2IMEA

2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase: a kappa class glutathione-s-transferase from pseudomonas putida
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
203
structure length
203
Chain Sequence
MIVDFYFDFLSPFSYLANQRLSKLAQDYGLTIRYNAIDLARVKIAIGNVGPSNRDLKVKLDYLKVDLQRWAQLYGIPLVFPANYNSRRMNIGFYYSGAEAQAAAYVNVVFNAVWGEGIAPDLESLPALVSEKLGWDRSAFEHFLSSNAATERYDEQTHAAIERKVFGVPTMFLGDEMWWGNDRLFMLESAMGRLCRQNADLSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase
publication title 2-Hydroxychromene-2-carboxylic Acid Isomerase: A Kappa Class Glutathione Transferase from Pseudomonas putida
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas putida
molecule tags Transferase
total genus 79
structure length 203
sequence length 203
ec nomenclature ec 5.99.1.4: 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase.
pdb deposition date 2006-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2imeA00
1Z5YE 4TXOB 1M7TA 1A8YA 1TI1A 1S3DA 2HSHA 3LSZA 3QMXA 4FYBA 2H30A 4TR3A 3TKRA 1R7HA 1GSSA 1OC8A 8GSSA 4L5LA 2QKEA 1GSUA 4JEDA 3TJBA 2L5OA 4IN0A 4YAPA 2R37A 4F2IA 2VOCA 4EXJA 3DYRA 2H0GA 18GSA 2X8HA 2B5EA 1X9MB 2VCXA 1GTBA 3D21A 2A2RA 3TDGA 2KHPA 3HHVA 1HNCA 2B5YA 1F6MC 2D2ZA 4OFMA 3GSSA 1QMVA 2H1AA 3VI5A 3GKXA 1IYHA 4IKHA 4XS6A 2L4QA 3KGKA 4NV2A 5CO3A 2OA7A 2HRFA 2PMTA 4MPFA 1PRXA 4PGTA 3VPQA 1URMA 5FWGA 5INYA 3DXBA 3KZQA 1CQHA 2VCQA 5ECPB 2LS5A 1THOA 1ABAA 1WPIA 3UBKA 7GSSA 1XVWA 5DALA 3KH9A 2HZEA 1J9BA 3VWXA 4X1UA 2DJ2A 3TRQA 3LXZA 2OKAA 5J41A 2WZ9A 5ECIB 1B4QA 2VL3A 3TKSE 3L9UA 4QQ7A 4XS4B 5IIZA 5JWQB 1EV4A 4EUYA 4ZB6A 2LV3A 2JL4A 3ISOA 1A0FA 4YQMA 1M2DA 2KP1A 2L5LA 3IC4A 5CNWA 2NPBA 5IQYA 1JZOA 10GSA 1LBKA 1W89A 3TRXA 4XIHA 