EVMA 3C73A 4IELA 4OFTA 4F2IA 3TKSE 2F9SA 3L78A 1V2AA 1G7EA 2DJ3A 1LU4A 3W8JA 3FR6A 1EV9A 2BMXA 1YJ6A 4IQ1A 3FZAA 2GDRA 3EVIA 3D0ZA 1QXHA 5G2ZA 3M8NA 3K8NA 3W6GA 3WYWA 4MJAA 3Q19A 4GF0A 3MDKA 6GSSA 1YF0A 2G2QA 3KTLA 2O7KA 4N0VA 2AUVA 4PUAA 3TJGA 4IGJA 2GZPA 1X5EA 4IQAA 3LYPA 1VF2A 1T4YA 2H66A 3FK8A 4OFNA 3GKNA 3HY2A 4K2XA 4KDXA 4EIQA 1PX7A 4G9HA 3KXOA 5IPHA 5JWQB 1O73A 5F07A 1N2AA 4MF7A 2CA8A 2B6MA 4YAPA 5JWRB 3DIEA 3LFLA 3NIVA 1WRYA 2KHPA 2JADA 1K0DA 1A23A 1XWAA 2L6DA 3KH9A 4Z2UA 2JL4A 3KH7A 1X9SB 5FWGA 1YKCA 1MTCA 4CY6A 2H71A 1JZRA 3VWVA 1M3JA 1M9AA 2DMMA 4WBRD 5GAPD 3BOAA 3EWLA 2WDUA 5IPGA 2V6KA 1T00A 4V2MA 1K0CA 2FGXA 5CNWA 3TJJA 1XXUA 5B6NA 2AJQB 4DSQA 4ZBDA 2V6OA 1TDIA 1AUCA 3MSZA 1J08A 2IMFA 3CMIA 1K0NA 1VF1A 2DSAA 2I81A 4GRFA 6GSXA 3IV4A 2ZNMA 3M3MA 3F6DA 1F2EA 4MZCA 2L57A 2TRXA 5EL8A 3A5IA 1G0TA 1W4VA 5G1LA 1HD2A 4K5SA 3W8SA 1GWCA 1PL2A 1XG8A 3QDNA 1IYIA 1MDKA 5CRDA 4POMA 1Y25A 1FHEA 2CAIA 1JHBA 3ZIJA 1FAAA 2FWGA 1S3CA 4NV2A 5BRTA 2LNSA 3M9JA 11GSA 4XHMA 4FIWA 1ABAA 1UA5A 3DRNA 3TKSC 1EV4A 4PURA 2EIRA 4XRAA 4EDZA 3RDWA 2A4HA 3PH9A 5AN1A 2IMIA 2LV3A 4TR1A 1HNAA 1N8JA 4K0NA 1YZXA 2OJLA 5HR0A 3I9V2 2C0FA 5ECMB 5AGYA 1QK8A 3BCKA 2VD1A 3DYRA 1M2AA 5KEJA 5KN0A 1E2YA 5DALA 1AAZA 2IMDA 2F3MA 2H1DA 1GTBA 1R5PA 1XZOA 5D8IA 3D4MA 3LJRA 2N5BA 1OVNA 2X4AA 3EMPA 1E6BA 3H4KA 2YPMA 4ZILA 2K8SA 1GLPA 1GH2A 2ALBA 4YQMA 5F05A 3QFAC 5IM9A 6GSWA 6GSYA 1XVWA 3QPMA 1B48A 2ZUPA 2DIZA 2FUG2 4ECIA 1BJXA 4E8EA 5IMAA 3ZMLA 4PQIA 1SK2A 2WZ9A 5DCGA 1B9XC 4G0LA 4I6XA 4ML1A 4XS6A 1SKRB 4X0XA 3I69A 3ZREA 1X0RA 3A2WA 1K3OA 3ZVJA 2H8LA 1BYEA 1M9BA 3IXRA 3D5JA 3VPQA 