3O6TA

Mycobacterium tuberculosis thioredoxin c c40s mutant in complex with quinol inhibitor pmx464
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SATIKVTDASFATDVLSSNKPVLVDFWATWCGPSKMVAPVLEEIATERATDLTVAKLDVDTNPETARNFQVVSIPTLILFKDGQPVKRIVGAKGKAALLRELSDVVPN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Electron transport/inhibitor
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Structure of Mycobacterium tuberculosis thioredoxin in complex with quinol inhibitor PMX464
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
total genus 27
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3o6tA00
3HDCA 2NPBA 4F03A 2DMMA 4YAVA 4Q5QA 2VIMA 4KNDA 4HI7A 2QGVA 1ABAA 3DYRA 4E8EA 1SJIA 3UJ1A 1XOBA 3EE2A 5A5KA 4V1Ag 1ZGNA 3IBHA 2FLSA 1NHOA 3M9KA 2IJYA 4IJIA 3MAKA 1XWBA 3RHCA 4MF7A 5DCGA 2YPMA 1XFLA 3WT1A 3TKSC 4V2MA 3BOAA 3F3RA 1K3YA 1RK4A 4G19A 2LV3A 3FZ5A 1ERWA 3TKQA 4FH8A 5E59A 2PWJA 1OC9A 4ISDA 1M2DA 1TRUA 4K6XA 4ZL7A 4I2UA 4KH7A 3VLNA 4ZB8A 1F3AA 1UVZA 2IMIA 4IGJA 3ERWA 1PGTA 3QAGA 1R26A 2F51A 4IP6A 2XPEA 1TTZA 1YKAA 4O32A 3H79A 1VF4A 4PNGA 2B3SA 2N5BA 4OO4A 1SU9A 4HUAA 2X8HA 2EIQA 1Z7PA 5ECPB 4AJ8A 5DVBA 1OC9B 3VK9A 2HLSA 3ZYWA 4POLA 4TW5A 1GUKA 4WBJA 5HR1A 1A0FA 3LEFA 4DSRA 3F8UA 1PQNA 2LJKA 5D8IA 4NXIA 2IMKA 5G5EA 2VAFA 4WF5A 1Y25A 4BVXA 1V40A 3TJBA 1XCCA 5H5QA 3F6FA 2I3YA 1NW2A 4HZ4A 3LQ7A 5ECNB 2DMLA 3A2WA 3TKPA 3GH9A 1U3IA 2GQMA 2YV9A 2B7KA 3H8QA 2OJLA 1PN9A 3KGKA 3TB2A 1K0NA 4ZB9A 1S3AA 2RIIA 4MJBA 4EE0A 2DJKA 1K0CA 2N5AA 2K9FA 2EIOA 2JZTA 4ZB6A 1M2BA 1A23A 3I43A 2FHEA 1SL0B 5J9CA 1WE0A 4TR3A 3HZ8A 2PVQA 2LTKA 3IPZA 1YJ6A 3A3TA 4ZBAA 3HVXA 3UBLA 3CYNA 2VCQA 2E0QA 4EO3A 1TP9A 1QUWA 1O7UA 1VF2A 3BBYA 2FCHA 1ZCPA 2O87A 2JU5A 4E8HA 4K1FA 2YJ7A 1KBNA 3Q6OA 5GAND 3TJFA 4TKYA 1ZL9A 1SKSB 4OCEA 4GRFA 1R7HA 2L6DA 4HJ2A 2L6CA 1W89A 4MF6A 3PR8A 3QOUA 5EY6A 3SWLA 5J5NA 1ZOFA 3APQA 2RLIA 3KD0A 1SK2A 1JZOA 1DUGA 4QQ7A 1EGRA 1EOGA 2H19A 3ZIJA 4PX1A 1Z5YE 2TRCP 2V41A 4KDUA 1RW1A 4K2DA 4FO5A 3FR6A 4G2EA 