5IM9A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f1
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 49
structure length 156
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5im9A00
1JZOA 4AJ8A 3GKXA 5HR3A 3PGTA 4IP6A 2GQMA 3LQ7A 2V2GA 4K7OA 2XBIA 1F6MC 4IBPA 5G1LA 2DJ2A 5DDLA 1T4YA 3CXGA 1XOBA 1K0DA 2V6KA 1HYUA 4ECBA 5IMVA 2FNOA 1SJIA 4RI7A 5IOXA 4F0BA 3TKQA 4L0UA 3LORA 3GRXA 2FLSA 2C0DA 5GAPD 1TDIA 4ID0A 5COHA 1TI1A 4JU5A 1O8XA 2WB9A 1GULA 4TR0A 3TKSE 5DJLA 2QGVA 2CA8A 3F0IA 3ZTLA 5JWOB 3ZMKA 4IELA 1Z7PA 3F8UA 5F05A 4TR1A 4NXIA 1PL2A 3VWXA 3VI7A 2AJQB 3LSZA 2L5OA 2VCZA 5E59A 4XS6A 3UBLA 3F4RA 2PU9C 3I69A 1JLVA 1YJ6A 4ZB9A 4E8EA 3ZFBA 3WT1A 2FWGA 3WT2A 5ID2A 2K9FA 3IV4A 4CHSA 1NW2A 4F9ZA 1ACVA 1X0RA 4HZ4A 1FHEA 2DBCA 2OACA 2GZYA 3DVWA 4ZBBA 3A2XA 3APQA 2CAIA 2VUPA 1AIUA 2I1UA 2R4VA 4K2DA 3HHVA 2TRXA 1SKWB 1S3CA 4DSRA 3UARA 1J0FA 4NMUA 3W6GA 3U5RE 1QFNA 2FUG2 3GNJA 2YN1A 4PGTA 2ES7A 2HI7A 5DAKA 5F07A 5IO2A 22GSA 2VLVA 2RM5A 2E2GA 1XWCA 5A4WA 3DXBA 2VIMA 4XRDA 4JZQA 3PINA 4AJ7A 3TKRA 1RW1A 1GSQA 1EV4A 1H75A 1ABAA 3QAGA 1TRWA 5H5SA 5J4UA 3UIWA 2C0GA 1FW1A 3TJKA 1W89A 20GSA 4RQRA 5FHIA 1A2JA 1K3LA 3F6FA 3US3A 3TUEA 4BWQA 1K3OA 2YNXA 4WEYA 3DKSA 5F0GA 1SK1A 2YJHA 4TXVA 2M80A 4XS4A 3Q19A 1LJRA 2E7PA 2GZPA 3UMAA 1BYEA 3L4NA 4EO3A 4Z7XA 1YF1A 2AUVA 19GSA 3NZNA 3UVTA 1TK5B 2K6VA 2F8AA 4D73B 1DE2A 1GRXA 3D21A 4PQIA 3EC3A 4YH2A 2X99A 5IMAA 10GSA 5GZZB 4F2IA 5CRDA 4BVYA 4RI6A 4FO5A 2N5BA 4KCAA 3KMNA 4OO4A 2YOIA 4WF4A 1PQNA 4EVMA 3GL5A 1VGLA 1Y6EA 3IA1A 4TN8A 2IFQA 4NV5A 3TOUA 1U6TA 4L0WA 5ECLB 6GSSA 2XPEA 4HQZA 1EZKA 3VPTA 4KE3A 1SKRB 2CVBA 2AHEA 1JZDA 1DBYA 4KUNA 1FB6A 1ZYQB 2HT9A 1EOHA 5B8AA 2VM1A 1SENA 1GSSA 2R5GA 3VURA 2H1GA 5CRWA 2FWEA 1XW9A 3FZ9A 4PXOA 1SK2A 2LJAA 4EF0A 2MMNA 1M7TA 2R6KA 2HZEA 2IMFA 2PBJA 2QKEA 1WPIA 2YV9A 2GT5A 1HNAA 2LRCA 2C8UA 4I5QA 3FZ5A 2L4CA 4LL1B 5J9CA 3NIVA 4I8BA 2JACA 1QMVA 2I81A 4TKYA 