2RLIA

Solution structure of cu(i) human sco2
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
170
structure length
170
Chain Sequence
SFTGQGDFHLLDHRGRARCKADFRGQWVLMYFGFTHCPDICPDELEKLVQVVRQLEAEPGLPPVQPVFITVDPERDDVEAMARYVQDFHPRLLGLTGSTKQVAQASHSYRVYYNAGPKDEDQDYIVDHSIAIYLLNPDGLFTDYYGRSRSAEQISDSVRRHMAAFRSVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords SCO2 protein homolog, mitochondrial
publication title A Structural Characterization of Human SCO2
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Metal transport
total genus 44
structure length 170
sequence length 170
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2rliA00
1T7PB 4G9HA 5H5SA 5INYA 3IE3A 2M72A 3HCZA 2C3QA 2HNLA 2QGVA 3VLNA 1HNAA 4J57E 4V2LA 5FT3A 3H79A 5CRGA 3TKQA 1UC7A 1KBNA 4KDXA 2DJJA 4FYCA 5G30A 3FK8A 1XWKA 3GSSA 3EU4A 5F07A 3A2WA 4KA0A 4TR1A 3D4MA 6GSVA 3ZMLA 4GXZA 1Z6NA 1HQOA 1BQ7A 2C0DA 3CSJA 4CW9A 1G7EA 1F2EA 2JSZA 2H71A 2MBSA 1J08A 3GN3A 2K8VA 1ML6A 3OR5A 4YAPA 2M80A 4EXJA 1XCCA 2VLUA 1SK0A 2NDOA 3KH7A 1O8WA 1TP9A 2HLSA 4WF4A 4EVMA 5HFKA 3UVHA 3GIXA 3KJYA 1IYHA 1V40A 1B4PA 1B8XA 1V9WA 8GSSA 3TRPA 4QL9A 2YZUA 2HT9A 3GMFA 3I6AA 3GTUA 1JHBA 2V6OA 1ZYQB 1X9MB 1AQVA 1B9XC 2HSHA 5D9XA 5CRDA 3UJ1A 2VL9A 4EF0A 2FCHA 4TR4A 2DMMA 2FLSA 3E9JB 2LJRA 3EMXA 3LGCA 1O8XA 1N8JA 1XW9A 2L5OA 4JBBA 3TJBA 3D0ZA 3W6GA 3KP8A 1E2YA 3UMAA 1ZMAA 2D2ZA 3ERWA 2HZFA 5KN0A 4MCUA 2N5AA 2YWIA 3FZ5A 2VCXA 2H0GA 3LYPA 3IOSA 6GSXA 2GZZA 4KAEA 1BX9A 2L6DA 2C0GA 4LLRA 2H1DA 1G0TA 1NM3A 1DBYA 3C7MA 5IO0A 2FY6A 2YV7A 3GL5A 2FNOA 4GWRA 1FB6A 4ZL7A 3CSIA 3H4KA 3IPZA 1GSUA 2H74A 3RAZA 4EDYA 1XBSA 1ON4A 1WRYA 2C0FA 2FHEA 3QCPA 1OC8A 4L8EA 1O6JA 4Q5FA 2CX3A 1IYIA 1B48A 4KDUA 22GSA 4PXOA 2MMZA 1GULA 5LNKe 4K2DA 3JCML 4ZILA 1VF1A 3TOUA 3I43A 2GQKA 1SJ6A 4NHWA 5IM9A 1AC1A 5J5NA 1KNGA 3HDCA 3GSTA 4K6XA 4PQIA 2GSTA 18GSA 1XWCA 2OADA 3IDVA 3UBKA 2XC2A 2HZEB 2GZYA 2PWJA 5CP1A 3TJFA 1USBA 1X5DA 2WFCA 3VWVA 1XWAA 2XBIA 3ZYWA 4EE0A 2GTUA 1XZOA 1MDIA 1Z5YE 1QQ2A 3LXTA 3ZTLA 