2RLIA

Solution structure of cu(i) human sco2
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
170
structure length
170
Chain Sequence
SFTGQGDFHLLDHRGRARCKADFRGQWVLMYFGFTHCPDICPDELEKLVQVVRQLEAEPGLPPVQPVFITVDPERDDVEAMARYVQDFHPRLLGLTGSTKQVAQASHSYRVYYNAGPKDEDQDYIVDHSIAIYLLNPDGLFTDYYGRSRSAEQISDSVRRHMAAFRSVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A Structural Characterization of Human SCO2
pubmed doi rcsb
molecule keywords SCO2 protein homolog, mitochondrial
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
total genus 44
structure length 170
sequence length 170
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2rliA00
3TDGA 1XWBA 1B48A 2AB6A 2HYXA 1YKCA 1KNGA 5H5QA 1G6WA 4F82A 1Y6EA 4YAVA 3CXGA 1GNEA 1QQ2A 1TRVA 3D21A 1Z6MA 1XOBA 3Q18A 5G1LA 5DJLA 2GTUA 2FWFA 2A2SA 1JZOA 4LMVA 4OD7A 2FCHA 3ZIJA 1NSWA 3IV4A 3GUSA 4GQCA 4XS4B 3VWUA 5DALB 3ZLPA 3HJMA 3BCKA 4GCIA 4MCUA 2X8GA 1PL2A 3F4RA 5HFKA 5J3RA 3IK7A 3GFKA 2IMKA 4E8HA 2VAFA 1R5PA 2O85A 2XPDA 3L4NA 3FYGA 2ZCTA 4KE3A 5ECLB 5ID2A 2OACA 3CMIA 3UARA 4FIWA 2C80A 1TKDB 4V2MA 1JFUA 1ERUA 1HNAA 3HVSA 3SWLA 2R37A 1YY7A 1JHBA 1JLVA 2OBKA 1A8LA 2NTOA 1DE2A 5IPGA 1K0DA 2C0GA 3G7JA 2VL9A 3QOUA 1X5DA 4WBJA 1AW9A 4FYBA 1U3IA 1WMJA 4WBRD 3ZFBA 1S3AA 2IMFA 2YANA 4RQRA 3FZ5A 1FO5A 3A2VA 3QCPA 2A4VA 1M9BA 1SK1A 1EP7A 4NV5A 2FWEA 2VL2A 1GH2A 1PD21 3CYNA 5IMVA 3UOMA 4V1Ap 1JZWA 12GSA 1MDKA 1Z7RA 2K9FA 1ZYEA 14GSA 2QSIA 6GSSA 5D9TA 1BEDA 3KEBA 1OVNA 3L0HA 1M9AA 5CREA 1B9YC 2KP1A 2YZHA 3FEUA 4TW5A 1Q98A 3PINA 4TOPA 3F6FA 2LRCA 2M46A 3TKSA 1BJXA 3D4MA 4GWRA 4MZCA 1YEPA 3IXRA 3TRPA 4MABA 1T4ZA 2FGXA 1FOVA 3VPTA 1NHOA 3L78A 1A0RP 2C3TA 3KJYA 3GX8A 2VCXA 3ZZXA 2DMMA 2YWMA 1TRSA 2KUCA 2E7PA 2AHEA 3TOUA 4DSQA 4IVFA 3WT2A 4YAPA 2C0FA 2V6OA 3VI5A 1E6BA 2HZFA 1WJKA 3GKMA 3BCIA 3FKFA 2F51A 2OJLA 4MJEA 2YN1A 4YH2A 3EWLA 5B6NA 5JCGA 2I4AA 4BVYA 1R5AA 2VCZA 4JBBA 3TRXA 1M99A 4N11A 5CRGA 4JU5A 3HJPA 1XWKA 1A2LA 3NIVA 1OKDA 3HA9A 1R7HA 2HRFA 3MWHA 2JL4A 2VL2C 4XTSA 2GSTA 5D73A 