4NAXA 3LGCA 1K3YA 5D73A 3EINA 5IOWA 2DC5A 1GUMA 3VLNA 3O76A 2B5XA 1AIUA 1GSUA 3F3RA 2K6VA 4MNNA 1QMVA 3ME8A 2TRCP 1O6JA 4A5PA 1AC1A 2IWTA 2C1YA 2AYTA 2VOCA 2L4QA 2HZEB 1XIYA 3F6FA 1VF4A 1XWBA 2HT9A 3HDCA 1ZYNA 4WEYA 1EGRA 4FYCA 1R7HA 2CT6A 4XRDA 1EP7A 1R5AA 1BAYA 4YQVA 3A5WA 5GZZB 3QMXA 2H6ZA 3C1RA 2PERA 1TJDA 4XIHA 3PPUA 1F6MC 3KGKA 3LORA 1ERTA 4GSTA 1XOAA 2GS3A 3RPNA 2PMTA 1ZYQB 1ZOFA 3ZYWA 1S3AA 4RQRA 4I2TA 4DSSB 3TOUA 2HNLA 1ZCPA 3C71A 1W89A 4J57E 2DJ1A 1OE8A 4KDUA 2X49A 2C3QA 3HJPA 3G7JA 1KNGA 1OC9A 2YV7A 3APQA 4MZBA 3GKKA 1AQWA 3LYKA 4TXOB 4G0IA 4IP1A 2X99A 2R5GA 1Z5YE 4LLRA 2FHEA 2WGRA 4I2UA 17GSA 3PGTA 2GGTA 3TCOA 5G1KA 2KLXA 3TJFA 3EU4A 2F51A 2OADA 1PKZA 4H86A 4OWYA 1T7PB 2XC2A 2FY6A 1SKSB 4WF4A 3VWUA 4TVEA 1O8WA 2H1BA 4HUAA 1K3LA 5IQYA 2C4JA 3IK9A 4WF5A 5ECNB 5IOXA 1K0AA 3VURA 3BJ5A 4N11A 1YKAA 1MEKA 2R0GA 1YQ1A 3IPZA 2FLSA 4WR5A 3R2QA 1KTEA 4D73B 1TTZA 2D2ZA 3VK9A 1O7UA 5GSTA 2HI7A 4BVYB 1KEBA 3F0IA 4HS1A 3HVXA 1HYUA 5IMFA 5J9CA 3GH6A 4EDYA 3G9BA 4Q5FA 4Q5QA 5B8BA 4HU9A 4XTSA 1RW1A 3GSSA 4USSA 4ID0A 4NV5A 2CAQA 3Q18A 2HYXA 1GUKA 2FWHA 4BIKA 4XCSA 4JBBA 4HDEA 1UN2A 1B9YC 3EURA 4JZQA 1SJ6A 4XS1A 2RM5A 3E3EA 5ID2B 1M99A 2JZTA 5B8AA 1OC3A 3F4TA 2YANA 4J2FA 3P2AA 2BTOT 4NXIA 2NTOA 1TP9A 2HXKA 3ED3A 5DDLA 2NPBA 2VL2A 5DQSA 2UZ8A 1Z3EA 3KP8A 2H70A 5ECIB 1A8LA 1R4WA 2GT6A 3FHKA 8GSSA 2P0GA 2R0PA 2PGTA 3C1SA 4ZB6A 1GRXA 4K0GA 1MDJA 4JU5A 2Z9SA 3HA9A 1M0UA 3IHQA 2V32A 4EC0A 2GQLA 2R2JA 5IMZA 3GIXA 4KW6A 3HJMA 4TW5A 2RLIA 2M72A 3ZL5A 3SBCA 3VWWA 4GLTA 2H1AA 1QUWA 1WOUA 2DLXA 5A4WA 3C7MA 5JCUA 3ZFLA 1JZOA 5DJMA 2IN3A 2GZYA 4ZL9A 2L6CA 3HKRA 