5IMAA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f2
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
157
structure length
156
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 48
structure length 156
sequence length 157
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5imaA00
5H5RA 1ZYQB 1F3BA 4JRRA 4MMMA 2O87A 1LU4A 1XWAA 4WBJA 4PQ1A 2WFCA 2R3XA 2GZPA 4EO3A 1U3AA 2E0QA 2H1BA 1AQXA 2P0GA 4WR4A 3VURA 2FY6A 4MH3A 4TR0A 3EE2A 1GLPA 2M80A 3CYNA 1ZL9A 5ELGA 4GRFA 1H75A 3ZVJD 3TJFA 4WF4A 1JZDA 3TOTA 4MPGA 4K7NA 3FR3A 2VOCA 1ERTA 4E8EA 3QPMA 4AJ7A 2FA4A 4FYBA 1I9DA 4F03A 2C4JA 3IBHA 1FB6A 3TJGA 4MJAA 2VM1A 1EP7A 3A5WA 3DD3A 3G7IA 2H1GA 4YH2A 1CQHA 3RHCA 3IHQA 2DMLA 3KD0A 2R4VA 3H1NA 4I2TA 4OO5A 4J2FA 3M3MA 2NPBA 5ECQB 4K2DA 1J0FA 3HZ4A 5JCGA 5JCWA 1MD3A 18GSA 4O32A 3I9V2 4ZB8A 2HYXA 3F8UA 5DQYA 2CVKA 3F4TA 4MJBA 4TVEA 3UIWA 4HEA2 3QMXA 2PGTA 4RI6A 1OAZA 3E0UA 4KB3A 1XWKA 4ZB9A 4MPFA 1VRSD 4G2EA 2CZ3A 2VCZA 1O73A 1V9WA 1OKDA 3F9UA 1BEDA 4IJ3A 4V2LA 3UAPA 2GZZA 5DALB 1T3BA 3GNJA 4ACSA 3KP8A 2L57A 4WF5A 2X8GA 4KSMA 2H01A 3U6VA 1F2EA 1KTEA 3FZ9A 2H72A 5KN3A 3DEXA 3C71A 2MBSA 2JSYA 1G7OA 1CQGA 3GL5A 1DBYA 3ED3A 1SK2A 3ZFLA 3KJYA 3GHAA 4PX1A 1Z5YE 4PQHA 2JU5A 2LRNA 2TIRA 2VCWA 4BL7A 4TR1B 2DJ3A 1NW2A 4PNGA 3FZ4A 1G7EA 1T4YA 2MBTA 5ELAA 4IP1A 4DVCA 1A0FA 3R2QA 3F63A 1GSFA 4RUVA 1T7PB 1K0OA 4KDYA 4NV2A 1OYJA 1TU8A 1YEPA 5CRWA 1E6BA 1ABAA 3AY8A 3GH6A 2L6DA 1SD8A 1TK5B 2IFQA 3HDCA 1YY7A 1SL1B 2PU9C 1PD21 4TKYA 1A0RP 3GTUA 3RPPA 1S3CA 2VL9A 3LORA 1ZZYA 4ZL7A 1A24A 1HD2A 4MCUA 1M99A 1OC3A 2A2RA 4EC0A 2WZ9A 4TR3A 10GSA 2RUFA 4EUYA 3K8NA 1T4ZA 3LYKA 3EC3A 6GSSA 2L6CA 3S9FA 1SK0A 2N5BA 1I5GA 3IR4A 1TOFA 3GV1A 1V57A 3TDGA 3GSTA 3M8NA 5B7CA 5IPGA 5IM9A 2FHEA 3CMIA 1XXUA 1J08A 1HNAA 3TKSC 1MD4A 1X9MB 2BTOT 4WR5A 1TXXA 2B1LA 1E2YA 5KEJA 4J57E 4LL1B 1DE1A 1O8XA 3QCPA 3WD6A 1QXHA 4ML1A 2WULA 3F3RA 3LXZA 1WWJA 1TP9A 2LUSA 1OE7A 4E8HA 4ECCA 4K9ZA 