2TIRA

Crystal structure analysis of a mutant escherichia coli thioredoxin in which lysine 36 is replaced by glutamic acid
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCEMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
molecule keywords THIOREDOXIN
publication title Crystal structure analysis of a mutant Escherichia coli thioredoxin in which lysine 36 is replaced by glutamic acid.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 31
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2tirA00
3DKSA 3P8WA 1JFUA 1GUKA 3GTUB 1ZL9A 1BEDA 1MTCA 4IQ1A 1GUMA 4ILFA 5D73A 1ZYQB 3UOMA 4JEDA 3SWLA 1F2EA 5DJMA 1TK0B 1PL2A 3ERWA 20GSA 2C4JA 5J3RA 3MWHA 4L5OA 3EINA 3KEBA 3KMNA 1EP7A 1GTUA 2DJKA 3HJOA 2OKAA 5IPHA 4XCSA 2BMXA 2EC4A 3IR4A 3FR3A 2TRXA 4K1FA 5J41A 2C3NA 3O3TA 1K3OA 19GSA 4ZILA 1QK8A 2CZ3A 2H6YA 1DSBA 2YJ7A 3BJ5A 3ME7A 2O7KA 4GWRA 1PX7A 2CVKA 4OO5A 2HZEB 1MEKA 1OC8A 5ECHB 5ECSA 1ERUA 2OE3A 1QXHA 5ECNB 5KN3A 3M9JA 2RUFA 1S3DA 4FO5A 3GA4A 5JWRB 3HJMA 4QL9A 1NSWA 2HRFA 4MPFA 3GH6A 1AQXA 2R5GA 2ZUPA 2KLXA 5ID2A 2OBIA 3BCIA 12GSA 2VCQA 2V32A 5ECLB 3EC3A 2VO4A 3QMXA 1XWCA 2H1GA 4G10A 2QC7A 2H71A 3CRUA 1HNBA 1G0TA 2I4AA 4RI6A 5EVOA 3LGCA 2H30A 3ZFBA 3GUSA 3TJFA 2IMIA 2F8AA 1OKTA 2MBTA 5HR1A 3GL3A 2C1YA 3CRTA 3RHCA 2WDUA 2H72A 3VK9A 3GKKA 2HE3A 5H5SA 3TKRA 4MZWA 1FVJA 2NDOA 4TXOB 1ON4A 3BCKA 4TR1A 1A0RP 1JLVA 2RM5A 4CW9A 1X5CA 2IFQA 2WZ9A 1GRXA 2GGTA 1ZOFA 5F8BA 2VL9A 4XS4A 4EE0A 4PXOA 1R5PA 3F8UA 2YPMA 4IS0A 5G31A 1H4OA 2IPAA 5A5KA 2LJAA 5IMVA 2B6MA 5DJLA 5AN1A 1X9WB 1U3AA 2DC5A 2A2RA 2H74A 2BTOT 3F63A 1PL1A 2GQMA 18GSA 3FKFA 1URMA 2RIIA 1XWKA 5COHA 5D8IA 1WPIA 3W8JA 4ECCA 4LMWA 4PUFC 2PGTA 2PERA 3IDVA 2G2QA 2PPTA 2F51A 4NPBA 2FWHA 4OCFA 4NV5A 1UA5A 1K0MA 1GSDA 3KTBA 4PNGA 4MJBA 2ALBA 1K0CA 4ZB8A 3TJBA 4EO3A 1VGLA 2XBIA 1T3BA 2X8CA 3ZMLA 1GTAA 1BYEA 1SK2A 1A2LA 1KEBA 3JCML 4MJEA 5KN1A 4KGIA 2PVOC 2IMFA 1NM3A 6GSUA 3HCZA 5F05A 4NWYA 5ECOB 5H5RA 1HNCA 3IOSA 3DD3A 3GH9A 3NIVA 3RHBA 