1Z6MA

Structure of conserved protein of unknown function from enterococcus faecalis v583
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
175
structure length
175
Chain Sequence
SNAMDISVIDATKVNTETGLHIGESNAPVKMIEFINVRCPYCRKWFEESEELLAQSVKSGKVERIIKLFDKEKESLQRGNVMHHYIDYSAPEQALSALHKMFATQDEWGNLTLEEVATYAEKNLGLKEQKDATLVSAVIAEANAAHIQFVPTIIIGEYIFDESVTEEELRGYIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of a conserved hypothetical protein from Enterococcus faecalis V583
rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Enterococcus faecalis
molecule keywords conserved hypothetical protein
total genus 57
structure length 175
sequence length 175
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.1200.90 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Non-ribosomal Peptide Synthetase Peptidyl Carrier Protein; Chain A DsbA-like domain 1z6mA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1z6mA01
3GH9A 5IQYA 2ZUPA 3U6VA 2H0GA 1PMTA 2J23A 4QL7A 3UVHA 3M1GA 1OC3A 4TR1B 3APSA 5B7CA 3TOTA 2WJUA 3MNGA 1XW6A 4FYCA 1VRSD 1J0FA 3TJJA 2RLIA 4BWQA 4EUYA 3ZLPA 3D6IA 3UOMA 3F3RA 1V9WA 3RHCA 1SK0A 2PPTA 3VWUA 3HYPA 1Y25A 2GQKA 2GSSA 5HR1A 3LXZA 2J9HA 1ZL9A 4EL1A 1K0CA 3E9JB 1X9MB 4KCAA 3MSZA 5IIZA 1SJ6A 1H75A 4PNFA 4PQ1A 3F0IA 1B9YC 1GSQA 1THOA 4ZL8A 1A24A 2FNOA 1TRVA 5DJLA 2LSTA 2RIIA 2OKAA 1AQVA 3DEXA 5EVOA 4N10A 3WT1A 3IE3A 4POKA 4ZB6A 1AUCA 1TK0B 3D21A 1M7TA 2ZCTA 5D9WA 2FA4A 2OJLA 3KMOA 3Q6OA 1JZWA 2LRNA 2XPEA 3H79A 2VL3A 5KN3A 4D73A 1U87A 20GSA 2VCVA 4HQSA 1OKDA 2YOIA 4ID0A 2HSHA 2A2RA 3TKSE 4WXTA 1MDKA 3GN3A 2YV7A 3IR4A 1O81A 5EPFA 5ECKB 4CDOA 2LKUA 3GUSA 2JU5A 1MDJA 4JR4A 2TRXA 3APOA 5IMAA 5EL8A 2R5GA 4BPYA 4IS0A 1U88A 4F2IA 4Z7XA 