1Z3E | Genus

Total Genus 35

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	35
sequence length	119
structure length	119
Chain Sequence	HMVTLYTSPSCTSCRKARAWLEEHEIPFVERNIFSEPLSIDEIKQILRMTEDGTDEIISTRSKVFQKLNVNVESMPLQDLYRLINEHPGLLRRPIIIDEKRLQVGYNEDEIRRFLPRKV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of the Bacillus subtilis anti-alpha, global transcriptional regulator, Spx, in complex with the {alpha} C-terminal domain of RNA polymerase pubmed doi rcsb
molecule tags	Transcription
source organism	Bacillus subtilis
molecule keywords	Regulatory protein spx
total genus	35
structure length	119
sequence length	119
ec nomenclature
pdb deposition date	2005-03-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF03960	ArsC	ArsC family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1z3eA00

3RAZA 2H75A 2ZUPA 1XFLA 5ELAA 3LORA 1GRXA 5L71A 2WFCA 4MF5A 5HR2A 4TR0A 2R5GA 4EF0A 3FEUA 4MDCA 4ML1A 5ECNB 2CA8A 2LNSA 5D9TA 2CZ3A 1PX6A 19GSA 1TOFA 4PUFC 2AAWA 2NVLA 4TXOA 5EL8A 3FZ9A 2R37A 2C0DA 4TRXA 3Q74A 2FY6A 2MZCA 1K0AA 3D5JA 1R26A 4FYBA 2HI7A 3LSZA 2R2JA 1JLWA 1X5DA 3TKSC 1T4YA 2CAIA 4FH8A 2RM5A 4JU5A 5HR1A 2DBCA 2ON7A 4EXJA 1J08A 3O76A 2GQKA 2QKEA 5G31A 3GRXA 5IPHA 3BCIA 2H6XA 5GZZB 1OYJA 2IFQB 3QPMA 3ZMLA 3F0IA 3ZVJD 3KEBA 2OE1A 2OADA 5J9CA 5J4UA 2YN1A 2YZUA 3IA1A 1TDIA 1E6BA 1PSQA 2IMEA 1WWJA 2GS3A 3SWLA 2DLXA 2LQQA 12GSA 3CBUA 1GTBA 2XPEA 1GWCA 2YWOA 1SKRB 3UIWA 3ZVJA 4WF4A 1TK8B 3MSZA 1GSYA 1G7EA 2LJAA 2DC5A 2R3XA 1S3CA 4ZILA 4E8HA 4N0ZA 2H6YA 4RI7A 4WKWA 3CYNA 2P5RA 4HZ2A 5F06A 3FR6A 1AQWA 1O81A 1X0RA 4NWYA 4IGJA 5ECOB 3CRTA 1GP1A 2D2ZA 4I6XA 1PMTA 3GSTA 3APOA 4O92A 3TCOA 5JCUA 4YQVA 3ZRDA 1F37A 3GFKA 1HD2A 4LL1B 1BG5A 