1OE8A 3H4KA 4K0NA 3H1NA 3IRAA 1EV4A 5JWQB 1X0RA 1ABAA 2WDUA 2V2GA 1T3BA 10GSA 1VF3A 1TI3A 1USBA 4N0ZA 3M9JA 3TKSC 5KN2A 1QK8A 4NPBA 4PXOA 1TRWA 5DCGA 1GSUA 2Z9SA 3QMXA 5ELAA 2IMIA 1DBYA 1GRXA 2LEGA 3GTUA 2ZUPA 2H1GA 1SKRB 1GLQA 1ML6A 2HE3A 1YF1A 5ID2B 2GT5A 4EE0A 4ZL7A 5KN0A 1UC7A 2YJHA 5F05A 3E0UA 1LBKA 1YQ1A 1SL2B 3H93A 3ZREA 3LEFA 1GTUA 1GTBA 2ES7A 5DJMA 3IOSA 3WGXA 4MJBA 1THOA 4G2EA 3S9FA 4WR4A 3GA4A 2X99A 4GRFA 1F3BA 2NPBA 2CX4A 1N2AA 3A3TA 4GF0A 4HDEA 4DSRA 2PU9C 4BWSA 3KM6A 4WF4A 2FUG2 1V98A 4WETA 1SENA 2O8VB 4L5LA 3R2QA 1N8JA 1XW9A 5J5NA 2AJQB 3EYTA 3UVHA 5IMDA 3TRQA 3EURA 1R4WA 3TKSE 5IMZA 5ENUA 17GSA 4ZBDA 1PKWA 1TK5B 2MMOA 1DSBA 4QQ7A 3DVXA 4X1UA 1K0OA 2CZ2A 4MLYA 4KNDA 1O7UA 4I8BA 4PQ1A 2GQMA 4KCAA 1QXHA 1GLPA 2VOCA 4MP4A 1Z9HA 2WB9A 2R6KA 5JCWA 1FVKA 2C0EA 5CRDA 3DD3A 2IFQA 2V1MA 1F9MA 5C00A 2DLXA 4K8MA 1BQ7A 1JZRA 4P3YB 3C1RA 3F8UA 2CX3A 2GGTA 2IPAA 11GSA 5ECRB 2LRNA 1SL0B 1SKSB 3EE2A 3P90A 2GZYA 3VPQA 2CA8A 1W4VA 2H1BA 3H79A 3KIJA 5GAPD 1EEJA 3IAM2 1RK4A 3W8SA 4RUVA 5B8AA 6GSVA 3GSSA 4OCEA 2MMZA 4F9ZA 1OE7A 3NOFA 4IQAA 3GN3A 5G30A 3LWAA 4TXOA 2C8UA 1MD3A 3HY2A 4OMVA 1XBSA 3PH9A 2VD0A 3RBTA 5LD0A 1URMA 5CYYA 3CBUA 1H4OA 2B1LA 4ACSA 4HOJA 4L8EA 3CSHA 1V9WA 2VL3A 3KTBA 5KN1A 1UN2A 2ON7A 3QAWA 2HI7A 2PN8A 2YV9A 5ECMB 1HQOA 1NM3A 2C3QA 2G0FA 6GSWA 4J2FA 2LJRA 4LL4B 2H76A 5DBQA 1EP8A 1ZL9A 4IP1A 3APSA 3ZIVA 4FYUA 3RHBA 1ST9A 2H0GA 2K18A 3GTUB 2C3NA 5F0GA 3FR3A 1SD9A 3W6GA 1F37A 3RPNA 1K0BA 1AQWA 2H66A 4DSSA 3VWWA 22GSA 3LGCA 1EGOA 2FHEA 1XPVA 5FWGA 4ZL9A 5INYA 5JCUA 1OKTA 2LUSA 3TOTA 2HZEA 3ZMLA 4TR1A 5CAXA 4L0WA 1J0FA 5ECOB 19GSA 2MZCA 2F9SA 1XFLA 2FWGA 4WXTA 4PNGA 3WYWA 3APOA 2O89A 3M0FA 4MMMA 4ML6A 5LNKe 2OE0A 4IJIA 5HFIA 4KB3A 4KUNA 1X9SB 4Q5RA 2X64A 3RDWA 4HQZA 1OC3A 3TKQA 5IOWA 3A2WA 3KH7A 5AIXA 4KDXA 4F0CA 3LQ7A 5H5SA 3CTGA 2B3SA 2VLUA 5ECIB 3UBKA 2EIRA 1YZXA 1T1VA 4ZBBA 5G1KA 2GS3A 1SYXA 1G0TA 1I9DA 4E8EA 5DAKA 3KZQA 3C7MA 3N9JA 3F4SA 4WR5A 3DGQA 4KDUA 2TRCP 1OC8A 1RW1A 18GSA 1F6MC 3LSZA 2IFQB 