2QKEA 1GSQA 2KHPA 13GSA 2PBJA 1TRSA 3CSIA 4IW9A 1JLVA 1K3LA 2B5EA 2YPMA 3CRUA 3ZRDA 3DMLA 3A2WA 5IO2A 3FYGA 2KP1A 2L5LA 4ULXA 4GSSA 5DQSA 3EMXA 3GKXA 4DSRA 3VK9A 4PNFA 2FWHA 1NSWA 4AJ8A 4ZIJA 2VM2A 3CRTA 4GQFA 1WJKA 1USBA 1XOAA 1GTBA 4GCIA 4WEYA 5DAKB 2OACA 5LCZA 4EDZA 4JR4A 5KN2A 3L0HA 5ABRA 1ON4A 4I8BA 2VCTA 1EP8A 3KIJA 3FW2A 3DKSA 2FGXA 2AYTA 2B7JA 1VF1A 4KX4A 5HR2A 1UVZA 3TKSA 1SL0B 3M0FA 4K1FA 1PX6A 1ERUA 4P3YB 3QAGA 1XVWA 3EYTA 1TK8B 4ID0A 4MF7A 1ACVA 2LJRA 1R26A 3EMPA 3KP9A 3MDKA 1T8EB 1K0DA 1FVJA 5J5NA 3H8QA 3GL3A 2PERA 2HE3A 3P2AA 3TKRA 2YWNA 2I1UA 1O85A 5GSSA 3RBTA 5IMAA 3LSZA 2Z9SA 2FWGA 1GTIA 4JR6A 3D4TA 5CRHA 3GH9A 2OBKA 4IGJA 1SKSB 3C8EA 2O7KA 6GSYA 4V1Ag 2YZUA 4XRDA 3CSJA 2IJYA 1NHOA 2XPEA 4MJCA 1HYUA 3MNGA 2VO4A 1XW9A 1AQWA 4FO5A 2XBQA 5EL8A 3U5RE 4LMVA 2GLRA 4WKWA 2GSTA 2MYGA 1B48A 1EV4A 2WCIA 4OCEA 1PX7A 3UMAA 2GVPA 4WBRD 1T00A 3GRXA 4ZB6A 4PGTA 5AGYA 1Y25A 1EOGA 5CP1A 3DWVA 2MMNA 2L4QA 1Z6MA 3G7YA 3GSSA 2JL4A 3F6FA 5DCHA 1F37A 4O7HA 1JLWA 3G7JA 3FZAA 3C1SA 3TJBA 1MDKA 3UL3A 4X1UA 3D21A 2N5FA 2ES7A 4HUAA 2BMXA 4JBBA 3TCOA 3HVXA 2VL2A 4MJEA 2MMZA 4AF2A 2D2ZA 2I9HA 3ZITA 2H19A 4PUFC 3TOUA 2B6MA 3C7MA 3WGEA 4PQIA 1WIKA 5J9BA 3KMOA 4KSOA 1Z9HA 2H70A 2X99A 1B9XC 4MA9A 3UARA 2H75A 1EWXA 2DSAA 5IMFA 1O7UA 4NHZA 3L9SA 1ZCPA 5AIXA 3WGDA 1N2AA 4BWQA 5DBQA 1M2BA 1G6WA 1FW1A 1ZYEA 2IMEA 4IQ1A 1PN9A 2L59A 5IIZA 5D73A 4EE0A 3VWVA 1KNGA 2YWIA 4ZL8A 2RUEA 2IIYA 3GKNA 3CXGA 4ZL9A 1IYIA 4TXVA 1QMVA 2HXKA 2K8SA 2V32A 2HRFA 3PR8A 4X0XA 1QUWA 5HQPA 1Q4JA 2GGTA 16GSA 4POMA 2DLXA 3IK7A 2NVLA 4EVMA 2WB9A 1A23A 3VPQA 3CSHA 5D9TA 1Z7PA 3TRPA 5ECLB 2HSHA 5A5KA 1EZKA 5FHIA 3ERWA 3GN3A 1YF1A 1NM3A 4OWYA 2VCQA 4NHWA 1WOUA 2NDOA 4NAXA 1HQOA 1PQNA 2VCXA 2WRTA 3BJ5A 5C04A 3ZIVA 2VD0A 5H5SA 2E2GA 4NV5A 1PL2A 1AC1A 1GWCA 4HJMA 2IL3A 2VAFA 4O92A 2V2GA 2C0DA 5HFIA 2CX3A 3HJOA 1S3DA 3FHKA 1X9SB 3ZLPA 2O89A 2RIIA 3A2XA 4G19A 4BWSA 4YAPA 3FR6A 1JHBA 2OKAA 5F8BA 1JZRA 