2LRCA 2FHEA 4MF5A 5CRDA 4ISDA 2A2SA 4H86A 4MP4A 1BX9A 4MDCA 2B1LA 3UEMA 4MZBA 2XPEA 3ZVJD 4XS1A 5HFIA 5J4UA 2J9HA 5C00A 1VF1A 4MA9A 5IIZA 4IJ3A 5DQYA 1V40A 1Z7RA 1SD8A 1EOHA 3KP9A 1TP9A 3GNJA 4PQIA 4GF0A 5DVBA 1SJ6A 2VCXA 1EOGA 5EPFA 1DUGA 2HXKA 1PMTA 3QAWA 2VIMA 4P3YB 3FZ5A 2DBCA 3FZ9A 3C73A 2Z9SA 1R5AA 1SKRB 1LU4A 2VD0A 4I97A 3O76A 1K3LA 5JWOB 3D21A 3HXSA 2VLVA 2OBKA 2IJYA 4MPGA 5ELAA 4POKA 4HUAA 2B5YA 4CDOA 4NAXA 2K8VA 4FYBA 4MLYA 3W8SA 4CHSA 3WGEA 2XPDA 3KZQA 2AB6A 2CVDA 2IIYA 5EL8A 2E0QA 4RI7A 4TW5A 1ACVA 4TRXA 3Q18A 4QQ7A 5ID2B 2MMNA 4V1Ap 2EIRA 3ISOA 3KIJA 1ERWA 3WGDA 3GL5A 3HJPA 3O6TA 1XCCA 2DMMA 1A8YA 1ZGNA 3PINA 1W89A 3GKMA 3UVTA 1LBKA 2EIQA 3TKQA 1SKSB 5DCHA 1GSFA 5A4VA 2QGVA 2H75A 3TCOA 4MZCA 1O7UA 2VUPA 3EYTA 3ED3A 5GZZB 4IQAA 5IO2A 1A8LA 3KH7A 4K2DA 3QFAC 5F06A 3VWVA 1JZDA 2LS5A 4BPYA 1S3AA 2R37A 4HU9A 3EWLA 3IE3A 2XC2A 3LEFA 1QQ2A 5D9VA 1J08A 4K7IA 1SL1B 1YKCA 1OE7A 3UMAA 5ECMB 1DE2A 2B3SA 4FYCA 5B6MA 3IV4A 1M0UA 2X99A 1WP0A 4PX1A 9GSSA 3EURA 3KMOA 4F0BA 2RLIA 2GSSA 4KSOA 2PUKC 4TR1B 3G7JA 5AIVA 3QPMA 5ECPB 1XOAA 2M72A 3Q19A 2IFQB 5JCGA 2I9HA 3N5OA 3ZYWA 3P2AA 4O92A 2K8SA 3KCMA 5CAXA 1SYRA 3BD2A 4KUNA 5ECQB 3F6DA 2WRTA 4XS4B 3ZMKA 2WGRA 3KGKA 5KN2A 2P5QA 1NHYA 2JZTA 1A2JA 3ZZXA 3UAPA 3J7Yb 4F9ZA 3QDNA 3KM6A 3MDKA 1T00A 2AUVA 1EV4A 3QR6A 4YQVA 4I5QA 1PRXA 2JU5A 4HOJA 1ZCPA 1Z5YE 2HZFA 3TJJA 1VF3A 4MF6A 1Z3EA 4DSSA 1GNEA 1SJIA 2F3MA 1TU8A 2H0IA 4ID0A 4GSNA 2VCVA 3F4SA 1HQOA 2FUG2 6GSXA 4WR4A 1OKDA 5L71A 4HDEA 4ML1A 3G7YA 1T7PB 5G5EA 4QL7A 1J0FA 3H8QA 1BAYA 3DYRA 1K0AA 3IXRA 2N5FA 3D22A 2VLTA 1TK8B 2VAFA 4ZBDA 3VWXA 2DMLA 2HFDA 5CP1A 5H5QA 1FB0A 1U3IA 1R26A 1YJ6A 5DAKA 4X1UA 5DCGA 4KDYA 4K8MA 3F3QA 1CQGA 1YDKA 3E3EA 4HZ4A 1TRUA 1FVKA 4IBPA 1TTZA 1OAZA 1SU9A 2E7PA 2PMTA 3LWAA 3F3RA 3GMFA 1QUWA 3C71A 4HQZA 1GSYA 1Y6EA 1YQ1A 3G9BA 2B1KA 1ML6A 1K0NA 1ZMAA 4GXZA 2LUSA 5DDLA 4MJAA 1FB6A 3M8NA 3S9FA 3L4NA 3RDWA 3H79A 2OACA 2FWEA 4PQHA 1GTIA 5J9BA 4EDZA 3HVSA 1QMVA 3TOUA 1KNGA 