2ON7A 1Y6EA 4XIHA 4XS6A 5JCUA 2R6KA 3ZITA 4TW5A 3CSIA 1A2LA 3FHKA 3RPPA 3F6DA 1N8JA 3F63A 3CRTA 4BVYA 1X5EA 2F8AA 1O85A 4WF5A 1K3LA 2DJKA 1YKAA 1ZGNA 1M9AA 2O7KA 2WB9A 2DBCA 3HZ4A 2CX3A 2CZ2A 3GURA 4Q5FA 4F0CA 1SD8A 3QOUA 2LJAA 4X1UA 4TRXA 2G0FA 5AISA 2NBSA 1AIUA 3J7Yk 3KM6A 4NAXA 1EV9A 2WZ9A 9GSSA 4V2MA 1Q4JA 3GKXA 4HU7A 4HJ2A 1T3BA 1AAZA 5H5SA 2IMEA 2MMZA 3F9UA 4MLYA 2H70A 4ULXA 4TOPA 3I9V2 3O76A 4KSMA 2QGVA 2IIYA 3US3A 3HY2A 3P7XA 4ZIJA 3IBHA 3HKRA 5CRDA 1FOVA 3KTLA 4DSSB 4MJCA 2WDUA 1XCCA 3GH6A 1GL8A 3GKKA 1TI3A 2V2GA 4ILFA 4KW6A 2OE1A 3Q18A 3UMAA 1GNEA 3G7YA 4ML6A 3TJKA 1YJ6A 2HT9A 5HFKA 2B7JA 2DLXA 2NVLA 3ZYWA 4F0BA 1GSUA 2WS2A 4IELA 4K7NA 2H30A 3PINA 3QFAC 2QKEA 4NV5A 2FWGA 1YZXA 4Q5NA 3RAZA 1G0TA 1LU4A 4POMA 4XRDA 4K0NA 5E4WA 3HD5A 4KNDA 4ML1A 4LMVA 3TCOA 4YAPA 5CRGA 3LORA 4EXJA 2RUFA 2N5FA 3VWXA 1JLWA 2C4JA 1EGOA 3I43A 1OE7A 2OA7A 4HQZA 2I3YA 2L6DA 1NW2A 1SD9A 1EP8A 4XHMA 4XRAA 3C1SA 1O6JA 4N11A 4BL7A 1M99A 2HYXA 1WOUA 1B9XC 1GTUA 1XWCA 2CZ3A 2L59A 2YWNA 3WGXA 1EZKA 5B6MA 4MF6A 1ST9A 4KA0A 2YCDA 3IOSA 4J56E 1CQGA 4XTSA 3PGTA 2V1MA 2MYGA 4MDCA 2C0FA 17GSA 3PH9A 2X8GA 2VM1A 3VI7A 1WIKA 2V32A 3ZRDA 2CA8A 3FR6A 4Q5RA 3FZ4A 3KP9A 3DIEA 1GLQA 4FO5A 5ECHB 1NHOA 2VAFA 3APQA 1SENA 2C3NA 4HDEA 1PL1A 2H73A 4CW9A 3I6AA 1Z6NA 4POLA 2GZZA 2VL9A 3M3MA 1SL0B 2L4CA 3SBCA 2NDOA 2GGTA 5IM9A 3HZ8A 3HVXA 4HS1A 1GLPA 2VCWA 2TRCP 5ECQB 5B6NA 1FW1A 2V6OA 3UARA 1RK4A 2C0GA 1FVJA 1R5AA 3HCZA 2H0IA 4AJ6A 2GZPA 4JU5A 5H5QA 1H4OA 5D8IA 1ZYEA 4OFMA 4ZB8A 1SYXA 3BD2A 1VGLA 5HR3A 3W8SA 3S9FA 4F9ZA 2B1LA 5KN1A 3PR8A 1O73A 1UA5A 4ACSA 1JLVA 1F3BA 1DE1A 3LSZA 1GTAA 1GULA 6GSSA 1ERUA 1SYRA 3KIJA 2EIOA 4V1Ag 3A2WA 1WMJA 5J9BA 4K6XA 5GSSA 4G10A 3EVIA 4N0VA 3WGEA 