2H71A

Crystal structure of thioredoxin mutant d47e in hexagonal (p61) space group
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
b'DKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIAEEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Thioredoxin Mutant D47E in Hexagonal (p61) Space Group
rcsb
molecule keywords Thioredoxin
source organism Escherichia coli
molecule tags Electron transport
total genus 33
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h71A00
4ZBDA 1EOGA 4HOJA 1JLWA 3GRXA 4FYBA 3PINA 3Q19A 1TRVA 2RUEA 1Y6EA 1XWBA 2FLSA 3US3A 3FRCA 2V2GA 4GCIA 1TK5B 3HY2A 4F82A 1BQ7A 3GIXA 3NZNA 1GP1A 2L6CA 5IMVA 1XBSA 3CBUA 4XIHA 3RPPA 5J41A 2PN8A 2J23A 4K2DA 3IDVA 5KEJA 4K6XA 5A4UA 2GZPA 3QR6A 1M2BA 2YNXA 3RHCA 3LXTA 1B4PA 2DJ0A 2FCHA 5D9WA 4EF0A 4ID0A 1M9BA 4OD7A 4JR4A 4MK3A 1SKSB 1VF2A 1QK8A 5JCUA 3TKQA 2OACA 3GV1A 4K9ZA 3HZ4A 4QL7A 2DMMA 3DYRA 1GSUA 1F3BA 4XS4B 1VRSD 2FWHA 2JZTA 2WJUA 5ECPB 3A2WA 4PQ1A 1O81A 1GWCA 5IO2A 2H72A 2TRCP 2IWTA 1V98A 2XC2A 3F63A 3TRPA 3QAWA 5IOXA 3LYPA 4WF5A 1B9YC 2OKAA 1YJ6A 1EGRA 3F8UA 2K9FA 3VWWA 1B8XA 1A2MA 1X9SB 5EY6A 2LQQA 2D2ZA 4DSRA 4RI6A 2P5QA 2VIMA 3FEUA 3HJPA 2OBKA 5A5KA 2AUVA 2HFDA 2H76A 1F9MA 5KN3A 11GSA 3BCKA 3ZREA 1PL2A 1GSQA 3GKNA 1RW1A 1M7TA 3HDCA 4KUNA 2LRNA 2WZ9A 1BYEA 5CRHA 2RIIA 4XTSA 1XWGA 1EP8A 3EWLA 1SYXA 2CV4A 2PBJA 3APOA 5EL8A 1SKRB 2C8UA 3L0HA 1WOUA 3JCML 1TK8B 3Q18A 4TXOA 3CTGA 1Z9HA 1BEDA 3KMOA 2YJ7A 1AQXA 2YCDA 6GSTA 4FIWA 1X0RA 1TP9A 4V2LA 2C1YA 1AIUA 3TRXA 3BBYA 4N11A 1OE7A 4TR4A 3E3EA 1H4OA 1GSSA 2X64A 3UIWA 2RLIA 1VF3A 3HJMA 2CQ9A 4HU9A 1B4QA 4K8MA 1EP7A 1ZOFA 3F6FA 2VCVA 3DVWA 2H1DA 1SD9A 2H71A 3TJKA 5FHIA 1G7EA 3GKMA 1OC9A 4MF5A 2L5LA 2O85A 5LD0A 3IBHA 2DJKA 5JWRB 3IK7A 2WFCA 1GSFA 3C73A 2GT6A 5J5NA 3WD6A 2QC7A 2HYXA 3O76A 5C04A 2NTOA 4FH8A 3CRTA 2FA4A 2PWJA 5DALA 1ON4A 5ECNB 17GSA 3BD2A 3F4TA 1YZXA 1R5PA 3APQA 4HJMA 5ECMB 4KB3A 2VL3A 3D22A 4TN8A 3LJRA 5IMCA 2VCTA 3TUEA 4KCEA 2L59A 2I3YA 4L5OA 