2IMEA

2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase: a kappa class glutathione-s-transferase from pseudomonas putida
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
203
structure length
203
Chain Sequence
MIVDFYFDFLSPFSYLANQRLSKLAQDYGLTIRYNAIDLARVKIAIGNVGPSNRDLKVKLDYLKVDLQRWAQLYGIPLVFPANYNSRRMNIGFYYSGAEAQAAAYVNVVFNAVWGEGIAPDLESLPALVSEKLGWDRSAFEHFLSSNAATERYDEQTHAAIERKVFGVPTMFLGDEMWWGNDRLFMLESAMGRLCRQNADLSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title 2-Hydroxychromene-2-carboxylic Acid Isomerase: A Kappa Class Glutathione Transferase from Pseudomonas putida
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Pseudomonas putida
molecule keywords 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase
total genus 79
structure length 203
sequence length 203
ec nomenclature ec 5.99.1.4: 2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase.
pdb deposition date 2006-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2imeA00
2FA8A 3EURA 2HI7A 3KZQA 2DBCA 3HHVA 2C4JA 5GZZB 1LBKA 5CP1A 5IM9A 4XS4A 1VRSD 3I69A 3HJMA 2OACA 3GV1A 2YWOA 2VOCA 3H79A 3FR6A 2B3SA 3TJFA 4KSMA 3EMPA 1A24A 1TJDA 1MD4A 2VUPA 1EOGA 1S3DA 3PINA 1GLPA 3ERFA 2K8SA 4JBBA 4ZILA 1FVJA 1JHBA 2A2RA 3ZITA 4X0XA 3C1RA 4OO4A 4PQHA 1E2YA 4H86A 4TRXA 3NIVA 4YAPA 5HR2A 5FT3A 3FZ4A 3E0UA 3GRXA 4HZ4A 4EE0A 2OE0A 3QAVA 3EU3A 2PGTA 1M2AA 2C0DA 4MCUA 3VWVA 1AXDA 2MYGA 1SYRA 4OFNA 1Y25A 3IXRA 3FKFA 4J2FA 1ZGNA 2B7JA 3N9JA 19GSA 2LQQA 3VFIA 2L6CA 2V2GA 1XWCA 3M1GA 1PMTA 1YKCA 2N5FA 5ECLB 3BBYA 1O85A 2LS5A 6GSVA 2B6MA 3EINA 2CZ2A 1GTAA 2YV7A 4AJ6A 1SENA 1U3IA 1U6TA 1DSBA 5IMFA 2GT5A 5C00A 2YZUA 2GLRA 4JZQA 4KUNA 2B1LA 3UMAA 1V98A 2LJRA 4TR3A 4WXTA 1TTZA 3UOMA 4K0NA 