1T7PB 4MDCA 2GQKA 3IA1A 6GSYA 5D9WA 2RM5A 3FRCA 2DSAA 1ZMAA 2VLVA 4K9ZA 4GTUA 1ZZYA 1QGVA 2H6XA 3M9KA 1Z5YE 3IHQA 4NWYA 4LMWA 2H0IA 2KOKA 4NHZA 3EMXA 5IQYA 2PVQA 1Z7PA 5IMFA 4GSTA 1GL8A 1XZOA 4AJ6A 2AV4A 3P7XA 4TR0A 3KXOA 4DVCA 2E2MA 2TRXA 2GDRA 2JSZA 2B5EA 4ISDA 2WGRA 1A8YA 4ZIJA 3FW2A 1X5CA 5E4WA 1T8EB 4N30A 4G10A 2RM6A 4TXOB 3HZ4A 2H6YA 2GVPA 5ELGA 4ILFA 3H8QA 4POLA 1B8XA 3QFBC 2FA8A 2R3XA 2OE1A 3DKSA 3HVXA 6GSTA 3IC4A 5CO3A 1G7OA 3GSTA 5ECKB 4F2IA 3ME8A 3LXTA 4ZILA 1XW5A 4XS6A 4JZQA 1WRYA 4TR4A 1Y25A 1GNWA 3F9UA 2PMTA 4IBPA 3GHAA 5IOXA 4G19A 3P8WA 1PRXA 1GTIA 5GSTA 4KGIA 4QL9A 1TTZA 5AN1A 4LA1A 1MTCA 1SK2A 1GP1A 3F3QA 3M8NA 4DSSB 3GKNA 4JEDA 4AF2A 20GSA 3GH6A 2MBTA 4L0UA 3I69A 1K0NA 3ZMKA 2B5YA 2HZEB 5G5EA 3D4TA 4TR1B 4NMUA 3KMOA 4FO5A 5COHA 4CDOA 1T4YA 1O85A 1EOHA 3TJFA 2GSSA 3EINA 2HSHA 2N5BA 3O76A 1K3YA 1W89A 2HLSA 2V32A 4K7IA 1X9WB 4GXZA 4F03A 3GKXA 4ECJA 3O3TA 1ZYQB 4WEYA 1DUGA 2DJ3A 2LJKA 4GLTA 3TUEA 2H71A 1F3AA 1PX7A 5B8BA 1GTAA 2PVOC 5CNWA 2YOIA 4K2DA 1J08A 16GSA 3GYKA 2YZUA 4ZB9A 4MK3A 1K0AA 4D73A 3F3RA 3DYRA 4ULXA 2LNSA 4AJ7A 2YP6A 5IO2A 5AISA 4MZBA 3QFAC 1SJIA 2ALBA 3RHCA 3ERWA 4HZ2A 3WGDA 3APQA 3C1SA 2VCVA 4V2LA 3GH9A 5DAKB 2RUFA 3L9SA 2HXKA 1U6TA 2O7KA 3CRUA 2X8HA 5A4UA 1TK8B 2LQQA 1GSQA 4HJ2A 4IGJA 1PX6A 1MD4A 4MA9A 3U6VA 1R26A 2AAWA 2PWJA 4IHUA 2L4CA 1M2DA 4Q5QA 3FY7A 1O8XA 3UL3A 4ECBA 4V1Ag 2YPMA 1AQXA 2FY6A 9GSSA 3ME7A 4MF6A 4EXJA 3Q74A 1PA3A 3VURA 1PSQA 1F2EA 5F06A 1TJDA 5B7CA 2LS5A 5DCHA 2H73A 1SYRA 2N5AA 1V57A 2WJUA 4GQFA 4EDZA 3N5OA 2XC2A 4PX1A 2OBIA 3ZTLA 3UEMA 2B5XA 5L71A 1IYHA 2R5GA 1O81A 2GZZA 3DIEA 1PGTA 4K1FA 5J9BA 1NHYA 2DJJA 2RIIA 4HJMA 1UVZA 4AJ8A 3F4TA 1NW2A 4NAXA 4EKZA 2E2GA 1EGRA 4I97A 4HUAA 1U88A 4MF7A 4MPFA 2OADA 2JSYA 4K7NA 3EU3A 3VLNA 2R2JA 1TW9A 5D96A 3KCMA 5FT3A 1GSEA 1SK0A 1PL1A 2H01A 4BL7A 1TRUA 2LTKA 1Z6NA 2VO4A 4GSSA 4I5QA 2CV4A 4OO5A 1FB0A 1SL1B 3J7Yk 3LYPA 2CT6A 4XIHA 1GUHA 1XW6A 2PPTA 3HVVA 3L9VA 1ZGNA 1WWJA 1SJ6A 1SJZA 2GZPA 3DMLA 4K0GA 2CVKA 2F8FA 2FA4A 2IJYA 