2H71A

Crystal structure of thioredoxin mutant d47e in hexagonal (p61) space group
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
DKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIAEEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
publication title Crystal Structure of Thioredoxin Mutant D47E in Hexagonal (p61) Space Group
rcsb
molecule keywords Thioredoxin
total genus 33
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h71A00
1PMTA 3HXSA 3G7IA 2JZTA 4EF0A 4TKYA 4K9ZA 5CRWA 2FA4A 2CVBA 3CSIA 1SJZA 2IJYA 3HKRA 1IYHA 1EEMA 1ZMAA 4IHUA 1GH2A 1BG5A 4NHWA 1LJRA 2H8LA 5D9XA 2RM5A 3HJPA 5COHA 2HZEB 4IQ1A 4MJAA 3GKKA 3GTUA 2YN1A 4EDZA 2N5FA 2R5GA 3D22A 4PQ1A 5EPFA 1R7HA 3GSSA 1GSEA 1SK2A 5J41A 1Z7PA 1O6JA 1J9BA 2C3TA 4KAEA 5D9TA 2CZ2A 2H71A 3MSZA 1R4WA 1DE2A 2F8FA 1FHEA 3QAGA 4NMUA 1X5DA 1Y6EA 2D2ZA 2P5QA 5CRHA 3UARA 3H8QA 1ERWA 2GVPA 1XWCA 4FYBA 2PERA 1WOUA 1GTAA 2RM6A 2XBQA 2GLRA 1TRSA 5DDLA 5ECNB 2YV9A 4KCAA 4JR6A 3ERWA 4NPBA 3UAPA 1SD8A 2B1LA 5ID2A 4OO4A 4ZBAA 3VWWA 4EUYA 3KP8A 3TKSE 1ZYQB 1GRXA 2GSRA 2M46A 2GSTA 3I9V2 2H1DA 1PKZA 1T3BA 2VL9A 5DBQA 4FH8A 2YWIA 4QQ7A 3APSA 4KH7A 3BD2A 4ZB8A 3TJJA 2LJKA 2LRNA 5IO2A 3H79A 4MPFA 5JWOB 4KDUA 1KBNA 4YH2A 1XWKA 2FHEA 1MDIA 3FZAA 5FWGA 1YQ1A 3GL5A 3IPZA 4PUAA 1GNEA 4O32A 3KJYA 4Q5FA 2H74A 1XFLA 3LORA 1TK8B 3H93A 3VK9A 4DEJA 3D0ZA 4N30A 4RI7A 5HR3A 3GSTA 3CXGA 4GSTA 2HYXA 1S3DA 4NXIA 4MZBA 3QR6A 4OFNA 3IRAA 1AQVA 2LTKA 4MMMA 3IA1A 3APOA 3I6AA 4PUFC 2VCZA 4YQUA 2JZRA 1V58A 4X0XA 2FY6A 4IBPA 3C8EA 1A0RP 2AUVA 3M0FA 1VF2A 2JADA 2H76A 3NIVA 4X43A 1BEDA 3BCIA 1TP9A 2X64A 4MCUA 5A5KA 3HZ4A 3HZ8A 6GSTA 3HVXA 4GTUA 2VD0A 5AISA 1GLPA 3HD5A 2ZUPA 3FEUA 2KHPA 3IAS2 3KH9A 4K0NA 1WMJA 4AJ7A 2HNLA 5ECQB 3R2QA 3UOMA 13GSA 4O92A 4MPGA 3HYPA 2MBSA 2CA8A 2HZEA 3KXOA 1K3LA 3DGQA 2JSYA 1EP8A 4BVYA 2VCXA 5G30A 4V1Ap 3A2VA 1R5PA 1NSWA 2LJRA 1AQXA 4IN0A 2XPDA 3TB2A 3TRXA 2A2RA 2IWTA 3CSJA 5DQYA 1B8XA 4IVFA 3QMXA 4HS1A 2HE3A 1O8XA 3AY8A 