3TKP | Genus

Total Genus 67

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	67
sequence length	197
structure length	197
Chain Sequence	HLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDKLN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Homo sapiens
publication title	Structural insights into the peroxidase activity and inactivation of human peroxiredoxin 4 pubmed doi rcsb
molecule keywords	Peroxiredoxin-4
total genus	67
structure length	197
sequence length	197
chains with identical sequence	B, C, D, E
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2011-08-28

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family
A	PF10417	1-cysPrx_C	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3tkpA00

3BD2A 2DBCA 4ZL8A 4TRXA 4MF5A 2VLTA 5EY6A 3F3QA 3ZYWA 2H1DA 2IMDA 2E2MA 3ZL5A 16GSA 4XS4B 3F9UA 3MWHA 5LCZA 2E7PA 3L78A 1ERTA 5C04A 1A8YA 4AJ6A 1T3BA 1VGLA 1TKDB 4YAVA 3QR6A 5JWQB 5KN0A 3U5RE 4IJ3A 2WGRA 5E59A 3LXZA 3TRQA 3DMLA 1A8LA 5G31A 3TGZA 5GAND 5J4UA 2HLSA 5IM9A 4HUAA 5J41A 4N30A 3QDNA 2EC4A 4NPBA 4YQVA 4ZILA 4KW6A 5HFKA 1Z6NA 5G5FA 1HD2A 1XW5A 5G5EA 1OVNA 1WMJA 2PN8A 2M72A 6GSWA 4CDOA 1FVKA 5IMZA 4ZBDA 4ZXGA 4IW9A 3PH9A 4WR5A 3C7MA 3ZFBA 4HZ2A 3PGTA 2WRTA 2FWHA 3IRAA 1PX7A 1QGVA 2MMAA 3W6GA 2A4VA 3GH9A 4RQRA 2FCHA 3F0IA 3GMFA 5ECSA 2WJUA 1SJ6A 3EMXA 3L0HA 2RLIA 1NW2A 4KX4A 2OBIA 3HZ8A 3HCZA 4IQAA 3QAWA 1S3DA 2QGVA 4PNGA 2IMEA 1QMVA 2I81A 4POMA 2X99A 1ZYQB 4MJBA 5CO3A 1K0MA 3C8EA 2L4QA 5GAPD 1R5PA 2I9HA 3TJJA 1EOHA 2H74A 4G19A 3BOAA 1X9MB 1C72A 3FZAA 3DVWA 3EC3A 1FW1A 1FG4A 4POLA 2NBSA 5AISA 4WBRD 2AV4A 2PERA 2VL3A 5ID2A 3ERWA 1ZYEA 2H72A 2JZSA 2GQKA 1OYJA 1SJIA 3U6VA 3CRTA 3LG6A 3ZIVA 4ML1A 4KAEA 5FT3A 2HI7A 3I69A 4MZBA 6GSUA 2IIYA 1M2BA 1YZXA 2MBSA 2MYGA 3UBKA 4MJAA 4F0CA 1TK8B 2JU5A 3GYKA 6GSTA 1H75A 1OC9B 4ID0A 2YNXA 4K0GA 3GIXA 3QFBC 3LORA 4J56E 3CSHA 3RBTA 1G0TA 1DE2A 2LJRA 3FEUA 1SYXA 3EE2A 1WPIA 3IAM2 4PUFC 4YQMA 1PD21 1U88A 4EVMA 3TRXA 2FHEA 2LJKA 4JR4A 2VO4A 3HVSA 3L4NA 1Y25A 2IMKA 3DRNA 1XPVA 2GQLA 