1XFLA

Solution structure of thioredoxin h1 from arabidopsis thaliana
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
MASEEGQVIACHTVETWNEQLQKANESKTLVVVDFTASWCGPCRFIAPFFADLAKKLPNVLFLKVDTDELKSVASDWAIQAMPTFMFLKEGKILDKVVGAKKDELQSTIAKHLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure of thioredoxin h1 from Arabidopsis thaliana.
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Arabidopsis thaliana
molecule keywords Thioredoxin h1
total genus 36
structure length 114
sequence length 114
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xflA00
3FK8A 5HQPA 2TIRA 2YWIA 2PVQA 1W4VA 5G5EA 3M9JA 5ECMB 5ECLB 1PKZA 3F4SA 3VFIA 4L5OA 4ZL9A 3GA4A 2JSYA 3KJYA 1SKRB 3KH9A 5E59A 1JLVA 5KN3A 2C1YA 2IMEA 2YZHA 4J57E 2L6DA 2XHFA 3QR6A 1G6YA 2NTOA 1SL2B 3UAPA 1X9MB 4D73B 4HI7A 3FR9A 2XC2A 1AIUA 5ABRA 1XOBA 3WGEA 2CVKA 1GSUA 5IOXA 1AXDA 1GSDA 1TOFA 3GX8A 2FWFA 4N30A 1BX9A 5F8BA 2O85A 4MMMA 1FG4A 2OE3A 1XW9A 1PMTA 4LA1A 2CX4A 2IPAA 4MCUA 5ECIB 3GTUB 4ML6A 1PN9A 4PX1A 2HYXA 5F06A 2H1BA 2ZCTA 1UVZA 1SL1B 3ZFBA 2CQ9A 2PGTA 2VO4A 1N2AA 4JE1A 4ZXGA 2AV4A 1N8JA 3D4TA 3G9BA 3I9V2 3M0FA 2GSQA 2WZ9A 5FWGA 3HJPA 4OCFA 4GQFA 4N11A 3L78A 2PMTA 1WOUA 2YPMA 2HZFA 1I5GA 2R4VA 1O81A 4GSTA 2K18A 3GUSA 3WT2A 1YF0A 1ZCPA 3U6VA 3SBCA 2HRNA 5IMCA 1TU7A 4WBRD 1M9BA 1YKAA 4ZBBA 1OYJA 3L0HA 2M46A 1ZOFA 1G7OA 2K9FA 3O76A 5J3RA 4G2EA 4OFTA 4PGTA 3ZIJA 3ED3A 4O7HA 1K0DA 2O89A 3CRTA 1USBA 3IE3A 3KMNA 1YEXA 3UVHA 5D9TA 3HD5A 1T4ZA 4MF5A 3FRCA 2LEGA 2QSIA 4WKWA 3JCML 2GQKA 5DQYA 3FZ4A 6GSTA 2H0IA 2RUFA 5DCGA 4HU9A 2DMMA 4XRAA 1YKCA 9GSSA 1DUGA 1H75A 5D9VA 2AB6A 4HOJA 1OE7A 5EPFA 5FT3A 4PXOA 2PVOC 3DD3A 2LTKA 4V2MA 1J0FA 1RK4A 3TKSA 5J9CA 5DALB 3DIEA 4Q5QA 1TK5B 1ON4A 1PL2A 4IQAA 2R3XA 3TCOA 1JLWA 3ERGA 4WR5A 2HNLA 5GAND 4I6XA 1J08A 3RPPA 2YV7A 1FVJA 3FYGA 4WXTA 3O6TA 2YJ7A 2VM2A 2PPTA 4HJ2A 3IPZA 4MZCA 2X8HA 1EEJA 1W89A 2H1DA 3W6GA 2ZNMA 5ECHB 3J7Yk 5HR1A 4F9ZA 2C80A 1EOHA 4OFNA 2GZYA 3O3TA 4AJ6A 3CYNA 3TJFA 1AUCA 2D2ZA 1DE1A 