1W4VA

Structure of the oxidised form of human thioredoxin 2
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
HGSTTFNIQDGPDFQDRVVNSETPVVVDFHAQWCGPCKILGPRLEKMVAKQHGKVVMAKVDIDDHTDLAIEYEVSAVPTVLAMKNGDVVDKFVGIKDEDQLEAFLKKLIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords THIOREDOXIN, MITOCHONDRIAL
publication title Crystal Structures of Oxidized and Reduced Forms of Human Mitochondrial Thioredoxin 2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Oxidoreductase
total genus 34
structure length 110
sequence length 110
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1w4vA00
3U5RE 2YWNA 2DJ2A 3CMIA 1M9AA 4CW9A 1K3OA 4F0BA 1V58A 4OO4A 2KP1A 1A2LA 3D22A 2HI7A 4GQFA 1SK1A 1W89A 1TK5B 2N5AA 2DMMA 1GL8A 1FW1A 3CTGA 1EEMA 3KCMA 4HOJA 1ZZYA 5FWGA 2YZUA 2L4QA 3N5OA 2H76A 2DMLA 4PNGA 3I69A 3GYKA 2OACA 5EL8A 1O81A 1IYIA 1GSSA 3IE3A 2CQ9A 2HLSA 1WRYA 3BCKA 1FVKA 3M8NA 6GSXA 2LV3A 1PX7A 2FWGA 1B9XC 1YQ1A 1PRXA 16GSA 4G9HA 4EL1A 3ZIVA 2HE3A 3IRAA 14GSA 1XOBA 1B48A 3UEMA 2DJKA 3LXTA 2ON5A 1V9WA 2XBIA 1FB0A 3ZVJD 4F03A 3DVWA 4EXJA 1XWGA 3VI5A 3FEUA 3ZVJA 5DVBA 1M2BA 1R4WA 3KEBA 1ILOA 3L0HA 2H0IA 3ZLPA 3A2WA 4OO5A 2TRXA 4ZB8A 2GZPA 5GAND 3TRPA 2VCQA 3VURA 1K0BA 1GTBA 4K0NA 4HU7A 1TRUA 2LSTA 3L9SA 4PXOA 2TRCP 4HQSA 4J57E 5COHA 3MWHA 1VF2A 1MTCA 2BJXA 2C4JA 4N11A 3WGEA 3C1RA 4OD7A 4ACSA 4POLA 2H1BA 3IC4A 2AB6A 3C71A 1V57A 2I4AA 4FYBA 5B8AA 4YQUA 2BMXA 5ECQB 3ZL5A 2VM1A 3TGZA 2DJ3A 6GSTA 1GLPA 1SENA 2OE0A 3LGCA 2HRFA 5ECRB 5C00A 1ERVA 1JLWA 4N0VA 2PVQA 3GKMA 1XWCA 2L59A 4DSRA 3LQ7A 3QFBC 2H75A 2RIIA 1KBNA 2LNSA 4NAXA 1ZGNA 2JSZA 4NXIA 3ZFLA 4EC0A 4AJ8A 4N0ZA 5IMCA 4F2IA 1MDJA 4ZILA 3HJPA 1ZL9A 4TXOB 2MMAA 1ERTA 2RM5A 3TJFA 1PL1A 3H93A 2WCIA 2L57A 5JCWA 3H1NA 2H8LA 1SD9A 1M2DA 2H6ZA 4WKWA 1XZOA 5D9XA 1GP1A 2JSYA 1X9MB 1Z6MA 5CRGA 3TRQA 4WR5A 1ABAA 4MH2A 2GQLA 4JEDA 1QK8A 3VLNA 4RQRA 5IMAA 19GSA 2PMTA 3FR3A 1F3AA 2DJ0A 2FA4A 4XCSA 3KIJA 4ECCA 3C1SA 4TXVA 4TXOA 3TCOA 4QQ7A 1XWKA 2CX4A 2EIRA 3TOUA 3KXOA 3HD5A 