5ID2B 3H93A 1XXUA 2GDRA 1SKSB 1GUMA 3F4SA 1SK2A 2OA7A 1GUHA 3MSZA 4EF0A 2VCZA 1R7HA 1ACVA 1GSEA 2FGXA 2VL3A 4G19A 4J56E 3HZ8A 4IQAA 2VCQA 4ML6A 3TDGA 2YANA 3GH6A 1SJZA 3KP9A 3H8QA 1EP8A 2TRCP 8GSSA 4MDCA 1NSWA 3KXOA 5G5FA 1XW6A 1K0BA 5CRGA 2F8AA 1YEXA 4OMVA 1XVQA 1GTIA 4G2EA 2CV4A 5B8BA 1TXXA 1WPIA 3GNJA 1ML6A 2I81A 3TB2A 1C72A 2LNTA 3GFKA 3TJKA 2LNSA 4TN8A 1TRUA 4IGJA 1X5EA 2YCDA 1ZYEA 1HNCA 5DAKA 1ILOA 3O6TA 4IN0A 2E0QA 20GSA 1GTBA 1TI1A 4N11A 5D93A 2DIZA 2NBSA 1FW1A 5G2ZA 4IP6A 1KEBA 2BJXA 3J7Yb 3FHKA 4TXVA 2H0HA 4DSQA 4I8BA 5D9XA 2X8GA 2E7PA 1YQ1A 2I9HA 1EEJA 4EKZA 3HY2A 1V9WA 4K2DA 3TKSE 1GTUA 3D6IA 5ECRB 3IK7A 3F4TA 2LV3A 3DVXA 3CSJA 4ML1A 1TU7A 4K0GA 1RW1A 4IS0A 1FVKA 1A8LA 1PSQA 1AW9A 1XCCA 3BOAA 3LJRA 4TOPA 4TR4A 5DJLA 2JSZA 3SWLA 5G30A 3G7JA 4G10A 5IO2A 2VM1A 4L5OA 4I6XA 2YWNA 4MZCA 3GKXA 1AC1A 3WT1A 2QC7A 1UA5A 3TRQA 1NHYA 1K3YA 2VM2A 4F0CA 1PGTA 4GWRA 1GUKA 5HFGA 1I5GA 3Q19A 2FWEA 4HU9A 4Q5NA 5D9VA 5IPGA 3TUEA 1ERUA 1PKZA 3DIEA 4GLTA 4NHZA 2JZRA 3UBLA 1PL1A 2J9HA 4GTUA 1VF2A 2IIYA 3W8JA 1R4WA 5B6MA 5IOWA 1A0RP 3QAWA 2B5YA 4L8EA 5CAXA 4F9ZA 4V1Ag 3RBTA 3KMOA 2HZEA 1XOAA 3C8EA 3PR8A 4MP4A 3GN3A 5J9CA 2HYXA 1XOBA 2IMIA 2IN3A 2BTOT 2H6YA 1RK4A 2P31A 5B8AA 1SL0B 4F0BA 3DXBA 2FWGA 4KDXA 4WEYA 2C3QA 3GHAA 1UC7A 2GZYA 1MD3A 1DE1A 2IMKA 6GSWA 3F9UA 1GSDA 2H1DA 2HLSA 1BEDA 2JZTA 2RIIA 3VURA 3RDWA 4DSSA 3J7Yk 3FRCA 5DALB 2C8UA 3FR9A 4V2LA 4WR4A 5JCWA 2IMFA 5A4UA 3Q74A 4EDZA 2EIRA 3KEBA 2IFQA 1M7TA 1YF1A 1ERWA 1TW9A 5CYYA 2YOIA 3D4MA 2B5EA 1EGRA 5IOXA 2ALBA 2F9SA 3CBUA 4X43A 2IPAA 3M3MA 4HEA2 5LNKe 3VI5A 3WD6A 2TIRA 4IQ1A 4ECCA 1T3BA 2MMZA 4NPBA 2X8HA 4GF0A 4POKA 4XS1A 2NDOA 3WGDA 4WKWA 4ECIA 3G7YA 4GXZA 2H76A 1B48A 2HT9A 3GKNA 3KGKA 1SJIA 4XRAA 