1AUCA

Human thioredoxin (oxidized with diamide)
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKCMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Human thioredoxin homodimers: regulation by pH, role of aspartate 60, and crystal structure of the aspartate 60 --> asparagine mutant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
molecule tags Oxidoreductase
total genus 36
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1aucA00
2JZSA 3LEFA 1TJDA 4ACSA 2H70A 2GT5A 3GH6A 1VF4A 4XIHA 5G2ZA 1PRXA 1MTCA 1K0NA 1GP1A 1OC9A 2H72A 2JZRA 4BPYA 3ED3A 4ZL7A 1F6MC 1XWGA 1NW2A 2H0IA 2FY6A 1PSQA 4F2IA 3APOA 4G10A 3HVSA 3SBCA 5KN1A 4FH8A 2R6KA 2VD0A 4ECCA 5D9VA 4L0UA 5F07A 4MP4A 6GSWA 2XHFA 4IN0A 3LQ7A 1G6YA 4OFNA 3VWXA 2PWJA 3C1RA 5G1LA 3GHAA 1WPIA 4NXIA 2DC5A 4MF7A 3H79A 4KX4A 3LORA 5DDLA 1GSDA 1YJ6A 2AB6A 4MH3A 5COHA 3HKRA 3SWLA 1AQXA 1GSUA 2YWNA 2IMDA 2H8LA 2LV3A 3ERGA 5ENUA 3GKMA 1S3AA 2H01A 5CAXA 4PNFA 2NBSA 2VCWA 3O76A 3WGXA 4ID0A 2V41A 5ECNB 5J3RA 1O7UA 2M46A 3G7YA 2GLRA 1X9WB 2B7JA 2K18A 1N8JA 1OC3A 1YQ1A 4IQAA 4NV2A 4V2LA 4Z7XA 2FGXA 4XRAA 5F0GA 1B8XA 1QFNA 2J9HA 3QMXA 5DQYA 3ZIVA 3E0UA 4OFTA 3KMOA 2ON5A 5D9TA 4F03A 1TU8A 4JEDA 1ZGNA 4OMVA 1T8EB 1GNEA 1XOAA 4F9ZA 1V2AA 2YANA 5JWRB 1TI3A 4TKYA 2MBTA 2DJJA 4AJ7A 1E2YA 1TI1A 4EF0A 1YZXA 1OC9B 2NTOA 9GSSA 2MMOA 1SJIA 1S3DA 3ISOA 5HR2A 3W8JA 1F2EA 5LCZA 1WMJA 4ZL8A 4PQIA 4POBA 3GN3A 3QDNA 2GSTA 4K8MA 2D2ZA 3TB2A 1R5AA 1K3YA 2HYXA 3GSTA 3U6VA 4KUNA 3UEMA 1T00A 2R4VA 5DQSA 2GQLA 3Q74A 3HHVA 2PERA 5JCGA 3CSHA 5EVOA 5CRWA 3QD9A 5IPGA 2MBSA 1UN2A 4FO5A 5CRGA 4AF2A 1PMTA 3TJBA 1X5DA 3D21A 3QOUA 1XW5A 3G9BA 3ZL5A 2ALBA 2PBJA 4CHSA 2LJRA 2KLXA 1AQWA 1XVWA 3CYNA 3KCMA 2KOKA 3EWLA 1W4VA 1J9BA 1BQ7A 1WWJA 4FYCA 4WETA 3BD2A 2CA8A 3EMPA 3D4TA 2X8HA 1AQVA 2RUEA 4ZB9A 1EEJA 3W8SA 2P5QA 5B8AA 2F9SA 5DVBA 4AGSA 4YQVA 2OA7A 4I6XA 3C8EA 1JFUA 1TOFA 4JR4A 4N11A 4GQCA 5CRDA 2MMAA 4CDOA 2GS3A 2DJ2A 4EXJA 3P2AA 1GH2A 1ERTA 1GUKA 5D73A 