1SL2B 4J2FA 2HXKA 4D73A 1MDKA 2OE0A 1HYUA 1GNWA 2FA8A 2LJAA 3D0ZA 3F0IA 3GURA 2GZYA 3P2AA 5ECRB 1FHEA 2X8GA 1ACVA 1WP0A 5HFIA 5CRGA 1B48A 4ML1A 4MZWA 2LKUA 2L59A 1DSBA 3P7XA 3KP9A 5HR0A 2B1KA 3GMFA 4PNFA 3LXZA 2CX3A 2EIRA 2WULA 4O7HA 4HQSA 4I6XA 3J7Yb 22GSA 5LCZA 3VWWA 3ZTLA 1TRSA 1S3DA 2LQQA 4V1Ap 3UBKA 1SYXA 2E2MA 3UOMA 1W4VA 1IYHA 4CW9A 4PQ1A 1M9AA 3HVSA 3ZMLA 3HZ4A 4XS6A 2JSYA 3MNGA 2PBJA 1A2LA 1WPIA 2DJ0A 5CRDA 2GZZA 4ZL8A 2WB9A 1EP8A 4BPYA 1DBYA 3US3A 2FWEA 3WD6A 1ON4A 4BA7A 5FT3A 3IRAA 4LL4B 5DJLA 4I5QA 4MK3A 4PUAA 1OKDA 2PUKC 2OACA 5J4UA 3IAM2 1YDKA 4TVEA 3TKRA 5CRWA 4X43A 4TXVA 4EL1A 1GSQA 1YF0A 2R2JA 4G10A 2GZPA 1SJ6A 5LNKe 3VPTA 1TI3A 3Q18A 1AXDA 3G7IA 2IMEA 2QSIA 2VLTA 1U6TA 2LS5A 4XS4A 3EYTA 3GTUA 1Q98A 3LYPA 1BX9A 2CAQA 1F6MC 2VLUA 2A2RA 1PL2A 3QFBC 4L5LA 3BCKA 2I1UA 3ZLPA 5G1LA 2YANA 5ECHB 2PGTA 5D96A 2DSAA 2L5LA 5CRHA 1ILOA 1VF3A 3I6AA 2H0HA 1O81A 2X64A 4ZXGA 1PX6A 4JZQA 1TK0B 5JCUA 1NM3A 4BVYA 4XS4B 1G6YA 3APOA 2MBTA 5JCWA 3V1WA 3VI5A 4K7NA 4ZIJA 1XPVA 1SK1A 1FOVA 1F9MA 17GSA 3BCIA 2VL2A 2CT6A 4MJCA 4PURA 3GX0A 2C1YA 2L4QA 4TXOA 1A8LA 3UVHA 1TKDB 3QDNA 4N0ZA 4RUVA 1B4QA 1Z6NA 2FY6A 2GGTA 3G7JA 1R5PA 2C0GA 1K0BA 2VL3A 1AQWA 5DAKB 3CTFA 1J9BA 5AISA 4J56E 3CSIA 1EV4A 1FB6A 1TU8A 1HNAA 1K0MA 4OO5A 2H6ZA 1FVKA 5HR3A 1AC1A 1T3BA 1Y6EA 2MMOA 3HYPA 1I5GA 4X0XA 2ON7A 1K0DA 1T8EB 3HKRA 3ERFA 1Z9HA 5F8BA 3ZMKA 4FYCA 2LUSA 3FRCA 5INYA 1MD4A 5FWGA 1O6JA 4L0UA 2JZSA 2XBIA 2YJHA 5ID2B 5G2ZA 2J23A 5HQPA 2J9HA 1T00A 1JLWA 2BMXA 1N8JA 2GQLA 1EP7A 1TJDA 4NMUA 1PRXA 3KJYA 5B6NA 1YEPA 2R37A 2VCWA 1GSSA 1TK8B 1EEMA 4DVCA 2YCDA 2C3QA 3Q74A 1S3CA 4DEJA 2F9SA 5G1KA 2O7KA 3IR4A 4AJ7A 5IO2A 4TOPA 1EWXA 1X5EA 3QAVA 3ZVJD 5B7CA 2F8AA 3KTLA 2I81A 4NV2A 1GH2A 3LGCA 4XRDA 3WGXA 1C72A 1AIUA 2LNTA 3FHKA 1HQOA 5D93A 3IA1A 2X8CA 1AW9A 3EU4A 4L8EA 3SBCA 2CX4A 2VL9A 3NIVA 4K8MA 1WMJA 1FB0A 2ZUPA 4MJAA 2OBKA 2HI7A 5F07A 3TKSA 1M7TA 2C0FA 3IXRA 3IV4A 4XS1A 4MPGA 2CVKA 2R3XA 5J9BA 2LSTA 2V6OA 2GT5A 1PA3A 4WKWA 3ME8A 1XVWA 2X99A 