1B9YC

Structural analysis of phosducin and its phosphorylation-regulated interaction with transducin beta-gamma
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
217
structure length
167
Chain Sequence
EGQATHTGPKGVINDWRKFKLESEGCLRKYRRQCMQDMHQKLSFGPRYGFVYELETGEQFLETIEKEQKVTTIVVNIYEDGVRGCDALNSSLECLAAEYPMVKFCKIRASNTGAGDRFSSDVLPTLLVYKGGELISNFISVAEQFAEDFFAADVESFLNEYGLLPER
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
source organism Rattus norvegicus
publication title A molecular mechanism for the phosphorylation-dependent regulation of heterotrimeric G proteins by phosducin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (TRANSDUCIN)
total genus 46
structure length 167
sequence length 217
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF02114 Phosducin Phosducin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.168.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Phosducin; domain 2 Phosducin, domain 2 1b9yC02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1b9yC01
5IMFA 1EP8A 5COHA 4PNGA 2RIIA 3APQA 4F82A 4O92A 3QCPA 4FH8A 5ECNB 2YJ7A 3LJRA 4KDYA 13GSA 2LNSA 2YNXA 2XPEA 5C00A 4KB3A 1V40A 5DBQA 3TGZA 4YQVA 4HZ4A 5J9CA 3TKSC 1PX6A 1AQVA 6GSVA 3D0ZA 2PN8A 2XBQA 2OADA 1ZL9A 1R5PA 2P5RA 3P2AA 1TU7A 2DBCA 2H30A 1Z6NA 4N0VA 3ZTLA 3VI7A 3TOTA 3CMIA 2F8FA 1VRSD 3UARA 3Q74A 5D8IA 5D96A 3BCKA 1S3AA 3GA4A 2GSQA 2RM6A 5CAXA 2J9HA 2GT5A 1B8XA 2JL4A 1Z7RA 2H6XA 4HUAA 2YN1A 2C80A 3F8UA 2FWFA 1K0BA 4EKZA 3UIWA 2E7PA 2C4JA 2HRNA 2WJUA 1MDIA 3KXOA 4G19A 3HJMA 5DALA 3WGEA 1PMTA 3F4RA 4IJ3A 1GNWA 4MZBA 1V2AA 4LL4B 2NDOA 14GSA 3W6GA 2OE0A 1W89A 2AV4A 1MD4A 2PGTA 4WETA 3TOUA 3QR6A 5B8BA 3GHAA 4DSRA 1M7TA 3VURA 1TK5B 5DJLA 3GV1A 4RQXA 5DQYA 2EIQA 