5IO2A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - c48s mutant
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
158
structure length
158
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGSTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule tags Oxidoreductase
total genus 50
structure length 158
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5io2A00
3KH9A 1TRSA 3IAM2 5D9WA 4IKHA 1Z7RA 5EVOA 1GSSA 1V9WA 4IGJA 2V32A 3ZFBA 5J4UA 1MD4A 18GSA 2KHPA 1TK0B 1SJ6A 4JZQA 8GSSA 1RQMA 1OAZA 2JADA 1J08A 3ED3A 3GKXA 4NAXA 1O73A 1TU8A 4PX1A 3F4RA 4TR3A 2GQMA 1OC3A 3D0ZA 1GNWA 2HE3A 5EY6A 1MEKA 2WB9A 1QXHA 2X8HA 1HQOA 5DJLA 1HD2A 2V6OA 4OCEA 3CRTA 3TJGA 2HI7A 2YANA 3VWXA 1WP0A 3ZMKA 4ECJA 1JZDA 3TJFA 4RQRA 1A24A 3ZMLA 3APOA 3TUEA 1PX7A 1SK0A 2WRTA 3FZ9A 1TRWA 3O3TA 1K0BA 3PINA 3UL3A 2OJLA 5FHIA 3GTUA 3H93A 3ISOA 3U6VA 2RIIA 4K0NA 2O8VB 4MJCA 2JU5A 2HFDA 3M9KA 5J9BA 2LKUA 2H6XA 5ID2B 4F82A 3DKSA 4GQFA 6GSXA 3G7YA 3LFLA 1QUWA 2B1LA 4XS4A 3KZQA 2NVLA 1M0UA 5FWGA 1CQGA 4IP6A 4J57E 4BPYA 3HVSA 4QQ7A 2ZNMA 1TRUA 2HZEB 5G5FA 2XBQA 2OE1A 3KTBA 4TW5A 1B4PA 4V1Ag 4X0XA 4MF7A 1FVJA 2O85A 1A8LA 2WGRA 3AY8A 5HR0A 2VCZA 3BOAA 5G2ZA 5ECIB 1MTCA 1XW6A 3CRUA 4TXVA 4ULXA 1OKTA 3F9UA 5GZZB 4MLYA 4TR1B 1WE0A 1M7TA 3GYKA 2XHFA 1T8EB 2DIZA 4TOPA 2VL2A 3IR4A 2L4CA 3RAZA 2R3XA 1GUHA 4L5LA 2PERA 3QPMA 5LNKe 2O89A 2N5BA 3L0HA 1ZGNA 3QCPA 4EO3A 1Z5YE 2P5RA 2VL3A 4O5RA 4LLRA 2OACA 2YN1A 4ML6A 2RM6A 4H86A 2EC4A 4EXJA 3I69A 3IXRA 2IMDA 4JR4A 3IA1A 3NZNA 4GSSA 1X5EA 5HR1A 4EF0A 4LL1B 2CX3A 3M3MA 1EGOA 4GTUA 4PXOA 1F2EA 5HR3A 1G7OA 2LNSA 4HQZA 2ALBA 3TKRA 5E59A 2H8LA 1I5GA 5DALB 4IVFA 2IJYA 4WBRD 4GSNA 2YOIA 1NHYA 4ZXGA 1T7PB 1PKWA 4NHWA 4TVEA 2IFQB 7GSSA 3M8NA 2A4VA 4HU7A 3VPTA 3LYPA 1SYXA 4XS6A 4JBBA 2E2MA 3LGCA 2IN3A 3TCOA 1U88A 4KA0A 2QGVA 2PVOC 2H1AA 4MPFA 4FH8A 1YKCA 4TXOA 2J23A 1YDKA 5ECLB 4GLTA 4MF5A 3IK7A 1Z7PA 4IBPA 1R7HA 3PH9A 2FY6A 5CREA 1DUGA 2JL4A 5COHA 5AGYA 