3TKP | Genus

Total Genus 67

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	67
sequence length	197
structure length	197
Chain Sequence	HLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDKLN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	Peroxiredoxin-4
publication title	Structural insights into the peroxidase activity and inactivation of human peroxiredoxin 4 pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
molecule tags	Oxidoreductase
total genus	67
structure length	197
sequence length	197
chains with identical sequence	B, C, D, E
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2011-08-28

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family
A	PF10417	1-cysPrx_C	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3tkpA00

5E59A 1OC8A 1J9BA 5J9CA 1XZOA 3M8NA 4ULXA 3ZFLA 2WB9A 4PNFA 1EGRA 2VLVA 3HA9A 2HZEB 4IJ3A 2K8VA 2B1LA 4J56E 5EPFA 2WZ9A 2DJ0A 2DSAA 2WDUA 3LXTA 3QDNA 5CO3A 1G6YA 2FWFA 6GSXA 4XS4B 1TK0B 4V1Ag 5FHIA 5KN2A 3VLNA 4F03A 1UN2A 5KN3A 3FR9A 1PSQA 3APOA 4IQAA 2MYGA 4ZBAA 2PUKC 4J2FA 2JZTA 4Q5FA 1MD4A 2M72A 2OBKA 1FW1A 1KBNA 1TK5B 3HDCA 4KCEA 1YEXA 1TTZA 3QFAC 1BG5A 4MMMA 2QGVA 1GUKA 1BEDA 2IL3A 1RW1A 2D2ZA 5GSSA 2H71A 3UEMA 5EY6A 3QD9A 1H75A 2ALBA 3TOUA 2YCDA 3Q74A 4L0WA 5G2ZA 3IE3A 1QXHA 4MJBA 3QCPA 1FVJA 1OC3A 2GQLA 1NHYA 3CBUA 2HSHA 4O92A 4KW6A 4KB3A 4POLA 3ZIVA 2A2SA 4ML6A 3H4KA 5HFKA 4KNDA 1TRVA 4XRAA 3C1RA 1XWCA 1M7TA 5IIZA 3H79A 1M2BA 3UVTA 1GH2A 2LRCA 2DMMA 2IMIA 5ECMB 4OD7A 1X5CA 2AV4A 2E7PA 3DYRA 5DAKA 4JZQA 1QQ2A 2FCHA 3GFKA 2JACA 1K0OA 3LYKA 3F6DA 4LA1A 1THXA 4G10A 2EIOA 2GVPA 3KMOA 2H73A 5JCGA 5D96A 5HR1A 1XW9A 1A23A 2FWHA 1SL1B 3APQA 4RQXA 4TXOA 1GTUA 2E2MA 2PGTA 4I97A 3CSJA 1M2DA 3O3TA 4GSSA 5C00A 1V57A 2HSYA 4AJ8A 1GL8A 2IFQA 2WULA 2FWGA 5INYA 1W4VA 3KTBA 1SD9A 1R26A 3DGQA 4V2MA 3ERGA 1HD2A 2PWJA 3KIJA 3SBCA 1MDKA 4MH3A 3TCOA 5HQPA 3EINA 1WWJA 1SU9A 3KP9A 3QMXA 4YQUA 2O89A 2VO4A 1ZGNA 3D0ZA 4EXJA 1JLWA 4QL7A 5F07A 1K0AA 4ZIJA 4IP1A 1Z3EA 3UBLA 5ENUA 1PMTA 3GSTA 1ABAA 2VCTA 5DCGA 2IIYA 4MPFA 