4WXTA 2V41A 3AY8A 2IPAA 4BVXA 2QSIA 2O87A 1UC7A 5B6MA 1TI3A 3UJ1A 1A0RP 2CVBA 2A2SA 2H73A 3GV1A 1SU9A 4IJ3A 1ACVA 4I8BA 3IDVA 1GTUA 3ZVJD 1DE1A 5EVOA 4CHSA 3VWXA 1SK0A 1PSQA 3EC3A 4WBJA 4WETA 1THXA 2NBSA 2WRTA 3APSA 1T3BA 4K7OA 3FR9A 4TXVA 3UVTA 4ECCA 1ERWA 4G2EA 3I43A 3FY7A 1OYJA 4ILFA 4N30A 1U3IA 1QFNA 3EYTA 5CRHA 2YZUA 3LXZA 5DAKA 1BEDA 3FMWA 1BX9A 3FYGA 2MMNA 5G30A 5FHIA 2L5LA 4I5QA 2GVPA 4Q5RA 4V2LA 2L59A 2CZ3A 2VL3A 2X8HA 3CSJA 5E4WA 2XBIA 1FOVA 12GSA 1YY7A 1PFOA 1M7TA 1Z6MA 3FR3A 4GWRA 18GSA 1UVZA 4AJ6A 3UL3A 2PVQA 3C8EA 2XHFA 2MMAA 4LMWA 1GLQA 3IR4A 4G0KA 2XPDA 4NHWA 1GNWA 4GTUA 2H30A 2E2GA 2MMZA 4KCAA 4WR4A 3KTBA 2DJ2A 2OBKA 1HNCA 4BL7A 1Z6NA 5ELGA 1YEXA 5AISA 4RI6A 4IJIA 3V1WA 1RQMA 4Z2TA 4HSCX 1O85A 3WD6A 2DKHA 1G6WA 4DSRA 2BJXA 4EXJA 1X5DA 3RBTA 2C0EA 2A2PA 1OKTA 4G10A 3GX8A 1GL8A 3CXGA 4GCIA 4XS4B 3GTUB 2VL2C 4LL4B 4PQHA 1K0OA 2X8GA 1F37A 2E2MA 5KN2A 1JLWA 4HJMA 2WB9A 3GL5A 2FCHA 4YAVA 2MMOA 1TRWA 2N5AA 1F9MA 5IO2A 3A2XA 4L8EA 4O5QA 4AGSA 1EOHA 2B7JA 1SKWB 5COHA 1USBA 4EE0A 1QGVA 1XWKA 5ECHB 1A2MA 3H93A 3RHCA 2GSQA 2GSRA 2YZHA 3D21A 3L4NA 2IFQA 3IOSA 1X9WB 1ZYPA 2DKIA 4OCFA 1QQ2A 3BCIA 6GSTA 1TI1A 1X5CA 7GSSA 2XBQA 3HCZA 2HFDA 1BG5A 3U5RE 3ME7A 5IMCA 4NMUA 2X8CA 5HFIA 2O89A 2KP2A 3WT1A 2MYGA 4EL1A 4L5OA 4KSOA 1A2LA 4L0UA 4MF5A 4EUYA 3ZITA 4IW9A 3GHAA 2YNXA 5A5KA 1PD21 1EOGA 3D22A 4POBA 3CBUA 2LTKA 1T8EB 5ECLB 1SENA 1A2JA 5INYA 5GAND 3A3TA 4X43A 3BD2A 5LD0A 1Z7RA 2YWOA 3GKXA 1FVKA 2GT5A 1GSYA 2VUPA 2OE3A 2YWMA 5JCGA 4QL9A 4YH2A 4YKGA 2GQKA 2I9HA 3F8UA 3HD5A 5H5RA 1XCCA 4I97A 2PUKC 3FW2A 2A2RA 3P90A 3IRAA 1WMJA 1YDKA 13GSA 1DBYA 