3ZMKA 5A4VA 2DJKA 4O32A 3F6FA 3LXTA 2VL2C 1MDIA 3IC4A 1VF1A 1PKWA 5JWOB 1ZZYA 5J3RA 4XS4B 1THXA 5CRHA 5DQYA 2MBTA 2P0GA 2O87A 1GL8A 1T8EB 1F3BA 2WULA 4PGTA 3QOUA 2V1MA 2V32A 1TK0B 2JL4A 3IHQA 2CT6A 2GGTA 3ERWA 1YJ6A 3GKMA 3A2WA 3MNGA 4KH7A 1U88A 1WE0A 3FYGA 5J41A 3GX8A 2PN8A 4TR1B 5DCGA 5F05A 5A5KA 1K0NA 5KN1A 4D73B 4ZL9A 3HJPA 1USBA 2CA8A 3IOSA 1LU4A 1BX9A 1XW5A 1PX7A 1V58A 4ID0A 4GSSA 4HQZA 3IPZA 2H6ZA 2RUEA 4Z7XA 3G7IA 1SD8A 4N0VA 3FR3A 1URMA 4GCIA 11GSA 1SL2B 1ZL9A 4F03A 1CQGA 1XPVA 3O76A 2VLTA 4NMUA 1YZXA 1B9XC 3ERGA 4YAVA 3EVIA 2REMA 3MDKA 3Q18A 3JCML 5KN3A 5DDLA 4WBJA 4JU5A 1FB6A 9GSSA 3MWHA 1F6MC 4KCAA 4I5QA 3ZFBA 1SYXA 2DIYA 3EWLA 2R6KA 2E2MA 2LQOA 4MJBA 1J0FA 3IK9A 1R5PA 4BVXA 2A2SA 4Q5QA 1Z9HA 3LYKA 2DJ2A 2G0FA 3F6DA 1J08A 1QGVA 2CAQA 5ENUA 1MDJA 5KN0A 2ES7A 4JR6A 1H75A 3L9UA 2H75A 4ZB9A 4MLYA 2H70A 4ISDA 3CSHA 1DBYA 3CMIA 3S9FA 4XTSA 1Q4JA 3UARA 2R37A 4BVYA 5JWRB 2GSRA 3KP8A 2LEGA 1GP1A 1BJXA 5HR0A 4IP1A 2MMNA 2FCHA 3C71A 2A4VA 4HJ2A 2CX3A 4PQIA 2QKEA 2C0FA 2OJLA 2AUVA 5AGYA 3QD9A 2CVDA 3PGTA 4XCSA 2C3NA 1YF0A 2HRNA 4WF4A 2X64A 3VPQA 2V41A 1TK8B 3M0FA 3HVXA 5G1KA 3IE3A 2QSIA 2JU5A 3HXSA 3FZ9A 1ZYQB 4HU7A 3ZVJD 5FHIA 1VF3A 4RI7A 1XW9A 4RI6A 3LEFA 1Z3EA 3KTLA 1O8XA 4ZIJA 1XZOA 3ZRDA 3QR6A 2NTOA 4HZ2A 4N30A 5EY6A 3L9VA 4BL7A 2H30A 1F37A 3GSSA 5HR1A 3GUSA 4O7HA 5DCHA 1X9WB 4ZBBA 3HYPA 3D21A 1V40A 1DE2A 4FYUA 5B6NA 5AN1A 1T4ZA 4FYCA 3WGXA 4KE3A 4RQRA 1WRYA 4AGSA 4MF7A 5EPFA 2VIMA 2VCTA 2C80A 3RPNA 4PXOA 3ZZXA 3ME7A 2DJJA 3TKSC 1YEPA 2F51A 3SBCA 1R5AA 2YN1A 2OE1A 5D96A 3APOA 1FG4A 1O81A 2FD3A 5AIVA 1PL2A 5IMAA 22GSA 4EDYA 2PU9C 2N5BA 2WCIA 5EL8A 4TW5A 1U3AA 4MH3A 3I6AA 5ABRA 2EIQA 4LL1B 4K7NA 1GULA 4F2IA 1HD2A 4KGIA 2GS3A 3IAM2 2L4QA 3E3EA 