1T00A

The structure of thioredoxin from s. coelicolor
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
112
structure length
112
Chain Sequence
SHMAGTLKHVTDDSFEQDVLKNDKPVLVDFWAAWCGPCRQIAPSLEAIAAEYGDKIEIVKLNIDENPGTAAKYGVMSIPTLNVYQGGEVAKTIVGAKPKAAIVRDLEDFIAD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Expression, purification and X-ray crystallographic analysis of thioredoxin from Streptomyces coelicolor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Streptomyces coelicolor
total genus 30
structure length 112
sequence length 112
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1t00A00
4NHWA 18GSA 1GULA 2B5YA 2C3TA 3HKRA 2FWHA 4XCSA 3UVTA 2B5EA 2AB6A 4POMA 4HS1A 1SL2B 3RPPA 3M1GA 4TR1A 1R4WA 4K0GA 2VL2C 2VUPA 4FH8A 2OA7A 3GMFA 1UVZA 2MYGA 2DC5A 1G6YA 4TR0A 1HQOA 1LU4A 3GL3A 2CV4A 3BD2A 4ECIA 2IFQA 3ME8A 3QDNA 2L4CA 4IVFA 2YV9A 2MMOA 3IDVA 5HR0A 2H01A 2CVBA 2LRNA 2A4VA 2H76A 3HZ8A 3M8NA 3QAGA 1OKDA 4HZ4A 2YANA 3O6TA 3GSSA 1V58A 6GSSA 1Y6EA 1M2DA 3I69A 2GDRA 3TKSA 3H79A 4XS4B 4EVMA 1R26A 3GTUA 1YY7A 4YAVA 3VWWA 1ZCPA 4OO4A 5L71A 3J7Yk 1F3AA 1ZYQB 5AN1A 4HEA2 2EC4A 2L59A 1T8EB 1F2EA 3IA1A 1SENA 3E0UA 2M80A 1TK0B 1PGTA 4WETA 3GUSA 4MJEA 3UBKA 1BEDA 5DALB 3HDCA 4OCEA 1ML6A 10GSA 2BTOT 2H8LA 1SD8A 5AISA 2FNOA 2H71A 2N5BA 2YJHA 1SD9A 2MZCA 3EYTA 4ML1A 1Z7RA 4LL4B 3MNGA 3A2XA 4I97A 1FVJA 7GSSA 2Z9SA 3GNJA 2HZEA 2H70A 4ECCA 2DIYA 4GSTA 4K2DA 1JLWA 1A8LA 2DJ1A 5CP1A 1KBNA 4Q5RA 4MJAA 4O5RA 1PX6A 9GSSA 3G7YA 4O32A 5FT3A 1ZYEA 1O8WA 2CAIA 4HI7A 5IO0A 3ZFLA 4TN8A 1GSQA 1DE1A 1GSSA 5B6NA 3F6DA 4KB3A 1FW1A 3LYPA 4G10A 1QUWA 2OKAA 3CBUA 3M9JA 4X0XA 5D93A 3HCZA 5DCGA 4POBA 2HSHA 4EKZA 4JZQA 4MZBA 2K9FA 4ISDA 1BJXA 1B48A 3ZVJD 3CTGA 1JLVA 4Q5FA 1NHYA 1PX7A 4ECJA 3I9V2 5A4VA 2IJYA 1GSUA 2CVDA 3GL5A 4RI6A 4IQ1A 3CMIA 3FR3A 1EP7A 1OC9B 5JCUA 1J9BA 1V57A 1EOHA 1G0TA 4KH7A 1VGLA 1ON4A 3D5JA 2I9HA 3F4RA 3LORA 2V6OA 4ZB6A 1TTZA 2KHPA 1TU7A 1V98A 4TR1B 5J9BA 1O7UA 4ZILA 1Q98A 4I8BA 3DRNA 4NPBA 2F8FA 4DVCA 3DEXA 