4PQIA 3W8JA 1T4YA 4EL1A 22GSA 4ZB6A 1F37A 2YZUA 4KCEA 2YWNA 1GLPA 4MK3A 1WPIA 1A8YA 2FLSA 3CMIA 1EV4A 2DJ2A 1PKZA 1YZXA 5IMFA 4ECCA 2VCTA 2L6DA 2V6KA 2GSQA 1PSQA 3HVXA 2R37A 4ECBA 1GLQA 4OMVA 3H79A 1O8WA 5HR2A 4YAVA 2YNXA 1AW9A 1AIUA 3H1NA 4I8BA 4L0WA 1DE1A 1YEPA 1V58A 3GNJA 2X64A 3O6TA 2ON5A 4O7HA 3EC3A 3I43A 1OC9A 2H1GA 3MWHA 4F0BA 1JLWA 5HQPA 3ZIJA 1Y25A 4KDUA 4Q5QA 4PNFA 11GSA 3TJKA 4LMVA 2LQQA 2LQOA 4BVYA 1XW5A 1DBYA 2M72A 2CX4A 2HSHA 3FHKA 1A2LA 2H71A 2C80A 4DSRA 19GSA 3CTFA 2H74A 3G9BA 1B4QA 1TTZA 3DIEA 1XFLA 5JWQB 2FWFA 3SBCA 1UA5A 3TJJA 1GSDA 3KCMA 4KB3A 2L5LA 2YWIA 4DSSA 2K8SA 6GSYA 2FD3A 3GIXA 1UVZA 4MP4A 4K0GA 4AJ6A 3C8EA 3GTUB 2HSYA 5GSSA 1O8XA 2O7KA 3SWLA 1THXA 2CA8A 3QAGA 2PPTA 1TRVA 4IHUA 1GL8A 2O87A 3GHAA 4ZBBA 1WMJA 2H70A 2HZFA 1ZOFA 4TR4A 3DEXA 5F05A 2LUSA 1O81A 1NSWA 3GSSA 4RI6A 4XS4B 2DJJA 3CSHA 4BWSA 3RBTA 1FHEA 3KTLA 5ECOB 9GSSA 2FA8A 1R5PA 2H0IA 2AV4A 5HFKA 3KH7A 4HZ4A 1SL2B 2BJXA 5IMZA 4JR6A 3APQA 1X9SB 5GSTA 4NMUA 4G19A 3EU4A 2C3NA 3Q74A 1E6BA 3CYNA 3VFIA 3F6FA 4L0UA 1XWBA 1F6MC 3FEUA 4KCAA 4F03A 1VF4A 1GTIA 1PA3A 2IWTA 3I6AA 1GNEA 2H0GA 5F06A 2H75A 1VRSD 2A2SA 4BWQA 3RHCA 1TW9A 4IP1A 1JLVA 3QAVA 3HKRA 1K0DA 2DJ1A 4HQSA 4KH7A 3TB2A 1YJ6A 2KP2A 4MH2A 4JE1A 5ECHB 2MMNA 3F63A 3H4KA 4OFTA 4XIHA 2FA4A 3PR8A 3GMFA 1Z3EA 2WJUA 3UIWA 4IS0A 3ZTLA 4G2EA 2PWJA 4J2FA 1X0RA 1PN9A 3HXSA 4IQAA 2VUPA 3JCML 4PQHA 1ZZYA 4I6XA 3UMAA 1AUCA 5B6MA 3EMXA 2DJKA 1F9MA 1M2AA 1XXUA 3FKFA 2LS5A 3ZIVA 1W89A 4K2DA 3Q18A 3R2QA 4EDYA 1TJDA 2H30A 4BA7A 2MMZA 2H66A 2VLVA 3HDCA 2R6KA 1ZMAA 1GSFA 2CVBA 6GSTA 1XZOA 3QD9A 4V2LA 2K8VA 5JCWA 3ZL5A 1HNCA 1OC8A 2F8FA 1GTBA 4TXOB 3DGQA 2XBIA 1OE7A 1ZYEA 2CVDA 5IMDA 3M1GA 3VWVA 3TDGA 3UBLA 1XBSA 1ERUA 4AGSA 1V57A 2REMA 1YF1A 1DE2A 3WD6A 5EPFA 4HDEA 3QAWA 2YV7A 2MMOA 4GQCA 2MZCA 1Y6EA 2DJ0A 3F8UA 3FYGA 1GH2A 2P0GA 5LD0A 3DWVA 2YJ7A 3EWLA 1JFUA 1ZL9A 5ECKB 1T4ZA 4WF5A 2KUCA 3GN3A 2E7PA 12GSA 3HYPA 3IK9A 5G31A 17GSA 2NPBA 3L9VA 