4XHMA

Archaeoglobus fulgidus thioredoxin 3 m60h
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
ARKVLDSPVKLNSSNFDETLKNNENVVVDFWAEWCHPCKMIAPVIEELAKEYAGKVVFGKLNTDENPTIAARYGISAIPTLIFFKKGKPVDQLVGAMPKSELKRWVQRNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Rheostat Re-Wired: Alternative Hypotheses for the Control of Thioredoxin Reduction Potentials.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin (Trx-3)
molecule tags Oxidoreductase
source organism Archaeoglobus fulgidus (strain atcc 49558 / vc-16 / dsm 4304 / jcm 9628 / nbrc 1
total genus 31
structure length 110
sequence length 110
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xhmA00
3TJJA 2VLVA 4EDZA 3IBHA 4EC0A 4J2FA 1I9DA 3M3MA 2YZHA 4WR5A 4EUYA 2VM1A 1XOAA 4IJIA 2VL2A 2HZFA 4TRXA 2FUG2 4N0VA 3GUSA 1GSEA 2H0HA 1XWGA 5H5SA 1KTEA 4TVEA 3GURA 3HVXA 4POBA 4RUVA 1MEKA 5CNWA 4K6XA 1K3OA 1CQGA 2CX4A 1EP8A 2F51A 5F05A 5CRGA 4ZBDA 1DE2A 4RQXA 4TKYA 1JZRA 4IQAA 3TKSE 4F0CA 4JE1A 1MD3A 5LD0A 2Z9SA 5AISA 3IA1A 2FWEA 1YF0A 2C3QA 3EMXA 1PMTA 4KDUA 1V58A 5G5FA 5LNKe 2X8GA 1ZYQB 1WOUA 3TGZA 3EVIA 2C3TA 4NV5A 3EU3A 2B5EA 4F0BA 2H74A 2P31A 3P2AA 4ILFA 1NW2A 1SD8A 1X5CA 1TU8A 2C8UA 2JADA 4V1Ag 4PQ1A 4POKA 5J5NA 2B1KA 17GSA 4I6XA 1FW1A 3EU4A 4ZL7A 4GF0A 4G2EA 5HFKA 2C0FA 4TW5A 3S9FA 3RPPA 4MJBA 5IMAA 2FWHA 7GSSA 1M7TA 3UEMA 3DIEA 2WDUA 1A0RP 3KD0A 1G6WA 1M9BA 3APQA 5HR0A 1YY7A 3H79A 1TI1A 4OFNA 1TRVA 3RHBA 3F4TA 2JU5A 5CO3A 2L6CA 5F07A 3C73A 4K7NA 4XHMA 3VPQA 2YWIA 1PKWA 4OO5A 3V1WA 4EDYA 2K8SA 4ECIA 4IS0A 2YJ7A 1F3BA 2VLUA 2GSTA 4TN8A 2K18A 4RI6A 3FY7A 2FCHA 3D22A 1ST9A 1G6YA 1JZWA 3QFBC 3L9VA 3LQ7A 1NSWA 1Z3EA 3DMLA 1MDJA 2E2MA 2GQLA 3F3RA 1K3LA 3BCIA 3EURA 2IMKA 2YN1A 3CRTA 4HZ4A 3Q74A 2CAQA 3C1RA 2OJLA 5ECIB 4OFTA 4PURA 2OE3A 3DD3A 4Z7XA 1YKCA 4LL4B 1T4YA 2RM6A 4ECJA 2B3SA 5CAXA 2EIOA 4CW9A 3KZQA 4GCIA 2HZEA 3VPTA 1V98A 2CQ9A 3W8JA 1EOHA 4POMA 5ECNB 3QAWA 1ACVA 3L4NA 2HSHA 2MMAA 4K8MA 5HFGA 3GFKA 1O6JA 2MMZA 4KW6A 5LCZA 1G7EA 1FO5A 3A2WA 4PX1A 3APOA 4E8HA 