3EYTA 3RHCA 3KCMA 3IXRA 3BCKA 4CW9A 2H01A 1YF0A 4HZ2A 1TI1A 4X43A 3LG6A 1TRWA 1FB0A 2MBTA 3WT1A 2DIZA 2PMTA 1I5GA 1RK4A 3KH9A 1B4PA 4K7NA 1DE2A 2C0FA 2H1AA 2VM2A 1AUCA 1HQOA 4CDOA 3FZAA 5ECRB 1F37A 1U87A 1K0MA 3F3RA 3HKRA 1Z6MA 1AIUA 3ZYWA 1DSBA 1K3LA 1UA5A 3TUEA 3TKRA 4TRXA 2XPDA 3O6TA 3IPZA 1FG4A 3TKSE 2GSTA 5G5FA 2JSZA 2GSRA 3GRXA 2A4VA 3ZVJA 2LEGA 1O85A 3KXOA 2P0GA 1T00A 4EUYA 1YKAA 1GP1A 2BMXA 5HR2A 3DEXA 2VLTA 4CHSA 3ZRDA 4FIWA 3GNJA 1V9WA 3P2AA 1DE1A 3LYPA 4WKWA 1SYXA 4E8EA 2C3TA 4HZ4A 4EDZA 3F9UA 5CP1A 4ZBDA 1HNAA 1PL2A 4IGJA 3UVHA 2G0FA 3CXGA 1OAZA 2L57A 3FR3A 1PL1A 4N10A 1T3BA 4O7HA 1OKTA 2EC4A 5L71A 1O8XA 5IM9A 4MABA 2IJYA 3WYWA 2VLUA 2HXKA 1T4ZA 18GSA 3MWHA 2L6CA 3FY7A 4KUNA 1I9DA 5H5QA 3ZZXA 4RUVA 1FOVA 4BVXA 3F4SA 2ZCTA 5CRGA 4XS1A 4EO3A 2H66A 2OKAA 2GDRA 5LNKe 4K0GA 2DMLA 1SKWB 5AISA 3I43A 4K7OA 4MDCA 2DIYA 2R5GA 1ERWA 2F8FA 5A4UA 1VGLA 2X8CA 3HY2A 3N5OA 1EV4A 3KP8A 1LBKA 4I5QA 3QFBC 4D73B 5FT3A 3TJJA 1YKCA 1ZMAA 3F6FA 3GHAA 1WE0A 4MZBA 5G1KA 2VL3A 3KMNA 5ECPB 2H76A 4L0UA 3I69A 4IS0A 2P5RA 3ISOA 1XVQA 1TXXA 1Z5YE 3MSZA 1ZL9A 1G6WA 4IQ1A 2GTUA 4OFTA 2IMKA 3KD0A 1PX6A 2MMZA 3FZ9A 3M9JA 1KTEA 1USBA 3D4TA 5ELGA 3W6GA 5CYYA 4JEDA 2YWOA 3VWVA 1GLPA 1QFNA 4PXOA 4K6XA 1GTAA 5DJLA 4PURA 1V40A 2KP1A 4BA7A 1TKDB 3IDVA 3GKXA 3DKSA 4DVCA 3VWXA 1ZYEA 5ID2B 2L59A 1IYIA 4F0CA 1F2EA 2E0QA 3HXSA 1CQHA 3R2QA 3HVSA 1AQXA 1AC1A 3HZ4A 2PVOC 4TOPA 5JCWA 4ISDA 4L5OA 3BD2A 3F4TA 1NM3A 2YANA 5DALA 1GSDA 3A3TA 4GF0A 4F0BA 3MAKA 1XIYA 1SJ6A 1YQ1A 3KM6A 1GSUA 2XPEA 4GWRA 3S9FA 1EV9A 3CRTA 4GXZA 2LV3A 4K9ZA 3CSHA 3TKPA 1X5EA 1GSFA 1K3OA 3RAZA 1U6TA 2F3MA 2YWNA 3CMIA 3L9UA 4KDYA 4N0VA 3TGZA 1ZYQB 1SK0A 4NAXA 1K0BA 4DSSB 4RQRA 5LCZA 3QPMA 4YAPA 1F9MA 2LTKA 4OCFA 2DJKA 2KOKA 20GSA 5CAXA 4WETA 5COHA 1K0DA 1NHOA 2KLXA 2H74A 1VF3A 1S3CA 1XCCA 1Y6EA 3FW2A 1FAAA 1R4WA 3HHVA 3WT2A 1A2MA 1BQ7A 2FA8A 1BYEA 2J9HA 3TJKA 5A5KA 3IBHA 2FA4A 2HYXA 3ZIJA 2ES7A 2HRFA 3QAGA 3GKKA 3C7MA 4ZB9A 3IA1A 5J5NA 4HU7A 2B6MA 1N8JA 3RPPA 4RI6A 1XW5A 2QC7A 2PVQA 3C73A 3VI5A 2V2GA 3QAVA 5EVOA 1W89A 2JADA 