5IM9A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f1
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 49
structure length 156
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5im9A00
2H1GA 2IN3A 1MDJA 3APOA 2AJQB 1E2YA 3KZQA 2MMOA 2VL3A 2V6KA 2H66A 1HNBA 2HNLA 1GUMA 3GV1A 4PUAA 1SJZA 2C3NA 1EGRA 3FZ5A 4KH7A 3PR8A 5G5FA 12GSA 3HCZA 3KTLA 5E4WA 2PERA 1IYIA 4ISDA 2L6CA 1KBNA 2VLVA 2LQQA 3DVWA 3L9UA 2H6YA 4IKHA 5D9VA 3QR6A 4GXZA 4FH8A 1MTCA 1I5GA 3N5OA 1AQXA 1TU8A 5GAPD 5DDLA 2GZZA 4PQ1A 1GLPA 3WT1A 3EWLA 4HUAA 2C0EA 4N0VA 3BJ5A 4D73B 5B6MA 3KGKA 2HI7A 3GHAA 1K0DA 5ABRA 3MNGA 3PH9A 3W8JA 4NAXA 4KX4A 4I97A 5AN1A 2FA8A 2B7JA 4MA9A 6GSXA 1OAZA 3GX0A 4FIWA 1X0RA 3KP8A 4YH2A 4EDZA 3D5JA 1HD2A 3LXZA 3QCPA 2WJUA 2E2GA 1B48A 4K0GA 2FGXA 2BMXA 1GTIA 2IFQB 2H72A 5IPGA 3M1GA 3Q19A 1WE0A 4ULXA 3VWXA 2RUFA 1SJIA 3DGQA 2R6KA 3J7Yb 2C3TA 2L5LA 3CBUA 2OE3A 1Y6EA 3GTUA 4MZWA 2EIQA 1CQHA 3HD5A 3TUEA 2D2ZA 4WBRD 1FVJA 2H76A 4MF5A 2WULA 4HS1A 2VO4A 4ZB6A 1V57A 2H30A 2ZCTA 1NM3A 5IOWA 2K8VA 5IO2A 5HR0A 1AQVA 3TB2A 2LS5A 2IIYA 2H1DA 4KCAA 5JWOB 4MJBA 3P7XA 1U3AA 2YOIA 3U5RE 4HU9A 3FR9A 4BL7A 2FA4A 5JCGA 1THOA 1RW1A 2OADA 4V1Ap 5H5QA 4RUVA 2CAQA 1F2EA 5JCUA 11GSA 4OFMA 3PINA 1XW6A 1K0MA 1T1VA 4NHZA 4K7NA 4ZXGA 1AIUA 1OKDA 4TR4A 4Q5FA 1LJRA 5A4VA 2PVOC 4F9ZA 3HKRA 1GTAA 5LCZA 4JR4A 2H0HA 3EYTA 4IVFA 1HNCA 2J23A 2GDRA 3F6DA 5KEJA 4WBJA 3DYRA 5IMFA 2I1UA 3EU4A 1EZKA 3ZTLA 2FD3A 5H5SA 1EV4A 4TXVA 2M80A 2LJAA 1ZCPA 2PBJA 4GQCA 5EL8A 3GKKA 3O3TA 1XWKA 1USBA 3D21A 1GWCA 2LEGA 4OWYA 5HQPA 3F6FA 6GSWA 2K18A 5ECLB 1FHEA 1X9MB 1I9DA 1TOFA 5F07A 2NBSA 5ECOB 4GCIA 1SENA 3A2VA 5D9WA 2H1BA 1A8LA 3H1NA 4WR5A 4MPFA 3GKNA 2HE3A 2DC5A 1QGVA 2OKAA 1ERUA 5G31A 3VPTA 3D0ZA 4EE0A 4GWRA 1YZXA 1SL2B 5CRWA 5LD0A 2L6DA 2JL4A 5DJMA 2QKEA 3F8UA 4TKYA 3ED3A 1K0CA 5D9TA 3TGZA 3C8EA 4AGSA 1G6WA 4EDYA 2CQ9A 1GTUA 1GP1A 4ILFA 1FVKA 3WGXA 2R2JA 3QFBC 4MJAA 3BOAA 3FRCA 