5D96A 2A4VA 4QQ7A 3VI5A 1GSYA 4XS4A 3WGDA 2JSYA 3ZRDA 3H1NA 1DSBA 1LJRA 6GSWA 4IN0A 1FOVA 2K9FA 3FR6A 1F2EA 2JZRA 4KSOA 4RQRA 1Q4JA 1SYRA 2F3MA 13GSA 3GYKA 2PUKC 2WZ9A 5GSSA 5HR2A 2MMOA 3GKKA 3EC3A 3GL3A 1V40A 2GTUA 3TJFA 3ZITA 1K0CA 1AXDA 4HU9A 3HJOA 4WETA 2H01A 4QL9A 3CSHA 4IKHA 2VAFA 3P8WA 4MCUA 3UBKA 2IMFA 3Q18A 4JZQA 2H8LA 2IJYA 3WD6A 3CTGA 1ABAA 2LJKA 3I9V2 1GTAA 1T7PB 2V2GA 1ZZYA 3IAM2 1EEMA 1UA5A 4EF0A 1X5EA 1HNBA 2GS3A 4BWSA 2E7PA 3TDGA 1AAZA 1GSQA 3GL5A 2BMXA 2IFQA 4DSRA 1J08A 4PNFA 1XVQA 3DGQA 3ZYWA 2KP1A 5G1LA 3IR4A 5DCGA 1X9WB 1PL1A 1R5PA 1U3AA 4GLTA 5DAKA 1GNEA 1B4QA 1DUGA 3MWHA 6GSSA 1TOFA 3EMPA 4IBPA 4F03A 1FAAA 1S3DA 4QL7A 1K3YA 1AUCA 2HZEB 3UMAA 5ECMB 3GIXA 5J9CA 3HYPA 2TRCP 2FD3A 4N30A 3ME8A 4MH3A 1T3BA 4XS6A 2LS5A 2XPDA 2HT9A 2OBIA 5G30A 1XXUA 1O73A 2NBSA 3KTLA 4JR6A 4ML6A 4X43A 2OKAA 4ML1A 2J23A 2LSTA 2MZCA 4KB3A 4O5RA 4LMVA 2P0GA 1Q98A 1A2LA 4XS4B 5F06A 1ERUA 2X8CA 2REMA 2CT6A 5IIZA 3HCZA 10GSA 1M2BA 2A2RA 3W6GA 2OACA 3ME7A 3IOSA 5J9BA 2DBCA 4IGJA 2DJKA 3GMFA 1PRXA 2FA4A 4NXIA 5INYA 1EGOA 1JZDA 3I69A 3LEFA 3O3TA 2C80A 2YV9A 4HQZA 4Q5RA 1TDIA 1PKZA 3CBUA 2GLRA 2KUCA 1XVWA 1A24A 3A2XA 1X9SB 2M46A 3MDKA 1FVJA 4MZWA 4P3YB 2VL2C 2IFQB 2IL3A 5IQYA 2IMIA 3QOUA 1IYIA 4BWQA 2LRNA 2ON5A 2N5FA 2JACA 6GSXA 1BQ7A 5CRHA 1FVKA 2H76A 3IPZA 5DAKB 1RK4A 3RAZA 1TW9A 1XWCA 1GSFA 3BJ5A 4ZBAA 3LYKA 5DDLA 2L4QA 4AJ7A 1WJKA 4POLA 2PMTA 3GSSA 1AQWA 1QUWA 3KJYA 4V2MA 2JZSA 2H72A 1Z6MA 2QGVA 1XW5A 3F9UA 2IMDA 4AGSA 3UL3A 3F0IA 2P5QA 5ECQB 4JU5A 4GRFA 3Q6OA 2G0FA 2HXKA 1SYXA 4RI7A 1AQVA 1EV4A 3HY2A 3KIJA 3QD9A 5F0GA 2WGRA 4LA1A 2QC7A 4BPYA 3ZREA 1WPIA 2BJXA 4ZL9A 1KNGA 2L5OA 5ECHB 1ML6A 2E2GA 3UAPA 1XCCA 1V2AA 3IAS2 4Q5FA 2IWTA 3KGKA 1Z7PA 2PERA 1G0TA 2VCXA 2VL9A 3RDWA 2AHEA 16GSA 5CYYA 5KN2A 2H6YA 2KHPA 2N5BA 3ERWA 4NPBA 2BTOT 3VFIA 4X1UA 5F8BA 4BA7A 6GSUA 4Q5NA 3KMOA 3PINA 5ECKB 4OD7A 1QXHA 1W89A 3D21A 2FNOA 2RLIA 2VD0A 3TJKA 1GSSA 2R2JA 2XBIA 3ZIJA 2O89A 2AV4A 4I2UA 2PN8A 3DRNA 1EOGA 2F9SA 3PGTA 1TJDA 4GQFA 5A4VA 