2OBIA 2ON5A 2IFQB 4CHSA 4FO5A 3TJGA 3LG6A 4JU5A 2C4JA 4J2FA 3N9JA 2PU9C 3HVXA 4JR6A 2HZFA 2C3NA 3UOMA 1NM3A 2GZZA 2V32A 2H6XA 5D9VA 4TXVA 3H4KA 3ERWA 16GSA 1TP9A 1X9MB 3GA4A 1YKAA 1SKSB 3F9UA 2PVQA 4KGIA 2CT6A 2CAQA 5EL8A 2RLIA 3S9FA 3GTUB 1RK4A 3CSHA 2M46A 3FK8A 6GSTA 2GTUA 2VD0A 2EIOA 3APSA 3US3A 3KEBA 3U5RE 4XHMA 5IPHA 5C04A 2LNSA 1PSQA 2G0FA 4BA7A 4LL1B 5GSSA 5IOXA 3TJJA 4L0WA 2IMDA 4I2UA 3ISOA 4HDEA 1SJZA 3BBYA 2C1YA 5J4UA 2H6YA 1O73A 5B8AA 3NZNA 3IOSA 2HT9A 4ULXA 1XWKA 3BJ5A 3RAZA 3TRQA 1KEBA 5DJLA 5G31A 2HZEB 2P31A 2CZ3A 2FA4A 5F05A 5CRHA 2LS5A 1TDIA 1GL8A 1QGVA 4YQUA 5DJMA 4TW5A 4WR5A 2H0IA 1Q4JA 1TI1A 4KCAA 3TKRA 3KGKA 5ECIB 4L5OA 2VOCA 4XRAA 2H66A 2HRNA 2YJ7A 1HNCA 2LRCA 1FG4A 4EF0A 1X5DA 5F06A 1BYEA 2WJUA 3SBCA 1H75A 2N5AA 1ZGNA 1MDIA 4IN0A 2BJXA 3RBTA 5JCWA 4LLRA 2K8VA 4GWRA 3KZQA 4LA1A 3D22A 1X9SB 3F63A 4ID0A 2CX4A 4X1UA 2LRTA 2X8CA 5CRGA 4ECBA 2VD1A 3F3QA 3KH7A 1MDKA 5ID2A 1MTCA 3HXSA 3WD6A 1O85A 3IE3A 3CSJA 1EOGA 3KMNA 5F0GA 1NHOA 2VCQA 4KX4A 2PGTA 1VF4A 3KP9A 4HU9A 2R37A 4F2IA 2OJLA 3TKPA 4IQAA 4D73A 1GTIA 3FR6A 4YAPA 2PN8A 5IIZA 3GSTA 1A2MA 4OFTA 3V1WA 2FLSA 4HOJA 3GIXA 4TR3A 2FY6A 4GSNA 2GSQA 5CNWA 2XBQA 4QL9A 1GTBA 3WGEA 1AIUA 3QAVA 5A4WA 1PQNA 3H8QA 3ERFA 3GRXA 1GH2A 1GNWA 1R5PA 2FWFA 2MBSA 4N0VA 3UBLA 3ZREA 1VF3A 1ZMAA 1J08A 4K9ZA 1QFNA 1GTUA 1TRSA 3IR4A 3P90A 1KNGA 4WR4A 4N10A 2X8HA 1TRWA 3WYWA 2D2ZA 2OE1A 2C0GA 4BVXA 4YQVA 2L6CA 3C8EA 2HI7A 1QQ2A 1PL2A 1U3IA 2GT6A 3TRXA 1BX9A 5D8IA 1AXDA 4IKHA 4V1Ag 2GQMA 1GSDA 1K3YA 1EWXA 4RQXA 2I1UA 4JR4A 1YDKA 2B7KA 1UA5A 4BWSA 3ZVJA 2RUFA 2LJAA 3E3EA 1EV9A 1JHBA 5HR2A 1FAAA 4DSRA 4ZBAA 3FZ5A 3DYRA 4GXZA 2WS2A 3QMXA 2DMLA 4Z7XA 1Z7PA 5HQPA 3J7Yb 4XS1A 5CRWA 5G1LA 2X8GA 1YEXA 3IAS2 12GSA 3LGCA 2O85A 1XVQA 1PA3A 3HZ4A 3EMPA 2DIZA 1Y25A 1TK5B 1AQVA 3GURA 1XW5A 3TJKA 3RHCA 1ILOA 1T4YA 3O76A 5LCZA 3HJMA 2PVOC 3P8WA 2FWGA 2EIQA 3FKFA 1AC1A 3QFBC 1M0UA 2B6MA 2GZYA 3F0IA 1UC7A 3EU3A 3AY8A 2L6DA 5COHA 5ECPB 3TJFA 1CQHA 3L9UA 5ID2B 1EZKA 2JSZA 2R5GA 