3G7IA 3H8QA 3S9FA 1DUGA 4F0CA 2X8CA 3QDNA 3IBHA 2CQ9A 4Q5QA 4MF5A 3SBCA 2V32A 3ZIVA 3GUSA 3I9V2 2VL2C 2PVQA 5GSTA 1XFLA 1TK5B 3EYTA 4AJ8A 3VI5A 1F3AA 1HYUA 3GKKA 4IP1A 3FR6A 2GSRA 5IOWA 4IS0A 2JZSA 3QPMA 2RM6A 4CHSA 1T4ZA 2H6YA 2GT6A 3A2VA 1U3IA 2B1LA 1A0RP 3ED3A 3UBLA 4H86A 1WIKA 4YH2A 3DRNA 3LXZA 5A5KA 3G9BA 4L0WA 2MMOA 2QC7A 4KNDA 1UA5A 4POMA 2O7KA 5G1LA 5KN2A 4IP6A 5ID2B 2CAQA 1ZL9A 3TJKA 1S3AA 1PMTA 5DAKB 3NZNA 3U6VA 5HFIA 3VWXA 3IV4A 5AN1A 4IQAA 2LJAA 4KW6A 3H93A 1SENA 2IMIA 3BCKA 2R3XA 1BJXA 4ZB6A 4HDEA 3NIVA 1PL1A 2YN1A 1WWJA 3EWLA 2H1BA 1AIUA 3J7Yk 10GSA 3F63A 3J7Yb 1EGOA 5CRHA 4XS4B 1LU4A 4X1UA 4O92A 1GNWA 3E0UA 3TKSC 1R26A 3F4TA 4KB3A 4IGJA 5HQPA 4KGIA 2KUCA 5CAXA 4O32A 3EU3A 1OE8A 3LSZA 1T00A 4FIWA 1NSWA 3KM6A 5GSSA 1YF0A 2CVKA 1Z9HA 4HZ2A 3HJPA 1WMJA 1GNEA 1N2AA 2WS2A 5JWQB 1QXHA 4HOJA 3FZAA 1YEPA 3GKMA 3UL3A 1ZZYA 1GLQA 1YY7A 5DBQA 12GSA 1QUWA 2LS5A 1GSDA 3TKSE 2I81A 2VM2A 1QMVA 5DAKA 4ECIA 5G2ZA 1A2JA 1SL1B 3IC4A 2FWFA 1X9WB 5COHA 3FEUA 1R5AA 1KEBA 3UIWA 1TKDB 4GF0A 3HVSA 2O89A 4KDYA 3HJMA 4X0XA 5IMDA 4WEYA 4GSSA 4NAXA 2B6MA 2VCZA 2H76A 3KP9A 4AF2A 2YJHA 3ME8A 1TRVA 3BJ5A 2CT6A 5KEJA 2E2GA 1BAYA 2H72A 2IFQA 2JADA 1K0DA 1R4WA 2H0IA 1BEDA 1JZRA 4WF5A 4I5QA 1TXXA 3LQ7A 3QD9A 4ZBBA 4IQ1A 5E4WA 1X9SB 3US3A 3LG6A 1MTCA 5F0GA 5AISA 1H4OA 2IMDA 5G1KA 3GL3A 1SD9A 1BYEA 2FWHA 2YZHA 1U6TA 2H19A 2DJ2A 3TKPA 2VCWA 2EIOA 2C0EA 2C8UA 1JLVA 4XS1A 5GZZB 2BJXA 1GSSA 5CYYA 5ECQB 4OCEA 1PL2A 2O87A 1XVWA 3M0FA 2WGRA 1JZWA 5LD0A 3ERFA 1YDKA 16GSA 2LRNA 3EE2A 2C4JA 3GFKA 1TK0B 1C72A 4DVCA 3EURA 4CDOA 4HI7A 2CV4A 4F03A 4PGTA 1MDKA 1TTZA 2AYTA 3F9UA 3KEBA 4JZQA 4DSSA 5J9CA 4WBRD 1XW6A 2HRFA 3FYGA 3P90A 4AGSA 6GSSA 2N5FA 2FD3A 3KTLA 1DE1A 3GX0A 2AJQB 5AGYA 3FHKA 5B6NA 5HR3A 4RQRA 4G10A 2MMNA 3DEXA 3TB2A 3PINA 5C04A 2NPBA 5IPGA 4LA1A 3QAWA 1K0MA 3N5OA 5ECSA 2XBQA 4OMVA 4E8EA 5B6MA 2E2MA 3GRXA 1URMA 5ECPB 1MEKA 2CZ2A 4TXOA 2KLXA 1XOBA 3M3MA 3MAKA 4WR5A 4G2EA 3D4TA 1RK4A 1ST9A 4JR6A 2OACA 4PNFA 3K8NA 1SYRA 1EV4A 4K9ZA 1Q4JA 