4IW9A 3TJGA 4X1UA 3FHKA 3UBLA 1DSBA 3GTUA 5IPGA 1VF3A 2B6MA 1QQ2A 2HE3A 3GL5A 2O87A 3C1SA 2CVDA 2B1KA 4ZILA 3DWVA 2L5OA 1F6MC 2MMZA 5AN1A 4NPBA 4G9HA 1V2AA 3TB2A 3EINA 4KE3A 2TRXA 1BG5A 2PUKC 4F0CA 1T8EB 2P5QA 2O7KA 4G10A 4IP1A 3ERFA 1BYEA 4OCEA 1XVWA 1GULA 3IAM2 4K7IA 5DBQA 1EP7A 1V98A 2IL3A 1ERWA 2FWHA 2FA4A 4LMVA 4QQ7A 3VI5A 5HFGA 2H70A 1QFNA 3KM6A 1X9SB 1THOA 1K0MA 4PUAA 2LUSA 1AQVA 3ZYWA 3GURA 1XXUA 2FWEA 2GZPA 4I2UA 2MBTA 6GSVA 3UVTA 1Z3EA 3WD6A 1QGVA 4YQVA 1SK2A 2JZSA 5IO0A 5A5KA 3FZ5A 5G2ZA 4MJAA 3F9UA 3KCMA 2HXKA 2JZRA 2VAFA 1R5PA 3TJBA 2I4AA 1GTUA 1T3BA 4L8EA 2IN3A 1TI3A 4HZ4A 5D9WA 4ZIJA 5ENUA 3TKRA 2DMLA 4TXOB 3GH6A 1Z9HA 2HSYA 3CXGA 3NIVA 1FVKA 1XWKA 6GSXA 2VOCA 3FY7A 3LJRA 4BWSA 4GSNA 4OFMA 1X5CA 2VIMA 4EUYA 3NOFA 1H4OA 4GCIA 4N0ZA 3GSSA 2G0FA 1SYXA 2QGVA 1AQWA 3TKPA 2V6KA 1XCCA 2IFQA 2H66A 4GXZA 1SK1A 4LMWA 2IJYA 2MMNA 2IMDA 4OMVA 4XHMA 4JU5A 3ZITA 3KP8A 4HQZA 1F3AA 5IMVA 3C71A 3F6FA 1EWXA 5CO3A 4JEDA 4NAXA 2O8VB 2XBQA 1SJ6A 3IAS2 3TJKA 3H4KA 4L0WA 4OD7A 2OE1A 3WT1A 3M9KA 1FO5A 4NV2A 1GTIA 3WGDA 2LKUA 4RQRA 4BPYA 1U6TA 1GSSA 2QC7A 2HZEB 4E8HA 4AGSA 1UN2A 3ZREA 3EU4A 2MBSA 4FH8A 1B4QA 3RBTA 4OO4A 5J9BA 3A5WA 4XTSA 1WMJA 3BOAA 18GSA 4TR0A 4MLYA 3E0UA 3A2XA 3L9SA 5EY6A 6GSUA 1ST9A 5JWRB 3ERWA 3I6AA 4GQCA 5J41A 1K0BA 1OKDA 2RUEA 5ECKB 2N5FA 2RM6A 3ZIVA 2H6XA 2DJ3A 4H86A 3ZMKA 3GH9A 4MA9A 1ACVA 3GKKA 2NPBA 1KTEA 2FHEA 2ON7A 3BJ5A 2R6KA 3TRPA 2MYGA 1WE0A 2XBIA 5DDLA 1YDKA 2H76A 2JU5A 2Z9SA 4L5LA 4MPGA 2H0HA 1NHOA 1YJ6A 3DKSA 2VLTA 2H71A 4V1Ap 4IJIA 2H0GA 3GNJA 3KGKA 3GX0A 2F3MA 1UA5A 4POMA 3G7IA 3GN3A 2VL3A 3TKSE 3WGXA 2C0FA 1AAZA 4POLA 1GUHA 3GRXA 2M72A 4K7OA 2F8FA 5DQSA 4YQMA 5GAPD 5IO2A 1GTBA 1O8XA 2LRCA 2LS5A 3RAZA 2WGRA 3F8UA 3CTGA 1WPIA 5ECSA 2BTOT 2FNOA 4TR1B 4CHSA 1O6JA 3LORA 4I5QA 5KN1A 4IHUA 5JWOB 2MMOA 3VPTA 5J5NA 4PUFC 1B48A 4TXOA 2GSSA 3GYKA 1TI1A 2VCQA 4ECJA 4MF7A 4EVMA 1M0UA 2C3TA 3DVXA 2P0GA 2R37A 1PX6A 3H8QA 2AYTA 4JRRA 2DBCA 5DVBA 1MTCA 4K6XA 2WJUA 4PQHA 1AQXA 1HNAA 