2G2QA 2K8SA 5GSTA 3L9VA 2CX3A 5F07A 1MD4A 4G19A 5EY6A 4D73B 2C3QA 2E2GA 1A2LA 5D9XA 3VFIA 1FB6A 3TGZA 1Z6NA 2YZUA 1XCCA 1B4QA 2DSAA 1VRSD 4MA9A 4IP6A 2OACA 3LFLA 3HVVA 2AYTA 1UN2A 4ZBDA 1TU8A 2ZCTA 1E2YA 4ML6A 2WZ9A 2YWMA 1SYXA 1X9WB 2DBCA 3PGTA 1M2BA 4ILFA 5DVBA 3HA9A 2P5RA 5HFKA 1O6JA 5KN1A 2H6ZA 1DE2A 5CREA 4GSSA 1S3DA 4POLA 1B9YC 3TKSC 4AJ7A 1PD21 3VWUA 6GSUA 3W8SA 2DJJA 4P3YB 1Z9HA 3D4MA 4MF5A 2VCTA 4WF4A 4PNGA 4K7OA 3KJYA 1SJ6A 2H72A 2NPBA 3GH9A 2A2SA 2KUCA 4V2MA 1M9BA 2QSIA 2PPTA 2A2RA 3WGXA 1AQXA 4NAXA 4N30A 1T4ZA 1WOUA 1CQGA 2IPAA 2HSYA 2OBKA 2L4QA 2LNTA 3EMXA 1S3CA 3D21A 3DMLA 3DGQA 2OE0A 1G6WA 4JE1A 5H5QA 1AQWA 3VURA 1J0FA 2HFDA 3UL3A 4ZB8A 3GV1A 1HYUA 2JL4A 4KSMA 3LXTA 1OKTA 4L8EA 4HUAA 2JZRA 1G7OA 5G5EA 3PINA 1F6MC 3A5WA 4GQFA 2H1AA 2VLTA 3HY2A 2YOIA 2V1MA 1YF0A 1TOFA 1W4VA 3Q18A 3ZMLA 2VM2A 4TR4A 4MH3A 4ZL7A 3IK7A 3R2QA 3MAKA 1TJDA 5CAXA 3ME7A 1WPIA 1PKWA 1JZOA 2XPDA 2O7KA 3CYNA 5DDLA 4BVYA 5KN0A 2HRFA 3ZFBA 2REMA 4GRFA 4KW6A 4MJCA 1N2AA 1OVNA 2ALBA 4WEYA 2VLVA 3CXGA 3F4SA 2PBJA 1GUHA 3CTFA 1PN9A 2LSTA 4WBRD 4XTSA 1QK8A 3E9JB 1M99A 3EE2A 4ZL8A 2YV7A 4PQIA 3TOUA 3LXZA 1A24A 3VPQA 1TRUA 4MK3A 1U88A 3H93A 1BG5A 1KTEA 2E7PA 4L5LA 4EXJA 1TW9A 1QXHA 5D73A 3SWLA 1T1VA 1GTAA 4I5QA 2DLXA 1XBSA 5AIVA 1A0RP 3C71A 2NTOA 2ZUPA 4DSSA 2B5XA 4MJBA 2LEGA 8GSSA 4PGTA 2I3YA 1SK2A 1WIKA 3VLNA 5ECRB 2TRCP 3QCPA 3M9KA 3EU4A 4PXOA 2MBTA 1TRVA 4N0ZA 3I43A 1YF1A 1TXXA 2ES7A 2RIIA 1SL0B 2KP1A 2IMIA 4YH2A 2HYXA 1OE7A 4NWYA 1HD2A 4MF7A 3IPZA 3QFAC 1F37A 2VLUA 4HU7A 4TVEA 1DSBA 4HQSA 5GAND 3LWAA 4KCEA 1GSFA 5DCHA 1LJRA 3FYGA 2VCVA 3UMAA 2XPEA 2YWNA 4F0BA 3ZL5A 5G30A 4NV2A 5JWRB 2E0QA 1EGRA 2O87A 1EEJA 2MMZA 17GSA 1JFUA 5HFIA 1OAZA 1ERWA 4IW9A 4F9ZA 2MMNA 4EC0A 3WT2A 5A5KA 4V1Ap 4MMMA 1GSYA 1X5EA 4OD7A 1YKCA 2AHEA 2KP2A 1GUKA 3TRPA 3GYKA 4FYCA 1B8XA 5DBQA 5HR3A 4MF6A 2LQOA 3BOAA 2LKUA 4WF5A 2YN1A 4V2NA 1JZRA 1K0OA 2M72A 2V41A 1GLPA 5D9WA 1U3AA 4RUVA 2FD3A 2MMAA 4OFNA 4CW9A 1FVKA 2RM5A 1EP8A 3HHVA 1URMA 3CRUA 1GLQA 2P0GA 