5IMAA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f2
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
b'TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
molecule tags Oxidoreductase
total genus 48
structure length 156
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imaA00
1QQ2A 2PN8A 3DKSA 3FR9A 5ECLB 3NZNA 5IIZA 2WRTA 1GSEA 5KN0A 1LJRA 1BQ7A 2C8UA 1GSFA 22GSA 5KEJA 1A0FA 2LTKA 4HQSA 4MLYA 5F05A 5IO2A 4PQ1A 1XWKA 3L9SA 3TOUA 2DC5A 4DSSB 5A4UA 4ACSA 2IN3A 3ME8A 4K1FA 4IJ3A 4GF0A 2YWOA 3QDNA 4G9HA 2FA8A 5JCGA 5EY6A 1GNWA 3VI7A 1F6MC 1M2BA 2GSQA 1ZGNA 1IYIA 4GWRA 5HR2A 1G6YA 1ERVA 2P31A 3HD5A 2KLXA 2MZCA 1Z6NA 1A24A 3VURA 1FW1A 5ECQB 4F2IA 3APOA 1HQOA 3EU4A 3GYKA 2L6DA 2H30A 4MZWA 2G0FA 2E0QA 1R4WA 5G5FA 5KN1A 3BJ5A 2C0GA 2FUG2 1GSYA 2L4CA 2XC2A 2PPTA 2I4AA 1XW9A 3IV4A 5J5NA 2BTOT 3W8JA 3FR6A 2MMNA 1G7OA 3KCMA 4N11A 3FYGA 4PURA 1QFNA 5DJMA 2FY6A 2WJUA 1GSDA 2NBSA 3A2XA 4TR4A 4E8EA 2L4QA 2WGRA 3U5RE 4FO5A 4LMWA 2AJQB 2LKUA 4DSRA 4EDYA 3H8QA 5KN3A 4CDOA 2LNSA 1CQHA 2GGTA 3A2VA 1SYXA 3UMAA 1JLVA 2R2JA 2LUSA 3E9JB 1BG5A 3KH7A 4OO4A 3VK9A 2WDUA 2YNXA 3GKKA 1TU8A 1OYJA 5HR0A 4EO3A 3VLNA 1FB0A 4IN0A 3A5WA 1MD3A 3RPPA 5JWRB 2D2ZA 2B5YA 5FT3A 4HUAA 1PL1A 3RDWA 1EEJA 5G1KA 4HOJA 3MNGA 1X9MB 2A2RA 2H6YA 2P0GA 3HY2A 4K0NA 3WGEA 1SK2A 1UN2A 5LCZA 3L0HA 2YV9A 2VLUA 2CV4A 2GQKA 3ZREA 1Z6MA 1TJDA 4KNDA 1BEDA 1RK4A 3C8EA 2FWEA 4ML1A 19GSA 2H66A 2X8HA 4HJMA 4JU5A 5EVOA 4GRFA 1YKAA 4OFMA 1BYEA 3S9FA 2B5EA 2DJ1A 5B6MA 5CAXA 5JCUA 3RBTA 4V2NA 4MDCA 3FRCA 2NPBA 4KX4A 4TXVA 4EUYA 1YF1A 3M3MA 4MJAA 4BWSA 5G1LA 1ZMAA 1DBYA 4OCFA 2ES7A 5CREA 3P2AA 1O6JA 1OE8A 3I6AA 3IR4A 4OFNA 3IC4A 2H1GA 3DGQA 3ERWA 3PR8A 1EGRA 4KE3A 2VD0A 3TJJA 3FW2A 3BCKA 3TOTA 5AGYA 2H6XA 2IFQA 2WFCA 1EOHA 5AIXA 4MJCA 5CRGA 3EU3A 4IGJA 4PNFA 2IMEA 2O89A 4DSSA 3VI5A 3EVIA 1XBSA 10GSA 1SU9A 2J23A 2FGXA 3D5JA 1TW9A 1JZOA 5IMAA 4LA1A 3TUEA 2GT6A 5H5QA 1T7PB 1FVJA 2YZHA 2E2MA 3VWWA 