5IM9A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f1
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule tags Oxidoreductase
total genus 49
structure length 156
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5im9A00
1QMVA 1WMJA 4V1Ap 1JZDA 1A0RP 3CTFA 2LRCA 3VLNA 3I9V2 2X64A 3F4RA 3KTLA 1NHYA 2B6MA 1JFUA 4IQAA 3UOMA 3S9FA 2H6XA 3FZ9A 5IPGA 3LYPA 1PN9A 4ZB9A 3RBTA 4K0GA 1ON4A 1TP9A 3BOAA 2LNSA 2DJ3A 3P2AA 5AIVA 2TRXA 2B1KA 2CX4A 2VAFA 1ST9A 1K0NA 1GUKA 5D9XA 2C4JA 1XVQA 5D73A 1XVWA 2PPTA 5IMZA 4JU5A 1M9AA 4WR4A 4WXTA 4WBRD 4P3YB 5IOWA 1XOAA 4EF0A 4PXOA 3IV4A 4O92A 1O85A 2CVKA 5CREA 3KXOA 5IPHA 4D73A 1JZWA 1Z7PA 5ECQB 4HZ4A 2IN3A 1X5DA 3C1RA 2K8VA 4KUNA 4KAEA 1ZYEA 3A2VA 5KEJA 2GSQA 3L4NA 4I2TA 3TKSC 19GSA 2L4QA 5D8IA 3TJBA 8GSSA 4GTUA 4OCEA 3GH6A 1J08A 2RLIA 6GSUA 3E3EA 2H1BA 4K7OA 2IFQB 2X8HA 1YJ6A 3TRQA 1QQ2A 1YKAA 5KN3A 2R37A 4ZBBA 4F0CA 3KP8A 2YJ7A 1DBYA 2YP6A 2LKUA 3D6IA 4YQUA 3HHVA 2K6VA 3HJPA 5DCGA 2XHFA 1SU9A 1Q98A 1M99A 1XXUA 4I6XA 1M9BA 1FAAA 1TRWA 4HQZA 2QGVA 4XRAA 3FKFA 2YCDA 1KNGA 1XWBA 5CO3A 2CVDA 5G2ZA 4TOPA 1DE2A 5LCZA 4GQCA 5ABRA 5G5EA 1VF1A 1LU4A 2XBIA 2OADA 12GSA 5E59A 3FR3A 2JACA 2VOCA 3EE2A 4I5QA 2M72A 5F07A 4ZILA 5HR1A 2YWMA 2EIOA 5D93A 5KN2A 4NAXA 2VD1A 3ZMKA 3EYTA 1H4OA 4ILFA 4JRRA 1A2JA 5GZZB 3F4SA 4PQHA 3GX0A 1PKWA 4ISDA 4OWYA 2PWJA 3BCKA 4NV5A 1E6BA 4V1Ag 2VCXA 2VCTA 2EIQA 4BVYA 2LJRA 2MMOA 3GN3A 2KLXA 5GSSA 2O7KA 5HFKA 4BVXA 1O7UA 2FWGA 1C72A 2J9HA 3LEFA 1FW1A 4I8BA 4D73B 1GSYA 3U6VA 2FGXA 3TDGA 3L0HA 3L78A 1MEKA 1GSQA 4DSSA 2JSZA 3HVVA 1YEXA 2GT6A 2IIYA 3MNGA 4KH7A 4Z7XA 4K6XA 2DIYA 5HFGA 5IMFA 5IOXA 3G9BA 3P90A 5ENUA 3TUEA 1TK5B 5FHIA 1AQVA 3EVIA 4GF0A 4MDCA 2N5BA 1CQHA 2C3TA 3ED3A 1F2EA 4ECIA 4HJ2A 4F0BA 2GSSA 3TJKA 1WE0A 4TR4A 1GWCA 1B8XA 1TJDA 1SL0B 3ZITA 3EMPA 2C0FA 5G5FA 3FHKA 1PD21 2PGTA 2K18A 1K0MA 1TRUA 2VCQA 1UC7A 2H30A 4QQ7A 3O76A 1PSQA 1PMTA 4PQ1A 4BL7A 1OE8A 3GX8A 4FIWA 