2TIRA

Crystal structure analysis of a mutant escherichia coli thioredoxin in which lysine 36 is replaced by glutamic acid
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCEMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
publication title Crystal structure analysis of a mutant Escherichia coli thioredoxin in which lysine 36 is replaced by glutamic acid.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
total genus 31
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2tirA00
1TJDA 3TCOA 4JRRA 2REMA 1AXDA 2WULA 3M8NA 1V9WA 5J4UA 1DE2A 4KA0A 4ZBAA 2VAFA 4BA7A 4K6XA 2O87A 4EF0A 5IMDA 3HDCA 2VM1A 4ZILA 3ZFLA 3O76A 1WIKA 3Q6OA 2ZNMA 2CT6A 4K0GA 3CYNA 1V2AA 3PGTA 5JCWA 2L57A 4POMA 1XFLA 4WF5A 3HJOA 4PGTA 3RPNA 3J7Yk 4MZBA 3ME8A 4MF7A 5D8IA 4IW9A 2J23A 4GSNA 1EOHA 3VWVA 1NHOA 4GSTA 4LMVA 3ZTLA 1SL2B 4YQMA 4BWQA 2NPBA 1A2JA 4PQ1A 3DEXA 1R5AA 3F8UA 1OE7A 2H0HA 5ECMB 4AJ7A 1KTEA 3IDVA 2I4AA 12GSA 1S3AA 3FEUA 1O73A 3G7JA 4KE3A 2B3SA 2YWOA 3LXTA 4MMMA 3GKNA 4P3YB 5G1LA 3QOUA 1M0UA 1MDIA 3HJPA 1ZCPA 1FVKA 3N9JA 2JL4A 1MEKA 2AJQB 4F82A 5H5QA 5ELAA 1O8WA 2FY6A 1GTBA 4JBBA 3H93A 3QAGA 4I97A 4K9ZA 3S9FA 3GKKA 2K6VA 2VCTA 1U3IA 4AF2A 3APQA 2YN1A 1ON4A 1SKSB 1QQ2A 3IR4A 4ZB8A 2OE0A 3KTBA 2VCXA 5IOXA 2XHFA 1A23A 1DSBA 1E2YA 2TRXA 3F4TA 3L0HA 2IMFA 5DQSA 4ZB6A 2PBJA 3LGCA 3QAVA 2HYXA 5ECLB 5A4WA 1SJ6A 4POBA 4MF5A 2RLIA 2CA8A 1LJRA 4I5QA 2HRNA 2P31A 1F9MA 1TK5B 3IAS2 2OJLA 1K3OA 1Z6NA 4LLRA 5ELGA 5ABRA 1TRSA 4WKWA 1PRXA 4BPYA 2YJ7A 1AQVA 2CAIA 2CX4A 1FHEA 4XTSA 2PU9C 2F3MA 2C0DA 2L4QA 3PINA 4HJMA 4DEJA 3CRUA 4IP1A 3ISOA 5IMAA 3ZFBA 2YANA 1Q4JA 4L5OA 5F8BA 3I43A 1XWAA 2EIQA 1O8XA 4IVFA 1OC8A 3KD0A 2BJXA 5ID2A 1YZXA 1OC9A 2O89A 4WBRD 3O6TA 1NM3A 1J0FA 3FR9A 4OCFA 4GWRA 4KGIA 1PL2A 4V2NA 1K0NA 2MBSA 4KB3A 1Z7RA 3IK7A 3C73A 4LA1A 1PX6A 4XS6A 4KDYA 2KOKA 5D9WA 5KN2A 5EPFA 3UAPA 2DSAA 2OE1A 3KCMA 5DVBA 4DSSA 2L5OA 2DJKA 3IK9A 5GSSA 2AHEA 2H66A 5ECNB 3ZRDA 6GSYA 1H75A 4N0VA 4IP6A 2IMDA 5EVOA 