3IAM2 1MDIA 3ZREA 4IP1A 1FAAA 2E2GA 2G0FA 1Z6NA 4K9ZA 2B5EA 1IYHA 4HDEA 4KCEA 1WMJA 4G10A 1KBNA 2MMOA 5EY6A 1UA5A 3H4KA 2C8UA 4KSMA 2VO4A 1CQHA 3EU4A 3HHVA 4IVFA 2VCWA 1FB0A 3TJKA 1AXDA 3GURA 4KNDA 1PGTA 2X8HA 5FT3A 3N5OA 1A2JA 3HZ8A 1CQGA 1X5CA 1JZWA 1TTZA 2H73A 4XTSA 5IO2A 1T3BA 1ZCPA 4WBRD 3DD3A 4IQ1A 1SKSB 1OE7A 5JCGA 3I69A 2FLSA 4ECBA 3GX0A 2RM6A 1PKWA 9GSSA 4IBPA 4IW9A 2LJRA 4K6XA 2ZCTA 4OCFA 2B7JA 4RQRA 4K7NA 2VLTA 3M3MA 5KEJA 1MTCA 4WEYA 2V1MA 2H01A 1M2BA 5A4UA 3G9BA 4XS4A 2F8FA 1FG4A 5A4WA 2H0IA 2LQOA 2F3MA 2VCXA 4GLTA 1O7UA 4AJ6A 3F8UA 4AF2A 1Z6MA 1DSBA 1U3AA 4HUAA 4NV2A 3GTUA 1U6TA 4ML6A 1Y6EA 1WOUA 2RUEA 6GSTA 3GA4A 3DWVA 2NTOA 4X0XA 4N30A 4YH2A 4MF7A 3QDNA 4MJCA 2GQLA 3BD2A 4N11A 4J2FA 3C1RA 5B7CA 1NM3A 1Z7PA 5G1KA 3CTGA 1BYEA 5KN0A 2FCHA 5C04A 5ELGA 1O8WA 2H30A 3TOTA 5LD0A 4K7OA 4EDZA 1PKZA 1XOAA 5J5NA 2ES7A 4IP6A 4MZWA 1F6MC 5LNKe 5IM9A 4IN0A 4EDYA 3KH9A 2F51A 4KDXA 3DVWA 3EURA 2OBKA 1WRYA 4POMA 4BWQA 3FZ5A 4TVEA 3KCMA 3ZL5A 3WGXA 2TIRA 1GTAA 2L6DA 1TI3A 2CX4A 3J7Yb 3C8EA 1A8LA 4JR4A 4XCSA 1GNEA 2FWFA 2GT5A 4BVYA 1SYRA 2YWIA 3D4TA 4PURA 2G2QA 3A2WA 3TKPA 1F2EA 4EKZA 4LA1A 2GSTA 4OFTA 1QGVA 1JZOA 1ZL9A 3WT2A 4I8BA 1R4WA 3D22A 5ECHB 1VF2A 4ZBBA 2IPAA 4KB3A 1ML6A 3LJRA 2CVBA 2FD3A 1T7PB 4BL7A 5AGYA 3VWWA 4H86A 5B6MA 4IS0A 4O32A 2RUFA 1MDJA 1Z5YE 3HCZA 1X9SB 2E0QA 2KOKA 2KP1A 3UAPA 2R4VA 2VL2A 2H8LA 1SD8A 3QFAC 3HVVA 1U87A 3GNJA 2GSRA 1EOHA 2GVPA 1M99A 1YF0A 3QOUA 2VCTA 3ZIVA 1JZRA 5AN1A 1J9BA 3IBHA 3UBLA 1AAZA 1GLQA 2J23A 1G0TA 1V98A 2IMDA 4G2EA 2N5FA 6GSSA 1MD4A 1W89A 3DRNA 3HDCA 2GQMA 5ID2A 1ACVA 3PINA 3VWXA 1EWXA 1PRXA 1ST9A 4ID0A 4I97A 3UARA 3LXTA 2H71A 1B8XA 2NBSA 5DQYA 3F9UA 2P0GA 1ERTA 1Y25A 1X9WB 4L0UA 4XS6A 4OCEA 