3O6TA

Mycobacterium tuberculosis thioredoxin c c40s mutant in complex with quinol inhibitor pmx464
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SATIKVTDASFATDVLSSNKPVLVDFWATWCGPSKMVAPVLEEIATERATDLTVAKLDVDTNPETARNFQVVSIPTLILFKDGQPVKRIVGAKGKAALLRELSDVVPN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Electron transport/inhibitor
molecule keywords Thioredoxin
publication title Structure of Mycobacterium tuberculosis thioredoxin in complex with quinol inhibitor PMX464
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 27
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3o6tA00
1LBKA 4LMWA 1YJ6A 4TR1A 2GDRA 2FLSA 5EPFA 5A4UA 2AV4A 4MF6A 4OCEA 2WRTA 2GZPA 3LXZA 5JCUA 4WEYA 4CW9A 3HCZA 4IS0A 2PERA 5HR0A 3FEUA 4K7NA 3HZ4A 4PNGA 3TJKA 3FZ5A 1TKDB 1T1VA 2TRXA 4IHUA 1YF0A 1JFUA 1VF2A 2H1AA 1GSUA 2VCZA 1SK1A 4ECCA 2CZ3A 3F9UA 1A8YA 3TRPA 1SKWB 1K0AA 2GS3A 2OBKA 3U6VA 3EVIA 3IR4A 5J41A 1YEPA 1AAZA 5D9XA 4XRDA 1A24A 4ACSA 3RPPA 3ZFBA 4BWSA 1U87A 4K7OA 4Q5RA 1J9BA 3J7Yk 3GX0A 1QFNA 2PWJA 1M2BA 2WS2A 1EV4A 2LJRA 1J08A 3APOA 1QMVA 3IPZA 4TVEA 2GT6A 4EDZA 3CTFA 1O73A 1THOA 5KN3A 3E0UA 5ECIB 1ZCPA 1FOVA 1ZGNA 4ZB9A 3KTBA 3GA4A 1AUCA 3UBLA 1AQVA 2L5OA 3HVXA 3HJMA 4HJMA 1GNEA 4V1Ag 4G19A 3IK7A 5ECRB 1U3IA 2PN8A 2M46A 4HU9A 3F3QA 1GNWA 2H66A 1I5GA 5B8BA 1QGVA 7GSSA 3OR5A 3KH7A 3RPNA 5A4VA 4KSMA 1ZYQB 13GSA 6GSYA 1WP0A 5GSSA 2OACA 5IMDA 1TRWA 3IRAA 2DJJA 5JWOB 1MTCA 19GSA 1F2EA 2JL4A 3KJYA 1WE0A 2LKUA 2GTUA 4ZBBA 1AXDA 1HNCA 3Q19A 2C4JA 1F6MC 3QAVA 1A0FA 2DJ0A 1DBYA 4FO5A 2H71A 3MWHA 5CYYA 2GQKA 2VL9A 4J2FA 2JZSA 1SJZA 2XHFA 3CRUA 1R26A 4FYCA 4OFMA 1X0RA 3VPTA 1XOAA 1CQHA 3W6GA 1SJIA 1GH2A 4ECBA 2C3QA 2LNSA 4YAVA 1GTUA 3DD3A 4TXOA 4Z7XA 4HUAA 4OCFA 2C0DA 2OE0A 4K6XA 1M7TA 2HSYA 4PUFC 2OE1A 2OKAA 2R37A 4RQRA 2H1BA 5ECHB 1M9BA 4NHZA 5CRWA 1WWJA 1Z6NA 2I1UA 1RK4A 2VL2A 2GSSA 1MEKA 4JZQA 1BQ7A 3APQA 2PVQA 2IWTA 1MDKA 1TI1A 3QFBC 2I3YA 4NV5A 2YV7A 3CSJA 1VGLA 1R4WA 1AC1A 1R5AA 3MNGA 2A2SA 3EMPA 2X8HA 1SD8A 