2LNSA 4JRRA 4ULXA 4XCSA 1AQXA 2O89A 2YZUA 2L5LA 4TW5A 3I43A 1QXHA 1GLPA 5IM9A 6GSWA 1M0UA 4K8MA 2LS5A 5JWRB 1YZXA 1PA3A 2PVQA 2HLSA 4MPGA 4P3YB 5F06A 3M3MA 3DRNA 3WGXA 5B6MA 5CRGA 4N11A 3ZL5A 4TXOA 1BG5A 3ZVJD 3ZFLA 4MH2A 1K0CA 2I3YA 3K8NA 1PRXA 13GSA 2YZHA 4MJAA 3GMFA 5KN3A 3ZYWA 2HSYA 5IOWA 1ZGNA 2X8HA 5HR1A 2GZZA 1EWXA 3TJFA 3HJMA 4PQHA 4F0CA 5JCWA 1O7UA 4YQVA 3UAPA 2KUCA 3BCKA 4DSSA 4MZCA 3HDCA 5JWQB 1ERVA 3HA9A 1Q98A 2P5RA 1G7OA 4OFNA 2P5QA 1E6BA 4FIWA 4HZ2A 3ZITA 1HD2A 1IYHA 1EP7A 3C71A 2H1DA 3FKFA 5HR0A 1HNCA 4GSNA 11GSA 1N8JA 4MJCA 4KSOA 3L9SA 5IMFA 2RIIA 4YQUA 3TOTA 4AGSA 1F3AA 1ERUA 4WBRD 2C1YA 4J57E 2EC4A 2YCDA 4TR1B 3IK7A 3GX8A 4PNGA 2H70A 2V6OA 3DIEA 3FHKA 2I9HA 2JL4A 3ED3A 3WYWA 4MF5A 4FYCA 2YPMA 4WBJA 2C0EA 3EINA 5DCGA 3H8QA 2HFDA 1J9BA 2L6DA 1TRUA 1OE7A 2XHFA 5B6NA 1TRSA 2WS2A 3VWUA 1TJDA 3TGZA 2JZSA 2N5FA 5ID2B 1N2AA 1GNEA 4I2UA 5CRHA 4IP1A 5D9TA 3VLNA 2C3QA 2ON7A 2OADA 1VF4A 2EIQA 4EDZA 1R5PA 3APSA 2JU5A 1PKZA 5ELAA 1LU4A 4KGIA 1THXA 1M9BA 5A4UA 5DQYA 4PNFA 3D4TA 3DWVA 2VL3A 3LWAA 4IW9A 3DD3A 2H75A 4FH8A 4X1UA 4HQSA 3CRUA 5EY6A 2GLRA 1ERTA 5DCHA 5JCGA 4GCIA 5IO0A 3FW2A 2V32A 2WZ9A 2WGRA 1W4VA 3DMLA 5IMZA 3P8WA 1YEPA 2VO4A 3TRXA 1VRSD 3L9UA 1SYRA 3GX0A 4O5RA 8GSSA 5HQPA 4K0NA 2P31A 1DUGA 3GL3A 1U88A 4GQCA 1XW5A 4EDYA 3H1NA 3P2AA 2B1KA 4ZL7A 1EGRA 2KP2A 4O32A 1G6WA 3KTLA 2EIRA 4FYBA 4O92A 2FHEA 2DC5A 1HNBA 4JE1A 4PURA 1UC7A 2HZFA 1PX7A 3UBKA 3E9JB 1FO5A 2CVKA 2EIOA 3GV1A 1O8WA 4OO5A 2CV4A 2XPDA 1X5DA 3Q6OA 4JBBA 1TU8A 2HXKA 3MNGA 3GKNA 2OE1A 1OKTA 2L59A 2DJ0A 1GTBA 2GQKA 2M46A 2K18A 3F3RA 3M8NA 2NBSA 5H5QA 2WRTA 2H0IA 4BPYA 2HYXA 2OE3A 1K0MA 3GSSA 4Q5RA 2LRTA 1T1VA 5ECHB 3OR5A 1Z3EA 3EURA 4MPFA 4OCEA 3HD5A 3FK8A 2OE0A 3IOSA 1USBA 3QCPA 3CYNA 3KIJA 1ERWA 2MMOA 4IN0A 2X64A 3M0FA 3KZQA 4ILFA 4POBA 9GSSA 4ZBDA 3ERGA 2LRNA 2WDUA 3GTUA 5AISA 2H6YA 3HJOA 4F03A 3UOMA 2IWTA 2LTKA 4N0ZA 4QL7A 1C72A 4ZB8A 4OFTA 4YAPA 