2YWNA 1TW9A 2MMNA 2C80A 1A23A 2TRXA 3E3EA 4YAVA 2WDUA 5DAKB 3EC3A 3D4TA 5B8BA 4DSRA 3F63A 3KZQA 4MJBA 3RAZA 2H0GA 3DYRA 2H70A 3WT2A 3GUSA 4IQAA 1OE7A 2DJ1A 3BBYA 3ZFLA 3TKQA 3L9SA 2ON7A 3GHAA 1FO5A 4HQSA 3I69A 2E2GA 1H75A 1U88A 2CQ9A 3F9UA 3GKXA 3TJKA 2R37A 2WRTA 2IMEA 4ECJA 3ZREA 1K0OA 2PUKC 1B9YC 1OAZA 2L5LA 2DJJA 3C73A 1JZRA 2IMKA 2WGRA 5A4VA 4TW5A 4DSSA 4K7OA 2ON5A 3LEFA 3MDKA 3P90A 3FZ4A 2LV3A 3RHBA 1OKDA 2PGTA 4TR1B 3GX0A 4WF5A 1NHYA 3EVIA 2F9SA 2B7JA 4QL9A 4WEYA 2C8UA 1SK0A 5EY6A 3F6DA 1AUCA 5KEJA 2DJ0A 1JFUA 4GXZA 1PQNA 2LS5A 4MZCA 3N5OA 2LSTA 1EGOA 2M72A 2HZFA 1M9BA 3I43A 3W6GA 1YEPA 4LMVA 1JZDA 2GQKA 3H1NA 3GH9A 6GSYA 1JLVA 5CO3A 3LYPA 2JU5A 1TK0B 3GA4A 2E2MA 2IMFA 1M0UA 1GSQA 1MTCA 2LRTA 3EINA 2PU9C 4LA1A 1AQWA 2IFQA 1YF0A 3C71A 4E8HA 5ENUA 2ZNMA 2VL3A 2AJQB 2WCIA 5HFGA 5D9WA 4IS0A 3GURA 2HSHA 3KMOA 3GFKA 4L8EA 3HVVA 6GSSA 3HCZA 2I3YA 2FWFA 4XS1A 1F6MC 5HFIA 1V40A 2DSAA 1BQ7A 4F82A 1XW5A 1YKAA 2C0DA 5IMFA 5CAXA 2QGVA 2DJKA 2DIYA 2OE3A 2VCQA 2J23A 1U3IA 1M2AA 3TKSC 3TUEA 3GX8A 5F07A 1OC9B 4V2LA 3VPTA 1VF3A 2FWGA 3V1WA 4TR3A 1Y25A 4PXOA 1XW6A 1A0FA 2DC5A 2F3MA 2C3QA 3A2XA 2FWHA 4ZL7A 5JWRB 1V9WA 5J9BA 2PWJA 4OMVA 2AHEA 1XBSA 2KP2A 1AXDA 1A24A 4KB3A 5GSSA 1B9XC 2R3XA 2HI7A 1PX7A 3QOUA 1WE0A 1URMA 3RPPA 10GSA 5DJLA 4PNFA 1TU7A 2OA7A 5IIZA 2VO4A 2K8VA 1QMVA 4L5LA 1XIYA 2NTOA 3LXTA 3CRUA 2N5BA 1SD9A 4IW9A 3LWAA 1I5GA 1SK1A 4PX1A 5F06A 2WFCA 1AC1A 1WIKA 1EOHA 2PPTA 4OO5A 2B5YA 3SWLA 5D93A 1ZGNA 3HVSA 3VLNA 4KX4A 2K6VA 4ZIJA 5CP1A 3EWLA 3GRXA 1DE1A 1HYUA 4F03A 1SU9A 5DCGA 3IR4A 2CVDA 4NAXA 3ZMLA 1TTZA 5ECOB 1EV4A 2BTOT 3Q18A 4ZL9A 17GSA 5E59A 4GQFA 1K0CA 4ZILA 3IV4A 3ERFA 4MJEA 4IP6A 2MMZA 2YANA 3QD9A 4WBRD 1NHOA 1K0BA 5FHIA 1TJDA 2XC2A 1FG4A 1TKDB 1HQOA 3IK9A 4TXOA 4HZ2A 3RPNA 3IK7A 4K1FA 4EVMA 1OE8A 4MZWA 1THXA 2VCTA 3EE2A 1JLWA 3KTBA 2OBIA 2YZHA 5B8AA 2E0QA 2ALBA 3LYKA 4KSOA 3ZMKA 2B5EA 5DJMA 1XWAA 2M80A 4AJ8A 1TRWA 4EKZA 5IMZA 3FR3A 4Q5RA 1T7PB 3ZTLA 3IC4A 1ST9A 