2L4QA 3I43A 3QAVA 2XHFA 3LXZA 3PR8A 2VD1A 1GSSA 2MMAA 3FR6A 5A5KA 2NDOA 1K3OA 1VF4A 3RAZA 2L5LA 5HR0A 4KH7A 3ZYWA 4KDYA 1I5GA 1HD2A 2FLSA 4EC0A 1AQVA 4XS1A 1WE0A 1ERWA 3W8JA 3LG6A 2KP2A 1B4QA 4KW6A 5G2ZA 2K8VA 4PUFC 5J41A 4EO3A 5AGYA 2IL3A 2H6ZA 2ZNMA 3CTFA 1GSFA 4I2UA 1KTEA 2VUPA 1A0FA 4D73B 3MAKA 5ECQB 1OAZA 4YQMA 3US3A 2D2ZA 1ILOA 3ZRDA 4Q5NA 3MSZA 2CVDA 4G9HA 4YQVA 2JZSA 3F6DA 2LNTA 4NXIA 2K6VA 3P2AA 1LU4A 4DEJA 2QC7A 4I2TA 5D9VA 2HFDA 1QMVA 4O5RA 4ZB8A 1V2AA 4EDYA 3GL5A 2PUKC 2H75A 3KMNA 3QD9A 2B7JA 2I81A 1O73A 5HFGA 1TOFA 2M72A 3LORA 3ERGA 3IR4A 1EWXA 2JU5A 1C72A 2H1DA 2FWHA 1ZCPA 2DJ2A 2OKAA 1AUCA 2MYGA 1VRSD 1VF2A 4KCEA 3I6AA 2C1YA 1TK0B 2FNOA 4TN8A 3TJGA 4ZL8A 2F3MA 5GAND 7GSSA 1EEMA 3FR9A 2V6KA 1FG4A 3MNGA 2YV7A 4KSOA 2K8SA 2H8LA 4NHWA 2B7KA 1YDKA 2WCIA 2H72A 3EC3A 1HNBA 2I3YA 2NVLA 2CVBA 3D0ZA 1V58A 1T00A 1G7EA 1AIUA 5CRHA 5IM9A 3VI7A 1EV9A 2AYTA 2HRNA 2EIOA 3WT1A 4EF0A 5CRWA 4BA7A 2VCTA 1OC9A 1PQNA 3DWVA 3ERFA 3FZ9A 4OFNA 1XVQA 4TRXA 1FHEA 5EVOA 3LFLA 3RPPA 1QFNA 2BJXA 4O32A 4LL1B 1TP9A 5AIVA 1B4PA 3HYPA 2IWTA 5DQYA 1TI1A 2EC4A 3UAPA 3ISOA 2WFCA 4ID0A 2G2QA 4O7HA 5CP1A 3Q6OA 2P31A 3BBYA 2WRTA 2YJ7A 2V41A 3ZVJD 3A2XA 3KD0A 1XWCA 3C73A 2M80A 2LSTA 1XWGA 4PURA 2DJ0A 3GNJA 2VM1A 4CW9A 2H19A 1TU7A 4JE1A 4IN0A 1SKWB 2B1KA 3DRNA 4ZB6A 2E0QA 2P5QA 5IO0A 2DIYA 2H1AA 2EIQA 4FYCA 1EZKA 3DXBA 2REMA 2DMLA 2AUVA 4RI7A 4OCFA 1TXXA 2DC5A 5ABRA 1K0CA 3CRTA 1YKAA 1YF0A 4KA0A 4IQ1A 2DBCA 3L9UA 4MH3A 2IMDA 2NBSA 2DJKA 1SU9A 3WD6A 3JCML 2YWOA 4HEA2 4MPGA 5F8BA 2OA7A 3D22A 4XRAA 1AC1A 4X43A 3TGZA 4V2NA 5G31A 4X0XA 4HU9A 5A4VA 4QL7A 3G7YA 2QGVA 1FW1A 1XIYA 4N10A 1ERTA 3HKRA 5HR1A 4WF5A 2N5FA 4HU7A 3TCOA 4IW9A 4ZBAA 4OWYA 3NZNA 3V1WA 1FVJA 5HQPA 1DE1A 2H74A 1ON4A 3LYKA 1GSDA 1O6JA 5C04A 1TU8A 4HI7A 2VCWA 3IPZA 6GSUA 2VCQA 1PMTA 2RLIA 4HQSA 2KHPA 2L6CA 1BX9A 3DEXA 2L5OA 1KEBA 1WOUA 1ZOFA 1M7TA 2WULA 4KSMA 3QR6A 1THXA 2J9HA 3ZITA 1Z3EA 3KP9A 2CZ3A 2IN3A 1BYEA 1AAZA 1QUWA 3UMAA 2H30A 4LLRA 1TDIA 4HZ4A 1OYJA 2IMEA 4MJAA 4WKWA 