3A3TA 2JADA 1RK4A 1MDIA 1EGOA 2P5RA 2CVDA 1U6TA 3CXGA 10GSA 1Q4JA 2QC7A 4RI7A 4XCSA 2VD0A 4IN0A 3GRXA 3FZ5A 4MH3A 4NHZA 2HT9A 5ECIB 3TKSE 4FYBA 2GLRA 3D4TA 3PINA 1SKWB 4KCAA 1MD3A 4L8EA 5ABRA 6GSYA 4TR1A 5J9CA 1Z9HA 2H6YA 3HKRA 3TOTA 4EDZA 4X43A 1ZCPA 3D21A 3FZ4A 1MTCA 1XBSA 4GSNA 4IQ1A 1AXDA 4TKYA 4JZQA 3CBUA 3IAS2 3KJYA 4MLYA 3APQA 1GRXA 5DDLA 1A0FA 2LSTA 1U3AA 4N0ZA 4MJCA 4K8MA 3JCML 1U3IA 4RQXA 4GF0A 3KTLA 3F3RA 2LV3A 2M80A 3UVTA 3C71A 1O6JA 2HFDA 3LFLA 1K0AA 2JACA 3WGXA 4LMWA 1VRSD 4KDYA 4MMMA 3KTBA 2H8LA 1N2AA 1TU7A 2DLXA 2B1KA 2OBKA 3W8SA 3ZLPA 1GSDA 3HXSA 3Q19A 2C3TA 3DXBA 3ED3A 5CRDA 2K6VA 4MCUA 1PKWA 2J9HA 4KSMA 2IPAA 4AF2A 3G9BA 4BPYA 1BQ7A 2PPTA 2JSZA 5EVOA 3LYKA 2GZPA 2MZCA 1FB6A 3TKQA 3FK8A 1K0NA 2IMFA 4P3YB 2LJAA 1CQGA 1HYUA 2HZEB 1TI3A 4OD7A 2DJ1A 5ECHB 2VL2C 1AQXA 4ZBAA 5J5NA 1XWKA 2GQMA 2VCQA 4PUAA 1NSWA 3DYRA 5DCGA 1PL2A 1YQ1A 2HZEA 3EYTA 2EIRA 1GH2A 1OE7A 4HQSA 3RAZA 5IMFA 3UIWA 2H6ZA 1CQHA 1TDIA 1XIYA 4XS6A 3EURA 4IJIA 3KXOA 3IE3A 5F05A 2LRNA 5B6MA 3FW2A 4HJ2A 2XHFA 3LJRA 1HNAA 4L5LA 4XRAA 2H1BA 2L5OA 2DJ3A 4HDEA 2VCXA 2YWNA 1T7PB 2YZHA 2A2RA 4EE0A 2F8AA 3D0ZA 3BBYA 4BA7A 1DBYA 5IMCA 2B1LA 3ZMKA 2OADA 5ELGA 5J9BA 3DD3A 5L71A 1J9BA 1EV4A 2ON5A 4J2FA 3KP8A 1LBKA 3KIJA 3GX8A 3CSIA 2N5AA 4GWRA 3UMAA 4EF0A 3D6IA 4CW9A 5ENUA 3EVIA 3P8WA 2VLVA 5CRWA 1PA3A 3VWWA 3I9V2 1A2MA 5FWGA 3BCIA 5AIVA 2ALBA 3M3MA 2PU9C 5G1LA 11GSA 3H93A 1BX9A 2H30A 1PGTA 3VI7A 1PMTA 3F4RA 1BAYA 2XC2A 3LWAA 4F9ZA 1WOUA 1XOBA 4ILFA 4ECBA 4IP6A 4N11A 1IYHA 5JCUA 2R5GA 3KMNA 1V58A 3KP9A 4KE3A 3KZQA 4MK3A 2DSAA 1M2AA 1JLWA 4GSSA 1JZRA 1GSQA 1EEJA 2B5YA 2H01A 5IIZA 5IPHA 4QL7A 4G9HA 4PNFA 5B8AA 1PRXA 4LL4B 5KEJA 1I5GA 2JL4A 1EP7A 1T4ZA 4L5OA 1LJRA 3UEMA 5HQPA 3E9JB 5B8BA 1J08A 3TKSC 4YQUA 4HS1A 4GTUA 4EL1A 5D8IA 3GSTA 1K0BA 1Z7RA 1QQ2A 3UAPA 1F37A 3D5JA 3BJ5A 1SD8A 3RHCA 1XWCA 2XPEA 2AYTA 1G7EA 3R2QA 2RM5A 3IV4A 5D73A 1ERUA 4FH8A 2H71A 5IQYA 5J3RA 2A2SA 2PBJA 1PL1A 5A4WA 4I8BA 4KDUA 1T8EB 1OKTA 1X5CA 1ERVA 1MEKA 4OCEA 2X8CA 2FD3A 5D9WA 3QFAC 2ZCTA 2B3SA 1YKCA 