4K1FA 3D4TA 5D9TA 2BMXA 1WRYA 3PR8A 2TIRA 4K7NA 2GGTA 1A8YA 4FIWA 3TKSE 1Z6MA 3IXRA 2VIMA 1THOA 2FGXA 4WKWA 3PH9A 1AUCA 4F0CA 4IS0A 1ACVA 3KXOA 5IQYA 3H1NA 4PUFC 2GLRA 5H5RA 2LQQA 2IIYA 5JCGA 1EEMA 2WGRA 5C00A 3GFKA 2L5LA 5B7CA 5J5NA 1ERTA 5IMFA 1YQ1A 1BAYA 5DALA 1FHEA 4X43A 4H86A 3P7XA 2R3XA 2H1GA 4DSSB 2IL3A 2YP6A 2JADA 2F51A 1GSEA 4ZBBA 6GSXA 1PL1A 1WMJA 1K0BA 4OFMA 3ERGA 5FWGA 4FYUA 1N8JA 4IHUA 4NV5A 2CQ9A 1IYIA 3IHQA 1O8XA 2GZPA 1SU9A 2VL2A 2H1BA 3BCIA 1GUMA 1ZL9A 4MPGA 3FZ4A 4HZ2A 4LMWA 4MP4A 1BQ7A 4OCFA 1X5CA 4RQRA 5IOWA 3WT1A 4J57E 3VWXA 1ABAA 4GLTA 5ECQB 1WP0A 3IAM2 2GSRA 2WDUA 4KSOA 4AGSA 4DSQA 2F8AA 1T7PB 5DQSA 2YPMA 4IGJA 1K0DA 4EE0A 3LJRA 4DEJA 2VCZA 4BL7A 4MABA 5IMVA 3GKXA 5ECNB 5LD0A 1Z3EA 5CO3A 5HR1A 1H4OA 3HVSA 3L0HA 2F9SA 1XWBA 2VM1A 3MWHA 2HXKA 3FRCA 4YQMA 3TUEA 4IJ3A 3F3RA 3DIEA 22GSA 2NBSA 2B3SA 2EIRA 2HLSA 2FWEA 3QAWA 3UJ1A 3ZIJA 1XOAA 4TRXA 4GTUA 1GWCA 3EWLA 4I2TA 1E6BA 1X0RA 3FZ9A 3QD9A 3W6GA 3QR6A 2J9HA 4K6XA 2FUG2 5KN2A 4MZWA 2H74A 1PRXA 3KTBA 2QC7A 5ECMB 1XWCA 1C72A 2R4VA 3HJPA 2FA8A 1I9DA 2PUKC 1V9WA 2IN3A 5GZZB 1SKWB 3Q19A 4JEDA 4Q5QA 4JBBA 3GH6A 2YWIA 2PMTA 1K3OA 5IPGA 3TOTA 5IMDA 3KP8A 4HJMA 1S3AA 1QMVA 5INYA 2QKEA 2AV4A 2B1LA 2ZNMA 4OO5A 4NHZA 3MDKA 3VK9A 2ON7A 5KN3A 4WXTA 1M7TA 2NDOA 4N11A 3LQ7A 2C0DA 4V2LA 5E4WA 1JZDA 4E8HA 2XHFA 4PX1A 1B9XC 1RW1A 3G7JA 4QL7A 3HYPA 19GSA 1W89A 4ZXGA 4J56E 4ZL9A 3UAPA 1M9AA 2F3MA 3CSIA 2KOKA 1XW9A 1OE8A 1EV4A 3TB2A 2XBIA 3A2VA 3ZRDA 3EVIA 4XS6A 2H0GA 4L0UA 14GSA 2DJ0A 2VAFA 6GSVA 3CRTA 2AAWA 5A4UA 5CRDA 2VCXA 5JWQB 3QOUA 1F9MA 1V2AA 4Q5NA 1IYHA 4ZIJA 2QGVA 4F82A 1A2JA 5EPFA 3RDWA 1ZOFA 1XIYA 1AW9A 3GN3A 4PURA 2WCIA 3F8UA 1A23A 1SK0A 3TCOA 2VCWA 5ECOB 5G1KA 5EVOA 2OE3A 4PQ1A 3VI7A 1Z5YE 1EGOA 2V2GA 1A0FA 3APQA 1ZZYA 1M2AA 1HNAA 3HJOA 4MZCA 1TK8B 3TJBA 1FOVA 4KAEA 3C1RA 4HJ2A 1SKRB 1K0MA 3ZITA 3DVXA 3EURA 2X64A 5G2ZA 2C0FA 3N5OA 4JRRA 1SJIA 1XFLA 5H5SA 2O8VB 3FR9A 3ED3A 3UIWA 4BPYA 6GSYA 13GSA 1XOBA 2J23A 3D6IA 3GX0A 2H0HA 3Q6OA 4O7HA 1YJ6A 