3D6IA 2PMTA 3N5OA 4HQSA 1EEJA 3OR5A 3ZIJA 3ISOA 3P8WA 4DSSA 2H74A 5ID2A 5KN1A 4ECBA 3J7Yk 2ZCTA 5DJMA 3IK9A 2O8VB 3KTBA 3HHVA 2LQQA 2P31A 5G5EA 1AW9A 1UN2A 2HRNA 5JWOB 2IFQB 17GSA 1TI1A 2LSTA 4GXZA 3A3TA 2YOIA 3GTUB 1S3AA 5LD0A 2N5AA 2R37A 4GLTA 4L5OA 1V40A 3Q19A 14GSA 4I6XA 2CVDA 1XIYA 3HA9A 3GMFA 2ZUPA 1YKAA 2JZSA 5CRDA 5D96A 3KH7A 1R5PA 3DRNA 2OJLA 5ECMB 3I6AA 5KN0A 4BVYA 1GUMA 5F07A 2LJKA 3DIEA 4N30A 1WP0A 2LRTA 3HXSA 1M7TA 2XPDA 2X64A 1X0RA 1BAYA 2VCVA 3IV4A 5J3RA 2CZ2A 4AGSA 1OC8A 2OA7A 1YDKA 2H6XA 3D0ZA 4CHSA 2QSIA 3MAKA 3H4KA 5IMVA 3P7XA 1VGLA 2DIZA 2C80A 2OE1A 1K0NA 6GSTA 1SD9A 1O8WA 4L8EA 3QAWA 3HVSA 4KH7A 4XS4A 2IMFA 3KZQA 4YQMA 5COHA 2YJHA 1PRXA 4OCFA 2G0FA 5CYYA 3UVHA 1UC7A 5G2ZA 3WYWA 4LA1A 4Z7XA 2PWJA 3RHBA 3FRCA 2I4AA 3V1WA 2YWMA 2ALBA 3IXRA 2PN8A 2YANA 4HOJA 1EGRA 2VLTA 5G1KA 4ZILA 5IMCA 1QK8A 3EU3A 3C73A 4N0ZA 1XW6A 3L4NA 2YNXA 3D4MA 2CAIA 3E9JB 3D22A 4F0CA 1LBKA 1WRYA 3HJPA 2L4CA 3L78A 1TRVA 22GSA 1EGOA 4F0BA 5DDLA 1K3YA 4J56E 1YEXA 2PPTA 1XW5A 5D9XA 4H86A 5FT3A 1UA5A 2R2JA 3QD9A 4K6XA 2H66A 2DBCA 1THXA 1XOBA 2IMKA 3IPZA 4IKHA 1YKCA 3EVIA 1DE2A 5B6MA 2K18A 3HZ8A 4K8MA 8GSSA 2ON5A 2K6VA 3CTFA 5HR0A 1ZGNA 2H6ZA 4ZBBA 3BD2A 3HY2A 4DSQA 4TOPA 1MDJA 3FK8A 1U3IA 2J9HA 3APQA 1GUHA 3VPTA 5HFKA 4YAVA 3UEMA 4XTSA 2H1AA 2JZTA 1V2AA 1HNCA 1GTUA 2JZRA 3VLNA 12GSA 4FH8A 4LMWA 3Q6OA 2GQMA 5G5FA 3IRAA 2L5OA 3HJMA 3APOA 2DJ0A 3UBLA 4IJIA 1SYRA 1GSDA 1Z3EA 1F3AA 5IMDA 4LLRA 2C1YA 2M46A 4IHUA 2MMOA 2LJAA 4L0UA 4GSNA 3TKSE 1GNEA 3DXBA 4PUAA 5CO3A 2HSYA 4HU7A 1O6JA 5JWQB 5HR1A 1FB0A 1X5DA 4OFNA 4MLYA 20GSA 2CQ9A 2H8LA 2WJUA 2LS5A 3W6GA 1LJRA 3TGZA 4QL9A 1R4WA 3F3QA 4MK3A 3ZYWA 1XCCA 2OE0A 3BCIA 1BG5A 1SU9A 5ECOB 2WS2A 5E4WA 4IELA 3MWHA 2EIRA 3VI7A 3DYRA 5ECRB 3NOFA 1GSSA 2VL2C 5ECPB 3QFBC 3HKRA 4XIHA 1AUCA 3APSA 2K8VA 2KP2A 5HR3A 2CT6A 1JZWA 5GAND 4OD7A 2C3TA 3Q18A 1GRXA 4KCEA 1KEBA 1WPIA 1U6TA 4MF5A 1MTCA 4IBPA 4F82A 4DEJA 4HDEA 3W8SA 1FAAA 