3ME7A 1OAZA 1ZGNA 4O32A 2VAFA 1X5CA 4V2LA 1PD21 1N2AA 4WR4A 1T8EB 2DBCA 5CRHA 3KM6A 4KB3A 4J2FA 2F9SA 1AQXA 2H8LA 1A0RP 5IMDA 4MZBA 2C8UA 5IPGA 4IS0A 2I1UA 1GNEA 3RDWA 3G7YA 1FOVA 2O89A 4PXOA 3HJMA 5HR2A 5COHA 3ZIJA 5CREA 5G30A 1SL1B 5DAKB 1SU9A 4O5RA 5CAXA 4IJIA 3UARA 3HYPA 4F82A 4RUVA 2YN1A 3C7MA 2FWFA 2H19A 1SJIA 1EP7A 2ZUPA 3EVIA 4FYCA 1WRYA 19GSA 3EURA 1GP1A 2RUEA 4JU5A 3ED3A 5D73A 1MDJA 5IMZA 3A2VA 2PUKC 3ZLPA 3WT2A 2LUSA 5DJLA 2EIRA 3FZ5A 4G19A 3G7IA 2KUCA 4MJBA 1BAYA 4F0BA 2LEGA 1YDKA 5IMAA 1M9AA 3WYWA 2DJKA 2WDUA 2VL2A 1KTEA 4TRXA 2C0FA 3EMXA 2VCVA 3TOTA 4Q5NA 3UVHA 1UN2A 1Y6EA 2C80A 1V40A 1U87A 3CYNA 2DJ1A 3GX8A 3QDNA 1A2LA 3ZVJD 2GT6A 1OYJA 5B8AA 2LRCA 1BQ7A 1AW9A 4TXOA 4BA7A 5HR0A 1QGVA 4IQ1A 2NBSA 1FAAA 5H5RA 1TRVA 2PN8A 3PH9A 3L0HA 1DUGA 4JZQA 2B6MA 4ZILA 4WR5A 1FVJA 3FR6A 1E2YA 1VRSD 2IMKA 2CVBA 3TGZA 4L5OA 2H0IA 4JR4A 5A4UA 2IN3A 2V32A 4WEYA 3ZREA 1XWKA 1I9DA 2AYTA 1EGOA 1X5DA 4ZL9A 1NHYA 2FA4A 3F6DA 3UL3A 4ECIA 5AGYA 2DSAA 1XXUA 3TKSC 4G2EA 2K18A 3IHQA 1ST9A 3GH6A 3QD9A 2LJAA 2HI7A 4NHWA 3EYTA 1F2EA 3LGCA 1NW2A 1VF2A 4IGJA 3LYKA 3MWHA 1H4OA 3U6VA 3ERWA 5GSTA 1EWXA 2H6XA 3LEFA 4WKWA 4NXIA 2VIMA 3KP9A 2YPMA 4KA0A 1YJ6A 4XS4A 5JWRB 3EINA 4LL4B 4P3YB 1BG5A 3ERFA 3CBUA 1TU8A 4H86A 4LMVA 5B8BA 2RM6A 1V58A 1A2MA 4CW9A 5LCZA 3CMIA 3LG6A 3UIWA 1SJ6A 3P90A 4ZL7A 4NPBA 1XOBA 2O7KA 3CSHA 2GZYA 3D4MA 3M0FA 2FWHA 1HNAA 4NHZA 2F8AA 2FGXA 3HA9A 2WCIA 3S9FA 4CHSA 5AIXA 1WJKA 1AQVA 4HOJA 4I5QA 4PUFC 4F9ZA 4D73B 1TI3A 5G5EA 1FO5A 4V1Ag 2R4VA 3N5OA 4HU7A 1SKRB 1YEXA 5IMCA 1R5PA 5F06A 2BTOT 3HKRA 3ZMKA 2PU9C 1R5AA 5LNKe 5DAKA 4JRRA 3EMPA 3U5RE 2RLIA 3GUSA 3PINA 1YKAA 5IOWA 2K8VA 5GAPD 2VCTA 1TP9A 2F51A 3VURA 2OE0A 3FRCA 1GSYA 1KBNA 3L4NA 2GDRA 