1XFLA 3ZIVA 4ECCA 4OFTA 3WGEA 3ZMLA 3C7MA 1K0NA 3GHAA 4POMA 2CX3A 6GSSA 1GTIA 1Z7PA 1XVQA 4TR3A 3GL3A 3O6TA 4OFMA 1AUCA 2JZRA 4GTUA 4N0ZA 2G2QA 4FYCA 4KW6A 1YEPA 2HE3A 3UAPA 5D93A 1Z7RA 1AXDA 2IL3A 4TW5A 1HNBA 4IGJA 2L57A 4NHZA 1Z6MA 3KXOA 3EMPA 4LMVA 2O89A 3EU3A 2YWOA 4IQ1A 4BPYA 2GGTA 1V2AA 4MA9A 2IJYA 3C1RA 4EDZA 4GSSA 3H79A 1JFUA 3KP9A 2P31A 5DQSA 2R4VA 2B7KA 3DWVA 5IOWA 3HVSA 3GX0A 4MMMA 2IFQB 4YH2A 2LNTA 4RUVA 2C80A 5IO0A 5CO3A 2LJRA 2YWIA 1GULA 3KTLA 2A2SA 3F6DA 2BJXA 3MNGA 1U3IA 3LGCA 5DVBA 3M9KA 2VLVA 1MDKA 4MJBA 3IA1A 1MD3A 3HA9A 1PX7A 2GVPA 3WGDA 5B6MA 4POBA 3LFLA 5ECSA 3HD5A 5GAND 2AJQB 3EINA 1ZMAA 3L78A 3ZLPA 4IHUA 4GLTA 2DJ1A 5DCHA 3RAZA 2OJLA 3CYNA 2GQMA 2FWFA 5GZZB 1ZL9A 1K0BA 3QDNA 3L9VA 2FNOA 4L8EA 5ECIB 3M0FA 2B6MA 2JACA 3UMAA 4KAEA 4WKWA 2LRCA 3KD0A 5C00A 1V9WA 4FYUA 3W8JA 2JU5A 2K8VA 4EDYA 3IRAA 2JADA 2R5GA 3KH7A 4KDXA 5DAKA 1YF1A 2FA8A 2QKEA 2K18A 16GSA 1JZDA 2LV3A 3H8QA 4DSSA 2ON7A 3FY7A 1X5EA 1ML6A 4OCFA 4AJ7A 1R4WA 2FWGA 4F0CA 1T4ZA 1A8LA 1G0TA 1TK0B 2VM1A 1K0OA 4TR1B 4WF4A 4NAXA 5G31A 1F6MC 1ST9A 1M99A 3CMIA 1MTCA 1OAZA 3TOTA 3DVXA 1XVWA 4KGIA 4KX4A 3ZFBA 3TKPA 4TVEA 2L6DA 5B7CA 2AYTA 3IAS2 3UEMA 1CQHA 3UBKA 3GKKA 3L9UA 1TRUA 1K3YA 4K0NA 3D5JA 5B6NA 1WWJA 2MYGA 4JU5A 1XWKA 5IMDA 2GSSA 1FVJA 2FD3A 2YPMA 1VF1A 2PERA 2L5OA 2H6YA 3R2QA 2MBSA 1GUHA 4MLYA 3U6VA 3VLNA 2HI7A 3DXBA 3FZAA 4WR4A 2XBQA 3PR8A 5KN0A 1M0UA 1X9WB 3TKSA 4XRAA 1Y25A 4KSOA 1F3AA 1I5GA 1Z3EA 1URMA 2GQLA 4AGSA 4HJ2A 5AIXA 5IM9A 3O3TA 4Q5NA 1TXXA 1OC3A 1QMVA 4OO4A 5CRGA 1YF0A 2X8GA 5KN1A 2EIRA 1FW1A 2V6OA 4WBJA 1O6JA 6GSYA 1V58A 4MF7A 3GTUB 3QD9A 2VCZA 3VI7A 3KIJA 6GSXA 3BOAA 1A0RP 3PH9A 1UC7A 4NMUA 5G1LA 2PPTA 4GWRA 2X8CA 3ZVJA 1OKDA 1F37A 2LJAA 4N0VA 4MJCA 3TKSC 1ERUA 2IMDA 2WGRA 2G0FA 4LA1A 4F2IA 2A4VA 4HZ4A 5IQYA 1WE0A 2H8LA 1OKTA 3CRUA 10GSA 1F2EA 1X5CA 2HZEB 3BCIA 2REMA 1BJXA 2VL2A 2FGXA 2I9HA 3Q6OA 2DIYA 5FWGA 2YJHA 3D4MA 2GLRA 5IMAA 5D8IA 4GXZA 6GSWA 1NM3A 3IR4A 3ME7A 1SENA 3FR3A 