4MK3A 4MMMA 1Z5YE 1JZOA 5IOWA 2L57A 4DVCA 3CXGA 1VF3A 2AAWA 2VCZA 1DE1A 4F9ZA 5DJMA 5IOXA 3ZIVA 1A23A 5AIVA 1ERVA 5HQPA 2C0EA 2ZUPA 5DQSA 1GSDA 4F82A 1JFUA 1M2AA 1SKRB 3DVXA 1B4PA 1K0AA 2PWJA 4KGIA 4AJ6A 2M72A 1TRWA 5L71A 5IMDA 3G7IA 3FYGA 1YQ1A 1FB6A 3DYRA 2DIZA 5B8AA 3FR3A 1R26A 6GSTA 4TR4A 4HS1A 4WBRD 1TP9A 3TRQA 1E2YA 3C8EA 2HSYA 1X5DA 3SBCA 1C72A 4YAPA 2VO4A 2PVQA 2IIYA 3BCKA 4V2LA 1YDKA 3TOTA 3QAGA 3TKPA 5IPHA 1Y6EA 1ZL9A 1X0RA 2FHEA 3QFAC 18GSA 4V2NA 3ERGA 5HR3A 2H70A 2NTOA 2MBSA 5A4WA 4KX4A 4KCAA 3F6FA 2GVPA 5E59A 4WR4A 1SJ6A 1URMA 3ISOA 3A3TA 1G7OA 3CSIA 1B9YC 2IPAA 2WS2A 4PQIA 3CYNA 3VWWA 4NAXA 3L9SA 2YPMA 4IJ3A 1N2AA 4CDOA 1A0FA 2VLTA 1VF2A 2YOIA 3U5RE 5AGYA 3UVHA 2R6KA 2OBKA 1K0OA 2M80A 4JRRA 5D9WA 4PNGA 3M0FA 1SK1A 3GV1A 1YZXA 1JLVA 2ZCTA 2LNSA 1UVZA 1OKTA 2JZTA 5D9XA 1SL2B 2GDRA 1U3IA 3DEXA 3M1GA 1KBNA 4IHUA 2NVLA 2LUSA 3KTBA 4ID0A 3FZ9A 2O87A 1O85A 3PH9A 4MJEA 5C04A 3GKMA 4EVMA 3W8SA 4LMWA 4TXOA 2HRNA 4HJ2A 1TXXA 3ZTLA 5FHIA 4XS1A 1FHEA 4KSMA 4I8BA 2H0GA 3JCML 4CHSA 2LQQA 1U6TA 5JCWA 2HYXA 2K8VA 1V57A 3ZFBA 1YJ6A 1Z7RA 2FGXA 2GZPA 4LLRA 3J7Yk 2YZUA 4N11A 2G2QA 4KDXA 2R37A 2ES7A 2HLSA 3TRPA 1LU4A 1TK5B 1NM3A 3MSZA 2H6ZA 2WULA 4I97A 4NV2A 5B7CA 3TRXA 4JEDA 5FT3A 2FWFA 3LWAA 3GTUA 4ZXGA 3TKRA 3O6TA 5H5QA 2DIYA 2GT6A 2VCVA 2X64A 1VF1A 1QFNA 1EEJA 3IV4A 4OMVA 1M9AA 3G9BA 3OR5A 1XIYA 5C00A 5J4UA 1B9XC 2LEGA 1UN2A 3LGCA 3U6VA 3D6IA 5KN3A 1QQ2A 2J9HA 3L9UA 2HRFA 1K0DA 3H8QA 5ECRB 1TKDB 3HXSA 4XIHA 3F6DA 1PL2A 2XC2A 3DWVA 3MNGA 3GA4A 3VWVA 3P90A 3LXZA 2TRXA 3N5OA 5J41A 1GSUA 2V41A 5IPGA 1VF4A 3IC4A 2VUPA 3LYPA 4PQHA 3F63A 4KCEA 3HKRA 1F6MC 3UIWA 3VI7A 3WYWA 4OFMA 3PR8A 2AUVA 5H5RA 3GKXA 2H71A 2VOCA 4K0NA 1O8XA 4X0XA 2CX3A 4MA9A 5D9VA 4IW9A 1O81A 4EE0A 2B7KA 2E0QA 4NWYA 3GH6A 1KEBA 3FRCA 1LBKA 4KH7A 4JR4A 3FKFA 3CMIA 2CVBA 4TXOB 1ZMAA 3GH9A 3CTFA 4YQMA 5DJLA 5ECOB 3LFLA 1FG4A 2HI7A 2FY6A 5ID2A 5A4UA 1WWJA 4EXJA 3M8NA 2C3NA 5KN1A 1WE0A 2GSSA 5ELGA 8GSSA 1H75A 2VM2A 2VD1A 2OA7A 1TU7A 2I4AA 4PUAA 1AW9A 4EO3A 