2F8FA 3FY7A 1X9MB 4N0ZA 2HZEB 1ZOFA 3DYRA 2GSSA 4G9HA 3ED3A 3VWXA 2JSYA 4OFMA 3CTGA 2YP6A 2TRXA 2OE3A 3DRNA 1BYEA 1F3AA 1N8JA 3LSZA 2O85A 1OVNA 1FOVA 5ECMB 3IDVA 4MJCA 1JZWA 2WGRA 2AJQB 4TXOB 5G1LA 4KB3A 2KHPA 1AUCA 4RQXA 3RHCA 1GWCA 3LXZA 3M9JA 2GZZA 4EUYA 4POMA 3D5JA 3RPPA 4FIWA 1F2EA 1Z7PA 3DMLA 4TR0A 4WBRD 4K6XA 1NM3A 1EP7A 2CAIA 2DJ1A 4OD7A 3Q6OA 1WOUA 2IFQB 2PPTA 2XC2A 4KA0A 3M8NA 5IO0A 1T1VA 5ECQB 1B8XA 4IW9A 1X9SB 1PA3A 4IJ3A 2FLSA 1AQWA 3KJYA 4MJEA 4BA7A 4N10A 1PD21 4WR5A 1I9DA 1WP0A 1HNAA 10GSA 2IMDA 5AIXA 2V6OA 2I4AA 5F8BA 4DEJA 5ID2A 4ILFA 5E59A 3D4TA 2PMTA 3F8UA 2ON7A 1IYHA 3NZNA 1YKAA 2H8LA 3HVVA 1IYIA 4ZBAA 5D8IA 17GSA 3GH9A 4NWYA 1EOHA 4LA1A 1MEKA 2VAFA 5J4UA 3UL3A 2M80A 2R3XA 1SL1B 2VL9A 6GSYA 2HRFA 3UVTA 1TK5B 1K3OA 5IPHA 1QMVA 1SU9A 1A2MA 2VO4A 2AHEA 14GSA 1FO5A 2MZCA 3W8SA 2PWJA 4PQ1A 2CQ9A 2ZNMA 2O89A 5G31A 1NHOA 1SKRB 1X0RA 2R4VA 2PVQA 1OC9A 6GSUA 3L78A 2YPMA 5CO3A 2K18A 1XFLA 2VD0A 2GQKA 2WS2A 3QDNA 1V2AA 2XHFA 1SK1A 2RLIA 2LSTA 3HKRA 3VK9A 1Z6NA 3I9V2 2P5RA 4ZBDA 4IBPA 2PUKC 5G5EA 3TCOA 6GSXA 4FO5A 2WB9A 4K7OA 3EC3A 3KMNA 2L4CA 4PURA 2L57A 3TJGA 4MZWA 2FUG2 3KTBA 3KH9A 4XIHA 2MMAA 1ZCPA 2LRNA 3N5OA 2H19A 3ZIVA 2DMLA 1X5CA 2HXKA 4TVEA 2PVOC 1K0CA 3UVHA 1EWXA 1WIKA 2WZ9A 5ELAA 2RUFA 1YDKA 4OO5A 5FWGA 4ECBA 2C0GA 1O6JA 1GH2A 1E6BA 4HUAA 3BCKA 2P5QA 1OE8A 4ZB8A 4KAEA 2FHEA 4EO3A 4MZBA 3QMXA 3LG6A 4ACSA 5ECHB 4BPYA 5LD0A 1JZRA 1WMJA 1Q98A 5IIZA 4IHUA 3F63A 2H1GA 4XHMA 2IJYA 5DJMA 2WJUA 4XRDA 4TKYA 1K0AA 1PQNA 3AY8A 2H0GA 2WRTA 4FYBA 2AYTA 2JZSA 3U5RE 4LLRA 2YJ7A 1H4OA 5JWQB 4MPGA 1G7EA 1UVZA 2M72A 3CTFA 5ECNB 3O3TA 4GSTA 1F9MA 2JADA 4F82A 3APQA 4CDOA 3HD5A 4YQUA 2LUSA 2EIOA 4JE1A 3VWWA 1Z6MA 2GSQA 2H1BA 1KBNA 4ECJA 5F07A 2GSTA 