1GULA 1JZOA 1X5EA 1F9MA 1ABAA 1LU4A 3F3RA 3L78A 4MH2A 1XBSA 2MZCA 3D6IA 4Q5RA 3WGEA 5DJLA 2GZZA 3ZITA 3ZRDA 3GX8A 1YKCA 4YAPA 7GSSA 1K0MA 2C0FA 3TJGA 3FYGA 1CQGA 3UBLA 3HY2A 13GSA 3KIJA 1ZCPA 4F0CA 2JL4A 2I9HA 3KTBA 1GTUA 3MAKA 1JHBA 2YWMA 4MF5A 3IK7A 1UVZA 1O8WA 4V1Ag 3APSA 3P90A 2YV9A 2H71A 1BEDA 2PGTA 2B5EA 3I69A 3CMIA 2GVPA 2GT6A 5DALB 2F51A 1G7EA 1U3IA 3QAGA 3PINA 4IKHA 4GWRA 2C0EA 2C3QA 2GSSA 2HLSA 1K0AA 3IAS2 5ECSA 1HYUA 4CW9A 2VIMA 4GRFA 4DSQA 1OVNA 3EE2A 3GIXA 3HXSA 4BVYA 1V98A 3QAVA 4JZQA 1GSFA 2DJ1A 1EOHA 4XTSA 4OCFA 2HSYA 3FZ9A 2HZEA 3N5OA 4ZB8A 4KCAA 1EGRA 4MJAA 1EWXA 1ERUA 4POMA 2OE3A 2WFCA 2I3YA 3UVTA 4FYUA 1YY7A 4KDUA 1T4YA 3GMFA 2VCQA 3O3TA 4HU9A 3TRQA 3CTFA 3CSIA 3TOUA 5IMVA 1TU7A 2GZYA 1F3BA 4D73A 3UL3A 3RAZA 5A5KA 4I97A 2YNXA 4AJ8A 4HU7A 3IC4A 5JWQB 1G7OA 2HXKA 4RUVA 1BAYA 3A2WA 1XWCA 3J7Yb 4K2DA 1FAAA 4L5LA 2OJLA 1SK1A 2M80A 5ECPB 10GSA 2H0GA 2YOIA 5EPFA 2WJUA 5ABRA 4TR4A 2DLXA 4N10A 2P31A 2LUSA 2DSAA 3KZQA 5GAPD 2PPTA 1BYEA 4BA7A 3ZMLA 4K7IA 6GSTA 5B6MA 3H1NA 2XBIA 2PU9C 2DMLA 3HZ8A 4KSMA 4X0XA 2CAQA 3MSZA 3LXZA 4LLRA 4TXOA 1ZOFA 3A2VA 4YQUA 3UBKA 1J08A 3RBTA 3ERWA 3LSZA 1GLQA 2H0HA 4Q5QA 3IA1A 2B7KA 3L9SA 3GX0A 4ZBAA 1URMA 5B7CA 4POLA 4WEYA 5E4WA 3CXGA 2HZEB 2KP2A 1IYIA 1XW9A 1ILOA 3HVVA 5KN3A 1ZZYA 5ECOB 3IV4A 6GSSA 2EC4A 3BCKA 3FZ4A 4WF4A 1U6TA 5C04A 1GSQA 2VOCA 3G7JA 3PH9A 3DEXA 4IS0A 2BTOT 1T7PB 2G2QA 4KB3A 3GTUA 1GNWA 4ZBDA 5AGYA 1M9BA 3KEBA 1V57A 5JWOB 2GTUA 4JE1A 2CX4A 2QC7A 2H1AA 2LEGA 2PMTA 4LA1A 4HUAA 3WT2A 1PKWA 4G9HA 3I6AA 1AC1A 3M0FA 1PX7A 5DJMA 1Z3EA 3M3MA 2LQQA 4IJ3A 4KW6A 2FWFA 4TR1B 1FB6A 4PNGA 2OE0A 1YEPA 1Z9HA 2DBCA 1FW1A 4X1UA 1A8LA 3AY8A 2LS5A 4IELA 2H6XA 3KTLA 5CNWA 2GSRA 2JZTA 1VRSD 2CQ9A 3UVHA 3NOFA 2P0GA 3L9VA 1M99A 4P3YB 2YJ7A 3EU4A 5ECRB 5GAND 1A0FA 1VF2A 5ECMB 1K3LA 2M72A 1R5PA 3GH9A 5EL8A 1AAZA 3VPTA 3P8WA 3NZNA 2H1GA 1A2JA 5G30A 1AW9A 2XC2A 5IIZA 1PX6A 3BCIA 2H6ZA 4KNDA 1V40A 4HJMA 2O89A 4KCEA 1TDIA 2HRNA 5ELGA 1T1VA 4O32A 