2PWJA 5DALA 3HYPA 3UBLA 2B5EA 1XFLA 4XIHA 4HZ2A 1GP1A 4OWYA 4BA7A 2CZ2A 4N30A 4N10A 1TOFA 1FHEA 4GRFA 3K8NA 5FHIA 1M9BA 2JZRA 1M9AA 2DIYA 5CNWA 4KX4A 2VD1A 4WBJA 2VL3A 3Q74A 2WJUA 4MK3A 4NHZA 2GTUA 4LA1A 2ON7A 5ECIB 3L9SA 4D73A 1KBNA 2VM2A 1TU7A 4F03A 3IAS2 1UN2A 4TR4A 1GUHA 1RW1A 2VCZA 2AAWA 1PX6A 3ZIJA 3ZVJA 1V58A 4EXJA 2KHPA 2P0GA 3D4TA 2X8HA 1B8XA 2YN1A 3F4RA 1PA3A 2GLRA 2WB9A 2B7JA 5JCWA 3EU3A 1GTBA 2GS3A 2GDRA 2RM6A 2MMAA 1GL8A 1EWXA 5IQYA 2YANA 4DVCA 3DMLA 2FCHA 2X8GA 2DJ2A 3BOAA 1JHBA 1WMJA 4FIWA 2C3QA 1TDIA 1B4QA 1Q4JA 1TRWA 2PU9C 4ECJA 1HD2A 5D9TA 3LXTA 6GSSA 2IMDA 3ZIVA 2CAIA 3FR9A 1O6JA 3RAZA 3A3TA 2P31A 4N0VA 4KE3A 1ST9A 1T4ZA 4JBBA 4K6XA 4JE1A 2V6OA 2MYGA 4KNDA 3L78A 1TI3A 3VWWA 1IYIA 5G30A 1EZKA 3UL3A 3HVXA 2MMOA 5AGYA 3IAM2 2D2ZA 2MBSA 3UIWA 4J56E 1WWJA 5E4WA 16GSA 3ZLPA 1C72A 1K3YA 2HRNA 4RQXA 4WEYA 5D9XA 1XXUA 1AW9A 3FW2A 3AY8A 1X9MB 3WYWA 1GH2A 4DSRA 2TIRA 3VPQA 4AF2A 1A23A 5DAKB 4YQMA 4JR4A 3MNGA 4LL4B 3ZL5A 3C1RA 4PGTA 4WBRD 2F8FA 4JRRA 3US3A 4PQ1A 2YWMA 1TKDB 1G6YA 3CSIA 1F37A 1YF0A 5B8AA 2AYTA 2C0DA 1PGTA 4FYUA 5D9WA 1XW9A 2I1UA 1V57A 4HQSA 2GZPA 1NHOA 1YEPA 2O87A 1XPVA 4LLRA 1I5GA 1GWCA 1TRSA 1VF4A 2KP1A 4IELA 2RUEA 2H8LA 5IOXA 1MDKA 2YOIA 3KXOA 4YAPA 1THXA 2JACA 1BG5A 2H1BA 5IMAA 4O5RA 3I6AA 5DALB 3DXBA 1Y25A 1BJXA 1Q98A 5B7CA 1ZZYA 2GVPA 4OFTA 2C0EA 3HY2A 4KCEA 3TB2A 3ERFA 2NPBA 2M80A 4K7NA 3HZ8A 22GSA 2ES7A 4Q5RA 1RK4A 1E6BA 3GTUA 3G7IA 3CSJA 4K7OA 5CYYA 4NMUA 2HLSA 3VI7A 1O73A 3LYKA 1U88A 2QKEA 5JWQB 4PURA 1PKZA 4YH2A 2ON5A 2C0GA 1JZRA 2YNXA 5J9CA 4D73B 4G2EA 2TRCP 1A24A 3HKRA 4EVMA 2CT6A 4DEJA 2MMZA 1ILOA 2L5OA 3A2WA 3IPZA 4ZL9A 1JZOA 1FAAA 4F0CA 1K0BA 2GQLA 3FZAA 2FWFA 2H76A 5CO3A 1SKWB 5C04A 1EGOA 4IHUA 5B8BA 1F9MA 3HVVA 1TJDA 2E2MA 3VPTA 4HEA2 1QGVA 4IKHA 4ZIJA 4TN8A 1UC7A 2YP6A 3KP8A 3GN3A 1EP8A 5DQSA 4F82A 2M46A 5AIXA 4BVXA 3C8EA 3DEXA 3F4TA 2HSYA 5HR2A 3ZFLA 3BBYA 3F0IA 3TKSA 5HFKA 1AUCA 4GQFA 3DGQA 4EKZA 1AC1A 1TXXA 3MAKA 2V1MA 4E8EA 1O81A 5INYA 1YKAA 