2MBSA 1SJIA 1Y6EA 3KM6A 2LJRA 2HNLA 1AUCA 6GSTA 3GH9A 2YV7A 3HDCA 2FCHA 3GMFA 3GA4A 3LEFA 5GSTA 5F8BA 4N0ZA 2LRTA 2YZUA 3GKXA 1XWBA 1AIUA 5D9VA 2R37A 1R26A 4NV5A 5F06A 2VLVA 5ELGA 3IAM2 3RHBA 2MMAA 5INYA 3HJOA 3N5OA 5B6NA 1ERUA 1ZYEA 1XXUA 5IMDA 3I9V2 1OC8A 1JZRA 1U6TA 5IMCA 5DVBA 6GSYA 4L0UA 2E2GA 1UC7A 2NVLA 5IOXA 2CVBA 4I8BA 4NMUA 1EZKA 5D73A 1OVNA 3G7JA 4KA0A 4OCEA 3QAVA 3LGCA 5GAPD 2AUVA 3WYWA 2HI7A 4AJ6A 3GIXA 2PWJA 5J4UA 1G0TA 3TRPA 1SKSB 1BAYA 4FYUA 2X99A 5GZZB 1R5PA 2JZSA 3M1GA 2B3SA 2I81A 2H73A 5H5SA 3GKMA 3GHAA 1HYUA 1ON4A 2L5LA 2VL9A 3F6FA 3G9BA 1B4PA 4ZBDA 2DJKA 1A23A 2H1DA 3KJYA 2LRCA 2RM5A 1WPIA 1EV9A 1VGLA 2XHFA 4PGTA 3VFIA 1PX6A 2IMKA 4PQHA 3DVXA 4NPBA 4IHUA 1EWXA 2YJHA 4POLA 3UAPA 4YQUA 2VD1A 2P5QA 2IJYA 3GSSA 1LBKA 2OBIA 5ENUA 2WS2A 1X9SB 3TRQA 4IBPA 3QOUA 3DMLA 1SL0B 2TRXA 4KB3A 4MH2A 2DMLA 1B48A 1GSSA 3ERGA 5DQSA 2H75A 3V1WA 1U3IA 3P7XA 2GSTA 2LS5A 4PXOA 3GURA 4BWQA 5LNKe 2VIMA 2F8FA 3WGXA 1PSQA 3CTFA 3DRNA 4IVFA 3H93A 1ERTA 2N5AA 4Q5QA 4G19A 3VWUA 1M2DA 1HD2A 2ON7A 2OACA 5F0GA 3RHCA 3D21A 1SK0A 2DJ0A 1TRUA 1T4YA 4AGSA 2L6CA 4K7NA 4EVMA 9GSSA 1XWGA 4HI7A 3F3RA 2ZNMA 2JZTA 1B9XC 1X5DA 4XTSA 2R3XA 3O76A 4Q5RA 2JSYA 3MWHA 3BBYA 4FYCA 3HZ8A 2PERA 3ZMKA 5HFKA 3F0IA 2YWNA 1K0MA 3GKNA 4KH7A 2CZ2A 4EE0A 4EL1A 5ECKB 3GUSA 2GSRA 4L8EA 2XPDA 3C7MA 3QMXA 3G7YA 1M0UA 1O81A 2BMXA 1FG4A 2FLSA 1ML6A 4MCUA 1WJKA 5CP1A 3FZ9A 1Q98A 3KZQA 3UVHA 3ZLPA 1IYHA 2H8LA 5A4WA 5HR1A 3IOSA 1ZL9A 1GUKA 2BJXA 3DYRA 2IMDA 3Q74A 2XBIA 4KDYA 2C3NA 3W8SA 3H1NA 5IM9A 2I1UA 2DSAA 4PX1A 1SKWB 3FHKA 4WR5A 3TJKA 3L78A 1TK0B 4QL7A 1GL8A 4MZCA 4KCEA 2GZPA 1O73A 2IFQB 2L5OA 4YQVA 5H5RA 1QMVA 1OC9B 3LQ7A 3EINA 5G5EA 4D73B 2CT6A 3SWLA 3IBHA 4TOPA 1T8EB 2H1AA 5HR3A 4KSMA 4HDEA 4KDUA 2LEGA 5KN2A 3FY7A 1XOAA 2VCWA 4L0WA 2VL3A 4JE1A 6GSXA 1O8WA 2X8GA 3F63A 1R7HA 4RUVA 4YH2A 1JHBA 2N5FA 1XZOA 4N0VA 2V32A 3TDGA 2YN1A 4GLTA 5IPHA 1PGTA 1PN9A 3HVSA 3QAGA 3IE3A 1LU4A 1Q4JA 