1XZOA

Identification of a disulfide switch in bssco, a member of the sco family of cytochrome c oxidase assembly proteins
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
172
structure length
172
Chain Sequence
QQIKDPLNYEVEPFTFQNQDGKNVSLESLKGEVWLADFIFTNCETICPPMTAHMTDLQKKLKAENIDVRIISFSVDPENDKPKQLKKFAANYPLSFDNWDFLTGYSQSEIEEFALKSFKAIVKKPEGEDQVIHQSSFYLVGPDGKVLKDYNGVENTPYDDIISDVKSASTLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Hypothetical protein ypmQ
publication title Identification of a Disulfide Switch in BsSco, a Member of the Sco Family of Cytochrome c Oxidase Assembly Proteins
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
molecule tags Metal binding protein
total genus 51
structure length 172
sequence length 172
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xzoA00
4MF5A 1G6YA 2YOIA 1FG4A 3GYKA 5JCWA 4G19A 2H01A 4YQMA 5J41A 2H74A 3TKSC 3UL3A 4NV2A 4YQVA 4DSQA 1U6TA 3IAS2 3M9KA 2VIMA 5D9VA 1G7OA 2B6MA 3QCPA 5HR1A 4KDYA 4XS4A 4O5RA 3A5WA 1Q98A 1SKSB 2JZSA 2Z9SA 2HRFA 2GDRA 4HUAA 18GSA 3Q6OA 4NMUA 5IMCA 1K0MA 1MDIA 2KHPA 4V1Ag 1TDIA 3LJRA 1EWXA 2L5LA 5ELAA 4CDOA 5ECIB 1A8YA 2H1GA 4TR4A 5DJMA 2M72A 4TN8A 1G7EA 1VF2A 4TR0A 5EY6A 4K0GA 4QQ7A 3GA4A 1K0NA 3L0HA 2JZTA 3ZIVA 1S3DA 3G7YA 1YEPA 3HHVA 1W89A 3G7JA 3IAM2 1GSSA 1F9MA 5ELGA 4ISDA 3GV1A 4O32A 4F0CA 3FR3A 5ECOB 4I5QA 4POKA 3GFKA 3TJKA 3EWLA 5CREA 4MF6A 5IMAA 3KEBA 1FB6A 1U87A 4ZB9A 5CRHA 2ZCTA 2RUEA 7GSSA 2R2JA 3DRNA 1JLVA 4ZBAA 1GTAA 1GUHA 4LLRA 4WR4A 4YAPA 1LBKA 3M9JA 5COHA 4DSRA 1GULA 4HJ2A 3W8SA 1TOFA 5D8IA 3F63A 4IP6A 2FD3A 2FA8A 5G5EA 3WD6A 4ZXGA 1QQ2A 3TOTA 3F6FA 2O7KA 2DIYA 5JWOB 2KLXA 4G10A 5ECLB 4KX4A 1TRSA 5D9WA 1JFUA 5J9CA 2HSYA 