3HVVA 4EC0A 2H0GA 3TUEA 3NZNA 1T4ZA 3RPNA 4NWYA 3QR6A 3FY7A 5ELAA 2C3TA 3KMNA 2RUFA 11GSA 1LJRA 10GSA 2P0GA 1XVQA 5D9TA 1VF1A 3GKXA 6GSUA 1THOA 4IS0A 3M9JA 4O92A 1MTCA 4MH2A 2IMDA 5DDLA 3ZITA 1M9BA 1VRSD 2YNXA 5KEJA 2IN3A 4XTSA 3IDVA 2A2SA 3H4KA 5EL8A 2GSQA 2ES7A 2AUVA 4IW9A 4OFTA 20GSA 2DIZA 5CAXA 2H66A 4KX4A 4GQFA 5AGYA 1SENA 1XBSA 2HRFA 1O85A 3TJJA 2AYTA 1WRYA 3BJ5A 2WZ9A 4OD7A 2K6VA 3U6VA 4EUYA 2N5FA 1K0OA 4AF2A 1HNCA 3UVTA 4MLYA 1JHBA 4POKA 1JZWA 1MDIA 2YZUA 3G7YA 1V98A 1G7EA 3ZREA 4IN0A 2H6YA 7GSSA 4KA0A 1MD3A 3UL3A 5DBQA 2H73A 5IOXA 3WGEA 2LRCA 4EDZA 1X0RA 1URMA 3FR9A 2VUPA 2IFQA 4I8BA 5IQYA 14GSA 1YY7A 5HFGA 4N11A 1J0FA 2LQOA 1KNGA 2KUCA 1GTIA 3F4TA 4PUFC 2EC4A 1LU4A 2XC2A 4YQUA 3OR5A 5IIZA 4KCEA 3DEXA 2H01A 1A8YA 2H1AA 5ENUA 1YEXA 3F3QA 3VWVA 2CA8A 3W6GA 4Z7XA 1LBKA 1KTEA 2YP6A 3VI7A 3TRPA 2IFQB 2YZHA 1A0RP 3VWUA 1O8WA 2HZEB 4Q5NA 2LRTA 1J08A 1UC7A 5IMVA 4QL9A 4GSTA 4GLTA 3O6TA 3A5WA 3FZAA 3MWHA 4WF4A 4MCUA 3UIWA 5L71A 1UA5A 2FD3A 1O73A 2C80A 2O85A 5KN1A 3GHAA 3L0HA 2GLRA 5GZZB 2DJ2A 1SL1B 3ZL5A 4NAXA 4LMVA 4MDCA 4TR0A 1SD8A 5KN2A 1GUMA 4KSOA 2FWHA 1QMVA 1CQHA 2JZRA 3E3EA 1CQGA 2F8FA 5HFKA 5JWQB 3TDGA 4GXZA 1X5CA 3FK8A 1XOAA 3H93A 3WYWA 1Z3EA 4MH3A 4MF5A 2CVBA 2RM5A 3GFKA 5IMAA 4NV5A 2FUG2 2DLXA 3CRUA 1U3AA 2RM6A 1AQXA 4OFMA 4MABA 1X9MB 2JACA 4HS1A 2IWTA 4H86A 1Z6MA 4ILFA 1MEKA 4OWYA 4ZBBA 2IPAA 2GVPA 3P90A 5COHA 3DKSA 3EMXA 3HHVA 1ZYQB 1PKWA 4JEDA 5IMFA 2K8SA 3N9JA 4KB3A 2NVLA 1FO5A 3FZ9A 2AV4A 4HDEA 1XWAA 2KOKA 3I9V2 4MA9A 1B9YC 3I69A 4XHMA 2DBCA 1N2AA 1PKZA 1E2YA 2D2ZA 2H76A 4N10A 4RQRA 4MZBA 3C71A 3TKSE 2ZNMA 1T4YA 2AJQB 4FYBA 1OVNA 2H1DA 3LSZA 5H5SA 2OADA 2NDOA 2B5EA 3JCML 1OE8A 2XBQA 2L5OA 1AUCA 1ST9A 2O8VB 8GSSA 4GTUA 1EGOA 3L78A 3TGZA 2PMTA 4WETA 1THXA 1X5DA 3ZRDA 3C73A 3LWAA 2GT6A 1BQ7A 3QPMA 3QFAC 1QK8A 2VCZA 2VM1A 2C0DA 2GTUA 1YZXA 3A2VA 4ML6A 4ECBA 4G9HA 2OA7A 1BJXA 2PERA 2AHEA 3E0UA 5IPHA 1A2MA 1SKRB 3D6IA 3IHQA 4KDYA 2MMAA 1EV9A 3IC4A 4HEA2 4IJ3A 4YQMA 5AN1A 2DJJA 5D9VA 1UN2A 1X9SB 