3HZ8A 1J08A 1WP0A 4GQCA 4Q5FA 5J5NA 1ZYQB 1XWGA 4PQ1A 1WOUA 4JR6A 3GYKA 2N5FA 3DWVA 3GRXA 1GTIA 3GTUB 5G5EA 5JCWA 1V58A 4OWYA 2H8LA 2BTOT 2TRCP 1LJRA 3RDWA 2MYGA 1QUWA 4HJMA 4XS4B 5AN1A 4MJEA 4EO3A 2BMXA 1VF2A 1PKWA 2CVBA 2FA4A 3BJ5A 3US3A 3VFIA 2HFDA 5IOXA 3FZ4A 2DIYA 3GFKA 3VLNA 3GN3A 5KN1A 3GX8A 1EP7A 2IMKA 1N8JA 3M1GA 4PQIA 3MDKA 4LMVA 5ECLB 1F9MA 1GP1A 1GWCA 2JSZA 2LV3A 4BWQA 2WCIA 2HSHA 2LTKA 12GSA 4IW9A 1ZGNA 4BA7A 3CXGA 3E3EA 2PU9C 4MZWA 2H73A 2LQOA 2O8VB 4IBPA 4MK3A 3UMAA 1J0FA 2FNOA 3O76A 1YEXA 1X0RA 1EV9A 3QAWA 1THXA 1TRSA 2VCWA 1TK0B 2IL3A 5ECHB 4LMWA 1AQWA 3DKSA 1O6JA 3UVHA 3F6FA 3L78A 5DQSA 1OC3A 3ME7A 2QGVA 2R5GA 2MBTA 3GSTA 5FWGA 1TTZA 4O5RA 5DVBA 3UAPA 2FLSA 5IMVA 3GMFA 2RM5A 3C8EA 4WBJA 1Y6EA 3E9JB 1TU8A 2GVPA 3DIEA 3BOAA 5HR1A 1AW9A 4NV2A 3APOA 1C72A 2VCTA 1K3LA 1LU4A 4ECIA 3VWVA 2C0GA 1NW2A 3F4TA 3GTUA 2RUFA 2EC4A 2VIMA 5GZZB 3GKMA 2QSIA 1OVNA 5CRHA 1WMJA 3S9FA 2YOIA 3O3TA 4IVFA 4XS4A 4TR1B 2K6VA 2FHEA 4HS1A 2GGTA 3ERFA 3KD0A 5F07A 2KUCA 4GSSA 2WZ9A 3KMNA 1K3YA 3FYGA 4OD7A 1GUHA 4WBRD 1ILOA 3GX0A 3HYPA 2H1DA 3DRNA 2VCXA 5J41A 2WGRA 1K0CA 2HSYA 2EIOA 5D9XA 5EPFA 5JWRB 2NBSA 4MJAA 5CRWA 3FKFA 3QMXA 2DMMA 4EXJA 2L5LA 5EY6A 4KH7A 4DSSB 2ZUPA 1OE8A 4X0XA 1FOVA 4YAPA 5H5QA 2H71A 1SKSB 1EGRA 4RUVA 5KEJA 7GSSA 4EDZA 3FZAA 3ZITA 3ZFLA 4KW6A 2H66A 3C73A 2B7JA 1A2JA 2C0FA 4WEYA 3HJOA 1AXDA 2K8VA 2R6KA 3L9SA 5CNWA 2VL9A 2OJLA 2FY6A 3ZVJD 3ZMLA 4I97A 2X64A 1H4OA 2VLVA 3IAM2 3DEXA 2C0EA 4Q5QA 2XPDA 1USBA 4JR4A 1VF3A 4PUFC 5DCHA 18GSA 2YWMA 3J7Yb 2DIZA 4L5LA 1PN9A 4NV5A 3IHQA 4V1Ap 3HHVA 1BAYA 2IPAA 5IMAA 2HNLA 1QXHA 3VWXA 1TOFA 3FRCA 3BCIA 2IMDA 4O7HA 4BVXA 3UEMA 4LLRA 4MH2A 1ERWA 1R26A 3QAGA 5FT3A 1JZRA 3TJFA 1PRXA 1SYRA 3V1WA 2VUPA 2R2JA 4NHWA 