3TKSC

Crystal structure of full-length human peroxiredoxin 4 in three different redox states
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
197
structure length
196
Chain Sequence
HLSKAKISKPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDKLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural insights into the peroxidase activity and inactivation of human peroxiredoxin 4
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-4
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 64
structure length 196
sequence length 197
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
C PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tksC00
1ON4A 1PQNA 4WETA 3DYRA 22GSA 2C1YA 3P2AA 1O8WA 3D0ZA 5ECRB 2OADA 4RUVA 1WIKA 3GNJA 4IS0A 1ZGNA 1TI3A 3H8QA 3E0UA 2IWTA 2DSAA 2EIOA 3F4RA 1GLQA 1GSDA 3U6VA 2C4JA 1EOHA 3ERWA 5JWQB 2LKUA 2AUVA 2ES7A 3H1NA 3GKXA 1EEJA 1A0RP 2YV9A 4LA1A 1V98A 5B6NA 3F0IA 2PN8A 3V1WA 2LNSA 1OE8A 2EIRA 5IMAA 1SKRB 1PA3A 6GSWA 4PUAA 2IFQB 3M8NA 3GSSA 1OC9B 1YY7A 3L9VA 2YP6A 1K3OA 5AIVA 1SK2A 5DDLA 3PR8A 2L5OA 3TKSA 4PX1A 4XIHA 1GH2A 3KH9A 4WR5A 4X0XA 5JCWA 2LNTA 1DBYA 2H71A 5D9WA 17GSA 3TJBA 1XWKA 1M0UA 2AAWA 4GSTA 2HRFA 1K3YA 5CAXA 1U6TA 2IPAA 5IMVA 1XW6A 3IC4A 4LL4B 1OE7A 2VOCA 2E2GA 4FO5A 4OCFA 1GULA 4HU7A 5F06A 5J9BA 2F51A 4JU5A 3LJRA 2MMNA 1U3IA 1SL0B 4OO5A 3KIJA 2VCVA 2JZSA 3A2WA 2AB6A 4ZBAA 2YPMA 3HXSA 4K9ZA 3LEFA 2H6YA 4HEA2 1YKAA 2C0DA 2M72A 2H76A 3IHQA 1V58A 1U88A 20GSA 4MPFA 4GLTA 1X9WB 3N5OA 3EU4A 2KLXA 2XBQA 1SENA 4MJCA 5H5RA 1O81A 4MF7A 4TN8A 1FB0A 1ZYEA 3ZZXA 3VPTA 4PURA 4YQVA 1PX6A 3GRXA 1SK1A 1FB6A 2FGXA 2VAFA 2LTKA 2H72A 6GSXA 2H19A 2CX3A 3QPMA 4YAVA 5ENUA 3L4NA 3SBCA 4X43A 5CRDA 1ERTA 4KA0A 5ECSA 2XPEA 4ACSA 3IAS2 3UL3A 3DMLA 5D9TA 1HYUA 4KSMA 4OFNA 1M2DA 5IO2A 5AIXA 4JEDA 4NV2A 2NTOA 5GAPD 4BWSA 4MF5A 2O85A 1XXUA 2GSSA 5JCGA 1AXDA 2LSTA 2WRTA 2H6XA 1EZKA 1TK0B 4HS1A 1FG4A 4CDOA 4FH8A 2YWMA 3HZ8A 5GAND 3FEUA 3HD5A 4JZQA 5B7CA 3O76A 2MBTA 4NHWA 4HQSA 3IAM2 5G1LA 2FHEA 