4QL9A 2OA7A 4BL7A 2H8LA 1OAZA 2VLVA 1ERTA 5CNWA 5CYYA 3GIXA 1ML6A 4YAVA 4KGIA 2DLXA 2FLSA 2EIOA 5ECQB 3EMXA 4ZL8A 1TKDB 4EXJA 5ID2B 4EKZA 3A2VA 5EVOA 2VCXA 4HUAA 1GH2A 2VM1A 4Q5RA 5FHIA 1A23A 5CRWA 2LNTA 3R2QA 1KEBA 5GSTA 4WEYA 2KOKA 2GDRA 3ZZXA 2ES7A 1VGLA 5DAKA 1YEPA 2YWMA 1WJKA 1DE2A 1Z7RA 1A2LA 3K8NA 4AJ8A 2JL4A 4IGJA 4AF2A 4DSQA 1Q98A 3ZVJA 2E0QA 4BWQA 3CBUA 1SD9A 1NM3A 4P3YB 2HZEA 3EE2A 1PX7A 1LBKA 2YN1A 4ECBA 1F9MA 1JHBA 1Z6MA 1R7HA 1O8WA 5D96A 3W8SA 4BVXA 4ILFA 2CZ3A 3E3EA 4ML1A 3VWUA 1A0FA 3ZVJD 4EDYA 2DC5A 3LXTA 5ECNB 3DVWA 5HR0A 1ZGNA 2VCVA 3IK7A 2RM5A 3CRUA 4CDOA 8GSSA 2I3YA 5IIZA 5B7CA 3HCZA 4F03A 1TDIA 4J56E 2GSTA 3DRNA 3KEBA 4ID0A 3C73A 1OVNA 2A4VA 1R4WA 3KZQA 3RHCA 3HA9A 2IFQB 4TR3A 3DYRA 2LNSA 3IDVA 3D6IA 4F82A 3LFLA 5KN2A 5IMZA 3IXRA 1A8YA 2YNXA 2OACA 4IVFA 3HJMA 1HD2A 2H6YA 3HJOA 3NZNA 1K3OA 3TDGA 1B4PA 4PNGA 4YAPA 2H30A 3VK9A 2AAWA 1GNEA 3HYPA 2KHPA 2RLIA 4DEJA 11GSA 4DSRA 1WIKA 1Z7PA 2H01A 2C0EA 2I81A 4MZBA 3QD9A 3GKMA 5IMFA 3E9JB 1Z5YE 3L4NA 1Z6NA 2VL2C 4IBPA 1GSQA 1KNGA 5ELAA 2V32A 1SD8A 1ILOA 3F3RA 1SK0A 5LNKe 3F6DA 4TR1A 2DSAA 1TK0B 2KP2A 3HVSA 4CW9A 22GSA 4E8EA 1MD3A 1SENA 1FB0A 1THXA 2V41A 5J4UA 4IQ1A 2LJAA 5IMAA 3QCPA 4O32A 3SWLA 5A4VA 2C0GA 1EV9A 2CX3A 3UJ1A 1EGRA 5L71A 1GSEA 5IMDA 12GSA 1BEDA 1I9DA 2X64A 4ZB6A 3F0IA 3UL3A 1SU9A 1BJXA 2VCWA 4DSSA 5A4WA 1A2JA 2FGXA 1O85A 4QL7A 2WDUA 4MABA 4KSOA 2B7KA 5ID2A 2N5BA 4IN0A 1FAAA 1OE8A 4TW5A 4MJCA 1U87A 3UARA 4XIHA 4K9ZA 4X0XA 4KDYA 4XS6A 5D93A 2G2QA 2IMFA 1PA3A 4XS1A 3IK9A 1ERUA 1XOAA 2NVLA 2E7PA 1QXHA 3APSA 5IPHA 2X8GA 4XCSA 2IMIA 3EC3A 2A2SA 5A4UA 1S3DA 2BMXA 1U3IA 3H1NA 2MZCA 3DEXA 3CSHA 1M2DA 2FCHA 4GLTA 5E4WA 4OO5A 2OKAA 16GSA 4IJ3A 4KB3A 1CQHA 3ME7A 2YANA 4KCEA 1YQ1A 2A2RA 4TRXA 2PBJA 1PSQA 3IA1A 6GSSA 5COHA 1TXXA 5G5FA 5IOWA 4KDUA 4ACSA 1OC3A 5KEJA 4KNDA 1T00A 2CAIA 4I97A 4K0GA 4FO5A 2VD1A 7GSSA 1SKWB 2J9HA 1GSFA 1WRYA 1TRVA 3BBYA 1FHEA 3PR8A 2TRCP 4HEA2 2FWGA 2H72A 4RI6A 3CSIA 1XZOA 3KD0A 3KTBA 2WCIA 1K0CA 1T1VA 