4PQHA 5G30A 2P0GA 1T8EB 2QGVA 4POBA 1DBYA 5DVBA 1OE7A 4ML1A 1SU9A 2H6ZA 4KNDA 1QFNA 1VRSD 4QQ7A 2VM2A 3I43A 3GN3A 1GNWA 1F9MA 1QK8A 1T00A 3QAWA 2WFCA 5COHA 4NMUA 3LQ7A 1JZWA 2MYGA 1F37A 4MZBA 2EIOA 1ML6A 3GA4A 4CDOA 1JHBA 1RK4A 4K2DA 1A24A 4X0XA 1S3AA 1XWCA 18GSA 1X5CA 5AISA 4LA1A 2VOCA 3F4TA 4K7OA 5KN3A 4LL1B 2LQOA 1XPVA 3C7MA 4X1UA 5G1LA 1OE8A 2CVKA 1QMVA 3CTGA 5DCGA 1KTEA 2LJKA 4IHUA 2GZPA 3IDVA 1VF3A 1AUCA 2J9HA 2VD1A 4PXOA 4XCSA 5J3RA 5F8BA 3GKXA 1PSQA 4LL4B 4NPBA 1KNGA 5D9XA 3G7IA 3QDNA 3FZ9A 1YF0A 4MK3A 4BA7A 3Q18A 3CMIA 2C0GA 3ZRDA 2YZUA 2DMLA 5KN0A 5J5NA 3ZMKA 5ECRB 4GSNA 4EF0A 3R2QA 2WDUA 3IAS2 4EXJA 1EGOA 2VM1A 1PA3A 5ECPB 3HVVA 4MCUA 1N8JA 4LMWA 4OD7A 1SKSB 3SWLA 4KE3A 4DSRA 1MEKA 2YWMA 1X5EA 5A4WA 1GSYA 4N0ZA 3MAKA 2P5RA 4G10A 2GVPA 1ERWA 5DALA 4CW9A 1FG4A 1OC3A 4HEA2 3L0HA 2OA7A 4KDUA 1BG5A 4XTSA 1R4WA 1RQMA 1PL2A 4L0UA 2NDOA 1ON4A 5IMDA 5F0GA 2L4QA 4KA0A 2FCHA 3E3EA 2H70A 1V9WA 1Z9HA 2NTOA 4EVMA 1YQ1A 3IK9A 1LU4A 2MMZA 1SD9A 1G6YA 4HOJA 5D93A 3TRXA 1QXHA 1NHOA 3HVSA 4G2EA 4PGTA 4D73A 2CVBA 2F8FA 1KEBA 4IQ1A 3O76A 4FYBA 2LRNA 2B5XA 2YJHA 3F9UA 3FZAA 22GSA 1MDKA 5DQYA 2DIYA 3L9VA 4HU7A 1AC1A 2B7KA 4RQXA 2PVQA 5ECKB 2IMEA 5INYA 2R4VA 4JEDA 4KB3A 3ZIJA 1EEMA 1JFUA 3H79A 2RM6A 4FYUA 1EP8A 5B6NA 3LORA 3N9JA 5IMAA 4BPYA 2LNSA 4ID0A 3W6GA 1XW5A 4KDXA 2LRTA 4Z7XA 3VWWA 2IFQA 2O85A 2HZEB 4AJ6A 1ZGNA 5CNWA 1ZL9A 3RPNA 4BVYA 2HFDA 3DWVA 1SL0B 20GSA 1BAYA 4IJIA 5J9BA 2PU9C 2JADA 4TR1B 1U87A 4LMVA 5ELGA 4IS0A 2RUEA 2YNXA 3CSJA 4MJEA 2WS2A 4TN8A 2LRCA 5ECSA 4L5OA 4BWSA 2B5YA 1XXUA 5AIXA 1VF1A 2CZ3A 2P5QA 13GSA 3UBKA 4JRRA 3TKSC 3DRNA 2YWIA 4MABA 1A2MA 2FHEA 5IOXA 6GSYA 3HHVA 1Z7RA 4Q5RA 2GSTA 2L59A 6GSSA 1NSWA 5EPFA 2BTOT 4WEYA 1XWAA 1OKTA 1YJ6A 5ECMB 3TKPA 3G9BA 1N2AA 5HFKA 4IQAA 4ZL7A 2O7KA 2LNTA 1SD8A 5GSSA 2OBKA 1WWJA 3A2WA 3C73A 3DD3A 2AV4A 1GSQA 1YEPA 2H74A 1B9YC 2YANA 1T4YA 1UN2A 3C1RA 1W4VA 1Y25A 2WCIA 3IK7A 3OR5A 