4LMWA 3FZ9A 1TJDA 2LQOA 5DDLA 1K0DA 2YZUA 1S3CA 4TKYA 2NVLA 3TRQA 1PL1A 4CW9A 3MWHA 22GSA 1IYHA 2B5YA 2H1GA 2GS3A 2YV9A 3WT1A 4F0BA 1TTZA 4BL7A 3EE2A 1JZWA 1ZYQB 2FUG2 3P90A 1T8EB 4G9HA 1GLQA 4WEYA 5LNKe 5EPFA 3GUSA 4IELA 2H1BA 3VI5A 2L4CA 1TI3A 2MZCA 2PVOC 5ECHB 1GSDA 3G7JA 4ZBAA 4LL1B 3S9FA 5HR0A 1TRSA 1QGVA 4PNFA 2VL2C 2WDUA 1TI1A 1J9BA 2OE0A 1JHBA 1J08A 2ALBA 2E2MA 3HHVA 5ECQB 1ZYEA 4ACSA 3IOSA 1AC1A 1DSBA 2YWNA 1G6YA 4AF2A 4JBBA 3DGQA 5AN1A 3G7YA 3KCMA 3IC4A 19GSA 1R5AA 2GSQA 2VAFA 1PKZA 5G1KA 4ZXGA 5IMFA 3E0UA 1MEKA 3P7XA 1EEJA 5INYA 1XW5A 4I6XA 2X8HA 4EVMA 4O5RA 5G30A 3VPQA 2LSTA 1BX9A 1O73A 3GURA 1XXUA 2I1UA 4ECIA 3VK9A 3QAVA 2H01A 5ID2A 1DBYA 3H93A 3ZTLA 1A24A 5JCGA 2CVDA 3HKRA 3P2AA 1SK2A 2FWEA 3IPZA 1AAZA 4MH3A 1H75A 4FO5A 1HNCA 3MDKA 2GTUA 1WMJA 5IMZA 2ZUPA 3EVIA 2HSHA 1W89A 1TDIA 4O32A 3FW2A 3TOUA 4JZQA 2XHFA 4AJ6A 2HZFA 2VCWA 1RQMA 2YV7A 3LEFA 4MJAA 3I6AA 4EL1A 1SJZA 3TGZA 3VURA 3TKRA 3VWXA 2MMOA 1O8XA 4G19A 5ECRB 1FB6A 2QSIA 2O87A 1QUWA 1SK0A 4V1Ag 4ECBA 1SK1A 2PMTA 4N30A 4D73B 3E9JB 4DSQA 1K3OA 4IP1A 4MZBA 2H73A 3QAGA 1V40A 2ZNMA 3QCPA 2F51A 3RHBA 3F9UA 4EKZA 2MMAA 4IQAA 4OO5A 1OYJA 2YN1A 3GN3A 3QMXA 2VCQA 4PUAA 8GSSA 3QOUA 3EURA 4XS1A 1K3LA 1S3DA 2CAIA 2JZSA 2O7KA 2OA7A 1VGLA 3I69A 3TJFA 4PQHA 4EC0A 3IK9A 4LL4B 5A4WA 2ZCTA 2LTKA 3RDWA 3CSIA 3ME8A 1FO5A 2CZ3A 2YZHA 1AQWA 2HRFA 2IMFA 4EXJA 3EMXA 1VF4A 3UL3A 2H0IA 18GSA 2V41A 3IV4A 1IYIA 2CVKA 3UVTA 2F8AA 4CHSA 4CDOA 1X5DA 4GQFA 4KDYA 5HR2A 2M80A 4K0GA 4DVCA 3GSTA 1X9MB 3OR5A 1T4YA 3ZVJD 2E2GA 2V32A 2LKUA 4POKA 2C3NA 4ZB6A 2DJ2A 3IXRA 4X0XA 1O7UA 2YWMA 3DKSA 4GRFA 4NPBA 3RBTA 2VLTA 4AJ8A 1FG4A 3QFBC 2CAQA 3SWLA 3LORA 2H70A 1LBKA 2M72A 1XOAA 4ZL8A 1TKDB 3UOMA 3D6IA 3TB2A 5KN2A 3C71A 4QL9A 2LEGA 12GSA 4ILFA 2TIRA 4OFNA 4BWQA 4XS6A 3GH9A 5CP1A 4XHMA 2VD0A 2XPDA 5J9BA 3CSHA 1GSYA 5J3RA 2GZYA 4Z7XA 3ZIJA 3MSZA 5G5EA 2QGVA 1YKAA 3N9JA 4NV5A 2IMIA 4Q5FA 2IMKA 4PNGA 3KTBA 2C0FA 4H86A 1HNAA 4I8BA 4Q5QA 2H0GA 4OMVA 4ML6A 4X43A 