1T00A

The structure of thioredoxin from s. coelicolor
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
112
structure length
112
Chain Sequence
SHMAGTLKHVTDDSFEQDVLKNDKPVLVDFWAAWCGPCRQIAPSLEAIAAEYGDKIEIVKLNIDENPGTAAKYGVMSIPTLNVYQGGEVAKTIVGAKPKAAIVRDLEDFIAD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Thioredoxin
publication title Expression, purification and X-ray crystallographic analysis of thioredoxin from Streptomyces coelicolor.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces coelicolor
molecule tags Electron transport
total genus 30
structure length 112
sequence length 112
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1t00A00
3IAM2 3E0UA 4GWRA 18GSA 3FY7A 4WF4A 2OA7A 1EGOA 3QMXA 4MJAA 3L4NA 3J7Yb 4YQVA 5G30A 3F4RA 2K8VA 3SBCA 2IMIA 4EL1A 5KEJA 3MWHA 4F82A 3QR6A 5KN1A 4F9ZA 2VL9A 3ZITA 4CHSA 3HY2A 4AF2A 2TRCP 3IDVA 1JLVA 4YQUA 4POMA 5ECRB 4HQZA 1KNGA 1WRYA 1XXUA 1FVJA 2K18A 2E2GA 1B8XA 2REMA 1ZCPA 1O7UA 2WFCA 4BVYA 5J41A 1XW9A 3HJMA 1X9WB 5IMVA 4LMVA 4ZBAA 4PUAA 4ZIJA 3AY8A 3UAPA 3DIEA 2VLUA 2PVOC 4PNFA 6GSSA 1Q98A 2PVQA 4WBRD 4PNGA 3H1NA 1WE0A 4ILFA 2GQKA 4TXOB 3UIWA 5A4WA 3D6IA 3P7XA 3GTUA 3L9UA 3GMFA 4ZBBA 1X9MB 4YQMA 1SJIA 3KXOA 3GIXA 3UVTA 2YJHA 3H79A 4IVFA 3TRPA 4F0BA 3CSHA 1ERUA 1SYXA 1GTUA 1V2AA 2FA4A 2GS3A 4IJIA 2BTOT 4NXIA 5HR0A 2YN1A 2JU5A 4DEJA 5D9TA 5IQYA 1FG4A 5FHIA 5IMAA 1PX6A 2VCXA 5F0GA 1ERWA 4HU7A 2P0GA 3HJOA 3N9JA 2EC4A 3KMNA 3IXRA 4KDXA 4OFNA 3I69A 2KHPA 3BOAA 2KUCA 5IOWA 1ZYQB 5ECLB 3HYPA 3FZ9A 3UEMA 1BEDA 2FY6A 1MDKA 3RAZA 3KM6A 5DAKB 3IHQA 3UOMA 2ZCTA 4OCFA 5HQPA 1V57A 3APQA 1SU9A 3FYGA 4TXOA 1TKDB 1EP8A 5GAND 1GNEA 4PQHA 1T8EB 2B3SA 2JACA 4GXZA 4MPGA 4JEDA 5AIXA 1A8LA 4DSSB 1UVZA 4NWYA 2VCTA 2IMFA 2GGTA 2LNSA 4YAPA 4TXVA 2B7JA 2VM2A 1O6JA 3I6AA 3LG6A 4JR6A 3IC4A 3M1GA 2IMEA 4IS0A 3CRUA 4KH7A 1LBKA 4RQXA 5B7CA 3M9JA 4TR4A 2GQMA 1WMJA 1WJKA 2ZUPA 1XFLA 1WIKA 4K9ZA 2YV7A 4OMVA 4BPYA 4ID0A 2WGRA 4YH2A 5KN2A 1GTBA 1H4OA 5DDLA 1AQWA 3C7MA 1GNWA 4MABA 4RI7A 5FWGA 