3RHCA

Crystal structure of the holo form of glutaredoxin c5 from arabidopsis thaliana
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
103
structure length
103
Chain Sequence
SFGSRMEESIRKTVTENTVVIYSKTWCSYCTEVKTLFKRLGVQPLVVELDQLGPQGPQLQKVLERLTGQHTVPNVFVCGKHIGGCTDTVKLNRKGDLELMLAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Arabidopsis thaliana
publication title Arabidopsis chloroplastic glutaredoxin c5 as a model to explore molecular determinants for iron-sulfur cluster binding into glutaredoxins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin-C5, chloroplastic
total genus 33
structure length 103
sequence length 103
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3rhcA00
4PUFC 2O7KA 3UJ1A 3N5OA 4I5QA 1T8EB 2QSIA 3GX8A 2PERA 1A8LA 5ECLB 4FH8A 2HYXA 4IP6A 3RPPA 1UVZA 1NM3A 4L0UA 3ZTLA 2R4VA 1SKSB 2E2GA 1K3LA 3CXGA 5D96A 4V1Ag 1SU9A 1A8YA 1PX7A 3MWHA 2L5LA 3D21A 1JHBA 2C3QA 1I5GA 3GYKA 3ZLPA 3L0HA 2P5RA 2G0FA 3TKRA 3C8EA 3N9JA 2JL4A 3M0FA 1JZOA 4N30A 3Q74A 2L57A 2BJXA 5GSTA 4J57E 4WBRD 1ERVA 2H0GA 2NVLA 1UN2A 4EDYA 3LJRA 3LQ7A 4V2MA 4WR5A 2LJKA 1TU8A 5CYYA 4IW9A 4OFTA 1OC9B 4IHUA 4L0WA 3Q6OA 3UVTA 2X8HA 5DJMA 22GSA 4N11A 3G7IA 3GKXA 5IMVA 2WGRA 1WWJA 1F3BA 1O7UA 1QQ2A 3FZAA 3LYPA 4G10A 1MD4A 2VCZA 1URMA 5ECMB 2VL9A 1OKDA 5JCWA 1O8WA 1XWBA 2LS5A 2MBSA 1HNBA 1ERTA 1XPVA 4OO5A 2MMZA 2IFQB 2RUEA 3H4KA 1F6MC 1B4QA 4E8EA 4KH7A 1YKCA 4KAEA 1SD9A 1R4WA 1SYRA 4XRDA 1HNCA 3I9V2 4ULXA 1GSUA 1O6JA 2VCTA 4WF4A 3C73A 3OR5A 5LD0A 3TJBA 2E7PA 5ABRA 4BVYA 1GWCA 5B8AA 5HR3A 2H0HA 4RI7A 5GAPD 2HSHA 3IC4A 4IBPA 5HQPA 3EINA 4MH3A 1XWAA 2XC2A 2E0QA 3LSZA 2FLSA 3TKSC 2VOCA 4ISDA 2NTOA 3ED3A 1WMJA 5JCUA 3HJMA 2H74A 1YF0A 2WZ9A 4GXZA 2F8FA 1KEBA 3GUSA 1SL1B 1AAZA 3P7XA 3UBLA 2CQ9A 1JZRA 2LSTA 2H1DA 2GQKA 2LKUA 5IMCA 1DE1A 1ACVA 3TJKA 4Q5FA 4GCIA 1R7HA 3EMXA 3L78A 2YCDA 2FNOA 3A2XA 2P31A 4HJMA 4LMVA 4I97A 5GAND 3TGZA 3H1NA 2GTUA 2DJKA 3PGTA 1S3DA 1SD8A 4FIWA 1F3AA 3HYPA 4IGJA 1PMTA 1QMVA 2GS3A 6GSWA 5ELAA 2ES7A 1THXA 2IJYA 3A2VA 