4ZB9A 2H30A 2LKUA 1UVZA 2OA7A 2F3MA 1GTIA 4YAVA 4K2DA 3F6DA 1RW1A 1U88A 3BD2A 3APSA 2AUVA 2FLSA 3DWVA 4POBA 2IL3A 5LNKe 4MDCA 1WMJA 1CQHA 5KN2A 1JZRA 2PVOC 1V40A 5D93A 1GTUA 4X1UA 5CRWA 4AJ6A 2K6VA 3BCIA 1QQ2A 2M46A 1LU4A 1AIUA 3EU3A 4HJ2A 2E2GA 4KSMA 4PQHA 5ECSA 3QAWA 3CTFA 2OBIA 3Q74A 3J7Yk 4GSTA 1CQGA 5D9TA 5IO2A 3TDGA 1MD4A 1T4YA 2K8VA 4HEA2 1TRWA 5ID2B 2LJAA 1NW2A 5HR1A 5JCGA 2RLIA 2YV9A 5ELGA 1K0CA 1RK4A 2O7KA 3ZREA 2TIRA 3ED3A 3GHAA 1EOHA 3IBHA 3F6FA 1NSWA 2KOKA 2GLRA 3CYNA 3IAM2 2X8GA 5D8IA 2RUFA 1G6WA 4NMUA 4KDXA 2ZUPA 1T7PB 1UA5A 4HZ2A 1F2EA 2C0EA 3D6IA 4HS1A 5H5RA 2V32A 2KLXA 5J41A 4DSSB 3R2QA 4TOPA 2JL4A 5H5SA 5DJMA 3HJOA 5L71A 4KDUA 2WFCA 2JADA 4F9ZA 1OE8A 1JZDA 3DEXA 4ML1A 3O3TA 4WEYA 4KUNA 2GS3A 1TKDB 3ZITA 4ZBDA 1DBYA 4JR4A 1DE1A 1OKDA 4GQCA 4O92A 2I3YA 5LCZA 5DBQA 1Z6NA 1EEJA 5A4VA 2H72A 1YF1A 5HR0A 1T3BA 2PU9C 5C04A 1GH2A 4PQ1A 3F4TA 3GKKA 4AJ7A 5IM9A 1O8WA 1QMVA 2IFQA 2LTKA 2R2JA 1OE7A 1JLVA 4PNFA 3EWLA 4HJMA 2LRNA 2XPEA 1GSDA 3TRXA 17GSA 4MF7A 3VI7A 3FR6A 1PMTA 2MZCA 4L8EA 1SJZA 2PN8A 3DD3A 5D9WA 3CSHA 1PD21 5ECKB 3GRXA 2HRNA 4MH3A 1BYEA 1PL2A 1GNWA 5HFIA 3DRNA 2ON7A 1FHEA 1FOVA 2OE3A 2H73A 3G9BA 1X5EA 5IMDA 1VF1A 4WETA 3AY8A 1ST9A 3NIVA 2X8HA 3P2AA 1BG5A 4HI7A 2NVLA 2XPDA 1A2JA 1ACVA 4HZ4A 2H0GA 1K0OA 2VD1A 1HD2A 4IW9A 4K0GA 4MJBA 3VK9A 3QFAC 5ECMB 4X43A 5IOXA 3QAGA 4I5QA 5G2ZA 1UN2A 3UBLA 4POKA 3DYRA 3F3RA 2LRCA 4LMWA 5IO0A 4YH2A 2R37A 3BBYA 4GLTA 3N9JA 2F9SA 5D73A 1VF4A 3UOMA 2C0DA 2NPBA 4F0CA 2CV4A 1PKWA 1W4VA 1YDKA 3UVHA 2IMEA 4YQMA 3H4KA 2CX3A 3LEFA 4KH7A 1HNAA 2WB9A 5DCGA 1WIKA 4GTUA 3TKRA 1A8LA 1WWJA 1XW6A 2OBKA 3JCML 2GSRA 2O89A 3C7MA 5AN1A 2H66A 1WPIA 4GXZA 2IWTA 2ZCTA 3A5WA 1FO5A 2I81A 1M9BA 3PR8A 5F06A 5KN3A 1BX9A 4J56E 5HFKA 1AQVA 1I5GA 1MEKA 1THXA 4EDYA 4L5LA 2CZ2A 3APOA 2WULA 5J3RA 3D21A 1EGRA 3RPNA 3I43A 4KCAA 1E6BA 2YANA 4G2EA 4ECIA 2HZFA 5HR3A 1B9YC 4JZQA 2E2MA 1O73A 4O32A 2C80A 3TJGA 1WE0A 2YCDA 1XVQA 1R26A 1SJIA 5D9VA 2L6DA 4ILFA 4OFMA 1NHYA 5CRDA 2MYGA 2J23A 