2OBIA 5JCUA 1PN9A 1Z5YE 3GTUA 4MABA 4MF6A 1TRSA 4EC0A 4MK3A 1QFNA 3C7MA 1TDIA 3I43A 2H01A 1A8YA 1AQXA 2H6XA 1OKTA 4EL1A 3CYNA 4BWSA 5DALA 4GSNA 3UIWA 13GSA 2D2ZA 3TKRA 2JACA 4PX1A 4ULXA 5IQYA 4KW6A 1MTCA 1EGOA 6GSTA 1R26A 1V57A 3HJOA 3US3A 4J57E 2LKUA 4MA9A 3D0ZA 3GX0A 4HQSA 2HFDA 1TKDB 5IMCA 2OADA 2H0IA 1EV9A 3FK8A 5C04A 2KP2A 2G2QA 1FHEA 2C3TA 5HR3A 3LWAA 3ZL5A 3GA4A 2GZPA 4MF5A 2H73A 1M9AA 3ZTLA 3EYTA 1S3AA 1O8WA 5D73A 5D9TA 1XWBA 1G6WA 3LYPA 1FB0A 2FA4A 3ZREA 1HNBA 1JLWA 2H1AA 1XVWA 1PRXA 1ERTA 3ZMLA 2IL3A 3E9JB 1GSQA 5IMDA 2FWHA 3HDCA 4I2TA 18GSA 5D9WA 3GSTA 1ON4A 3F3QA 3GKKA 3DVWA 5DAKB 2B7KA 4OCFA 1K0DA 2VL2A 4WETA 4JR4A 5ECPB 1Z7RA 3NOFA 2VCWA 3P7XA 7GSSA 4PNGA 5ECKB 2H66A 2GT6A 4I97A 3HVSA 2O8VB 4TR1A 4PUFC 5HQPA 4QQ7A 1M0UA 4IVFA 3BCIA 3A3TA 4D73A 4WF5A 2FY6A 3QCPA 2O7KA 2WFCA 1JFUA 2FWFA 3MAKA 4L5LA 2GQMA 3FW2A 2KOKA 2RM6A 2I3YA 4HDEA 1O7UA 3IV4A 4NAXA 2KUCA 3GMFA 5A4WA 3FZAA 4ZXGA 5KEJA 1M9BA 3LQ7A 1GRXA 4GRFA 3DEXA 2HNLA 1M2DA 4ZB6A 1ABAA 3L4NA 5GSTA 2K8VA 2ON5A 2XBQA 1YY7A 4OFTA 1GLQA 1QQ2A 3CXGA 4KNDA 4NV5A 5E4WA 1TRVA 1AIUA 2H72A 2QGVA 1GSSA 2X8CA 4JRRA 5IMZA 4LMWA 4POLA 3FZ5A 3WT2A 4OCEA 1M99A 3KD0A 1K0OA 3ZLPA 3TRPA 4LL4B 2IWTA 2L6DA 1AQVA 12GSA 5CREA 1EZKA 3C1SA 2LRTA 1G6YA 5J5NA 1X5DA 4OWYA 2KP1A 3HCZA 5IMVA 1TU8A 2MBSA 3KH7A 3DGQA 4IKHA 3FEUA 4KSOA 4L0WA 3LGCA 2NPBA 4Q5FA 3DKSA 2B1KA 2RM5A 5ECOB 4LMVA 1OC9B 4CW9A 5DBQA 3K8NA 1G0TA 3UJ1A 4KDUA 3GL5A 3GIXA 2DLXA 4PUAA 1A0FA 3F3RA 2XPDA 5GSSA 1U87A 3UAPA 3F0IA 5CNWA 3EU4A 2YNXA 4DSSB 3UEMA 3EE2A 4JEDA 3RHBA 2HE3A 1OC8A 1GSFA 4L0UA 3TOTA 1A23A 1ST9A 3BD2A 4DVCA 2DJ0A 3H1NA 4CHSA 2DC5A 3ZYWA 3RAZA 1Y6EA 4K8MA 3P8WA 1VF4A 5ELGA 2BMXA 4MPFA 1OC3A 1JZOA 2M46A 3L9SA 1GSYA 3HA9A 3L0HA 