3A5WA 3L4NA 5J4UA 3TDGA 3IHQA 1EWXA 1GWCA 5DCHA 3FYGA 4NV2A 1GNWA 4XS6A 3UIWA 2RM6A 1QUWA 1SENA 5J41A 4MP4A 3H8QA 1X0RA 2CAIA 2R2JA 4EVMA 1HNCA 2LSTA 1U3IA 3HVVA 2IN3A 4FO5A 4ZL9A 4Q5RA 3TRPA 3F3QA 4OFMA 1JFUA 4XIHA 2VD0A 1V2AA 5GAND 2H1BA 5ECSA 5JWRB 3HJMA 1WP0A 1VF4A 2H0IA 4FYBA 4AJ7A 5IOXA 4TXVA 2N5BA 5IMDA 2GT5A 2H1GA 5A4WA 2J23A 4P3YB 4OCEA 4WXTA 3DWVA 4JU5A 1BAYA 2H0GA 5AN1A 3EURA 1UVZA 2VL2C 4TKYA 2VL9A 1ZCPA 3A2XA 1PQNA 5HR0A 3GH9A 3IK9A 2CZ3A 1YJ6A 3DD3A 4IKHA 1ST9A 1A0RP 2C1YA 2PN8A 2ON5A 3IR4A 4MCUA 2FWEA 3UJ1A 2I3YA 3UAPA 1GSEA 4HUAA 2OE0A 4MF5A 1GSSA 5F05A 4ECBA 2NDOA 2NBSA 3A2WA 2HE3A 3IAM2 1ERTA 5DQYA 3EU3A 1WJKA 1TOFA 3FEUA 1SKRB 2QKEA 9GSSA 3D5JA 3HJPA 1XWBA 4HQZA 3IV4A 4V1Ap 2TRXA 1B4QA 5G30A 4QL9A 2O87A 3EMPA 3RBTA 3UBKA 3W8JA 1C72A 5B7CA 2CA8A 5H5SA 3EMXA 1TI3A 3ME8A 4MJAA 5ECLB 3KJYA 4EL1A 3PR8A 4OO5A 2TRCP 2I81A 1R5PA 1XWKA 3D6IA 1XOAA 3ME7A 2VAFA 3HVXA 2LJKA 1ML6A 1V98A 4IVFA 1WOUA 5HFIA 3L0HA 3U6VA 6GSUA 4OWYA 4X0XA 1GLQA 5FWGA 2K18A 5ID2A 2P5QA 2JSYA 2DJ3A 4PQIA 3CYNA 4TN8A 3LWAA 1B48A 2H6XA 1VF2A 1SL0B 3TJBA 3GTUA 3LJRA 4NV5A 4DSRA 3VPQA 2H72A 4AGSA 2YOIA 1TW9A 4FH8A 4JR6A 3KGKA 2OBIA 3GH6A 2V6OA 1ON4A 1E6BA 1XPVA 2VCWA 2L5OA 1JHBA 1ZOFA 2RUFA 1H4OA 1XVWA 4ZL7A 4PUAA 4ZB8A 1R7HA 1A8LA 5ECNB 3U5RE 2VCQA 5IPGA 3HZ8A 2GZPA 1T1VA 2H30A 4KA0A 2CAQA 5HFGA 4NHWA 4TR4A 2LJRA 3GL3A 2GZYA 2YZHA 3H1NA 3WD6A 4LL4B 3HJOA 2LRTA 5A4VA 3ZMKA 4DSQA 8GSSA 4KAEA 2R6KA 2JZSA 5CRDA 2MBSA 4MA9A 2MMNA 4X1UA 2YNXA 1AW9A 2DJ1A 3PGTA 2HI7A 4LL1B 1F3AA 1TU7A 5IOWA 3OR5A 4KE3A 3TKSC 1IYHA 1G7OA 2B5YA 4HI7A 2H0HA 1T7PB 1VRSD 3GMFA 3GV1A 2VL2A 1ERUA 4EC0A 5DAKB 2IWTA 4PQHA 2HZEA 4KH7A 2A2RA 4J57E 2H1DA 2IMFA 3NIVA 3VK9A 4XS4A 4V2LA 5IMCA 1OKDA 1U88A 4YQVA 2R3XA 2AUVA 2QSIA 3BJ5A 1ZZYA 5F8BA 3A2VA 3LEFA 4K7IA 3ZMLA 2GT6A 1FO5A 3IOSA 1TDIA 1AXDA 2GS3A 3E9JB 11GSA 1UC7A 1JZOA 1M2AA 1OE7A 2V41A 2NVLA 1SJIA 4YH2A 2BJXA 4LLRA 2VCZA 5GZZB 2H6ZA 4FYUA 3G7JA 4NXIA 3E3EA 2VM1A 5EL8A 1T4YA 4YQMA 2AYTA 1SL2B 2AHEA 1F3BA 4ECCA 4WF5A 1PA3A 3LQ7A 3GSSA 2PU9C 3WGEA 3US3A 4I2UA 