2GZPA 5IMAA 3Q18A 2BMXA 3SWLA 1U87A 4JR6A 1E2YA 3LXZA 4IN0A 4MK3A 3UBLA 2YZUA 3PR8A 1GSEA 2J23A 5JCGA 1FOVA 1O8WA 4OO4A 3HY2A 2FWEA 5ECKB 4TXOA 3TOUA 5KN1A 1M7TA 1A24A 4MZBA 2DLXA 4PNGA 4POBA 1QXHA 4X43A 2YZHA 2GZYA 3H79A 5ID2B 3P8WA 1HNAA 5IMCA 4WR5A 5DVBA 4V2MA 4PQIA 4IVFA 1GRXA 5G30A 1GH2A 5AGYA 4ZBDA 3IOSA 3IK7A 3H1NA 2NPBA 4TVEA 2R3XA 4DEJA 1XWGA 5IM9A 14GSA 2LS5A 3VWVA 3IBHA 3N9JA 4GCIA 3D21A 1JZRA 2E2GA 4GSTA 4HJMA 1BQ7A 1QUWA 3KGKA 1AC1A 2B7JA 2HXKA 2PU9C 3F0IA 5E4WA 1Y25A 1ERWA 4FYCA 5CAXA 3F63A 1GL8A 5A4VA 2OBIA 6GSXA 3ZTLA 4POMA 4EO3A 1TK0B 5CP1A 3MSZA 1GTIA 4WEYA 2OE1A 1JLVA 2RIIA 2VL9A 7GSSA 3A3TA 1FB0A 1TU8A 3QFBC 3ZMLA 5HQPA 3ZRDA 3F9UA 3ME7A 3C1SA 2HSHA 4PUAA 2C8UA 1FVKA 3W8JA 5J9CA 2N5AA 1W4VA 3Q19A 2WFCA 2FCHA 3CSHA 3VFIA 3UAPA 1AQWA 3DMLA 1K0OA 1H75A 3W8SA 2KP1A 5KN0A 1EGRA 4EUYA 4BPYA 1K3LA 3DRNA 1TI3A 1XBSA 1WWJA 1Z3EA 5DQSA 2VCZA 2YPMA 1EP8A 3FYGA 1B4QA 5B6NA 2LQQA 2DJ2A 3CBUA 2CZ2A 3L9VA 1T4YA 1B4PA 2HFDA 3HDCA 5AN1A 3N5OA 5JWRB 1S3CA 3EINA 2H70A 4Q5FA 1B9XC 2WDUA 3UL3A 1DUGA 4EKZA 3MDKA 4RI7A 1XWKA 4HQSA 2D2ZA 1T1VA 1B48A 4XS1A 5F8BA 2O8VB 5CRDA 2DBCA 5G1KA 2FD3A 3IR4A 3KMOA 5EPFA 2P5RA 1V9WA 3J7Yk 2LRNA 4K0NA 2PMTA 2XBQA 5A4UA 1M2BA 5LD0A 4TN8A 2E0QA 1PL2A 3IAM2 2C3NA 2RM5A 3WYWA 4JZQA 1O8XA 1A23A 2B5YA 2RM6A 5ELAA 2R4VA 4MH2A 5ECLB 1A2LA 2LQOA 3LQ7A 4IP1A 5ECSA 1ERVA 1X5EA 4POKA 2DJJA 1GTAA 1PL1A 3CMIA 2C0EA 3D5JA 2I1UA 1BYEA 1U3AA 4V2LA 2V41A 5DQYA 1SYXA 4EXJA 1OC8A 3CRUA 2CZ3A 3BBYA 3US3A 4CHSA 4MLYA 1J9BA 4KSMA 5C00A 2LV3A 2DJ1A 4OFNA 3BCIA 3C73A 4ZL7A 3QMXA 4MZCA 3VPQA 2FWFA 2F8AA 4ZXGA 3NOFA 1T3BA 5ECIB 3DD3A 4ECJA 1GNEA 1S3DA 2PVQA 2VLTA 5IMDA 1AAZA 1GTUA 3RAZA 4NPBA 2VLUA 2IPAA 4HOJA 2FLSA 1OE7A 3WGDA 1DE1A 2XPDA 4F82A 3M0FA 3GKKA 3CSJA 3ZFLA 2P0GA 2YOIA 2HT9A 4IS0A 1WPIA 3R2QA 1HNCA 2HNLA 1PQNA 4XS4B 2VIMA 2C0DA 2LJKA 2MMZA 4TR1A 4N0VA 2TRCP 3KCMA 3ERFA 4O7HA 1GSSA 1M2AA 4G19A 2RUFA 1HD2A 3LYKA 