5IO2A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - c48s mutant
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
158
structure length
158
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGSTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
total genus 50
structure length 158
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5io2A00
3CRTA 4EF0A 1GULA 5ECLB 2H01A 1TKDB 1XW5A 4DSRA 1PRXA 5DAKB 1ZCPA 2HRNA 3IR4A 1C72A 2OBKA 3QCPA 5IOWA 3QDNA 4K6XA 2RIIA 3QAVA 1FO5A 4POMA 4FYCA 1JZWA 3P90A 4BA7A 4ZL9A 5GAND 3UARA 4G2EA 2YJHA 5ECQB 2M46A 3DD3A 4OO4A 1N2AA 2C3TA 3FEUA 3TRXA 3QAWA 3IXRA 3TJJA 3GYKA 1W4VA 2VM2A 1O7UA 3G9BA 3C73A 1F9MA 5G31A 2O7KA 3BCKA 1XWCA 4L5OA 4EDYA 3KXOA 1OE7A 1F6MC 2N5FA 1THXA 4IW9A 2NVLA 13GSA 1DE1A 2YV9A 3HZ8A 4LMWA 4V2MA 3FZ9A 1R4WA 4Q5RA 1ML6A 4HZ4A 1X9SB 3LYKA 2F51A 4POLA 3L4NA 2LV3A 2WRTA 2TIRA 2DSAA 4NPBA 3RDWA 3E0UA 3TKRA 5INYA 3F4TA 3FZ5A 3WYWA 3D5JA 1B9XC 3DVWA 4ML6A 4ZB9A 2TRXA 1UN2A 2OKAA 2R5GA 2F3MA 2VM1A 1SL2B 3TKSE 1GSUA 2VIMA 3H79A 10GSA 1OAZA 1OC3A 2R2JA 4MA9A 1NHOA 2AYTA 4NAXA 5D8IA 4N11A 3EU4A 2C0EA 3FR9A 4GSNA 3FW2A 2CVDA 2R37A 3GA4A 1FOVA 4POBA 3NIVA 6GSUA 2PPTA 2V6KA 2JZRA 4TR4A 3DVXA 4K2DA 3BCIA 1RW1A 5CRHA 5ECHB 3L78A 1VRSD 1AXDA 3C1SA 3TRQA 3CSHA 5B6MA 2XPEA 2H72A 3ME7A 4MP4A 2YZHA 3F4SA 4TR1B 2PGTA 3R2QA 1EV9A 1SK0A 3TJFA 1BYEA 3GL5A 3LEFA 4MZCA 3GKKA 2R6KA 4ISDA 3UEMA 3QFAC 3CSIA 3BJ5A 4LLRA 5KEJA 2A2RA 4E8HA 5ENUA 3V1WA 2GSTA 3L9SA 3IBHA 1UVZA 4DEJA 4N30A 4IELA 1SK1A 6GSYA 4I8BA 1Q98A 2YWNA 4WEYA 2GSQA 4TRXA 4IGJA 1U3IA 1A8YA 2DJKA 1N8JA 2C1YA 2OE0A 3VK9A 5E4WA 1O81A 1FW1A 2L57A 5A4WA 3ZVJD 4PUAA 5CREA 2H6YA 2I81A 4WR5A 2H6ZA 1B4QA 2PU9C 3ZMKA 3IA1A 2H74A 1BG5A 3D4MA 2YV7A 2OACA 4RI7A 14GSA 2I4AA 4XS6A 1RK4A 3NOFA 4EXJA 2CVBA 1DE2A 2H0GA 2M80A 3MNGA 1G6YA 2OBIA 3IV4A 2R3XA 1T4ZA 4LL4B 2VLVA 5IMCA 3DMLA 1O73A 2YANA 3UVTA 1O85A 1F2EA 3C7MA 3GFKA 4K0GA 2IJYA 3UOMA 3A2WA 2FA4A 1GWCA 3JCML 2IWTA 