5IO2A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - c48s mutant
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
158
structure length
158
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGSTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 50
structure length 158
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5io2A00
2CX4A 5DVBA 2NPBA 4ILFA 5DDLA 5D9WA 1MDIA 4GXZA 1USBA 5JCWA 3D22A 3IE3A 3ZRDA 2XHFA 1ML6A 4MJEA 2H01A 2GQLA 1XWGA 2JSZA 1OC9A 1R4WA 4HQSA 1GSEA 1ZL9A 5ID2A 3ZZXA 4HZ2A 3MNGA 2JU5A 3M9JA 3H93A 2PMTA 6GSSA 3VFIA 1ERWA 3VWVA 5FHIA 4FYUA 4MH3A 4MJAA 1EEMA 3WGEA 5CRWA 3HDCA 2PUKC 4G19A 3S9FA 2L4QA 4LA1A 5IOWA 4HEA2 4CHSA 2CT6A 4MF5A 2DJ1A 4JEDA 4OCFA 1J0FA 2HYXA 4HOJA 4P3YB 3LORA 4OFTA 2VO4A 3E9JB 1PD21 1F3BA 1Y25A 4TRXA 1GUHA 2A4VA 3QAGA 3EE2A 3KZQA 3UL3A 2C3QA 1UC7A 4X1UA 2O8VB 2EIRA 2YNXA 2V6KA 3QMXA 5F05A 2V41A 2GDRA 2MMOA 2A2RA 5CO3A 1JHBA 1BEDA 5B6NA 1PSQA 3WYWA 2R4VA 4OWYA 3MSZA 3FR3A 3WGDA 2CZ3A 2C80A 4KH7A 5JWOB 2EIOA 3Q18A 1OC3A 1XXUA 4PUFC 3TGZA 4K0NA 2IL3A 1Z3EA 5JCUA 3FY7A 2PVQA 3MDKA 2YJHA 4I2TA 1FVKA 1U3IA 1YZXA 1TRSA 5G5FA 1DE2A 3P8WA 4NV5A 2R5GA 4I2UA 3QR6A 5IPHA 3KP8A 1U88A 1V40A 4PQHA 1SJZA 2O85A 4HU9A 5CRGA 3IOSA 3O76A 5ELAA 3M1GA 1X9MB 4TXOA 1AIUA 3CRUA 2HE3A 2C3NA 1VF2A 4O92A 2VUPA 3ZIVA 1M2BA 3EMPA 2P5RA 2WGRA 4TR4A 3KGKA 3TJFA 3TKSE 2RUFA 1LBKA 2JADA 1A8YA 2LJRA 3C1RA 1G7OA 2P31A 2DJ3A 1GH2A 1TDIA 2H1DA 2R3XA 3VWWA 3GL5A 2H0GA 4IBPA 1AQVA 2HZEB 1ZYQB 4ZIJA 1M9BA 1U3AA 2KLXA 1CQGA 3UEMA 1EOGA 1GLQA 4AJ8A 3TKQA 2L6CA 3EVIA 1ACVA 1V9WA 1YF1A 1H75A 3VURA 3UMAA 1M7TA 1F9MA 3EU3A 3HJMA 1JLVA 2K6VA 1FHEA 1PN9A 4AGSA 2HXKA 1XPVA 3VPTA 1N2AA 2IN3A 4JR6A 13GSA 1GULA 1M0UA 3RPNA 1S3DA 1EOHA 1BJXA 2VLTA 4CW9A 4DVCA 2O87A 4I5QA 3AY8A 2CZ2A 2ES7A 1A2JA 4O5RA 1GLPA 1RQMA 4I6XA 2FCHA 3NOFA 5CP1A 1A2MA 4GWRA 3UARA 2LJAA 2VCWA 1HYUA 4JBBA 1UN2A 4MPGA 4LMWA 5IIZA 3GURA 4I97A 2H0HA 5IO2A 1I9DA 1K0DA 3LG6A 2VM1A 