2O8VB 4N10A 4LMWA 5ID2B 1XVQA 1OC9B 2B7KA 2OE3A 3HXSA 2L59A 3US3A 4GTUA 3IA1A 2K8VA 4ID0A 14GSA 2BMXA 1G6YA 4KUNA 4JE1A 1OKTA 3GSTA 4K7IA 1AAZA 1WRYA 2C0FA 3GHAA 3DVWA 4WF4A 1FW1A 5ECRB 4BVYA 9GSSA 2E2MA 3QCPA 1LBKA 2D2ZA 4OFMA 3C71A 2HRFA 2VLUA 3RDWA 2B5EA 2GSRA 4MH3A 1PSQA 1BG5A 20GSA 3CSJA 1SYRA 4PX1A 4ZIJA 3UBLA 2GQMA 3FZAA 1S3CA 3FRCA 3GYKA 5B6NA 2B5XA 2LQQA 3FZ5A 4I2TA 5GAND 4KNDA 2LV3A 4YQVA 4J56E 5JWQB 1QK8A 4HU9A 4YAPA 6GSTA 3ZL5A 3DRNA 2KUCA 4GSSA 18GSA 2GT5A 5H5RA 2YCDA 1XWKA 1ZL9A 2LEGA 3TKPA 5GZZB 4X0XA 1ACVA 3Q74A 2CZ2A 1QUWA 5IQYA 3DMLA 4XS4A 2ALBA 2H0IA 2H19A 2L6DA 5G2ZA 1TU7A 2FLSA 3GKMA 2CX3A 5ECKB 3I9V2 2K18A 3KM6A 2HNLA 3ME7A 3DD3A 1SU9A 3WGXA 4NMUA 2DMMA 4IQ1A 2GTUA 2DJ0A 2ON7A 1ST9A 4FYCA 1F3BA 1TP9A 1B8XA 2HZEA 3F63A 4MJCA 2EIOA 2GSQA 3GKXA 3OR5A 2O85A 2PN8A 2PMTA 3L78A 2QSIA 4DVCA 4HQSA 5CRWA 3WT1A 1X9MB 2YZHA 3UIWA 5E4WA 3KXOA 1SYXA 3EWLA 2IPAA 4JEDA 1K0BA 4IJ3A 3UARA 3LQ7A 4XS4B 2VCVA 4RI6A 2J9HA 3GURA 4GRFA 5GAPD 3TRXA 3TKQA 4JZQA 3E3EA 5HFIA 4QL9A 2LRNA 5IMVA 4TR0A 1GLPA 5DQYA 1R26A 5AIVA 5ECPB 4TN8A 2FA4A 3ERWA 3KZQA 5ECQB 1GSUA 2FUG2 3M0FA 1GTIA 2V1MA 3LXZA 4TR1A 1SK2A 16GSA 2XPDA 2HZEB 5AISA 2FWEA 1JZOA 4NHZA 4POKA 2PERA 1JZRA 4HU7A 1GNEA 2LS5A 4NXIA 2FD3A 3CTFA 1SK0A 1EP7A 2YNXA 5J9BA 1NW2A 1EEJA 2JSYA 4ACSA 3LG6A 2GZYA 2E2GA 5IOWA 1O81A 1R5PA 1FAAA 1O85A 3P7XA 2IL3A 1AW9A 1A8LA 5D96A 4H86A 1HQOA 4ZXGA 4WBJA 5IO2A 3HYPA 2B7JA 1Z5YE 1V40A 2CVBA 1XW9A 3TRQA 2I9HA 2V41A 3VWWA 4X43A 1YF0A 1DE1A 5IMZA 3UOMA 4K2DA 2LKUA 2WB9A 5ENUA 3V1WA 1VF3A 1BJXA 1JZWA 3QMXA 3D22A 2QC7A 4FIWA 1FB0A 1T4YA 3I69A 4AJ8A 1U88A 2H6XA 2MMAA 4GF0A 4BVXA 4V1Ap 5DJMA 1AQWA 5HQPA 2IIYA 3L9VA 4Z7XA 2HZFA 3Q19A 1J08A 3D21A 1V57A 5J5NA 1JHBA 3EU4A 3VWXA 3TB2A 1H4OA 2GS3A 4WXTA 3ZZXA 3SBCA 3FHKA 1B9XC 2H1GA 2DIZA 2VL2C 1B9YC 4NHWA 5KN1A 2MMNA 6GSVA 2H76A 3A3TA 2OADA 4G10A 4HS1A 2YPMA 2B1LA 1TK0B 1GNWA 1BAYA 1PMTA 3TRPA 2PWJA 4TXOA 4ZBBA 2ZCTA 2C3TA 3ZIJA 5KEJA 2YV7A 2WJUA 3E0UA 2VOCA 