1GSFA 2LUSA 2H1GA 2GS3A 1EGOA 5DALB 3ME8A 1V2AA 4PGTA 4HEA2 1T4ZA 3GHAA 2YV7A 5G31A 1OC3A 4LL4B 2LRTA 4I97A 4IHUA 2V6KA 3LGCA 3F3RA 3TOTA 4MJAA 4GXZA 3DKSA 1U3IA 3AY8A 4AJ7A 2B1LA 3C8EA 3QFAC 3HA9A 1SK0A 4MPGA 2V32A 3OR5A 4ULXA 3V1WA 2V1MA 3IXRA 1SD8A 2XPEA 3TB2A 4EDZA 2H1DA 1X9WB 3M3MA 3VWWA 3D22A 1SJIA 5GSTA 1R26A 1T8EB 1TI1A 2O89A 1Q4JA 1A8LA 5J41A 2V6OA 2GTUA 1YF0A 4EDYA 2H0IA 1FVJA 1ERTA 13GSA 6GSTA 1YDKA 2HLSA 2IMIA 2OA7A 3I6AA 3KTBA 5ID2A 1ABAA 3HCZA 4ZB6A 2L5OA 4MP4A 2X8CA 3A2WA 1SD9A 1BX9A 2FUG2 1ZYQB 2BJXA 4I2UA 3SBCA 1XOBA 3CSIA 4J2FA 1O81A 2PN8A 3EU3A 4YQVA 5CRGA 11GSA 3APOA 4X0XA 2A4VA 4FYUA 3UBKA 4PX1A 3GIXA 2HYXA 2LEGA 3I69A 4G2EA 2V2GA 4KB3A 1GLPA 3KP9A 4TR1B 5IO2A 3IA1A 3DVWA 2C1YA 3I43A 1F6MC 4IJIA 2VM2A 3F6DA 2EIRA 2R5GA 5LNKe 1EEMA 2FA8A 2KHPA 2IWTA 5EVOA 4EL1A 1TOFA 4Q5RA 1I9DA 1MD3A 1MTCA 4O32A 1TK8B 2CAIA 4GWRA 1Y6EA 4TKYA 4MH3A 1G7EA 1NHOA 1AXDA 1G0TA 1SENA 3KH9A 5CRHA 4OCFA 4PURA 3TKRA 2FHEA 3FRCA 2REMA 3TKPA 1XPVA 1THOA 2GGTA 2GSTA 2F51A 1GUHA 2YV9A 3IPZA 1TRSA 1SK2A 4HS1A 2CX3A 5JCUA 4IELA 4G10A 4K7NA 4KSOA 3RDWA 1CQGA 1TTZA 3KMNA 4ZL8A 2DMMA 4GSSA 1YY7A 1AIUA 5ECHB 5A5KA 1I5GA 3HVSA 2G2QA 2QC7A 4ZIJA 2C80A 1XW5A 1BJXA 3VURA 1EOHA 1YEPA 4EVMA 4J57E 2KP2A 1Z6NA 5J5NA 2AJQB 2IMFA 2H76A 1PA3A 1PX6A 3DXBA 5COHA 1HQOA 3PH9A 5H5SA 2DJ0A 1XFLA 3WD6A 1VRSD 1O6JA 1YQ1A 1EV9A 3BJ5A 3HYPA 3CXGA 2AYTA 3M1GA 2JADA 2BTOT 2ZUPA 2C0GA 3O3TA 1WRYA 2MYGA 3G7JA 4ML6A 5F0GA 2DIZA 3KH7A 4IJ3A 4IP6A 3TJJA 1GLQA 2AUVA 3GURA 2L5LA 2H01A 2ZCTA 1YKCA 1AUCA 2PUKC 3IRAA 4L8EA 5F06A 4NHWA 5DAKB 2C3QA 4BWQA 3HVXA 1SL1B 3GNJA 3RHCA 1FG4A 1UVZA 3GUSA 2I81A 2VUPA 4DVCA 5J9BA 3DIEA 17GSA 3W6GA 3IDVA 4GRFA 5D96A 2AHEA 3APSA 1OKDA 2L6CA 2VL2A 4N11A 2K9FA 4AGSA 2JU5A 2B3SA 5DJLA 2L6DA 4RQXA 4RQRA 1QFNA 4GQFA 4L0UA 5FWGA 3GTUA 1A8YA 3M9JA 3A2XA 3GSSA 3PGTA 1PGTA 4V2NA 5ECNB 5ECMB 2FY6A 3ERWA 3VWXA 5DDLA 1THXA 1G7OA 4HU9A 2CAQA 2CA8A 4KDXA 