2RLIA

Solution structure of cu(i) human sco2
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
170
structure length
170
Chain Sequence
SFTGQGDFHLLDHRGRARCKADFRGQWVLMYFGFTHCPDICPDELEKLVQVVRQLEAEPGLPPVQPVFITVDPERDDVEAMARYVQDFHPRLLGLTGSTKQVAQASHSYRVYYNAGPKDEDQDYIVDHSIAIYLLNPDGLFTDYYGRSRSAEQISDSVRRHMAAFRSVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A Structural Characterization of Human SCO2
pubmed doi rcsb
molecule keywords SCO2 protein homolog, mitochondrial
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
total genus 44
structure length 170
sequence length 170
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2rliA00
2AJQB 2CVBA 4MZCA 4HUAA 4WF5A 5LD0A 2MYGA 4YQVA 2VCWA 1LBKA 4I97A 3UJ1A 4X0XA 4EDZA 3WYWA 3DYRA 4POMA 4F9ZA 1R26A 4QL7A 2K8SA 3IR4A 4OCFA 4I6XA 1W4VA 2WS2A 5CRDA 1K0NA 5KN2A 2FWFA 4JRRA 4ACSA 3GRXA 3L9UA 4LMVA 1O8WA 2FGXA 1RK4A 3CSIA 1YDKA 2EIOA 2GSRA 3D22A 2H30A 1KNGA 1ERVA 16GSA 1PL2A 4I8BA 5ECRB 3VPTA 4J57E 2F9SA 3DKSA 1X9SB 3ZVJA 2PU9C 3IK9A 1ZOFA 4TR4A 2FY6A 1OC9B 2N5AA 5B6NA 2TIRA 1YF1A 1X9WB 1XWGA 4TR0A 5D93A 4I2TA 2HLSA 2HSYA 4POLA 4NHZA 6GSUA 4WF4A 1GP1A 4N0ZA 3GSSA 4PQ1A 1HQOA 1EP8A 4KDYA 1OE7A 4KDXA 4IN0A 1PKWA 3GKMA 3DEXA 1ST9A 2FA4A 2YZUA 4G2EA 3RBTA 1ZCPA 5CRWA 4LL1B 1V98A 2R3XA 4MF6A 1CQGA 1G6YA 4XS6A 5FT3A 1ON4A 2K18A 1ILOA 4D73B 4XIHA 2ON5A 2OKAA 1EGOA 5DALB 4TRXA 2JSYA 4ZBAA 2LRCA 6GSVA 3VK9A 1SYRA 2C8UA 5ELGA 1H75A 3F4SA 1YKCA 9GSSA 4JEDA 2IMIA 2JSZA 3WD6A 2H0GA 3ZREA 2CVDA 3GA4A 1O6JA 5JCUA 4HI7A 1XXUA 3H93A 3GHAA 5ECMB 2MBTA 2HYXA 3K8NA 3ZIJA 2OE0A 1QGVA 4NWYA 3PH9A 3UVHA 3ZTLA 4IELA 3QFBC 1GNWA 1AUCA 2H01A 4YAVA 1E6BA 3PINA 4ECJA 4IJIA 1A0RP 5ELAA 5ABRA 2L4CA 2MMNA 3I43A 2GZYA 1YKAA 4NHWA 1MDKA 3WT2A 3TKSC 1XWKA 4NPBA 6GSWA 1T3BA 3GKXA 2CVKA 3EU3A 3IC4A 4HQZA 2CX3A 4HJMA 3UARA 2OA7A 2PUKC 1JLWA 4KW6A 3WGEA 1R5AA 2YJHA 1M2DA 1Z7PA 4WEYA 1VF2A 2YOIA 3GUSA 5D9TA 4L0UA 3UVTA 3QAGA 3I69A 4IVFA 4ZXGA 2PN8A 2YN1A 4NMUA 3HJMA 1SJ6A 5G5FA 1R4WA 3LYPA 6GSTA 2K8VA 