3TGZA 4MP4A 1EEMA 1EZKA 5KN0A 3M8NA 4JBBA 3IC4A 1XWCA 4ZBAA 3H93A 2OBKA 5F05A 1KBNA 5F0GA 3C8EA 5G30A 2KP1A 1ABAA 3CMIA 3CTFA 4NHZA 1LU4A 1ZMAA 1TJDA 1FW1A 2L5LA 2P31A 3P2AA 3MDKA 3EURA 4BA7A 2C3NA 2PU9C 2EC4A 1CQGA 4K1FA 5DAKB 1GRXA 1K0NA 4MK3A 4Q5FA 1GP1A 1GL8A 3KTLA 1Y6EA 1V9WA 3M3MA 3D4MA 2C4JA 4WBJA 3BD2A 3HDCA 3HVVA 3Q18A 4KDXA 3QAGA 4KUNA 4TXVA 3UIWA 2B7JA 4OWYA 1OC8A 3IBHA 1EGOA 1TU8A 2L6CA 2GQLA 4N0VA 2GSRA 1X9WB 3EYTA 3I69A 2YCDA 4GWRA 1S3CA 2HI7A 1PRXA 1XWAA 3RHBA 4WF4A 2YWOA 3LYKA 1MDJA 4O5RA 2GT6A 2XPDA 2GGTA 2B5EA 1QUWA 2CVBA 2KLXA 4WETA 2VCZA 2GVPA 3V1WA 1BQ7A 3FZ9A 1T7PB 2P5RA 3U5RE 4NMUA 1GLPA 3QPMA 1VF2A 1O7UA 3MNGA 5IM9A 4KSMA 2JZTA 5CREA 3G7JA 1JZDA 1YY7A 3US3A 1U88A 2C3QA 2C8UA 1JZRA 4PQ1A 4ISDA 3TUEA 4I8BA 1NSWA 3UOMA 3LSZA 5ECPB 3KH7A 1PD21 1XVQA 1GSYA 1PQNA 3HHVA 1SL0B 2NDOA 3MAKA 3FW2A 2L4QA 5G31A 3EMPA 2B5XA 3A3TA 4XRDA 1NHYA 5EL8A 3CSJA 5GSSA 1U3AA 3FKFA 5H5QA 1VF1A 4J2FA 2OJLA 2H1AA 2WB9A 5D9XA 3QAVA 1K0OA 1HQOA 4Z7XA 3LG6A 3J7Yb 5G1KA 3WYWA 1PL1A 5DJLA 4GTUA 3LQ7A 1XW6A 4MJBA 3AY8A 2YOIA 2YZUA 1GUKA 4JR6A 2LJKA 3P90A 1IYIA 1M2AA 4NV5A 1R26A 3TOTA 2DJ1A 2WFCA 4X43A 2E2MA 2LV3A 1NW2A 5JWQB 2L4CA 4K8MA 5F07A 2HT9A 2FUG2 3HXSA 2YP6A 4EL1A 4DSSB 1GWCA 2VCTA 3GKNA 2DJJA 2PN8A 2REMA 3HVXA 2OADA 1SJIA 5AISA 5DCHA 1FOVA 1XIYA 3EWLA 3ZL5A 3Q6OA 3GSTA 2F51A 1E6BA 1ERVA 3VI7A 3P7XA 1B8XA 1RQMA 4G19A 4KX4A 3HZ4A 3GL3A 3G7YA 3S9FA 2LQOA 1MDKA 4FYUA 2FY6A 2JACA 2CA8A 2OBIA 5LCZA 1UC7A 1VF4A 4EE0A 2B5YA 4GSSA 2PWJA 1TRSA 3IR4A 1XW5A 4KW6A 2FD3A 1F2EA 2M80A 2ZUPA 5INYA 2AUVA 4XS4A 4BVYA 4EDZA 3Q74A 3PH9A 1AC1A 3H79A 5D8IA 3APOA 1V57A 2WULA 3ZLPA 1QK8A 3MWHA 3QMXA 1G7EA 4N10A 5LD0A 5HR3A 3GV1A 19GSA 1V40A 4HDEA 4KA0A 3FR3A 1S3AA 2VL9A 4JZQA 1EP8A 1ZZYA 3VWVA 2KUCA 4TOPA 3W8JA 3GFKA 5B8BA 2F9SA 3KMOA 4MDCA 4DVCA 3LWAA 2VL2A 1K3YA 4MJEA 5H5RA 2DIYA 5ELGA 3UEMA 4ZL7A 3HY2A 3TOUA 3P8WA 4V1Ag 5JCUA 4MPFA 2LRTA 4EC0A 2PERA 13GSA 1B9XC 2N5AA 5ECOB 3APQA 2I9HA 2V1MA 4HQSA 4IKHA 1X0RA 1MEKA 