2ON5A 3GKMA 1TDIA 4ULXA 1YZXA 4HDEA 3F4SA 1SYRA 3I69A 6GSTA 4L0WA 1VF4A 3MAKA 5HFKA 1B9XC 3M9JA 5ABRA 3ZRDA 1F9MA 1G0TA 1JZRA 2H71A 1AXDA 1B4PA 3WGXA 4GF0A 2IMFA 1K0MA 2A2SA 1J0FA 3H8QA 1GUKA 2YZUA 3CRUA 3QAVA 1TRUA 1O8WA 2DMMA 3TJFA 3HY2A 1XCCA 1EEJA 2YCDA 2X64A 5D9WA 4I8BA 2P5RA 4GTUA 2CAQA 2GT5A 2X99A 4HJMA 4I2UA 1JZDA 1EZKA 1EGRA 3E3EA 5LD0A 4HI7A 4KUNA 3K8NA 4OCEA 1WOUA 4AJ6A 2R6KA 2GLRA 2C4JA 4RI7A 5AN1A 2OBKA 4IW9A 3QAWA 3FY7A 4GSTA 2YZHA 3PGTA 4F03A 2XBIA 4TVEA 4BPYA 4E8HA 2LKUA 22GSA 1EV9A 4POKA 4EO3A 4OO5A 4I2TA 1QUWA 4I6XA 2GSSA 4IP6A 1DE1A 1VF3A 3IA1A 2AB6A 1XBSA 3IV4A 3LORA 1K0BA 5ECKB 4TR1B 1OC3A 3QAGA 4GLTA 4MA9A 3M1GA 3QOUA 1N8JA 2AV4A 5CYYA 3ZL5A 4RQXA 3P8WA 4BL7A 3NIVA 2HYXA 2DJ0A 2XPDA 4Z7XA 3TJKA 3FW2A 4GCIA 2GGTA 5D8IA 1THXA 2GZZA 1R4WA 1TK8B 1FB0A 3VWVA 1SKWB 2MMNA 3GURA 1RK4A 2Z9SA 1PN9A 4PQIA 3C73A 3EU3A 5DJMA 5DDLA 3TJGA 4HS1A 4XHMA 4MZCA 1T7PB 2R5GA 1GL8A 5JWOB 2M46A 3QFBC 4KAEA 2CX3A 1VF1A 6GSSA 1ERTA 1KNGA 2HXKA 5KN0A 1JHBA 1QXHA 2DC5A 4LA1A 1X5EA 3CRTA 5G1KA 4GQFA 2CT6A 1AUCA 2V6OA 4IELA 3APSA 1M99A 2K6VA 5KEJA 2JADA 2B7KA 1IYIA 3J7Yb 1SKSB 2DJJA 3FEUA 4IHUA 5J3RA 1MD3A 3C1SA 3DVWA 3LQ7A 1SD8A 1Z3EA 2E0QA 4O7HA 4JR6A 3UEMA 5HFGA 1V98A 1MEKA 1TOFA 4D73A 2PERA 4K8MA 1AIUA 2F8FA 4EDZA 1Z9HA 2M72A 4QL9A 5IPHA 4HJ2A 1XZOA 5F8BA 1DSBA 5G2ZA 1I5GA 2FD3A 2CAIA 4NV5A 1SL2B 5ECNB 2IPAA 3D5JA 2H1DA 4MF5A 1ERUA 1GLQA 2YWMA 2YWIA 2BMXA 2MMAA 4WBJA 4LMWA 3LFLA 2GSQA 2MBSA 3GYKA 4KX4A 3TKPA 4ECCA 3GHAA 4PX1A 1FB6A 2VD1A 5C00A 5J9BA 4IVFA 1FHEA 3ZFLA 2JSYA 2AAWA 4KDUA 3WGDA 5GSSA 4MJEA 1ZMAA 3BJ5A 1LJRA 4KH7A 2YV7A 3KJYA 3NOFA 2C0EA 2LQQA 5EL8A 6GSYA 3ZYWA 5ELGA 3DGQA 1B8XA 2X8GA 5DBQA 14GSA 4NAXA 4ML1A 1UC7A 3M8NA 4MH2A 