1V98A 10GSA 8GSSA 1Z5YE 2O87A 2C0FA 4QL9A 3IV4A 4ZL7A 4HQZA 1PGTA 2H1AA 1B8XA 3HVXA 3L9UA 2B7KA 2DJ1A 2YV7A 2VUPA 3KJYA 4TKYA 3UIWA 2H1GA 1ZYQB 4GF0A 4IBPA 1SK2A 2K18A 4ZXGA 2C0GA 2EC4A 1G6YA 4OWYA 4MCUA 3PH9A 3FZ9A 1MDKA 1XPVA 5GZZB 3DKSA 1EGOA 1K3YA 1GULA 3EURA 3RHBA 2I1UA 2KP2A 1Q4JA 4NWYA 1TOFA 20GSA 3GSTA 2A2RA 1TI3A 3GNJA 4MF6A 1KNGA 1YF0A 3L9VA 3KH7A 2VL2A 2GDRA 3F4RA 3UMAA 1LBKA 5ENUA 1B4PA 4I2TA 4CDOA 1H4OA 3K8NA 5AIXA 5GSTA 4XS1A 3CBUA 5EY6A 2BTOT 3Q6OA 3I9V2 1BEDA 2AYTA 4V2LA 1VF3A 3L78A 5ECNB 1H75A 3GTUA 5IMZA 4I2UA 4K9ZA 4LL4B 3W8SA 1J0FA 2WS2A 2RUEA 3HDCA 2YWIA 2LQQA 3FZ4A 3RDWA 1ERUA 5DCHA 3WD6A 1HQOA 4IHUA 3VWWA 4HDEA 4XS4A 3D0ZA 3EMPA 4RQXA 3LYPA 1JFUA 2PUKC 2YJHA 2NTOA 2QKEA 4PGTA 4IJ3A 2C3TA 2AV4A 4TR0A 4I97A 4BA7A 6GSSA 1TU8A 2DIZA 3H8QA 3F9UA 1O8XA 2B1LA 1MDIA 5EVOA 3FK8A 2V41A 6GSWA 5GSSA 3A2VA 1V2AA 2K9FA 3IAS2 3J7Yb 4J2FA 3LWAA 1G7OA 1Q98A 4NHWA 2LQOA 3RAZA 2VL3A 2FHEA 2V6OA 1AUCA 3QOUA 4FIWA 1PKZA 4MPFA 3L4NA 2N5BA 3GIXA 11GSA 2EIQA 4EVMA 2FA8A 4HUAA 4XRAA 6GSUA 1F9MA 4WXTA 1TXXA 5H5QA 1PX6A 2XBQA 1GSQA 3GN3A 2NDOA 5J9CA 5E4WA 5LD0A 1ZYEA 4AF2A 2CT6A 2MMOA 1ON4A 1FAAA 4KGIA 1C72A 3QR6A 3DMLA 2DBCA 1SKRB 5E59A 2FNOA 2P31A 2VO4A 2DJJA 3CSJA 2O8VB 2CVBA 2ALBA 5A4UA 5G1KA 1TDIA 4YAPA 4OFNA 5G1LA 4MP4A 1VGLA 9GSSA 3I6AA 4GRFA 3RPPA 4IVFA 4BVYA 4MF5A 3UBKA 3GX0A 4E8HA 3CXGA 2B1KA 3KZQA 1AC1A 4H86A 5DALA 4MZCA 3GL3A 3PGTA 1OVNA 2R3XA 3KTBA 4Q5RA 4V1Ag 3GH6A 3EC3A 3C73A 3KH9A 1ZOFA 3O76A 1SL2B 1AQWA 3RHCA 4XIHA 2CVDA 4K7OA 1UC7A 1XOAA 1K3LA 5CO3A 3FY7A 4GWRA 4X0XA 3FHKA 5INYA 1XVWA 2GZZA 1T00A 4WF4A 4ZBAA 4TN8A 5ECIB 1YZXA 5F07A 2MMZA 3M9JA 1Z7RA 1X9WB 3BJ5A 5KEJA 1VRSD 3KTLA 3IA1A 1HYUA 5F0GA 4KSOA 1XW5A 5DJLA 1TRVA 5HR2A 4MZBA 4HU9A 2IPAA 4IQ1A 3UJ1A 1I9DA 3TJKA 2IFQB 5KN1A 1TW9A 1SL0B 4ZIJA 3GFKA 1GUMA 3HHVA 2DIYA 2RM6A 4PQIA 2K8SA 2LEGA 2JZRA 2GSSA 5IOWA 3HVVA 2G0FA 1Z7PA 1U3IA 4MPGA 2HFDA 3IPZA 2OE1A 4WF5A 5AIVA 2V2GA 2XHFA 2FGXA 4IN0A 1X0RA 2B5XA 2D2ZA 2H6YA 2X8CA 2Z9SA 2QGVA 