1EGRA 4D73B 4MH3A 5CNWA 2JL4A 3KMOA 4NPBA 3F4RA 4MJCA 5F8BA 5HR1A 2WRTA 1TRSA 2IIYA 3APQA 4MPGA 2MZCA 5AIXA 3CRTA 1U3AA 2OE3A 2XHFA 2LUSA 1SKSB 3F0IA 1A24A 1GTAA 1EP7A 1U88A 4KE3A 1B9YC 5H5RA 4TRXA 3O76A 3TRQA 5J41A 2QKEA 2VL3A 2IL3A 3E3EA 2YANA 4OWYA 3L9UA 5EVOA 4IBPA 2I4AA 4PUAA 1XXUA 1VF3A 2VUPA 1F6MC 4NV5A 2B5YA 2VM1A 1I5GA 3I69A 4J2FA 5IIZA 4I97A 2KOKA 1GUMA 2YWNA 5D9WA 1Z7RA 3ZVJA 1W89A 4EKZA 1VRSD 1T8EB 3F6DA 1WOUA 1TK8B 2I1UA 4NWYA 3L0HA 3VPQA 5JWRB 3APSA 3UOMA 3CTGA 3UVTA 2PPTA 3L9SA 4F9ZA 3IK9A 5GAND 2VD1A 1HNBA 4MABA 4QQ7A 4KSMA 2ON7A 3FZ4A 3CRUA 1OC9B 2ON5A 2GLRA 3PR8A 3HJOA 3VI7A 4MMMA 3HZ8A 3EC3A 2GS3A 3KXOA 2GGTA 3DXBA 3ZVJD 5ECMB 3DVXA 5ENUA 2CAIA 5J9BA 3R2QA 5DQYA 2YOIA 4V2NA 3C1RA 1AUCA 2VL2A 2LJKA 3D21A 5A4VA 1GWCA 4RQXA 3UEMA 3U5RE 5D73A 2P0GA 4ZIJA 11GSA 4TOPA 4Q5NA 2O8VB 3IK7A 3TOTA 1XOAA 3M9KA 1X0RA 2H1AA 3FR9A 2CX4A 3C71A 3RHCA 1V98A 4EO3A 3CSHA 3LORA 2F51A 3HHVA 4K7OA 2YWMA 6GSUA 1SK1A 1UN2A 3EVIA 4O7HA 5HR0A 1A8YA 1FO5A 4PURA 1EP8A 2L4QA 1EV9A 1JFUA 4GQFA 5GAPD 1K0AA 3HVVA 3RDWA 1NHOA 4HJ2A 1Z6MA 5D8IA 2HI7A 1SYXA 5ECNB 1GP1A 2PBJA 4BA7A 2MBTA 4ML6A 6GSWA 1O7UA 3WD6A 2H66A 2N5BA 3BOAA 1PN9A 3FW2A 4HUAA 3IHQA 4HQZA 1AAZA 1SK2A 4J56E 2X8HA 4YQMA 4ZB8A 3GHAA 1R7HA 3WYWA 2E0QA 2TRCP 2ES7A 1K0CA 2VO4A 2KP1A 2AV4A 2LRCA 3TKSA 1HD2A 1X5EA 2AAWA 1GLPA 3VWWA 3APOA 2H8LA 1EOGA 6GSTA 2YNXA 1O73A 1O81A 2WB9A 2LV3A 1E6BA 1A8LA 2A2SA 4XS6A 1QGVA 5DCGA 3ZFBA 1MDJA 1TRUA 4N0VA 1M2BA 3O6TA 4K0NA 3ZFLA 3MDKA 3M8NA 4LL4B 3TDGA 5KN1A 5A4WA 2IWTA 2HZEA 5DALB 2I3YA 5D93A 2H1GA 3IAS2 3QAVA 2FA4A 1K3LA 3Q19A 1GRXA 4TW5A 1PSQA 2OE0A 1FW1A 3RPPA 3WGEA 2WJUA 1NHYA 4I6XA 4GTUA 1CQGA 2Z9SA 2REMA 4BWSA 1JLWA 1YJ6A 1YF1A 1XPVA 2JSYA 3MNGA 1SL2B 4ECBA 1RQMA 3D22A 4AJ7A 1TJDA 2R5GA 3IA1A 2PUKC 5D9VA 4BVYA 1ERTA 2DJ0A 2RM5A 4V1Ap 1GUHA 5DVBA 3G7YA 2B7KA 5L71A 2O85A 2VIMA 4K8MA 4F0BA 5ECHB 2PN8A 4GRFA 2JACA 5B7CA 1EEJA 2PVOC 3CYNA 2F9SA 2BMXA 1AQXA 3QMXA 5FWGA 5ECIB 1WP0A 2DMLA 1GTBA 3QFAC 5B8BA 2BTOT 1FHEA 5H5QA 3G7JA 