5DALA 2H6XA 3A5WA 5GAND 1WE0A 1RK4A 3DGQA 4BPYA 1ZZYA 1ZMAA 3TKPA 2VCTA 5GSTA 5ECIB 4EXJA 2GQMA 5GAPD 3C71A 2LJKA 3KH9A 4JRRA 4OD7A 5JCGA 3DD3A 2YANA 1ZYEA 2L4CA 3DKSA 1SL2B 1AAZA 4O7HA 4PX1A 4BL7A 2H75A 2V2GA 3F0IA 3HVVA 2CVBA 5ECPB 2MMNA 1F3AA 3TB2A 3F4RA 4X43A 1TRVA 5HQPA 5HR1A 4K7IA 22GSA 5D9VA 2LKUA 1YY7A 2IJYA 4PQIA 2I9HA 4GSTA 2YZHA 2IMDA 2C0FA 4F03A 1FAAA 3IRAA 4TR0A 5IM9A 5J9BA 5CYYA 3PGTA 2LRCA 4QL9A 1EP7A 4RUVA 1GTUA 4ISDA 2LQOA 2VM2A 3GRXA 4MF7A 2YWMA 4WETA 1OKDA 4GLTA 2OE3A 1XWCA 5HFIA 1GUKA 2YOIA 2VL9A 4TKYA 4V2MA 1K0OA 5D9XA 4OMVA 2V32A 4K9ZA 1WPIA 3F6DA 5LD0A 2BTOT 2K8VA 8GSSA 1TXXA 1IYHA 2QKEA 2GSSA 5F07A 3DIEA 4HS1A 5B7CA 12GSA 2E0QA 1OE8A 3CTGA 4ID0A 3FKFA 4FYCA 3TJGA 4L5OA 1TKDB 4MZBA 1HQOA 2XPDA 4KNDA 5ELGA 1FVJA 3GX8A 1YKAA 1EGRA 1TI3A 4V1Ap 1HNBA 4TR1B 1SYRA 4XS6A 4KW6A 4RI7A 4ULXA 2LNSA 4F2IA 1YF0A 3C1SA 1GSSA 5LNKe 3I69A 3ME7A 4ZXGA 3BCIA 3O3TA 4ZBDA 4MPFA 1GL8A 5ECLB 3E0UA 4MK3A 2X64A 3F3QA 5G2ZA 6GSVA 1OE7A 1R7HA 5HR0A 1A24A 1SK2A 3F4SA 5DBQA 3VPQA 4TXVA 3TJKA 4NHWA 2H1AA 4PURA 2YZUA 4KCAA 2HSHA 3A2VA 2MMZA 1EV4A 1GTAA 5F06A 2JZSA 3W8SA 2R6KA 3GTUB 2FA4A 4PNGA 5ENUA 2H70A 2HZEA 3I9V2 5IMVA 3LSZA 4HUAA 4IQAA 2FUG2 1BQ7A 5IMFA 4MA9A 1WJKA 3ZMKA 2HSYA 2FHEA 1J08A 3ISOA 1TRUA 5CRDA 3GL3A 3HVXA 3CSHA 2DBCA 3V1WA 1QUWA 5IMAA 3GYKA 3ZTLA 3L4NA 2H66A 4OFMA 2O89A 1Z7PA 4KCEA 3TJBA 2GZPA 1MTCA 3DMLA 2B6MA 2OBKA 4I8BA 5KN0A 3HY2A 3TOTA 1HD2A 3EURA 1THXA 2AYTA 1A8LA 3HZ8A 2PGTA 2PBJA 1X5EA 2FD3A 3I6AA 4F82A 2Z9SA 1XBSA 1XVWA 2L5OA 1YKCA 1JZWA 2VCQA 3ERFA 1GSYA 4TOPA 1GNWA 1G6WA 4GTUA 5FWGA 1Z5YE 19GSA 3TRQA 1SKWB 3FZ9A 4GQCA 2PVOC 1O6JA 2IMIA 3QAVA 4LLRA 5JWQB 4YQVA 1E2YA 1X5DA 2B1KA 4XIHA 1GSFA 1Z6MA 5G1KA 3F6FA 4J57E 3R2QA 2A2SA 3GV1A 2K18A 1RW1A 3LQ7A 5COHA 2FNOA 4L5LA 2JACA 2WS2A 4N30A 3UJ1A 4EL1A 1THOA 3VK9A 1K0CA 3M9KA 2M72A 4JU5A 2X8GA 2H6YA 2IMFA 2X8CA 1URMA 4PNFA 4ML1A 3IV4A 5HFGA 2VL2C 2L5LA 1B9XC 2K8SA 4KX4A 5G1LA 1FB6A 4HZ4A 