4YH2A 1MD3A 1RK4A 2YJ7A 3GN3A 4G9HA 4HQSA 4EO3A 3QCPA 2LNSA 1WP0A 5J9CA 4DSSA 5KN2A 1EP8A 3PR8A 3NIVA 4POBA 4OD7A 2H72A 1FOVA 3E0UA 2OE1A 2YWIA 1O8XA 3RHBA 2OE3A 2YP6A 2MMOA 1AC1A 2L4CA 2OBKA 3L9UA 1BQ7A 3KIJA 3UAPA 1AQXA 1PKWA 1XXUA 2GLRA 4ZILA 4N0ZA 1QK8A 3FW2A 1Z6NA 3E3EA 4ECBA 3BBYA 4IVFA 2CZ3A 2JZTA 2ZUPA 4GF0A 2HLSA 3UARA 3TOUA 1YEPA 4QL9A 1XW5A 3GMFA 3FZ9A 19GSA 5A5KA 3SWLA 3TRPA 2H6YA 2HFDA 1Z7RA 1TU7A 3Q19A 2B1KA 4NV5A 1Z5YE 4NWYA 5LNKe 1GTBA 2C0DA 1PD21 2ON5A 2EC4A 1SYXA 1W89A 3TOTA 4KB3A 5ENUA 1EV9A 2C1YA 4IKHA 2NDOA 2CAIA 5DCHA 2ZNMA 3VFIA 2FUG2 1M2AA 2V2GA 1X5DA 3LXZA 3ZVJD 3QFAC 4TXOA 3CSHA 1MDJA 2L59A 3C7MA 3GTUA 4WXTA 2QGVA 3TJGA 4K6XA 4MF6A 1IYHA 4XS6A 5G5EA 1TXXA 4ECJA 2OACA 3ERWA 1HD2A 2FWEA 2H70A 4OFNA 2MZCA 4ECCA 3KM6A 3D0ZA 1AQVA 4POLA 2WFCA 5C00A 1NHYA 1WE0A 16GSA 4LA1A 3KD0A 2CV4A 3WGXA 3DMLA 2H01A 3TKSA 3F9UA 3DVXA 4O92A 5D9WA 6GSUA 2HSYA 3DD3A 3WD6A 11GSA 2X8GA 1A0RP 6GSXA 2OADA 1GSEA 4HJ2A 4JRRA 3GSSA 3QMXA 3HVSA 3GSTA 1EEMA 5J3RA 2N5AA 4EKZA 4ECIA 1GTIA 3DYRA 2CVKA 5GSSA 2H0IA 4L5LA 1XWCA 3APOA 3RBTA 1CQGA 2JZRA 2JACA 1OC3A 2R2JA 1SKRB 2I1UA 3RPNA 4XCSA 1G6WA 2K9FA 1BAYA 3TJFA 2J23A 3RHCA 2IL3A 2DJ3A 5IOXA 1OVNA 3RDWA 4AF2A 3ZIJA 1GL8A 3DIEA 3GKNA 3WT2A 2J9HA 4MJEA 1FVJA 2IIYA 2R3XA 3GA4A 1BYEA 1E6BA 12GSA 5G30A 3GH6A 2WRTA 3DKSA 5DCGA 1YZXA 2L6DA 2C3NA 5B6NA 2XPEA 3F4RA 4WBJA 1KNGA 2GSRA 2YZUA 3TKQA 1ERUA 3M8NA 4KSMA 1OYJA 1F9MA 4NMUA 1EOHA 4Q5NA 2DJ0A 4JZQA 1VF3A 1VF2A 1X5CA 4POKA 1K3OA 5ID2B 2H73A 2VM1A 6GSSA 2FY6A 2VM2A 4TR1A 4ZB8A 4ZXGA 3HCZA 3APQA 3GNJA 3ERGA 5EPFA 2MMNA 1TRWA 2LV3A 4QQ7A 4DSRA 2H6ZA 4LMWA 3VPTA 2D2ZA 3E9JB 1A24A 3FR3A 2HNLA 2ON7A 2C0FA 4GSNA 4EVMA 2LNTA 2IWTA 4HZ2A 5IO0A 5H5QA 1PL1A 5FT3A 4GSTA 10GSA 2VD0A 3TKSE 2RLIA 2PGTA 2PBJA 2O87A 2WCIA 3EU3A 1X9WB 5IM9A 1K3YA 5HFKA 3W8SA 4IQ1A 1WIKA 4XIHA 1ZZYA 3G9BA 3P8WA 1MDIA 1VGLA 3HJPA 3ZMKA 2TRCP 2DJ1A 5KN0A 4OO4A 4XS4B 1R5AA 4PGTA 3D4MA 5DQYA 3HD5A 4XTSA 2B7JA 2P0GA 1KBNA 5ECNB 4ML6A 5AN1A 2H6XA 1SJZA 3CYNA 1F37A 4BVXA 