1BEDA 2KP2A 1HD2A 3M8NA 5ECOB 2VOCA 3A2XA 4HOJA 2PN8A 5D9XA 3EC3A 3DVWA 5B8AA 2WCIA 4ZILA 1XWCA 1O8XA 1PX7A 2V32A 4TR4A 2C4JA 1QGVA 4ECIA 4CDOA 3GN3A 4DSSB 2O89A 2GQKA 4TN8A 2ALBA 2FWFA 1GSEA 1TK5B 2KLXA 1E6BA 1ERUA 4EF0A 2XPDA 3L4NA 1GNEA 1GSFA 1OE7A 1ZYEA 5EVOA 4MJEA 5DAKA 4RI6A 5CO3A 1SJZA 3O3TA 4IQ1A 2HZFA 2L57A 4J57E 2LEGA 3HD5A 4XRAA 2HE3A 5ECKB 4K7IA 2NBSA 4P3YB 3W8JA 2G0FA 3KIJA 3MSZA 5AIVA 4KCAA 3GYKA 2P5QA 4KSMA 6GSWA 1H4OA 2CZ2A 2WRTA 4EVMA 9GSSA 1A24A 3LG6A 4BL7A 5F05A 1GTBA 2QC7A 1GSDA 3DXBA 5ID2A 2YN1A 1TDIA 3KMOA 5DQSA 4IVFA 4IKHA 3L9SA 3FEUA 3IOSA 1SK0A 2I9HA 3RAZA 1M0UA 2H6XA 3UEMA 3IK7A 3QMXA 4JBBA 4KUNA 3TJKA 3S9FA 1K3LA 4TR1A 3D21A 1JLVA 1GSUA 5JWOB 5DALB 2TIRA 5DQYA 3C1SA 5IO0A 1Q4JA 2GDRA 1F37A 5CYYA 3R2QA 2H8LA 4PXOA 3GSSA 4YH2A 4IHUA 2MBSA 2PVOC 1XWKA 1USBA 6GSXA 1ML6A 1GLPA 3GV1A 3WGDA 2WGRA 2CV4A 3FR3A 1ZZYA 5A4UA 16GSA 3C7MA 5IMDA 2E7PA 1FW1A 4MZCA 2H75A 3KZQA 3QD9A 4GQCA 1T1VA 4TR1B 3M0FA 3BD2A 2CAIA 4N0VA 2B6MA 4OMVA 1OAZA 4IELA 3F6DA 3KH7A 4GSNA 2GS3A 5F06A 1M99A 1V2AA 4HJMA 3DGQA 2P31A 5LD0A 2YOIA 5E4WA 1ERVA 1TRVA 3DRNA 3EMPA 3Q19A 3PGTA 4AGSA 1FVJA 3ZFBA 2YWOA 3O76A 4RQXA 4OCFA 4QL7A 5GSTA 2NTOA 5GSSA 1FG4A 3GKKA 3ME7A 5CNWA 13GSA 4RI7A 5B6MA 2RUEA 1PL1A 4KGIA 1TOFA 1G0TA 3GNJA 2YV7A 1FAAA 5C04A 2WS2A 2C3NA 2KP1A 3RPPA 5D9WA 2H30A 1YF1A 3DWVA 3ERGA 5ECMB 1U88A 1B9XC 5G31A 2V6KA 2HFDA 4WR5A 5A4WA 4PQHA 3M3MA 2XHFA 1F2EA 3L9UA 2FNOA 3ZZXA 4YAPA 1WIKA 2AB6A 1EEJA 1YQ1A 3TRQA 3EVIA 3RDWA 3KTBA 1H75A 4EKZA 1QQ2A 1OC8A 1ERTA 4GCIA 1V58A 3IE3A 3W8SA 1XWGA 3FZ4A 2VLVA 1G6WA 2L4CA 2LJRA 3KH9A 1XW6A 5H5RA 2IIYA 3F9UA 3VWXA 2H70A 2MYGA 3UMAA 3M1GA 3QAWA 3VPQA 3CMIA 3TOTA 1EZKA 6GSTA 4IP1A 1QFNA 5FHIA 3EURA 1GTUA 2LNSA 2B1LA 3NOFA 4IBPA 2DC5A 2WDUA 2CQ9A 4K0NA 1K0AA 4KAEA 4O5RA 3GL5A 2G2QA 2HZEA 2ZCTA 1M2AA 3HJOA 4HZ2A 4FIWA 2OBIA 3KM6A 2TRXA 1HNBA 1T7PB 5IM9A 5JWRB 1TRWA 1XZOA 1SD9A 1GP1A 2B7JA 5JCGA 5EPFA 3CBUA 4XIHA 3C1RA 4MP4A 4XCSA 4IQAA 2GSSA 2KHPA 4L0WA 3PINA 3DIEA 1JZRA 3KCMA 