3QCPA 1EWXA 4POBA 4FIWA 3L78A 4ECBA 2VIMA 9GSSA 1O8WA 1BYEA 1X5CA 2PU9C 3LYPA 5J4UA 2LUSA 3ME8A 4GCIA 3I43A 3TOUA 1XFLA 3FK8A 2E2MA 4Q5QA 3D4MA 5H5SA 2JL4A 2PWJA 4MP4A 3KMNA 1KBNA 3TRPA 2F8AA 2HI7A 3G7IA 3W6GA 3IHQA 2IPAA 3FYGA 3CBUA 4TW5A 4XS4B 3D5JA 3N9JA 14GSA 2M46A 2XBIA 2KP2A 1A0RP 4CDOA 3F63A 2JSYA 1A2LA 2F8FA 5DQSA 1O8XA 1XW9A 3OR5A 3QPMA 1DSBA 2CA8A 5HFKA 3F4TA 2VCZA 2WB9A 1Z6NA 4G10A 4KSOA 5D9TA 5IPGA 3LXTA 3SBCA 3GSSA 5AGYA 4DSRA 5FT3A 4TR1A 1OYJA 4YAVA 1A0FA 1TK5B 1M9AA 4TN8A 1BAYA 4GSSA 3Q74A 2BJXA 2ON5A 2RM5A 3NIVA 2AUVA 2GVPA 4YQUA 1GTIA 4EVMA 2YWNA 4BVXA 3ZMLA 1TI1A 1AC1A 3KCMA 2DLXA 2QGVA 2M80A 5G5EA 3KTLA 1ZOFA 4YH2A 1XW5A 4K1FA 1DUGA 1F37A 3UAPA 3CYNA 3KJYA 3SWLA 4KE3A 1H4OA 3FR9A 1EP8A 1B4QA 4AF2A 4MJCA 18GSA 4BWQA 3US3A 1GRXA 3APSA 1Z9HA 4ZB6A 2F3MA 4G9HA 2OBIA 3JCML 3HHVA 1SJIA 1XW6A 3VLNA 2ON7A 1SD9A 2YCDA 4GQFA 2KUCA 1V57A 2V1MA 1J9BA 3IDVA 4BA7A 2HNLA 3CSJA 1TTZA 3VI5A 4Z7XA 2H73A 3H8QA 1AQXA 1SKRB 2TRCP 2OJLA 1HNAA 4DSQA 2TIRA 3U6VA 2F9SA 1SYXA 2B5EA 2CX3A 4ZILA 2B7KA 3GNJA 1NSWA 3HYPA 2GSRA 2YP6A 2D2ZA 4ZB9A 2X8HA 3GIXA 1SL1B 4FYBA 1QFNA 3ZL5A 2OA7A 3UBLA 1WP0A 5DQYA 2OACA 1E6BA 2I81A 3HXSA 4J2FA 1VGLA 2YN1A 1KNGA 5DCGA 3D6IA 2FGXA 2H8LA 2PERA 5KN3A 4NWYA 1ZCPA 1K3YA 4N0VA 2J23A 1F6MC 4HJ2A 1ST9A 1Q98A 1O85A 1W89A 3HKRA 3WD6A 4H86A 3TKRA 4K7NA 2EC4A 3CSIA 1T4ZA 1ILOA 3TDGA 1V98A 2C3TA 2H30A 4GSNA 3P2AA 5IO0A 3F9UA 2NDOA 3DEXA 1NHYA 1C72A 1IYIA 1QK8A 2H1BA 3KMOA 4IQ1A 4EE0A 1MDJA 4TR3A 1XVQA 5IMDA 4QL7A 2N5FA 1PA3A 1AQWA 2CAQA 4GRFA 1VF4A 1PGTA 1ZGNA 2DIZA 1SK0A 3LEFA 3H1NA 1W4VA 3QAWA 1F2EA 4RI6A 4YQMA 3IK7A 3ZIJA 1FOVA 1N8JA 3PR8A 4ACSA 3VI7A 3HVSA 1WWJA 2GLRA 3QDNA 3RHCA 5F0GA 4KGIA 4HJMA 4IS0A 5JWRB 2GQKA 5ECSA 4ECCA 4L0UA 3D4TA 2YWOA 2WFCA 1EGOA 1WOUA 3GHAA 2BMXA 2WCIA 3FRCA 1WMJA 4FH8A 3TKSA 3DVWA 4MJBA 10GSA 1LJRA 2VL3A 2NTOA 3FHKA 3DXBA 1UA5A 4O32A 2OE1A 3C73A 1TOFA 1U6TA 17GSA 2FWHA 5A4WA 2LSTA 4POKA 2DSAA 3TJJA 1FG4A 