2H19A 2DMLA 2VLUA 2OBIA 2YWIA 1ML6A 4KCEA 2V6KA 4MJCA 5KN3A 3P90A 5HFGA 3PGTA 3EVIA 4IS0A 4DVCA 4OCEA 2X8HA 5D93A 4TR1A 1UVZA 4GCIA 3WT1A 5GSSA 3EMPA 1OAZA 4FYCA 1MD3A 2YZHA 4FYBA 5ID2A 2JZRA 5IPHA 3MWHA 1TI1A 5A4UA 3TRXA 3IK7A 3W8JA 2PPTA 1YZXA 2V32A 1A0FA 1DE1A 2P5QA 4WF5A 1FW1A 1K0DA 2YCDA 2G0FA 2K8SA 5CREA 1X5EA 2MZCA 1O8XA 4JBBA 5G5FA 1M2BA 3K8NA 1X5DA 2FD3A 3A2VA 3HA9A 1YKCA 5G30A 3KJYA 3ZFBA 5LNKe 1OKTA 4DSSA 2AHEA 4ZB9A 2LSTA 1BJXA 1M2DA 1AUCA 4GQFA 4OFMA 5DDLA 2V1MA 3L4NA 3D4TA 1B48A 3UJ1A 2WB9A 2I9HA 1FB0A 5B6NA 1E6BA 2H74A 4GLTA 2B3SA 4MH3A 22GSA 2OKAA 1U3AA 2R3XA 2NVLA 4LA1A 3FHKA 1QFNA 4NPBA 2WS2A 5F0GA 4KX4A 1T7PB 2KHPA 5EVOA 9GSSA 2GT6A 4ECJA 4ULXA 1I5GA 2H01A 3DVXA 1IYHA 5HFKA 1BQ7A 1S3DA 3LYPA 4POBA 3TB2A 5H5SA 2M46A 2OBKA 3U6VA 3FW2A 2DJ0A 2DSAA 2PERA 1XFLA 1B9XC 1U3IA 2AAWA 2WFCA 3KCMA 4CW9A 2VCZA 3FY7A 5F8BA 5GAND 1T4YA 3VI5A 2JADA 4ZB6A 2FCHA 2V2GA 4WKWA 5D9VA 4KDXA 1GTBA 2JZTA 1XWCA 4CHSA 4AF2A 5CO3A 4DEJA 3WYWA 3LXTA 3VPQA 1ON4A 1CQGA 4BL7A 1SD8A 4ECCA 4KA0A 8GSSA 3DYRA 5INYA 3I9V2 1AC1A 2XHFA 2CVDA 3RPPA 1SD9A 4HDEA 3J7Yk 1JZOA 2IIYA 3QPMA 1G6WA 2VD0A 1I9DA 1T1VA 2YP6A 3PINA 2A2RA 4IN0A 4H86A 3IR4A 4HOJA 4ZB8A 4TXOB 6GSSA 2IMFA 4L8EA 4ID0A 1GSFA 3IE3A 3SBCA 4IP6A 3H4KA 1TRWA 1A0RP 5E4WA 2FA8A 3LFLA 1TK8B 1UC7A 2C0DA 1JLVA 2GQMA 1HD2A 3KH9A 2G2QA 1TI3A 3TKPA 3I43A 3NOFA 2E2GA 4POMA 4ECBA 5IQYA 1F37A 1FVJA 2WULA 3CSJA 5D73A 4EC0A 2ON5A 3RPNA 3FZ5A 1K3OA 1WWJA 4G2EA 2X8CA 1A23A 1F3AA 4EL1A 4KUNA 1IYIA 3R2QA 3W8SA 3KH7A 3C1SA 5D9TA 1XVWA 2ZNMA 4V2NA 3IRAA 5HQPA 1K0AA 2N5AA 2XC2A 4X1UA 2X99A 1PA3A 2PWJA 3C71A 3IV4A 5IO0A 4GRFA 2J23A 1NHYA 3CSIA 5ENUA 1NM3A 2QKEA 1EWXA 1N2AA 3FR9A 3U5RE 4KDUA 5IMCA 1YDKA 2LJRA 1RQMA 1GUMA 3LSZA 4HQZA 