3GX0A 2GSQA 1VGLA 3UBLA 2CAIA 1ZGNA 3GTUB 2KLXA 1GUHA 1GWCA 3I43A 3M9KA 4ZBBA 2I1UA 2ALBA 3HHVA 4NMUA 1ZCPA 1HNCA 20GSA 1SK0A 1NHOA 1WIKA 4GQCA 2L4CA 5IMFA 4HUAA 2DSAA 1GRXA 3LSZA 2I81A 1AQXA 4XCSA 5EVOA 3LORA 3DVWA 1Y25A 2MMNA 4K0GA 2N5AA 4KUNA 2CZ3A 2DJJA 4L8EA 4OCEA 4FIWA 1F9MA 3IXRA 4FYUA 4ACSA 4KA0A 5IMZA 3H93A 4N0ZA 2RUFA 3D4MA 1ON4A 3FHKA 4MF7A 3ERFA 1S3CA 1A2MA 4K2DA 5ABRA 2AB6A 2H1AA 3DXBA 2AJQB 2H0IA 4MDCA 2HE3A 3C7MA 2DJ1A 3QR6A 4KNDA 1U87A 3HDCA 5ID2B 3UJ1A 3HJMA 3CRUA 3ZMLA 2LKUA 4PXOA 1T8EB 1CQHA 3Q19A 5EY6A 1SD9A 3LXTA 2DJ2A 2LJRA 4ISDA 2YNXA 1T1VA 3E9JB 2VL3A 5ECSA 3FW2A 3F3QA 3TOUA 4V1Ap 2GZZA 2F8AA 3H4KA 1TI3A 4G9HA 1U88A 4MPGA 19GSA 4YAVA 5G31A 2YWOA 4L5OA 4YH2A 4MZCA 3ZFLA 2WRTA 2RM5A 2RUEA 1SENA 2PVOC 2OADA 1TRSA 3GNJA 4JBBA 3QCPA 4ECCA 1XBSA 4N10A 2OE1A 4HQSA 3FZ5A 1SK2A 1SL0B 2H75A 1J9BA 4HOJA 2X8HA 2I3YA 4ZIJA 3UOMA 1F3AA 5JWQB 2A2SA 1YEPA 2VCTA 5IMCA 3E0UA 4I5QA 2TIRA 4WBJA 2P5RA 3C71A 1S3AA 2LRCA 4DSSA 3P7XA 2LRTA 4GWRA 1EZKA 5GAND 3VLNA 1B48A 3ZVJD 1PA3A 1VRSD 5COHA 3NIVA 3NOFA 1GNWA 2I9HA 3EE2A 4EL1A 2CA8A 3WT2A 1GUKA 4LL1B 3TJBA 3HJPA 2HNLA 1THOA 3VK9A 3TJGA 2XPEA 12GSA 3HVSA 1M99A 2LNTA 1THXA 1R7HA 3SWLA 2B1LA 2C1YA 3KXOA 1DBYA 1XW9A 1N8JA 4IELA 2YANA 3E3EA 1SKWB 2B5XA 1SL1B 1YEXA 1XWBA 1K0MA 5GSTA 5AN1A 1XFLA 1WMJA 4IVFA 1OC8A 3HA9A 1A8YA 4IP6A 1O8WA 1OVNA 2H19A 6GSVA 3WT1A 11GSA 4DEJA 3LJRA 4NHZA 5IM9A 2CV4A 1PN9A 3L0HA 1BYEA 4YQUA 5JCGA 4TXVA 2YCDA 4F2IA 3KH9A 2GQKA 4J57E 3AY8A 1OKDA 2PU9C 3VURA 3KEBA 4MF6A 4MF5A 1BX9A 1PX6A 3M9JA 3HVVA 3G7YA 3K8NA 4FYCA 5ELAA 4ECBA 3UVTA 3FZAA 2DJ0A 4WEYA 4DSSB 4PGTA 2H73A 2V6KA 2WFCA 1X9MB 4FH8A 2NPBA 1SJZA 5A5KA 1GP1A 4TR0A 4MZBA 5G1KA 4OCFA 1PSQA 3UARA 3IHQA 2PGTA 5J3RA 1TK0B 1GTUA 3ED3A 3F4SA 5EL8A 2DC5A 1K0NA 1GLQA 4EKZA 2CVDA 3CSJA 5B8BA 1T4ZA 5IMVA 1ERWA 1USBA 1QGVA 4WF5A 3D5JA 3ZMKA 3US3A 2JSZA 2JL4A 4K1FA 2R3XA 1XPVA 2H6XA 1OE7A 1WRYA 1EP7A 5DCHA 1R4WA 2EIQA 1ILOA 2B7JA 2HFDA 3FEUA 3C1SA 4BL7A 4ZB9A 4GXZA 1EGRA 2CVKA 2DMLA 3ZLPA 1RW1A 2VIMA 