1Z7RA 4MPFA 2O8VB 4HJMA 5AGYA 2ZNMA 2VLUA 2V41A 5JWQB 3O3TA 1KEBA 1DE2A 2OACA 1HNAA 1V57A 4O5RA 1YEXA 4MF5A 4IP6A 3TGZA 3E3EA 5KEJA 1Z5YE 2K18A 3VPTA 1TP9A 2B6MA 2LRTA 2V6KA 2LQOA 1YKCA 2H01A 5A4UA 3ZIJA 3LG6A 5LD0A 2HE3A 3P90A 5ECNB 3GRXA 2MMAA 1A2MA 2GLRA 3ERWA 2WRTA 1T1VA 2H75A 1U3AA 2QSIA 3UVTA 6GSYA 1DSBA 2AV4A 2OBIA 3BCKA 2O87A 5KN0A 2H6XA 3NZNA 3TUEA 3C71A 11GSA 4K7IA 2AHEA 18GSA 1R26A 3QCPA 2FLSA 2RM5A 4L8EA 2A4VA 2H66A 2VCZA 5F8BA 1T7PB 2Z9SA 2WULA 1ABAA 2MBTA 4MH2A 13GSA 3BCIA 1T8EB 1XOBA 4FYUA 3A2VA 5D9XA 4I2UA 2A2SA 1AXDA 5DDLA 5IMDA 2DSAA 5DAKA 3IV4A 4POBA 4HZ2A 1MDIA 2CT6A 2IFQB 2GS3A 4G9HA 1PN9A 4WETA 3TKPA 3P2AA 1BYEA 3LFLA 1DUGA 2LJKA 2IMDA 2H76A 5DVBA 4CHSA 4GWRA 2O85A 4N30A 1BG5A 5ENUA 1ON4A 4LA1A 2WCIA 3EE2A 3D22A 4K2DA 4AJ8A 1HQOA 1SK1A 2XPDA 1U3IA 3D5JA 1OKTA 2C80A 4GLTA 4MMMA 2P31A 2GT5A 1FB6A 3ED3A 4LMWA 2JSZA 2M46A 4MP4A 3EINA 5JWOB 1J9BA 2PU9C 4MH3A 2BTOT 5DALA 3DD3A 4GSSA 1A8YA 1Z6MA 3EMXA 3ZFLA 3IC4A 3L9SA 1S3CA 3NIVA 1UVZA 1W89A 4GXZA 4BA7A 1PKZA 1CQHA 2VL2C 4L0UA 10GSA 4OCFA 2JACA 3LJRA 3IK9A 2KLXA 2C1YA 4ZBBA 3RDWA 2AAWA 2M80A 4EC0A 3CMIA 3GYKA 4JRRA 3QAGA 1EWXA 3QAWA 2LUSA 2P5RA 3BBYA 2I1UA 1VF3A 4GSTA 2VL2A 3TKSC 4MZBA 4XCSA 4GQFA 3CXGA 1SKRB 1OC9A 3M9JA 2R2JA 3KZQA 3EYTA 2HZEB 3ZTLA 16GSA 2F3MA 1M2DA 3VK9A 4ISDA 1O8XA 1BEDA 1NSWA 1TK8B 3ZMLA 3TJGA 1ZOFA 3TKSA 3FR3A 2N5AA 1S3AA 4KE3A 4ECBA 2TIRA 2LTKA 1XPVA 2D2ZA 3CTFA 4GCIA 5ECMB 2XBQA 5HQPA 1W4VA 3ZL5A 2PVQA 4IJIA 2L5OA 2C3TA 5ID2A 3WGDA 2WFCA 4TN8A 3HVVA 1V2AA 5F06A 1QGVA 1AC1A 4I5QA 3M9KA 2L6CA 1XZOA 4WKWA 3LEFA 3L9VA 4EDYA 2OBKA 1NHYA 4ECJA 1O7UA 2VD1A 5IMCA 2IPAA 5ECLB 5D9TA 3HJOA 3F8UA 4H86A 4IN0A 4ECIA 5GZZB 1K0DA 3EURA 1GSYA 3H4KA 4PQIA 3QMXA 3C1RA 