2LQOA 1WJKA 2H75A 4BA7A 1BQ7A 3DMLA 1AW9A 1XW9A 3PR8A 5G31A 1V57A 5JCWA 5IO0A 3GURA 2V2GA 1G7OA 1TRSA 3ZIVA 1F3BA 5EPFA 3TUEA 3GA4A 4EIPA 1JLVA 2IL3A 2H01A 1XWGA 5ECPB 3LG6A 1TW9A 2IMEA 2H6YA 3I6AA 5KOXA 1NM3A 5D96A 2J23A 1Z9HA 4IHUA 3LWAA 4ECJA 3FRCA 3DVWA 2HE3A 3F4SA 1ILOA 5D9WA 3GX0A 1SYRA 5A4VA 5LNKe 5JWOB 3IC8A 1GSSA 5C00A 3UARA 1SL2B 3G7YA 3ZFBA 1SJIA 1GSQA 4OO4A 2JU5A 1F3AA 1GTAA 2N5FA 4RUVA 2KUCA 4HEA2 5DCHA 4KCEA 3ZZXA 1ST9A 4ZXGA 4ZL8A 3MAKA 1AXDA 2LQQA 4HQZA 2CZ2A 3VFIA 3KJYA 2H1GA 2HRNA 1TRVA 2L4CA 2HSMA 2I4AA 2PPTA 4DVCA 5LCZA 3F63A 3GH9A 3RHBA 4KSMA 2PBJA 1FVJA 1FO5A 3WGEA 2VIMA 2R3XA 2RM6A 4X4JA 3ZMKA 2NDOA 3R3EA 4K7IA 4IN0A 2DBCA 1GNEA 3DEXA 4OD7A 16GSA 4PX1A 4BPYA 3QCPA 3GN3A 4BWSA 1V98A 2LEGA 5D9XA 1S3DA 4MPFA 3KM6A 1PL1A 2WULA 4KH7A 2QC7A 4ICYA 3GL3A 3L9SA 5J4UA 1EWXA 2HSHA 4CW9A 2VM1A 1VRSD 2JZSA 4ZB9A 3KCMA 1SL0B 2C3TA 2DJ0A 2VAFA 5L71A 3GMFA 2PU9C 2IIYA 4PQ1A 1GSDA 4KB3A 3VI7A 2QA1A 2GSTA 5CP1A 1MD3A 4PTSA 3Q74A 3N5OA 2YWNA 2YV9A 3ERFA 5ABRA 1NHYA 5CO3A 3QFBC 2FNOA 2R6KA 4TR0A 1GP1A 2H0IA 2AAWA 3HZ8A 5CRGA 1SD9A 5AIVA 1M2BA 1PN0A 2MBTA 4LL1B 3ZLPA 4Q5NA 2LNTA 2JSZA 4F03A 3TKQA 5KOWA 6GSUA 1PMTA 4F0BA 4RQXA 1J9BA 1H4OA 2C3NA 3RAZA 2AB6A 3QAGA 2ZCTA 3H1NA 2LRNA 3GRXA 4TOPA 4FYBA 4N10A 2WS2A 19GSA 1YEPA 3ERGA 1GSEA 4JR4A 22GSA 4F9ZA 3EPTA 5HR3A 3ISOA 4HQSA 3F4RA 3EU3A 4AF2A 2LRCA 4GSSA 5H5QA 3M0FA 5F0GA 1EEJA 14GSA 4TR1B 1THOA 1SJZA 2GSSA 4O5UA 1LBKA 1ML6A 2RUEA 1IYHA 3D4TA 5CAXA 4IVFA 4PGTA 3UMAA 2K8VA 4KF9A 5HFGA 5KN3A 2J9HA 3UIWA 4K1FA 1HNBA 3TJKA 1PX6A 5DALB 3DKSA 1XPVA 3IC4A 1Q98A 2VLUA 3FZ4A 2EIOA 2YOIA 3GUSA 3D6IA 