2GLRA 4OMVA 4HEA2 4JBBA 2K6VA 2IMDA 2PERA 4Q5QA 2V32A 3V1WA 1A2JA 1EEJA 1Q98A 2YWMA 2HNLA 4HJ2A 3BBYA 4HS1A 3GX8A 1TJDA 3Q19A 1QK8A 2OE1A 2LQOA 4BVYA 4XCSA 3IRAA 2YJ7A 1PN9A 3J7Yb 1O81A 5D9XA 5B8AA 1LJRA 2E2GA 4Z7XA 3VWUA 3AY8A 4EDYA 1Z7PA 1R5AA 2CVBA 2XBQA 3J7Yk 2B7KA 2RIIA 2LJAA 3Q6OA 1DBYA 3L9SA 2MZCA 5ECIB 2HZFA 4ACSA 2LRNA 1NSWA 3F0IA 3PH9A 1URMA 4Q5NA 5IQYA 2WS2A 1JZDA 5KN1A 2K9FA 4TR3A 5GSTA 1WIKA 4XRDA 4MZCA 4IJIA 2YWIA 1O73A 1OC9B 2DLXA 3D22A 2OADA 5JWQB 2HT9A 4EE0A 5CREA 1RQMA 5IPHA 4PNGA 4TR1B 1XW6A 2GQKA 2C0EA 4WBJA 4OO4A 4IW9A 4MZWA 3VURA 3QAWA 4N0ZA 1BX9A 3G7YA 4K1FA 4NWYA 2LKUA 3P90A 1MTCA 2OA7A 5ECOB 5D9TA 1YEPA 4GQCA 1YF1A 4ILFA 1PX7A 2JZRA 3TRQA 3EE2A 2LUSA 1G0TA 4KDUA 4RI7A 3TKSA 2LNSA 4KSOA 2YN1A 2H19A 4G9HA 2WFCA 2GSSA 2DC5A 1EZKA 3GN3A 4POMA 1GSQA 4KX4A 3ZVJD 1WMJA 2HLSA 2FGXA 3IK7A 2MMAA 5KN0A 1SJZA 1A0FA 3Q18A 1FB6A 2I4AA 3KTLA 4PX1A 3TOTA 4F9ZA 1TRSA 2CT6A 1KNGA 3FR6A 3C1SA 2FNOA 5D9WA 3TB2A 2OE3A 5IMZA 2CX3A 4LMWA 5H5RA 3ED3A 5JWOB 4GCIA 3RHBA 3MNGA 3JCML 3WGDA 5G31A 3VFIA 5CRHA 3HCZA 4H86A 3W8SA 4MLYA 2WCIA 3DVXA 1PRXA 1FHEA 3EC3A 1KEBA 3IAS2 4IHUA 4BWSA 3F8UA 2X8GA 4GSTA 5CRWA 4GLTA 1MDIA 1PKZA 3NZNA 4HOJA 3KH7A 5E4WA 2V1MA 2OACA 2H75A 2ZNMA 1EP7A 4ZL8A 1GRXA 2IPAA 1B8XA 5IMFA 3EWLA 4IP6A 4BWQA 4ECJA 3LSZA 2M46A 3VPTA 12GSA 2LS5A 5IMAA 3HYPA 5J9BA 1U3AA 6GSTA 2RUEA 1AQVA 4KDXA 4WR5A 3BCIA 1JLVA 2L5LA 1Z9HA 3FK8A 3DXBA 3P8WA 3LGCA 5ABRA 5G5EA 4GTUA 2RM5A 2C0GA 3F4RA 1J0FA 1TP9A 3FZ5A 5DJMA 2REMA 5B6MA 4N30A 2DJ2A 2L4QA 3QR6A 2YPMA 1O8WA 2KUCA 1THOA 3KEBA 2TIRA 4MK3A 2HRNA 4PQ1A 1GTIA 5JCUA 6GSWA 4JE1A 2N5AA 3MDKA 3ZTLA 3DVWA 1Q4JA 1F6MC 4DEJA 5LD0A 3GKNA 5DALB 2C3NA 4D73A 3APSA 2X99A 2EIRA 4GRFA 2WJUA 2HFDA 6GSVA 1QMVA 2C8UA 4O32A 5D9VA 2YV7A 4I2TA 4YAVA 1GUHA 3BOAA 1YZXA 3C71A 1N2AA 2AJQB 4KCAA 3TJGA 2IMEA 2XC2A 5IMVA 3TJFA 16GSA 5D8IA 2B1KA 3VI7A 3HD5A 2C0DA 2F8AA 1DUGA 3LFLA 3H93A 4WEYA 1S3DA 3UOMA 2GGTA 3UMAA 1S3AA 1PGTA 1OVNA 4XHMA 3GUSA 5CNWA 1MEKA 2GZZA 2VD1A 1PD21 1T8EB 1GNEA 2B5EA 3VWWA 2R37A 1ACVA 3L9VA 2X64A 4F82A 