5J9CA 5DJMA 2E2MA 4HOJA 2HRNA 1B4QA 3M8NA 1XWBA 4DEJA 2DC5A 4XS4A 1T4YA 4ZXGA 3U5RE 1JHBA 4FH8A 1WRYA 4AGSA 2YPMA 3L78A 4MZCA 4RI7A 4JEDA 2I4AA 5A4VA 2H6YA 2XBIA 12GSA 4I6XA 3KD0A 1TDIA 2DMMA 4MABA 1K0BA 1E6BA 1GP1A 4KUNA 4KX4A 4N0ZA 1EGRA 1PX6A 2MZCA 3DVXA 3EU4A 6GSUA 3BOAA 5G2ZA 3GX0A 4HEA2 5LNKe 3FK8A 4WBJA 3A5WA 4KB3A 2CVDA 1WPIA 2H19A 2CAIA 1LJRA 1XW9A 2GSTA 5ELAA 2KOKA 2B3SA 2IJYA 3R2QA 3FRCA 2IL3A 2KP1A 3ZVJA 3GMFA 4KSOA 4JBBA 3VI5A 3KP8A 5HFIA 1HNCA 2HZFA 1PRXA 3SWLA 5IMZA 5J3RA 1QMVA 4GTUA 2C3QA 1T4ZA 4I2TA 1TK5B 5EY6A 2G2QA 1NM3A 1B4PA 3DYRA 3L4NA 3MAKA 4KDYA 2HFDA 3GTUA 2VCQA 2GZYA 2OE0A 3VLNA 5ABRA 5IOWA 1TOFA 4X43A 1X0RA 4TR0A 1GRXA 1SJIA 4NHZA 5KN2A 5IMVA 1UN2A 2VCTA 2AYTA 3C7MA 3M0FA 1R7HA 4E8EA 1ZMAA 2X99A 4IQ1A 3G7JA 2O89A 2B5XA 3TRPA 3VWWA 2E0QA 4WR5A 1GUMA 4O92A 5E59A 3GSSA 3VURA 1Z7PA 1G6WA 4WF4A 3DGQA 1V98A 3GV1A 3KGKA 2FCHA 3Q19A 3QFBC 2LJRA 2HNLA 4NPBA 1BJXA 2IMKA 1ML6A 1K0AA 2IMFA 4QL9A 3KCMA 2H1GA 2JZRA 1E2YA 4KDXA 2FHEA 2FGXA 4G2EA 2HSYA 3H93A 5D73A 3O6TA 1MEKA 2B1KA 5ECIB 2BMXA 4ZILA 2VCXA 1N2AA 2FUG2 2LV3A 1SKSB 1I5GA 5IMFA 3ZZXA 3A3TA 4PGTA 2XHFA 1G7OA 2KHPA 2H1BA 2BJXA 3HA9A 1OVNA 3P8WA 4IKHA 3J7Yb 3ZREA 1FVKA 5CREA 1BQ7A 2IN3A 2VLVA 5CP1A 2I9HA 4JR6A 1USBA 4PURA 4PXOA 1ZZYA 1FG4A 3FEUA 4PQHA 3DWVA 5G30A 5IO2A 3Q74A 5JCGA 2ON5A 1MD4A 3K8NA 1FHEA 4YAVA 2AB6A 5D9VA 4EDZA 3TJFA 1OE8A 4TXOA 4GQCA 2WGRA 2H1AA 3CTGA 1F6MC 1SL1B 3FW2A 3IA1A 5D96A 2HLSA 2YWIA 1FO5A 4DVCA 3GL5A 2YP6A 5JWRB 2FA8A 2YZUA 2MMOA 3L0HA 3FY7A 1Z9HA 2GSRA 1XWGA 4IJ3A 4WBRD 3ERGA 3CRUA 14GSA 2YWOA 3FZAA 4V2NA 1ILOA 1FAAA 1TXXA 4NWYA 1U6TA 3WD6A 4V1Ap 3VPQA 3W8JA 1FB0A 4OD7A 2CAQA 2DJ1A 2IFQA 2VM2A 1T00A 4EVMA 5J4UA 4K0GA 2JZTA 4TR1A 2PWJA 