3L9VA 1XIYA 3KGKA 3WD6A 3DIEA 3PH9A 3KXOA 2B7JA 4PNGA 3SBCA 1V2AA 2FWFA 5B8BA 3ZZXA 3DVWA 1NHOA 1SKRB 4YQMA 4HU7A 1DSBA 2LSTA 1I9DA 4ZL8A 1U88A 4XHMA 2FD3A 4HQZA 4LL4B 1MDJA 2GZYA 3IRAA 3IA1A 3DD3A 1PMTA 1ZOFA 2H0GA 1SL2B 2EIQA 1VF2A 4MK3A 1O7UA 5C04A 5DJLA 2R6KA 2KUCA 2L57A 4WBRD 5J9BA 2V2GA 2H6ZA 1QUWA 5G31A 1Z5YE 2C0FA 4NHWA 3WT1A 4OO5A 2HSHA 1M2AA 4RQXA 4HS1A 1X0RA 1SD9A 5CRWA 4ISDA 2H72A 1YZXA 1TOFA 2V1MA 2K8SA 1JLWA 4IJIA 4Z7XA 1ST9A 1X9WB 1XW5A 2YPMA 3Q18A 3F6DA 2HZEB 4KUNA 5ID2B 3DXBA 3ZFLA 8GSSA 1M9BA 5AN1A 3EURA 4ZB9A 4KW6A 1J08A 2H19A 7GSSA 2MYGA 4N30A 1CQGA 1PQNA 1ILOA 1BJXA 5DALB 3HJMA 1QGVA 3NIVA 5IMZA 4ZIJA 3UBLA 1QK8A 2H70A 1WMJA 2VL2A 4K2DA 5AIVA 2VOCA 1J0FA 4O5RA 1MEKA 4I2UA 1T4ZA 1OKDA 1K0OA 2EC4A 2YANA 1WE0A 1YY7A 1F2EA 1GLPA 1F9MA 4BL7A 5IMFA 3QPMA 4BVYA 3FR3A 1EOGA 5L71A 3M9KA 4IELA 3F4SA 3QCPA 4JRRA 2R5GA 3CXGA 5B8AA 4K6XA 2CVDA 1HNCA 1RQMA 6GSUA 2XBQA 3GX0A 3BOAA 4RQRA 2DBCA 3GTUB 2I3YA 4OD7A 4HEA2 1GULA 1G6WA 4I5QA 4F0BA 2REMA 3ZVJD 4X1UA 1QXHA 4MH3A 2O7KA 2IL3A 2CZ3A 1OC9A 2VL2C 1Y25A 4GQFA 3DEXA 3F9UA 4D73A 1TU7A 4O32A 1EGOA 3NOFA 2V41A 1SYRA 3LYPA 6GSWA 1AC1A 2E7PA 1FO5A 4KSOA 2TRCP 1YF0A 3TJGA 5ECRB 4ECCA 1V98A 2P5RA 1TXXA 3GN3A 20GSA 1V9WA 2IIYA 2GT5A 2OE0A 4K9ZA 1UVZA 3CTGA 4K7OA 2YCDA 1TI3A 3TCOA 3HHVA 4XS4B 3BCIA 4V2MA 1XOBA 1GUMA 4XS6A 4L5LA 1N2AA 2WULA 2B1LA 2NTOA 1MDIA 1U87A 5ECMB 1NW2A 5IO0A 3HJPA 2JADA 2K6VA 4MABA 3WT2A 2LNTA 4GSTA 4MPGA 2OKAA 4ECJA 1G7EA 4POKA 5E59A 2C80A 2AHEA 1C72A 1Z7PA 1S3AA 5JWOB 3A3TA 1KBNA 4PUAA 3M9JA 6GSVA 1PL2A 2RUFA 3ZMLA 3VPQA 5D9TA 3HVVA 6GSSA 1XPVA 3MSZA 2OBKA 4I2TA 2HRFA 2LJKA 3TGZA 1YKCA 2VLTA 5HFIA 2Z9SA 1X5EA 3JCML 1M7TA 2HZEA 5ID2A 1UA5A 4LMVA 2MMZA 3TKQA 4EXJA 5HFGA 2GTUA 3GFKA 5AISA 3GH6A 4GXZA 2CX4A 3CBUA 2KP1A 1VRSD 3UVTA 3FEUA 2DJ2A 5DALA 5ECOB 2EIRA 2HYXA 3UOMA 1N8JA 2GQLA 3LFLA 1GTBA 2FA4A 4V2LA 1A8LA 18GSA 1M9AA 3ISOA 2WCIA 3O6TA 5ECSA 4QL9A 4IQ1A 1DE2A 3J7Yk 