2HLSA 1UVZA 2VO4A 1K3OA 4GSSA 1O8WA 4FIWA 2HSHA 2V6OA 2VCQA 5ECNB 4ID0A 2HI7A 1N2AA 3KP8A 4LA1A 5JWQB 4KCEA 3VI7A 5EY6A 1GSEA 5HQPA 1OC3A 2HZEA 3HJOA 4P3YB 5AIVA 1WIKA 3D4MA 1PQNA 1OC9A 2LRTA 3IK9A 2YANA 1XWCA 3BJ5A 3A5WA 2VCVA 2DJ2A 3PGTA 2CAQA 4MP4A 1N8JA 4NAXA 4XS4A 5F8BA 4F0BA 3DYRA 2RM5A 3UVHA 1XOBA 1KNGA 3DWVA 1X5CA 1K3YA 2LSTA 2HXKA 3L0HA 1ZOFA 5KN1A 1GWCA 5CRGA 3ZITA 3IHQA 1O6JA 4LL1B 3UBKA 3GKMA 3IOSA 3L9SA 4AGSA 4MJCA 4BWQA 1EGOA 5LD0A 1RW1A 4AF2A 3APSA 2EIOA 3D0ZA 3TKQA 3M0FA 3O3TA 4HJ2A 3M3MA 4EVMA 4HI7A 4YQUA 5CNWA 2JSYA 5D73A 1Q4JA 3VWXA 2B7KA 1SJ6A 2I4AA 3QPMA 3IV4A 2C3NA 3TKSA 2H8LA 2I81A 5DVBA 2MBSA 5IM9A 4JR4A 5JWRB 1Q98A 3DVXA 3GX8A 2CX4A 3QR6A 4WR5A 4NPBA 3WT1A 3D6IA 1OAZA 3H8QA 3HD5A 3UAPA 2VD0A 3O76A 1EEMA 2FNOA 6GSXA 1UC7A 5HR1A 5H5RA 3RBTA 4I8BA 2OA7A 4FYBA 1Z7RA 2IN3A 9GSSA 1BEDA 4ZB8A 3GIXA 1RQMA 2DMMA 3QFAC 2KOKA 2GQMA 3M9KA 1XPVA 3FZ4A 3KM6A 4WETA 1X9MB 4TKYA 2IFQA 2R6KA 4NHWA 1PN9A 4HZ4A 3GYKA 3G7IA 4L5OA 2JADA 3C71A 3LYKA 2YCDA 4JE1A 1F9MA 4K7IA 1BYEA 4KDXA 2EIRA 2IL3A 3ZTLA 5DALA 3KXOA 3CMIA 2O85A 2HRFA 3TGZA 3IA1A 5C04A 4MH3A 4TR4A 4GQFA 2YOIA 2XPEA 2LQOA 1XBSA 3F8UA 1ACVA 1XVQA 5IPHA 2L4CA 2REMA 1XXUA 1E2YA 3CSHA 3CXGA 3EU4A 4HS1A 2DC5A 1NM3A 4IJ3A 1T3BA 2MBTA 2H0GA 3W8SA 1TXXA 1NW2A 2IMKA 2BJXA 4ECJA 2N5FA 5G31A 5D9WA 5E59A 4LL4B 4JEDA 2D2ZA 1E6BA 2J23A 2O89A 3D4TA 3EYTA 1R7HA 4ZL8A 3LORA 4N10A 2OADA 5A4WA 4PXOA 5IMCA 1GSYA 3EWLA 2L6DA 1Y25A 1ERUA 2K8VA 1PX7A 2AB6A 4HZ2A 1T4ZA 5D8IA 2O8VB 5ECQB 5ABRA 1XCCA 3FK8A 1ON4A 2WCIA 4RI6A 2AUVA 1FO5A 2PPTA 2NPBA 4ULXA 3GTUA 2FCHA 4WBRD 3DVWA 1JLWA 4ML6A 3ME8A 2C8UA 1XWBA 4OFNA 4CDOA 5F05A 2FHEA 5IMVA 2WGRA 16GSA 4ZIJA 2YJ7A 1MD3A 2VM1A 4YQVA 4J57E 1TW9A 3DMLA 3ZYWA 2DIYA 3KTLA 4TR0A 4IJIA 3HDCA 5G2ZA 3CSIA 1T4YA 4MZWA 2VL2C 1OC8A 3FKFA 5HR2A 2KLXA 2MMOA 1YF1A 4NWYA 1A2LA 2VLVA 3VWVA 3LG6A 5FT3A 3BOAA 3DKSA 2I9HA 2FUG2 1ERVA 3DXBA 4F03A 1SK0A 5DAKA 4KDYA 3M8NA 3Q74A 4O7HA 1TK5B 3R2QA 1H4OA 1U88A 5IIZA 2K9FA 3GUSA 3QD9A 2LUSA 