3KP8A 1X9SB 3FRCA 3LWAA 1F3AA 4TOPA 4EDYA 3HD5A 4OO4A 2H19A 4HZ4A 2NVLA 1N2AA 3H8QA 5G31A 1HNCA 2H30A 5ECLB 3GTUB 3ZTLA 1MDIA 2GQKA 5IM9A 2DJ0A 4WR4A 1FHEA 1QGVA 4IGJA 4NPBA 5IOXA 2FHEA 1FG4A 17GSA 3EURA 3FR3A 2VL3A 2FLSA 4TR3A 4KGIA 3VURA 4LL4B 2C0DA 2L4CA 3TUEA 5F8BA 5LD0A 2FA8A 3F4RA 3DXBA 2C3NA 5D8IA 4JBBA 5IOWA 2N5AA 3LXTA 2E7PA 2O85A 1NHOA 3IAM2 2VLUA 4TVEA 1ZYEA 4WXTA 2WULA 3QCPA 4EDZA 1EP8A 4MABA 2OBKA 1G0TA 2LSTA 4PGTA 3KGKA 1Q98A 4IJIA 1EP7A 2MMNA 2GGTA 2K8SA 2J23A 1R4WA 4DSRA 3F4SA 4O5RA 4PXOA 1TK0B 1G6WA 3IR4A 3F6DA 2I1UA 1O8XA 4MPGA 1Z5YE 3ZIJA 4MF6A 3ERFA 1GSSA 3ZZXA 1SJZA 1XWKA 1A23A 4KDXA 2JSYA 3C71A 2YN1A 1JLWA 3M8NA 3IPZA 5HFIA 3J7Yk 4MZWA 3IHQA 4HQSA 5D96A 3ME8A 3GRXA 1SJ6A 2FWEA 5H5RA 5CP1A 1X0RA 4F82A 4K7NA 1USBA 3F6FA 2WZ9A 2VO4A 3QFBC 1GTBA 5DCHA 2PN8A 2VLVA 2VAFA 4BWSA 2H75A 2H66A 2LQOA 1DUGA 4NWYA 1K0BA 5LNKe 3A2XA 3QR6A 4GF0A 3TKPA 1SL0B 3KXOA 3KM6A 2IN3A 4KA0A 4OWYA 2YPMA 1J0FA 2VCZA 4DSSA 3M9KA 4GSSA 3FR6A 3APQA 2R5GA 3I9V2 3VPQA 3GA4A 3Q19A 1YF0A 2A2SA 4OCEA 5KEJA 2X8GA 4K6XA 1SD8A 4HOJA 1X9MB 3UIWA 4IW9A 2C0GA 2B1KA 6GSYA 3KP9A 4G19A 4GLTA 1UA5A 1ERVA 3R2QA 2VL2A 4XHMA 1S3CA 4EE0A 2VD1A 2CAIA 1HNAA 5GZZB 3D4MA 1GSEA 3GL3A 2K9FA 3HJPA 20GSA 2IMIA 3A5WA 5INYA 1XIYA 4EO3A 2LRTA 4EVMA 1T3BA 2HFDA 2YP6A 3ME7A 2V1MA 2LTKA 1YDKA 5J5NA 1M0UA 3MNGA 2IJYA 4O92A 4V1Ap 3V1WA 1UC7A 3F8UA 3EINA 2VCVA 2C4JA 3EYTA 4BVXA 2YWIA 1U88A 2L59A 4JU5A 2JADA 2GSQA 1PL2A 1K0OA 2CV4A 1TTZA 2NDOA 1EGOA 4MCUA 2IFQA 3HVXA 2LKUA 2DMMA 2E0QA 1QMVA 3GURA 1R26A 1AIUA 3D5JA 5HR1A 4XS4A 4FIWA 4HJ2A 2B3SA 5CREA 5FHIA 2N5FA 2FWHA 2B6MA 1SENA 2F8FA 2R3XA 4OFMA 3CBUA 2VUPA 5L71A 3GKNA 1BG5A 4K7OA 2JACA 5J9CA 4ZXGA 4N0VA 2HZFA 2EIQA 4DSSB 1ERWA 2OE1A 19GSA 1OAZA 1A2MA 4E8HA 1XVQA 1JZDA 5ECQB 4G2EA 3FY7A 3IBHA 3ZVJA 1NM3A 3TRPA 4NHZA 1WP0A 3HDCA 1VGLA 4IP6A 3N9JA 3TRXA 3LGCA 3H4KA 2VM1A 5FWGA 5G5FA 4KH7A 4GXZA 2QGVA 3TKSC 3F3QA 4WBJA 5CRHA 3S9FA 3VI5A 4E8EA 1GLPA 3RPPA 2OKAA 3Q6OA 