1R4WA 2C0FA 3APSA 4ILFA 4WEYA 8GSSA 1Z6MA 4MA9A 3DWVA 9GSSA 2YPMA 1UVZA 1ILOA 2FCHA 4ECCA 1IYHA 3EU4A 4JBBA 1SD8A 1ABAA 4K7OA 2E7PA 2YCDA 4HZ4A 1KTEA 1WOUA 1XPVA 4IKHA 5KN0A 2CZ3A 3TKSA 2B3SA 1YEXA 2YWNA 2VOCA 4L0UA 2B5EA 3FRCA 3G9BA 5F8BA 3QDNA 5IM9A 4HU7A 1OC9B 1GSYA 1NM3A 3FZ5A 2FWGA 2IL3A 2PUKC 1TW9A 2VLVA 2VCVA 3GKKA 1R5AA 1OAZA 3C73A 4PQHA 2LEGA 3ME7A 5H5SA 1SJZA 2LS5A 3FHKA 1W4VA 2A2RA 2GLRA 5J4UA 3LORA 2C0EA 4X43A 2H66A 2YNXA 5L71A 1R7HA 4J57E 4X0XA 1U3AA 3FZAA 3QOUA 2V6KA 2C0DA 1CQHA 3L9UA 3UEMA 2BMXA 1GH2A 2B1KA 4AJ6A 4IELA 4XRDA 2F3MA 3A2VA 2H0IA 3GX0A 4E8HA 1YY7A 1Z5YE 3GKMA 3H1NA 4IS0A 1A23A 4MJAA 2G0FA 1B9YC 1SK0A 4I2UA 3ZMKA 3IOSA 14GSA 5A5KA 4I8BA 4PNGA 1OC3A 3VPQA 2HLSA 2CV4A 3VWWA 4ZL7A 1ZL9A 6GSXA 2VCWA 3NOFA 3NIVA 1XVQA 2H0HA 3D22A 5ECHB 2FHEA 1AXDA 2V1MA 3KP9A 5H5RA 5LCZA 6GSTA 3BCKA 1EEMA 1XOBA 3ERGA 1V98A 3PINA 4ACSA 4V2MA 3UARA 2CAQA 2YJ7A 4MP4A 1SK1A 1UA5A 3LXZA 4MZWA 5CP1A 2H0GA 3R2QA 13GSA 2LRNA 2C1YA 1XWBA 5ECPB 1EOGA 2IN3A 1F2EA 3TJGA 1M2DA 1SD9A 4GQCA 1A0FA 4LL4B 5IMVA 4EC0A 4L0WA 3EMPA 1AQXA 2HE3A 4V2LA 3KGKA 1SYRA 3PR8A 5KN3A 2C0GA 3LQ7A 1K0OA 3ZLPA 3DKSA 1QFNA 4MJBA 3PGTA 1O7UA 4I2TA 4P3YB 1YKCA 2R37A 1BYEA 4KAEA 2B5XA 5DDLA 1OC9A 3N9JA 1XW6A 5F0GA 3GIXA 4F2IA 2VLTA 1X5DA 1Y6EA 1AUCA 3UBLA 5B8BA 4ZBBA 2XPDA 1GTIA 1UN2A 4F03A 2N5BA 3FK8A 4ZL8A 5IQYA 3DMLA 5CO3A 10GSA 2LJAA 4GXZA 2GSQA 3QAGA 1XWGA 3UVTA 2GSSA 2YV7A 3IBHA 3A2XA 2DBCA 3BCIA 3US3A 1MDJA 4MDCA 5B7CA 3FEUA 3GSTA 5C04A 3TKRA 4F9ZA 3W8JA 3MWHA 3VURA 2REMA 2GSTA 2DJ2A 3GN3A 4N30A 3M8NA 3F9UA 4O7HA 3VPTA 1XFLA 4Z7XA 5AIXA 4TR1A 6GSSA 1URMA 2RUFA 1T4YA 17GSA 2NVLA 5AGYA 4XIHA 4V1Ap 2ZNMA 1BJXA 2V2GA 3KTBA 4MPFA 4FO5A 4EF0A 5HQPA 