1M9BA 4XRDA 1A8YA 2B5EA 4G9HA 2IMDA 4HJMA 3D6IA 3WGEA 4RI6A 3GNJA 4OCFA 2A4VA 3KM6A 4KSOA 3WD6A 2EIRA 4WKWA 3S9FA 3IBHA 1SK1A 4IN0A 1OVNA 5G5EA 2CV4A 2AUVA 1Z6NA 3RHCA 5A4UA 2V41A 5HR3A 4I8BA 1TRUA 4MH2A 2JZTA 3K8NA 2GLRA 3CRTA 5CRGA 3NIVA 2KP1A 3ZLPA 1TRSA 4NV5A 2N5AA 1Z7PA 1WP0A 3HJOA 3PGTA 1Z3EA 2ON7A 4GQFA 1TI1A 4AF2A 3F3QA 1WIKA 1XFLA 2OJLA 2OBIA 2GSSA 2H0IA 1GRXA 2HXKA 2GT6A 1PKWA 1YKAA 3GL5A 1J0FA 2YWOA 4Q5NA 5GZZB 1SJ6A 4IELA 2PUKC 2H19A 4PQIA 3VK9A 4EC0A 1LBKA 3UIWA 4KAEA 4MLYA 2LV3A 2G0FA 3RDWA 3HXSA 3QMXA 1GSDA 2I4AA 3WT2A 2VL2C 1AAZA 5D8IA 1VF2A 2M46A 1K0OA 1TP9A 5IMVA 5H5RA 1TK8B 2PN8A 4DVCA 4ECCA 4ZIJA 5L71A 1SYXA 4XIHA 2I9HA 3F3RA 4ECBA 14GSA 3IRAA 2C0DA 2GS3A 1TJDA 3GH6A 3TCOA 1M9AA 3BD2A 3VI5A 1T3BA 1AXDA 1JZDA 4PUFC 1XIYA 4YAVA 2WZ9A 1XVWA 2FY6A 4I6XA 1GUHA 2TRCP 2HT9A 4ZBDA 5EY6A 1X9WB 4HZ2A 3IXRA 4ZB8A 3KEBA 4MMMA 4FYCA 2RM5A 3KMNA 2O89A 3VFIA 1FO5A 3EC3A 3HVXA 1PX6A 1SYRA 2VUPA 1ZYEA 3J7Yk 5KN1A 5G2ZA 3G7YA 3QAVA 5DBQA 5DJLA 1QQ2A 4E8EA 2LKUA 4KGIA 1PMTA 2YZHA 1FOVA 1TW9A 2X8GA 2X8CA 3I6AA 2JU5A 3UMAA 1E6BA 3FYGA 5ID2B 3GIXA 4KW6A 3DMLA 2L57A 1DE1A 2IJYA 1BYEA 2F9SA 4WF5A 3C71A 3HZ8A 1T4ZA 2NPBA 2GQMA 4XS1A 1XWGA 2YPMA 4V2LA 1FB6A 16GSA 1EP7A 2FUG2 4POLA 1GLQA 3H93A 3HDCA 4HQZA 3ZIVA 17GSA 3ZFBA 4F2IA 4AJ8A 4DSQA 2DJ0A 2R37A 1J9BA 3P90A 3LYPA 2VCZA 4WXTA 1NW2A 4HDEA 3F63A 3QD9A 4J57E 2TRXA 5CREA 5GAND 3IE3A 3LXTA 2ON5A 4O7HA 3UL3A 1GSFA 2M72A 1PRXA 1O81A 2DBCA 1WRYA 3CYNA 2LSTA 2IMIA 2C80A 3HJPA 5B8AA 1ACVA 2OACA 2IMKA 3LG6A 1GTBA 2C1YA 5HR1A 1A0RP 2A2SA 2KOKA 4KUNA 4ECJA 4IP6A 2VIMA 3CSIA 3ZMLA 4ACSA 2ZNMA 1CQGA 4XRAA 4KDYA 2FWHA 1NHYA 3A2XA 1M7TA 4MF7A 7GSSA 5ECHB 1TK5B 2GGTA 1O8XA 3FW2A 3KP9A 5D96A 2HZEA 3IOSA 2FNOA 3DVXA 1WPIA 2O87A 2QC7A 3ISOA 1THXA 1H75A 2DJ1A 2VCWA 6GSUA 1GSUA 1SL1B 2VCTA 4OMVA 2X99A 4TVEA 3HY2A 2B1KA 1M2BA 4N10A 4PURA 2L4CA 3FY7A 2IPAA 4TR1A 1O85A 1PL1A 4IJ3A 4NXIA 1TK0B 