1XW9A 3GSSA 2ALBA 4G10A 5AIVA 4HU7A 1OE7A 2I81A 2AUVA 1FG4A 3VPTA 3EMXA 2M72A 3HZ4A 4TR4A 2QC7A 2GQLA 1XWKA 3Q19A 4ZBAA 5A5KA 2VCVA 4TR0A 2O85A 1YY7A 2LRCA 2PVOC 4ISDA 3M8NA 2CV4A 2MMAA 5H5RA 3GURA 2R37A 2X8GA 3NZNA 1YF0A 5LD0A 3ZYWA 5HFIA 4PXOA 2MMZA 3G9BA 4ACSA 5IM9A 1SK1A 1A24A 1K0NA 4I6XA 1Z7PA 3KM6A 3GKKA 1EGOA 4DSQA 5F06A 2CAQA 5EL8A 3CTGA 4L0UA 4ZXGA 3H93A 3H8QA 1ABAA 1Q4JA 5ECOB 3M0FA 1Q98A 2OA7A 3CTFA 1M2AA 4TXOA 19GSA 4NWYA 4JEDA 2LNTA 1R5AA 2LJKA 4I2TA 2DC5A 1GRXA 1ST9A 3Q6OA 2NTOA 2L5OA 3I6AA 3D4MA 1G0TA 1XWBA 5DJMA 1DE2A 4MF6A 2YANA 3LYKA 1QQ2A 4RI7A 3GL5A 1ZZYA 4PX1A 1BEDA 1URMA 1JFUA 5ID2B 2AYTA 1K0OA 1MTCA 4JRRA 4AJ8A 5F05A 3KMOA 2GDRA 3E0UA 4KNDA 1PQNA 3CRTA 5JCUA 3KTBA 3A2WA 2M80A 4MDCA 2H1GA 1GSYA 4MCUA 4WR4A 2HZFA 2PUKC 3HKRA 3ERGA 4IGJA 4PUAA 1AQXA 2VO4A 3L9UA 3H1NA 1PKZA 4WR5A 3LXZA 4V2LA 3OR5A 1PL2A 2B7KA 3TJJA 1YKAA 3QDNA 1JHBA 4TKYA 2KOKA 2MMNA 2L59A 4ZL8A 3CBUA 1SJZA 3FR6A 5GAPD 4K7OA 2VL2C 4ML6A 2I3YA 4OCFA 4EF0A 1WJKA 2GSSA 1XCCA 3KTLA 2ON7A 1JZWA 2H76A 1MEKA 6GSTA 3MNGA 3UOMA 1CQHA 1SU9A 3C7MA 3HVVA 4PURA 3APSA 3LEFA 5J3RA 1X9WB 1DSBA 5IMDA 3ZRDA 2TRXA 2H0GA 1EOHA 1F3BA 2JZSA 4F9ZA 3G7JA 3GL3A 4HQSA 4GSTA 3TKSE 4QQ7A 2GZPA 1K0MA 2FWGA 6GSUA 2L4CA 3KZQA 4RQRA 1ZCPA 3I69A 2YJHA 1M0UA 2CAIA 4TRXA 2LQQA 1A8LA 1R7HA 5ECMB 10GSA 4I2UA 3D5JA 5B6MA 4F2IA 3GUSA 1EV4A 3GIXA 3KIJA 3QD9A 2YPMA 2LRNA 3ZVJA 2NPBA 2CZ3A 1YJ6A 1PGTA 1XBSA 4IHUA 4JZQA 1GULA 3EWLA 4XS1A 3FEUA 3TKSA 4J57E 4N11A 2B5EA 1TRUA 3M9JA 2K9FA 4PGTA 2IMEA 3TCOA 3TDGA 3TJKA 4L5OA 3QAVA 2OE1A 2C3TA 3MSZA 2B6MA 1GSQA 3ZREA 4MJBA 4PNFA 1U88A 2H70A 4NXIA 3TKQA 4K9ZA 1Z3EA 1THOA 2DJ1A 3M3MA 1NHOA 1ZOFA 2IFQB 1PSQA 4ILFA 4J2FA 1F6MC 4ML1A 3LGCA 3FK8A 1G6YA 3P7XA 1XW5A 