4DEJA 3VPQA 2DIYA 2DJ3A 2WGRA 2NTOA 5CNWA 1I5GA 2C80A 2VCVA 1OE8A 3HJPA 1EV4A 4D73A 4EKZA 1BG5A 1YZXA 5DCGA 4TKYA 3HHVA 4O7HA 1V2AA 3Q18A 1K3YA 2REMA 4TN8A 2VIMA 1DSBA 2LSTA 5DALA 2EIRA 2YCDA 1XBSA 1GLPA 5H5QA 3AY8A 2DMLA 3D5JA 2V32A 2PVQA 4E8EA 4GSSA 2N5FA 2P5RA 1ERUA 3EE2A 5J9BA 1XWCA 3A3TA 4X43A 1O73A 1GTBA 4PURA 1THXA 4HZ4A 4KB3A 3VWWA 4JBBA 3F4TA 3APOA 1FG4A 4EO3A 1TJDA 4X1UA 2E0QA 1TU7A 1J08A 2VL3A 5KN0A 2LQQA 3TDGA 4ILFA 3DVWA 1PX6A 1XPVA 3M9KA 5A4VA 2PMTA 5IOXA 1G0TA 3DRNA 2OACA 5DQYA 2VCTA 1G7OA 3H4KA 1XCCA 2YP6A 4FH8A 2WRTA 1XOBA 3EURA 1ML6A 2FHEA 5B8BA 5EVOA 3C8EA 1K0DA 4ZL8A 1Y6EA 4WXTA 3D0ZA 1S3AA 14GSA 3CRTA 1A23A 4YQMA 3M9JA 5IO2A 1SJIA 2B5XA 4OD7A 2B7JA 3G7JA 1TRWA 2JACA 5IPHA 1EOGA 1YEXA 3NZNA 5D73A 4KUNA 6GSYA 1PQNA 2OADA 2VCZA 2X99A 5LNKe 4FIWA 1SL2B 1F6MC 1I9DA 2VL9A 1WJKA 2ES7A 4ZB6A 3GSTA 3FZ4A 3PGTA 3F8UA 1V40A 2VCXA 4MPGA 2L5OA 3WGDA 1KTEA 1XOAA 3RPPA 4K8MA 2P0GA 4FYUA 5HFIA 5DJMA 1U6TA 4F0BA 1GTUA 3LGCA 4MH3A 5DVBA 4GTUA 5HQPA 3FYGA 5IMFA 4OO4A 1TI3A 3KMNA 4NV5A 5D9VA 3LYKA 1TK0B 1ZL9A 1WIKA 4DSRA 4V2LA 1GLQA 1PX7A 1XFLA 5H5RA 3F6FA 1WPIA 4XCSA 4POKA 1Y25A 5F07A 1CQHA 4MJCA 1T7PB 5AN1A 3QOUA 1TRVA 4MJBA 5COHA 3DMLA 4YQUA 1XVQA 3C71A 4XS4A 4K0GA 2B1KA 3FR3A 2B5EA 4ZL7A 3CBUA 2CZ2A 2KP2A 1GSSA 3KD0A 3FRCA 2A4VA 3N9JA 3UIWA 2IMKA 1URMA 4PNFA 4XRDA 3WT1A 5B7CA 3KEBA 3HVSA 2BMXA 1NHYA 2H0IA 2MMZA 4RI7A 2VUPA 4BL7A 4GRFA 4TR1B 4PNGA 4O5RA 2XC2A 2FLSA 3ZRDA 2VM2A 1F37A 3H1NA 1PN9A 4DVCA 1O85A 3HZ8A 2X8GA 5AGYA 3RHBA 2P5QA 5G31A 2E2MA 5GZZB 1ERTA 1DE2A 2V41A 3JCML 4MCUA 2CZ3A 1TDIA 4IQAA 1H4OA 1FVJA 5B6MA 1GUKA 1PGTA 3TOUA 4TW5A 8GSSA 4G9HA 1TRUA 2O7KA 2YNXA 5EPFA 2G2QA 3ZFLA 5HR1A 4OFNA 3GTUB 2DC5A 5ECQB 1A8YA 1IYHA 2WCIA 2VD0A 1RQMA 4KE3A 3KM6A 5IIZA 3CYNA 2L59A 1WMJA 2LQOA 1YF0A 1AXDA 3LG6A 3GH9A 2H6ZA 4K2DA 2GT6A 1B9YC 4ECIA 3MNGA 5CO3A 17GSA 1GSYA 4ML1A 2VLTA 1SK2A 2WFCA 3VI7A 2FCHA 5DJLA 1XIYA 3ZFBA 1HD2A 2VCQA 1QQ2A 2X8HA 3W6GA 1M2AA 2FWEA 5CREA 1SKSB 3DGQA 2LNTA 2PWJA 3ZITA 3F6DA 2KP1A 