4GCIA 4NAXA 2C1YA 1KNGA 3TKPA 3F4RA 3RPNA 1GLQA 1OC3A 1K0NA 4JBBA 4N10A 4ZBAA 5E4WA 5FHIA 1PKZA 5DCHA 2RLIA 4NWYA 1ACVA 5LD0A 1I5GA 2V6KA 4O92A 2V6OA 2VCTA 3ZRDA 3G7IA 3GTUA 4EF0A 1K0DA 1T1VA 1XVWA 2PGTA 3KP9A 4TRXA 5ECHB 5FWGA 1GH2A 2F9SA 3D22A 1GRXA 2VM2A 2DLXA 1AQVA 1GTUA 5F07A 3CSHA 3UJ1A 1NM3A 1EV4A 5EL8A 1DUGA 2OADA 4XRAA 5CRDA 1OAZA 2J9HA 3E3EA 3FZAA 14GSA 1S3DA 3CSIA 4MPFA 1Z3EA 1K0BA 1TRVA 5DDLA 2HFDA 1SD8A 2YJ7A 1MDKA 2C3QA 2GZZA 3WGDA 4F0CA 4J57E 1K3YA 3QFAC 1TI1A 3VWXA 3N9JA 5ECIB 4WEYA 1JFUA 2H01A 3UARA 1GWCA 1VF1A 4NV2A 1JZWA 2RM6A 4KCAA 1XWCA 3IXRA 3GRXA 4I6XA 2IMFA 2FWHA 5HQPA 3TB2A 11GSA 4XS4A 2XPEA 2DIYA 2B6MA 2CAIA 4TW5A 4ECIA 4IW9A 4NXIA 4H86A 2FNOA 3ZTLA 1WWJA 1S3CA 4ZXGA 2C3TA 2H74A 3L9UA 1A8YA 4TXOB 2K18A 1GTIA 4WXTA 1GUHA 1TRSA 1V40A 1V57A 1ZZYA 2ZCTA 5J9CA 2R4VA 4BPYA 3ZYWA 3H4KA 3RAZA 2HSYA 4ZL9A 1HNBA 5EPFA 5GSSA 5IOWA 4LL1B 3KH9A 2VUPA 2F8AA 4V1Ap 2OE3A 3W6GA 4GQCA 5ABRA 3EE2A 2DJ3A 1H4OA 4HZ4A 1XCCA 2M46A 5CYYA 4KDXA 3QR6A 2K8VA 3EMXA 4LLRA 1OE7A 2H1BA 3D4MA 4ZILA 5COHA 1EP7A 3LYKA 5DCGA 1PRXA 1J9BA 3HXSA 4F9ZA 3ZFBA 5D9WA 4OMVA 2HLSA 1K0AA 4POBA 1FB6A 2YWMA 5CNWA 4E8HA 3UL3A 1T3BA 1PA3A 1EP8A 2HRNA 2TIRA 4HZ2A 2F3MA 2VCZA 2GS3A 1TKDB 3M0FA 5JWQB 4F82A 3TKSE 3FZ4A 3LWAA 3VWVA 1VF3A 3FZ5A 2YOIA 4WKWA 2DJJA 3CSJA 4XCSA 3EYTA 2I9HA 2AAWA 4MF7A 1H75A 1TDIA 3CMIA 2IMIA 4X43A 2M80A 2LV3A 2VCVA 1HNAA 1KTEA 4ILFA 2GLRA 4JZQA 1ZCPA 3KP8A 4FIWA 4MMMA 4ZL7A 4NHZA 1AAZA 4TR1A 3P8WA 3HKRA 3MDKA 4JEDA 1A2MA 2JL4A 1WRYA 2G2QA 3TKSA 4ULXA 3D4TA 3ED3A 2H0HA 2GDRA 3LORA 4F03A 3KTBA 4IKHA 4HU9A 1THOA 2QGVA 3LXZA 1TK8B 4HJ2A 4O7HA 4RI6A 2YWIA 3QFBC 2C0DA 3IDVA 17GSA 2CAQA 1DE1A 1AQWA 2LJAA 2QSIA 2KP2A 3UIWA 1K0CA 4MP4A 4BA7A 1K3OA 3H79A 3F4TA 1SJ6A 4XIHA 2F51A 1GSUA 3IK7A 3OR5A 2OA7A 4TKYA 1TK5B 2AYTA 4JR6A 5GAND 3TKRA 16GSA 2GSSA 4WR4A 3F3QA 3GNJA 1Z7RA 5B7CA 3AY8A 2VM1A 3HVXA 4AJ8A 3TKSC 1USBA 1R5AA 4AJ7A 3KIJA 5G30A 13GSA 1ERWA 