2R0CA 4KE3A 1XWCA 1RK4A 3IAM2 2H74A 5GSSA 3QAWA 2HLSA 2O85A 5ENUA 2IJYA 3GKMA 5F8BA 1U88A 3HZ4A 4JEDA 3TB2A 4MJEA 5HR1A 4J56E 3UAPA 1SYXA 1FW1A 2HZEA 1R26A 2VD0A 3KD0A 3HYPA 2R4VA 4IP6A 3KP9A 4JR6A 3IE3A 4JRRA 1WWJA 1ERVA 3FEUA 2B1LA 3BBYA 3G7IA 1GULA 1ZYEA 3L0HA 3P8WA 5ECSA 2C8UA 4GQFA 2ON5A 3US3A 4EF0A 4K2DA 4MMMA 3DGQA 3ZRDA 4TR4A 1ERUA 5FT3A 2PN8A 1OAZA 20GSA 4OFMA 4DSSA 2VO4A 3E9JB 2VCWA 1NSWA 4ACSA 1PQNA 3J7Yk 4AJ7A 5IIZA 2NVLA 4QL7A 3TGZA 3DVXA 1FOHA 2K18A 3F9UA 4JE1A 1PN9A 2VLVA 3HHVA 3HVNA 2LS5A 1WP0A 2P5RA 1VF3A 4MCUA 2V1MA 3KZQA 5CRWA 4TXOA 2LJRA 4ZL7A 1NW2A 1ZGNA 4N0ZA 4KAEA 2M80A 2VCQA 4MABA 1OC8A 1T4ZA 4NHZA 1TK8B 1DE2A 1I5GA 3HXSA 5C04A 4ECBA 2H6XA 4ML6A 2ES7A 2HSYA 1FB0A 1U87A 4K8MA 3TRQA 5DBQA 2HRKA 4Z2RA 1ZZYA 2JSYA 3F3QA 3IAS2 2GZZA 3GSTA 2XPEA 3QD9A 4IKHA 4O32A 1JFUA 3JCML 2YWIA 1OC9B 1TKDB 3O6TA 2AHEA 4KX4A 2A4VA 3ERWA 4IS0A 4V1Ag 2KP1A 3A2VA 4D73A 4HZ4A 4O92A 1TK5B 2C80A 1C72A 2K9FA 5D9VA 4X1UA 4BVYA 2KOKA 2HRAA 9GSSA 1H75A 2OE0A 3H79A 4V1Ap 5D9TA 1EGOA 3H8QA 2B1KA 1A24A 1XBSA 2IMKA 1EP8A 1XOBA 2YJ7A 2VLTA 4OCEA 4KUNA 3QR6A 1FB6A 3NOFA 1T1VA 2CX3A 2FWFA 4MF6A 1U3AA 1TOFA 5HFKA 5B7CA 1GUHA 3HVSA 1B4PA 2PVOC 5ECKB 3APOA 1PGTA 4L0WA 5ID2A 2LKUA 4GSNA 5J41A 2VCZA 5EY6A 5CREA 2OA7A 3O3TA 4K7NA 5AIXA 4MDCA 4HZ2A 4V2NA 2WCIA 3SWLA 4ZB8A 4GQCA 3WGXA 2GTUA 3CRUA 3N9JA 3MIXA 2JACA 3ZTLA 1MD4A 3EMXA 2C0DA 2VCVA 3DD3A 5H5SA 2P5QA 1X9MB 1VGLA 2E0QA 3TDGA 5E59A 4QQ7A 4CDOA 2EIQA 4KA0A 4MA9A 1TXXA 2LJKA 2QGVA 3CYNA 3TKRA 3IA1A 2LUSA 4HI7A 4YQUA 2CX4A 3Q6OA 2VCXA 3CTFA 2DIYA 1SD8A 2VL9A 4YKFA 2DJJA 1SL1B 2MBSA 3PINA 4MJCA 1V58A 5ECRB 