5DAKA 5ECNB 1TDIA 2IPAA 14GSA 1ZOFA 4MF5A 2G2QA 4XCSA 4BVXA 2RIIA 2RUFA 2B6MA 4HQSA 4ZBDA 5CRGA 1TTZA 4DSQA 3LSZA 1I9DA 1EEMA 2CQ9A 2DJ3A 2H73A 1YQ1A 4POLA 4J57E 2FWFA 4MLYA 4DSSA 3F6DA 5D9XA 1CQGA 1QXHA 4O32A 3TCOA 1NM3A 3HZ8A 5HFKA 7GSSA 1OKDA 3DMLA 3MAKA 2V32A 2H1DA 3TRXA 3CTGA 3DKSA 3HXSA 3Q18A 2IWTA 5JCWA 2YP6A 2B1KA 2FWHA 2VD1A 2HI7A 3UBKA 1GSDA 3DVXA 3TKSC 2CA8A 5IMZA 2H01A 2L5OA 3LQ7A 4Z7XA 5JCUA 4N10A 1XWKA 2GT6A 4GSTA 3EURA 1KTEA 5E4WA 2C8UA 3FKFA 3IOSA 5HR3A 3D22A 17GSA 2KP2A 1XPVA 1PSQA 2JZSA 3HD5A 3RPNA 3CTFA 4K7IA 2LKUA 1HQOA 3KEBA 4WEYA 3F9UA 1GUMA 4F2IA 4KB3A 2H6YA 2VCQA 1M9AA 5D96A 5ELGA 4JR4A 3IBHA 4RUVA 5DBQA 1MDJA 3M8NA 5H5QA 3DGQA 1Y6EA 2JL4A 3MSZA 2V1MA 1TW9A 1Z7PA 1A23A 5ECQB 4BWQA 4IP6A 2YJ7A 1VF2A 3KZQA 3BCIA 2C0EA 1GSEA 2JSZA 4FYBA 4WKWA 4X0XA 1M0UA 4HOJA 2FA8A 2F8FA 1Z6MA 3LXTA 3TOTA 1DBYA 1OE7A 5CNWA 2WS2A 5IM9A 2LJRA 4D73B 4MZCA 2H8LA 1U3AA 3CRTA 4XS4B 5D93A 1PKZA 1Z5YE 3QFAC 3TJJA 4GQFA 2R5GA 1K0MA 3PH9A 1JZRA 1WOUA 3IE3A 3APOA 1FO5A 1AQVA 3TKRA 2VLTA 1A2MA 1A8YA 3VPQA 3ZL5A 5GZZB 4KNDA 4RQRA 4K0GA 2H19A 5IO0A 1GWCA 1K0DA 2VCZA 3GNJA 2MZCA 4J56E 1O73A 1J0FA 4IQ1A 3HHVA 4I5QA 4JE1A 3HA9A 3BJ5A 4HEA2 2AV4A 2AHEA 4XS6A 3ZIVA 1T4YA 1JZWA 3APSA 1MD3A 1UN2A 3GH9A 2PMTA 1AQXA 3F4SA 2VM1A 4ECIA 4CDOA 1M7TA 1EV9A 4IJ3A 1EP7A 1K3LA 1OE8A 2OE0A 2H6ZA 4D73A 2N5AA 2LEGA 3TB2A 4G9HA 4XS4A 1BYEA 3TDGA 3J7Yk 3LXZA 5DVBA 4RI6A 2N5FA 2R3XA 2L59A 1TRVA 4KCAA 2GZZA 3C71A 2NBSA 2HFDA 3GH6A 1YJ6A 5IPGA 1TU7A 1DE1A 3FHKA 1KEBA 2DMMA 4MP4A 3VWWA 5DCGA 2K6VA 3ZYWA 4XTSA 2KLXA 4JBBA 5G5EA 2GT5A 4TOPA 3F3RA 3BBYA 1FB0A 1ERVA 3UJ1A 3VWUA 2IN3A 1R7HA 1BAYA 3GYKA 5HR2A 3FR3A 1ILOA 1PX7A 3GKMA 4LA1A 1T3BA 3ZLPA 4V2LA 1SJ6A 5JCGA 4V1Ag 3NZNA 4EDYA 2QC7A 1R4WA 3EVIA 5ECPB 2MBSA 2DLXA 1U6TA 2C0DA 2X8GA 3W8JA 3TGZA 3HVSA 2HNLA 3HZ4A 3EU3A 4X43A 1OAZA 2LRTA 1A0RP 1TXXA 3PR8A 2F51A 4XHMA 3ZREA 2C4JA 4KSMA 2DJ1A 1XIYA 2GSTA 2HSHA 5J4UA 2YV9A 3C1SA 4E8EA 1MD4A 3RHBA 5IPHA 5J9CA 4V2NA 4GSNA 4MF7A 5CYYA 5IMDA 3EU4A 3UARA 5B8BA 