2VD1A 1I5GA 4OCEA 1K3OA 3GN3A 3IAM2 2PPTA 4G2EA 3WT1A 3UVHA 2C4JA 4KB3A 2FLSA 3FR6A 2GTUA 2C0GA 5DJMA 1MDKA 2DJ0A 1R5PA 3ZYWA 5CNWA 1TW9A 1GUMA 2YJ7A 2AAWA 2DJJA 5A4UA 1T7PB 3UOMA 4IP1A 2R37A 2J9HA 2WDUA 4QQ7A 3KH7A 1R26A 4OFNA 2H19A 4MH2A 5F8BA 4NMUA 3CRTA 5INYA 3HJPA 1LU4A 3LWAA 5D96A 4JR4A 4IGJA 3RDWA 4BVYA 4HQZA 1BG5A 2GZZA 1DBYA 4XHMA 11GSA 3IBHA 4L0WA 2VLVA 5CREA 4EUYA 3GX0A 1XZOA 3ERWA 5B8AA 3J7Yb 2I3YA 5G30A 5C00A 2P0GA 5ECRB 5L71A 1Z7RA 5H5RA 3LXZA 2VAFA 3TRXA 3VWUA 2XBQA 1X9SB 1O7UA 3FZ4A 2QSIA 5ABRA 4IVFA 1TRWA 3ED3A 3L9UA 5EVOA 1QMVA 6GSTA 4XRDA 4HDEA 1PKWA 3C8EA 3APQA 4YAPA 4XTSA 4ECJA 3QFAC 3ZFLA 2CQ9A 2K9FA 4EC0A 1K0BA 2FWEA 2WULA 5ECNB 2AB6A 1R5AA 3QD9A 3KD0A 2WRTA 2XC2A 2HRNA 4K2DA 1PL1A 5EPFA 2VCVA 4F9ZA 1B4PA 1OVNA 2LRNA 2VLUA 3A3TA 3N5OA 5HR3A 2LV3A 3RBTA 4NPBA 4L8EA 2DMLA 4N11A 1QGVA 6GSYA 1SENA 3IA1A 3F3RA 4PQ1A 2X99A 4KDYA 2DJKA 1OC8A 1JFUA 3L9VA 2YV9A 3Q19A 4HU7A 3UIWA 4NV2A 1V58A 4GF0A 4DEJA 2CAIA 3E3EA 4OO5A 1T1VA 4N0ZA 3GKKA 5AN1A 3F8UA 1PKZA 2EIQA 3K8NA 4POLA 2KP1A 1U87A 2OADA 4X0XA 4F0CA 4OO4A 1DE1A 2ZCTA 3ERGA 3KM6A 3LFLA 4D73B 5IMCA 5HR2A 1YDKA 4V2NA 4KAEA 3KIJA 1M2AA 5KN2A 2B5XA 4LL4B 5E59A 3IPZA 1EV9A 1WRYA 2MBTA 2ZUPA 2OE0A 5IOXA 1AUCA 1MD3A 5KEJA 5A4VA 3QFBC 3PINA 2B3SA 1VF3A 4IELA 3ZFBA 7GSSA 5CRHA 1ERUA 2N5AA 4ZBBA 6GSUA 1TK0B 3G7JA 4MF6A 2L6DA 2OKAA 3EU4A 4K7OA 1FW1A 1NW2A 1TU7A 2REMA 4NXIA 3A2XA 1K0AA 3GKMA 2IWTA 3FW2A 4WF5A 5KN1A 1WIKA 2MYGA 4IJ3A 1XWBA 4IP6A 3DVXA 4RQXA 1TU8A 3WGXA 3FZ5A 4MCUA 1GTBA 3QOUA 1T3BA 1XIYA 5J41A 4KA0A 2ZNMA 2CVKA 4WXTA 1SD8A 4NHZA 1B8XA 1SJ6A 1XWAA 1A23A 1BX9A 3UVTA 4MABA 1EZKA 4ZL9A 3WT2A 5B6MA 1M2DA 1K0NA 4ECIA 3EMXA 2O7KA 1ERVA 2FWGA 1YJ6A 1Q4JA 5DAKB 1SL0B 2HT9A 3RPPA 4IN0A 4IJIA 1OAZA 4J56E 2WJUA 2DC5A 3IC4A 2IMKA 2DJ2A 1QXHA 2GGTA 4XS1A 4MDCA 2RM6A 5EY6A 2JZTA 5IMZA 1GNEA 3GTUA 4WR5A 1JZRA 3RHBA 4Q5NA 4NAXA 1GSQA 3LGCA 4TVEA 4AJ6A 2GSQA 3M8NA 5E4WA 2N5BA 1T8EB 2IFQB 1VRSD 2LS5A 