4YQUA 2B3SA 1A2JA 2YWOA 1YQ1A 2WCIA 1M9AA 4YAVA 1GTBA 1OC8A 2F8AA 1EWXA 5ECSA 4WBJA 2GSRA 3F0IA 3UBLA 1XPVA 4EVMA 3OR5A 2WJUA 3QOUA 1XFLA 3FRCA 2DJ1A 2JZTA 3I43A 3GX0A 4D73A 1GUMA 2G0FA 5G1KA 4KDXA 5G2ZA 4IBPA 3FYGA 2XBIA 4KNDA 4MH2A 1FB6A 3HA9A 5E59A 4CDOA 4GWRA 3IAM2 1X0RA 4POKA 3S9FA 4WBRD 5HFIA 4ZBDA 2FNOA 4XCSA 5HFGA 2C0GA 3MAKA 2B1LA 4JR4A 5HR3A 1KEBA 4XTSA 1ZZYA 3CTGA 2LSTA 1GTIA 1B48A 1BQ7A 1DBYA 4KW6A 1OKTA 2HI7A 2IPAA 4I6XA 4ACSA 2HLSA 1OC9B 3KMNA 4D73B 2NTOA 4WXTA 2KUCA 4GTUA 2R4VA 3IE3A 1K0BA 1Z6MA 3A3TA 2VAFA 1PMTA 4XRDA 2OADA 1EEMA 1TRUA 2KP2A 1XWBA 4KE3A 1GSFA 1A2MA 2FWHA 2CT6A 2MMAA 1PQNA 4PUFC 4JBBA 3P7XA 1M99A 1Z5YE 3GUSA 3M1GA 2GZZA 4CW9A 1XWGA 1S3DA 3F8UA 4TKYA 2YOIA 2DIYA 3HKRA 1OYJA 5IMAA 2L59A 2WGRA 2V2GA 1HYUA 1U88A 1LU4A 2WULA 1U6TA 1QGVA 2P31A 2CZ3A 4ULXA 3LSZA 2H1GA 1M2AA 1I9DA 1ERVA 4N10A 1J08A 1GSYA 2J23A 5B7CA 2KOKA 2B5EA 3GV1A 1AUCA 4KSMA 1QMVA 4TR0A 3F9UA 2G2QA 1SJZA 3HHVA 5EL8A 3KD0A 4K8MA 4ZL8A 2DIZA 1JLWA 2M72A 1Z9HA 1TI3A 2ZUPA 3H8QA 3TCOA 2DBCA 2CZ2A 1MTCA 4V2LA 2LJKA 4O32A 4ZIJA 3GKNA 3IHQA 3RHBA 3VI7A 2ZCTA 3KMOA 4OO5A 2LJAA 3F63A 1EP7A 3KP9A 5ECPB 1XWKA 1XZOA 5D96A 3ERFA 5GSSA 1XIYA 3O76A 3ZITA 2H71A 1JHBA 5CO3A 4I5QA 5CAXA 5H5SA 2JSZA 4OFNA 3HVXA 3GIXA 2GDRA 1MEKA 4MPFA 1A24A 1TU8A 3VWXA 3UJ1A 4GQCA 1GRXA 1URMA 4AGSA 4F03A 3LFLA 1UC7A 4KB3A 2GLRA 4J2FA 1FG4A 4MF7A 1XW6A 5ECMB 2DJJA 4MCUA 5G30A 1KNGA 5H5RA 4JE1A 4JR6A 1SYXA 2LRTA 4NMUA 3O3TA 1EGRA 2EIRA 3W8JA 2C3QA 2VLTA 5FHIA 4EDZA 4RUVA 3TUEA 3J7Yb 1S3CA 2FWFA 2KLXA 2GQMA 5ELGA 2VLUA 3ZL5A 1TRVA 4LL1B 1OVNA 5L71A 3D6IA 3KZQA 3L9UA 3LWAA 4K7OA 3IK7A 1BJXA 1Z7RA 4MJEA 3NZNA 1HD2A 1YZXA 5LNKe 3EWLA 1WE0A 2CVKA 1T1VA 4AJ8A 2L6DA 5IOXA 2DJ3A 1T8EB 2VCXA 2GT5A 2Z9SA 2L5OA 2B7KA 3VWWA 4N0ZA 5IPHA 1A0RP 1R5PA 1EGOA 3KEBA 3PGTA 2C4JA 2MBTA 4I2TA 3UIWA 2WDUA 4G10A 5DALB 1GSQA 4PQIA 2H66A 2H8LA 2LS5A 5F07A 5FWGA 4MDCA 5EY6A 2L6CA 5J3RA 5DVBA 4IJ3A 1TXXA 4H86A 2KHPA 4OCEA 