1XOBA 4K8MA 4MMMA 1X0RA 4POBA 1TI3A 2YNXA 1SENA 3FEUA 4IELA 2ZNMA 5B6MA 2JZTA 2F3MA 2LV3A 6GSVA 3L0HA 3F3QA 4EO3A 1TK8B 3RHCA 2ES7A 1R5PA 3H93A 4EUYA 3RPPA 1YDKA 4X1UA 1EOHA 4KA0A 4LL4B 6GSYA 2I81A 3H4KA 3E3EA 4TR1B 3HVVA 2JSYA 2XBQA 4Q5RA 4TRXA 5IIZA 3I43A 4ZB8A 1GSYA 2L6DA 3A3TA 3EC3A 1AIUA 4ZL8A 3F6FA 1FAAA 2H72A 4OO5A 4ZB9A 2VL3A 3TKSA 2HZEB 1MDIA 5DALB 3ERFA 8GSSA 3E9JB 3U5RE 3QFBC 1GUKA 3WYWA 3CMIA 1VF4A 3Q19A 4FYUA 1ACVA 5ECOB 2XPDA 3WGXA 3FR9A 3ZRDA 1XVWA 2NVLA 1SKSB 2OBKA 5J9BA 1SYRA 1B48A 2L5LA 2HLSA 5G31A 2LNTA 1E2YA 1IYIA 4IW9A 2BMXA 2VIMA 4ECJA 1JHBA 3ZMKA 3C1RA 1YEXA 2VOCA 1B4QA 4TR1A 2LSTA 4MF6A 3QAWA 4ZL7A 5A5KA 4EVMA 5CP1A 1GTIA 2TRXA 4PQIA 5CRHA 1TK5B 3ZMLA 3GURA 3D5JA 5EPFA 3D21A 1X9SB 4JZQA 3HKRA 3KP9A 2DMLA 1E6BA 2HZEA 3IPZA 4N30A 5DALA 3HJPA 2CX4A 2FGXA 1AC1A 1V9WA 1TRSA 3DWVA 2LUSA 2WZ9A 1HNBA 4G10A 2RM5A 2IMDA 2XC2A 2P5QA 3TJBA 2HXKA 1M99A 2H0GA 2P5RA 3GSTA 5HFIA 5D9VA 3ME8A 1RK4A 1OC9B 2FUG2 1XWCA 2I3YA 3OR5A 1F6MC 2CX3A 1FW1A 2M46A 2IMKA 1V40A 3RBTA 2HYXA 3UVHA 3VLNA 1O8XA 3DXBA 2G0FA 2A2SA 3L9SA 4E8HA 22GSA 2B5YA 2GTUA 1AXDA 3TUEA 1JFUA 4O7HA 2C3QA 4OCEA 1PRXA 3DVWA 1XVQA 4MH2A 2QKEA 4FYCA 2MYGA 3ISOA 5G1LA 1SK0A 4K2DA 2H0IA 5L71A 5GSSA 4MH3A 2QGVA 3FZ5A 5C00A 3VWXA 2B7KA 4HZ4A 3FR6A 4EDZA 3GN3A 4F0CA 2M80A 1WPIA 3CSJA 1TU8A 1EOGA 1OYJA 1TI1A 2H1AA 1SK1A 4KW6A 1DUGA 1T4ZA 4K1FA 4IN0A 4HU9A 2B5EA 1ZYEA 1SD8A 2DJ0A 1UC7A 5D8IA 2VCWA 1YF1A 1M2AA 1GSUA 2F8AA 3ERGA 4WF5A 1OC9A 2FWEA 5G2ZA 2PN8A 3IK7A 4L5OA 2HZFA 2O85A 1Z3EA 4I6XA 1W4VA 3VK9A 2VL2C 3QDNA 5ABRA 2GZYA 2ON7A 3ZFBA 2YOIA 1ABAA 4AJ7A 3IV4A 4I8BA 2NDOA 4I2UA 1SD9A 4MDCA 2FCHA 3UBLA 2LRCA 1V98A 4MJEA 3P90A 5ECHB 2V2GA 1B4PA 3LYPA 5F07A 3QAGA 3WGDA 4IHUA 4NHZA 1G7EA 1GULA 1PN9A 5CREA 2HT9A 5LNKe 3FRCA 3O76A 4K7NA 1N8JA 1U3IA 3CSIA 3ME7A 1A2LA 4TW5A 3ZTLA 3G7YA 1PL1A 1JZDA 6GSTA 2ON5A 2VO4A 4QL7A 3VI5A 5DQYA 2DJKA 2WRTA 2VUPA 4ZL9A 2XPEA 6GSUA 2J23A 3G9BA 4O92A 2H1BA 2EIRA 1GTAA 2FWGA 4DVCA 1B9YC 4GQCA 5EVOA 5IMFA 5D9WA 6GSXA 4BA7A 