4TR3A 4ZBDA 2HZEB 4EUYA 4ZL9A 4KSMA 3NIVA 3WT2A 1T8EB 1B4QA 1ERUA 2F51A 4K2DA 3HCZA 4KGIA 2I1UA 4ZBBA 3UL3A 1XW6A 4POLA 1NSWA 1AAZA 1AIUA 1WIKA 5ECRB 3RHBA 1GNEA 4ZL7A 5JWQB 1GLQA 4YQUA 1XZOA 3CSHA 5G1LA 4BVYA 4JE1A 2C3QA 1TJDA 1HYUA 1OYJA 2VM2A 4YAVA 4TXVA 4XCSA 3SWLA 1DUGA 4O32A 4IP1A 1KNGA 1U87A 2XBIA 4MZCA 2K18A 4NHZA 2H72A 5KN2A 3IA1A 3GKXA 2B1LA 3IBHA 2GLRA 5DCGA 1G7EA 4EVMA 1A2MA 4HI7A 1V57A 2MMOA 1V98A 4F0BA 3EC3A 6GSYA 5JWOB 2DJ2A 1T3BA 4QL9A 1SL1B 5CP1A 4XRAA 2A4VA 1GSEA 1XOBA 3KGKA 1GSDA 3LORA 3TKRA 3L0HA 3LG6A 3ZZXA 4OMVA 2VM1A 5G1KA 2JACA 4TW5A 3ERWA 4JU5A 1OC9B 2B1KA 1A2LA 3IK9A 2PMTA 4MF7A 3MAKA 4K1FA 4P3YB 2YV7A 2L57A 1FVKA 2YWNA 1ERVA 5B7CA 3KP8A 2RUEA 2WRTA 3WD6A 4GXZA 3GH6A 2WDUA 3F63A 3DD3A 3TUEA 3GH9A 4KAEA 5AISA 1SKRB 1U6TA 1ZYEA 3ZIVA 2FGXA 4K8MA 1O7UA 4AGSA 4YH2A 4V1Ag 3PH9A 1KTEA 5ELGA 1T00A 4NMUA 3TRPA 1WE0A 4G9HA 2H1BA 5A4VA 2DJKA 2IFQA 3H79A 2IMIA 6GSXA 3A3TA 2H0IA 5DAKA 3UBLA 3IAS2 3M9KA 5G2ZA 4POKA 2HZEA 2CX4A 2F9SA 2IWTA 4MABA 5IOWA 3RHCA 3EURA 4WF4A 2FWHA 3KEBA 3DVWA 3QOUA 4K0NA 2C1YA 1GSSA 11GSA 1SL2B 3IC4A 2FWEA 5D9WA 4WXTA 1VGLA 3F9UA 1GTUA 4D73B 1HNCA 1JZDA 1UN2A 3WGXA 4TN8A 2Z9SA 3G7IA 2AB6A 3RBTA 1XPVA 4K7NA 1TKDB 2F3MA 3TRQA 3ISOA 5ECKB 2HRFA 1TXXA 1E2YA 2JSYA 4K7IA 1YQ1A 4RI6A 4HZ2A 3UVTA 3GKNA 2VAFA 4FO5A 4L0WA 1SJIA 4OFNA 4EDYA 1GUKA 1TDIA 2O89A 4HEA2 3EINA 5ECQB 3CRUA 1GL8A 2HLSA 1SJ6A 4K6XA 2O87A 2I4AA 3RAZA 5GSTA 4KE3A 1FAAA 2TIRA 4MP4A 1QK8A 5IPGA 3DGQA 1X9SB 4HJ2A 4V2MA 3HXSA 4MF5A 5L71A 1EEMA 1OC9A 1XXUA 1SL0B 4FYUA 3C1RA 1ZMAA 3IOSA 1A8YA 4MA9A 2V41A 1X9MB 2GTUA 1KBNA 4N10A 1QGVA 4XTSA 2O7KA 5CYYA 4CDOA 3N9JA 1OKDA 3EE2A 4OO5A 1B4PA 4GTUA 3L9VA 4XIHA 1GH2A 2E0QA 2VD1A 1MDKA 1HQOA 4OO4A 3IPZA 2VLTA 2V6OA 