4I97A 2B1KA 5D96A 5EL8A 5C04A 4OD7A 1A2MA 5ECPB 4NV2A 3D21A 5B6NA 2GQLA 1V2AA 4KE3A 3W8JA 1OC3A 1PA3A 1K0MA 4JZQA 3KTLA 3US3A 2YNXA 1USBA 2DLXA 2GZPA 5HQPA 2P31A 2VCVA 1VGLA 4FO5A 1GP1A 3ERGA 1AW9A 2RIIA 3J7Yb 1W4VA 1QFNA 1OC9A 3O3TA 1Z3EA 2PN8A 1R5AA 1F9MA 5ECIB 4N10A 1OC8A 2VD1A 3WD6A 5G1LA 3GKMA 4TXVA 2GDRA 4ZB6A 3FRCA 1VF4A 1FVJA 3L9UA 4HQZA 2VLUA 5DCHA 3HHVA 1HNCA 1G7OA 1MD4A 4ML1A 2L6CA 2RUEA 4DSSB 3TDGA 1U87A 4PQIA 1G0TA 2O7KA 2QC7A 2FNOA 4XIHA 1G6WA 1GULA 3JCML 3IAM2 1Z9HA 2WJUA 5J4UA 2LEGA 2LJAA 5JCUA 2G0FA 3N9JA 4J56E 1YEXA 4IGJA 1EV9A 1T8EB 1J0FA 3HJOA 1SYXA 2F8AA 4G10A 1EOGA 1I9DA 2HRFA 1XPVA 1SJ6A 2KLXA 1CQHA 4HJMA 2TIRA 2GS3A 3RBTA 1BYEA 3FR9A 4MK3A 4P3YB 3ZYWA 3UBKA 4V2MA 1B4PA 4WBJA 2LQOA 2YJHA 1A2LA 1O8WA 2MBTA 1VF1A 2JACA 2V41A 2TRCP 3D6IA 4LLRA 4F0BA 2IFQB 2LRCA 1ZCPA 2H6ZA 3GNJA 2XBIA 4JRRA 1PRXA 3EU3A 4KGIA 1K0DA 2CV4A 4HI7A 3TKPA 1Z7RA 3VWUA 2RLIA 2OE0A 1ACVA 2CX4A 2XPEA 3LSZA 5LNKe 4BVXA 4N0VA 4Z7XA 3KIJA 1IYIA 1E2YA 2JSZA 1WJKA 3DXBA 3WGEA 2C0FA 4AGSA 1B48A 1Z5YE 5ELGA 1O7UA 2VL2C 4ZXGA 5HR1A 3LG6A 3VWXA 5AIXA 2EIRA 4HDEA 4ZBBA 2MYGA 1TU8A 4JE1A 1T1VA 3E0UA 2MMOA 4TR0A 3F8UA 4MP4A 1TXXA 2FA8A 5GZZB 5ABRA 2A2SA 5D8IA 3BCKA 3UVTA 2B6MA 4KSMA 4PGTA 4V1Ag 4EC0A 3OR5A 3UJ1A 4MF5A 1K0AA 1S3CA 1A8YA 4ECIA 1K3YA 4TR4A 4BWQA 4CDOA 5FT3A 2YOIA 2YWMA 3Q74A 1XOAA 2CT6A 3L4NA 5ECHB 3D4MA 20GSA 2H73A 2FWEA 1ILOA 2ZCTA 2NDOA 1O85A 3KGKA 2H6XA 3HJMA 2IMIA 3VI7A 1TRVA 1YJ6A 3L78A 2FCHA 2F51A 5IMCA 3E9JB 1SL2B 3DEXA 5LD0A 2GT5A 2R2JA 1XW9A 3ZLPA 5H5SA 4MABA 1M2BA 5IOWA 1FOVA 4K7IA 4EL1A 3DMLA 3UVHA 4ULXA 2O8VB 1N8JA 3S9FA 4IP1A 1QGVA 3VFIA 1JZWA 1X5CA 3KM6A 3FK8A 4PURA 1SKWB 5AIVA 4ECCA 2REMA 1EEJA 4XS4B 4ZL8A 2OBKA 3IHQA 3LXZA 2KOKA 3F4SA 3HY2A 7GSSA 1AIUA 1EGRA 4OCEA 14GSA 1T4ZA 1G6YA 1GTUA 2R4VA 1ZYEA 4TVEA 2AV4A 3RHCA 1F37A 2L5OA 4TXOB 1PSQA 3PGTA 4DVCA 3VPQA 2DBCA 4KA0A 1FVKA 4WF4A 4WXTA 3C1SA 8GSSA 5INYA 5JCWA 2X8HA 3F4RA 1BAYA 1GSUA 2QKEA 3CMIA 2VCWA 4GWRA 1GSSA 