4KGIA 3EMXA 1ON4A 2OBIA 2IMIA 1PRXA 2IPAA 5HFKA 5CRGA 4X1UA 5H5QA 3CRUA 2HT9A 4Q5RA 2A2SA 4E8EA 3ZL5A 1PMTA 2BJXA 3ZRDA 2VD0A 2OBKA 3ZVJA 4FYCA 4Q5NA 1XZOA 1NSWA 1OVNA 3F3RA 3IRAA 4I97A 4OO5A 1A8LA 4FYBA 1S3CA 3VI7A 1H75A 3TRPA 1DSBA 1YKAA 1O6JA 2K6VA 1HYUA 3FR6A 5LD0A 4ML6A 3QAVA 3TKQA 2PBJA 2H1AA 2DJ0A 2LRTA 4IJ3A 4EKZA 2DJJA 5F05A 3C1SA 3ZMLA 1EGOA 2H6ZA 1JHBA 2QGVA 2B7JA 3TKPA 3I9V2 2KOKA 3H79A 3FYGA 3APQA 1T7PB 5IO0A 2GZZA 2MBTA 3W6GA 1OKDA 2YZHA 4MJEA 2QSIA 1JZOA 1T00A 3TKSE 1PN9A 1AIUA 2E2MA 2TRCP 2VAFA 3ISOA 2E0QA 2H76A 4TOPA 2AJQB 3E0UA 4WBRD 4ZB8A 4GQFA 4HQZA 1XXUA 2OE3A 2TRXA 6GSWA 2K9FA 1TU7A 2VCXA 3KMOA 4I6XA 3ZYWA 3L9VA 2B1LA 2XC2A 1TRVA 22GSA 1T1VA 5J9BA 1SKWB 2YZUA 2LRCA 4FH8A 2O85A 2I81A 4N0VA 3KXOA 1Z7RA 2X8CA 1Z6NA 4DSSB 1HNCA 3UBKA 5ECRB 4PGTA 2F9SA 2P0GA 2JL4A 1PL1A 3HDCA 5IPHA 5D93A 1JZWA 3RPPA 1SKRB 1JZDA 4GCIA 3M1GA 3KD0A 2RLIA 1MDKA 1EOHA 5IO2A 3P7XA 4MABA 4DEJA 2PGTA 3EINA 3KJYA 5ECSA 2MBSA 1GLQA 2R4VA 1K0DA 3EYTA 1GWCA 4TRXA 4KW6A 2JU5A 2WB9A 5DALB 2GVPA 3QMXA 2H71A 5A4VA 1ML6A 16GSA 3GURA 1Z3EA 1F37A 5D9TA 2H72A 1OE8A 3LWAA 1NW2A 1OYJA 2M46A 3APOA 4F0BA 4K1FA 2GQKA 2RM5A 4MH3A 2L6CA 1SJIA 3IHQA 4NWYA 2CX4A 4V2NA 4NXIA 1O81A 4MPGA 5ENUA 1GSEA 2OE0A 2GZPA 1PSQA 3VWXA 1WIKA 1XWAA 5DQSA 2PPTA 1TI1A 1ERUA 2RM6A 2GQLA 1HNBA 4G9HA 4OFTA 1ZYQB 3ZZXA 1K3OA 1XWKA 5ECNB 3KZQA 1Z9HA 4OWYA 1K3YA 3CSHA 3QAWA 4ZB6A 2B7KA 1ZMAA 3QPMA 1O8WA 2KP2A 5EL8A 2D2ZA 3F3QA 2O87A 4CHSA 1TRWA 4AJ8A 1KEBA 3DEXA 1YF0A 4WETA 5IMZA 4IJIA 2DC5A 3V1WA 1X9MB 3HZ8A 3IE3A 5DAKB 1I9DA 2C4JA 1R5PA 1HNAA 2JSZA 3I69A 1B48A 4HEA2 5HR0A 1M9BA 3ME8A 3J7Yk 11GSA 3D4TA 1QGVA 5JWQB 5DVBA 4AGSA 4IHUA 4GWRA 4KH7A 3VWVA 4MF7A 1S3AA 1FVKA 