3TCOA 2IMEA 4PGTA 2AJQB 2FA8A 2VCXA 4WEYA 1XOAA 4ZL7A 3O6TA 3IXRA 3TUEA 1GSDA 1TP9A 2VD0A 2KHPA 3J7Yk 3DYRA 5ECOB 4ZB8A 1O81A 3KP9A 1SK1A 5J9CA 1S3CA 3ZVJA 4XRAA 2MBSA 5GZZB 3HZ4A 4BWSA 2CV4A 1AW9A 3LYKA 4HI7A 2CVDA 2H74A 4K8MA 1OKTA 1GSUA 5AIVA 4RQRA 4F0BA 1Y6EA 4EDZA 2R2JA 2B5YA 4DSSB 2NBSA 1ABAA 2WZ9A 4ZL8A 3M3MA 1G7EA 4V2LA 4WBJA 2YV7A 2V6OA 4FO5A 5AISA 3LJRA 3ZITA 4KSMA 2GT6A 1JLWA 3UBKA 2LEGA 2H0IA 2E7PA 3EWLA 1CQHA 4KDXA 4MZWA 2E2GA 2I1UA 1FB0A 2B1LA 3W8JA 3ZLPA 3G9BA 2DMMA 4EF0A 3FZAA 1OC9B 2C8UA 5ID2B 2H76A 2H71A 2AV4A 3HD5A 6GSXA 20GSA 2I4AA 3DRNA 4D73A 3GA4A 3PH9A 2GZYA 1S3AA 3G7YA 3FEUA 3D21A 1HNCA 4MMMA 2MMAA 1ERTA 2C0DA 1X0RA 3Q6OA 2HRFA 3DWVA 4JE1A 1V2AA 3HA9A 1KTEA 3CXGA 3EC3A 1G6YA 2YPMA 2F51A 1YEXA 4KUNA 2DIYA 2HLSA 2L59A 2LQQA 2LRTA 2VOCA 1SU9A 3BBYA 3GKNA 3EYTA 2HZFA 1UVZA 2MZCA 3A2WA 4WR4A 1B48A 3L0HA 2H6ZA 4E8HA 4XS4A 3BCKA 3BOAA 3EINA 1PX6A 4IW9A 3GFKA 4POMA 2IIYA 1YQ1A 3U5RE 1PL2A 3GUSA 1JZDA 5GSSA 5ECQB 1O73A 5IQYA 3GH9A 16GSA 5DJLA 2LTKA 2JZRA 4IKHA 4AJ7A 2H72A 3CTFA 5ECHB 1K3LA 2RIIA 4JZQA 2P5QA 2B7JA 5G31A 3ZVJD 4MLYA 3GMFA 4EO3A 1TK8B 2GS3A 6GSWA 4E8EA 3KEBA 3NZNA 3APOA 2L57A 5ECKB 5B8BA 3ZREA 2GSTA 3C7MA 3H4KA 4KDUA 2FY6A 1T4YA 1VF1A 5DAKA 5H5QA 1TJDA 2TRXA 3IR4A 1PX7A 4Q5RA 4TXOB 2GT5A 4IHUA 1GP1A 4PUAA 5A5KA 5CAXA 3RAZA 2G2QA 3TKSC 3H79A 2C1YA 5LCZA 4K6XA 1SKSB 1NM3A 2AHEA 3KXOA 3P90A 1PMTA 4PXOA 1EEJA 3D0ZA 3HJOA 3GKXA 1YEPA 5EL8A 1JZOA 3IAS2 4LMVA 1GWCA 2NVLA 4ZBAA 2YWIA 3MWHA 2IFQA 1M99A 5D73A 3M0FA 4LL1B 2XPEA 3HCZA 4XCSA 3KTBA 5D8IA 1MD4A 3L9SA 2VL2A 3P7XA 4Q5FA 2ALBA 2PN8A 4WF4A 5DCHA 4WBRD 5C04A 5D93A 1KEBA 1XCCA 5ECMB 1AXDA 1PQNA 1NHOA 1B9YC 2H1GA 3GSTA 2RUEA 5AIXA 5J5NA 1K0MA 1X9WB 2RLIA 1FO5A 1PRXA 3VWXA 3GH6A 1T00A 1XOBA 4MZCA 2FWFA 2LNTA 3IK9A 4V1Ag 4EKZA 2G0FA 1XWKA 2HFDA 4DSSA 1QQ2A 3BD2A 2KOKA 4ML6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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