4EVMA 3DRNA 2YWOA 1A23A 6GSUA 4BA7A 4MA9A 4K7OA 5CRGA 3MDKA 5B6MA 4L5LA 3LSZA 4K8MA 2HZFA 2L4QA 2RLIA 4I97A 3WGEA 2L6CA 1JZOA 2VLVA 4IELA 1GTBA 3ME8A 1GSYA 3HCZA 5B8AA 2TRXA 2PBJA 3KTLA 4MJEA 3TCOA 3ZIJA 4EL1A 2H74A 2DIYA 2PU9C 2A2SA 1J0FA 1GNEA 2R37A 2OBKA 1ACVA 3WT2A 2B5EA 3ZVJA 1GL8A 1TW9A 1S3DA 1VRSD 4PQ1A 5ELGA 3HJMA 2FA8A 1B9YC 5IMZA 2O89A 4N11A 4L5OA 4V2LA 2GT6A 5HFGA 2CZ2A 1QFNA 2XPDA 5DVBA 3JCML 1XW5A 1EV9A 1XOBA 4V1Ag 2M46A 2GQKA 4G19A 2VCZA 3ZMKA 5ECOB 3CBUA 3Q18A 2MBSA 4OO4A 4O92A 5FWGA 3GH6A 5CNWA 2ON5A 1TKDB 1HD2A 1X5CA 4GWRA 3F8UA 3W8SA 4YQMA 4PNGA 3NIVA 2GVPA 1O85A 1EV4A 3D4TA 1B48A 4KGIA 1EGOA 3DEXA 3H79A 5G2ZA 3UVTA 4AJ6A 3L9UA 2ZNMA 3QAWA 4TXOB 2KUCA 4KAEA 3ZFBA 1RW1A 3J7Yk 3QDNA 1UC7A 1X5EA 1XFLA 1MD4A 5DJLA 3QMXA 4G9HA 3KJYA 1JZWA 5JCUA 4ILFA 2DJ1A 2F8FA 3GKNA 4J2FA 3FRCA 1F9MA 2VL2C 5C00A 4NV5A 2R4VA 4QQ7A 3GYKA 1AQXA 4GXZA 4WR4A 2YOIA 4KB3A 3ERGA 1TRUA 1KNGA 2KP2A 3ZMLA 3LYPA 2K8VA 2FNOA 2HXKA 1OVNA 1W4VA 5J4UA 3UJ1A 3HHVA 4E8HA 4XS6A 1PD21 1N2AA 1YEPA 2P31A 2JU5A 1EGRA 4D73B 2LQOA 4WBJA 3QFBC 2PGTA 2GZZA 5JWOB 3FZAA 3DWVA 4AF2A 1HNAA 3GX0A 2B1LA 4IVFA 5F8BA 1YF1A 3LG6A 1ZL9A 1THXA 4WEYA 4JR6A 1ABAA 4XHMA 5E59A 2E2MA 3D21A 3VWWA 3PH9A 4EE0A 1BJXA 1EP7A 3Q74A 3P7XA 3IE3A 2VD1A 2RM5A 5ECQB 2FY6A 3KMNA 2PVOC 2N5FA 2DJJA 2P5RA 3U5RE 3A5WA 3RDWA 2PPTA 1JLVA 4IP6A 3OR5A 13GSA 3VWXA 4RI6A 2H1DA 4MH2A 3VWUA 5D93A 2DJKA 3S9FA 4L0UA 1TRSA 2VCXA 14GSA 3APQA 1MDKA 1PL1A 4KUNA 1SL2B 4TKYA 3EMPA 4EXJA 1IYIA 2JSZA 2NVLA 5HQPA 1HNBA 3GTUB 3MNGA 2F9SA 3I43A 4JRRA 1NW2A 1XW9A 4GQFA 2QGVA 4ULXA 1AC1A 2WULA 1GLPA 3DIEA 2F8AA 3CYNA 4OCEA 3J7Yb 1GRXA 3HYPA 2NBSA 1SJIA 1G7OA 3FK8A 5F05A 4L0WA 3G7IA 3ZYWA 3IXRA 3L78A 4MJAA 5L71A 1ZYQB 1JHBA 5EPFA 2OE0A 1GWCA 2HLSA 4G10A 4ZBDA 2PMTA 4KX4A 3TKQA 4PQIA 2V41A 4OFMA 2RM6A 1THOA 2I9HA 4GTUA 3TKPA 2G0FA 2R5GA 4NXIA 2M80A 2QSIA 2WB9A 4F9ZA 1VF2A 4HJMA 4AJ8A 2J9HA 1PSQA 1PGTA 4I6XA 5CREA 1GSFA 1HNCA 4V2NA 5KN1A 4KCAA 5EL8A 2H75A 3D6IA 3HJOA 5G31A 1OC8A 4GCIA 4KCEA 2IMEA 