4TN8A 3M9KA 3HCZA 2QC7A 4V2NA 1MEKA 2IMIA 3DGQA 1RW1A 3FY7A 1A8LA 4ISDA 2LEGA 1XFLA 4WXTA 3ERFA 1SJ6A 1TRUA 5IOXA 1OC9A 2GDRA 4BA7A 2DIYA 3IDVA 4NWYA 4KNDA 1YQ1A 1XBSA 1B8XA 5DVBA 1J9BA 5D9VA 4TW5A 1W89A 2C0GA 2EC4A 4MF6A 1URMA 5G1LA 3MSZA 2NTOA 2PVQA 5GZZB 1GULA 3ZZXA 4NXIA 3EU4A 1FHEA 2C8UA 4IP6A 1G6YA 4MABA 4ZBDA 2M72A 6GSVA 2XBIA 1PKWA 2LNSA 2LQOA 3W8JA 4TXOA 3KEBA 1PL1A 1A2JA 2V6KA 4GF0A 4LL4B 1PSQA 4POKA 3P90A 1R5AA 4BVXA 4F9ZA 2EIQA 5E59A 1TU7A 1BX9A 4V2MA 1TJDA 1X5EA 1BJXA 11GSA 1QQ2A 2H0HA 1EV9A 1K0AA 2PVOC 5DCGA 5IO0A 4HI7A 1PMTA 4MZWA 4MZBA 4HZ2A 2LKUA 4TR4A 1F9MA 2IPAA 4EDYA 2HFDA 2DMMA 3IE3A 4IVFA 2E2MA 2EIOA 4DSSB 1K0MA 5ID2B 1HNBA 4KE3A 3ZVJA 2IMDA 3F4RA 2F3MA 4D73A 2H6YA 2O85A 4HJ2A 4HU9A 4OO4A 2YJ7A 2HLSA 1U88A 1VF4A 2RM6A 3N9JA 3HYPA 2YZHA 1TI3A 4K0NA 1SK1A 3IAS2 3LYPA 2AV4A 3PINA 3CBUA 1U87A 3GUSA 3UVTA 1SYXA 4JEDA 3RPNA 2DJKA 3PGTA 3LXTA 1ERWA 2CX4A 3US3A 1GP1A 5C00A 2C3QA 2MMAA 3HVVA 2CAQA 4ML6A 1GSEA 3LFLA 4GWRA 2YWOA 3GKKA 1RQMA 1O81A 5ECIB 3TJJA 1RK4A 2FLSA 4G10A 3ME7A 2H71A 4HS1A 4KGIA 3M1GA 3GX8A 1PKZA 2HZEA 3LJRA 3GX0A 4XS4B 5EPFA 4KAEA 2DJJA 1V58A 5D8IA 2P5QA 1A8YA 3BOAA 2KOKA 4Q5NA 3VFIA 1V98A 3H79A 4EKZA 1SKRB 2YV7A 2GQKA 4POBA 2CA8A 4IS0A 2R5GA 1DSBA 2B1KA 4XRAA 3RDWA 4PXOA 3TKQA 3O76A 3DVWA 2GZYA 2H1DA 2CVBA 2F8FA 2FD3A 4XHMA 4N0VA 3IC4A 3LQ7A 1B9YC 4WETA 1F6MC 5EY6A 2V41A 2HNLA 4MDCA 2HZFA 3I43A 1TW9A 1XVQA 2H76A 4HZ4A 5AISA 1GSYA 1K0CA 1MDIA 3ZL5A 3TRXA 5JWRB 4Q5FA 4L5LA 4N11A 5D93A 2E7PA 2DJ2A 1Z7RA 5CREA 3JCML 4IQAA 1ZOFA 1OKTA 1Q98A 3TUEA 4POLA 4PURA 3C1RA 3SBCA 1ZMAA 4L0WA 1TTZA 4JZQA 2X8HA 3GKMA 2YP6A 3GYKA 2GTUA 3WGXA 3DVXA 1EEMA 2WDUA 1AAZA 4K0GA 2F8AA 4GQCA 4FIWA 4KDXA 4GTUA 3VWWA 3KH9A 4N10A 2VD1A 1TK0B 4XS6A 2F51A 1AQVA 3ZFBA 5IPHA 4TRXA 5CNWA 2H30A 2FA8A 1KBNA 2HT9A 2NBSA 4Q5RA 2HI7A 5F06A 1JZOA 4JE1A 4QQ7A 4Q5QA 1TDIA 1XWBA 3FZ5A 1Y6EA 1TKDB 2XHFA 2AB6A 3QOUA 4NPBA 3KMNA 3ZREA 2A2SA 2V1MA 1OVNA 