4TW5A 5FHIA 4CW9A 5J4UA 5C04A 4IS0A 1GSYA 3GL5A 1GSDA 3ZFLA 1H4OA 2TIRA 3TUEA 2X64A 4GLTA 4HI7A 2F51A 2OA7A 5D9TA 8GSSA 2R6KA 1U3AA 3CSJA 5AGYA 4AJ8A 4EUYA 5DAKB 1Z3EA 1G6YA 2AHEA 5IMAA 1V9WA 3JCML 4DVCA 1SJIA 2XBQA 2H71A 3L9SA 1K0NA 2O85A 2O89A 5J5NA 5F05A 2I9HA 1ABAA 2CT6A 1PKZA 4EF0A 4CDOA 1U3IA 4KW6A 3SBCA 4N0VA 1B9XC 3QAWA 4D73A 3CSIA 3G7YA 3A3TA 2V6KA 2TRXA 2FHEA 2CX4A 3CRUA 3ERFA 3M9KA 1TDIA 4V2NA 3WGEA 1UA5A 3ZITA 4LL4B 4K7OA 6GSTA 1GP1A 2H1BA 3GHAA 3F6DA 1ZYEA 6GSVA 5ECHB 4ZL7A 4MZCA 5ECOB 5B6MA 3VWXA 4I8BA 3D22A 1EV4A 3IR4A 4V1Ap 1QUWA 1NW2A 2DC5A 3QFBC 2CAQA 2B7KA 4MDCA 1TI1A 4OMVA 3LYKA 2HZEA 1M2BA 4F03A 7GSSA 2FD3A 3CBUA 2DMMA 5AIVA 2I4AA 1HYUA 1U6TA 1GLQA 4BWSA 3HDCA 6GSYA 5D93A 3ZFBA 5INYA 3QAVA 4HZ4A 2C8UA 4ZBDA 3FRCA 1PQNA 5F0GA 1FW1A 1HQOA 3NZNA 3I69A 4MF7A 5G1LA 4K2DA 3FZ5A 3M1GA 3C1SA 1S3CA 4YQVA 1SK0A 4MCUA 1AXDA 1YEXA 1VF1A 4JR6A 3ME7A 3L9VA 4NXIA 3VI5A 2M80A 3HVVA 2C4JA 2M46A 1EZKA 3FK8A 1TI3A 1ERWA 1Z6MA 18GSA 4HOJA 5DALA 5AIXA 2ALBA 2PN8A 2XHFA 1GH2A 1ZL9A 1WRYA 3H93A 3U6VA 3HZ4A 3QPMA 4EL1A 3ZIVA 2C0EA 1K0AA 1V40A 3KP9A 4OCFA 4HQZA 4YQMA 5G5FA 2KLXA 3P90A 5ELGA 2VL3A 3HA9A 3EU4A 4NV2A 4EE0A 5A4WA 1K0DA 1UC7A 3EMPA 1VF4A 3F8UA 1RQMA 3CTFA 4K1FA 2AB6A 2EIRA 2GZPA 5ECPB 3PINA 3QOUA 4EXJA 1GULA 2PU9C 1YKAA 3WGDA 5COHA 5JCGA 2VCXA 1DE2A 2ZCTA 2GQMA 3J7Yb 1K0CA 2GT5A 3M9JA 4ACSA 3A5WA 1EGOA 1JZDA 3KMOA 3FR6A 3KP8A 3HY2A 2KHPA 2C0GA 5DVBA 2OJLA 2I3YA 2H8LA 4MP4A 2CZ2A 2LJAA 1OE7A 1J08A 4E8HA 2DIYA 3CMIA 2PVOC 3G7JA 3C1RA 2DMLA 1GTUA 1LBKA 1BJXA 3O3TA 4HUAA 1R26A 3FKFA 4IELA 2IMKA 4LLRA 2YPMA 5JWRB 2B5EA 4I2UA 4J56E 1FAAA 1A23A 2RUFA 2K18A 4WEYA 2LRNA 14GSA 3ZZXA 1BG5A 2R37A 3KXOA 5F8BA 2WJUA 1LU4A 3LXTA 4X1UA 4KCEA 1T00A 1T3BA 3O76A 2GZYA 2FWFA 1EOGA 5CO3A 3HZ8A 3IK7A 3LEFA 4YQUA 4Z7XA 3U5RE 2OE0A 1GUMA 3ZVJA 2IMFA 2P5QA 3HXSA 2HT9A 2LUSA 5CREA 1GNWA 4PUAA 4WETA 1GTAA 3KJYA 4GQFA 2YZHA 1YDKA 4G2EA 1AW9A 1K0OA 2B5XA 1O81A 4FYBA 3H8QA 3WT1A 1YQ1A 2MBTA 4TOPA 3RAZA 1DBYA 4KE3A 2E2MA 2VUPA 4K8MA 5G2ZA 4ZIJA 