2V41A 1PQNA 5FHIA 1Y6EA 2VOCA 1KTEA 5ID2A 4JR4A 4GSNA 1T4YA 1GTIA 3WGDA 2ZCTA 1Z3EA 2OBIA 1OKDA 4F2IA 1S3CA 3PH9A 4Z7XA 4AJ6A 4TN8A 5F06A 4LL1B 4ZL9A 5IMFA 1PRXA 5KN3A 2IMEA 5EY6A 2X99A 3TJJA 1NW2A 1GSQA 3A5WA 3ERGA 1SKRB 4ACSA 3VK9A 1ERWA 1PA3A 2L57A 1ZCPA 1ZYEA 1SU9A 2IN3A 5LCZA 4TR1B 1M9BA 2F8AA 4PQ1A 2R6KA 2V1MA 2PGTA 4OFMA 4QL7A 4LMWA 4XS4A 2HYXA 1WE0A 1GSFA 3LJRA 3QAGA 1M2AA 2P5RA 3SWLA 5EPFA 1FAAA 1ZGNA 1BG5A 3FKFA 2H6XA 4IELA 1CQHA 4G19A 3DKSA 4KH7A 1PD21 4L0UA 2P5QA 3C1SA 1A0FA 4YAVA 3GNJA 2VLVA 17GSA 1MD3A 1PX6A 2WZ9A 4ZBDA 3FY7A 4GLTA 2DJKA 5AIVA 2RLIA 2VCTA 1F9MA 5HFGA 5JCUA 2OKAA 2LSTA 3F6FA 1VF4A 3A2XA 4PX1A 1PGTA 3RHBA 2AB6A 3VFIA 4OFNA 2P31A 1VGLA 4TR0A 3TCOA 2DC5A 2PERA 3O3TA 3AY8A 2DIZA 3LYKA 4E8HA 5IMZA 2H73A 3QR6A 4KUNA 4K7NA 3GTUB 4N0ZA 4OO4A 3M1GA 5ELAA 4WKWA 1A23A 1GTUA 4YQUA 4RUVA 3GURA 4FO5A 5JWOB 3GKXA 4ULXA 2V2GA 2DIYA 5ECKB 1F37A 1T3BA 2H01A 2CVDA 3ZITA 4WXTA 2K18A 2H30A 2X64A 2HRNA 1A2LA 3D5JA 2CZ3A 1XW5A 2L59A 4MZWA 2I9HA 1EEMA 5F05A 1PX7A 3GA4A 4XTSA 2F8FA 4TR3A 3Q6OA 2TRXA 2LRTA 3BBYA 3GYKA 1OYJA 4GCIA 2RUEA 3MWHA 1THXA 5IMAA 4OFTA 1I9DA 1X5CA 5E59A 2LKUA 3WT1A 1OKTA 4ZB9A 2WULA 5DJLA 5DDLA 2NBSA 1B4QA 5JCWA 3VURA 5HR2A 2LTKA 4ML1A 1M99A 4WETA 1ERVA 3IR4A 4NV2A 3GKNA 2LNSA 3L9VA 2OBKA 1U87A 3Q18A 1AW9A 1PKZA 2L6CA 3TUEA 1K3YA 4EC0A 4XHMA 4IN0A 3V1WA 4MPFA 1FB0A 1FOVA 3DWVA 2B5XA 2OA7A 4K1FA 2KP2A 1XVQA 1H75A 2JU5A 1Y25A 4WR4A 5ELGA 3L78A 3EMPA 1ILOA 3QFBC 1K0BA 2J23A 3IAM2 4HU9A 1LJRA 2R37A 4MK3A 3P8WA 2R2JA 2OJLA 1YKCA 2XPEA 3F3RA 1OVNA 1K3OA 3C8EA 4MJAA 3KTBA 4ZBAA 4BVXA 4NHZA 5ECOB 3WGXA 1PKWA 1QFNA 3M9JA 3CMIA 3P2AA 1AXDA 5DQSA 2VLTA 1YEXA 4MZBA 4L5OA 4ECCA 3QOUA 3F3QA 3KD0A 2AUVA 4I8BA 2IJYA 4EDZA 2GSQA 4ZL8A 3DVWA 2C3NA 1RW1A 3ZREA 5DCHA 4DEJA 3ZRDA 2DLXA 2KHPA 2YV9A 1DSBA 2YCDA 2FUG2 2VCQA 1FVKA 3TGZA 4POBA 4XRDA 4LMVA 5JCGA 1G6YA 2TIRA 3GV1A 1J9BA 14GSA 3DD3A 5J4UA 4ILFA 4D73A 2PMTA 4X43A 1TDIA 3DMLA 4HEA2 4POLA 3P7XA 4PQHA 3KZQA 4XIHA 1FG4A 5IOXA 3NOFA 3HVXA 1ZOFA 2ZNMA 