1XW9A 4PUAA 2MYGA 1QK8A 1TP9A 2MMAA 1ZL9A 4MDCA 2FD3A 2RM6A 3UOMA 4K0NA 2GGTA 1T7PB 1YZXA 3WGDA 4X0XA 1BG5A 1MD4A 1M99A 5ECLB 3ZFLA 4DSSA 2GLRA 5FWGA 4QL7A 2DJ3A 5IO2A 1DE2A 4GF0A 3JCML 5DQYA 1AQXA 1QQ2A 2R2JA 1YEXA 2H6XA 1GTIA 2YWOA 2GVPA 1YQ1A 5CRHA 3GKNA 4FYUA 1DSBA 5DDLA 4EC0A 2A2RA 3HZ8A 1G6YA 1FG4A 1TDIA 3LFLA 3WGXA 1FHEA 2ZUPA 5C00A 5AIXA 4LMVA 4XHMA 1PKZA 3ZMLA 14GSA 1XIYA 1VRSD 2LTKA 3MAKA 1TRUA 5CO3A 4ML1A 5ELGA 4EO3A 2R3XA 3TKSC 4BVYA 4IBPA 1A8LA 2OE3A 3HKRA 5G5EA 3EU3A 3UVTA 1JZRA 5HFKA 3FHKA 2RUEA 3F4TA 5D93A 1FVJA 5GAND 5G1KA 2DJ1A 4DSQA 5D96A 3CTGA 4FH8A 4JR6A 2NBSA 3H79A 5CREA 4BVXA 4KX4A 6GSTA 3L78A 1KEBA 4D73A 5ELAA 3CBUA 2L57A 4MJAA 3A2WA 3TJJA 3P8WA 5COHA 8GSSA 1DUGA 2QC7A 3L9UA 3GRXA 2FWEA 3QCPA 4TR1B 1SYRA 4XRAA 1GULA 2H19A 4G10A 2FGXA 2BTOT 2ON7A 5H5SA 1WOUA 3HVSA 3GFKA 2KP1A 1OKTA 3GSSA 3EE2A 4ZILA 4ZL7A 2NVLA 4EL1A 1HYUA 2G2QA 5CP1A 3GURA 1FW1A 5IO0A 3VK9A 3KP9A 4X43A 3IBHA 4BPYA 4CHSA 1B8XA 2M80A 4XS1A 22GSA 2F8FA 2HT9A 4WKWA 4K9ZA 1LJRA 4DVCA 3UL3A 3ZIVA 4K0GA 4N0ZA 3TRXA 4GSNA 2VLTA 1YKCA 1HNBA 2H1GA 5IMZA 1AQWA 4RI7A 1X5EA 4PQ1A 1SL2B 1C72A 4WBJA 1JLVA 5IPGA 3A2XA 1J0FA 3AY8A 3O6TA 5ID2A 2R5GA 2MZCA 2CAIA 2AJQB 2H74A 2WDUA 2E2GA 2QGVA 4MA9A 4RUVA 2B5EA 2WFCA 3F63A 3S9FA 2V6KA 2GT5A 2CV4A 4EKZA 3VI5A 5LCZA 3L4NA 3G9BA 4TW5A 1V2AA 1V9WA 5KN2A 1GUMA 3Q18A 4OWYA 3DEXA 4ZB6A 5ECKB 1V98A 1XW6A 3V1WA 5G5FA 1TTZA 5IQYA 1GSSA 3N5OA 4GSTA 5HR3A 4F82A 3G7JA 4KAEA 3J7Yb 5DCHA 2N5BA 4TXVA 2BMXA 1SU9A 5J9CA 4NMUA 5J4UA 3K8NA 1A0RP 3IE3A 1X9WB 3IAS2 2LJKA 1B9XC 1ZZYA 1GL8A 3ISOA 4HQSA 1O7UA 3GL3A 4TR3A 5JCGA 3E9JB 3QAGA 4QQ7A 1WRYA 3H4KA 2B6MA 3WD6A 1OE7A 3FYGA 2C0FA 3TCOA 1S3CA 2MMNA 4Q5NA 1VF4A 3UJ1A 2VOCA 2P0GA 5KEJA 4EXJA 1O85A 4AJ8A 1OYJA 1R5PA 11GSA 1WPIA 4L0WA 1Z6MA 6GSWA 3I6AA 4JRRA 5F06A 4TXOB 5ECOB 1Z5YE 1GLQA 4J56E 1EP7A 1U6TA 4YAPA 4DEJA 2YWIA 2JACA 5CAXA 2B7JA 1PA3A 2P31A 2GSQA 1TU8A 3GV1A 1USBA 4KNDA 4IN0A 4ZBDA 3A2VA 4HU7A 2L6CA 4KA0A 3PR8A 2F8AA 2C1YA 4I2TA 3US3A 1AW9A 2LJAA 