3GIXA 1OC8A 2MMNA 1WJKA 1GSFA 5F07A 3GA4A 6GSWA 4MJBA 5COHA 3VWVA 4MJAA 5FT3A 2VO4A 3KH7A 5B8AA 1R4WA 4X0XA 4O7HA 4L0WA 4NXIA 2H1DA 4F03A 1GH2A 4OFTA 3RHBA 1XFLA 2PUKC 4MJEA 3RBTA 1XWKA 4ZL7A 6GSTA 1HNBA 4KH7A 1A23A 2KP2A 4Q5QA 3LGCA 1GUHA 1K3OA 1IYIA 1JZDA 3F4SA 1AQXA 5JCWA 1J08A 2PMTA 3ERFA 5DAKB 2CX4A 2B5YA 3LYPA 1X5DA 1AW9A 1TU8A 2REMA 2RM6A 3QD9A 2AJQB 2AUVA 1Z3EA 5HR0A 2GDRA 3IDVA 5ELGA 2VOCA 1R5PA 1A8LA 4MCUA 5CO3A 4OWYA 3HVSA 3ZVJD 2ES7A 3QPMA 3V1WA 4FYBA 4HI7A 4IHUA 1SU9A 5IPHA 3GKNA 3EMPA 3UEMA 2KUCA 1PA3A 1VF1A 4TXVA 3CBUA 2LQQA 1XW5A 1M2AA 4IP1A 1WWJA 2K8SA 2JL4A 2YZHA 4TR4A 1ZCPA 3E0UA 1YF1A 3DMLA 3ZIVA 5DALB 2PGTA 5B8BA 5GSTA 2HZEA 5J5NA 3JCML 3ZMKA 4HU9A 4BVXA 5G5FA 5HFGA 4RI6A 2YNXA 3FKFA 1S3DA 3TRQA 2N5BA 3FZ5A 2YJ7A 1C72A 2C8UA 5CYYA 4HZ4A 2CQ9A 2E7PA 3HJPA 2B7KA 1PGTA 3IAS2 1A2JA 2FWHA 1RQMA 3OR5A 1THXA 2P5QA 3EC3A 1DBYA 4EE0A 3G9BA 1QXHA 5A5KA 4TVEA 2P0GA 2NTOA 1GSSA 1ACVA 1KNGA 2OADA 4YQVA 1X9SB 1RW1A 5AIXA 3AY8A 3IXRA 4D73B 4YH2A 3HJMA 2JADA 1QK8A 3HXSA 1AQWA 1OC9B 1TRWA 1UC7A 4RQXA 5DCGA 1O8WA 4BWSA 3BJ5A 1B8XA 1OYJA 1Q98A 3UJ1A 1PL2A 1TU7A 4P3YB 3EU3A 4PX1A 2FD3A 3ME7A 2GVPA 2F51A 1XVQA 1MTCA 3ISOA 2C0EA 5A4WA 3CSHA 2PN8A 3TJBA 4DSSA 3D4MA 1EOHA 2GSQA 1VF2A 3FYGA 2GQLA 4GSNA 2EC4A 5FHIA 19GSA 1EEMA 1K3YA 2DJJA 4OMVA 2FWEA 5DBQA 2VUPA 2JZSA 1G6YA 3KJYA 4WEYA 5ID2B 2C0DA 3EWLA 2QC7A 4IQAA 2PVOC 1A0RP 2GT6A 2GTUA 4LL1B 6GSVA 4L5LA 3F4TA 1YF0A 4DSQA 1X9WB 1GUKA 1JFUA 2HI7A 5G1KA 5J41A 3RPNA 3WYWA 1K0OA 3A2XA 3D4TA 3IRAA 4NV2A 1TRUA 2ALBA 1YEPA 4OFNA 4G19A 3GHAA 5GAPD 1EEJA 3QR6A 1F3AA 4ZBAA 1B48A 2X8HA 3W6GA 3TRXA 1ERWA 2H71A 3QDNA 1K0MA 5DQYA 3F3QA 1PSQA 2B5EA 3F6FA 4MPGA 2LEGA 4XS4B 3MDKA 1BAYA 4MZWA 2CVBA 3D0ZA 4PUFC 