1QQ2A 1YF1A 1GUMA 1HYUA 1O81A 2IIYA 1ZYQB 2LJRA 4YH2A 2H01A 3F63A 3QCPA 2EIOA 3RPNA 3HVXA 5H5QA 4WBRD 1M0UA 2OACA 1OC9B 1S3CA 4K0NA 4MH3A 1SK1A 2DMLA 4AJ7A 4IP1A 1Y25A 2M80A 4TKYA 2L57A 1K3YA 2E2GA 3BD2A 2V6KA 2GQMA 5H5SA 2B3SA 2L6CA 5ELAA 4GXZA 2LRTA 4TR1A 4ACSA 4OMVA 2YJHA 3IK7A 2YV9A 5FHIA 3D6IA 3KMNA 1TRWA 2ES7A 3O76A 1XOAA 5G5FA 1K0DA 2HNLA 4XS1A 1JZWA 1GTIA 5FT3A 1Q98A 3BOAA 1TJDA 1ZOFA 3FKFA 2CQ9A 2P5QA 3MNGA 1DE2A 1ERWA 3ZZXA 4ILFA 3H93A 1O85A 3C71A 5AISA 3ZITA 3GRXA 1U88A 4N0VA 3MSZA 1T4YA 4PUAA 3CXGA 3IE3A 3F4RA 5DQSA 3FR3A 2HFDA 3GH9A 3IDVA 2LNSA 1MTCA 2B1KA 4V2MA 3GSTA 4KSMA 20GSA 1NSWA 1GLPA 4YQUA 2CZ3A 1SK0A 4KDYA 1GH2A 2E7PA 4Q5FA 3GKKA 1XIYA 5ENUA 4ZIJA 2CVDA 3LJRA 4CDOA 1HD2A 1PQNA 1PX7A 1UVZA 4HQZA 3Q19A 3C8EA 1SD9A 2B5XA 1F37A 2AUVA 2XBQA 3H1NA 4K2DA 4FH8A 4MABA 1M9BA 3UOMA 4POLA 1TK0B 1GNWA 2ALBA 1J08A 2I3YA 1U3AA 3CSIA 4V1Ap 3VK9A 2HRNA 5GAND 5D9XA 4RQRA 2OE3A 3FZ4A 2IMDA 1O8XA 3O6TA 2FHEA 5D93A 1XWBA 2J23A 2IJYA 2FCHA 1NHOA 4MPGA 4J57E 3FK8A 2FA8A 4DVCA 2L6DA 3TOUA 1AQWA 3IRAA 5ECLB 2I4AA 5E59A 1GSQA 2H66A 2WS2A 2HSYA 3DEXA 2G2QA 5IOXA 4DSQA 4NWYA 3MDKA 11GSA 3EC3A 5DQYA 5E4WA 1S3AA 2FY6A 5JCGA 4ML6A 5J5NA 3FHKA 1SYXA 4ZB9A 5KN3A 4Q5RA 3J7Yk 5IO0A 1VGLA 2N5FA 4HU9A 3W8SA 5DCHA 4N0ZA 1XW6A 2GVPA 1ZZYA 3F0IA 4NMUA 3APOA 4HUAA 3DIEA 1M2AA 4RI6A 4ZXGA 2XHFA 1X0RA 2CVKA 1TW9A 5A4WA 3GX0A 3IPZA 4BVXA 2H6ZA 1XWGA 2C3QA 4MP4A 3VPTA 3GIXA 1HQOA 3GL3A 3IBHA 2FWGA 1RW1A 2YJ7A 3GV1A 3M9KA 4K7IA 1G7OA 1CQGA 3PR8A 4KGIA 2REMA 1XWCA 2C3TA 2CZ2A 2HLSA 2ZNMA 3GL5A 1WE0A 2ZCTA 1KEBA 3KXOA 2F3MA 4PNFA 2HE3A 2PWJA 3TKSA 5A5KA 1K0CA 1GWCA 4IJ3A 1T00A 4K9ZA 1H75A 2QGVA 3ZMLA 1GSEA 1FG4A 3D22A 2CA8A 4MCUA 1PL1A 4KCAA 2N5AA 4FO5A 4XTSA 1YKCA 