5IMZA 1VF4A 2VL2A 1GTAA 3DMLA 3BBYA 1XWAA 3F3RA 2FUG2 2C8UA 4XS6A 4GF0A 4N0ZA 2VOCA 3ZLPA 3UBKA 2CZ2A 3A5WA 4Q5NA 3N5OA 2HE3A 5ECSA 1R4WA 1VF1A 3CYNA 4Q5RA 2YWOA 2KLXA 4F0CA 1PD21 3EU3A 2P31A 4F03A 3ZIJA 2LRTA 1BG5A 3WGDA 1SYXA 1DBYA 4TOPA 3TJBA 1PX7A 3FR3A 2GS3A 3DXBA 1B9YC 2P0GA 3FZ9A 5J4UA 2H6ZA 3JCML 1G7OA 4D73A 1TW9A 1XOAA 4AJ7A 1MDJA 2OE3A 2LS5A 2JU5A 5LCZA 1BYEA 1M9AA 2YV9A 4HU9A 4MMMA 3G7YA 4NAXA 4EE0A 5G31A 2E2MA 4IJIA 4Z7XA 2LKUA 2MBSA 1X5CA 4K0GA 4PQHA 1JLWA 1HNBA 3F4SA 3HJPA 5JCGA 4AJ6A 2CVKA 1GLPA 2DJ3A 1W4VA 3IDVA 3D22A 20GSA 3HVSA 2ES7A 3KP9A 2HXKA 1RW1A 1ACVA 1SK2A 1Z5YE 1J9BA 1O81A 3ZMKA 4J56E 2H0HA 3VWWA 1Y25A 2R4VA 3ZL5A 1EOGA 1H75A 3QFBC 1YF1A 1M9BA 3VWUA 5CRDA 1O73A 5A4WA 1T4ZA 2B5XA 4BPYA 4E8EA 3PR8A 2CT6A 3EYTA 1HNAA 5ABRA 2F8AA 2B5YA 1YEPA 2GZYA 1F2EA 4IELA 3QFAC 1FHEA 2CX3A 4XRDA 2L6CA 1O85A 4LL1B 2DJJA 3O6TA 1SK0A 4GSNA 5HR3A 3F0IA 4TVEA 4IKHA 2YZUA 1XIYA 1M99A 2PVQA 1O8WA 5E59A 1FO5A 4IQAA 1Z9HA 2VCQA 4I5QA 2REMA 5ECIB 1BX9A 4KCAA 1ERTA 2VL3A 4I8BA 1EZKA 2OACA 4MPFA 1Z6MA 2AJQB 1OC8A 4FIWA 2CQ9A 17GSA 3VK9A 2HT9A 2A2SA 3BD2A 3F6DA 4OFTA 1V9WA 3HDCA 2RLIA 2HI7A 3F3QA 2H1AA 3P8WA 2HYXA 5HR0A 2LEGA 2GQKA 4KSOA 4MPGA 6GSWA 4N30A 1SKWB 4ZILA 3A2XA 3EU4A 5CRGA 2GSTA 2KP1A 2KP2A 2LUSA 2IN3A 1QMVA 2BJXA 2L6DA 2N5BA 4GWRA 1UA5A 5DALB 1TP9A 1EEJA 3ED3A 1RK4A 5DAKB 4QL7A 1PL1A 2DLXA 2H75A 3D6IA 5IO2A 1KEBA 4MLYA 5AIXA 2PBJA 3ME8A 5IIZA 4BWSA 5HR2A 3TJGA 2ZCTA 2CA8A 1WRYA 3IXRA 4E8HA 1TRVA 2LJAA 2C3NA 5AGYA 2L4QA 5B8AA 16GSA 3AY8A 4YQMA 3LWAA 2D2ZA 5J9BA 1SENA 3HVXA 5ECPB 1FB6A 2EIRA 3Q18A 2IJYA 3HY2A 2GZZA 4XHMA 3D21A 2GSRA 5KN0A 4ZIJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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