2MMNA 4WXTA 5ID2B 3D0ZA 2Z9SA 1GH2A 4G19A 1C72A 3O6TA 4L0WA 5AN1A 5DJLA 2YANA 1LJRA 4WR5A 4DSRA 1K0OA 1SL0B 1S3AA 3WGEA 1RQMA 1F37A 1T1VA 2PGTA 1EGRA 4NMUA 1K3YA 2KOKA 2O8VB 3M0FA 1GLQA 3NOFA 4JRRA 2P31A 2CV4A 4KDUA 1PKWA 2A2RA 5DQSA 4TN8A 2MMAA 3GHAA 1EWXA 3GUSA 2H70A 2BJXA 2H66A 2M72A 4K7OA 3KH9A 12GSA 3I9V2 2GZPA 2E2MA 5C04A 4MJCA 5CRDA 2DIZA 4KAEA 3GA4A 3GRXA 2R2JA 2FNOA 3Q74A 3ZIJA 3ERWA 13GSA 2PUKC 5FT3A 5IO2A 3LJRA 3VFIA 1O81A 2DBCA 3DD3A 3KH7A 2IFQB 4ISDA 1THXA 5ID2A 3F8UA 5D73A 1SK2A 3GKKA 1T00A 3A5WA 1AUCA 4QL9A 3ZVJD 3LFLA 2OACA 4WR4A 3US3A 1EV4A 1GSSA 4MA9A 1IYHA 4IGJA 11GSA 1A24A 4MCUA 4XS1A 3QCPA 3UMAA 5F05A 1NHOA 4LLRA 2FHEA 2YWMA 3K8NA 1K0CA 4GLTA 20GSA 5CRWA 2H76A 5G1KA 3TOUA 2VLVA 3L78A 3TRQA 3ZVJA 1M2BA 4BL7A 2AYTA 2MMOA 1Q4JA 4JU5A 3EMXA 1FB6A 1SKRB 2NPBA 4PXOA 1M2DA 1M9BA 4YAVA 4FO5A 5AGYA 3IRAA 3HVXA 3C73A 3L9VA 3LORA 3F0IA 4XRDA 3HDCA 3DEXA 1XWGA 1AAZA 2IFQA 4MZBA 5CAXA 3FZAA 1QUWA 4POKA 4ULXA 3TKQA 3GKNA 5HR1A 4G2EA 2C1YA 2AAWA 2N5BA 2H71A 3MDKA 2YZHA 4K6XA 5ENUA 3KIJA 3G7JA 4OO4A 2CZ3A 3R2QA 2J9HA 2XBIA 5IMCA 3GX0A 4OD7A 2I1UA 3WT1A 1JLWA 3IK9A 2C3TA 3RDWA 1ZL9A 1XZOA 3EINA 4IBPA 2YWOA 5ECKB 2C0FA 4GCIA 1X5EA 1VF3A 2DIYA 5LD0A 1Y25A 4BWSA 1VF1A 4PQ1A 2L4CA 4WETA 4ECCA 2OADA 1USBA 2AJQB 5J3RA 2RUEA 2K8SA 4NV5A 2I9HA 4L5LA 1V58A 5J5NA 2MMZA 2H1GA 3D4MA 1K0NA 4CW9A 1HNAA 3N5OA 4KCEA 4ZXGA 2K9FA 3GL3A 5INYA 1YKCA 3ZZXA 1PD21 1GL8A 2CZ2A 1RW1A 2FD3A 3GKXA 4AGSA 5A4VA 2D2ZA 1G0TA 1HYUA 4P3YB 5H5RA 2F9SA 1HNCA 2C0GA 3TJGA 3LGCA 3P8WA 2GQLA 2WDUA 5DCHA 2L4QA 1WP0A 4GTUA 1G6WA 2L6CA 2VL2A 2OKAA 1YKAA 1XOAA 1J08A 2LS5A 1GRXA 5JWQB 4GRFA 1TOFA 4L8EA 1QFNA 1SKWB 2L57A 1XW6A 5ELAA 2I4AA 4NHWA 1XWAA 2WB9A 3DRNA 1EEJA 3NIVA 1F3AA 2YCDA 1T7PB 2EIQA 2OE1A 5AISA 1NW2A 1UA5A 3VI7A 4NV2A 1S3CA 1NHYA 1ZZYA 3SWLA 4MJBA 2LQQA 5DJMA 2VAFA 2R37A 5HFGA 2H0HA 1X5CA 2YPMA 2YWNA 5A4UA 1Z6NA 3EMPA 3VPTA 1F3BA 3Q6OA 1QK8A 3HCZA 2PWJA 1SL2B 2PPTA 2C80A 2VCVA 1U87A 4IKHA 4HS1A 4PX1A 3PINA 2JADA 1FVKA 2TIRA 1FHEA 1PQNA 2H6XA 