3E9JB 2TIRA 2L57A 3EU4A 2LRTA 3FK8A 3TJJA 1S3CA 2DJ1A 3IE3A 1SD8A 1YJ6A 2DIZA 2KLXA 1G6YA 2GT6A 2BMXA 3HXSA 3TJBA 4IJ3A 4IP6A 1PN9A 4K6XA 2VLTA 4XRDA 4TXVA 2JADA 2PBJA 5D93A 1XXUA 3IBHA 1HYUA 3GKKA 1A23A 1A2MA 1PKZA 1OC9B 1K0MA 4OFTA 3BJ5A 1VF1A 1WIKA 1M0UA 1YEXA 5IPHA 2JZTA 4PGTA 5ECSA 4BVXA 3ZL5A 4MH2A 2C0DA 2H0HA 4BWQA 3CSIA 5B6MA 2JZRA 2YNXA 4BPYA 1A2JA 1E2YA 2L6DA 4YQUA 2YWNA 3UJ1A 3UIWA 1XOAA 4EUYA 5ECHB 1XVWA 3BOAA 4POKA 4HS1A 3Q19A 2XBQA 2X8CA 3FZAA 1BAYA 2GSQA 3U5RE 3D6IA 4I6XA 4K7OA 2A2RA 5DVBA 2GSRA 2MMNA 2RUEA 3QPMA 3ZFLA 4H86A 4NV2A 1RQMA 2C4JA 3VK9A 3VWVA 2LKUA 4AGSA 5HR3A 3TKPA 1AXDA 2YWIA 4JRRA 3A5WA 2GQLA 3KP8A 2P5RA 5ECNB 3G7IA 3VWXA 2L59A 2VIMA 1MEKA 1GUKA 1WPIA 3QDNA 2LV3A 2OE3A 1MDIA 3TKRA 1UA5A 4KAEA 1LJRA 4PQIA 3GURA 3GMFA 1X5EA 2O87A 3LJRA 4MJCA 4O92A 1ACVA 4EL1A 1GSYA 4RQXA 2F8AA 1GULA 1VGLA 2FD3A 3KTLA 1O8WA 5A4WA 3GIXA 4ECCA 4Q5FA 4Z7XA 1M2BA 3M1GA 2CAIA 3DVWA 3C8EA 6GSXA 1A24A 5KEJA 4PUAA 8GSSA 3PGTA 1GWCA 4JR4A 1MDJA 4OFMA 5D8IA 3OR5A 1XCCA 2HSYA 1ERVA 4XS4A 3D5JA 2CQ9A 3CSJA 1U3AA 5DALA 2I1UA 5IIZA 3KH9A 13GSA 3I9V2 5JWOB 5F07A 3QAGA 4POBA 4IELA 4KX4A 2YCDA 3F63A 4GSNA 2XBIA 5IMAA 5GSSA 5EPFA 3FZ4A 3TB2A 3UVTA 3EVIA 5E59A 3G9BA 1FB6A 5FHIA 5DQSA 2ON5A 4IS0A 4TKYA 3BD2A 2HNLA 2HT9A 4PNFA 5KN3A 1K3LA 2PERA 1GUMA 5HR2A 2JACA 3HJOA 3SBCA 1J9BA 1KBNA 3GX0A 1V40A 3GV1A 3KGKA 4POMA 3TJKA 3ZVJA 3EMPA 2LQOA 2MBSA 2B6MA 5ECPB 3C71A 5EL8A 3K8NA 4ECIA 2CAQA 1H75A 5J9CA 5D9XA 3IK9A 4J56E 5H5RA 3VFIA 4JR6A 1EOGA 4IKHA 4XCSA 2WS2A 4OO4A 2QKEA 3FHKA 3E3EA 2H70A 4FH8A 5G5FA 1CQHA 3HCZA 3F0IA 1WP0A 2BTOT 2GLRA 2WZ9A 1JLWA 3WGEA 1M2AA 3O6TA 1B9XC 4ML1A 2R4VA 3HZ8A 4N0VA 3ED3A 2VM2A 5J4UA 4RI6A 1Q4JA 4TVEA 1HNCA 3HHVA 2P0GA 2J23A 5GZZB 2I9HA 3HDCA 3IDVA 4TR3A 4ZXGA 1FAAA 4CHSA 5DDLA 5JWRB 5IMCA 3MDKA 4L5OA 5LCZA 3UBLA 3M3MA 2IIYA 3GL3A 3GRXA 1JZDA 3AY8A 1XWAA 2PGTA 1S3DA 1X9MB 3J7Yb 4J57E 3HD5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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