1WMJA 2HE3A 20GSA 3KIJA 6GSSA 3FR9A 3E3EA 2LEGA 1XZOA 2QSIA 2H75A 3TRQA 4EUYA 4V2LA 3RHBA 2PGTA 4K1FA 5G30A 2LRCA 3Q6OA 2VL3A 4ILFA 1K0OA 5J3RA 2A4VA 3QDNA 1GTAA 3ED3A 4MF5A 3C8EA 4XCSA 3KH9A 2KP2A 1H75A 4KGIA 1ERTA 4IVFA 3SWLA 4JBBA 2HZEB 3F6DA 2LV3A 2XBIA 3FZAA 4HQZA 4E8HA 1OC9B 1SK2A 2GQLA 2O87A 3FZ9A 2LS5A 1O8XA 1ZMAA 3M9JA 4DSRA 4XS4B 4OMVA 1EOHA 4HEA2 1TU7A 2IMFA 4PX1A 2P5RA 4I5QA 4EE0A 4JU5A 5B8AA 2XBQA 2JZTA 3G7YA 2EIQA 1JHBA 3DRNA 4O92A 1A2JA 2VD1A 3GN3A 1GTBA 2PUKC 1Y6EA 5J9BA 5D9TA 5DJMA 3ZREA 3IAM2 2R4VA 2C3TA 1TRSA 4F9ZA 3ZL5A 4ZL9A 2DJKA 1K0BA 4ECIA 2YWNA 3PINA 1DE1A 3LQ7A 4OFTA 3C1RA 1B4QA 3LYPA 4KE3A 4TRXA 4POLA 2ALBA 3RAZA 4G9HA 1B9YC 2E0QA 5EL8A 2GSTA 3WGEA 2H6ZA 5ECMB 3QAWA 3WYWA 4L8EA 1SL0B 2X8CA 1V58A 2H30A 2YV9A 1UN2A 3MSZA 3HA9A 2J9HA 4MF7A 3ERWA 1A2MA 3D22A 2VCXA 3PH9A 1GUKA 2WB9A 4MZBA 5INYA 1S3DA 17GSA 1B48A 4GRFA 3MDKA 2X8GA 1HQOA 3F3RA 3KEBA 3UEMA 4AJ6A 2PMTA 3A3TA 4K2DA 2JZRA 2AYTA 2WJUA 2IFQB 2OJLA 1AIUA 3VURA 1W89A 1CQGA 3BBYA 5ECPB 1X5DA 2RIIA 2VLUA 1PD21 1FAAA 1OKDA 3QMXA 3ZMKA 2DBCA 4XIHA 3GHAA 5GSTA 2AHEA 2PVOC 3P90A 4WF4A 2LRNA 4EDYA 1EEJA 5DCGA 1TK8B 5DALB 2E7PA 2IMDA 1WJKA 4N11A 1ILOA 1GRXA 3TDGA 1JZOA 4ZBAA 1K0DA 4V2NA 3TJBA 1UA5A 5H5QA 1FVKA 2VM2A 4PGTA 1K0NA 2MMZA 3QOUA 2V1MA 3TKRA 1Z9HA 1X9SB 3EMXA 2YWMA 3HHVA 5ECSA 2B1LA 5JCWA 4ZXGA 1MDIA 4G2EA 5IOXA 5GAPD 3TB2A 4H86A 2X99A 4E8EA 2YZUA 3HY2A 3DIEA 1K0MA 5HFGA 4PQHA 4POKA 3VLNA 1NHOA 3KCMA 2L59A 2G0FA 3NOFA 1QUWA 4AJ7A 4BL7A 1K3LA 4GLTA 4MZCA 1GLPA 1FB0A 1SL1B 3ZRDA 3EINA 2L4QA 4MPGA 4GWRA 2B5XA 2PBJA 2FY6A 3C73A 4IW9A 5FHIA 1KTEA 2IMIA 1FB6A 4PQIA 2N5AA 3HXSA 4EF0A 1YY7A 1IYIA 2PU9C 2C0GA 2LQQA 3RDWA 4MJBA 1BX9A 4K8MA 2YPMA 3TOTA 6GSUA 4WR4A 4NV2A 1B4PA 3BCKA 4KB3A 2EC4A 4IP1A 1T00A 5A5KA 1ERWA 5AN1A 2FA8A 3GTUB 2VCWA 2VIMA 4IELA 4IQ1A 5IMAA 5AGYA 3CYNA 3HVVA 2CA8A 2QKEA 1YDKA 1XVWA 3C1SA 3I43A 2C0EA 1EOGA 3H1NA 6GSVA 1SD9A 4MH2A 2C80A 1BJXA 4PNFA 3U5RE 1XFLA 1EWXA 2KUCA 1PL1A 5GZZB 4OO5A 2K8SA 2YJHA 2JU5A 