3G7JA 3H93A 1I5GA 1Z7PA 2E7PA 3GUSA 4IGJA 3NZNA 2H70A 1XPVA 2RUFA 2N5BA 2B6MA 2AV4A 2JSYA 4LMVA 1NM3A 3TRPA 3ZREA 3P8WA 2DJ2A 3L9SA 1YQ1A 4F82A 2YZUA 2LRCA 5IM9A 5ECPB 1M99A 3GN3A 1F6MC 4POBA 1FVJA 4GSSA 1Z3EA 1V57A 4TR0A 3C73A 2X99A 1VF3A 2YANA 1Z6MA 1TI1A 3VI7A 1WJKA 4TW5A 4RQRA 1QGVA 3CMIA 3UARA 4DSSA 4LLRA 1WRYA 2HFDA 5G5EA 4ZXGA 3A3TA 1SU9A 3CRTA 1Y6EA 4JE1A 1K0OA 2DMMA 2IMKA 4IHUA 3KD0A 2GQMA 2ON7A 2HZEA 1TU8A 1QXHA 1PL2A 1QQ2A 4MH3A 4IJIA 2VCWA 2ZCTA 3ISOA 3TKSC 3BBYA 3QFAC 1IYHA 1G0TA 2CV4A 3MSZA 3UAPA 5DCGA 2FWHA 4XS1A 2HE3A 2A2RA 2H66A 2H8LA 1T7PB 2MMAA 2X64A 5HR1A 1VF4A 1ILOA 1GSQA 5KN2A 1XWBA 2X8HA 4F03A 4F0BA 1TRVA 2H30A 1K0AA 5ECKB 4IQAA 5KN0A 2VIMA 3F6FA 4EC0A 1JZDA 3GHAA 2GTUA 2AYTA 6GSVA 4H86A 2GSRA 1F37A 1QMVA 5DQSA 3HVSA 3RPNA 5IOXA 1K3LA 2EC4A 4CW9A 2IMDA 1R26A 5J5NA 3H4KA 3WGXA 2GQLA 4X1UA 3F4SA 1LU4A 1TDIA 2LJKA 3LQ7A 2MZCA 1A2JA 4HDEA 2GZPA 2LV3A 4HI7A 2C0FA 1O8XA 1OKTA 3VLNA 3I9V2 5IPGA 3EWLA 2VLTA 3C7MA 3F3RA 2B3SA 4ZIJA 3R2QA 2VLUA 4IJ3A 4N0ZA 1UA5A 2HRNA 4I2UA 4TR1A 3KTBA 5E4WA 1YKCA 2CVDA 3F3QA 3KXOA 2GLRA 3TJGA 2H0HA 4MDCA 4I8BA 6GSSA 5DAKA 2D2ZA 4KDYA 4E8EA 2DBCA 3EE2A 3UOMA 2O87A 3GL3A 4OMVA 3APSA 3FYGA 3EURA 1RQMA 1WOUA 1Z9HA 4GF0A 1MTCA 1UVZA 1Q98A 4MCUA 2EIQA 2L6DA 3BOAA 1SJ6A 3P90A 12GSA 1XVWA 2K8SA 3EC3A 4OFTA 2TRCP 1AQWA 4ML1A 2B1KA 1J9BA 3IPZA 4NPBA 3VURA 3FR3A 4HU9A 4P3YB 5F07A 4EF0A 1PX7A 2FCHA 3CRUA 2DC5A 3GMFA 4WF5A 3IRAA 1M2BA 4J56E 4HOJA 4ZB6A 1AW9A 3UMAA 4MABA 1BX9A 2BTOT 4O5RA 19GSA 1PRXA 3CTGA 1A2LA 2L59A 11GSA 2GDRA 2KP1A 5IO0A 3LXZA 1LJRA 1GTIA 4K2DA 4EKZA 4YQUA 2PWJA 4V1Ap 2QC7A 3DD3A 1XBSA 3KP8A 4IP1A 2H1BA 4KDUA 5DALA 1QUWA 1A8LA 4LMWA 2CAIA 1Z5YE 2DJ3A 2MMZA 1TU7A 2L57A 3QAGA 5IMCA 5ECIB 1JLWA 3IBHA 7GSSA 2GSTA 3FW2A 4FYCA 3TJKA 2H0GA 5JWRB 3K8NA 16GSA 1JZRA 3D5JA 1I9DA 1GSUA 1X5DA 1ZCPA 5LD0A 3QR6A 1T00A 1ZMAA 3MAKA 5GSTA 4DVCA 5IMDA 4WF4A 3M3MA 3WYWA 1F2EA 2OE1A 1S3CA 1GUKA 3F63A 1KBNA 3QCPA 3UIWA 3GFKA 3TOTA 2ZUPA 1BG5A 3FZ4A 1YEXA 3G9BA 2VL9A 2DMLA 4YH2A 2YV7A 