2P31A 4AJ7A 5DCHA 22GSA 4IJIA 3KMOA 3KXOA 3WYWA 1TK5B 2PN8A 3LGCA 2RIIA 3EYTA 2L6CA 4OO4A 4MA9A 5KN1A 5F07A 4IELA 3QAWA 1YEPA 3M8NA 3RDWA 4RI6A 3D21A 4NHZA 2X64A 1PL1A 5ECMB 5CRGA 4JEDA 5D73A 18GSA 1X5EA 2GSQA 5IMAA 2QSIA 4ZB9A 4RQXA 2N5AA 2VCVA 2CV4A 2K6VA 2PBJA 2K8VA 1NSWA 2JZSA 4Q5RA 5CP1A 5IMDA 1SL2B 3MAKA 2C1YA 3HJPA 5C00A 1ZOFA 3H93A 4X43A 4LLRA 1U3IA 3ERWA 3F6DA 4TOPA 3KMNA 3US3A 2A4VA 2E7PA 11GSA 3WT1A 3ERFA 3NIVA 3G7YA 3IK9A 1K0DA 3DXBA 3HYPA 3KZQA 1O85A 2HZEA 3IR4A 1SK1A 1GUMA 1MD3A 2H0GA 3WD6A 2MBSA 2HSHA 1RK4A 1A0RP 2M80A 3G7IA 4MF6A 1RQMA 3DYRA 4MABA 3KP8A 4DSRA 4K1FA 4NAXA 4EVMA 5F8BA 5AIVA 3TDGA 2XC2A 1V57A 3GYKA 3CTFA 3EU3A 1AQXA 4V1Ap 2HRNA 1THXA 2H1AA 3CRUA 1PD21 1X9MB 1U88A 3TKSE 1WE0A 4GSTA 3WGEA 4D73B 3BOAA 5ECIB 2WS2A 2H76A 3LXZA 7GSSA 2NPBA 3TGZA 1AQVA 4OMVA 4HZ4A 1SL0B 5GSTA 3VWUA 1PA3A 5IMVA 2PUKC 2IIYA 4V1Ag 1XVWA 1OC3A 4DSSA 2C3NA 4J57E 1N2AA 2V6OA 2MMAA 1SENA 1SJIA 4K0GA 1KNGA 1QMVA 3IXRA 1EGRA 1FHEA 4POKA 1UVZA 1A0FA 4MH3A 2DJ1A 3UL3A 1XXUA 1EOGA 4YAPA 4P3YB 3RBTA 3KTBA 4I2TA 2YJHA 2TRCP 1TKDB 2VL3A 3MDKA 2M46A 5DQSA 1EZKA 2B5YA 3UBKA 2I4AA 2CX3A 2PU9C 4GSNA 4WR5A 2GGTA 3DKSA 2WGRA 2PVOC 3TOUA 2B1LA 4I2UA 3GKKA 4IKHA 1G6YA 2LRTA 1GTUA 3APQA 2KP2A 2DJ0A 3L0HA 2FWEA 3P7XA 1QUWA 5B8BA 2PPTA 2K9FA 2L5LA 3EVIA 3MWHA 4BWSA 2KUCA 4YQMA 1RW1A 3M1GA 1GL8A 4V2LA 1S3AA 1R7HA 1M2DA 3OR5A 4PX1A 2JSZA 3IRAA 2LS5A 1SKWB 4IHUA 2HRFA 4Q5FA 4Q5NA 2LJKA 2A2SA 2BJXA 4L8EA 4ZBAA 2DSAA 4BVXA 2MBTA 5HQPA 1GSFA 2VOCA 1JLVA 3DEXA 1K3YA 1R5PA 1A23A 2HZEB 3FHKA 3ZFLA 2M72A 4KUNA 3AY8A 4JBBA 5D8IA 3KP9A 1TK0B 4O5RA 2WB9A 3FK8A 3H1NA 1KEBA 2ZNMA 1SL1B 1B9XC 4EL1A 2BTOT 2VIMA 2OKAA 3A5WA 4MK3A 2QC7A 5IOWA 6GSUA 1Z7RA 1GSQA 2FGXA 