4PNFA 5CYYA 2HRFA 4RI7A 2B7KA 2YP6A 4IBPA 2RUFA 4K6XA 1XVQA 3M1GA 1AQVA 1JZWA 1S3RA 4TRXA 3CSIA 1Y6EA 5BMUA 4MJBA 1MDIA 2YN1A 2EC4A 1K0MA 4OMVA 1TU8A 4HOJA 5G5FA 3CTGA 2REMA 3E0UA 3HJOA 3MWHA 1U6TA 3M9KA 4FQUA 4DEJA 3TRXA 4FYUA 2O8VB 4MH3A 4ISDA 1PKWA 3QAVA 4ZBBA 4BVXB 2VCTA 3QOUA 3KIJA 2B5EA 4KNDA 5KN1A 2LSTA 2FA8A 1K0BA 2GLRA 2AV4A 3KEBA 2YJHA 1OE7A 3IK7A 4EKZA 5G5EA 1J0FA 1O8XA 4LMVA 1CQHA 4AJ8A 1G6YA 1WPIA 3FZ5A 3IHGA 3U6VA 3IBHA 3FKFA 3J7Yb 2DJKA 1TRUA 3KMOA 2F8AA 4GXZA 3LXTA 2VM2A 1B4QA 3GNJA 2CVDA 2M46A 3CRTA 4TR3A 3OR5A 4HJ2A 3L9UA 4MH2A 5DAKB 5IMDA 2OACA 3KMNA 4KDYA 1YF1A 4EO3A 3UBKA 3DXBA 4O5RA 1KBNA 2DMLA 1PA3A 3UOMA 2TIRA 3MNGA 2PWJA 1JZDA 4FO5A 2QA2A 1AQXA 4OO5A 2R37A 5IMVA 1WIKA 5DVBA 1ZMAA 5A4UA 1EEMA 2G0FA 4PNGA 1SK1A 3LEFA 5DJLA 5ELAA 2H72A 3LSZA 2GQMA 3P7XA 1ON4A 2WFCA 2OE1A 2CQ9A 3TRPA 5J3RA 1O81A 4XS4A 3GTUA 2H19A 5D93A 1XW6A 3NZNA 4NWYA 4PXOA 2WJUA 3WGDA 1I9DA 3TOTA 4BL7B 2YCDA 1B8XA 4ZBAA 2JZRA 5HR2A 4MPGA 2OKAA 2LRTA 1PRXA 3CQFA 3FZ9A 1GTIA 4K5RA 4LA1A 5J5NA 3TKPA 2P31A 2X64A 3RPPA 3S9FA 1A8YA 2FWEA 1Q4JA 2I3YA 2CVKA 4E8HA 4POKA 4MZWA 2CV4A 2LJAA 2H76A 3UVHA 2OBIA 3VPTA 4KGIA 4MK3A 3EE2A 1FG4A 4G19A 3VI5A 2C0GA 2FA4A 1DUGA 5J9BA 1EZKA 1ZL9A 3UBLA 1V9WA 2E7PA 4WKWA 2IFQB 4Z7XA 5HQPA 1DSBA 1Z7PA 1CQGA 2RIIA 4O7HA 4K9ZA 1WE0A 1TK0B 4L5LA 2ON7A 3TJBA 3HVVA 4TN8A 1HQOA 2QKEA 2HZFA 10GSA 1A0FA 4TKYA 5DQYA 2L5OA 4CY8A 2B3SA 1NHOA 4POLA 2B5YA 6GSVA 2MZCA 1M3IA 4F0CA 1TU7A 1URMA 4MLYA 3CSHA 3UEMA 2F8FA 1LJRA 4HU7A 1XW5A
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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