1MDIA 2HZEB 18GSA 4L5OA 3D6IA 5D73A 1K0BA 1XFLA 3IDVA 3QAWA 5F8BA 1JZWA 2E2MA 5ECQB 1R26A 1M2DA 1GLQA 3NOFA 2R3XA 3GHAA 4MP4A 2KHPA 2YV7A 3KXOA 1SJ6A 4ZXGA 4J2FA 3F4SA 3EYTA 2NVLA 2LQOA 1A8YA 2OA7A 1GUKA 2E0QA 3RHBA 2C0FA 5ABRA 2M72A 1XCCA 1TKDB 1GL8A 2WCIA 2JADA 1GTAA 2VD1A 3PH9A 6GSYA 4JR4A 5LNKe 2FD3A 3F9UA 4LA1A 4TXOB 4NAXA 1KTEA 2HRFA 1F2EA 6GSXA 2C4JA 2C80A 2F51A 2H01A 2B3SA 4LMWA 1A0FA 4ACSA 3ZIJA 4MDCA 3BCIA 3TRPA 5AIVA 5ECRB 3G9BA 1X5CA 4WKWA 3IAM2 3RDWA 1FAAA 2GSTA 3VPQA 5LCZA 4DSSB 2G2QA 3GH6A 3TDGA 2H6XA 1VF3A 2VCXA 4OCFA 1X9SB 1R7HA 5HFIA 3C1SA 1WWJA 2AYTA 1JHBA 3UEMA 3LGCA 2H1AA 1EEMA 1LBKA 3IAS2 1GUMA 1XVWA 2B5YA 3KM6A 3VWVA 5C04A 3GN3A 3QPMA 3WGDA 2JZTA 5G5FA 3HVVA 1A23A 4HU9A 5E4WA 4RQXA 5HR2A 3KD0A 2XC2A 2I4AA 3S9FA 3W8SA 3FY7A 3N5OA 5B8BA 1HQOA 2YJ7A 3CMIA 3ZREA 3HXSA 3CSIA 1F37A 2A2RA 5DJMA 1JZRA 2XBQA 3KP9A 2GSSA 1SD9A 4MMMA 2H74A 2YWOA 1V98A 2IMEA 1AAZA 1TP9A 4PQ1A 2H19A 1EP8A 1XBSA 5J3RA 4WR5A 3Q18A 2AAWA 1G0TA 3L78A 1V9WA 1OAZA 2BMXA 3BJ5A 4WR4A 3CSJA 3EU3A 1BAYA 1AQWA 1SD8A 2DJ1A 2R37A 1O81A 1XW6A 3TJJA 2K8VA 2L6CA 4OWYA 5DQSA 3F6DA 2DMLA 2FA4A 2YWNA 1GTUA 4XTSA 2YWMA 2X8CA 2CT6A 3MSZA 3ZVJA 2OJLA 3QR6A 5CYYA 3P90A 4NWYA 4IVFA 3TKPA 4V2MA 2H72A 3O6TA 1TOFA 3EU4A 1EEJA 1B9YC 2QC7A 3ERWA 3N9JA 4ML1A 1S3DA 2PN8A 1GP1A 4KB3A 1GSDA 3IE3A 5G1KA 2B7KA 1JFUA 1B4PA 1YKCA 1K0NA 3TCOA 2WJUA 2FA8A 1PSQA 3DGQA 2QSIA 4EC0A 1U87A 2CAQA 3HYPA 2P0GA 2AB6A 1I9DA 2LV3A 1PL1A 1AXDA 5D96A 4TR4A 5CP1A 1EV9A 3QD9A 5KN0A 2OBKA 3UL3A 2DSAA 2R2JA 1XWKA 4DSQA 1TXXA 3FYGA 1EOGA 2O87A 5AN1A 3IHQA 2Z9SA 1YDKA 5D8IA 1XWBA 4BWSA 4PX1A 5KN1A 1V2AA 1SK0A 2GSQA 2NPBA 1Z9HA 4G9HA 4HDEA 4YAVA 3EWLA 2B6MA 4TRXA 1Z6NA 3IC4A 2H71A 2AV4A 5DVBA 1GWCA 2PGTA 5FWGA 3H93A 3GKMA 1ZYEA 1YY7A 2TRCP 1I5GA 4JEDA 1A8LA 3QDNA 4YQMA 4EL1A 1H4OA 3J7Yb 2RM6A 4I6XA 2NDOA 1PN9A 1G6YA 3ZIVA 3IPZA 3BOAA 3Q74A 3GTUB 1J08A 1SL1B 4H86A 1R5AA 5EPFA 3C1RA 4POMA 