1DE2A 3FKFA 3AY8A 4DSSA 4KUNA 4WF5A 5DBQA 2NTOA 2P5RA 4PURA 3JCML 1THOA 4HZ2A 4NPBA 4L5LA 4TR1B 4KDUA 1R26A 1GSUA 1QMVA 2H75A 1VGLA 2LNSA 1BQ7A 2O8VB 4ZL9A 4PUAA 2DMMA 2LV3A 4RI7A 4OFNA 2L57A 3RAZA 2DIZA 3LFLA 4TXVA 3RHCA 3U5RE 5AN1A 3WT2A 1QXHA 2P31A 5DALA 4TXOA 5G31A 2MMNA 1A0RP 2QC7A 5LNKe 4HDEA 3GHAA 3U6VA 4POBA 1X9SB 2I1UA 3DGQA 3UIWA 1PGTA 2PVQA 2WJUA 4K2DA 1TU8A 4POMA 3RDWA 4Q5FA 1VF4A 2WGRA 1BX9A 3EURA 4ECJA 4XTSA 1F3AA 2J23A 1EEJA 1XWCA 3TJJA 3E3EA 4GSTA 3TGZA 5ABRA 5DCHA 4HJMA 4D73B 1Z7PA 4ECBA 1V2AA 2LQOA 2H8LA 4KCEA 3L78A 2FGXA 5IIZA 1IYIA 3CBUA 2XHFA 2DJ3A 4L8EA 2ES7A 2MMOA 1WMJA 1PQNA 4PNFA 4NHZA 4L5OA 1GTBA 2LTKA 2L5OA 1SL0B 2DJKA 1G0TA 2IMFA 4OMVA 3MSZA 5FT3A 2JSYA 2H30A 19GSA 2FWFA 4NAXA 3DVXA 2AAWA 1H4OA 5F06A 1Y25A 2K8SA 1WE0A 4JZQA 5D9XA 3ERFA 4TKYA 1VF3A 5AISA 3TRXA 2L59A 3GL5A 5DAKA 2IJYA 1WJKA 4O92A 2O89A 4OO4A 1EGRA 3F4SA 3ED3A 1M7TA 2AB6A 2DJ1A 1U88A 4BA7A 2CAIA 5A4WA 2GTUA 2VUPA 3EE2A 1A24A 5KEJA 4TVEA 1YZXA 3ZTLA 2I4AA 1TK8B 1AQVA 4XS1A 5GZZB 3NZNA 1KBNA 1MD3A 3D0ZA 3UJ1A 1EP7A 1TP9A 2C80A 1JZRA 1MD4A 5GSSA 1X9WB 4HOJA 4RQXA 2PU9C 3L9SA 4WF4A 2CX3A 3KTLA 2HRNA 3M3MA 4LL1B 2EIQA 5EVOA 2J9HA 3H93A 2GS3A 1SL1B 4F82A 3GX8A 4FYUA 5G1KA 3S9FA 2GGTA 1SU9A 4K0NA 2IIYA 2JADA 3CTGA 2K18A 4ID0A 2LKUA 3FW2A 3D5JA 2I9HA 4MZBA 3TUEA 5IOWA 3TCOA 4PUFC 2HSHA 1V40A 1BAYA 1I5GA 4N10A 4ML1A 2H6XA 3Q19A 1TXXA 3BD2A 4KA0A 1B4PA 4JRRA 4TR3A 2DMLA 2VD1A 6GSYA 3TJFA 3HD5A 3LG6A 1ERWA 3UVHA 4EDZA 3GTUB 5AIVA 4QL9A 1GSFA 4JEDA 2VL3A 3WGXA 2ALBA 1M9AA 4JR4A 2VL2C 1J08A 1UC7A 3IK7A 4PXOA 2QKEA 4D73A 3EC3A 2XBQA 3SWLA 1GUMA 4MLYA 1GLPA 4IP1A 2MZCA 3MAKA 2IFQA 3TDGA 1GL8A 1NHOA 3GH9A 1RQMA 2CVKA 4PQIA 2EC4A 3FY7A 3QFAC 4G2EA 