4X43A 2J9HA 2PVQA 4TW5A 3F3RA 2AJQB 1WWJA 2PPTA 2LSTA 5ECOB 4EF0A 2WULA 2C0GA 3UMAA 1G6YA 1PA3A 4KW6A 1X9WB 2KOKA 3KMOA 1HNBA 1OC9A 2TRCP 3EWLA 2H76A 1ML6A 4MF7A 2VLUA 2YWOA 1JFUA 2AHEA 1B48A 2B7JA 4QL7A 3KTBA 3AY8A 3IAM2 4MK3A 1RQMA 4AGSA 3IK9A 4BWQA 2JZRA 5C04A 1ILOA 1JLVA 3IOSA 3L78A 6GSUA 3EE2A 4KE3A 4PQ1A 5ECSA 2IMEA 3ZFBA 5L71A 4HQSA 1AC1A 4OD7A 1ZL9A 1YQ1A 1B9YC 1K0AA 5G1LA 1QK8A 4PQHA 1XPVA 2WRTA 4X0XA 1WIKA 2OBIA 4AJ8A 3M3MA 4ZBAA 2WJUA 17GSA 2P0GA 2GSTA 2YP6A 1T1VA 4FIWA 4OFNA 1GUHA 5AIVA 5HQPA 1PGTA 1WMJA 1XFLA 2QC7A 2VCZA 4XRDA 3QR6A 3I9V2 1OKDA 1U6TA 2GQLA 1Z6MA 4ID0A 1TU7A 5HFIA 2OE1A 3CSJA 2MMOA 4K1FA 4YAVA 3US3A 3HD5A 2FUG2 4POMA 1QFNA 2E2MA 2H1BA 1TRSA 1X9SB 4ZBBA 3UJ1A 1T4ZA 1YEPA 2H75A 2LTKA 3CTGA 3OR5A 5EVOA 3F3QA 1U3IA 2WGRA 2GS3A 3HZ4A 2H6YA 2RIIA 5J4UA 3WD6A 1GSDA 4L0UA 3KP8A 5B7CA 4MLYA 1SJZA 3TKQA 1ERVA 1A23A 3WGEA 3DWVA 4GWRA 5KN1A 2NTOA 2XPEA 2VL2C 1BEDA 4GQCA 1BJXA 3DRNA 4EVMA 9GSSA 1E6BA 1M2BA 16GSA 1EEMA 1PSQA 5B6NA 2O85A 4G10A 3TUEA 2NVLA 3DKSA 1FVKA 1OVNA 4V2NA 4KNDA 2KLXA 3APQA 1G7EA 4OWYA 2OADA 2C1YA 3KIJA 5GZZB 3D4TA 4IQAA 3HZ8A 5HR1A 3FZ9A 2YANA 1GSFA 2VD0A 3TRPA 2V1MA 3RBTA 2PVOC 3I43A 5F07A 2VLVA 2IWTA 2JU5A 4DSSB 5J9CA 3G9BA 2GZPA 4TOPA 4G9HA 3GN3A 2QSIA 5ECQB 5HR3A 2RM5A 2I9HA 4TXVA 3FYGA 3HJOA 4L8EA 1BX9A 4BWSA 3R2QA 3W8JA 2N5BA 1A8LA 2DIZA 5ID2B 3L9SA 3KEBA 4EC0A 4GSSA 4XCSA 4ECBA 3F6FA 2GSRA 2VLTA 3VWUA 3BCIA 4LLRA 1TXXA 4JE1A 1R26A 1Z6NA 2XC2A 2V41A 2YOIA 3VI7A 6GSXA 4F0CA 4ZB8A 2B1LA 2LRNA 2VM2A 3GMFA 3I6AA 2H73A 2TRXA 2RUFA 4N10A 6GSVA 1OKTA 4ECJA 2H70A 5EPFA 1YF0A 2G0FA 2MMZA 4DEJA 5KN2A 1GTAA 3HXSA 1XW9A 4LL1B 2C3NA 4DSRA 4WF4A 1XW5A 1F3AA 4KSOA 3IR4A 3BBYA 2WFCA 4PNGA 2GQKA 3ZIVA 1V2AA 4MJAA 