1GNWA 4NV2A 3G7IA 3I9V2 1Z6NA 4WF4A 1ZOFA 1HQOA 5IO0A 1PKZA 1ON4A 4PXOA 3O6TA 4ID0A 2DMLA 1G7EA 2GGTA 5KN0A 1SL0B 1YY7A 4HUAA 1K0AA 3QMXA 2OE1A 2K6VA 4MLYA 3P8WA 1AW9A 4IKHA 1JZRA 1DUGA 2CX4A 3F6FA 2REMA 2VCZA 3GRXA 4YAPA 4TR1A 4DSSA 1XXUA 2V32A 2BTOT 1YF0A 4HEA2 1IYIA 4RI6A 8GSSA 2AV4A 2LJRA 3LYPA 4Q5QA 5DBQA 1XW9A 5ECKB 4F82A 2V41A 3TOTA 2I9HA 1BEDA 2CA8A 4MF6A 5GSTA 4X1UA 1FB0A 2H0HA 4IN0A 4AF2A 2PWJA 2JADA 5AIXA 2GS3A 2BJXA 5J4UA 2WS2A 1YJ6A 1ZYEA 2K8SA 3KIJA 1THOA 3VWVA 4ZBBA 1VF2A 1GTAA 3L9VA 1X5CA 1YKAA 1R7HA 1MDIA 4DSSB 5CRGA 1TJDA 4L5LA 1U3AA 12GSA 3ME8A 3Q6OA 4ECCA 3HJPA 1O8WA 1EOGA 1NSWA 1K0OA 4NHZA 3IAS2 2E2GA 3APSA 4ECJA 4K0NA 3W6GA 2GZPA 4HQSA 2X8HA 4EE0A 2HZFA 2O85A 3VI5A 2LUSA 4CHSA 3ZMLA 3RBTA 6GSWA 2H1AA 4GF0A 1GSDA 3EU3A 4PQHA 5CRWA 1O6JA 3VURA 2H76A 1J0FA 4OFTA 5IQYA 2JZSA 1ZL9A 1WWJA 3U5RE 5DDLA 2IMEA 3TJBA 3UL3A 5C00A 5JCUA 1PA3A 1A0FA 2VCWA 2JL4A 4K1FA 1K0NA 4YQMA 3PH9A 1GSEA 5B8BA 3DXBA 1OKDA 1WMJA 3KTLA 2BMXA 3BOAA 1AQWA 2VO4A 2X8CA 2VUPA 4PGTA 1YF1A 2HE3A 2HRFA 2VD1A 1R26A 4RQXA 5KN3A 2H19A 1A8LA 2PN8A 4GSSA 1V58A 3MSZA 3LORA 5IMZA 2P0GA 3VWUA 1MDKA 4PQ1A 2C0DA 3LQ7A 1MDJA 5EPFA 4WF5A 2KP1A 1YEPA 5J41A 2YN1A 5A4UA 5CYYA 5F0GA 1SKRB 4ILFA 3A5WA 5KN1A 2FCHA 5IO2A 5AGYA 2CAQA 2E2MA 3C71A 3KH7A 1BAYA 1VF3A 1XVQA 2AUVA 4MJBA 3GSTA 5AISA 5J9BA 1VGLA 2I3YA 1X9WB 2DC5A 1MD4A 1OC9A 3IC4A 2H30A 5F06A 2IMKA 4PURA 2RUEA 1TK0B 4TOPA 1O8XA 3GSSA 4NHWA 4HU9A 3RHCA 4DSQA 3QPMA 1HNBA 4XIHA 1GLPA 1HNCA 3F4RA 3HJOA 3VLNA 3CMIA 2GTUA 3IOSA 1GTUA 3GKXA 2WFCA 3CYNA 2ON7A 4BWQA 1SL1B 1K3LA 3DGQA 3APQA 2C0FA 2EC4A 3TGZA 1USBA 4ZILA 1ZYQB 1TK8B 2H73A 2FHEA 3UAPA 4IP6A 3HCZA 5EVOA 1F37A 4ZB6A 6GSSA 1SD9A 2K18A 1VF1A 4MZBA 2H1BA 1SENA 5KN2A 3ZZXA 2GQKA 1A23A 1AC1A 4HDEA 2PBJA 3G7JA 4OMVA 3HD5A 4NWYA 2ES7A 4ZL7A 5COHA 5IMVA 1V9WA 1YDKA 1FHEA 5DCHA 4JRRA 1ERTA 5JWQB 4IS0A 5AIVA 3FHKA 4WR4A 1XBSA 4ZXGA 1GL8A 3GH6A 4EKZA 1E6BA 2N5BA 3HYPA 5HR2A 4BVYA 4L8EA 