2PVOC 1YEPA 1WE0A 2LS5A 1EWXA 4XS4A 2GDRA 2YOIA 3IA1A 1GTUA 1FVJA 2WS2A 4GRFA 5CREA 4HZ4A 1K0OA 3IDVA 2E0QA 3UVHA 1OKDA 4IKHA 4PQIA 4XS1A 4MF6A 4JRRA 4OMVA 3GL5A 5CRGA 12GSA 1XVWA 3UJ1A 1THXA 2QKEA 5F8BA 4DSQA 2V6OA 1FOVA 3CSJA 1GLPA 2TIRA 4TXOB 2DJ2A 3TJBA 3TJGA 4WXTA 1PKZA 2P5QA 2AB6A 4TXOA 4E8EA 2GT5A 4IP1A 4F2IA 3QOUA 2WCIA 5DJLA 1Z3EA 1DE1A 1I9DA 2AAWA 4BVYA 1GP1A 1O73A 2OKAA 1XW9A 4D73B 5IO2A 5ECMB 1O85A 3N9JA 3DGQA 1XWBA 3MAKA 1K3OA 2BTOT 4F03A 2HE3A 1FAAA 4KNDA 1SK1A 4PQHA 2FY6A 2GS3A 1OC3A 3F4SA 3ZTLA 1ON4A 4YH2A 2OE1A 5D9VA 4OWYA 4TOPA 3KH9A 1TK0B 4GLTA 3A2WA 4DSRA 1B48A 2FUG2 5A5KA 4G10A 4HU7A 3ZVJD 2YV7A 3VPTA 3GUSA 5HFGA 4Q5QA 3FY7A 5HFIA 2K18A 4NHWA 1M99A 1GTBA 1YY7A 4EUYA 2C8UA 4NWYA 1S3CA 4Q5FA 5ECKB 2GZYA 2YCDA 3TJFA 5HR0A 1H4OA 1GUHA 2CAIA 1LU4A 3F4TA 5F07A 1K3LA 2GSTA 5DQSA 2HNLA 2I1UA 1O8WA 2IFQB 3WT2A 2AHEA 1ZL9A 3ZREA 2FWFA 1GL8A 4FO5A 4JR6A 3G7YA 1OC9A 2FA4A 3FR9A 2O87A 4MPGA 5FHIA 1X5DA 3L9SA 2H0GA 4ZB9A 4TR4A 4NAXA 3Q18A 2GSSA 3GTUB 2VCVA 1E6BA 5GSTA 1YJ6A 1A24A 1XWGA 2AJQB 5CRHA 3GTUA 3MDKA 3WGEA 5IMVA 8GSSA 1USBA 5H5SA 4KH7A 4EDYA 2FNOA 1M7TA 4J57E 3VURA 3GKKA 4O92A 4NXIA 2H76A 4EXJA 3EU3A 4ZB8A 1X5EA 4OO4A 3AY8A 3F6DA 1GNWA 3KEBA 1B4PA 4F0BA 2F51A 1SU9A 4H86A 2TRCP 3W8JA 2H75A 3KM6A 3M9KA 3E3EA 3GSSA 1QK8A 1G6WA 4FYCA 1Y6EA 4HJMA 1F2EA 5G2ZA 2OA7A 3L9VA 3GNJA 3F6FA 1AAZA 2VCTA 2CZ3A 1XXUA 1SD9A 2V1MA 2H0IA 1GSYA 2KHPA 1JZOA 4K2DA 1ACVA 4HQZA 2DIYA 3LEFA 1J0FA 2AUVA 3VWUA 3QCPA 2GTUA 4IELA 2R2JA 2DJKA 4HU9A 5AGYA 18GSA 1FB0A 3ZZXA 5G1KA 13GSA 3GH6A 3FHKA 1KNGA 3H8QA 4WF4A 3US3A 4WETA 4PXOA 1HNBA 3ZRDA 2KP2A 3GFKA 2LUSA 3HZ4A 2C3NA 2H1AA 1GTAA 5AIXA 2DJJA 1GTIA 3IOSA 2WULA 2IL3A 2O89A 3HA9A 1SKSB 3WD6A 2OE0A 3LSZA 4EKZA 5DALB 3P90A 3GKMA 1B9YC 1BG5A 3L9UA 3ERFA 1AC1A 4KDXA 2LNSA 3ME8A 5DCHA 5KN1A 1EV9A 1AIUA 4MZCA 4MP4A 2L57A 4KCEA 1PSQA 1R4WA 2YPMA 3CTFA 2NPBA 1XWAA 4KA0A 1G7OA 3M8NA 2C4JA 3FR6A 2V32A 6GSSA 2KLXA 1V57A 1TU8A 1NHOA 2IMIA 3RPNA 4N0VA 3UARA 1EZKA 1GSSA 1R26A 5DAKB 1U87A 3MNGA 3DWVA 3Q6OA 1A0RP 1ST9A 