4WBRD 5FHIA 3UL3A 2IMFA 4V2NA 4LLRA 2AB6A 2GT5A 2LS5A 4OO5A 3UAPA 5C00A 3GNJA 4XHMA 3A5WA 4ML6A 4MMMA 1EOHA 3ZMKA 2HT9A 2XPDA 4NAXA 4O92A 2JZRA 1AW9A 2B5YA 1JHBA 3MWHA 5D96A 4Q5RA 2GDRA 5IPGA 1NHOA 3E0UA 4ZBBA 2XBIA 3F3QA 2F51A 3G7YA 2V1MA 5ECSA 4I2UA 3HD5A 3P8WA 4EL1A 1F3AA 4TR1A 3GX8A 1BEDA 1A2LA 1W89A 4MA9A 3US3A 5J3RA 1LJRA 3D4TA 3BOAA 2MZCA 1AIUA 4LA1A 5IMVA 1A2MA 2WJUA 1BJXA 2KUCA 1OC3A 5IOWA 4KSOA 1GUMA 3ZMLA 3C1SA 3W8SA 2D2ZA 1R7HA 2CV4A 1OKTA 1VRSD 2EC4A 3KIJA 2C3QA 1OAZA 2DJ1A 2CX4A 4Q5NA 1OYJA 4KGIA 1DUGA 3IE3A 3GTUA 4RI6A 5ECNB 1YJ6A 2YZHA 6GSXA 4HU7A 2YWOA 2IPAA 3GH6A 3IXRA 2VL2C 4L8EA 2R6KA 4JE1A 1HNCA 4QQ7A 7GSSA 1YEPA 2O89A 2H1DA 2VOCA 4L0WA 1MTCA 4XRAA 5ECLB 3LFLA 3E3EA 5G1LA 1S3CA 5F06A 4AJ7A 3HDCA 3W8JA 1M7TA 1QXHA 1KBNA 1VF3A 3TJGA 2IL3A 3IK7A 1XW5A 3L0HA 1XW9A 1PL1A 2GQMA 4MH2A 2DBCA 4AGSA 1DBYA 1R5PA 2PERA 2DMMA 5HR2A 2IN3A 3GIXA 4MJEA 1B4PA 1LU4A 2JADA 1ZMAA 4EDYA 3EU4A 4N30A 5GSSA 4IBPA 5EY6A 2E2GA 3BD2A 2KHPA 3SBCA 1TU8A 5CRGA 1TK8B 1THOA 3TB2A 4ZIJA 4OMVA 1F9MA 1FB6A 2HRFA 3IV4A 2C0GA 2R37A 2HZEB 1IYIA 3TJBA 1HNAA 2IMEA 2VLUA 4DSQA 1K0AA 2JZSA 3APQA 2IJYA 1X9MB 1EV9A 2J9HA 2MBSA 4ID0A 1UN2A 1K0BA 2FD3A 1GUHA 4G10A 3N5OA 1SD9A 4MP4A 2RUFA 2YANA 1SKRB 2ON7A 3QD9A 4L5OA 5J5NA 2VAFA 5IM9A 3TCOA 1GNEA 2O87A 2O85A 4CDOA 2OE3A 4F03A 1GTAA 3LORA 3GYKA 5F05A 2RLIA 1SJZA 2H8LA 3TKSA 4HZ2A 2L4QA 2CAIA 4XS1A 3FR9A 1N8JA 1Z6NA 3HCZA 3V1WA 3HJOA 3ERFA 4TR3A 2YV9A 3DXBA 2K6VA 4XS4B 4FO5A 4KSMA 3S9FA 4RQXA 19GSA 5DQSA 3EVIA 2AUVA 1QUWA 3TGZA 1EGRA 1FW1A 1M99A 3IAM2 3FHKA 2QC7A 2H70A 3KJYA 1A2JA 3L9VA 1GRXA 1PA3A 1K0CA 4N10A 1VGLA 4PQIA 5ECIB 1UA5A 4IGJA 5GSTA 3ZVJD 2FA8A 4PXOA 1M9AA 4PQHA 4RQRA 1K3LA 2N5BA 1BYEA 1OKDA 3ME7A 2H19A 3Q74A 5KEJA 1ZYEA 5A4WA 3TRXA 4MJAA 1JZWA 1O8XA 2LTKA 2HXKA 2V6OA 2NVLA 1V9WA 10GSA 3H8QA 1PRXA 1K3OA 1F3BA 3Q19A 3BBYA 3IA1A 1Z6MA 1VF1A 1AC1A 3TKSE 2HZEA 4AF2A 3P7XA 1U3IA 2H6YA 3QFAC 1WP0A 4EC0A 2IMDA 2H72A 2RIIA 5FWGA 2C3TA 4TVEA 4BVXA 3GKNA 1U88A 3BJ5A 2GSTA 2PVOC 1X5DA 