5G1KA 4MF6A 1U87A 4MZCA 1WMJA 3EINA 1A2MA 4RI7A 4ECCA 3I69A 1GSSA 4N0VA 2LQQA 4XTSA 2V1MA 2H0IA 2HSYA 1NSWA 4KE3A 3IA1A 4NWYA 1M9AA 4EUYA 5GSSA 2CVBA 1A24A 1WE0A 3RHBA 4EDYA 3FY7A 4KNDA 4LL1B 4AJ7A 2WCIA 1UN2A 4TR4A 4BVXA 1OAZA 4GQCA 3BCKA 1A0FA 2FWFA 3GL5A 1T1VA 2I1UA 4MJBA 1KEBA 5ECHB 2FA4A 5AN1A 4BPYA 1KTEA 2Z9SA 1G6YA 2VD0A 3GH9A 1BQ7A 1PKZA 4MPGA 1FHEA 3QD9A 3F6DA 4NHZA 3KP9A 2FWGA 3WD6A 1DUGA 1V2AA 3KCMA 4Q5NA 2MYGA 2VUPA 3DVXA 3GIXA 3RAZA 1ZZYA 3C1RA 2GZYA 3DXBA 4XRDA 5KEJA 4XS4A 1SD8A 5ECMB 1BAYA 4D73A 5COHA 3UEMA 1AAZA 2O7KA 2PVQA 2IMIA 2K18A 2CA8A 1O6JA 1AIUA 1USBA 3E9JB 3VWVA 1R5PA 5A4VA 1SK0A 1O7UA 5J3RA 2L5LA 2C80A 4ZILA 3IR4A 1TK8B 1WWJA 2LRTA 5ID2A 4K7IA 1G6WA 5J41A 5D8IA 3LORA 2VCTA 2VM2A 3TDGA 2VCQA 5AGYA 3C71A 4KH7A 2YJHA 2DJ0A 3LFLA 1C72A 2I81A 2OBIA 1SL1B 3RBTA 2I3YA 2R6KA 4MZBA 2C3QA 3MWHA 1XIYA 2WFCA 2C8UA 3F9UA 1WPIA 4MMMA 4TOPA 3KGKA 1VF1A 2AJQB 4FYUA 5A5KA 4PGTA 3CTFA 4HQZA 4MK3A 4K0NA 1XWCA 5A4WA 2V32A 4HUAA 2F3MA 2WGRA 4BL7A 5INYA 5A4UA 1NHOA 3VFIA 4TVEA 4QL9A 3BD2A 3KMOA 1OKDA 4K6XA 5LNKe 2YN1A 1GP1A 4F0CA 5D9VA 1EOGA 2X8GA 5ECLB 2X8CA 4ZB8A 1K0MA 3HA9A 3M1GA 3D22A 4ML6A 2H1GA 4ZL7A 1TK5B 4K1FA 2LJRA 4DSRA 1F3BA 4K7NA 3FZ5A 3IDVA 4J57E 2YCDA 1O73A 1YF0A 1GTAA 3ZLPA 2YNXA 1X0RA 1BEDA 1OYJA 3HZ4A 4FIWA 5H5QA 8GSSA 3LYKA 3F4TA 5C04A 2BJXA 2I4AA 3QAVA 3ERFA 4CHSA 3KH7A 3PGTA 2WZ9A 4N10A 4DSSB 2YZHA 3DGQA 3GSTA 2YWNA 2IN3A 1SKWB 4MP4A 4I5QA 1XOAA 4ISDA 2IFQA 2FLSA 4ECIA 1CQGA 1OC9A 1Z6NA 3UBKA 5CO3A 1T3BA 3VPQA 2HZEB 1DE1A 4PXOA 4L8EA 3CSIA 1B4QA 3G7YA 1U3AA 5CP1A 3CSHA 2QKEA 3HVVA 1R5AA 2KOKA 1S3AA 4YAPA 4Q5FA 1R7HA 3VI5A 5ECNB 1TRWA 4KW6A 1AQVA 3QOUA 2MMOA 1QK8A 4ZB9A 3LGCA 3EMXA 3DVWA 5HFKA 1LBKA 3ED3A 3DKSA 3ZITA 1B8XA 2BMXA 3Q19A 3IK7A 3SWLA 2OJLA 3TOUA 3FKFA 1DE2A 2E0QA 5G5FA 3C8EA 1GUHA 1TOFA 1T4ZA 2H73A 4TXVA 2V2GA 4MZWA 3FR9A 4F2IA 2FD3A 2RUEA 3IV4A 3HKRA 2LEGA 4RQXA 3HDCA 1T4YA 4Q5RA 5CRWA 2AHEA 3IK9A 2WJUA 4O7HA 4IBPA 2CVKA 3APOA 2XHFA 2DIZA 1YDKA 1MEKA 3N9JA 3TKRA 1PMTA 3Q6OA 