3VLNA 3E3EA 3KJYA 4IJ3A 3FZ4A 1V9WA 4CDOA 4WXTA 6GSXA 5ECSA 1LBKA 2XHFA 4TXOB 4POLA 2RLIA 4CHSA 3PGTA 2GLRA 5EPFA 2LUSA 2LSTA 2IMFA 5H5SA 2X99A 2JU5A 3W8JA 1KTEA 4GQCA 1I9DA 4N0VA 4KDYA 3CSJA 1OKDA 3U6VA 3EINA 5F05A 3APSA 1GUHA 4PQIA 4HI7A 1OC8A 4KA0A 1F9MA 4PXOA 3I6AA 3QAGA 1XWAA 2Z9SA 1K3LA 4DVCA 2VAFA 3QD9A 4PQ1A 2LRCA 4MLYA 3KD0A 1AC1A 1XWGA 3E0UA 3HD5A 3LEFA 5LCZA 2ON5A 4KW6A 4KGIA 2AJQB 1M7TA 2C0FA 4TR1A 4XRDA 2MYGA 5HFGA 2I3YA 3TJGA 1GH2A 3BBYA 2DJ2A 4K0NA 4OD7A 3TKSA 1PL2A 2C0GA 2HSYA 1SJ6A 4FIWA 5CRDA 2VLUA 2VL9A 1DE2A 3Q18A 3VPTA 3FY7A 3VWVA 2O7KA 1ERWA 1EP7A 5JWRB 4NV5A 2MMNA 2JZRA 5DAKA 1GSDA 4F9ZA 2K18A 4IQAA 1YY7A 2IMIA 3BJ5A 3GKXA 5GAND 1OC9A 3FRCA 3KIJA 4ISDA 4XHMA 3JCML 4MP4A 4XS1A 4ILFA 3A2VA 6GSYA 4MJAA 2TRXA 2EIQA 2O8VB 1B9YC 5JCWA 3ZYWA 1EEMA 4MJEA 5F0GA 1B4QA 2OE3A 2XPDA 3IAS2 3LWAA 5GAPD 3BCKA 4QQ7A 1M9AA 4NPBA 4TR4A 4ULXA 3F3QA 3FKFA 2C3TA 2AV4A 2FWGA 2LTKA 5HR3A 4PNGA 4KSOA 3DMLA 1T1VA 2DMMA 1PN9A 2XBIA 4O7HA 4OWYA 5DJMA 1XW9A 1G6WA 1ZMAA 3IOSA 5HFIA 3GMFA 3IE3A 5DVBA 5D93A 1WPIA 1K0NA 2OE0A 1YZXA 1YEXA 1J0FA 1TRUA 5HR0A 1V58A 3RHBA 2EC4A 4KX4A 3I9V2 2O89A 4HQSA 13GSA 4XS4B 4FYUA 3FR9A 2L57A 1HQOA 1UN2A 3F3RA 2MMZA 2EIRA 3L78A 4YQUA 3GH6A 1GLPA 4V2NA 4K7IA 1W4VA 1C72A 2YNXA 3C1SA 4E8EA 3QCPA 2VCZA 3GTUB 4K2DA 2I9HA 3D6IA 5AISA 2P5QA 2V41A 1QQ2A 1AUCA 4HJMA 2OBIA 1M9BA 1VF1A 1THOA 4GRFA 4ZL7A 1NHYA 5HFKA 1TU7A 5G1LA 3IHQA 4PUAA 4N10A 2GDRA 2YWNA 3QAVA 3HVXA 3L9VA 2AB6A 5CREA 5GSSA 3UJ1A 3C7MA 5DAKB 1B4PA 1PQNA 3RHCA 5D96A 1K0CA 2HZFA 3O3TA 2GZPA 1XIYA 1TJDA 1OC9B 4ECIA 2JL4A 4KE3A 3J7Yk 1XVQA 3TJJA 4ZIJA 4V2MA 4ECCA 2VD0A 1XWKA 2WZ9A 2YPMA 3ERGA 1HNBA 1V2AA 2B7KA 4YAVA 1DUGA 5J3RA 1EGOA 4EC0A 4HJ2A 3GV1A 4G9HA 