5IQYA 1VRSD 1GWCA 2C0GA 3ZFBA 1X9MB 1XWBA 2IL3A 4XTSA 3P7XA 1XXUA 2HLSA 2WS2A 2C1YA 3GKNA 4I2UA 4WR5A 5DALB 2GGTA 1WRYA 2AYTA 2VLVA 3TCOA 2B5XA 5G1KA 1T00A 4N11A 3VWVA 3A2WA 3BJ5A 4GLTA 2O85A 3ED3A 4F0CA 2GTUA 4OFMA 4JEDA 3DIEA 1ERTA 1SL0B 1ON4A 4EXJA 5ECSA 4WR4A 1KTEA 1FAAA 3O6TA 1U3AA 2X99A 2Z9SA 3EURA 5LCZA 1RQMA 4GQCA 3FY7A 3ZL5A 1MDKA 1YZXA 2QSIA 1GSDA 4KCEA 1HNBA 2J9HA 1QQ2A 5F0GA 2R6KA 4NV5A 2O89A 1Z6MA 5KN0A 1T4YA 2VLTA 3U6VA 1PN9A 3TGZA 5CRDA 4MH2A 5F05A 6GSWA 3FKFA 1Q4JA 2H30A 3K8NA 3P8WA 4YAPA 1YY7A 4J57E 1M7TA 1M99A 2DMMA 5CYYA 2H72A 3LGCA 16GSA 2V6KA 4IKHA 2P5RA 2B3SA 2GSQA 1SJIA 4L0UA 3WT1A 2YJ7A 2H1GA 3MNGA 1GUKA 2VM1A 4HU9A 2JZSA 2BMXA 4MF7A 2PVQA 3GN3A 4ISDA 5HR0A 3DD3A 3TRQA 3EU4A 1TRUA 3U5RE 1Z6NA 4XS4A 5A4WA 1PL1A 3ISOA 2DJ2A 5F8BA 1WPIA 2O87A 4TN8A 2C0EA 2DJ3A 4HU7A 4KNDA 3KMNA 1N2AA 3KD0A 4GRFA 5JWQB 4BA7A 2CAQA 1SKSB 1R26A 2H0IA 1LBKA 3ME8A 1GLQA 3FHKA 5GAND 4WKWA 2YV7A 2L6DA 4I6XA 1KEBA 3SBCA 4JU5A 4NHZA 3GL3A 2CVKA 3GYKA 3DRNA 4EO3A 3M1GA 2FD3A 3PINA 1GTIA 1TI1A 4YQMA 1K0NA 5B7CA 2EIOA 1PGTA 2KUCA 1SYRA 2K18A 2V32A 4TOPA 5CNWA 2H75A 4LMWA 2IIYA 1XVQA 4RQXA 2AAWA 2NPBA 11GSA 1JHBA 3H4KA 1RK4A 2NVLA 1TDIA 5DALA 3MAKA 5AGYA 5CREA 4AF2A 4LL1B 1M2DA 3UIWA 3IBHA 3APQA 4OFTA 3NZNA 3QDNA 3ZVJD 2H6YA 2I4AA 2L59A 4HZ4A 4XHMA 2LKUA 3EMPA 3QFBC 6GSUA 2G2QA 3C1RA 1H4OA 1BX9A 1YF1A 3QFAC 3CSHA 4ACSA 3UL3A 1GL8A 3M8NA 3TJBA 5IPGA 4HOJA 4JR4A 4POLA 4L5OA 2PVOC 4BPYA 1C72A 1EZKA 4GSNA 1GTBA 3TOTA 4GF0A 3GIXA 1TK5B 4QL7A 3QAWA 3HA9A 3A5WA 2N5AA 4IELA 2OJLA 1WWJA 2GZYA 1EP7A 2H66A 3TKSA 3RDWA 5IOXA 4CHSA 1PKWA 3W8SA 3WGXA 3QCPA 4MF6A 1PL2A 4KW6A 3F6FA 1MDJA 4HJ2A 4G19A 2H1BA 4FYCA 2H0HA 1WP0A 4E8EA 3UMAA 5GAPD 4F9ZA 5GSTA 3L0HA 5ECKB 3C7MA 1NW2A 4KUNA 1F3AA 2MMAA 1GSFA 1F3BA 2CX3A 2I81A 1UC7A 4D73A 1THOA 4L0WA 3M9KA 2VIMA 3TJFA 3TRPA 2MZCA 1HNAA 3CTGA 2OKAA 5AN1A 4Q5QA 4HUAA 3ME7A 2X8CA 1SL1B 4I2TA 2YCDA 5DVBA 3G9BA 1RW1A 2FGXA 3LJRA 2YPMA 4K2DA 1ZOFA 1BJXA 5IMVA 