1JZOA 2BTOT 4KH7A 4IN0A 1T00A 4ZIJA 2VO4A 2KP1A 2Z9SA 3ZZXA 2DLXA 3W6GA 4I97A 4YQMA 2CZ2A 1GH2A 4ISDA 3CSJA 4JRRA 2H1AA 2HNLA 1M9AA 3KZQA 5G2ZA 2JSZA 3KEBA 4E8EA 3HVVA 4BWSA 3LG6A 4POLA 5CNWA 3Q74A 2CVBA 3LQ7A 2DC5A 3EC3A 1C72A 5D73A 4DEJA 5G5FA 2WULA 1WJKA 4ZL9A 1CQGA 13GSA 3H4KA 1M2AA 2C0EA 4HZ2A 4IJ3A 1DUGA 4HQSA 3KM6A 1OVNA 2N5AA 2VM2A 4MPGA 4MABA 1ABAA 4BA7A 2ES7A 1GSEA 2AB6A 1FVKA 1YY7A 4TXOB 3HZ8A 2JL4A 2V6KA 1ILOA 3LSZA 3ERWA 3VWUA 2WRTA 5D9XA 4NWYA 5CYYA 2C4JA 2AAWA 4L0UA 3I9V2 4HEA2 3GL5A 1K0AA 4E8HA 2B1LA 3FR6A 1EOHA 2AV4A 2AHEA 5DJLA 2F8FA 2B5XA 2LS5A 2XBIA 3VFIA 2O8VB 1O8WA 4JEDA 5HFIA 2M46A 2KLXA 1FOVA 1SJ6A 5B8BA 4WETA 5HR3A 3FZ5A 1OC9B 1PX6A 3AY8A 2A2RA 5F0GA 1B9XC 2IFQA 1A8YA 2H19A 3N5OA 2DJJA 2B5EA 2HRNA 2LNSA 1W4VA 4RI7A 4ZBBA 2R6KA 5JCWA 2LRTA 4KSMA 1R7HA 2GZZA 3BJ5A 1GUMA 3KGKA 4NV2A 4YQVA 2N5FA 3GSSA 5CRDA 2WCIA 3FHKA 3D21A 14GSA 3FZ4A 1EEMA 5DALB 3L4NA 4MCUA 2MMZA 5F06A 1ZZYA 3LWAA 1Z6NA 4LLRA 4WXTA 3KH9A 1OC8A 4IBPA 2B3SA 4G2EA 4MDCA 2F9SA 1EV4A 4MZWA 6GSUA 3H1NA 1PSQA 4GSNA 3EU4A 1YQ1A 1KEBA 2VD1A 4KDUA 3UJ1A 1T1VA 1QXHA 2KP2A 2V1MA 1TRWA 5HFKA 1PN9A 2GSRA 4YQUA 3F0IA 3DD3A 1THXA 5E4WA 4PX1A 4G10A 9GSSA 2NDOA 2B1KA 1GTBA 4L0WA 1JZRA 1SKWB 4F9ZA 4K7NA 1G6WA 1T3BA 3D0ZA 1JLVA 2YP6A 2X99A 1HQOA 4KE3A 1ACVA 2VUPA 2R2JA 1EGOA 1YKCA 1GRXA 5ENUA 3C1SA 3LYKA 1GNEA 1SU9A 1DE1A 3U5RE 5H5SA 4GQCA 1Q4JA 1OE8A 3G9BA 4GF0A 1NHOA 3ZITA 1WP0A 4TR1A 7GSSA 2FY6A 3FYGA 3UBLA 4TR0A 5H5QA 4IVFA 5J4UA 1EZKA 5IPGA 1A23A 2EIOA 3D4TA 1V57A 3WT2A 2LJKA 5ECOB 4HU7A 1KBNA 3RPNA 5DBQA 2K8SA 3A2VA 1WPIA 3WGXA 1FAAA 3KP8A 2C3QA 1BAYA 2JSYA 1E6BA 2I81A 2I4AA 2B7JA 3HYPA 4ZILA 1EWXA 4I5QA 1B48A 1WRYA 4GSTA 3DMLA 2K6VA 3P8WA 4I2UA 4K7IA 2DBCA 1ZGNA 5HQPA 1HD2A 1QQ2A 2E7PA 1GTAA 3GKXA 4OWYA 1NHYA 3F3QA 2C0DA 1I9DA 2DIZA 1XW9A 4O92A 3K8NA 3ZYWA 1S3AA 2F3MA 4PGTA 2TRXA 3HXSA 4JR6A 4EO3A 3A3TA 4TOPA 1A2JA 4ECJA 4XRDA 2L4QA 4ZB8A 1Q98A 3NOFA 2WB9A 2C0GA 1ERTA 3TJGA 3M1GA 4J2FA 1GTUA 3UARA 