2DMMA 2LQQA 4MZWA 3IK9A 4IKHA 2DLXA 1K0AA 1WRYA 1T00A 4Q5FA 3GIXA 3AY8A 4AF2A 4KW6A 3FEUA 3IR4A 3JCML 4I2TA 2MZCA 4PUAA 4ZILA 3MWHA 3QFBC 6GSTA 2N5AA 4IJIA 3DVXA 4N0VA 2IJYA 3CBUA 4HJ2A 4HUAA 4G19A 1BEDA 1S3AA 2RLIA 5DAKB 2VCQA 1A2LA 1SKSB 1G7EA 1RQMA 5DALA 2CQ9A 4K9ZA 1TRVA 2H66A 1GSUA 1O73A 2LNTA 3D4MA 1QQ2A 5G30A 4KDXA 4KDUA 3HVSA 4BVXA 1OKDA 1X9WB 3G7YA 5J5NA 1YEXA 1PGTA 3RPNA 3KP8A 4GWRA 1WJKA 3ME7A 3KH9A 5G2ZA 1MD4A 1GTIA 4L8EA 2LJRA 3SWLA 4GF0A 5DBQA 1UVZA 4MCUA 2IMIA 1OC3A 1Q4JA 1XZOA 3CTFA 3M1GA 2ZUPA 4ZL9A 2MMAA 5IPGA 2VL2C 2VCTA 1CQHA 1XIYA 1O85A 5KEJA 4XS4B 5J9BA 3F4TA 2OKAA 3TKSC 1THOA 3GUSA 4GRFA 4X0XA 3O3TA 1U3IA 3G7JA 3VI5A 5FT3A 1XWAA 2GTUA 2IN3A 2JSZA 5IMCA 5ECIB 3SBCA 4IHUA 1A2MA 5INYA 5HFKA 4ZBAA 4L5LA 5CNWA 2C3TA 6GSVA 4BL7A 1NHOA 1BX9A 2LUSA 3HZ4A 4K7NA 3F3QA 4I97A 2H8LA 4Q5NA 3ZLPA 2L4QA 5JCUA 3KGKA 4DVCA 4BA7A 2H1BA 1ZOFA 4J56E 2LEGA 3GKKA 1WMJA 4ECJA 3I6AA 5ECPB 2VCVA 2LSTA 3RBTA 3EMXA 4LLRA 2IFQB 2ZNMA 3P7XA 1CQGA 3MAKA 3D5JA 2KP1A 4TOPA 2VM2A 5ECSA 3L9VA 4XIHA 4HEA2 3HVXA 3LYKA 1E2YA 2CX4A 3QMXA 5IIZA 3O76A 2NTOA 1NSWA 3E3EA 4MLYA 5GSTA 2TIRA 4MZBA 3WD6A 1YKAA 1ML6A 5G5EA 4MF7A 5IPHA 1MTCA 4V2NA 4IGJA 1TU7A 4IQ1A 1RK4A 2KOKA 2IMKA 4MA9A 5D93A 2JSYA 1SU9A 3FR6A 1T7PB 2YANA 16GSA 3C7MA 5L71A 2HRNA 1TTZA 1V57A 1B48A 1AW9A 1MDJA 4XRAA 5AIXA 4O7HA 4KDYA 4KH7A 1GSEA 3E0UA 3ZRDA 4WXTA 4GSTA 4IJ3A 1UN2A 2YP6A 4TR3A 1WE0A 2CX3A 3IRAA 1YQ1A 4NHZA 4WETA 2B7JA 4G10A 1VF2A 2B5XA 2ALBA 1GH2A 2YWIA 2RUFA 1URMA 3R2QA 1XWGA 2KLXA 1TK8B 1OE8A 12GSA 2VAFA 3L0HA 1MD3A 4LL4B 1OYJA 2GGTA 3LEFA 3GFKA 5ECMB 4MJBA 4GLTA 4ECIA 2A2SA 3FR3A 2CZ2A 5B7CA 1TW9A 4N30A 1XXUA 4XS1A 2DIZA 3HCZA 3RPPA 2CVDA 3D22A 3LXTA 1A0RP 4IQAA 4Q5QA 3WGEA 1MEKA 1ST9A 3TJBA 4IS0A 4POLA 1K3YA 1OC9A 5D9XA 2L57A 7GSSA 3CTGA 1AC1A 4MH3A 2VOCA 5J41A 4OFMA 2GVPA 3KH7A 2LJKA 2GS3A 2G0FA 1GSFA 1ZL9A 1ILOA 3QOUA 1OC8A 3A2WA 3MDKA 5ECNB 2CZ3A 1NHYA 4MK3A 