3ZFBA 1GUMA 7GSSA 1GSYA 14GSA 5HR3A 3N9JA 5DBQA 2RLIA 3GA4A 2N5FA 4NPBA 5F06A 2JL4A 4NMUA 2WGRA 2LNTA 5B6NA 4TVEA 5DQSA 4N11A 1Y25A 3P7XA 1OE8A 1AQWA 2JU5A 1JZRA 1V58A 1TRUA 1BJXA 2X8HA 4WF4A 3K8NA 3D21A 2VUPA 2B7JA 4I8BA 1X5DA 4JR4A 1M9BA 2DJJA 2LQQA 1Z7RA 1LU4A 4ML1A 4G19A 2G2QA 4EF0A 3KZQA 1A24A 2FHEA 1ERVA 3RDWA 3ZLPA 4WR4A 1A2LA 2P31A 4GQFA 4JRRA 4ZILA 3CTGA 5F0GA 2KHPA 4MH2A 2H6YA 2I9HA 3E0UA 2C4JA 4ZXGA 4BL7A 2O7KA 3DRNA 2ON7A 2OJLA 4IELA 2PBJA 1O6JA 4MPGA 1M0UA 4POBA 1OC9A 1A8YA 2V6KA 3UL3A 2MMOA 1TU8A 4QQ7A 5ECQB 2NPBA 5G1LA 1MDJA 5IO2A 1JZWA 4TR1A 1B9YC 4KSMA 1ILOA 17GSA 4DSSA 1XWGA 3M3MA 4HDEA 4ZB6A 1HNBA 3DIEA 2F9SA 1X9WB 2VCXA 2B3SA 2L4CA 5AIVA 3FZ4A 4WBRD 3F63A 4L8EA 2YJHA 1K0CA 2BTOT 1SK1A 5KEJA 3C8EA 2R4VA 3WGXA 4MF6A 3GL5A 4EKZA 4HU9A 4ID0A 5D73A 1EOHA 4FYCA 4PGTA 2CZ2A 4OFNA 5ECKB 2CVDA 13GSA 1NW2A 2H8LA 3D4MA 3G9BA 4KGIA 4AJ6A 1CQGA 3GX0A 3GKMA 5AGYA 1XBSA 1EP8A 3QOUA 22GSA 4NHZA 2CV4A 2K8SA 1OYJA 1GULA 1AAZA 4GSNA 1XOBA 2C3QA 4TXOB 3CSIA 1SD8A 2FLSA 3ZL5A 4PUFC 2YV9A 2FY6A 3M9KA 4XTSA 6GSSA 3FRCA 5J3RA 4L5LA 5IO0A 1EOGA 3NOFA 4I6XA 2IFQB 2GQMA 1G7EA 2CQ9A 3I6AA 4TW5A 1XFLA 1YY7A 1FVKA 3TRXA 1WRYA 1M9AA 2FD3A 5C04A 1X9SB 5DDLA 3M0FA 6GSYA 2PPTA 4E8HA 2CX4A 2VIMA 2F51A 19GSA 4IN0A 2H70A 1Z6NA 3CTFA 2WRTA 3DMLA 2M80A 1K0NA 4F2IA 3M1GA 3PINA 1GTBA 5ECHB 1EGOA 4K2DA 4HQSA 2AB6A 3I9V2 1SKSB 3ERFA 5B8BA 4TR0A 1WPIA 3L78A 1XWAA 2O85A 5ELAA 4K0NA 3TKQA 2L6DA 4AF2A 2GSQA 2NTOA 5DVBA 4HJMA 1B9XC 3EU4A 3O76A 1SK2A 3LORA 4LMVA 2CVKA 3G7IA 1YDKA 3GTUB 2YP6A 2C80A 3ZITA 2YZUA 1K3YA 2KP2A 2ZUPA 4G2EA 3ZREA 3FKFA 4K8MA 1J08A 1PKWA 1SYRA 2DBCA 1TK8B 2EIQA 1QGVA 3IC4A 3LXZA 2XBIA 2O8VB 3EVIA 4V2NA 2FUG2 1O7UA 3CRUA 5GAPD 3SWLA 4ZBBA 2VCVA 4POKA 3GYKA 3GURA 2AAWA 4MJCA 4IBPA 1X9MB 2B5XA 2Z9SA 1XXUA 1VF1A 2XHFA 3UARA 3ERWA 4O5RA 4ECIA 2VOCA 5D93A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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3TKPA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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