5HR1A 5DAKA 1XW6A 1URMA 1V40A 1WRYA 3C1RA 1M9AA 22GSA 1B8XA 5LD0A 3MSZA 3TKRA 4X0XA 5C00A 5ECRB 4WEYA 1ZZYA 5ELAA 2HSYA 3H1NA 4PQ1A 3WYWA 3G7IA 2KUCA 3UOMA 2XBQA 2H1GA 2R37A 5COHA 4EO3A 4WKWA 1MDKA 2N5FA 4MA9A 3TB2A 3IC4A 2LRCA 1QFNA 2V6KA 3HDCA 1ABAA 3D22A 1GULA 2YZUA 2HSHA 2CV4A 4JE1A 4BL7A 2DMMA 4NV2A 5CAXA 1XFLA 1DUGA 5INYA 2O7KA 4K1FA 2YANA 3EWLA 5E4WA 4XTSA 1KEBA 1B4QA 2PMTA 1ZGNA 2L6DA 3VPQA 2JZRA 1OE8A 3GX0A 1THOA 2K8VA 4XRDA 3LQ7A 3KCMA 2E2GA 4QL9A 4PX1A 3O6TA 2DJ0A 4MABA 4CHSA 1JHBA 2GT6A 5IOWA 1M2DA 4KUNA 2QSIA 19GSA 3IPZA 3EU4A 1HQOA 1YEXA 3F8UA 3O3TA 2OE3A 2WB9A 4L0WA 4K7OA 1R5AA 4V1Ag 3ISOA 4I2TA 4AJ7A 2B6MA 3IK9A 5DBQA 3GN3A 3Q74A 4HOJA 2J23A 1OC8A 2EIQA 1Z5YE 4DVCA 5JCWA 2LTKA 2F3MA 1MDJA 1GUKA 1GSEA 1MD4A 1A2LA 3C1SA 2YJ7A 5A4VA 3LYPA 1JZDA 5IMDA 2MMOA 2L6CA 2ES7A 5ECPB 1UN2A 1RW1A 4NMUA 1F3BA 2RIIA 1BYEA 2B5XA 1V98A 2ZNMA 2YJHA 1VF2A 2Z9SA 1SK2A 2PGTA 1BJXA 2CZ2A 2MMNA 2CX3A 4V2NA 2C0FA 4MF7A 3DVXA 2TRXA 2GZZA 1ILOA 2V41A 5DJMA 1SL1B 1SENA 3TKSA 3H79A 3K8NA 4MZWA 2X8GA 1GNEA 1JZWA 3APOA 3QMXA 4XIHA 3ZIJA 5DVBA 4OFNA 2C0GA 3TOUA 3G7JA 3PR8A 5JCGA 2V2GA 4I5QA 3IBHA 3UL3A 1G6YA 2HZFA 4GCIA 3GHAA 1Z7PA 2F8FA 2BJXA 3TKPA 4ZBBA 5D9TA 2H70A 3KGKA 4D73A 1XCCA 3HY2A 3SBCA 4HEA2 3ZMLA 4ISDA 4JBBA 1X9WB 2ON7A 5KN2A 3DKSA 3GL3A 3IR4A 2CVBA 4V2MA 2PUKC 2C80A 1O81A 1SK0A 2FGXA 4LMVA 1FO5A 3UBLA 4TR0A 2RUFA 1AUCA 3APSA 1PX6A 3HJPA 1VF1A 4XHMA 1UC7A 1Z6MA 2RM6A 3HJMA 2EIOA 1TRVA 2VIMA 4ECCA 2NVLA 3CYNA 4ACSA 1ZOFA 2PWJA 1WJKA 4PURA 1AQWA 4Q5RA 3WT1A 3IK7A 2H0HA 2HXKA 3ZITA 3S9FA 4POBA 2LQOA 1RQMA 3ZFLA 4V1Ap 5LNKe 1HNCA 1GSFA 1W4VA 1TTZA 1OAZA 1DSBA 1SJZA 3OR5A 2XBIA 3P2AA 4JU5A 1TRWA 4FYUA 2OJLA 1IYIA 3VWXA 2BMXA 4KB3A 2JSYA 4K7NA 2MBTA 5CYYA 1FHEA 5ID2B 4OCFA 2CVKA 4PGTA 3ERGA 4JEDA 3J7Yb 5EPFA 3O76A 4DEJA 14GSA 4IGJA 4ZL7A 2JZTA 2O8VB 4MH2A 2L4CA 2VL9A 1A23A 1K3YA 3I43A 4I97A 2RUEA 3LXTA 5CNWA 2WFCA 2B7KA 2I4AA 1YF0A 3RDWA 4TXVA 2FA8A 5ECQB 1XZOA 2IFQA 3A5WA 3FZ9A 4GQCA 1SKRB 4I2UA 3VK9A 3KH7A 3V1WA 4IBPA 1JLVA 2KP1A 2OACA 2CX4A 