1F3AA 5AIXA 1SD9A 4IJ3A 1ABAA 2CZ3A 4I97A 2OBKA 5D9TA 2I81A 3D5JA 1TKDB 5B7CA 5AN1A 1CQHA 4GF0A 3DXBA 5HFGA 4I2TA 1OC9B 5C00A 3HCZA 2G0FA 3MSZA 2M46A 3IC4A 4D73B 2X8GA 3MDKA 4MZBA 2QSIA 3HZ4A 1E2YA 6GSSA 1Z6MA 1A0RP 4ZILA 1QQ2A 1X9MB 2TIRA 1VF2A 4TR0A 4KGIA 2YCDA 1EP7A 1SKWB 1EZKA 2ZCTA 3KP9A 1FVKA 4WEYA 2VO4A 2GZPA 4O92A 5JCUA 1TK8B 2CV4A 5ECNB 1FO5A 5DCHA 4ZBAA 4PQ1A 2YJHA 3TKSC 3GKKA 4DSSB 2GTUA 3BJ5A 3V1WA 3KXOA 1X5DA 4YH2A 2FWHA 6GSVA 5CRDA 2GS3A 5JCGA 2G2QA 3LEFA 1BAYA 1BYEA 3DD3A 2Z9SA 4NXIA 3FZ5A 4MABA 2GSTA 4RQXA 4MZCA 3FW2A 5IPHA 4WF4A 5HFIA 1G0TA 2JZSA 4K7IA 2VLTA 1EOHA 2GZYA 3GURA 4EC0A 5G30A 3UARA 2MMAA 2AHEA 1SENA 1XVWA 4HI7A 2ZUPA 2HXKA 5IO0A 1GTUA 1GSQA 2FNOA 1WJKA 2LJRA 3EVIA 3GH9A 1YKAA 3ZVJA 3LWAA 1MDIA 2LNTA 1K0NA 1Z6NA 4MPGA 2VIMA 4MF6A 1T00A 1LU4A 5D96A 3FY7A 3FR9A 2FHEA 2H19A 3QFAC 4GWRA 4XRAA 2YP6A 2WCIA 4HJMA 4AJ7A 2LEGA 2RUEA 4EE0A 2ES7A 1ERTA 1EGRA 1X5CA 3HJMA 3TRPA 3P2AA 3US3A 2NDOA 2DBCA 1ZCPA 2L59A 4KE3A 4ZIJA 5IIZA 1LBKA 1B9YC 5A5KA 1A2JA 2X8CA 1S3AA 3E3EA 3VI7A 2VCXA 2LRNA 1Q4JA 1N8JA 4RUVA 1OKDA 2EIQA 4HUAA 5KN0A 1WRYA 2VD0A 1M2BA 3TKPA 3VURA 3ERFA 3N5OA 3L78A 4LA1A 1THOA 3ERWA 4FYUA 3M0FA 4N10A 3GKMA 3ME7A 1FB0A 2PGTA 5DQSA 2I1UA 4IELA 5GAPD 5ELAA 3KM6A 5D9VA 5KN3A 2DJ3A 1SL0B 4HEA2 4HJ2A 5CO3A 2RLIA 3GUSA 5ENUA 5IO2A 2GGTA 3QMXA 4PGTA 1AQXA 3RPNA 1Q98A 5LCZA 1GSYA 3F4TA 4K7NA 3Q19A 3VWWA 2FUG2 2L5OA 4POKA 1XWGA 4ZL7A 1C72A 2C3TA 2H76A 3CBUA 3IHQA 1O85A 2AYTA 2I9HA 2BMXA 1EOGA 2GSSA 1PX6A 2M80A 3FR6A 3GSTA 4POLA 2CQ9A 3CTGA 3IAS2 4WR4A 3TKQA 1J0FA 14GSA 4MMMA 2TRXA 2PVQA 2OE3A 1NHOA 4FYCA 3VPQA 1SKSB 3VK9A 3IDVA 1A0FA 3GX0A 4Q5FA 1GUMA 3M9JA 1AXDA 1AC1A 3EURA 3ZLPA 4QL7A 3GX8A 1SK2A 2OE0A 1BQ7A 1OE8A 2AB6A 3GRXA 4JEDA 1K3LA 4LL4B 2VM2A 4FO5A 3EMPA 3G7JA 1KNGA 2B5YA 5J9CA 2C8UA 4GSTA 5FT3A 1ACVA 2VLUA 4L5OA 3FRCA 2V2GA 5DBQA 1B8XA 5INYA 1GWCA 4N0ZA 1DSBA 2DLXA 2WULA 2OADA 1F3BA 1ERVA 2VOCA 5L71A 4OD7A 3TRXA 4N11A 3TRQA 2WFCA 