1MDJA 2KLXA 1PKZA 3EU3A 2IJYA 3QR6A 2H6YA 2YWIA 5JCUA 4OFNA 4KSMA 1FO5A 4NAXA 1Y25A 3QDNA 4YAVA 1ZOFA 3E9JB 4XCSA 1QFNA 1QXHA 1Z7PA 2EC4A 3CMIA 3U6VA 4D73A 1YJ6A 2K8SA 3VLNA 1YEPA 4CW9A 3L9SA 3GX0A 3N5OA 2GSTA 1XWGA 3D0ZA 3GH9A 3VI5A 4J57E 4ZL7A 3TGZA 2C0EA 1M7TA 2X99A 3IHQA 2VL9A 3KIJA 2GGTA 2IFQA 4KCEA 1EZKA 2C80A 4MJEA 5B7CA 5LNKe 2VL3A 2C3QA 3MSZA 5C00A 3K8NA 3ERGA 3G7YA 3VI7A 1EEMA 3ZMLA 1SKRB 1M2AA 3MDKA 3ZITA 3DVXA 5D73A 1UC7A 2L5LA 2P5QA 1XWBA 1G7EA 1EV4A 3W8SA 1EV9A 1TXXA 3M9KA 3PR8A 3A5WA 2X8GA 4LL1B 4HZ2A 4D73B 4IHUA 2C0GA 2GZZA 1K0DA 1X9WB 1OC3A 1K0AA 1B48A 2DLXA 3FK8A 4RUVA 1VGLA 2DC5A 2RUEA 4TKYA 3L4NA 2VLTA 1K0MA 2L6CA 2H74A 2MBTA 2X64A 2RIIA 2V6KA 5A5KA 3TJGA 1F3AA 4GQCA 2CVKA 19GSA 2IFQB 1I9DA 3F0IA 3CSIA 1N2AA 2H6ZA 4OMVA 4ECCA 3H79A 1DBYA 1YKAA 1ZYQB 3KTLA 5IIZA 4WR4A 5IMCA 5DDLA 5AGYA 2JZRA 4POLA 5DJLA 3F6FA 1HD2A 2P5RA 1IYHA 2X8HA 3QFBC 1SKWB 3A2XA 3D6IA 2H1AA 5A4VA 3GIXA 1XXUA 1Z3EA 4MF6A 4YH2A 5LCZA 1JZDA 3HVVA 4KDUA 4MZCA 2OA7A 1NHYA 5DALA 4TW5A 1PD21 1F37A 5F0GA 5B8BA 5CAXA 1F6MC 2TIRA 4HQZA 1A24A 4PQHA 4J2FA 3CSHA 5C04A 3GTUA 1XOBA 1HYUA 3CRTA 5DCHA 2B1KA 3IV4A 3BD2A 3CTGA 2GQKA 1TK8B 2KP2A 2VL2A 3WYWA 2N5BA 13GSA 2JADA 4K7NA 1X0RA 7GSSA 3LSZA 5HFKA 2P0GA 4PNGA 2F51A 1MD4A 3RAZA 1K0OA 1XOAA 1T4ZA 3ZVJA 1GSDA 2R5GA 3EVIA 2OBKA 2WCIA 4IQAA 2WRTA 3GL3A 2I3YA 2IN3A 1NSWA 2C4JA 3GA4A 1GL8A 2A2RA 5G1KA 3EMPA 5J41A 2F8AA 2JACA 4O7HA 2L4CA 2R2JA 1GSFA 4DSQA 3GTUB 2XBQA 4DSSB 1XWCA 2QKEA 4V1Ag 1ERVA 1GSSA 17GSA 2PPTA 2DIYA 5IO0A 5F07A 3P2AA 2LRCA 1IYIA 2H30A 3RBTA 2RM5A 3VFIA 1SENA 2DMLA 2LRTA 2DJ2A 1MD3A 2LNSA 3SWLA 2CAQA 3NOFA 4ECIA 2JU5A 3LJRA 2A4VA 3W6GA 1BEDA 4IGJA 2FWFA 2YP6A 2GDRA 3VWUA 3D5JA 3H8QA 4DSRA 1J9BA 4GLTA 2FWHA 2VCZA 3TKSC 1VF4A 3HKRA 4F9ZA 2YWMA 3TDGA 3QPMA 2DBCA 1A2MA 3FKFA 1M2BA 2N5FA 3M9JA 4F0CA 1DUGA 3DIEA 4MA9A 2H8LA 2AYTA 3F4RA 4HJ2A 4IN0A 1TI1A 3KP9A 4EDYA 2XPEA 1GSEA 5DCGA 2LJRA 5DAKA 1GP1A 1F2EA 1WP0A 3ED3A 3HZ8A 5ECOB 4KW6A 1FVJA 4JR6A 