1V57A 2E2GA 1TI3A 1PKWA 2OA7A 3GKNA 4BVYA 3HVSA 3IK9A 5G2ZA 1TKDB 4N11A 1ZOFA 2R6KA 2WZ9A 1B8XA 2FA4A 1O73A 2AV4A 1XCCA 1XBSA 2HYXA 4MJCA 1KNGA 2F8FA 4RI6A 4KDXA 3HCZA 4KB3A 1WP0A 1ZZYA 2CA8A 1AW9A 2PWJA 3KCMA 3A3TA 3IC4A 1V58A 5JWRB 5ECMB 2VCQA 2H1BA 3MNGA 1SENA 4EL1A 1O85A 3GH6A 3UMAA 2X8GA 1TJDA 12GSA 3KM6A 2VL9A 1A2JA 2HZEA 2X8HA 2FUG2 4OD7A 2V6OA 4N0ZA 3BJ5A 3Q74A 3H4KA 3M0FA 4K7NA 2KP1A 3D21A 2CVDA 1X5EA 1TK5B 3OR5A 2VCTA 3CXGA 3HXSA 4J56E 3LXTA 3GSSA 1T8EB 4LMVA 3RPNA 1Q4JA 3SBCA 4KCAA 4ZILA 2H70A 5CAXA 2I3YA 3GNJA 2AUVA 3G7IA 2RIIA 1J9BA 2VM2A 2C3NA 3UOMA 5G30A 1THXA 3TOUA 1GUKA 2OACA 1K0CA 2PVOC 2IMKA 1OE7A 1LU4A 2OJLA 3F6DA 5D96A 2GT5A 3HY2A 1GTUA 4IQAA 2YJHA 1F3BA 2C3QA 1F6MC 4AJ7A 4IVFA 4TXOB 5ECQB 2IMDA 3CRTA 3BOAA 1V9WA 4MZCA 3GTUA 5GSTA 1K0BA 6GSVA 2VL2A 1ERTA 1MTCA 4MH2A 4ZIJA 4H86A 2GZYA 4EO3A 1RK4A 1AC1A 3FZ4A 2LSTA 4XHMA 5D73A 4KSMA 5C00A 4OCFA 1BEDA 4BWQA 2NDOA 1WWJA 4GF0A 3HJMA 2WRTA 2YV9A 2YANA 4LA1A 1OC8A 1NHYA 3EVIA 3LGCA 5A4UA 2A4VA 4NHWA 3EU3A 1GNWA 1JLWA 3P90A 4HQSA 4YH2A 1FO5A 2X99A 4MMMA 1EZKA 2WCIA 1K3LA 3QFBC 3CYNA 2N5FA 1SL2B 2PN8A 3DIEA 1ST9A 1PA3A 5J3RA 3L4NA 4RUVA 1TRUA 3DYRA 1E2YA 2OADA 3WT1A 3DVWA 4DVCA 3ZIJA 2WS2A 3ZVJD 2HI7A 20GSA 2LJRA 2VCZA 3MDKA 3IR4A 3D6IA 3GL3A 4IQ1A 2GQMA 2TIRA 4TW5A 1DUGA 3KIJA 2HFDA 2VM1A 2P5QA 4PX1A 2OE1A 1A2LA 1GP1A 1FAAA 4QL7A 4ZBDA 4WXTA 3RHBA 2M80A 2CZ2A 4GLTA 3TJBA 4OCEA 1ERVA 3IXRA 3LEFA 4BVXA 1DBYA 5ECKB 2LQQA 2V32A 5FHIA 3O3TA 5ID2B 5GAPD 1GNEA 2MMZA 5KN2A 4GSNA 5IMDA 5E4WA 2BTOT 2YP6A 3KP8A 4BL7A 1CQGA 3CSIA 2KUCA 5E59A 3HKRA 6GSUA 1M2BA 2FWHA 2NPBA 3GUSA 2N5AA 4EDYA 2OKAA 1ZCPA 3HVVA 1GSDA 1GSQA 2PERA 1E6BA 1SJ6A 3P2AA 2YWOA 3F4RA 2MMAA 4BPYA 