1ZMAA 3C8EA 1BJXA 1KBNA 4NPBA 1F3BA 2IMDA 3IBHA 3HKRA 4QL9A 3W8JA 2H0GA 2GT6A 3KEBA 5H5RA 4V1Ag 5KN2A 2H6ZA 2OBIA 3M9KA 5CAXA 2WFCA 4EE0A 4ECCA 5ECOB 4K1FA 3LXZA 5C00A 2O8VB 2MYGA 1WP0A 1M2BA 2V41A 3GA4A 5ECKB 5EVOA 1T8EB 1TK0B 2C3NA 1MDKA 1F9MA 2B5EA 1PD21 4KCEA 3CRTA 1A24A 1K0OA 4XHMA 3KCMA 5EL8A 2V1MA 3I9V2 5IQYA 2FGXA 3TB2A 1X9MB 1EGOA 2H0HA 2GDRA 1SJZA 4OD7A 1GSYA 4N10A 1M9AA 1KNGA 4KA0A 1X5EA 2VLTA 5DALB 3QFAC 3G7IA 1GUHA 1QK8A 2J23A 2VD0A 3H79A 4ISDA 5A5KA 1SL2B 2HE3A 2HSHA 4MF6A 1KEBA 1ON4A 2DJKA 3VFIA 2LKUA 1Y25A 3DYRA 1VF1A 2X8GA 1DSBA 1AUCA 3TRQA 1M2AA 4ZL8A 3GSTA 1PKWA 1QGVA 3HJPA 1JLWA 3RAZA 3GURA 2O7KA 3HY2A 1FVKA 4HOJA 2DJ3A 2RUEA 3F63A 4JR6A 1QUWA 3LYPA 5ENUA 2PVOC 3J7Yk 5GAND 2FWHA 1YF0A 2H30A 4KSMA 1WIKA 3D0ZA 2HNLA 4GQFA 4CDOA 1FVJA 5GSSA 3ERFA 14GSA 1XVQA 4OMVA 3UVHA 3FZAA 2VLUA 3TJGA 2DIYA 3LJRA 4NHWA 2PERA 2VL2A 3ME8A 1OVNA 1TI3A 1ZCPA 3TKSA 4HI7A 1NM3A 1FB0A 4ZIJA 4K6XA 6GSUA 2D2ZA 4HU7A 2IPAA 4AJ6A 1IYIA 3PR8A 4K7IA 2FWFA 5CO3A 2BJXA 3VWWA 4POKA 3UJ1A 1T4ZA 1FOVA 2IIYA 4D73A 3QAVA 3HZ8A 4KAEA 4TVEA 3BBYA 2A4VA 3FRCA 4GSSA 2F9SA 3A5WA 4NV2A 4DEJA 3EE2A 1AQVA 2MBSA 4LMVA 1T3BA 3KMOA 2ZCTA 1U3AA 3IXRA 4HJMA 1Z5YE 1R4WA 4K0GA 1WOUA 3H4KA 1XOAA 5LD0A 1UA5A 2BTOT 5D9WA 3LFLA 3M9JA 1V40A 3KJYA 4ZB6A 5AGYA 2VL9A 1DE1A 2IL3A 2PPTA 1B8XA 2FY6A 2FCHA 4KNDA 3U6VA 3CSHA 1O6JA 1Z7RA 2MBTA 2O85A 1B4QA 2PUKC 2B1LA 3FR9A 2PMTA 4GXZA 2H73A 2H76A 3BD2A 3EMPA 3DEXA 4GTUA 1FG4A 2JZRA 3C73A 1XPVA 4G2EA 5G31A 2K8SA 3GYKA 4MABA 2MMZA 3A2VA 4EXJA 1V58A 4RUVA 4MJEA 5CREA 3ZZXA 1B9XC 2F8FA 3VK9A 1GNWA 3KTBA 5D9VA 4EUYA 2REMA 4HS1A 3LG6A 3EVIA 2F3MA 2GSRA 2J9HA 4ML6A 4F82A 17GSA 3RHCA 2PWJA 3A3TA 3ZMLA 1SL0B 3APOA 1SYXA 2VCWA 1Z6MA 5ELGA 4X43A 2DJJA 1M99A 4FYUA 3V1WA 4E8HA 3FZ4A 4WF5A 4CW9A 4PUFC 1PX6A 5HFGA 4QQ7A 4KX4A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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