2E2GA 3HA9A 2RM5A 2FWGA 2O7KA 4ECJA 4IBPA 1SD9A 2C8UA 1W89A 5AIVA 1X5CA 3BBYA 1PGTA 4OO5A 2IWTA 3WD6A 2FD3A 2ON7A 2CVDA 1AXDA 4YAVA 4KDYA 5A4VA 1WOUA 2BMXA 5F05A 2R2JA 4NMUA 14GSA 2AAWA 5D93A 3HYPA 2LJAA 3KJYA 3HZ4A 2IFQB 2FCHA 1BJXA 1DE1A 5IMDA 4WF5A 1HD2A 4ECBA 3KH7A 2YZUA 2HI7A 4N30A 1GTAA 4FYBA 2O87A 4IQ1A 5ELAA 2OACA 3TKSE 2F3MA 2AYTA 1B48A 5A4WA 5KN2A 5ECKB 2HT9A 4JRRA 1TW9A 3UJ1A 3TJFA 5IMZA 3VLNA 3IK9A 3IE3A 3WT1A 2OBIA 1DE2A 4JR6A 3GNJA 1PKZA 2V2GA 1Z7RA 3I43A 2ZCTA 4H86A 3LFLA 4LL1B 2RUFA 4MLYA 18GSA 1SL2B 4ULXA 5KN0A 3M9JA 4ZB6A 3DYRA 5B8BA 3D22A 4D73B 2LJKA 3TOTA 3BJ5A 1EV9A 1DSBA 4O7HA 1SKRB 3O6TA 1EEMA 1MEKA 3PR8A 2WDUA 1M9AA 4TW5A 1Y6EA 3RPNA 1QK8A 3DD3A 1YEXA 2FNOA 1K3OA 1SYXA 4PUFC 3VWWA 3DVWA 5ECIB 1GUHA 3IDVA 4EL1A 4GSTA 3E3EA 1VF3A 3TCOA 3CRUA 5DCGA 4KAEA 1Y25A 1WIKA 1ON4A 2I4AA 5IMCA 5HR0A 1GWCA 2ZNMA 2Z9SA 2RLIA 2DJKA 3TKQA 3WGDA 4WR5A 3TKRA 3KH9A 5JCWA 3GV1A 6GSVA 5HFKA 1XOBA 5AIXA 4F0BA 1SL1B 3CRTA 3TDGA 4J56E 2WB9A 3DIEA 5AISA 2BJXA 1ZMAA 1B4QA 4TRXA 4TXOB 2H73A 2GZPA 5E59A 3PGTA 1SU9A 2XPDA 2GDRA 2CVKA 2XPEA 4MJBA 1ACVA 2A2RA 3US3A 1QXHA 4V2NA 3H93A 3L0HA 1WE0A 5GSSA 2REMA 3P7XA 3E9JB 2ES7A 3CSJA 4ZBBA 1M2BA 5IPHA 3TJJA 1LBKA 1OYJA 22GSA 4DVCA 1BX9A 4N0ZA 2VL9A 5IMAA 3UOMA 1WRYA 3Q18A 3FHKA 4ZIJA 3ZREA 3F9UA 1GTIA 1E6BA 4ILFA 1XPVA 2FA4A 2AHEA 4Q5NA 1TRVA 4K9ZA 5ID2A 2VCXA 4PURA 4XS1A 3ZYWA 1H4OA 1A24A 2WGRA 3HJMA 3KD0A 1U87A 1OKDA 2C80A 3LYKA 2AJQB 3FR9A 1FVKA 3QAWA 4GSNA 12GSA 1Z6NA 2QKEA 1SKSB 3BOAA 4IVFA 2GQMA 1Z6MA 3FW2A 3RHCA 1YKAA 1KEBA 5A4UA 4PUAA 1C72A 1T4ZA 3NIVA 2OADA 2CVBA 3K8NA 2YJHA 2B5XA 2CZ2A 2TRXA 2H6YA 3UAPA 1PD21 4PQHA 1RQMA 1TP9A 11GSA 1NSWA 4EC0A 1TK5B 4K1FA 1O6JA 4MK3A 1TRSA 2HSHA 3UARA 2C1YA 2DJ3A 4MZBA 5CYYA 3GKKA 4ECIA 1I5GA 2AV4A 3EVIA 2K8VA 4J57E 1F37A 5D9XA 2O8VB 1XW6A 2FUG2 1FOVA 3D0ZA 2IMFA 1XCCA 3C7MA 2HE3A 3GL5A 2LRNA 2KHPA 1IYHA 3RDWA 1GL8A 4HQZA 1XWAA 3LYPA 3C73A 2H74A 3A3TA 5H5QA 2MMZA 5J9BA 3TGZA 1PQNA 3CTGA 