3LJRA 1NW2A 2YP6A 4FYBA 5B8AA 2AAWA 2F9SA 2MZCA 2FD3A 1CQHA 3HY2A 1K0CA 1NM3A 2O89A 2FWGA 2HSYA 5H5QA 3DRNA 3QD9A 2ZNMA 4GRFA 2CQ9A 4IVFA 4MJAA 3F3RA 3ZFLA 3UVHA 5A5KA 2NBSA 2NPBA 5FT3A 4GCIA 2YCDA 2HZEB 3IPZA 1PX7A 2AB6A 1G6WA 2F8FA 5ECOB 5HR0A 1TK5B 3A2VA 4E8EA 3GNJA 3E3EA 1G7OA 4K7NA 1ZGNA 1KTEA 5JCWA 3IK9A 3HVVA 3M0FA 1EV4A 1YKCA 1GP1A 2DJ2A 4GLTA 2LEGA 2C8UA 4IQAA 2IMIA 1XCCA 3GL3A 3DYRA 4HU7A 5D9TA 1FVJA 1R5AA 1PN9A 3J7Yk 4HQZA 5ECIB 3US3A 5DJLA 3UMAA 4YH2A 1KBNA 3E9JB 3LG6A 1ZMAA 1F3BA 2RM5A 3M9JA 1WIKA 4QQ7A 3TKSC 2E0QA 3KGKA 3GN3A 3WT1A 3FR3A 1XOBA 2WZ9A 1TI1A 1SKSB 4XHMA 4G9HA 1WRYA 2TRCP 3KH9A 5IMDA 3HJMA 2N5AA 1AQXA 3BBYA 3FY7A 5D9XA 1QUWA 2A2SA 4X0XA 4XS4A 3APOA 1B8XA 4O5RA 2VL9A 4KCAA 2H6XA 5F05A 5CP1A 4F0CA 2LKUA 3F6DA 4QL9A 1QK8A 1W89A 2XHFA 3MDKA 2P5RA 5DALA 3GHAA 18GSA 3FR6A 20GSA 2VL2C 1X5EA 2VL3A 4MPGA 2IMFA 3CXGA 1EOHA 2FA8A 2YWMA 4NXIA 3W8SA 4J56E 2LTKA 4OWYA 4BL7A 11GSA 3I69A 5J9CA 4GQFA 2YJ7A 2GSSA 3WGXA 3WT2A 4F2IA 4TXOB 5IPGA 3FKFA 4XS4B 1V2AA 1JFUA 1G0TA 2V1MA 3RPNA 3WD6A 4K9ZA 4TN8A 5D9VA 1Z3EA 2OJLA 1M2BA 4FO5A 3HXSA 3SWLA 3C1RA 3EE2A 3ZLPA 3M3MA 4OFMA 4WKWA 3IRAA 4QL7A 2J9HA 4ZBAA 3LGCA 3U6VA 4EC0A 2VD0A 3MWHA 3D4TA 1H75A 2QC7A 4EL1A 2GT6A 4KCEA 1EZKA 2XPDA 5F8BA 2QSIA 3PINA 1Z7PA 3I6AA 2H70A 3ISOA 6GSVA 2JU5A 1OE8A 1TOFA 2IIYA 3K8NA 3DWVA 4KGIA 1HNAA 3TJKA 2NDOA 3ZIJA 3H4KA 2HYXA 1K0MA 1GLQA 4IHUA 4IP1A 3CTFA 2B5YA 4IQ1A 4FIWA 3DKSA 5CNWA 1F3AA 3BD2A 2GZYA 3ZRDA 2C80A 1ST9A 3SBCA 4BWSA 2C3NA 3ERGA 5JWRB 5D9WA 1JZDA 4YQVA 2LQQA 2K8VA 1TRWA 1TP9A 1B9YC 1T3BA 2LRNA 4I97A 1ERWA 1M7TA 1WPIA 2MYGA 2PUKC 5DJMA 3GURA 3N9JA 2OE3A 4MMMA 2WB9A 3H93A 5ABRA 5AN1A 5ID2A 4HI7A 3FZAA 2A4VA 5JCGA 1V57A 5C04A 1GUHA 1TU7A 2XC2A 2H75A 4ECBA 22GSA 4EUYA 3GX8A 5A4VA 3ED3A 4LA1A 1PGTA 1PKWA 2JSYA 4XRAA 1PX6A 3CSJA 3TB2A 3KM6A 3ZREA 2RLIA 2LNTA 1LJRA 4FH8A 2X99A 1JZOA 4OCFA 2FUG2 1GSSA 2XBQA 1GNEA 5B6NA 3D21A 4V2NA 1X5DA 1PSQA 5ID2B 2V6OA 4HJ2A 