1TOFA 4POMA 4H86A 5J9CA 2E7PA 2AB6A 2WZ9A 4X1UA 4MLYA 5A4UA 4RQRA 1J08A 2LQQA 1M9AA 2LNSA 5KN2A 1OVNA 1UVZA 1TI3A 4Q5NA 2HFDA 2IPAA 3TOUA 3Q6OA 4PNGA 5KN1A 5D9VA 1A2JA 3TKRA 1PX6A 5B6MA 2K8SA 1ABAA 1SENA 2H19A 3L9VA 5G31A 2VUPA 5HFKA 3EMXA 2VAFA 4MA9A 1CQGA 1X9WB 2VM2A 3QPMA 4ZB9A 3ZRDA 1O73A 2P0GA 2V6OA 3G7JA 1QK8A 1A8LA 3M9JA 4ID0A 1QXHA 1MEKA 5J5NA 5HR2A 5G5FA 3IOSA 5L71A 1ZL9A 3HDCA 1S3AA 1KNGA 4PQHA 4XS6A 4F2IA 5G2ZA 4AJ6A 5IMAA 6GSXA 3O76A 1EWXA 1G7EA 3ZIVA 2IMDA 3KEBA 3VURA 5IO0A 4I5QA 4XRDA 4MJCA 4NWYA 3KCMA 4OCFA 2L57A 3PH9A 3GV1A 2IN3A 2HXKA 3CTFA 4O7HA 2YP6A 3WYWA 4GCIA 2V2GA 2X8GA 4ZBDA 1QUWA 12GSA 1O81A 5IPHA 2I9HA 2HSYA 4BL7A 5D73A 19GSA 4RI6A 2H01A 6GSVA 2VOCA 4YQVA 4EE0A 1Q98A 2DIZA 3IE3A 5ELAA 1ERUA 4HEA2 3QAVA 2NBSA 2H1AA 4KDYA 4RUVA 4ML6A 2YZUA 2ES7A 4K7NA 5DQSA 4N0ZA 4XRAA 1W89A 2L4CA 4DSQA 1GSYA 1SKRB 3F3QA 1FB6A 4FYUA 3DKSA 2BJXA 2KP1A 3CRTA 1XVWA 3DVWA 1NM3A 2HRNA 1YKCA 2GT6A 3IXRA 2B7KA 1GNWA 4K0GA 4KDXA 2LNTA 3CBUA 22GSA 3GH6A 3KH7A 4G2EA 18GSA 1ERVA 1FW1A 1UN2A 2GSSA 3Q19A 2L4QA 1XOBA 3PR8A 3ZIJA 3M3MA 3F0IA 3GMFA 3GTUB 4J2FA 1YDKA 2C3NA 5CRGA 2DMLA 1X9SB 1AAZA 4JBBA 4G9HA 5E4WA 4ECBA 2GZZA 1GUHA 2RUFA 3TJGA 3FZ9A 2CAIA 1DBYA 3P2AA 3CYNA 4V2NA 4MDCA 5J3RA 5EVOA 4OWYA 2OADA 3F3RA 5IMDA 2EC4A 2HT9A 3A3TA 4FIWA 1HD2A 2A4VA 1V98A 4MH3A 3FR6A 1XWGA 1X5EA 2CZ3A 5ECRB 2I1UA 5ID2B 3LQ7A 3EYTA 3FZ5A 4WETA 5JCGA 5KN3A 3ZVJA 2K9FA 1JZOA 1E6BA 3IDVA 2XHFA 3FW2A 3LFLA 4EDYA 3ZZXA 3UEMA 5ECMB 1GUMA 1DSBA 1V57A 9GSSA 1K3OA 5IM9A 4POBA 4TRXA 1LU4A 5C00A 4ILFA 3D5JA 5DAKA 4I8BA 3VI5A 2VL2A 5H5QA 2WB9A 5ECLB 2PMTA 4POKA 4CW9A 2EIQA 4IJ3A 3DVXA 1FB0A 2YWOA 4K8MA 1UA5A 2JL4A 1ML6A 4XCSA 3KP9A 4K6XA 3WGDA 3G7YA 3J7Yk 2FLSA 2V1MA 1DUGA 1XZOA 3UBLA 1XCCA 3MWHA 3NOFA 1MD3A 3BOAA 4D73B 1B4QA 4LL4B 1PD21 2OE1A 3F4TA 4IJIA 5G5EA 4GSSA 3FYGA 4O5RA 1F2EA 5H5RA 2LUSA 2PBJA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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