4ZB8A 1FW1A 4KNDA 2F9SA 3A5WA 5DAKA 5CRWA 5CAXA 1ILOA 5ECSA 3CSJA 2DMMA 2GSRA 2I3YA 3D6IA 5A4WA 3UAPA 3C1SA 4EVMA 2B6MA 1KBNA 4DVCA 1NW2A 2VL9A 1GSEA 2C4JA 1EWXA 4YQVA 3VLNA 4KSOA 5C04A 5ECMB 2P5QA 4P3YB 1QMVA 4O32A 2IIYA 2CVKA 2RUFA 3KMNA 1AQWA 2HNLA 4XRDA 4YQUA 2MBSA 4F0CA 4K1FA 2L4QA 1GSUA 4WXTA 1XOAA 2VM1A 4XCSA 3UBKA 6GSUA 3A2VA 2PN8A 2VL2C 5H5SA 4CHSA 5DALA 3MNGA 3DYRA 5CNWA 1T3BA 5IMCA 1TU7A 3HZ8A 1GULA 4OO4A 4IJIA 1HYUA 3LORA 5F07A 3VWUA 3DVWA 3WGXA 4PUAA 1HNBA 3HD5A 2C0DA 4MJBA 1RW1A 4YAPA 1B48A 4DSQA 13GSA 2VAFA 3IV4A 1BG5A 1B9XC 2H1BA 4RI7A 1G6YA 5G1KA 3ZVJD 3ZREA 2HLSA 4XHMA 3IE3A 5H5RA 3P8WA 1A2MA 4OCFA 2B7JA 1O6JA 5B6NA 1KTEA 2OA7A 4Q5NA 5EL8A 10GSA 1ST9A 1ML6A 2H73A 5CP1A 3HY2A 2GQLA 3ZFLA 2AJQB 1NM3A 3BBYA 2PU9C 3BD2A 1MDJA 2HYXA 2MBTA 1JHBA 3WYWA 2GT5A 1M9BA 2WDUA 1YF0A 3A2XA 2H6ZA 5KN1A 2B1KA 4EKZA 3GH6A 2KOKA 3W6GA 4PURA 4TN8A 3TKSE 4JU5A 3LSZA 1M99A 3J7Yb 2LTKA 3PGTA 4K9ZA 5DQYA 3LJRA 2KLXA 3E0UA 2IMFA 3APSA 2VCQA 2E2GA 1PRXA 3DVXA 4YQMA 1U3AA 2K18A 1K0AA 1URMA 2VD1A 3DMLA 2DSAA 2K9FA 5IOXA 3G7IA 3F3RA 4G9HA 4DEJA 1TK5B 3WGDA 3C73A 3KGKA 1XW9A 1H4OA 3LQ7A 1R4WA 3WGEA 4AJ8A 4JRRA 1EEJA 5B8BA 4EUYA 2V1MA 2F3MA 3FR3A 1QFNA 2DIYA 4HS1A 2D2ZA 3F4SA 3MAKA 3QDNA 1TDIA 5IMAA 2GLRA 1JZRA 2HT9A 3UVHA 2QC7A 3TOTA 1U3IA 4POMA 5B8AA 2OBIA 5J3RA 2JZRA 3LG6A 4ZBDA 5DVBA 1SJIA 1JZWA 4E8EA 5D73A 1ON4A 2R5GA 1TOFA 1BEDA 5AISA 1ERWA 2FWGA 1XWCA 5ECPB 1SYRA 5A4UA 2EIOA 1PL2A 5F0GA 5H5QA 2C0FA 3HHVA 4BL7A 4OWYA 5GAND 5AIVA 1SL1B 2YZHA 5CRHA 4KX4A 3S9FA 2F8AA 2A2RA 2CT6A 5DAKB 3UEMA 5F8BA 2LRCA 2MYGA 5IPGA 4MCUA 5KN2A 5IM9A 3FZAA 3ZYWA 1WWJA 1SD8A 2R2JA 2WZ9A 3QFBC 1K0OA 1EP8A 4XTSA 2GDRA 4TKYA 1OVNA 4OFMA 1VGLA 4L8EA 2X99A 2N5FA 4G10A 2GZZA 4OO5A 2IMEA 1SK1A 1V40A 3GV1A 2I4AA 1KEBA 2C1YA 2JZTA 2AUVA 1UC7A 3C71A 1Z9HA 5E4WA 20GSA 3UJ1A 1YQ1A 3WT2A 1PGTA 2K6VA 2P31A 1TI1A 2H01A 1K0MA 3IOSA 2F51A 3RDWA 1QGVA 3I9V2 3LXTA 5A4VA 5D8IA 3L9UA 1BX9A 4FYBA 5JWRB 3OR5A 