1F9MA 20GSA 1SYRA 4K0NA 4EC0A 2VAFA 4WR4A 3D4MA 3M0FA 1PQNA 2MMZA 3IHQA 1GUMA 2I3YA 2GVPA 4Z7XA 2C0DA 2R6KA 1VF4A 3I6AA 2HRFA 2D2ZA 3TRPA 3HVVA 4TR3A 1SL0B 4ZIJA 2G0FA 4MPFA 2R4VA 2DIZA 3P7XA 4BWQA 2G2QA 4K6XA 3TDGA 1VF3A 3GV1A 3VWVA 4O5RA 4I6XA 1B9XC 1GSUA 3QAVA 2F9SA 4TR1B 5HR3A 1TP9A 3M9JA 4ZL9A 3M1GA 4E8HA 1KTEA 4N10A 1E2YA 2LQQA 4MJEA 1EEMA 3CTGA 5B7CA 2IN3A 3FRCA 3TUEA 2H6XA 4BWSA 2VCZA 5GSSA 1F3AA 3ME7A 2FLSA 4TW5A 4IHUA 4ECIA 5H5RA 3NIVA 2YN1A 3TCOA 2VUPA 2C0EA 3QAGA 1T1VA 5G30A 1XOAA 2YWMA 2H73A 2LEGA 2B5EA 3VFIA 1M0UA 2VM2A 4LLRA 4O32A 6GSVA 2ZUPA 1V9WA 3LGCA 3DIEA 3QPMA 2HYXA 2H66A 2K9FA 1YF1A 5ECOB 3GA4A 2VOCA 3BCKA 5JWOB 3SWLA 2FWGA 4ULXA 1X9SB 1V2AA 4TN8A 2YWOA 1R7HA 4NV5A 5D96A 5D93A 1NHYA 4ML6A 3IXRA 3HHVA 2CAQA 3ZVJA 3A2VA 3KD0A 3VLNA 1XVQA 3A2XA 3HJOA 1M9BA 5DQYA 1JFUA 1TK5B 1EP8A 2VCWA 2X64A 1AQVA 4MDCA 1UVZA 6GSXA 4RUVA 1X0RA 5B6NA 2NTOA 4OFTA 3VI5A 4GSTA 1BEDA 4OFMA 3N5OA 4ZB6A 3DEXA 2VLUA 5IOXA 1YDKA 1TXXA 1T4YA 4TVEA 1O8XA 1QUWA 5EL8A 1UA5A 5IO0A 4LA1A 5DALA 2WDUA 1TRUA 4HI7A 3RHBA 4GQFA 4QQ7A 2DMLA 1N8JA 2KOKA 5F0GA 1WIKA 4V2LA 3KMOA 2REMA 3F63A 2LNTA 1F6MC 3C73A 5IMAA 2L59A 1O7UA 1TW9A 4BVXA 2VD1A 3CMIA 2CQ9A 2CT6A 1WWJA 3EMPA 3QD9A 2N5BA 4G2EA 3RPPA 17GSA 3CRUA 2GGTA 1PN9A 4L0UA 1EOGA 1TRSA 5GZZB 5ECNB 4K9ZA 4POKA 1EGRA 1ML6A 4Q5NA 3HYPA 3NOFA 3GURA 2LRTA 1TI1A 5H5QA 4AGSA 3EINA 3FYGA 5IPGA 2M46A 1A2JA 1W89A 2VL2A 2DC5A 3J7Yk 1YKAA 2K8SA 3TJKA 2R3XA 4YAPA 2GSRA 2YP6A 3FKFA 9GSSA 2L5LA 1ZMAA 2O85A 4O7HA 2GSQA 4DSSB 5F06A 2X8HA 5AN1A 4LL1B 2H19A 2C1YA 2YWIA 3WGDA 2HRNA 1KBNA 1T00A 2C3QA 1GLQA 4DSSA 4IS0A 2P31A 2LKUA 3H4KA 4WF5A 3E0UA 2VM1A 4RI6A 1AW9A 2B7JA 2PVQA 3NZNA 1WP0A 5JWRB 4OO5A 2FWEA 7GSSA 3GKXA 1NM3A 4GXZA 5CP1A 2IWTA 2IJYA 2YV9A 1S3AA 1TOFA 5HR2A 1SL2B 5KN3A 1GWCA 4K7IA 4IVFA 1QXHA 5ECLB 1Q98A 4X1UA 4KSOA 1ERWA 2CA8A 3GKNA 3HD5A 3FR3A 4AJ8A 3HVXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3TKPA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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