2C0DA 3CTGA 5JWRB 1QMVA 3QAWA 4AJ8A 5CAXA 4I5QA 3TJJA 3EC3A 3GX0A 3MDKA 3IBHA 4MK3A 3D21A 5ID2B 4H86A 2CQ9A 1UC7A 3O3TA 1EWXA 3TJKA 1JLVA 2C4JA 3DVXA 5HR0A 1Q98A 3HYPA 4Z7XA 2IIYA 4GSTA 1B48A 4IJ3A 3KMOA 2RM6A 4JR6A 2QGVA 3KP8A 2YWNA 5DAKB 4EE0A 2H1GA 3F3RA 1RW1A 1SK1A 2H1AA 1T4YA 1XWAA 3VLNA 4BPYA 5HR3A 2EIQA 4G19A 5KN1A 2LEGA 4HQSA 1AQWA 5HFKA 4QL9A 3LQ7A 4GQCA 2GSSA 2H0HA 2A2RA 1AAZA 1SU9A 3FZAA 1B8XA 1PD21 3G7IA 2DJJA 3HXSA 4XTSA 3KCMA 2LJKA 5G2ZA 3ZZXA 3APSA 3L9SA 5ECKB 3TOTA 4N11A 3O6TA 5E4WA 4E8HA 5IMCA 4Q5QA 1C72A 3FZ5A 3KH9A 4KCAA 5C04A 3A2VA 1VF4A 1NW2A 4MPFA 4CW9A 1ABAA 2WZ9A 3C1RA 11GSA 4OFTA 4LL4B 3ISOA 1XZOA 2WULA 2R4VA 4GF0A 5JCGA 3D4MA 4LMWA 3TKRA 2R5GA 4HDEA 1PMTA 2NDOA 2LJAA 1Z5YE 4GXZA 3L4NA 1AQVA 2GLRA 5B8AA 1O7UA 2GZPA 4EF0A 2IFQB 2NBSA 4ZB8A 3P90A 5A4UA 5GAPD 2VD1A 5AIVA 3NOFA 1TI1A 4OCEA 1MD3A 4ECBA 1JFUA 5D9XA 4BVYA 2M46A 2R2JA 3EMXA 4WETA 5CRHA 4PUAA 1JZRA 1Z7RA 4HU9A 1M2BA 3GMFA 2WB9A 1OVNA 5ID2A 3KGKA 1TRSA 1B9XC 2F8FA 4F2IA 1BAYA 1XW6A 1EEJA 2JL4A 4GQFA 3LJRA 3KZQA 3EWLA 2TRCP 1GULA 4WBJA 5DAKA 1EP7A 3RHCA 1YY7A 1GL8A 4MF7A 1FB0A 3VI5A 1BQ7A 2FUG2 2GGTA 3GL3A 4ZL9A 3EMPA 1WRYA 1JZOA 4TXVA 2K9FA 2DJ2A 5JWQB 5D9WA 3QPMA 3CSHA 3QCPA 3UBKA 3ERGA 1TTZA 2OBKA 2HFDA 4GWRA 1QK8A 4NV2A 3FK8A 3LXZA 3SWLA 4MLYA 5AISA 1TXXA 3VWVA 3H79A 2BJXA 3C7MA 4OWYA 5J41A 1GH2A 2MMOA 4IP6A 2YWMA 3R2QA 2O8VB 3UOMA 4PX1A 2C0FA 1TKDB 4ZILA 4TOPA 4V1Ap 3QDNA 3GN3A 2X8CA 3FW2A 3UBLA 4J2FA 3ME8A 4FYBA 3LXTA 3KTBA 5ECOB 5EL8A 3TRPA 2VO4A 3CSJA 2WDUA 1USBA 4V1Ag 6GSSA 2IFQA 3QMXA 3I9V2 1NSWA 5G30A 1OC8A 1ZYQB 5F0GA 4MF5A 2DIZA 3D6IA 2ZNMA 3IHQA 2JU5A 3QR6A 2YJ7A 1V58A 5L71A 3J7Yk 2H66A 5D8IA 1WE0A 3GV1A 1Q4JA 3IDVA 1X5EA 4CHSA 5GAND 2YPMA 2C0EA 5DDLA 3DWVA 3VWUA 4EVMA 2H71A 1PSQA 3FEUA 4O32A 5DCHA 4N0VA 1O81A 4IS0A 1TK5B 4KAEA 22GSA 2HI7A 2AYTA 2X64A 3CMIA 2JZTA 4BWSA 1T1VA 1KEBA 4HOJA 3ERWA 1M0UA 3O76A 2L57A 3GKKA 4ZB9A 3U5RE 4F0CA 1AQXA 2L6DA 2B1LA 2J23A 3EYTA 2HSHA 1TOFA 2AHEA 3OR5A 4BWQA 5IMDA 2RUEA 1FO5A 5G1KA 