3GKMA 5ECSA 5AIVA 2CVKA 3QAVA 3FZ9A 2LNTA 3ME8A 2VLTA 3UIWA 5ECOB 1XIYA 4E8HA 4YQUA 1WE0A 4KGIA 1SKWB 2F9SA 2MBSA 4JE1A 2YJHA 3GFKA 4K9ZA 2VIMA 5F05A 1URMA 4L5OA 4IVFA 4RUVA 1A0FA 5D93A 1YQ1A 2F8FA 5CRHA 3IHQA 3N9JA 5IPGA 5DQSA 5CAXA 2FY6A 7GSSA 3HDCA 5IO0A 3TB2A 2DMLA 1BX9A 3KTBA 4ECCA 1I9DA 1XOAA 2YANA 22GSA 1PD21 4OO5A 5CRWA 3TDGA 1TKDB 2R4VA 1V40A 3KXOA 3HHVA 5ECRB 1TI1A 1EOGA 3LWAA 3NOFA 4ZBDA 2H0HA 3GTUB 5H5RA 1PQNA 4QQ7A 3H8QA 1XBSA 2M72A 2PBJA 1ERTA 4J57E 2YV9A 1PKWA 3DXBA 3WT2A 1HD2A 1GSEA 1IYHA 4IW9A 2EIRA 4K8MA 5CNWA 1GWCA 3DRNA 2X64A 2H8LA 4EO3A 2DIYA 1XWAA 2H74A 5C04A 3VFIA 4I97A 6GSXA 1WP0A 4JZQA 1PX7A 3G7IA 1F9MA 3I69A 1TW9A 3IAM2 4J2FA 5GAND 2FWFA 1GTIA 3C8EA 4DSRA 3IPZA 4KAEA 3KH9A 5INYA 4WR4A 4LL4B 4ZB9A 2H6ZA 4TR3A 4HUAA 2CV4A 4MK3A 1TRSA 4KCEA 1LBKA 1V58A 5IOXA 3L9UA 2K8VA 5G1LA 1VF4A 1SL2B 1EV4A 5F0GA 2DIZA 3LXTA 1XXUA 2OE3A 5HR2A 4LLRA 2XC2A 5L71A 3UBLA 4NMUA 1YY7A 4I8BA 8GSSA 2DJ0A 2NPBA 3DVWA 1SJZA 4O32A 5C00A 5AN1A 2LS5A 1EP7A 3DKSA 2EIQA 5ECPB 3N5OA 4K1FA 2E2GA 2IWTA 3GSTA 1KTEA 1OAZA 2I81A 1XVWA 4ZL9A 1GNWA 1G7EA 4EKZA 4NHWA 4AJ7A 4TKYA 3LYKA 2HXKA 3KMNA 4YQMA 1K0NA 1M0UA 1QQ2A 1M9BA 3C73A 3UAPA 1MD3A 1JZRA 1ZYQB 4MF7A 3TKRA 4FIWA 4RQRA 5LCZA 4IBPA 1F37A 1TJDA 1HYUA 2PERA 4AF2A 3LQ7A 2YN1A 3FR9A 3TOUA 4PNGA 2GQMA 3CYNA 2HRFA 3UBKA 4F82A 2YWMA 1JZOA 4GRFA 3GNJA 3ZFBA 2JSYA 4OO4A 4TXOB 3UL3A 4EF0A 3H1NA 1SK2A 2DJ3A 2L4QA 5G31A 5DCHA 4IGJA 2X8CA 2DJ2A 3TKQA 2IMIA 2LRCA 2K9FA 2LNSA 3GX8A 1ERVA 4V2LA 5FWGA 3MWHA 1YDKA 2H72A 2L57A 1X5CA 1M2BA 3GL3A 1QUWA 3IK7A 4PUAA 4MA9A 1GSDA 1QFNA 4K7OA 2RUEA 3KEBA 2R3XA 5G5EA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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