4KH7A 2MMOA 4AGSA 4RQXA 3F9UA 3GMFA 1LU4A 4IJIA 2FWGA 3F6DA 4K7OA 2HT9A 4OCEA 6GSWA 3DGQA 5IPGA 4F03A 3BCIA 5KN0A 1FB6A 2LJAA 3P90A 1TW9A 3EINA 22GSA 1U87A 2FGXA 1RK4A 2PVOC 1K3YA 2YWNA 3GH6A 2AV4A 3DYRA 2IMIA 2VIMA 5A4UA 1AUCA 1XIYA 1XCCA 3QD9A 3HY2A 1R7HA 5HR3A 2G0FA 5JWRB 1ERUA 4N30A 2NVLA 4PNFA 3F3QA 3UEMA 4EDZA 4N11A 3VPQA 4MPGA 2GSSA 1GUHA 1M2DA 3KH9A 1I5GA 5CNWA 5G5FA 4G19A 2HI7A 1GRXA 5HR1A 2WGRA 5DBQA 1A0FA 2JSZA 1PKWA 2KHPA 1XVWA 5ECSA 6GSUA 5FWGA 3JCML 3MNGA 2GQLA 3NIVA 3FR3A 3FR6A 2AB6A 3C1SA 4KCAA 4AJ6A 2R37A 4K0NA 3GL5A 2VD0A 3KMOA 4HOJA 4FH8A 4RI7A 4TR1B 5FT3A 1R4WA 2PUKC 2C3NA 2HLSA 4MABA 4TRXA 4WEYA 2H1DA 3H4KA 2GT6A 4NV5A 3IPZA 1K0CA 2PGTA 3DWVA 4MK3A 4N0ZA 2FCHA 2M46A 2GZPA 2VD1A 4KDXA 1BX9A 2LUSA 1TDIA 4PXOA 2CQ9A 2MYGA 3G9BA 4TOPA 2VUPA 4KAEA 2DJJA 2JZSA 3UVTA 1AQXA 1TOFA 3HCZA 4BWSA 2V6OA 4ISDA 4MJAA 4GXZA 3IOSA 5G5EA 2CV4A 1YF1A 5EY6A 5JWOB 1KEBA 2B5YA 2IMEA 3APOA 1GTUA 1GULA 4MCUA 2VCWA 3ZVJD 3TKSA 2GLRA 4I2UA 4O5RA 4BL7A 5CRHA 5ECHB 2H0GA 3HJMA 3VURA 5D9XA 5CO3A 1T1VA 1CQHA 2AAWA 1GSQA 5CYYA 4ECJA 1A0RP 3UVHA 1CQGA 2E7PA 3ZIVA 1UVZA 3APSA 4OD7A 1EGRA 4GQFA 1ML6A 2R6KA 2KP1A 2OKAA 4HUAA 5IMFA 1V58A 3RHBA 1XBSA 4IBPA 2V32A 2LTKA 3UJ1A 1PX7A 2HE3A 5D9TA 1GUMA 1PL1A 2ES7A 2N5AA 1JLVA 4FYUA 3ZLPA 4XS1A 2G2QA 1T8EB 2E0QA 3PH9A 1VF2A 1W4VA 1ZZYA 2VCQA 3TOTA 3IE3A 3LYPA 4EE0A 3WGDA 1V98A 1SJIA 3C1RA 1ZGNA 2FA8A 1X5EA 3HHVA 3KEBA 1GWCA 4TXOB 1USBA 2ZUPA 5HR2A 2JZTA 2TRCP 2WDUA 1X9SB 4L0UA 4X1UA 5LD0A 1HNAA 5HFGA 4IKHA 3A2WA 1TRUA 1SD8A 1VF1A 4G9HA 5IM9A 3RPPA 4EL1A 3F4SA 3TUEA 1OE8A 4TR3A 5B6MA 5AN1A 4IELA 5KN3A 3FZ9A 4I8BA 1Q98A 5CREA 1ERWA 2DJ3A 2F8FA 1U6TA 4F2IA 5CP1A 3ZMKA 1GSYA 2M80A 1XW6A 4PUFC 3DXBA 5CRDA 3EC3A 3MAKA 4QQ7A 1RW1A 2I1UA 3KP8A 1G0TA 1S3DA 1AIUA 1A8YA 2WZ9A 2LSTA 4Q5NA 4ECBA 3IRAA 1YDKA 2FNOA 5ECIB 2H71A 2AUVA 3HVSA 2YV9A 4ILFA 1C72A 1OVNA 2O7KA 3D4TA 3BBYA 5FHIA 3U5RE 4CDOA 1ZYEA 3WGEA 4EC0A 1G7OA 1EWXA 4LL4B 1MTCA 4XRAA 3EMXA 4PURA 2IMKA 