5DALA 2V6KA 2A4VA 1M7TA 4K0GA 3DRNA 2L5OA 3JCML 4ZL9A 2VLTA 4L8EA 5ECHB 4BL7A 4WKWA 5DBQA 1Z7PA 1OC8A 2C3TA 1NHYA 1XWBA 5ID2B 1CQHA 2F8AA 4QL7A 4HS1A 4NV5A 2VL2C 2L6DA 4Q5FA 1LJRA 4NAXA 3ZVJD 2IL3A 3DVXA 1XFLA 2IPAA 4YQMA 1GSYA 1SKWB 5JCUA 3DMLA 4RQXA 3ZFLA 4XCSA 2G0FA 3L4NA 4OD7A 1QQ2A 5IMFA 2CZ3A 2R37A 2L5LA 1B4PA 4J2FA 4MJEA 3TJKA 1GRXA 2L4QA 5HR3A 2PVOC 5D9WA 4WBRD 2KP1A 3LG6A 3DKSA 4I8BA 3VWVA 1FB0A 2YCDA 4PQ1A 1ML6A 2JSZA 1TKDB 1TRWA 2QSIA 3FK8A 1O81A 3G7IA 1MDKA 3ZLPA 2I81A 4V2MA 3FZ5A 2IIYA 2H76A 5HFGA 1MD4A 1THXA 1XZOA 3HJOA 2IMKA 4HI7A 3ZMKA 1H75A 1TRUA 4HDEA 1I9DA 4NHWA 1MD3A 4XRDA 3EU3A 4POKA 3RHBA 4BWQA 5EY6A 5C00A 5F06A 4MA9A 1A0RP 3C1SA 1ZYQB 2H1BA 4ZILA 1K0CA 4ISDA 3ZFBA 3MWHA 1FVJA 2YV7A 3FKFA 1B9YC 2WRTA 8GSSA 3M1GA 2JU5A 3VI7A 16GSA 1JZRA 5IO2A 4ML1A 1EOGA 4HEA2 4XS6A 3VWUA 4AJ6A 2EIRA 2P5RA 2RM6A 4HZ2A 4RI7A 2AUVA 3QPMA 3MDKA 2TRCP 4KSOA 2EIOA 1VF1A 1PL1A 4YH2A 1Q4JA 2X99A 3HCZA 1KTEA 2B1LA 2KUCA 2MYGA 4I2UA 5DAKA 1SYRA 1O85A 1QUWA 4LMWA 3FEUA 3F0IA 5G1KA 2XBQA 5GSTA 1M2DA 5AN1A 1PN9A 2NPBA 2IMEA 3IOSA 1HQOA 2LNSA 2N5BA 4K0NA 1OKTA 4GTUA 1B9XC 4KE3A 4EUYA 1O73A 3GSSA 5G5EA 1R7HA 3LJRA 1TK8B 2HNLA 1TXXA 1AUCA 2PUKC 2X64A 4ML6A 4TR1A 4IHUA 1OE7A 1M2AA 4QL9A 4I2TA 5HQPA 4L0WA 1JZWA 2E2MA 2L6CA 3F63A 6GSXA 3GUSA 1EV4A 4I5QA 4LMVA 3EC3A 3QFAC 2X8CA 4RQRA 3F4TA 4QQ7A 2VCTA 4GCIA 5IQYA 2V6OA 4IP1A 1K0DA 3VFIA 4TR0A 4XS4B 1JLVA 2HRFA 4MDCA 4MPFA 3L9UA 1HNBA 3TKSA 3WYWA 1ZL9A 2YWOA 1YF1A 2B5YA 3IRAA 4MZCA 3GYKA 3UMAA 4MJCA 1V58A 5IO0A 4PX1A 4DEJA 5J41A 4MMMA 2ZUPA 2WS2A 5J4UA 2CX3A 5H5SA 3U5RE 1GUMA 3DWVA 1U3AA 5DAKB 4GQFA 1V9WA 3GFKA 2DIZA 5CO3A 1RW1A 1WJKA 2TIRA 2L57A 4X43A 3KMNA 2H1DA 3DGQA 1FO5A 3GKXA 1ST9A 1PA3A 1KNGA 4RI6A 3VK9A 2YZHA 4L5OA 1MDJA 4EKZA 2DIYA 1XXUA 4TXVA 1A2LA 3EMXA 1KBNA 2PVQA 2VM2A 1SK2A 2LNTA 5FT3A 5B6NA 1EZKA 6GSUA 3OR5A 4TN8A 3W6GA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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