2WFCA 5CRDA 2AYTA 1OKTA 1WRYA 3D4MA 4JR6A 2JZRA 4NV5A 2VLUA 4GSSA 1C72A 3A2WA 3HJPA 2K8VA 4WKWA 4JU5A 3IV4A 2GT6A 3HZ4A 5FWGA 1PX6A 2LNTA 4IW9A 3FZ9A 3QR6A 1XW5A 1QUWA 1RW1A 4HI7A 3IPZA 4MCUA 1FOVA 3GMFA 5B6MA 5EPFA 4JE1A 2H1DA 1B9XC 2G2QA 2L6DA 1FB0A 1J0FA 1T3BA 2EIOA 1B4QA 3HJOA 4RQRA 2LUSA 5G5FA 2F51A 5HFGA 1HQOA 4KE3A 4KNDA 3F0IA 2CT6A 5IMFA 2DLXA 3P8WA 1ZGNA 4FIWA 5B8AA 5DJLA 1YJ6A 2WDUA 3HA9A 1G6WA 3VI5A 2IFQB 3IA1A 1AQWA 4BWSA 4CW9A 1N8JA 2YN1A 4EUYA 3QD9A 1EP8A 3H8QA 2FNOA 4HS1A 1PX7A 3DD3A 3ERWA 2AHEA 1USBA 1TTZA 5INYA 3C8EA 1X5CA 1YQ1A 1M2AA 2FWEA 1PD21 2DSAA 1YF1A 2IWTA 1T4ZA 4GRFA 2XPEA 2LJKA 3O76A 5JCUA 2CVBA 4XRAA 5IOXA 2B5YA 4AF2A 2CQ9A 1AAZA 3F8UA 4HU9A 5KN1A 3GRXA 2VO4A 1SK2A 1YDKA 3GKXA 3VFIA 2X64A 1A2MA 4ECIA 3HVXA 3ZFLA 1EV9A 1FHEA 2MYGA 2C3TA 1M99A 3PH9A 3ZITA 3CSJA 5HFIA 2HZEB 4KSOA 5ID2A 4XCSA 3I6AA 2H6YA 5CYYA 4MK3A 3WGEA 5CNWA 4XS4B 2IMEA 5B6NA 4POLA 3Q18A 4GTUA 3O6TA 3N5OA 3IDVA 1SYXA 2ON7A 3ZFBA 2C8UA 2ZUPA 3WYWA 2NBSA 2L4QA 1K0AA 5J5NA 1MEKA 2R5GA 3KH9A 3FR9A 3J7Yb 5IPGA 1GRXA 2GSRA 4EXJA 4K6XA 1WPIA 3LSZA 4J2FA 2R3XA 2V41A 1LJRA 1XOAA 4PQ1A 3C1RA 3TRQA 4IN0A 1U3IA 2FY6A 5HR3A 3RBTA 1M0UA 3I43A 4K7IA 4K9ZA 1XVWA 4EE0A 5GAND 3CMIA 1FVJA 2YWIA 1HD2A 5F07A 1VRSD 5CRWA 3BBYA 1ZYEA 2WULA 2FLSA 3LYKA 2XBIA 2HXKA 3KMNA 4YQUA 1XIYA 5DCGA 1DE1A 1PKZA 4XS6A 1EV4A 3C7MA 2HNLA 2L4CA 1PL2A 3CTFA 3HYPA 1VF1A 3E9JB 4WBJA 4EVMA 3WGDA 4WR5A 1BG5A 4IGJA 5DQYA 2HZFA 4Q5QA 3LYPA 1TK0B 1FW1A 4IBPA 1N2AA 2H73A 4K8MA 2YWMA 2H19A 2F8AA 1QK8A 4ULXA 3C71A 3K8NA 1ACVA 4YAVA 3ZREA 2PMTA 3TB2A 5G1LA 2JACA 4OFMA 5JCGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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