3H8QA 2IJYA 4E8EA 1SJZA 4K7IA 1MDKA 2GQKA 3QCPA 2WULA 1EOGA 2VCWA 1V58A 1ERUA 4Q5QA 2H0HA 5ECPB 4K2DA 4FO5A 3RHBA 5B8BA 5A4WA 2GVPA 3FY7A 4XS4A 1A0FA 4GSNA 1R5AA 1XWAA 4PUFC 3UMAA 4LL1B 2WZ9A 2M46A 3QOUA 1OC9A 2VLVA 2OE0A 4MJEA 1TU7A 5FT3A 3RPPA 2KOKA 5DALA 4OFTA 1LBKA 4DSRA 3VI5A 1QGVA 3TRXA 1SJ6A 2A2SA 1XWCA 3G7YA 4WBJA 4N10A 5CNWA 2CVBA 5ECRB 2QKEA 1MD4A 2H6YA 3DGQA 2B5XA 1MDJA 2B5EA 3Q74A 4MZWA 1O73A 4MABA 5B7CA 2AB6A 4ZBAA 1JZOA 2HE3A 3QR6A 1ILOA 5J3RA 2MMNA 2H74A 2LSTA 3GFKA 1M2DA 1M0UA 1V40A 2CT6A 1F9MA 5D9WA 4O5RA 2FWHA 4LMVA 3DVXA 4ML1A 4MPFA 4IGJA 5JCWA 1LJRA 4OO5A 1K0BA 2VCVA 4TXVA 4WF5A 3CTGA 2WGRA 5B8AA 4N0ZA 2IMDA 5H5QA 5IIZA 3JCML 3E9JB 1SK1A 3MAKA 2WCIA 3KD0A 3VI7A 3GTUB 2YANA 4Q5NA 2OKAA 4NHZA 4BA7A 2E2MA 3CRTA 2CQ9A 2O85A 3LSZA 4HU7A 1TRVA 2GLRA 2YN1A 1N8JA 2MBSA 1X9SB 4TRXA 3D4TA 3LWAA 2I3YA 1U6TA 3GL3A 4OFMA 4L0WA 3GV1A 1K3OA 4AF2A 1EZKA 3LORA 3GYKA 4XTSA 3UARA 3GA4A 3TKQA 2F9SA 6GSVA 3KM6A 4QL7A 4X1UA 5ELGA 1TDIA 1K3YA 5HR3A 4KCEA 5G1LA 5C04A 18GSA 4FYBA 2LTKA 2DSAA 4HZ2A 4ECCA 1OC9B 1UA5A 1OVNA 3M8NA 1U88A 1VGLA 2R2JA 5EY6A 3HD5A 3DEXA 6GSWA 3KJYA 1KTEA 1F3BA 2B7KA 2F8FA 2LNTA 3QAGA 2JSYA 4KX4A 3ERGA 2VL2C 1X0RA 2NDOA 1PX7A 4NWYA 2H72A 2WJUA 5IO0A 1SKRB 2HRNA 3D0ZA 1ZGNA 2WS2A 2AAWA 2H19A 3QPMA 5JWOB 2QSIA 3C71A 5DJMA 4TR0A 2E7PA 5CYYA 3ZIJA 1F3AA 4POLA 1UN2A 3HKRA 4XS6A 2WRTA 3QAWA 3TGZA 3ZREA 3EMXA 3GL5A 3TRPA 4F9ZA 2PVOC 1VF2A 1BG5A 3D4MA 3GH9A 2GZZA 4OMVA 1TXXA 1Z9HA 2IMKA 2GDRA 3NIVA 1X9MB 2H71A 3IE3A 4K8MA 1GSDA 4E8HA 2HZFA 2L57A 3EWLA 1ZMAA 4L5OA 1K0AA 2VM1A 4FH8A 1MDIA 20GSA 1SKSB 1IYHA 2JZTA 1NM3A 2GSRA 4XHMA 2DC5A 5HFIA 1HYUA 3VK9A 4HI7A 1J0FA 1TW9A 1OAZA 2ZNMA 3CYNA 3A5WA 2MBTA 1FB6A 3ZLPA 3APQA 4JE1A 4IBPA 4MJCA 2H75A 2ON5A 3C7MA 2H0GA 2DJKA 4MCUA 1AQXA 3WGXA 4H86A 1RQMA 3KIJA 1ZL9A 3UJ1A 4JR4A 2GQMA 2H8LA 2HZEA 1QK8A 2FA4A 5GAPD 5AIXA 2MMAA 4YH2A 1OKTA 4IQ1A 1KEBA 4KCAA 2H73A 5DAKA 1ZOFA 4HUAA 