2GQKA 1ABAA 2E7PA 1Z5YE 2TIRA 3ZZXA 2HSYA 1B9XC 1K0NA 2B1LA 3FK8A 3VURA 4CHSA 1XW9A 1XCCA 3EU3A 4MP4A 4RI7A 1FB0A 2E2MA 4YQVA 2JZSA 2F51A 2CT6A 3BCKA 3CSHA 2DJ2A 4K9ZA 4X43A 3KTBA 1V58A 5B7CA 3FEUA 6GSTA 3FKFA 3NOFA 4H86A 3TKSA 4QL9A 5IM9A 2VCXA 4TW5A 2VL9A 3MWHA 4WF4A 2GZYA 2MBTA 5FWGA 1U6TA 2I81A 3IPZA 2MBSA 5J9CA 4GSTA 5HFIA 3HJMA 4YAPA 4F82A 1XBSA 4V2MA 2B6MA 1OYJA 3AY8A 3IA1A 1GH2A 1DE2A 5A5KA 2IWTA 2GQLA 2N5BA 2WB9A 1U88A 2FWGA 1G7EA 3A5WA 4TR3A 3F4SA 2EC4A 2XPDA 4JBBA 2FWEA 5IO0A 4JZQA 3TOTA 3EURA 2C0FA 2HLSA 3GYKA 3RPPA 3DKSA 2WGRA 2H75A 1PGTA 1TRVA 2H73A 5C00A 4L5LA 4I2UA 8GSSA 5ECIB 4ECIA 3LFLA 3ZVJA 1ZYQB 1R26A 3US3A 3LEFA 5F05A 1JZRA 1V2AA 4KCEA 1HNAA 3ME8A 4EL1A 3NZNA 3APQA 2PGTA 2YWNA 4L0WA 3LSZA 1WOUA 5B8BA 1VGLA 3UAPA 1F3AA 1VF4A 2AYTA 4JE1A 4DSSB 3E9JB 3GH9A 1GSSA 4LLRA 1EEJA 5JCWA 4EKZA 2YV9A 3APSA 4Q5QA 2RLIA 3GX8A 5JWRB 3BCIA 4MJCA 4KSMA 3M0FA 4IGJA 1M2AA 4PNFA 2DJ3A 1OC9A 1BQ7A 3SBCA 1K0AA 3TRPA 3EVIA 3U6VA 1X5DA 1YDKA 2KHPA 3M8NA 1EOHA 3WYWA 2HSHA 1S3CA 9GSSA 2H71A 1TRWA 3EE2A 3UEMA 1TXXA 3UOMA 2YV7A 4ZL9A 3DXBA 4MH3A 4K7IA 5FT3A 4F03A 1ST9A 3HA9A 3I69A 2VL2A 2JZRA 4NV2A 4IP1A 1ERTA 2OE1A 4V1Ag 3FR3A 1B4PA 1XZOA 4OCEA 2F3MA 1HYUA 3GSSA 1PKZA 5IQYA 1UC7A 4JR6A 3O6TA 4QL7A 1IYHA 3GFKA 4O32A 4NWYA 5F06A 2XBQA 3UBLA 3BBYA 1K3LA 1UA5A 5FHIA 3V1WA 3JCML 1K0BA 2PPTA 3D4TA 3W8SA 5IMCA 1AW9A 1UVZA 2JACA 3CTFA 4HI7A 1A0FA 2DSAA 3FR6A 5ELAA 2C8UA 2HYXA 1FAAA 1R5PA 2C4JA 3EMPA 4F0BA 2VLTA 1TU7A 4MZCA 1XOBA 5CRHA 5DQSA 5ID2A 2G2QA 1SKWB 2AAWA 3F4RA 1A23A 5IMZA 2H01A 3Q74A 1WJKA 1G7OA 3EINA 1Q4JA 3GURA 4PX1A 5G1KA 1OC9B 1F3BA 4MDCA 5J4UA 3M3MA 3RHBA 4IW9A 4XS6A 2HRFA 4MPGA 1G0TA 2YJ7A 3KD0A 2I3YA 2YN1A 1M99A 2DIZA 1EWXA 3CRUA 5ECQB 4ZB9A 4J56E 3KH9A 3VI7A 2O8VB 1GL8A 3QOUA 5J41A 3IC4A 3FHKA 4G19A 2DJKA 3TRQA 3TKRA 1JZOA 2B3SA 1R7HA 2MMAA 2VCQA 1DUGA 1XOAA 4E8HA 3C1SA 2AB6A 1B8XA 1A2JA 4N11A 1ILOA 3TJFA 4I2TA 3KMOA 