2KP2A 2L59A 2VM1A 2CV4A 4TN8A 3A2WA 3LWAA 3IXRA 4K6XA 4I97A 3CTFA 1AAZA 3L9VA 1EOHA 2FWEA 3H79A 4N30A 2IFQB 4BVYA 3V1WA 3FR9A 2I81A 4MMMA 2DJ3A 1O6JA 4XRAA 3RPPA 3W6GA 3Q18A 2A4VA 3IAS2 3SBCA 5EY6A 3HVSA 3QPMA 1O7UA 3GTUB 1SENA 6GSWA 4PURA 1TTZA 1O73A 2X8CA 4GSNA 2MZCA 1MDKA 3H4KA 3GFKA 1W4VA 3RAZA 1GRXA 5ECHB 1ACVA 4POBA 4JBBA 1OE8A 3BCKA 4EL1A 3A5WA 3SWLA 3GNJA 2WB9A 3LYPA 2HT9A 2P31A 1JLWA 3NZNA 1K0OA 4EE0A 1Z7PA 2VUPA 1G6WA 2LNTA 1A24A 1YY7A 4MDCA 1TKDB 1WP0A 4EDYA 3VFIA 3HJPA 5CRDA 3F8UA 3Q6OA 1A2JA 4WETA 4WXTA 3GA4A 2C0DA 5D9TA 3VLNA 13GSA 4FYUA 3A2XA 1UA5A 4ISDA 4GRFA 3ZTLA 1K3LA 3UVTA 3UAPA 4O92A 4OO4A 2H72A 5ECRB 3Q74A 1MDIA 2VL9A 3RHCA 1XVQA 2NDOA 1K0NA 2HZFA 2PGTA 4MZWA 3ME8A 4WF5A 2O87A 5ECMB 1GTUA 1PMTA 4MF6A 5IMVA 2DIYA 5CP1A 1GULA 3GKNA 4Q5QA 4ZL8A 2K8SA 3C1RA 12GSA 2R2JA 4DSSA 4HZ2A 3TCOA 5DALB 1Q4JA 2HZEB 5D9VA 4OFTA 5B6MA 5JCUA 3LXTA 2K9FA 2VCWA 1EOGA 3KCMA 1FW1A 2IL3A 1PKZA 2ON7A 2LQOA 3N9JA 1XWAA 4HEA2 3F4TA 5ID2A 3UBLA 2H1GA 3QFAC 5DVBA 3HCZA 4TR0A 1V9WA 1T3BA 1V57A 3FZAA 3D0ZA 1PKWA 3JCML 1EP8A 1ZCPA 3DD3A 2TIRA 3TJJA 3F9UA 4KDXA 2DLXA 2PBJA 1F3BA 4J56E 2YWNA 2MYGA 1TK5B 2H74A 1ZYEA 4K7NA 3ZVJA 1SK2A 3KD0A 4HZ4A 4YQVA 3DVXA 2IMIA 4OCFA 5DCGA 3HVVA 3E0UA 2JZSA 1MD4A 2V2GA 3HDCA 5JCWA 4IBPA 5IM9A 1K3OA 2MBTA 5IMFA 5G31A 1SL0B 2O8VB 1PL2A 3RHBA 4ZBDA 2YNXA 1NM3A 2VO4A 2OJLA 1LU4A 3VWWA 2IFQA 2EIQA 3E9JB 5IO2A 4TR4A 5F05A 3P7XA 3KH7A 3KTLA 2LJKA 5CRGA 2GTUA 3ERGA 2BJXA 3GTUA 2L4CA 5D96A 2CX4A 3EU4A 3P2AA 2JZTA 5A4VA 4K7OA 1ON4A 2H0HA 1USBA 2JACA 3DMLA 2JSZA 2R3XA 2FNOA 4N11A 1C72A 1BYEA 1DBYA 3A3TA 4EKZA 2EC4A 4MJCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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