1MDJA 3HJPA 4WBRD 2HT9A 1ZMAA 2M80A 2MMZA 1OC3A 2BJXA 4JR4A 3J7Yk 1WOUA 3L9VA 3EU3A 2IL3A 3ZFLA 3U5RE 4MMMA 4OFNA 4TRXA 4WR4A 1NHYA 3CSHA 2R4VA 4FYUA 2VCXA 3LFLA 2REMA 2OE1A 6GSSA 3HXSA 1SYRA 4ZBDA 3TCOA 4NHZA 1IYIA 2PPTA 5ECLB 2MMNA 5DJMA 4NHWA 12GSA 1PSQA 2JADA 3F4SA 4KDXA 1VGLA 4F9ZA 6GSVA 5G30A 1PMTA 3D4TA 2V1MA 3EWLA 1GWCA 1GLQA 4Q5RA 3TJGA 1V9WA 5CREA 2P5RA 2H72A 2BTOT 3LYKA 4V2LA 2WFCA 4PQIA 3D4MA 1GUHA 3FKFA 1TW9A 1JFUA 1TXXA 2DJ1A 6GSYA 1AQVA 2HRNA 2YWNA 1XW5A 4Q5FA 4I2TA 5ECSA 4F2IA 1TU7A 3E9JB 3ED3A 5IOWA 4N30A 4PGTA 1BYEA 3IAS2 1X9WB 3CXGA 3HY2A 2DJ3A 5ECQB 4BWSA 3APSA 2K18A 5G5FA 5C00A 1GULA 3AY8A 1GRXA 3CTGA 3GUSA 2AAWA 2HYXA 1XW9A 3RBTA 4D73B 1A2JA 2B5XA 2H1GA 2VO4A 1PD21 5IMZA 4GF0A 1Z7RA 4F0BA 3MDKA 3KEBA 4KE3A 4F0CA 3P8WA 2VCVA 4L5OA 3KXOA 3HA9A 5ABRA 3F63A 2ON5A 1GTAA 3ZVJA 1DE1A 2R5GA 4JU5A 1JZDA 4ID0A 2LRNA 2E2GA 4K9ZA 3IK9A 2FA4A 4X1UA 3RHBA 4ECJA 2VD1A 3ISOA 2GSTA 1OKTA 5J41A 2H71A 1I9DA 3QCPA 4DSSA 2F3MA 2Z9SA 4DSQA 2B5YA 5ELGA 2C8UA 3HJMA 2HSHA 1U87A 2CVDA 3UAPA 4GWRA 3HCZA 2JSZA 2CZ3A 1WJKA 5A4VA 4LA1A 3DMLA 4JRRA 1BAYA 4K0GA 4ZL9A 1BG5A 2HNLA 1YKCA 5AIXA 3GKMA 4LMWA 5DCHA 2M46A 1NSWA 3GL3A 1DE2A 3DVXA 2JL4A 4EXJA 2M72A 2OE3A 4BWQA 1AAZA 3K8NA 5KN3A 3PH9A 4I97A 4ACSA 5ECIB 2YWIA 3GX8A 1GL8A 3EINA 4AJ6A 2GSRA 1EOHA 3UARA 1GSYA 4ULXA 2QKEA 3VURA 5GAPD 1SKWB 1V57A 3D5JA 18GSA 2MZCA 1R4WA 1R5AA 4WXTA 3LXTA 1OYJA 2H0IA 4LL1B 1B4PA 4ECCA 1WWJA 4KW6A 1XXUA 1XIYA 5B8BA 2OKAA 3LORA 3GTUB 4GSSA 2R6KA 4MPFA 3FYGA 3N5OA 3GIXA 5CP1A 2IMFA 2PU9C 3LJRA 3DD3A 4NPBA 2VL2C 4HU7A 1TI1A 4HU9A 3GRXA 1B8XA 5DALA 3VFIA 1RQMA 5J3RA 3F4RA 2C0EA 4YQVA 5IPGA 2VM2A 4WEYA 4CHSA 4LLRA 5F0GA 3GA4A 2FGXA 3G9BA 4HQZA 3GSTA 5IMCA 3TRXA 3TOUA 5KN0A 2V2GA 3H1NA 1KEBA 3D22A 2WJUA 2DIYA 3C8EA 2K8VA 1K3OA 3GKNA 2H1BA 4F82A 2HSYA 2A4VA 4TXOB 1G7OA 3WT2A 3CSJA 4JR6A 2YWMA 2I4AA 4JE1A 2VCTA 4EDYA 3FW2A 3GH6A 5D73A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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