2OBIA 1GP1A 2B1LA 3BCKA 3D4TA 2EIOA 1URMA 2X99A 3JCML 4KSOA 1QMVA 5B6NA 3IA1A 4LL1B 1DSBA 2WJUA 4MK3A 3FZ4A 4PGTA 4PURA 3KP8A 2C3NA 9GSSA 5JWOB 4KUNA 10GSA 4QQ7A 1MTCA 4XIHA 2LJKA 2XHFA 1TRUA 1XBSA 1BX9A 3S9FA 2MBTA 5ECIB 1GLPA 1B9XC 3F4TA 3IR4A 3G7IA 4K0NA 3QAVA 4GF0A 1DE2A 4NPBA 1TP9A 1AW9A 2IL3A 4O5RA 3IAS2 1YEPA 3PGTA 4FH8A 1VRSD 2HRNA 6GSWA 3QPMA 4EXJA 4N11A 5KN3A 4MPFA 5JWRB 4IQAA 3A2WA 1GSQA 2O89A 2GDRA 4HZ2A 4N0VA 4WBJA 3EWLA 5COHA 2GLRA 1VGLA 1YY7A 1N2AA 1ML6A 1I5GA 1YZXA 2IJYA 1XW5A 2LJAA 2NTOA 4KGIA 4L0UA 3W8SA 1TJDA 4EF0A 4PUFC 1Z9HA 1ZGNA 1K3OA 4I97A 1O8WA 2YWIA 1PA3A 1K0BA 4TR3A 3FK8A 3FW2A 3CYNA 5F8BA 2QSIA 4Q5NA 3BD2A 1OC3A 1TK0B 5EL8A 2PBJA 3O3TA 3GX8A 4EKZA 3TJKA 5ECMB 1QGVA 1ZMAA 4KE3A 1ERTA 1GUHA 2O87A 3CBUA 2HRFA 2ALBA 5B8AA 4OWYA 2PERA 5G5FA 3V1WA 3TKSE 2X8HA 2DJ2A 2CAQA 4XRAA 1HD2A 2V41A 1G7OA 3M9KA 3CXGA 5F06A 4F03A 1GSFA 2JZRA 4KX4A 4TR0A 4Q5QA 1CQHA 2CAIA 1BQ7A 2HE3A 2FLSA 4V2MA 3F63A 5LCZA 1BJXA 2DSAA 1S3DA 2H74A 1XCCA 1K0AA 5E59A 3KMOA 4I2TA 5GAPD 4OFMA 1H75A 5H5SA 4AJ8A 3DYRA 4IP1A 4KDYA 4MZWA 5KN0A 5AIVA 2V6OA 5EY6A 1G6YA 3LYKA 4HUAA 4ECBA 3W6GA 4GSSA 1YF0A 2X64A 1R5AA 2DJJA 3EE2A 1OVNA 5IOXA 3A2XA 4Q5FA 1F2EA 2VD0A 3MNGA 2V6KA 1MEKA 1OC8A 3QOUA 1A2JA 4V1Ap 3C8EA 2O7KA 3VURA 2E0QA 4FIWA 4LMWA 3A2VA 1PL2A 3KD0A 1ON4A 1TRWA 5ECSA 2R4VA 3TJFA 2PU9C 2CT6A 2GSRA 2X8CA 4ML6A 2H30A 3H8QA 4ZB6A 3P2AA 2IIYA 4ACSA 1F9MA 4HJ2A 3KJYA 4ML1A 1SL1B 3GSSA 1W89A 1R26A 2OJLA 1FOVA 1U88A 1PMTA 1KBNA 2CVKA 4EC0A 4J2FA 1THOA 1XWBA 3GFKA 2AUVA 4OFTA 2LRNA 1X5DA 3QD9A 1LU4A 1ST9A 3EYTA 4TKYA 2GSSA 3WD6A 4H86A 3TKPA 4NAXA 2YZUA 4AJ6A 16GSA 3ED3A 2WULA 2RM6A 3UL3A 1Z7RA 2R6KA 1A0FA 1J9BA 3KTLA 3WT2A 3LEFA 2A4VA 4HJMA 4HI7A 1WWJA 3U6VA 4N0ZA 3KTBA 2GSQA 3KGKA 1OKTA 2CVBA 2GVPA 2LTKA 2HSYA 5GSTA 2DC5A 4TVEA 5CO3A 2OE3A 2B5XA 3M3MA 4HDEA 2KP1A 2AB6A 1JZOA 4ZILA 2WCIA 1PGTA 3VWVA 19GSA 3GL5A 2RLIA 4EE0A 1NSWA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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