3F4RA 1C72A 4KCAA 4HJMA 4PURA 3TJJA 4IP6A 2LRNA 1SKSB 2ALBA 4MH3A 5H5SA 1RW1A 2X8CA 2FA8A 5CP1A 1J9BA 3IRAA 4NWYA 5HFIA 2IWTA 3IV4A 2VLUA 3GMFA 3DGQA 3QFAC 1PKWA 4K0NA 4HS1A 2LSTA 2YWNA 3L9VA 1HNCA 4EO3A 2EIQA 2HSHA 3VLNA 5B6MA 3N5OA 1ZL9A 2DJKA 3OR5A 4NHWA 3F4TA 1X5EA 1K3LA 5CAXA 1OKTA 2B1LA 3GHAA 4D73A 1E2YA 3D22A 2H73A 3TRQA 4POBA 5JCGA 1A2MA 5HFKA 2K6VA 5CRHA 4K2DA 4NXIA 5AIVA 1JZOA 2JADA 1WWJA 1R5AA 3C7MA 3L9UA 3TKSC 4TN8A 2AJQB 1HNBA 2YJHA 2CZ2A 3KP9A 4PNFA 4V2LA 3PINA 4FYBA 20GSA 4L0UA 4ZB9A 2GT5A 4TR4A 1VRSD 5HR2A 1XWBA 2K8SA 3MSZA 6GSWA 5CRGA 3QOUA 2OE0A 2E2GA 5GZZB 1T4YA 3RPNA 4WF5A 4GF0A 4Q5NA 5G1LA 4JR4A 1Y25A 3ZMLA 14GSA 3KXOA 5B6NA 1OC9B 5AGYA 1SYRA 4V2NA 1TW9A 3FZAA 3D0ZA 5C00A 2WS2A 3M1GA 3UBKA 4FYCA 2EIRA 2DJ2A 1O73A 2C0DA 3EVIA 1XWGA 3LXZA 1JFUA 5IQYA 2BJXA 3PGTA 5C04A 1TK8B 3LYPA 1M2BA 2LQQA 1A24A 4ZB8A 5B8AA 2GLRA 3FR6A 4MZWA 4GRFA 2L59A 1JZWA 1FB6A 1A0RP 1MDIA 2DJ0A 4IS0A 4O92A 4TVEA 3IOSA 10GSA 4K7NA 1GNWA 1GLQA 3DMLA 2ON5A 2R5GA 4RUVA 1AW9A 4LL4B 1MD4A 2NBSA 4YQUA 3TKQA 2CV4A 4MH2A 4KAEA 4ECCA 2VUPA 3FEUA 3I43A 3ZFLA 1Q4JA 3QDNA 2GQMA 2H74A 3BCKA 1URMA 2J23A 4EF0A 3HZ8A 3KIJA 1TRWA 3GKXA 3TRXA 2CT6A 1G0TA 1TTZA 1F3BA 4F2IA 4TKYA 1EV4A 1B9YC 1QMVA 3RDWA 1ZYEA 4YH2A 2GS3A 1XBSA 4HU7A 3VWXA 3HKRA 2B3SA 5JCWA 1TRUA 2H75A 4MF6A 1X5DA 2F8AA 2IMKA 4I2TA 1BAYA 3ME8A 1GTAA 2XPEA 4AJ7A 4KH7A 5DALA 4XS4B 2H19A 3A2WA 4RI7A 2HLSA 5AIXA 4FIWA 2LJRA 4ULXA 2VD0A 1GUMA 1XFLA 2DIZA 3VPQA 1G6WA 1DBYA 3ZTLA 1F37A 3QAWA 4ECIA 3LEFA 1IYHA 2X99A 2JSZA 2CAQA 2H1GA 2QKEA 2GZZA 2K8VA 1WP0A 3IHQA 4HZ2A 1YF1A 4POKA 6GSYA 3BCIA 1A8LA 2I1UA 5ECRB 4LL1B 4PQIA 4F0BA 3EU3A 3C1RA 2YV9A 3N9JA 2MMAA 17GSA 2V6OA 3D5JA 3DXBA 3D21A 1EOGA 4WR4A 3ISOA 1XPVA 3ZRDA 1V58A 3QFBC 2AHEA 1YZXA 3Q19A 1SJZA 4RQXA 2GTUA 2WRTA 1M7TA 2RIIA 2V2GA 3VWWA 4IELA 1TP9A 4ZBDA 2L57A 1LJRA 3F63A 1ZYQB 3LGCA 1OC9A 2R2JA 1PGTA 1HYUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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