1SK0A 1E2YA 3M1GA 3FZ9A 3VFIA 1S3DA 3VWXA 3M0FA 3EINA 1OC9A 4L5LA 2OJLA 1GSDA 5H5SA 2HNLA 2FNOA 3MSZA 4ISDA 3TKPA 3E9JB 5INYA 1QFNA 2C1YA 5ECPB 4HS1A 3L78A 2MMAA 2GS3A 3ED3A 3GL5A 1FVKA 3IPZA 4RUVA 2DLXA 2GQKA 3A2XA 2F3MA 4IW9A 4K7IA 1EZKA 3MAKA 3RPNA 4F82A 2DJKA 2HZFA 4K0NA 1GSFA 2XBQA 2H76A 4ZBDA 4IHUA 4KA0A 2VL2A 3ZL5A 2LKUA 4WKWA 4WR4A 1ZGNA 2GZZA 2DSAA 1WOUA 1FHEA 3ZYWA 3GURA 1SL1B 2GTUA 1FOVA 2KLXA 12GSA 1GSQA 5LCZA 4KX4A 4MDCA 2ALBA 2LJRA 1T4ZA 2OBIA 3TUEA 1M9BA 2FWHA 4IQ1A 4BA7A 2E7PA 3HY2A 3HKRA 2M72A 4YAPA 3J7Yb 1WWJA 3BCKA 1T00A 2TRXA 2AAWA 4K9ZA 2LRTA 5F8BA 5G5EA 4KH7A 1BX9A 2OE1A 4K7OA 3PR8A 4J56E 1Z9HA 2VLVA 3IRAA 2LUSA 5AIXA 4EUYA 2YV7A 2I1UA 5HFGA 2BTOT 3UEMA 4MZBA 3HVVA 4JR4A 5JCWA 3TKQA 5A5KA 2GQLA 2YWIA 4AJ6A 1A8LA 1SENA 1GSEA 2H74A 3DD3A 2H6XA 1SKWB 4GCIA 4GSNA 4GLTA 2P31A 1HYUA 3KTLA 1TW9A 3VURA 3A2WA 2F8AA 1ZZYA 1K0OA 1YQ1A 2QSIA 1G7EA 5KN3A 3M3MA 4JU5A 1ACVA 5E59A 4ULXA 2I4AA 3BCIA 1MDJA 2L5LA 1HNBA 2HRNA 3FR6A 2GVPA 4DSSB 4K1FA 1X0RA 20GSA 1MDIA 4KNDA 3C73A 5IMAA 1V57A 5JWOB 3DIEA 2C3NA 2LV3A 3LWAA 4Q5FA 4EXJA 2FWGA 3RDWA 1GWCA 2M80A 4TXOB 3QAVA 2CA8A 1JZDA 1GTIA 2H73A 3WGXA 1EEMA 2HE3A 4MABA 1NM3A 4WR5A 1F2EA 2CT6A 3F4RA 1MEKA 3FKFA 1J0FA 3TJFA 2PGTA 1Z3EA 2V2GA 2PBJA 2I9HA 2V6KA 1A24A 3LEFA 2XPEA 1G6WA 4MZWA 4P3YB 3RAZA 4FYCA 2B7KA 1X5CA 5CYYA 3Q6OA 3KP9A 4K6XA 2AV4A 3HZ4A 3LSZA 1FAAA 2KOKA 2VM1A 3ZIVA 3CRUA 2L6CA 2G0FA 1XWBA 3G9BA 1U3AA 2CAQA 2Z9SA 1ERWA 4NXIA 4PUFC 5DBQA 5CP1A 1SL0B 3FY7A 3HA9A 3GFKA 1N2AA 4IKHA 3U6VA 5IMZA 3I6AA 4KCEA 3F63A 5J9CA 2IWTA 2I81A 4OFMA 1K0MA 1J9BA 1B4QA 2NPBA 1DE1A 2B6MA 5ENUA 4V2MA 4IP1A 2LRNA 5IO0A 4HJ2A 3IOSA 1A0FA 2XHFA 13GSA 3CXGA 4POBA 3F0IA 4KDUA 2A2SA 1UVZA 3M8NA 18GSA 1SD8A 3IAS2 2RM5A 3KXOA 4DSSA 5J4UA 4JZQA 4HEA2 3TRQA 5IQYA 3NIVA 1SYXA 2H75A 1XVWA 3ZLPA 1MD4A 1TP9A 4ECCA 1GSUA 2I3YA 4PGTA 3UMAA 3HVXA 2GSQA 2B3SA 1PKZA 2LNSA 4TXOA 2ZCTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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