4NXIA 3KEBA 1PKZA 3VWUA 4NV2A 1GP1A 2X8GA 3FZAA 5EL8A 4XRDA 4F03A 1G6YA 1XW6A 3Q6OA 2IMEA 1VF4A 3EU4A 2VO4A 4EC0A 2JZSA 5H5RA 3ZVJD 1GTBA 3H93A 4RUVA 2IL3A 1V57A 1JHBA 3KZQA 3UVHA 3WT1A 1ZCPA 1WJKA 4BWSA 2K8SA 3LG6A 5D9VA 2FNOA 2Z9SA 4OD7A 3HZ8A 5B6MA 1TKDB 2P5QA 2YJHA 4JBBA 3F8UA 1R4WA 2X99A 5D9TA 5L71A 9GSSA 2H66A 1K0DA 3TJFA 1KBNA 2L59A 3GKXA 4F2IA 1N2AA 2YNXA 3WT2A 2OACA 4WF4A 2YWNA 2MZCA 2H6ZA 3VPTA 2F3MA 1OYJA 3F3QA 4KA0A 1NSWA 1ML6A 4N30A 1EP7A 1RW1A 3QDNA 10GSA 5INYA 3FZ4A 5DCHA 1T00A 4MJBA 3BD2A 5F05A 4ZL9A 1PRXA 1Z6MA 4YQMA 1V98A 5AISA 1X5CA 1B9YC 1A2MA 1WOUA 1FO5A 5DBQA 3HJOA 4MA9A 3PINA 2ALBA 1YZXA 4XIHA 1HNBA 1NW2A 2OJLA 4MF5A 1R7HA 3IC4A 3M9KA 1Z5YE 1BEDA 1WP0A 3EURA 1ZZYA 3TCOA 4CW9A 3F6FA 1SKWB 3L9SA 2YWIA 4ECBA 2M80A 4JEDA 4KNDA 3ZL5A 4YAVA 3TJGA 2HZEB 1XZOA 3HJMA 3L9UA 3FR9A 1BAYA 1URMA 2I4AA 4AJ8A 2NTOA 4RI6A 2OE3A 1DSBA 2OBKA 4MF7A 1FHEA 2NBSA 1GUMA 1XCCA 4KDUA 2O87A 1GULA 4YAPA 2I9HA 2JL4A 1EV4A 3MWHA 3TKSA 1SL2B 4K9ZA 4DSSB 4AJ6A 4KDYA 3FW2A 4MF6A 6GSSA 3GKNA 5CRWA 1Z7RA 3ISOA 4MMMA 2P31A 1SYRA 5GAND 1EWXA 1GNWA 5HR0A 1IYIA 4XCSA 3NZNA 3O6TA 1G6WA 1USBA 4J56E 4WETA 2ES7A 3ZVJA 1XW9A 1GSUA 4WKWA 1XIYA 2G0FA 2GQLA 3ZIVA 4LA1A 3QAVA 4KGIA 2YWOA 3FZ5A 3P7XA 2AV4A 2WB9A 1EEJA 4G9HA 1R5PA 3HZ4A 1S3AA 2HI7A 3FK8A 4TW5A 4LLRA 4L5LA 4PNFA 3LFLA 5J4UA 3TKSE 3GRXA 3F4TA 3FR6A 1JLWA 22GSA 3G7IA 2VL3A 5IQYA 3GKMA 4LMWA 3EC3A 2VD0A 3ZZXA 2PERA 2L4CA 2R6KA 1ACVA 4ID0A 1F37A 5JWQB 1WIKA 4IW9A 3FEUA 3UEMA 6GSYA 2H1AA 4TXOB 1W89A 4TR3A 2XC2A 3RPNA 2KUCA 4NMUA 2A2RA 4ACSA 3DYRA 3LXTA 1T7PB 3GMFA 3WGEA 1YF1A 3UIWA 16GSA 3LJRA 3K8NA 2GT5A 2RUEA 5HR2A 3E0UA 3QD9A 3IHQA 3U5RE 5IMVA 2PBJA 3UVTA 2DMLA 4DSQA 2CV4A 5ECOB 2NVLA 2LJAA 2IFQA 4K1FA 3GSTA 3ZYWA 3DWVA 4EE0A 1AW9A 4KW6A 3IAS2 4ZB8A 1RK4A 1VF3A 1K0CA 2HSYA 3IK9A 4KE3A 2HRFA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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