3M0FA 1W89A 4IQ1A 1XVQA 1EWXA 2VL3A 1H4OA 4TR1B 3TUEA 5FT3A 5HFIA 1E2YA 2K9FA 1URMA 1V9WA 1ERVA 2OE3A 4AGSA 2IMFA 3ZVJD 5CRHA 5DAKB 2G2QA 1AUCA 1SYRA 3UVHA 1K0DA 1V40A 4HZ2A 2CAQA 1XWGA 1X9MB 3ZL5A 3AY8A 2PUKC 4V2MA 2P5QA 4IN0A 2JACA 3TRXA 5FHIA 3GX8A 4XCSA 2FWEA 4NAXA 4OWYA 1N8JA 1H75A 2LS5A 4WKWA 1E6BA 2CT6A 3O3TA 3M9KA 1GNWA 3KZQA 4ECBA 4IKHA 2A4VA 1TXXA 2B5YA 5IQYA 1M2AA 3GA4A 3CSJA 1CQHA 5CYYA 4TRXA 4ZL9A 1K0CA 2CQ9A 3GURA 5J9CA 2IL3A 4ID0A 2C3NA 2KHPA 1PN9A 1ERUA 1K0NA 2B7JA 1FO5A 2V6OA 4ZBBA 1JFUA 1TJDA 4IW9A 2XBIA 2JZRA 6GSYA 3EYTA 4PNFA 1F3AA 1M7TA 5IPHA 3KM6A 2GSQA 2GS3A 3BJ5A 1GTUA 1OC3A 4I2TA 1TTZA 5DALB 4HZ4A 5D96A 1VGLA 3PINA 5H5SA 3KEBA 5IMFA 5IOWA 2H1AA 3ZIVA 5B8BA 4Z7XA 3CXGA 3VK9A 1YJ6A 4DSQA 1PKWA 1SKSB 2VL2A 1A8YA 1HQOA 4MLYA 2IIYA 4G2EA 3A2VA 1SD9A 3O6TA 4JBBA 5HR3A 2RIIA 1K0BA 2C3TA 5G30A 5IIZA 2CX4A 2FUG2 2B5XA 4JR4A 4POLA 4HJ2A 1J08A 4PUFC 3GKKA 3RHCA 18GSA 2WDUA 3ZTLA 3IOSA 1XCCA 5GZZB 4XRAA 3W8JA 2O8VB 5KN3A 3TB2A 2V6KA 1RK4A 3TJJA 1GSEA 4POKA 3HY2A 4GSNA 2WS2A 1T8EB 3FZ9A 2N5AA 5ABRA 2HYXA 3FHKA 2ALBA 4BVYA 3WGDA 3A2XA 4TXOA 1ML6A 3TRQA 3UBLA 1BYEA 3ME7A 4O32A 3C1SA 2HI7A 4TR3A 2C0GA 5DBQA 2PERA 3BCIA 2VM1A 3GKMA 1G7EA 1B9XC 3HVXA 2JADA 1R4WA 2NDOA 1EP8A 4DEJA 3TGZA 1FVKA 2IJYA 2L4CA 2HT9A 1SJZA 2K6VA 5DQYA 4XS4B 2GT5A 4WXTA 5LCZA 3M9JA 4ECJA 1ZOFA 3LWAA 4WBRD 2LRNA 2R2JA 2DLXA 1Q4JA 1ST9A 2R3XA 2H6ZA 1SYXA 1MDJA 5DJMA 2OKAA 2P0GA 2J23A 3W6GA 1GUMA 4EDZA 3GV1A 6GSTA 5ID2B 4KSOA 3LXTA 3I6AA 2VO4A 4BWQA 4EO3A 4POMA 5ELAA 3RPPA 2LUSA 3EU3A 1Y25A 1ERWA 4Q5QA 1YZXA 2XC2A 1MD3A 10GSA 1EEMA 4NMUA 2CZ3A 3TJFA 3EVIA 1XZOA 2OA7A 2B7KA 2TIRA 3E3EA 4N30A 5HR0A 3TKSE 5EVOA 5F0GA 4K0GA 5D73A 2OACA 1FOVA 4FYBA 1DSBA 3D4MA 2YWIA 5HR2A 1WP0A 1Z7RA 2C0EA 1FW1A 4KDXA 2YJ7A 3WT1A 3L0HA 1B4PA 1XWAA 9GSSA 1X9SB 2GGTA 1M9BA 5D9XA 2HNLA 4GRFA 3US3A 1FAAA 3NOFA 5EY6A 2H01A 2JZTA 5DCHA 5AISA 4QL7A 1TP9A 3FR6A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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