1MTCA 2FWGA 4D73A 3TB2A 1EV9A 3ZZXA 4TR3A 4BVXA 1HNAA 3BD2A 3KMNA 5ECLB 1F37A 5GZZB 3TUEA 4O7HA 2NDOA 2B5YA 4Q5QA 1SU9A 2RIIA 1YF1A 5B6NA 6GSYA 4K7IA 3BBYA 3FZ4A 2EC4A 2L59A 3O76A 1JHBA 4TOPA 1AC1A 2WJUA 4I2TA 1OE8A 2R4VA 3KM6A 1MDKA 4TR1A 3HZ8A 1O7UA 4ZB8A 3ZVJA 2GT5A 5D8IA 4PUFC 5JCUA 1V9WA 1R5AA 1GLPA 2V1MA 4IQ1A 4NHWA 1J0FA 1M2DA 5D73A 4FO5A 3WGEA 14GSA 4L0UA 5FWGA 2GGTA 2V32A 5JWRB 1HD2A 3EYTA 2LQOA 1PGTA 1ZYEA 1GL8A 1T00A 1B8XA 3R2QA 2IN3A 3RPNA 2K6VA 3IDVA 4KDYA 2H1DA 4J56E 4FYBA 2O7KA 1TTZA 5HR1A 5E4WA 3KCMA 5CRWA 2C0DA 4ULXA 2EIRA 3GKNA 4G19A 4ZL8A 1GH2A 2C0GA 3D0ZA 1XWKA 1XZOA 4WKWA 1OC9A 2WCIA 5AIXA 4K7OA 3KP8A 1PD21 2YJHA 4O32A 1TRUA 3QAVA 2DLXA 5DALA 5DQYA 4L0WA 4L5LA 1QMVA 4GTUA 4MJAA 2IMEA 4HJMA 5ECPB 4WXTA 1Z6NA 3LG6A 2LJAA 3GHAA 4BVYA 3QMXA 2YP6A 3IE3A 4D73B 1HYUA 3HD5A 4KE3A 2MYGA 1FB0A 1MD4A 4MJCA 1PX7A 1RQMA 1WP0A 3I6AA 5JWOB 4E8EA 1GTBA 4O92A 5EPFA 2H1BA 1BG5A 2YWNA 2O85A 3TKQA 3F8UA 1A2JA 3N9JA 1SJIA 1AIUA 2GZYA 1ZOFA 4G10A 2C4JA 1PQNA 4XRDA 5GAPD 1SKSB 3J7Yb 3RHCA 3IK7A 4TR1B 1IYHA 1QK8A 1K0BA 1I5GA 1MDIA 1GULA 2KOKA 2LTKA 4XRAA 1OYJA 5IO0A 3FK8A 1E6BA 4MH2A 4GSNA 3ZL5A 1EWXA 3MAKA 2MBTA 5KN0A 2LV3A 3FR9A 2XBQA 3GRXA 1XWAA 3QPMA 4WF4A 3HZ4A 2VCWA 1H4OA 4OO4A 4OWYA 1GUMA 5DBQA 3GSTA 5DVBA 3TKSC 1W4VA 4MPFA 2FA8A 4MLYA 5KEJA 2DJ3A 22GSA 3A2VA 2V6OA 2PBJA 3L78A 4MP4A 3DKSA 3VWXA 2H1GA 2YWMA 2QSIA 2H66A 2L6DA 2F8FA 2VCQA 1OC9B 2PPTA 4K9ZA 1OC3A 5CP1A 3QDNA 4AF2A 4GSTA 4KAEA 5DALB 4ZILA 1ERTA 2YV7A 5D93A 2XHFA 2GQMA 1JLWA 3F4RA 3GX8A 1YKAA 4MABA 5D9TA 2ON7A 4ZB6A 1TK8B 3D4TA 4XTSA 4DSQA 5CRDA 2D2ZA 1UC7A 4HDEA 4AJ8A 5G2ZA 1BJXA 3G7JA 3IRAA 1M0UA 2QKEA 2O8VB 4IP1A 2R5GA 3RBTA 5ENUA 4YQVA 2B6MA 2ZNMA 1XOBA 5CREA 3BOAA 3TCOA 1BEDA 2DMMA 4H86A 1OAZA 4HU7A 2AYTA 3KH7A 3NZNA 1HQOA 3APSA 1Z9HA 4GSSA 2WB9A 2OE0A 3EWLA 2FLSA 3GN3A 1XW6A 1A8LA 4HI7A 2H30A 1NHYA 4HEA2 3EINA 5G5EA 3IK9A 3A5WA 2L5LA 1GTIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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