3LEFA 6GSWA 1ERVA 3QAVA 5FWGA 1JFUA 1YZXA 4EF0A 1B4PA 5B6NA 4I2UA 1QFNA 4G9HA 1N8JA 6GSUA 3HD5A 3ME8A 2PUKC 2RM5A 5GSTA 2FWFA 4EL1A 1NHYA 5ENUA 5J9CA 4KDUA 1XPVA 3QDNA 3M9JA 1THOA 1X9WB 2GSQA 2JSZA 1M2DA 4QL7A 4CDOA 4BPYA 4ZXGA 2AUVA 5IMZA 3GURA 1YJ6A 5DALA 7GSSA 1C72A 4OMVA 5A4UA 5A4VA 2H73A 2MZCA 1W4VA 4ECJA 3NIVA 2J23A 2C0FA 4YQUA 5F0GA 2B5YA 5J4UA 1A2MA 3F4SA 3A2VA 4AJ6A 1TRWA 4FYUA 3IOSA 3KXOA 6GSXA 3I69A 1G0TA 3UBKA 2LV3A 5AIVA 5CAXA 5AN1A 4RQXA 5ECSA 2VLVA 1OE8A 2GS3A 3EINA 4TR1A 3KGKA 2X8CA 5B8AA 5F05A 3LG6A 2LRCA 2OBIA 3EURA 3GA4A 1YF0A 2TRXA 4F2IA 1OC9B 2V6OA 5IOWA 2AJQB 2LNTA 4YQVA 2VL3A 5DJLA 5J41A 3E3EA 3LGCA 4OFMA 1XWGA 1BQ7A 3TJKA 1M0UA 2DJ1A 1GH2A 3FEUA 4O5RA 2WGRA 1SJIA 4EXJA 1FG4A 3PH9A 1ML6A 5G30A 4I5QA 2JADA 5IQYA 2YV9A 1Z6NA 4IN0A 5A4WA 2K9FA 1FVKA 3ZMLA 4TXOB 3FR9A 4KA0A 3BCKA 3J7Yb 2YCDA 4OFTA 4MH2A 2G2QA 3WT1A 4RQRA 4FYCA 5ECNB 4KW6A 3GIXA 4MZCA 2R6KA 1H4OA 2GT6A 3NZNA 1XWCA 5INYA 4GSTA 1M2AA 2AAWA 1GLQA 3UJ1A 1ILOA 4K7IA 3ERGA 1GTAA 5ECKB 3O6TA 2OADA 3BBYA 2IWTA 4RI7A 3KM6A 2FUG2 2GSRA 4JU5A 4ZBAA 2P5RA 2FNOA 2C3NA 2FWEA 1B4QA 2FCHA 2H0IA 1GL8A 5H5QA 3LWAA 4D73B 1ST9A 1AIUA 2B7KA 4V1Ap 1K0BA 3QR6A 5LNKe 1SL2B 1PA3A 3IAM2 19GSA 2RLIA 3KCMA 5CRGA 2KLXA 4I97A 2B5XA 1VF3A 3F6DA 4HQZA 1IYHA 2OE3A 2GSSA 3Q74A 5DAKA 5G31A 3D5JA 3EWLA 4MP4A 3ZMKA 5JCUA 1XZOA 5L71A 2REMA 5ECHB 3GFKA 3G9BA 2AHEA 1GNWA 3O3TA 4KCAA 1WE0A 5HFGA 3TRQA 3H93A 1SENA 2GQLA 3VWXA 4K7OA 3KTLA 2GT5A 5EVOA 3L9VA 2TRCP 1GSUA 2VUPA 1T1VA 1R7HA 1WMJA 1VF2A 4KUNA 1AXDA 2XC2A 1QGVA 1FOVA 3QFAC 2F9SA 2HZEB 1A2LA 4ILFA 3IA1A 2IN3A 1GUKA 5GAPD 3ZTLA 2I81A 2JACA 2VLUA 2KUCA 3UOMA 4XCSA 4NMUA 2I3YA 3RAZA 3VI5A 3CTGA 4XS1A 2A4VA 2YN1A 9GSSA 1EOHA 3F0IA 2QGVA 3SWLA 3TB2A 5B8BA 3TKPA 3L9UA 1SKWB 1X5CA 2ZNMA 1DUGA 1M9AA 2CV4A 3VWUA 1PGTA 1FO5A 1SJZA 2B3SA 2ON7A 1M9BA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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