3LXZA 2L6CA 3ERWA 13GSA 5IQYA 3O6TA 4GCIA 4RUVA 4BWSA 1T4ZA 3ME8A 5ECPB 1OC8A 3PINA 3MDKA 2NBSA 3LG6A 3TUEA 4KNDA 2PBJA 3E0UA 4N10A 1EOGA 3F8UA 1TU7A 1K0NA 2IMIA 2VD0A 1XW9A 4K8MA 3LFLA 4L5OA 3ERGA 1BJXA 1R5AA 5CREA 3HYPA 3HCZA 3D4TA 2VCZA 1IYHA 4EKZA 1BAYA 1EV4A 4CHSA 2B5YA 4TRXA 4ISDA 5G5FA 3V1WA 4EDZA 4MMMA 4PUFC 1ZMAA 3F4SA 4K7NA 2YP6A 4PUAA 5IMFA 5CYYA 3HJMA 3HXSA 2FUG2 2VL2C 2C8UA 2P5QA 1SKSB 2VCTA 2DSAA 2HZEA 4G19A 1U3AA 4I6XA 5G5EA 2QC7A 5CRHA 2E0QA 1XWBA 1AAZA 3KGKA 4JU5A 4OFTA 3IK7A 2XC2A 1QGVA 3BOAA 4OCFA 1EP8A 3LSZA 1XBSA 1Y25A 1TK8B 2GT5A 3HY2A 2X99A 1RQMA 4MLYA 2VCVA 1OC9A 4KDYA 1TP9A 1A0RP 3VFIA 4LMVA 1N2AA 2IJYA 4BVXA 3TB2A 1M2AA 3OR5A 4MK3A 4D73A 1TRSA 2H1DA 1K0MA 5ELAA 3KMOA 3IXRA 4NV2A 3A3TA 1GNEA 5ABRA 3TKSE 4K6XA 4OCEA 1DUGA 2C3QA 1GSEA 1XFLA 1K0AA 4POMA 4IS0A 4EUYA 3QAVA 5B8BA 3MSZA 3FYGA 2H74A 2GQMA 3GKXA 4QL7A 1S3DA 4KB3A 2C1YA 1FVJA 4XHMA 3KD0A 5A4WA 1FB6A 4F82A 3G7IA 1PQNA 1T8EB 5IIZA 2WGRA 5DAKA 3ISOA 1PN9A 1T1VA 2FY6A 3F63A 4MA9A 5B6NA 1YJ6A 4WBRD 2VOCA 1O7UA 1A8YA 4IELA 3FW2A 3VWUA 3F3QA 4TR1B 4TW5A 2OKAA 4JE1A 3D5JA 3P90A 1TK0B 5J9BA 2GSTA 5B6MA 5HQPA 3C8EA 3G7JA 1YEXA 2M72A 2B5EA 2R4VA 4E8EA 1F6MC 1FG4A 3KM6A 3UVTA 4IJIA 4DEJA 3FR9A 4IQAA 3A2XA 2HSYA 1JZWA 3HZ8A 4IP1A 4KAEA 5IMVA 4N30A 2GVPA 2PWJA 4TR1A 2REMA 1GRXA 5D96A 3TJBA 2HT9A 3GURA 3CSIA 1AW9A 2WJUA 3CRTA 3GUSA 2B6MA 5AGYA 5G30A 5FT3A 1ERWA 3KMNA 1OKTA 1Y6EA 5J5NA 1GSFA 4V2NA 1R5PA 1SKWB 4DVCA 1WJKA 1SD8A 1K0DA 2AHEA 1AXDA 5F05A 4FYCA 3CRUA 18GSA 2B7JA 5CAXA 3MAKA 3GA4A 2JZSA 3KP9A 2J9HA 2P0GA 5IPGA 2R5GA 3ZFBA 3EE2A 3GTUB 3F0IA 2C3NA 2IN3A 2R6KA 4NV5A 4Q5QA 4FO5A 2M80A 3US3A 2YNXA 2HNLA 5CNWA 2H71A 4ECBA 1JHBA 4XS4B 1S3CA 2A2SA 5CP1A 1SYXA 4BL7A 3DXBA 1ZCPA 4O5RA 5DQSA 2F8FA 3P8WA 3VPQA 22GSA 1JZOA 4MJCA 3WYWA 4FH8A 3TKPA 5JWQB 2LRTA 2VCXA 1U87A 4ECJA 2FWFA 3IR4A 4JBBA 4GSNA 3M1GA 1EWXA 4K1FA 3TKSA 3ZYWA 6GSYA 3GMFA 1O6JA 3IK9A 1QFNA 3TOTA 5ECLB 2H6XA 3FZAA 5JCUA 2YOIA 2YN1A 2IMFA 4KX4A 4K7IA 5ECOB 3DIEA 3E9JB 