3W8JA 1OC9A 4PXOA 1OAZA 4PNGA 1XWKA 2A2RA 9GSSA 3VLNA 1THOA 3F4SA 1XW6A 2VIMA 2HRNA 3IBHA 3QD9A 2DJJA 5IMDA 1X9SB 1T4ZA 1T7PB 1TK8B 2B3SA 5ECRB 1XFLA 3FY7A 5ECQB 3UL3A 2DBCA 5G31A 1RW1A 3R2QA 3CTGA 4TVEA 1SL0B 1PL2A 1FG4A 4DSSB 4K9ZA 1O73A 2HZFA 2IFQA 2HXKA 2YV7A 1TW9A 1GUKA 1X9MB 2BTOT 1FO5A 4TRXA 5JWOB 2YN1A 2F8AA 2EIOA 2N5BA 3FEUA 5H5SA 3LORA 3TRQA 2VCWA 4ID0A 1MTCA 2WB9A 5B7CA 5FWGA 1BX9A 1TOFA 2VAFA 3HVXA 3IA1A 4K7IA 3A2WA 3M3MA 5AISA 1OE8A 2LRTA 2YJHA 4K0NA 3GFKA 1MDKA 4O32A 1EWXA 1ZMAA 1H75A 4P3YB 5GZZB 1JLVA 1PRXA 1GNEA 17GSA 3HHVA 2HE3A 2AV4A 1Z7PA 2JSYA 2OKAA 1V98A 1PA3A 1EGRA 2JADA 3UEMA 1U87A 2DIZA 1GSFA 2H66A 4Q5RA 2I81A 1JZWA 1PSQA 2MMAA 3D6IA 5G1KA 4RQRA 2LQOA 2YWMA 4Q5QA 3WYWA 3GKKA 4GRFA 2X8CA 3S9FA 4NAXA 3ZL5A 2A2SA 5DJLA 5KN1A 4MPGA 3UMAA 5D8IA 1V58A 4KA0A 4LL1B 4F2IA 2REMA 4TR4A 1B8XA 1GSQA 2L6CA 4NHZA 4NPBA 2C80A 4DSQA 4ML1A 1XW9A 4ZBBA 4MA9A 3IAM2 3MSZA 1LJRA 4TXOB 3GTUB 4MJBA 1M9AA 2R5GA 5CNWA 5J9BA 5D73A 3KCMA 5DBQA 1A2MA 3IK9A 4CHSA 4K7NA 3O6TA 2VL2C 2GSSA 5IOWA 1XVQA 3PH9A 3LFLA 1CQHA 1YF1A 4G19A 1ST9A 2L4QA 4MLYA 5IMFA 2F3MA 2QC7A 2GSTA 5B8BA 2VCVA 1ZGNA 1FVKA 3KGKA 4O7HA 4PQHA 3TRXA 1E2YA 5CRHA 1S3AA 2VD1A 3P2AA 5IMZA 3GL3A 1XVWA 3TB2A 2MYGA 3ZYWA 5DDLA 4MK3A 1PN9A 1FHEA 3EURA 1XCCA 1EP7A 1YY7A 3QAGA 3LG6A 2KUCA 4H86A 3GURA 3BCIA 3HKRA 1USBA 3DWVA 3VI7A 2K8SA 5D9XA 3GKMA 2AUVA 4X0XA 5HFIA 2NBSA 1O85A 2EIQA 3F6FA 2RM5A 4XRAA 1ON4A 4BPYA 4IJ3A 4MJAA 2IMEA 2JZSA 3TKPA 3ZMLA 1OKTA 3VWUA 1TRVA 3GRXA 5CP1A 1AUCA 4GTUA 2WDUA 3J7Yk 3VURA 3DEXA 4TR0A 1SK1A 3ZREA 3IV4A 3MDKA 4PURA 3D4TA 1TKDB 1EEJA 4KNDA 1N2AA 1N8JA 4IQAA 4TN8A 3EE2A 2YNXA 2VO4A 4KDYA 4X43A 3FYGA 1GLPA 4QL7A 4WKWA 1M2DA 2FWHA 1M0UA 2FCHA 2M72A 4MPFA 2NPBA 1A0FA 3KH7A 3EVIA 2XBIA 4GWRA 1M9BA 1XIYA 2H19A 4TR1B 1WPIA 1YJ6A 3QDNA 1TRSA 1B48A 3KEBA 4HS1A 4TR3A 1ZOFA 2DSAA 2H30A 5IQYA 2H75A 3KMNA 2YWOA 3EYTA 1SKWB 2DJ2A 1XBSA 3ISOA 1M7TA 1U88A 3GH9A 1OC8A 2YANA 3F0IA 4RI6A 5HR0A 2JSZA 2AAWA 3IPZA 4RQXA 2LEGA 4XS1A 3FR9A 2WULA 4MMMA 4NHWA 2B6MA 