4V1Ag 2V6KA 3PGTA 3CTFA 1GL8A 2VAFA 5ABRA 1G7OA 4L5LA 2IMKA 4ZXGA 2VD0A 4XRAA 1O85A 1J0FA 3KGKA 1THOA 2MYGA 1TU8A 2NVLA 5IQYA 1K0NA 3HD5A 1WJKA 5D9TA 5J3RA 4KX4A 3HA9A 2LQQA 4IHUA 2GSSA 3LWAA 4RI6A 1G6WA 1HNCA 4OCFA 2L5LA 3HZ4A 1GH2A 3DGQA 1SL0B 2WDUA 2L4CA 4ISDA 4MLYA 2GT5A 1XIYA 4BPYA 4MH2A 1V58A 2QSIA 3ZL5A 2EIQA 2B3SA 5CREA 3MSZA 3IXRA 4HS1A 2A4VA 1AQWA 4I2UA 1YKAA 2H0HA 1TOFA 5IPHA 1GUKA 1LBKA 1OC3A 3FR3A 1MD4A 5D96A 2YWOA 1TW9A 3HKRA 5EL8A 1OC9A 1SKWB 2C3TA 5A4UA 1M9AA 1VF2A 3RBTA 2DJ1A 2C80A 1WPIA 2RUFA 4EL1A 4FYBA 3TKRA 2EC4A 4V2MA 1YZXA 2IPAA 4TXVA 3ZIJA 1W4VA 4BL7A 2DBCA 4MP4A 4K0GA 1OAZA 4KSOA 3FRCA 4OO5A 4DSQA 2FGXA 4MF6A 5B8AA 5IMVA 4IVFA 3F4SA 2K9FA 2AHEA 1V2AA 4MJBA 2B1KA 2ZUPA 3WT2A 4NXIA 4IJIA 4HZ4A 1UVZA 3A3TA 5DJMA 2VCVA 20GSA 4IKHA 2G0FA 3Q74A 4JU5A 2HFDA 5ECLB 3UAPA 3C73A 2GQLA 2EIRA 4ID0A 3GH9A 2H70A 4JE1A 1Q98A 1EOHA 1GSEA 5CO3A 3DIEA 3CXGA 4Q5RA 1OE7A 2JZRA 3ZZXA 4I2TA 4HU7A 3ZMKA 2HXKA 1XWGA 5C00A 2YJ7A 3L4NA 3CBUA 5IO2A 2IFQB 1TRWA 4JRRA 2FWGA 4JEDA 4YQVA 1A2MA 4DSRA 2B7JA 2DSAA 2RIIA 2OE1A 2HE3A 4IW9A 2H6ZA 1EZKA 1T1VA 3HYPA 2MMAA 3RPNA 3KH9A 4MA9A 1YQ1A 4PNGA 1V57A 4O5RA 3N9JA 3LFLA 2LQOA 3BCIA 4MZCA 2A2RA 4HJMA 1SJIA 2NTOA 2B5EA 4OD7A 3BD2A 13GSA 3KMNA 2GDRA 3W8JA 3EINA 2XPDA 1DE2A 3F8UA 7GSSA 2C1YA 9GSSA 5CRWA 4TVEA 4MJEA 2PU9C 4IJ3A 3H1NA 3HXSA 2K6VA 1K0OA 5G5FA 2HSYA 4N30A 1M0UA 4HQSA 3UARA 4MF7A 1XWBA 2J9HA 5IMCA 5DALA 1GSYA 1ERUA 2CA8A 4KCAA 3DYRA 1TU7A 2H75A 4RI7A 4DSSB 1ACVA 1M2DA 3ME7A 1SJZA 4P3YB 4N10A 5G5EA 4FYUA 2R4VA 3ZLPA 4GSTA 3FZ9A 1TI1A 3KIJA 3ISOA 3LEFA 1SD8A 3TRXA 2WCIA 19GSA 2M46A 1Z7PA 1JZDA 2YP6A 3TJGA 2FWEA 1QK8A 4PUFC 3W8SA 3GH6A 2G2QA 2YPMA 5ECRB 2GVPA 2E7PA 4TKYA 4TXOB 4K7IA 1TI3A 4POKA 2GZPA 3VWUA 4FH8A 3VPTA 4BWQA 4F82A 2GQMA 1F3BA 4XCSA 1FVJA 3KCMA 2K8SA 1JZOA 5G31A 2FA8A 2IMFA 4KCEA 1EWXA 1S3DA 2CVBA 4N11A 4WBJA 2X8GA 2LNTA 1R5PA 4NMUA 3D6IA 1M7TA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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