2HXKA 1YEXA 1XVWA 16GSA 3RPPA 4NV5A 2D2ZA 2YWIA 5IIZA 1V98A 4L0UA 2YPMA 4MH3A 4FYUA 5HR1A 3EMXA 3P2AA 1DSBA 5ECNB 3N5OA 1Y6EA 4KAEA 5JWOB 4HZ2A 3Q18A 3RAZA 1PL2A 4WETA 4K7IA 1TW9A 2O8VB 3F3QA 2CAIA 1I5GA 2B7JA 1SJ6A 1GH2A 3WGEA 2YNXA 1WOUA 1SJIA 2K9FA 4DVCA 1NHYA 4L0WA 5ELAA 3GMFA 2MBSA 2FY6A 1QFNA 4JZQA 3D22A 1V40A 4MJCA 4Q5NA 6GSTA 3VPTA 9GSSA 1JLVA 2CV4A 4JU5A 4XS1A 5IM9A 1H4OA 4TW5A 2VOCA 1K0DA 3CRUA 5HQPA 2H0IA 1VF4A 3G7YA 4GXZA 3H1NA 4KA0A 3D0ZA 4V1Ap 1E2YA 2FLSA 2PERA 3EC3A 3EMPA 3QAGA 3L0HA 1EEJA 1M0UA 3FK8A 5LD0A 6GSXA 3EURA 1T00A 1FAAA 2QGVA 1QQ2A 2MMNA 3EINA 4V1Ag 1UA5A 3IDVA 3TKPA 2L5LA 2IL3A 3Q19A 3CBUA 1T7PB 2E7PA 5G5EA 2B1KA 4HJMA 4KUNA 7GSSA 1ILOA 3WGDA 5CRDA 2YZUA 4AJ6A 1RQMA 3KCMA 4PNFA 4TXVA 1XWAA 2DLXA 2I1UA 4KX4A 2HSHA 4TR3A 1QXHA 1XOAA 1TRSA 2P5QA 4TVEA 1ABAA 4BVXA 1ACVA 4MK3A 2LQOA 4MF5A 4N0VA 1S3AA 1K3YA 17GSA 3AY8A 5LCZA 1LBKA 2PVQA 4KDYA 1Y25A 1ERUA 4AJ7A 2RM6A 3GH9A 2MMZA 4F0BA 4LMVA 5DQYA 1WJKA 1SU9A 2OA7A 2PMTA 5D73A 1M2DA 3ZVJA 2IMDA 1T4YA 2H1DA 4GSTA 4Q5FA 4ML1A 1EP8A 3A2XA 2VCTA 3HVSA 3KJYA 1AAZA 1SD8A 3TKSA 1M9BA 2X64A 2HZEA 3GKMA 4MABA 3ZFBA 4IJIA 2B5XA 5DCGA 1U87A 1A2LA 2LNSA 2JACA 2RUFA 4RQRA 4JEDA 3VFIA 3LXTA 5G1LA 1WP0A 1BX9A 2MMOA 2CX3A 1PD21 2IFQA 2AJQB 4I2UA 3KTBA 4J57E 1TTZA 1SYRA 1PL1A 2B6MA 5GZZB 4F9ZA 1K3OA 1B4PA 2VL2A 4ECIA 4Z7XA 3HZ4A 19GSA 2EIOA 4OD7A 1AQVA 4O7HA 3VPQA 4PNGA 2HT9A 2AHEA 4KDUA 5D93A 3QR6A 4HOJA 1SK2A 2ALBA 3ZYWA 1IYHA 4KSOA 1CQGA 4X43A 2IN3A 2QKEA 2VCVA 2FGXA 2ON5A 3TDGA 2IFQB 2EIQA 1MD3A 4PX1A 5G5FA 3GTUA 1FVKA 5DQSA 2VCQA 3FZ4A 5IMFA 4O92A 3ZTLA 3TJGA 2X8GA 3M8NA 5GAPD 2HNLA 3M9KA 4KH7A 3Q74A 1AIUA 5HFKA 4ZB8A 3EYTA 3EVIA 3QFBC 2GQLA 1X9MB 5DAKA 3PR8A 2DJ0A 2O87A 2GVPA 3ZIVA 3C8EA 4TXOA 5J5NA 3UBKA 2L4QA 3KP8A 4G19A 4EO3A 2PVOC 1J9BA 1TDIA 5ECRB 1SKWB 4P3YB 3LXZA 3GTUB 4MZWA 1Q4JA 3TRPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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