4MH2A 5ECSA 3ME8A 4BL7A 3C71A 2DLXA 2VLVA 3EWLA 3V1WA 2FWGA 1SJ6A 3TCOA 1WJKA 4OFMA 4KGIA 5JWQB 2FA4A 3F3QA 4MABA 1X5EA 4ZB9A 5ECKB 2RIIA 4JBBA 5IPHA 2KP1A 2C3TA 2VL2A 4OCEA 1A2LA 2IMDA 4IN0A 2K8VA 2GVPA 1W4VA 4EDZA 2LTKA 1QGVA 4FYCA 4YAPA 1Y25A 1G0TA 4AJ7A 2VLUA 3TDGA 1C72A 1FB6A 4WR4A 2N5FA 3UIWA 4IJIA 3BCKA 4TXVA 4I6XA 4K0GA 2GSQA 5IO2A 2CVBA 1Q4JA 2H1AA 5ID2A 3NOFA 4F9ZA 1V57A 4L5OA 4IP1A 2LJRA 3DRNA 3HJOA 4HEA2 3IRAA 3APSA 4F82A 3MAKA 5CAXA 4V2LA 5IPGA 3F4TA 4D73B 1F2EA 4MZBA 4JE1A 2IN3A 2K6VA 3W6GA 5E59A 3UOMA 3QR6A 1GUHA 1JFUA 3GIXA 1J0FA 1PX6A 3KH9A 2GT6A 5KEJA 4OWYA 1KTEA 2VLTA 1G7OA 2A4VA 4ZL8A 1PGTA 1Y6EA 1SL2B 3AY8A 1NSWA 4O5RA 3VWVA 1GRXA 3EC3A 20GSA 4FYUA 3K8NA 4TKYA 1K0BA 3IHQA 3LGCA 4AJ6A 5HFGA 2V32A 2H1GA 1ILOA 1ML6A 4HDEA 4ILFA 2HZEB 1QFNA 2IPAA 3BD2A 3IOSA 1WOUA 4XHMA 2RM6A 3CRTA 4XS4A 1G7EA 1XZOA 2XPDA 2Z9SA 4PNFA 2VCQA 1TK0B 2V1MA 5CRDA 13GSA 2GDRA 2GZZA 5HR1A 2X99A 5F07A 1XWGA 2PUKC 3VWWA 1R5PA 2PMTA 4KX4A 2AYTA 5CRWA 2IMIA 2B1LA 3Q18A 1XOBA 1FB0A 1B9YC 5ECIB 2WS2A 5CRGA 5EY6A 2V41A 4F0CA 3IAS2 1V2AA 5L71A 4AGSA 3IDVA 1T4YA 5DQSA 3DGQA 1T1VA 4ZB6A 3US3A 5DAKA 1BEDA 2BMXA 4MZWA 1I9DA 5HR2A 3H79A 5IIZA 3UBKA 4KDXA 1MEKA 1DUGA 1X0RA 5EL8A 4BWQA 5F06A 2QKEA 3KZQA 2CA8A 1M99A 4KSOA 4PQIA 4MF5A 1A2JA 4JU5A 3F63A 5DALB 1AQWA 2LRCA 3I6AA 3FZ4A 3ZRDA 1JLWA 1K0MA 1ZYQB 3LWAA 2YOIA 4PQ1A 2HRFA 2F9SA 1GSSA 2YWNA 2G2QA 1B4PA 3GV1A 3D5JA 3F3RA 1Z9HA 2H76A 3IE3A 4PX1A 4GQCA 3L4NA 2KP2A 2GGTA 3FHKA 1HNAA 3GX0A 4JR4A 4KUNA 4DEJA 1TJDA 3TJJA 5J41A 4L8EA 4HU7A 2GQLA 3UVHA 2LQQA 5H5RA 4BA7A 1VRSD 3BOAA 4JEDA 2FA8A 2PWJA 1XOAA 4FO5A 4EC0A 2PVQA 4KDUA 3DXBA 4GSSA 4HU9A 3KTLA 5LCZA 4MJCA 1SK2A 2YV9A 4POMA 2OBIA 1TTZA 4ZBAA 1NHOA 5D9VA 1SENA 2JU5A 1TP9A 2CX3A 3I43A 1Q98A 1AIUA 4WF5A 1J9BA 1TK5B 5A4UA 3DVWA 3IXRA 1TRUA 3MNGA 4I2TA 5KN3A 5EVOA 4J2FA 2V6OA 2L5OA 4ZL9A 2AJQB 2HI7A 2B5YA 4RUVA 1DSBA 4F0BA 2CVDA 1IYIA 5A4VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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