3J7Yb 2PUKC 1EV9A 3GTUA 3QPMA 4KA0A 3LXZA 1T7PB 5DAKB 4RQRA 1N2AA 2VLUA 4XCSA 4MZCA 5HR1A 2GSTA 4HUAA 5ECLB 4ULXA 1XWCA 3G7IA 4DSSB 2P5RA 3ZL5A 2H6ZA 1GNWA 1U6TA 3TCOA 2PVQA 2DSAA 4QQ7A 3DRNA 3ZRDA 5D9VA 2DMLA 2N5BA 3A2XA 4I2TA 4PUFC 1A2LA 1SL2B 1MDJA 5DQYA 2NPBA 1RK4A 2OADA 1UA5A 2P0GA 6GSVA 1XOBA 3M8NA 2HZEA 4EE0A 5ABRA 3FK8A 2IN3A 2FHEA 3ED3A 4WBRD 5IPHA 1SL1B 4XS4A 5D9TA 1Z5YE 3QFAC 1SYRA 4MP4A 3M9JA 5DCGA 3GYKA 1SJIA 2IPAA 3V1WA 5GSSA 1KTEA 3TDGA 2KHPA 1PGTA 5DJMA 2VCXA 2IIYA 2NBSA 4IW9A 5FT3A 3ZFLA 3NIVA 3A5WA 2DJ3A 2E0QA 4J56E 2HSYA 5J9CA 4ML1A 4O7HA 5B8AA 2H6XA 5EVOA 3IHQA 2GT5A 4J57E 3ERGA 1A0FA 1NSWA 3HVXA 3W8SA 3GA4A 4RQXA 3EYTA 3ZMKA 1PQNA 3KJYA 3IE3A 5COHA 5LCZA 1XPVA 1DE2A 1THOA 3DEXA 2CA8A 4V2MA 5A4VA 1PD21 3TKSE 1FB0A 2H66A 2GQKA 4K7OA 2H74A 2EC4A 1XIYA 2CX4A 5JWOB 4PQIA 4HDEA 4PURA 5HFGA 1M2DA 1USBA 4WR5A 1K0MA 5ELAA 2HT9A 4IJIA 2J9HA 4YAPA 3F4SA 3FR9A 4L5LA 4YAVA 1K0CA 3IAM2 2HXKA 3WYWA 1YDKA 2WS2A 1U88A 4P3YB 4V1Ap 5AIVA 3GMFA 5CAXA 1MD4A 4KCAA 5H5RA 3APSA 1AQVA 3I43A 2RM5A 2HLSA 4MF6A 1MDIA 4IS0A 4BVXA 2BMXA 1KNGA 2RUFA 1G7OA 1SD8A 1NW2A 4IKHA 4K1FA 4MH2A 2H0HA 4MJEA 1YEXA 2ON5A 20GSA 3GH6A 1BG5A 5ELGA 1GLPA 1UN2A 3MAKA 4BVYA 4HI7A 3VPTA 1U87A 3F3RA 4Q5RA 4F03A 1WIKA 1PA3A 3SBCA 2R37A 4ZL7A 1N8JA 1GUKA 3HJOA 1SL0B 1FHEA 4D73A 1TOFA 2RM6A 1ERVA 3DIEA 5AISA 1PRXA 5E59A 3C8EA 4JE1A 5F07A 2OE3A 5GSTA 2YANA 1LJRA 4X1UA 3F4RA 3KMNA 3TJJA 1UVZA 2PGTA 3TJBA 5GAPD 3ERFA 4MPFA 3PGTA 1AW9A 4NHWA 1U3AA 1LU4A 1XW6A 2YOIA 3L9SA 5D96A 2PU9C 3VWVA 4ZB9A 4TRXA 3CTFA 2VOCA 5CRWA 1PKWA 2CT6A 1O85A 4V2NA 3GX8A 4OCEA 2KOKA 5JWQB 1E2YA 1HYUA 5F8BA 1QFNA 3HCZA 5ECKB 1ERWA 1XZOA 1TU8A 1ZCPA 3M3MA 4IP6A 4KNDA 2H30A 1GL8A 4TXVA 3UVHA 1R26A 2LUSA 3CXGA 2GDRA 2KUCA 2XPEA 4HS1A 3J7Yk 5AGYA 2OBIA 3ISOA 1XCCA 5F05A 2MMNA 1TW9A 1J0FA 5ID2B 4HQZA 4EUYA 4N10A 1XWAA 2MBTA 2R3XA 2C3TA 2H75A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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