4ZL9A 4EXJA 4Q5QA 4FO5A 1THXA 5CRGA 1SL1B 2C8UA 3DKSA 1KNGA 3LYKA 4ML6A 2F9SA 2K9FA 3BOAA 1SK1A 3HZ4A 2X8CA 4IS0A 2GVPA 3H1NA 4L8EA 1GLQA 4OO4A 4NWYA 4ZBDA 2FHEA 1PQNA 1N8JA 4MLYA 4EUYA 1SJZA 3L9UA 3M3MA 4FYBA 1G6WA 4V2LA 4XIHA 3BJ5A 4V2MA 3CBUA 4NV2A 2MMZA 3R2QA 3FY7A 2H73A 3EURA 5COHA 4CHSA 5H5SA 4HI7A 3ERFA 3FW2A 3KJYA 4OO5A 3TKSE 4ULXA 1A2LA 2YZUA 2VM2A 3BCKA 5F05A 3I6AA 3IBHA 1YQ1A 2WS2A 4QL7A 4KSOA 5DALB 1B4QA 2HFDA 5F06A 3TJJA 4E8EA 2YJHA 5AIXA 3WD6A 4WR5A 4HZ4A 1QMVA 2NTOA 1M9AA 1EP8A 1YY7A 5J3RA 4O92A 2M72A 2OBIA 2H75A 4TVEA 3Q18A 4L0WA 4Q5FA 1WE0A 2NDOA 4NPBA 2BTOT 1Z6MA 3GNJA 3GX8A 1AC1A 2LNTA 3MWHA 2IWTA 1GH2A 11GSA 1M99A 1PN9A 4E8HA 1O7UA 1XW5A 3IC4A 4PQIA 4OFTA 4MDCA 1KBNA 1TTZA 4RQRA 1TRVA 1X5DA 1YKCA 4F0BA 1SL0B 1TU8A 3ZYWA 4I6XA 1GUKA 3O3TA 5G31A 3FYGA 1QGVA 5GSTA 3AY8A 1WWJA 5INYA 1EGOA 4ZB9A 1WMJA 1RQMA 3UBKA 3G7IA 1WJKA 1UN2A 4TR4A 4GCIA 3RHCA 3QFAC 4PUAA 4OWYA 1TI3A 1FG4A 1ABAA 3A2VA 4EO3A 1OAZA 2R4VA 2CVDA 2EIRA 3IXRA 2QGVA 1FOVA 1HNBA 4TXVA 1URMA 5L71A 1TRWA 3LEFA 3TJBA 3UMAA 2YOIA 3GN3A 3TOUA 3HVXA 3GFKA 4MJBA 2R3XA 3TJKA 2DJ1A 1XZOA 3HD5A 2WFCA 5D93A 3C7MA 4WETA 1JFUA 3CXGA 5JCGA 5EL8A 3EE2A 1E6BA 1THOA 5IPHA 4G2EA 5HR0A 4L5LA 1EOGA 4JR4A 3IAM2 4YQUA 2H70A 4XRDA 4JU5A 4HDEA 3C8EA 4O32A 3TKRA 3NZNA 2I81A 3LORA 5D9VA 3VPTA 4K1FA 1BYEA 2V2GA 2HSYA 2RUFA 1B4PA 4KX4A 2CZ3A 5DAKB 8GSSA 4XHMA 1VRSD 1ZMAA 2PVQA 2RM6A 1T7PB 3ZREA 4ML1A 1O6JA 2ON5A 1T00A 3KMNA 1HNCA 1OYJA 2B6MA 2HSHA 1TKDB 4MPFA 1ERTA 3KH7A 6GSSA 1SD9A 2MZCA 1GTAA 1UA5A 4ZL8A 3M1GA 2C1YA 5J9CA 1MDKA 3GSSA 3LFLA 3F3RA 1OKDA 1PA3A 3TJFA 1ILOA 4HEA2 1XPVA 3QAWA 3P8WA 1YEXA 1M9BA 3KGKA 4MP4A 2NBSA 2H72A 2LJKA 2H01A 4K8MA 1T3BA 3HA9A 2XBIA 4EVMA 1X5CA 2A2SA 3GV1A 5G30A 5E59A 3GUSA 1WOUA 2LQOA 1Y6EA 4MZWA 3UL3A 3VK9A 1WPIA 4EKZA 2H1BA 1U3AA 3FZ4A 1Z9HA 1BQ7A 2Z9SA 2VLVA 5B8AA 1PGTA 10GSA 3D4MA 2OACA 2VO4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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