3IR4A 2H74A 3WGEA 5ECIB 3DWVA 3TJJA 4NHWA 1T00A 4HOJA 1KNGA 1A2JA 1UN2A 3GURA 2K9FA 4PNFA 1B4PA 3R2QA 2L5OA 3UBKA 3CRUA 4QL7A 1HQOA 2N5AA 5ECSA 1BG5A 1PX6A 1QK8A 2L59A 3ZVJA 4V2NA 4NV2A 5KN2A 4AJ7A 1T4YA 2IMEA 2LJKA 2OKAA 4E8HA 4AF2A 2YZHA 3VLNA 3TOUA 5L71A 3VPTA 3QFAC 5DQSA 2K6VA 1GSUA 3ISOA 3V1WA 3QAGA 2YJHA 3ME8A 3GL3A 2AV4A 1WWJA 1T7PB 6GSSA 3D22A 2FNOA 2DMMA 2CZ3A 5F06A 3ZFLA 3TKSA 3WYWA 1TRWA 4AJ8A 4EXJA 1TOFA 4P3YB 5HFKA 4K1FA 3KIJA 3OR5A 2GQLA 1W4VA 4K7IA 4Q5RA 1XBSA 2J23A 4FH8A 2VD1A 3A2XA 4HS1A 4TXOA 3GTUB 2AB6A 3EMXA 2LJAA 4QL9A 2PBJA 1JLVA 1OYJA 2VCVA 1SKWB 4MJAA 2XPEA 2E2GA 5F0GA 4ZL8A 3H4KA 4YQVA 1M2BA 3A2VA 2LRCA 3TKPA 3QPMA 4BWQA 3IRAA 2VLUA 1OAZA 4V1Ap 5INYA 3F4RA 1SJ6A 2CVKA 2YWIA 5COHA 1LJRA 1XWAA 2DSAA 1QXHA 4V2MA 2KLXA 4O5RA 3P90A 16GSA 2YV9A 2XBIA 2ZUPA 3W6GA 2VLVA 3P2AA 2DJ3A 1XWGA 2V6KA 3G9BA 2NVLA 3GYKA 1ZMAA 2EC4A 3BJ5A 1MDKA 4HJMA 1RQMA 1VGLA 2L5LA 2Z9SA 2I1UA 4X1UA 3C73A 3TKQA 2OBKA 5EVOA 1BQ7A 2HZFA 2GVPA 3M9KA 3VI7A 3IAS2 2GTUA 1XWKA 2C0EA 1K3LA 4ZL7A 2B5XA 1S3CA 3APSA 5H5QA 3VWUA 1CQHA 4IJIA 4XS6A 1B9YC 3TRXA 2MMOA 2LTKA 3LFLA 3A5WA 4RUVA 3HZ4A 5LCZA 3QFBC 4K9ZA 1GNWA 2X99A 4GQCA 2C1YA 1J9BA 1EEMA 1W89A 1N2AA 2VCXA 4NXIA 3DD3A 4E8EA 1SD9A 3KM6A 3TGZA 2HSHA 4KDYA 4O92A 2F3MA 3LORA 2CX4A 5DVBA 5B7CA 4GQFA 2HSYA 5GAND 5H5SA 4MMMA 3ZIJA 1XIYA 5CRWA 5CRDA 1KTEA 2R5GA 4DSRA 1B4QA 4HI7A 3TJBA 4MH2A 5GAPD 1ERVA 1JZDA 2AAWA 4EVMA 1FAAA 3IBHA 1OE7A 1BAYA 4IELA 1DUGA 1NW2A 1QUWA 3CRTA 1WJKA 4I2UA 1THOA 4YH2A 1TP9A 4KX4A 1HYUA 5H5RA 3U6VA 3CSIA 1OKDA 2CVBA 5J9BA 3IA1A 2YWMA 1A2LA 1G7OA 3PH9A 1TI3A 2WDUA 2R2JA 4YQMA 1K0MA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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