4Q5FA 2YP6A 5DQYA 2VO4A 5J3RA 3J7Yb 5CO3A 3L4NA 2FWGA 3KD0A 2O87A 3HYPA 1OKTA 2WZ9A 1FHEA 1A2JA 4V1Ag 4L5OA 1MTCA 1ZYQB 2HT9A 1XVQA 4IP6A 4XRDA 2B7KA 3C71A 4TXOA 3APSA 1A2LA 1TRWA 4ZBBA 5CRHA 3MAKA 1YDKA 1WP0A 1KEBA 3IHQA 1EEMA 3I69A 3C73A 3Q19A 5DAKB 1GSQA 2OE1A 1FOVA 2KOKA 3EC3A 4KGIA 3LJRA 2VAFA 2NDOA 4XS1A 1O8XA 4IQAA 5D96A 1RW1A 2KHPA 1U3AA 2HE3A 3U6VA 3LG6A 1YEPA 3D6IA 3ZITA 5A5KA 1TP9A 2HXKA 4MJBA 3FKFA 4X0XA 1NHYA 3ERFA 4MF6A 3GL5A 1E2YA 4K7IA 3GX8A 2C0EA 4RI7A 2MMOA 2LRNA 3C1SA 3I43A 3KTLA 4YAPA 4ML6A 3ME7A 2VCQA 1FAAA 1AW9A 3K8NA 3GSTA 1JZDA 1B9YC 2H0IA 4ECBA 3ZVJA 3TJBA 3APQA 2ON5A 3KMNA 1XWAA 1T00A 3KEBA 4AF2A 4CHSA 3A2WA 3UEMA 2N5BA 3F8UA 4TN8A 1O85A 1TTZA 5IMVA 3R2QA 1SJZA 1B4QA 1PKWA 5D9XA 3PINA 1K3LA 1GTAA 2EIOA 2MBTA 3UBKA 1URMA 3US3A 4DSQA 4K0GA 3CRTA 4K8MA 2O85A 3ZIJA 2LQQA 4EDZA 4PQIA 4EKZA 1ABAA 5J41A 3VPTA 2CX3A 1YJ6A 2PMTA 1X5CA 3EMPA 4ZB8A 2CVKA 1F3AA 2A2SA 1V58A 3O3TA 2VCXA 1AXDA 4FYBA 2JU5A 3TJFA 3P90A 1SL1B 1YQ1A 2CQ9A 1E6BA 2B5XA 3IK9A 3TRXA 1F3BA 12GSA 3M8NA 1XFLA 3IPZA 4MF5A 4G10A 1Z9HA 3C1RA 2OJLA 3CRUA 4DVCA 1THXA 1FVKA 1W4VA 4G2EA 5ECPB 2PBJA 5ELAA 2JZRA 2CA8A 2L59A 2ZUPA 3D0ZA 4ZB6A 5IPGA 2AV4A 2X8CA 3DWVA 4TR3A 3LXTA 2IPAA 2GQMA 5D8IA 3E0UA 4GSSA 4MJEA 4TR0A 1W89A 1PD21 3Q6OA 4TR1B 3QD9A 1GP1A 2IWTA 5G2ZA 2PVOC 2PU9C 2JACA 4J2FA 4IS0A 3HCZA 1M99A 2RUEA 1YEXA 4IP1A 4WETA 2WB9A 1BX9A 3ZIVA 4EC0A 5DAKA 4J56E 4OFTA 4DEJA 2DMMA 2C4JA 4QQ7A 2FHEA 4OWYA 4YAVA 3GL3A 4P3YB 1PX7A 2RIIA 1XW6A 4Q5NA 1WOUA 1F37A 1MD4A 5C00A 3HA9A 4BVXA 4ID0A 4MZBA 1VF4A 2JSZA 5D93A 4GSNA 2LQOA 5JCWA 5DBQA 4MA9A 2HZFA 3KMOA 3ZL5A 3HZ4A 4TVEA 4WF5A 2H71A 5A4VA 2QKEA 1SK1A 2M72A 2K9FA 3IAS2 2H76A 2AB6A 1B8XA 1SENA 1GNEA 4KAEA 3LSZA 2QC7A 4JR4A 3QAWA 2B1KA 2ALBA 3GV1A 4PUFC 4I97A 3CYNA 4WF4A 2O8VB 3FK8A 2DIZA 5IQYA 2PVQA 2PUKC 4FH8A 1WIKA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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