3VWUA 4TXOA 4GTUA 1V40A 3GRXA 2PWJA 3TJGA 4OO5A 2KUCA 1BX9A 3IHQA 2CZ2A 2QSIA 4YQMA 3GTUB 2IL3A 2CAIA 1PQNA 3ZL5A 3H4KA 3P2AA 1EOGA 3IR4A 3KH7A 3QPMA 1TTZA 3M9KA 3MSZA 5GSTA 1ZOFA 3TJBA 3VPQA 1XWBA 1O6JA 4O92A 3ERFA 4NHWA 2V2GA 3GKMA 4ML6A 5ECNB 4GSSA 3RAZA 1A2LA 1S3DA 2XC2A 2ALBA 2E0QA 4L8EA 2N5FA 5IPHA 4JU5A 3UVTA 1WMJA 1PD21 4RQRA 2P31A 2AHEA 1K3YA 3HYPA 5EVOA 3LYKA 1M2DA 2X64A 3GSTA 4K0NA 4BWQA 1BEDA 3VWVA 1F6MC 5AIVA 2CA8A 5CRDA 3L78A 2BJXA 3RBTA 2MZCA 4TOPA 5HFGA 1DSBA 4ZBAA 5LNKe 2HZFA 3UJ1A 2GSRA 3WGDA 3A3TA 3D22A 3ZYWA 2JSYA 3Q6OA 2PMTA 3KCMA 2FLSA 2H6XA 2VAFA 1O8WA 4MF6A 2H0GA 2VD0A 4K6XA 4PNGA 3TJKA 1JLVA 2HRNA 1GNEA 1Z6MA 1O7UA 4XS4A 1BJXA 19GSA 2XHFA 3GUSA 2V6OA 2H8LA 5HR2A 2R5GA 2A2RA 2L5OA 3G7JA 4TXOB 2DJJA 4ZL8A 5C04A 4I5QA 4EO3A 2C3QA 5CP1A 2WRTA 3ME7A 1J08A 1QUWA 3L4NA 4POKA 3ZVJD 3TJJA 3P8WA 5DAKA 1SK2A 1M0UA 2IMFA 1YF1A 5ENUA 4J2FA 3LWAA 3IV4A 3ZITA 4OFNA 1GSEA 5KN2A 2LTKA 1ERVA 2DLXA 2K6VA 2XPEA 3H8QA 1C72A 1FW1A 3CXGA 2KP2A 4GLTA 1H4OA 5DCHA 1V98A 3KIJA 3ZFLA 4BVXA 3I9V2 3UARA 4K8MA 1X9SB 2X8HA 4IBPA 2H1AA 5AGYA 3F0IA 4F0CA 3KJYA 3MDKA 3E0UA 1HQOA 1K3OA 2FWFA 2REMA 2LJRA 1T7PB 4P3YB 2GSQA 3M9JA 1TDIA 2YP6A 4WETA 4DEJA 4WR4A 3D4MA 4DSSA 4HQSA 5JWQB 3UVHA 1MD3A 2K8SA 3QAGA 5D73A 3LJRA 2CX3A 3TKSE 2JSZA 2F8AA 2Z9SA 3TKQA 3DIEA 5CYYA 4XS4B 4OFTA 1EV9A 5E59A 3ERWA 1W89A 1GULA 2LUSA 3IAM2 1URMA 1R5AA 4ZBBA 1U3IA 4FO5A 1SK0A 2VLUA 2NVLA 3HZ4A 5CO3A 4GF0A 1Q98A 2DMMA 2GTUA 4V2NA 2RIIA 2XBIA 4HJ2A 2V32A 3ERGA 3GMFA 1ZMAA 3FZ4A 2OE0A 1GUKA 1OC8A 1JLWA 4POMA 4EUYA 2GT5A 3TDGA 10GSA 5DAKB 2KLXA 6GSVA 1ZZYA 4N30A 2ZUPA 4GRFA 3LGCA 2YCDA 4XHMA 4OO4A 4O5RA 2CVDA 1MD4A 3L9SA 1PN9A 4AJ7A 4TRXA 3TOUA 1YY7A 1B4QA 4HZ4A 3VLNA 2VCVA 3KXOA 3ZREA 1SKRB 2R3XA 1PX7A 1TKDB 3EMXA 2MMNA 2CX4A 1O73A 4TR0A 1MDIA 1TI3A 2ES7A 1YKCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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