3QMXA 1X9SB 4I8BA 1A23A 2WDUA 5JWRB 12GSA 1HNBA 2JZTA 1TJDA 2FCHA 2FWHA 3NOFA 1ML6A 1OYJA 3WT1A 2LUSA 2FWEA 3FZ5A 4BWQA 2LJKA 2X64A 3Q18A 1MD3A 4WR4A 2V1MA 4FYUA 3D4MA 1YKAA 3APQA 1DE2A 3EINA 1F37A 4MJEA 1TTZA 1KTEA 1OC3A 4GSSA 3DGQA 3NZNA 1XXUA 3GSSA 5DALB 3VWXA 5G31A 4O7HA 1EV9A 2YZHA 3ME7A 2JU5A 2L5LA 5IPHA 5A5KA 3UARA 3EYTA 4EF0A 2VM2A 4IP6A 2AAWA 1TI1A 1OAZA 4JRRA 2A4VA 4JR6A 2GGTA 3QPMA 5HFGA 2B3SA 3EMXA 2HYXA 2QSIA 3TKQA 1GLQA 2YWMA 1EZKA 5GAPD 3ZIJA 2ES7A 3GL5A 1GSYA 4LA1A 3IOSA 2I9HA 2LNTA 3EU4A 1B4QA 1GUHA 4L0UA 3W6GA 4BPYA 2H19A 2HSHA 2IIYA 3M0FA 2VCWA 2VLUA 3P7XA 3GV1A 1E2YA 3HZ4A 2DC5A 2PGTA 2H01A 1M0UA 3DVXA 5KN0A 2AJQB 4TR3A 4PX1A 4ULXA 3LORA 5ID2A 3FRCA 1Z9HA 2N5FA 4IKHA 2VL9A 4XS6A 1USBA 1X5DA 4ID0A 5F8BA 1XWAA 3HA9A 1PSQA 2H0HA 4ZL8A 3ZRDA 3VWVA 3HKRA 4DSQA 4XTSA 4G10A 2VLTA 2MMNA 4EE0A 2YPMA 1DSBA 5J4UA 1U6TA 1SL1B 3E3EA 4LL1B 1QUWA 2IMKA 1YKCA 4ZL9A 1SU9A 3GH9A 3IHQA 4ZBBA 1G0TA 2GZYA 1F3BA 5AISA 3KP8A 1O85A 2HXKA 1GSUA 3MNGA 3VPTA 2V6KA 1A24A 3SWLA 2CVKA 3G7YA 5FHIA 2KUCA 3GX8A 1SJ6A 1Z3EA 2GTUA 1AQXA 1M7TA 3H79A 2VLVA 4WBJA 4DSSA 1THOA 1GWCA 2GT6A 2O85A 2EIOA 1R7HA 5ECHB 4RI7A 5DQYA 3GKNA 3ZMKA 4P3YB 2G2QA 3WGDA 3ZZXA 3WGXA 4EO3A 4NHZA 1EP7A 1N8JA 2MBSA 2CA8A 3UAPA 3ZMLA 4V1Ap 4V2MA 2L5OA 3Q19A 2VIMA 4TVEA 1SYRA 1GUKA 1YEPA 3U6VA 1SK0A 4Z7XA 3QDNA 1WP0A 2CAQA 4OMVA 3FKFA 4ML6A 2VAFA 2HZEB 4KCEA 2F8AA 3QD9A 2FD3A 2CAIA 4NPBA 4MZWA 1S3AA 5JWOB 1NHOA 2P5RA 3EVIA 1URMA 4MABA 3SBCA 3ERFA 3LJRA 1QXHA 4KA0A 1YY7A 4Q5FA 4IGJA 3QCPA 5B7CA 4PURA 1KEBA 2IMDA 2WZ9A 2PPTA 2E7PA 1M99A 4ZB6A 1OC9B 3TJJA 2ZNMA 1X5CA 1PA3A 4Q5NA 2KHPA 1GTAA 1A0FA 2YJ7A 2OADA 6GSVA 2LS5A 2MBTA 4D73B 4TR4A 1NM3A 2DLXA 5DDLA 3WT2A 1XCCA 3W8JA 3S9FA 2GSQA 4KE3A 4XRDA 1WOUA 2OJLA 4L0WA 5EPFA 3UL3A 1J08A 2CZ3A 3HVSA 3M3MA 2H70A 4YQVA 2PERA 2GQKA 3M9KA 4KW6A 4AGSA 1BQ7A 3RBTA 2L4CA 4MJAA 1XIYA 3IDVA 1A2MA 3TKSC 2F51A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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