3KIJA 1DUGA 1NSWA 4GQCA 3RHBA 3KD0A 3MSZA 4I6XA 2JSYA 3DXBA 3IV4A 3LEFA 3ZZXA 2NVLA 4MH2A 4KUNA 3DKSA 1MEKA 2LJKA 2H30A 4TOPA 4AJ8A 2GS3A 4IJIA 3ZIVA 3C7MA 3EINA 4KE3A 3IK9A 2I81A 4G2EA 4QQ7A 5ECKB 5ABRA 5ECLB 3UEMA 3LYKA 2FHEA 2DJKA 1OC8A 2WFCA 2X99A 3UARA 1XXUA 4MDCA 4TKYA 2KLXA 4TXOA 3DWVA 3WGDA 2GQLA 5D96A 2CA8A 3W8JA 1O81A 1JZWA 1THXA 3UVHA 2RUEA 2YNXA 4F03A 3FW2A 4E8EA 2GSTA 1USBA 5GAPD 2B1KA 2IMEA 1TKDB 1MDJA 1T00A 1AAZA 4GF0A 3KM6A 3IBHA 3RPNA 2R6KA 3ZMKA 4G9HA 2WRTA 2JZTA 3A3TA 3IC4A 4BWQA 3VPTA 2YWOA 2IMKA 1SYRA 1XZOA 3ZTLA 3APOA 1VF2A 1GP1A 4PNFA 5DQYA 5G5FA 4K8MA 4K7IA 1PKZA 5KEJA 5DAKA 3OR5A 4HQZA 1K0CA 4IELA 2VO4A 20GSA 3NOFA 4CDOA 4NXIA 1TI3A 1SL1B 2DJ2A 4MPFA 1ST9A 3U6VA 2WB9A 3C73A 4OWYA 3FEUA 1XWGA 1K0NA 3A2WA 2LV3A 1MD3A 4KA0A 1LBKA 3GX8A 4K0NA 3P2AA 3FY7A 1HNBA 2V6KA 1XWAA 2XC2A 5ELAA 5ELGA 4XRDA 2B7JA 4MCUA 1R5AA 1K0AA 5ECHB 3L9SA 3DVWA 2WULA 2PERA 4WBJA 3BCKA 1F3BA 2GT5A 4EUYA 4NMUA 4EDZA 2VL9A 2LTKA 3D0ZA 5B6MA 1WE0A 3IRAA 5JWOB 4XIHA 1U6TA 1XPVA 4PQHA 4IBPA 2C0EA 3FHKA 5LNKe 2N5FA 3C1SA 2AJQB 3L4NA 1V40A 2E2MA 2HNLA 2IWTA 2K6VA 2JZSA 1PMTA 2H19A 1FB0A 4ZB9A 3M3MA 1B4PA 2CVKA 2LJRA 3GKKA 5HFGA 4RI7A 1WWJA 2DMMA 1T3BA 5FHIA 1DBYA 3I6AA 3DD3A 2L57A 1R7HA 2AUVA 3FZAA 4IP1A 3VWVA 3VI5A 5J9CA 4XS4A 3KH9A 2RM6A 2L5OA 2P5QA 4POKA 1K3LA 3GKMA 3L78A 4KDYA 5IMCA 2GQKA 3ZLPA 4AJ6A 1NW2A 3KMOA 5ENUA 2HE3A 2C8UA 3F6FA 4TXOB 2LUSA 2PWJA 5IMAA 3GHAA 3KCMA 4KNDA 1FO5A 2K18A 2JU5A 5E59A 1ERVA 1YZXA 3LSZA 1GNEA 4EL1A 1RQMA 2DJ3A 1OC3A 5IM9A 3JCML 1I5GA 2CZ2A 2OADA 4ACSA 4AF2A 5J3RA 3ZYWA 5ECSA 3EC3A 4KDUA 2GVPA 2R2JA 5AIXA 5CYYA 5F8BA 2I4AA 2YCDA 1GRXA 2FCHA 4PUAA 4FYBA 1YEPA 5IMZA 2JACA 3KTLA 5B8BA 1WJKA 3M0FA 3K8NA 6GSWA 1SK1A 2IMFA 3NIVA 2VL3A 3TDGA 1U87A 4KDXA 1G7EA 3O3TA 5DAKB 3Q74A 4OMVA 4O92A 4EDYA 1XVWA 2H1DA 2H73A 2GSSA 11GSA 1OYJA 5J41A 1ERUA 2C80A 2YZHA 4EO3A 4GCIA 2O89A 4LMVA 5IO2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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