2B5XA 1OE8A 3R2QA 1M2BA 4K9ZA 3APSA 3C1SA 5J5NA 1N2AA 4J2FA 2R4VA 3KTLA 2PBJA 2DJ0A 4HI7A 4YQUA 4I2UA 2VCWA 4L0UA 5LD0A 2PN8A 3VURA 5IMFA 2H1DA 3LQ7A 4LMVA 3GURA 3SBCA 4KA0A 5A4WA 6GSWA 5HR0A 1AIUA 3I9V2 3UVHA 3HDCA 2C3TA 1XWAA 1XW5A 5CREA 3EE2A 1GLPA 5IMDA 2VOCA 1J9BA 2YWNA 5E59A 2LSTA 3P90A 2I81A 4Z7XA 1TI1A 1EEJA 2H6ZA 2C0FA 3A5WA 2IMEA 4EUYA 4IGJA 1WE0A 3D6IA 5CRGA 4FH8A 4ECBA 2KOKA 4MH3A 4YAVA 3ZTLA 4RUVA 6GSVA 5GAND 2NTOA 3W6GA 3U5RE 1XIYA 1O8WA 4ECIA 3FR6A 3L9VA 1EV9A 3LFLA 1XOBA 1JZWA 4NHWA 2LRNA 2CX4A 3RPPA 1M2DA 1ZYEA 5F07A 2KUCA 4KB3A 3WGXA 3CSHA 3RBTA 2VL2A 2GT5A 3LYPA 2WULA 3VFIA 2HYXA 4KAEA 3GKXA 3QAGA 3LJRA 5ECKB 2L6DA 1GLQA 4KW6A 2GQKA 2IL3A 3QCPA 5IOWA 3IC4A 2FY6A 2YZUA 4BL7A 3DIEA 4HJMA 4G9HA 1SJZA 3PR8A 2C8UA 2YZHA 2L59A 4KDXA 2O85A 2GZYA 5FT3A 4RQRA 2IN3A 4I6XA 1PSQA 4N0ZA 14GSA 10GSA 2VLUA 2H70A 4V1Ag 3GYKA 13GSA 5LNKe 2HT9A 5EY6A 3KD0A 2H66A 3D0ZA 3KH9A 4X0XA 1SL2B 4MCUA 4MF7A 4MH2A 3M3MA 1K0OA 3C7MA 2OE1A 1N8JA 5CRHA 3D5JA 1GSQA 3FEUA 3ZREA 2L4CA 4HU7A 4BVYA 5IPGA 3EMXA 7GSSA 3LORA 4OFMA 3QD9A 1HNAA 2V6KA 3FYGA 4I8BA 4PUAA 4WF4A 3FHKA 1HYUA 1SL0B 1XW6A 1USBA 2R3XA 2X64A 3LG6A 3TGZA 2O89A 2XHFA 2OE0A 1FO5A 4AGSA 4Q5FA 2O8VB 4L8EA 2YWIA 4ML6A 1GSEA 3GSSA 3EU4A 3Q6OA 3GFKA 1A0FA 4XS6A 1EEMA 1MD4A 1MDIA 1X5EA 4ZXGA 4TOPA 3MSZA 2EIOA 3GRXA 2LJKA 4ZL8A 1PD21 4BWQA 5HR3A 2CX3A 5ENUA 4TVEA 2YV7A 5F0GA 3TJGA 2L4QA 3V1WA 1YF1A 3IK7A 1T1VA 1XWGA 3KJYA 1F3BA 3GX0A 4TR3A 2YCDA 5HFGA 3OR5A 2CA8A 3IA1A 2P5RA 4Q5NA 3CBUA 1AXDA 3ME8A 4AJ6A 3TJKA 3TRQA 4LL1B 2B7KA 1BQ7A 3CTFA 1V98A 2H01A 4DSSB 3UJ1A 4NXIA 3E9JB 2LV3A 4TXVA 3PGTA 1PN9A 1YZXA 4HJ2A 2DLXA 1OYJA 1F6MC 2LQOA 4ZB9A 2R6KA 4MABA 2L5LA 1M7TA 1WOUA 5KEJA 1DBYA 4V2MA 3TRPA 4F2IA 2MZCA 5FWGA 4BWSA 5LCZA 3GKNA 5JCUA 3E0UA 3GHAA 2IMKA 3GV1A 4K0GA 2OADA 4DSQA 3TUEA 2GSTA 2LQQA 3QFBC 3APOA 1SK0A 2A4VA 2XBQA 1EGRA 5GAPD 2K18A 3F9UA 4GCIA 3P7XA 3PH9A 4ZBBA 8GSSA 1R4WA 1KTEA 1RQMA 5IO0A 4I2TA 1K0DA 2AV4A 1G7EA 4WXTA 1OC3A 2CAQA 