3Q6OA 3TJBA 1XOBA 3C1RA 2VCVA 5ECQB 4MZWA 4KSMA 3HJOA 1G6WA 3BCIA 5J41A 1GTAA 4QL9A 3TOUA 4PNGA 3RPPA 1T1VA 1PQNA 3C7MA 3K8NA 4Q5RA 3P7XA 2JACA 1OYJA 2C0GA 4EDZA 5IQYA 3KEBA 1I9DA 2JSZA 1IYIA 3KD0A 4MA9A 4V2MA 2YV9A 3O76A 5DDLA 2PUKC 4Z7XA 2LV3A 3H8QA 1YEXA 1SU9A 3GL3A 3KJYA 1N2AA 2GT6A 1HNAA 1JZOA 3LXZA 3UOMA 1GUKA 1AQVA 3ZITA 2QKEA 3D22A 3QR6A 1QK8A 1FG4A 4FIWA 2RM5A 3EINA 1FOVA 3BCKA 2BTOT 3D4MA 1XPVA 2PBJA 1SJZA 5DCGA 3J7Yk 2C3QA 1K3OA 4CDOA 2H72A 1K3YA 2H6YA 1G7EA 4E8HA 1WIKA 2E0QA 4MJAA 2CAIA 2IMIA 4IQ1A 3GA4A 2HRFA 2CAQA 4X1UA 4KDXA 3L4NA 4IW9A 5D9XA 5JWOB 1TXXA 2YPMA 2IPAA 5IMVA 3HJPA 1YY7A 2C0EA 3IRAA 4N0VA 4XS1A 5J5NA 4KAEA 1PMTA 4NV5A 3TGZA 2LJAA 4X43A 2HRNA 4GCIA 4ZL9A 1S3DA 2DC5A 1R5AA 1MD3A 4KDYA 2LJKA 4ACSA 3F6DA 3EYTA 1VF1A 4I2UA 1MDKA 3ERGA 4D73A 1PD21 4F9ZA 4GRFA 4K8MA 4IN0A 3TKSA 4MDCA 3D4TA 3QOUA 4PUFC 4POBA 2R4VA 5ID2A 4KW6A 3EE2A 5CYYA 1XIYA 1EEMA 1PL1A 3U5RE 4I5QA 2XC2A 5ELGA 2J9HA 3GKNA 2PMTA 3LYKA 1S3CA 2JSYA 2FGXA 4AF2A 1R26A 4WKWA 4WETA 2LSTA 2HZEA 4K6XA 3EU3A 4ECIA 3ME8A 2GQKA 1SKRB 2YWMA 4WR5A 1UN2A 2XPDA 2DMLA 4ZL8A 2AAWA 2H0HA 3VI5A 2FCHA 3L9SA 5G5EA 3NIVA 4V1Ap 1J9BA 2B5EA 4OFNA 2B5XA 2EIRA 2KP1A 2NTOA 1XVQA 2NBSA 3A2WA 4TR1A 2WS2A 4ISDA 1V2AA 3GL5A 5ECRB 2H1DA 4K7OA 1A23A 3A3TA 2B7KA 3F3QA 4F2IA 3DRNA 2L57A 3HVVA 4V2NA 5G1LA 2FWEA 2GVPA 4ML1A 4NWYA 16GSA 1LJRA 4GXZA 2IL3A 3F0IA 4LMWA 1W4VA 5KEJA 3IBHA 1V98A 3ZZXA 2TRCP 3NOFA 2CZ2A 3FK8A 3KMOA 3E9JB 5D93A 1WOUA 4CW9A 2LRTA 4NHZA 4HOJA 4KUNA 1M9AA 1U6TA 3HA9A 1RK4A 2IMKA 3N9JA 1VF3A 4ZB9A 3KIJA 1K0CA 4HU9A 2YWOA 3D21A 1USBA 4BVXA 3FZ4A 4ID0A 4NPBA 1TP9A 4ILFA 3CXGA 1GP1A 5DJMA 2IFQA 2B3SA 1FB6A 1U87A 1X9WB 1XCCA 4NV2A 2ON7A 5IOWA 1XWAA 2V41A 3W8SA 4MJEA 4HZ2A 4N30A 1BJXA 1AAZA 3IPZA 3CSIA 4TRXA 1IYHA 4MH3A 1O7UA 1FAAA 4J56E 3WT1A 1H75A 2XPEA 3RHBA 1GRXA 5ABRA 3GFKA 1XWKA 2OKAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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