1H4OA 5ECRB 1I5GA 3NZNA 3TKRA 2HNLA 3S9FA 2I81A 1WJKA 3D4MA 1MEKA 2B3SA 1PX7A 1YJ6A 3GIXA 5DALA 1FVJA 1GSEA 4PGTA 3ED3A 2XBQA 2OJLA 1SD9A 2LKUA 2HFDA 2PGTA 3EMXA 2YJ7A 1F3BA 1YDKA 4CW9A 4KH7A 3QMXA 2YP6A 3O6TA 3F4SA 4MMMA 3HJMA 3HY2A 3VURA 2L5OA 2HLSA 1GULA 3QFBC 3TKQA 2DIYA 5JWQB 2H1GA 4OO5A 2DMLA 3DIEA 2V2GA 4TXVA 4EUYA 1QXHA 4HU7A 1EEJA 2DJ3A 4FO5A 4ZL9A 1K3OA 3PH9A 3K8NA 5IOXA 4TN8A 1B48A 4ZBDA 3Q19A 2H66A 4MCUA 3ZIJA 1EP8A 4OFMA 4ZL8A 4AGSA 4KAEA 4MH2A 1XW5A 5ID2B 2CT6A 1A8YA 3GSSA 3GKNA 1TRWA 4AJ8A 4KDUA 4F0CA 2F8AA 4Z7XA 2LV3A 2F9SA 1XZOA 2HXKA 2AYTA 2FWHA 3GL3A 3KTLA 5CRHA 4XIHA 1O73A 2IL3A 1Z9HA 2R6KA 1K0MA 3I43A 1GSSA 4WF5A 2FA4A 2GZZA 1BJXA 3LYPA 3D0ZA 2A2RA 3KM6A 3LFLA 3TUEA 3FZAA 5H5QA 1Q98A 1T8EB 2CAQA 4KCAA 1ZYQB 1HNCA 3TJBA 2C0EA 4J56E 3F6FA 2DJKA 3LG6A 2N5BA 2WULA 3L4NA 1TRSA 4JZQA 1TRVA 1VF4A 2I1UA 1WIKA 3EMPA 3IDVA 1USBA 2KHPA 1YF1A 2IMKA 20GSA 3FR3A 3RPPA 2AHEA 3L9SA 2CVDA 1LU4A 3F4TA 5DALB 5ECLB 4TKYA 3ZTLA 5DBQA 2FA8A 4BPYA 1TW9A 2H1DA 1OKTA 3A3TA 1EV9A 2AUVA 1AW9A 3HJOA 1SK2A 3ISOA 4TW5A 4GXZA 2PMTA 3EWLA 2YV7A 4G19A 3V1WA 3VI7A 1TU8A 3TJFA 2PERA 2CVKA 3RPNA 5INYA 2CZ2A 1F3AA 3VK9A 4GWRA 1NW2A 3UEMA 3L9UA 5IPGA 5DCGA 1FOVA 1YQ1A 3IV4A 3C71A 1M2AA 1HYUA 2YOIA 3F4RA 1E2YA 3PR8A 2K8SA 4MPGA 4HU9A 2FUG2 1XBSA 3TB2A 2VL2C 3DGQA 2X8CA 2JSYA 2L4CA 3P8WA 2YCDA 1YKAA 4I5QA 2BMXA 4NXIA 1TP9A 4DSSB 4WR4A 3P90A 3Q6OA 4DSQA 4LMVA 3UVTA 1URMA 3EE2A 3VFIA 2HE3A 2VCQA 3R2QA 2HYXA 1BEDA 4BA7A 4NHWA 3HKRA 1VRSD 2C3QA 1M0UA 2H1BA 1QK8A 2VM1A 2QGVA 4GF0A 5B8AA 2DJJA 1ERVA 2CQ9A 5IMCA 1SK0A 3TRXA 2YV9A 2EIOA 2PVQA 4GSSA 5EVOA 1VGLA 3GKMA 5DJLA 3HA9A 1GTIA 2YZHA 3ZZXA 1S3DA 3UVHA 1YKCA 5D9XA 3ZFBA 1OE8A 4POBA 5D9VA 2LRNA 2B6MA 