3IHQA 1T8EB 1SYXA 5IM9A 3TKSE 4OD7A 4EL1A 4HS1A 3FZ4A 3WT1A 2V2GA 2L57A 2LNTA 1TRVA 2H73A 1JLWA 4KCAA 5DBQA 4JR6A 3TKPA 1VF2A 5IMZA 4ZL7A 1ABAA 1E2YA 1FG4A 3QOUA 4POMA 1VRSD 5AISA 2G0FA 3VWUA 1G6WA 2LEGA 3TKSC 2AHEA 3GX8A 2HI7A 4IW9A 3DVXA 2GT6A 2LKUA 4TKYA 2LTKA 3A2XA 1NW2A 2JSZA 1PQNA 1XWBA 4IVFA 2F9SA 1B48A 2JSYA 1R7HA 2K6VA 1OC9A 4POBA 3WD6A 2CV4A 4OFNA 3HHVA 3EVIA 3ERGA 4OCEA 4L0WA 3CXGA 2LJRA 1O85A 5ELGA 5CRWA 5G5FA 5G2ZA 2R2JA 2V41A 2JL4A 1TK5B 3A2VA 4IP1A 2KP2A 1G7OA 11GSA 3TOTA 1PKWA 4IN0A 2NBSA 4XRAA 1WIKA 1H75A 1I9DA 1S3CA 2FA8A 3H93A 1TW9A 4V2LA 3D4MA 4MMMA 4NV2A 1OVNA 2H1AA 4X43A 4KSMA 3UARA 4KDUA 1B9XC 1F3AA 2WFCA 5HQPA 1XVWA 4GLTA 2VM1A 1Z6MA 2H0GA 1MD3A 3HD5A 3APQA 4G19A 4K0NA 2FLSA 3ZRDA 3F6FA 5KN0A 4O7HA 1X0RA 1W4VA 2DJ1A 2DJ3A 1WRYA 1Z7PA 2FD3A 2HZEA 1AAZA 4IP6A 2PVQA 1YY7A 2ZCTA 3CMIA 1B4PA 2FA4A 2FWGA 3TDGA 3N9JA 3L9UA 4AJ8A 4ZBAA 4GTUA 3IBHA 4EC0A 4ULXA 1Z6NA 1UVZA 2DJJA 2WS2A 1ERTA 1M2AA 3ZITA 2VL2C 3I43A 2YWOA 3M9KA 2OJLA 3DVWA 5ECRB 1FOVA 1AQVA 3FK8A 1AQWA 2HNLA 3RPNA 2H19A 3DRNA 4J57E 4GQCA 4N11A 5D93A 4GSTA 1FW1A 2LRTA 4TR0A 4Q5QA 2GSRA 1DE1A 2DSAA 3VLNA 3FRCA 4OMVA 3GSTA 4XHMA 3NOFA 3H4KA 6GSYA 2YJHA 3TRXA 2HSHA 3QAVA 5IMCA 2JADA 1GSSA 4E8HA 4POLA 3FY7A 1ERVA 2LNSA 2VCTA 4L5LA 2GZZA 2REMA 1SD9A 3H1NA 5B6NA 4O32A 2H6XA 2L6CA 1GNWA 4KH7A 3EMPA 4JZQA 1V9WA 2OA7A 1V2AA 1U87A 2BJXA 4TXOA 2AJQB 1XBSA 3CYNA 1SENA 2H0HA 4MJCA 1XZOA 4JU5A 2QSIA 2NVLA 4GSSA 4EF0A 1IYHA 3VI5A 3L0HA 2DIZA 6GSTA 2K9FA 4ZB6A 1A2MA 4XRDA 1XVQA 4OO4A 1YEXA 5GSSA 5A4UA 1Z9HA 5G1KA 2N5BA 3UBKA 1THOA 1M99A 1T4YA 2GSQA 1O8XA 4IJIA 5ABRA 1U6TA 3J7Yk 4EDYA 1SK1A 2FNOA 1CQHA 1B9YC 1LJRA 4WETA 2CVBA 2E2GA 3IK9A 1MDJA 3LXZA 17GSA 5G1LA 3U6VA 1QFNA 3I69A 3GIXA 3CTGA 4XTSA 5D96A 1X9SB 3WT2A 3HZ4A 4ACSA 1WJKA 2C80A 4V2NA 2N5AA 4PNFA 4WF5A 2I3YA 1X5DA 3HA9A 2J23A 2CQ9A 2FGXA 4AJ7A 2YV9A 1GSUA 2ZNMA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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