5ENUA 2V32A 4TN8A 2HZFA 2IMEA 2F9SA 4O32A 1JZDA 3BCIA 4MCUA 1Z3EA 3LWAA 2YNXA 5DAKB 1LU4A 5J5NA 1HD2A 2LNTA 3KMOA 1PX6A 3GMFA 3ME7A 3DGQA 2CQ9A 3LXTA 2HNLA 3FR6A 4KUNA 3GH6A 2H76A 4IP6A 3HYPA 4OD7A 1PL2A 4F0CA 2H73A 4IQAA 3RHCA 2HFDA 1M0UA 2OBIA 1F3AA 1PSQA 4HOJA 4N0VA 12GSA 3GL5A 3BD2A 4HDEA 1EP8A 4ISDA 4F2IA 3SBCA 4V1Ap 4DSSB 2DLXA 2NDOA 4YH2A 3KMNA 4N30A 1A23A 1K0CA 1O81A 4WF5A 3ERFA 1XW5A 3W8JA 4KW6A 2H01A 2VAFA 2FWHA 2CZ2A 1VF3A 2CX3A 3IC4A 1M2AA 2WULA 4IKHA 2F3MA 2Z9SA 2IIYA 2H0IA 2IJYA 3ZIJA 3D5JA 5DJLA 2RLIA 2TRCP 2V2GA 2XPDA 2GZYA 4BA7A 2FWFA 3P2AA 2YZHA 2F51A 4KH7A 3KZQA 5CRDA 1XWAA 3IXRA 1G7EA 2H72A 4IGJA 1GUHA 5DBQA 3L9VA 4OO4A 4GXZA 1TK0B 5IOWA 3TJGA 3TJFA 1SYXA 3EC3A 3GH9A 4L5LA 3ERGA 3TKPA 5AISA 2M72A 3LJRA 3FRCA 4I6XA 2ON5A 2FWGA 2TIRA 4I97A 3GSTA 1XWKA 1G7OA 1XWGA 2IPAA 4D73B 3C7MA 1G6WA 4POBA 2B5YA 4MABA 4POMA 4TOPA 2CT6A 4Q5FA 1I9DA 2H70A 4WXTA 1GP1A 4PURA 3EURA 2CVKA 1TOFA 2VUPA 1V57A 4KSOA 3TOUA 4LLRA 1MDJA 3D21A 1BAYA 3F6FA 4MMMA 3LGCA 1NSWA 5D9VA 3ZZXA 3GKXA 2L5LA 4X1UA 1M9AA 3F0IA 4KCAA 3LSZA 2V41A 2YP6A 1OE8A 1EZKA 1ZYEA 1SKSB 2DMLA 4L0UA 5HFIA 3LEFA 1U3AA 3VPQA 1THXA 2ES7A 4XS6A 5L71A 18GSA 3F4RA 1GSQA 4O5RA 3VWWA 5B6NA 1HNAA 1G0TA 2ZCTA 3VWUA 3H93A 2FA4A 5B6MA 5F0GA 1SKRB 1EGRA 5DQSA 1PGTA 3FR3A 2ZNMA 2DIZA 1KBNA 3ZVJA 10GSA 2NTOA 4GQCA 1QXHA 5IMFA 3IDVA 2CVBA 1GSDA 3NZNA 3TUEA 2RUFA 3VFIA 4GCIA 5ID2B 3GNJA 1ABAA 3N9JA 1ST9A 1F37A 3P7XA 3I69A 2K18A 1TRVA 3NIVA 4NXIA 1IYHA 2H1DA 2XC2A 1JZWA 4MLYA 1M2DA 4QL9A 3ZLPA 4GTUA 3F4SA 2WZ9A 3KD0A 1TJDA 1VF1A 3FY7A 1S3AA 2YN1A 2K6VA 3FW2A 1PMTA 2JSZA 5F07A 1YKAA 4I2UA 1ML6A 1NHYA 2HRNA 3TKSE 2X64A 3M1GA 1V40A 4MPFA 2P5QA 3I9V2 2AAWA 1Z7PA 2B3SA 1PKWA 2CVDA 1SENA 3UARA 3GKKA 3WT2A 5E4WA 4MK3A 5EVOA 2B1KA 3CRTA 2O7KA 3ZVJD 4V2MA 2KHPA 1TI3A 2GSRA 4YQMA 2GZZA 5LNKe 4XTSA 2E2MA 4KDUA 1URMA 5B7CA 1OVNA 2VCTA 4Q5QA 4RQXA 1T8EB 1EV9A 1F3BA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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