4F03A 1BX9A 2GTUA 3C73A 3M9KA 4ZXGA 3E9JB 2LEGA 2JACA 3WGDA 1QFNA 2IWTA 1WP0A 4LMWA 1XOBA 4LL4B 4NMUA 4XRAA 1DE1A 2VM2A 2KLXA 4TR3A 3HXSA 1O8XA 2O87A 4EO3A 4GCIA 3N9JA 5KN2A 5IIZA 5CRWA 1FVKA 3LYKA 4ZB6A 5E59A 1XW6A 2LNTA 1V40A 17GSA 4QL7A 1ZZYA 5IMZA 3P2AA 3VPQA 14GSA 2FHEA 2OACA 1BAYA 5IQYA 3NOFA 3EC3A 4PNFA 3GX8A 5JWOB 5A5KA 3UMAA 2YWMA 1UC7A 1ERUA 3HVSA 4HOJA 4RUVA 4JRRA 4GTUA 1XWCA 1OAZA 3FW2A 5A4VA 4HEA2 2B1KA 1O6JA 2C4JA 3TRQA 1K0OA 1XWBA 2GSSA 3VI5A 3CMIA 1JHBA 1TXXA 5ECPB 1LJRA 2JADA 1SU9A 5D9WA 2WJUA 3W6GA 1ON4A 2J9HA 4ECJA 2C80A 8GSSA 1K0BA 3G7JA 3ZMKA 1ILOA 3M0FA 4F0BA 1XPVA 5CNWA 1A24A 3GL5A 3A2XA 3LQ7A 1FO5A 3U5RE 1HNAA 3KH7A 4F2IA 2H74A 3ZLPA 4WBJA 4FYCA 1Z3EA 5CAXA 4GQFA 3F63A 5B6NA 3QR6A 2YANA 3KGKA 4ACSA 2OA7A 5J41A 4L0WA 2H70A 3ZITA 4ZB8A 5AIXA 1T4ZA 5DDLA 1TI1A 1ZYEA 4JR6A 2IN3A 5ECQB 2GZYA 3GH9A 2WDUA 2V6KA 5ABRA 16GSA 2NDOA 3TRPA 3DVXA 4JE1A 3UOMA 4WETA 4TR1B 1JZDA 1N8JA 4K8MA 4L5LA 2X8GA 5G5EA 5CO3A 4MPFA 1FB6A 5KN3A 4X1UA 4D73A 2H6ZA 1XCCA 5H5RA 4HQZA 5FWGA 1GUKA 3CSIA 1GSUA 2IJYA 1NHOA 3M9JA 6GSWA 3GUSA 5IMFA 1T00A 4MZBA 4MZCA 3IC4A 1EV4A 1MDKA 1GNWA 1BQ7A 5J9BA 1SJZA 5FHIA 4OFNA 1JFUA 2HT9A 2VLVA 2PWJA 4HS1A 1DBYA 1VF3A 3ME8A 2V32A 5ENUA 2IFQA 3GN3A 4L5OA 2FNOA 3H79A 1IYIA 3CSHA 6GSVA 2O85A 10GSA 2H72A 2REMA 2H19A 3SBCA 2DIZA 2VD1A 2WRTA 5G30A 5ECKB 1ZGNA 3ME7A 1R5AA 4Q5QA 5IO0A 3IK7A 5G2ZA 1ABAA 3H8QA 2VUPA 2B5XA 1OVNA 1Q4JA 5G5FA 2GT6A 1FW1A 3MNGA 2ALBA 4QL9A 3W8SA 5E4WA 3GHAA 4MJBA 2E2MA 2L4QA 3CXGA 1SYXA 1H75A 1A2LA 1G7OA 4EE0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1Z3EA

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Chain Sequence

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